AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar XinJiangDaYe / MS.gene035144


Find 230 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 440 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-GE



Chromosome Type Strat End Strand Name
chr5.2 gene 37601943 37608354 37601943 ID=MS.gene035144
chr5.2 mRNA 37601943 37608354 37601943 ID=MS.gene035144.t1;Parent=MS.gene035144
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chr5.2 exon 37607056 37607944 37607056 ID=MS.gene035144.t1.exon2;Parent=MS.gene035144.t1
chr5.2 CDS 37607056 37607944 37607056 ID=cds.MS.gene035144.t1;Parent=MS.gene035144.t1
chr5.2 exon 37606732 37606962 37606732 ID=MS.gene035144.t1.exon3;Parent=MS.gene035144.t1
chr5.2 CDS 37606732 37606962 37606732 ID=cds.MS.gene035144.t1;Parent=MS.gene035144.t1
chr5.2 exon 37603518 37604371 37603518 ID=MS.gene035144.t1.exon4;Parent=MS.gene035144.t1
chr5.2 CDS 37603518 37604371 37603518 ID=cds.MS.gene035144.t1;Parent=MS.gene035144.t1
chr5.2 exon 37603306 37603376 37603306 ID=MS.gene035144.t1.exon5;Parent=MS.gene035144.t1
chr5.2 CDS 37603306 37603376 37603306 ID=cds.MS.gene035144.t1;Parent=MS.gene035144.t1
chr5.2 exon 37603009 37603195 37603009 ID=MS.gene035144.t1.exon6;Parent=MS.gene035144.t1
chr5.2 CDS 37603009 37603195 37603009 ID=cds.MS.gene035144.t1;Parent=MS.gene035144.t1
chr5.2 exon 37601943 37602902 37601943 ID=MS.gene035144.t1.exon7;Parent=MS.gene035144.t1
chr5.2 CDS 37601943 37602902 37601943 ID=cds.MS.gene035144.t1;Parent=MS.gene035144.t1
Gene Sequence

>MS.gene035144

ATGGTCAACATGGGTAATAGTAAAAATGCATTTGGGTCATGGTTAGATGATATCAACTACATATCTGGTTCACAAGCTGGAACTATTCTTAACTGTAAGGGTGCTAGTAATATGAATCAACGTTTTCTCGATTCAAATGACTATAACTATTCAGCACCTTATGAGTTATATTGGTCTGCAAGAACAATGAGTAGTAGCAATGGTGATTCCAACATGAGGTGCAATCTAACATGGTCATTTAGTGTTGATTCTGGATTCAAGTACCTTGTTAGGCTTCATTTCTGTGAGATATCGATGTCGGTAACAGATATTAATCAGAGGGTGTTTGGTGTTTATATAAACAACCAGACAGCAGAGGAGAAATTGGATTTAGTTGCTTTGGCTGGTGAACCTTTTACTCCTTTGTATAGAGACTATGTTGTAATGGTTTCTGTAGAGACTATGTTGATCTCACTCATCCTAATTTGGAGTCAAAACCAAAGTATGCTGATGCTATATTGAATGGTGTTGAGATTATCAAGTTAAGTGATAGCAATTTTAATCTTGCTGCAAGTTTCCAATTGAAGAATGAAAGATTACACAACAAGAAGAAATTTCCAATTTTTATTGTTGTTGTAGCTAGTACTTTAGGTTCCACTTTGGGACTTTTCGTAACATTTTTCATTCTTAGAAGAAAAGGGTGGACAGTAATAAAAAGGGGAACTTTGAATTCTACTGCAAAAGGTGAAGAAAAGATTCAAGTAAAAGTGATATCAGGTAATTGTTATCAATTCACTTTAGCAGAGATAATATCAGCAACAAATAACTTCAATGATGATCTTGTCATTGGTGAAGGTGGTTTTGGAAAGGTATACAAAGGAATGATCATGCTTGATGGAGTGACCAATGTGGCGATAAAGCGTGCTAAACCGAGTTCACGGCAAGGACTTAAGGAATTTCAAAATGAGATCAATTTTCATTCATTTTATCACATGAATTTAGTGTCATTGTTGGGCTATTGCCAAGAGAGCATTGAACTTATAATTGTGTATGAATACATGGATCAAGGTCCACTTTGTGATCATTTATACAAGAAACAGAAGCAATCACTTTCATGGAATAAAAGACTAGAGATTTGTGTTGGTGCAGCTAGAGGAATCCATTACCTTCATACAGGTAGAAAGAATCCGGTGATTCACCGCGATATAAAGTCTTCGAACATATTATTGGATCAGAATTTGGTACCAAAGGTTGCAGATTTTGGGTTGTCTAGAATGGTTAATTCTATTTACCACACTCATGTTAGCACTGAGGTTAAAGGTACATTTGGATATTTAGACCCTGAGTACTATAAGAGAAGAAAAGTAAGTGAAAAAAGTGATGTTTATTCATTTGGGGTGGTTTTGTTTGAAGTGTTGAGTGGAAGACCAGCAGTGAATTCTATGGCAGTGGAAGAGGAAAATGAGAAAGTTGGTTTGGTAGAATGGGCCATGAGTTGTTACCAAAGTGGAACTATTGATAAATTGGTTGATTCTTGTTTAGAAGGAAAAATAGGGCAAGAATGCTTAATGGCCTTTGTGGAAATTGGTGTTAAGTGCTTGGCTAGCAAGAGTTCAGAAAGGCCAACCATGGGAGAGGTGGTAAGTAATTTGGAGAAAATTCTTTCCTTGCAAGAGTTTGGAGGGACATGAAATCATTTCAGTTGATATTGATAGGTAGCACCGATACTTTAAATTAAATGTGTTTGATATCCGACACATGTTGATGTTTGACACTAACACACACTAACACAACATTGTCACGTTTAACTAATGTAGTTACACGAGATCAGACAACTTGAATTCTTAAACAAGTTGGTTGTCGGACAACCACACCTTGATTCTCAAACAGTGTAGAATTTTTTGTATATTGAAACAAATTATTATATTTCTCATCAATGAATTTTTAAAAATTGTATGAAAGCAGTGGAAAGAAATGTATGTTAAