AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar XinJiangDaYe / MS.gene015930


Find 148 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 317 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-GE



Chromosome Type Strat End Strand Name
chr1.2 gene 9729558 9736359 9729558 ID=MS.gene015930
chr1.2 mRNA 9729558 9736359 9729558 ID=MS.gene015930.t1;Parent=MS.gene015930
chr1.2 exon 9735531 9736359 9735531 ID=MS.gene015930.t1.exon1;Parent=MS.gene015930.t1
chr1.2 CDS 9735531 9736359 9735531 ID=cds.MS.gene015930.t1;Parent=MS.gene015930.t1
chr1.2 exon 9730916 9731092 9730916 ID=MS.gene015930.t1.exon2;Parent=MS.gene015930.t1
chr1.2 CDS 9730916 9731092 9730916 ID=cds.MS.gene015930.t1;Parent=MS.gene015930.t1
chr1.2 exon 9729558 9730759 9729558 ID=MS.gene015930.t1.exon3;Parent=MS.gene015930.t1
chr1.2 CDS 9729558 9730759 9729558 ID=cds.MS.gene015930.t1;Parent=MS.gene015930.t1
Gene Sequence

>MS.gene015930

ATGAAAGTGATGAAGATGAAGCATATGTATGTGTTAGCCATGGTGATACTGGTAGGAACTGTTGCAGCTGATTTAGCAACAAATACCTGCAGTCACACTTGTGGAGGTCAAGAAATTCAATATCCATTTGCCATAAACGACACTTCATCAGATTCAGATTGTTTCTTGGGTGGTAAACTAATTCCGCTCACTTGCAATGGATCCAAAATATACTTGGGTAACATGGAAGTGTTAAACATAACCATCTCCAAAGCTGAAATTGACGTGTTATTTTACGTCTCTGAGTACTGCGGTGTTGATGATAATACTCGAGCTACGCTTGAAAGCGATTCATATACCATTTCAAGCAAAGAAAACAAGTTTGTAACTGTTGGTTCTAACAGTTACGGTTATTTTTATGTTTTCGATGGTGACACGTATTCAACTGGGTGCTTAACACGCTTTTTTGATCATCAAAGATCGATTGATAATGGAACATGTTCAGGTGTAGGGTGTTGCCAAGTTGATATTCCTCCTAGAATGTGGAATATAAGTATAGAAGCTTTTAATTTCAACAATGAATCCGATTTTTGTAGCTATGCATTTGTTGTTAAGAATGGTAGGTATAATTTTTCTTTAGCTCATTTATCACAAGGTTTTCCTTTCAAGGAACTACCTGTGGTTCTTGACTGGACAATTGGCAACGAAAGCTGCAGTACAGCTTCTAATGGAGTCAACTATGGGTGCAAGAAGAATAGCTATTGTGATGACAAGGACACATATTTTGGTTACCGATGCCATTGCAATCCAGGTTTTGAAGGAAATCCTTATCATCCCAATGGCTGCACAGGTCAATTTTTTATTCAAATTTTGGCAATTTACGTTTATTTTCATTTCTTCTTTAAACTTGGTATCGGTTTAATTACGTACTAAACTACTAATCCAAAGGTCCAGTTTCACTGCCTATGTGCGACTGCGCTATTTAAAACTCTTTGTATGGATTCCACAAAATTAACATTGAAGGATCGAACCTGAGACTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACACACTCCAAAATCTTAACTAAACCACCAAACCAATCCAAATATGTTTATAGTACAATATTGTTGATCTTTAGTGCTTTAATTAAGGTTCTGAAAATCAGACCCGTCCTTGATCAAGTCGTTCCAAGATTCAATAATTCAATGATAGCTAAATTTTGAAATTTTATAGTAGTGAATAAAAACATACATTGTCCCGTATGTGTAGCCCAGTTGGTAGCTACCAGGGACAATTTGAGCAGGGGACGGGGTTTGAATCCCAGATTCCCCACTTTTTCACACATAATGTGTGTGAATCTTGTCACTAGGCTACTTGACAAAAAAAAAAACATACTTAACATTTTTTTATATAATAATGATATTAATTATTACTACAAGTCTACAAGGGTATAAATGAAATTTATCATTTAATATATTTGAAATTTAATCAACGTCAATAGTATCAATAGTGTGTGTCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAAGTAATGTTTTTTATGTCACGTGTCACTTCCACGTTTATTCTCAATATTTTTTTATTTTTTAAAATCAATATTTTATTGGTATAAATATCTCAGCAAACTTTATATCGTATCCACTCAATATTTTTTCTTTTGAATTTCTAATATTTTATGCTGCAGAAATATCTCAACAAACTAGATATAATACTTTCAACAGAGTTTATATATATGATCTTATTTTATGATAAAAAGGCTCCAATCGGTTTGTTTTTTTTTTAGGAAAAGAAGCTTCAATTAGTTACTAAGTAATCTTTTATCACCGTATTATTCAATTAGCTTTTATTTTTGAGGAAAAAAGGCTTCGATTAGTTATTATGTTATCTTTTAACAGCATATTCTAATGCAAATGTTAACTATAAATAAAGGAATTTTTGTTAACCACATATTTTGAGCACAAACGAAAATTTCAAATCTTCTTTTCATCAAACATTTTTCCTTCTTCGGGTTCGCCAAACACCAATTCTATCATTTCTCTTACATATACTTTGATTTTTAATATATATATATATATTTCAACCACTTTGTAATGCTACTTTTTAATATAACATTTTTTCATCTTTTTGTTATTTTTATTTTTTAATTTTTGAAGACAACTTTTCAAACATCGTAAACACTTCTACTAATGTTTATACACACACACACTTACAATACTTTGATTCAATTTTGATTCTCATTTAACCAAATCATAAATTTCATCATTTTGTTTTTTATATTTCTTTTTCAGAACTTATGGCTACAAAATGTGACTTCATTGATGACGTCAATCAATCAGTATCAATAGTATATAAATAAAGAAAGATATTTTATGTCACGTTTAGACTCCACGTTTATTCTCAATTTTTATATTAATCTTCTATTTTTACATGAAGATTTAATTTTGAATAGATATCTGAACAAATTTCTTCTTTTCATCAAAAAAATATCTTCTTCTTTCTATTTAGTATATATCTCCCTCTCTCAAAAAACTATATAAATTACATTGCTATTTTCCAATAAATATATTACTTCATTATCTGATTAATAATATTTTTTTCTTACAAATGTTAACTATAGATAAAGGAATTTTTGTTAACCACATATTTTGAGCACAAACGAAAATCTCAAATCTTCTTTTCATCAAACATTTTTCCTTCTTCGGGTTCGCCAAACACCAATTCTATCATTTCTCTTACATATACTTTGATTTTTAATATATATATATTTCAACCACTTTGTAATGCTACTTTTTAATATAACATTTTTTCATCTTTTTGTTATTTTTATTTTTAAATTTTTGAAGACAACTTTTCAAACATCGTAAACACTTCTACTGATGTTTATACACACACACTTACAATACTTTGATTCAATTTTGATTCTCATTTAACAAATCATAAATTTCATCATTTTGTTTTTTATATTTCTTTTTCAAAAATTATGGCTACAAAATTTGACTTCATTGATGACGTCAATCAATCAATATCAATAGTATATAAATAAAGTAAGATATTTTATGTCACGTTTCGACTCCACGTTTATTCTCAATTTTTATATTAATCTTCTATTTTTATGTGAAGATTTAATTTTGCATAGATATCTGAACAAATTTCTTCTTTTCATCAAAAAAAAATTCTTCTTCTTTCTATTTAGTATATATCTCCCTCTCTCAAAAAACTATATAAATTACATTGATATTTTCCAATAAATATATTACTTCATTATCTGATTAAATAATACTTTTTTCGTACAATCGATAAAAGTATAATTTAATTTTATCATAATTTATTTTAATAGTTTATTTTTTTTCCATATTCAATATTTTTGTTTCTTTCACATTTGTTTTGAATATTTTGATTTTTGAATAATATTTATTTTAATTTGATATAAATATACCAATGTACATTTTTTTAATGTTTTCATAATATTATTTTTTAATGTTTTCATAATATTATATTTTTTATTTAAATAAACTTATTATTTTTTGAATTTTCTAAATATTTTATTTATTATTTTTTATGAAGTAATAATTTTTTTTTTGTGGTGGCCGGGGTTTGAACCCCGGACTTTGCATATTTTATGCATTGTCCCTACCAACTGAGCTATGCTCACGAGAACATGTAGCAATAATATCTCAACAAGCTAAATATCTTATATATATACTTTTTTGTTTTTCTTATATCTTATCTTTTAAAAACTAATTTTTATAATTGCTTATATTATTTGTTACTTCTTTTTATTTATCTTTTATCATCATATTCCAATTCAAACTTTCACAATAAAACTAGGTAAAAAAATTATTTCCATTTTTTAATGCTGTTTTATTTTATTACTTTATCATAGTTTATTTCAATAAATTTTTTATTTTTTATTATTTTTTATTATTTTTCAAATTTTTAGTATATTTTATTTTTTTTATGTAACATAAATATCTCAACAAGCTAAATATATTATATCCTTTTTTTTTAAAATTGCTTAAATTATTTGTTATTTCTTTATCTTTTAGCATCATATGCCAATTCAAATTTTAACTACTCACATAATTTTAGCACAAGTAGAATTACACCTTTGAAATCAACCTTCTCATTCCTGTTTGACAAATATCACTTCTATAATTTCTTTTTCATACACTTTTTCATATACTATTGATTTTTTTTTTTTGCAGAAACTTTATTAACATTATTCACACTCTAAATATAAAATATGGAGACCCAAGATTAGGATCATTAGAATGTGAAAAATGCCGAATTTCAAAGAGGTCACATAAATTTAATCGATTTGATTTTTATGTATGATAGAGCATGCATCAAATTTTTTTTCTTCGTTAAACTTTTAATAACATGATTTCACATTAACTTAATTATTTTTCTATGCTAATATTTATTTAATTTTGTTGGTGGTGATATTCTAAGGGATCAAAATTTAATGCACTGTGTGAAGCGACAATGTTACAAAATATTAATCTGTTATTATAAAAAAAAAATATCAATCTACGTTGATTGATGTAATATGTTACGAGATAAAAAAAAGTATCTTAATTGCTAATAACAACCGTAGATTTAAACGAACTTCCTATGAATATAGAATATTTTATAAAACTATAACCATTGTGAAGAAGCATAATTATTTTCAAGGAGTTAATTTATATGTCTTTTGTCTATTTATTCGTTATACTTTTTTTTTGGGTAACCATGATACATGTACACAAATTCCACCATCGTTAGCGATGACTAATCTCCGTCAGGAATCGGTGGGGCACAAAAGGTGGGTTCTTCCCTTTTAATCGATTTTTTTACTACGCATGAGCCACGAAACAAACTCATCACCACATGTTTAAAGGGACCCAAAACTCGTACTATTTGAACTAATTTGTTATTTTTAAGATATTATTATTATTGTAAATTATTCTTAATTATTTACACCATCTCACCAAAAATACCCAAAACTCATCTCACCATTTATAATTATTTTTAAGATATTATTATTATTGTAAATTTAAATAAATTTAATTTAATATACTTACATGTGTATTCGTGCACACAAACTTATTTAATATCTAACCCGGGCAACGTCCGGGCTCTAAACTAGTTTCTTATAAAAATAATTTGATAACTATTTACAACGAAGAATATCTAAATCAAAAGACCGTAGTGAGTGAAAGAAAAAAGTTAAAATTCTATTTTATGGGCATACAGATATTGACGAATGTGAAAGAAACTCACATGGATGCGATGTCATAGCAAAATGTAAGAACACTTATGGGAATTACACATGTGAGTGTCCAAAGGGGTATTTCGGAGATGGAACAAAGGAAAGAGGGTGCCAACTACATGATGCAAATGCAAATTCAATAGTACTACCTACTGTCCTTGGTAAGCAACTAAGCATGCCCTATTGATTTTGTTTAAATTGTTTTTTTTTCACTTTTTTATAATCCTTAGTGACATGCATGTTCATTTACTATGCAATAGATATTATTTAGTTAAGTGAACTATTCATAAACTGGGTTTGATATATTTTGAATGCAGGAGTAGGAGCAGCATTTATTATTCTATTTGTGGGGATAGTTTTCTTCATAATATACCAAAAAAGGAAATTTACCAAACTGAAAGAGAAGTTCTTTAGGCAGAATGGAGGTTCTATTTTGGAACAAAAACTTCTTCAAAGAAAAGACTCGTCTCAAATAGCTCACATTTTCAAAGAAAATGAACTAAGGAAAGCCACTAACAACTTTGATGAGAGCTTAATCATAGGTAAAGGAGGTTTTGGTACAGTTTTCAAAGGGGAACTAAATGATAATAGAATTGTTGCTATCAAAAAGTCCAAAACAATAGATGAAAGCCAAATTGAACAATTCATTAATGAGGTGGATGTTGTTTCTCAAATAAATCACAGGAATGTGGTCAAACTCTTAGGGTGTTGTCTAGAAACAGAAGTTCCTTTGTTGGTTTATGAGTTTGTTAGCAATGGTACTCTTTCTGAATTTATACACACACAAGGTAAGATGAACGATCCAACTTGGAAAACTCGTCTTAAGATAGCTGCAGAAGTAGCTGGAGCTCTGTCATATTTGCATTCAGCTGCCTCAATACCCATTATCCATAGAGATGTCAAGAGTGCTAACATTCTCTTAGATGGAACCAACACTGCTAAAGTATCAGATTTTGGAGCTTCAAGATTGGTTCCAATCGATCAAACTGAAGTAGCCACAATGGTGCAAGGAACTATTGGCTACTTGGATCCAGAGTATATGCAAACAAGCCAATTAACTGAAAAAAGTGATGTCTATAGCTTTGGAGTAGTTCTTGTGGAGTTGCTAACAGGGGAGAAGCCTTTTAGTTTTGGTAGGCCGGAAGAGAGAAGAAGTCTTGCTATGCATTTTCTGTCTTGCTTGGAAAAGGATAATGTGTTTGAAATTATTCAAGATGGTTTGTGGAATGAAGAAAACAAACAAGAGATCAAGGAGGTGGCTGTTCTTGCGGCGAAGTGTTTGAGACTTAGAGGGGAGGAAAGACCAAGCATGAAGGAAGTGGCTATGGAATTGGAGGGAATGAGGTTAATGGATAAGCACTCTTGGATCAATGATGACTTAAATGTAGAGGAGAGCCGGTGCTTGCTTCATGAATCATCATCTAGCCTCTATGAACCTGGTGATAGCAGCAAACATGGAGATATCAGATATGACAGCCTGAAAGAACTTGAACTGATAGTATTGGACGATGGAAGGTGA

Protein sequence

>MS.gene015930.t1

MKVMKMKHMYVLAMVILVGTVAADLATNTCSHTCGGQEIQYPFAINDTSSDSDCFLGGKLIPLTCNGSKIYLGNMEVLNITISKAEIDVLFYVSEYCGVDDNTRATLESDSYTISSKENKFVTVGSNSYGYFYVFDGDTYSTGCLTRFFDHQRSIDNGTCSGVGCCQVDIPPRMWNISIEAFNFNNESDFCSYAFVVKNGRYNFSLAHLSQGFPFKELPVVLDWTIGNESCSTASNGVNYGCKKNSYCDDKDTYFGYRCHCNPGFEGNPYHPNGCTDIDECERNSHGCDVIAKCKNTYGNYTCECPKGYFGDGTKERGCQLHDANANSIVLPTVLGVGAAFIILFVGIVFFIIYQKRKFTKLKEKFFRQNGGSILEQKLLQRKDSSQIAHIFKENELRKATNNFDESLIIGKGGFGTVFKGELNDNRIVAIKKSKTIDESQIEQFINEVDVVSQINHRNVVKLLGCCLETEVPLLVYEFVSNGTLSEFIHTQGKMNDPTWKTRLKIAAEVAGALSYLHSAASIPIIHRDVKSANILLDGTNTAKVSDFGASRLVPIDQTEVATMVQGTIGYLDPEYMQTSQLTEKSDVYSFGVVLVELLTGEKPFSFGRPEERRSLAMHFLSCLEKDNVFEIIQDGLWNEENKQEIKEVAVLAAKCLRLRGEERPSMKEVAMELEGMRLMDKHSWINDDLNVEESRCLLHESSSSLYEPGDSSKHGDIRYDSLKELELIVLDDGR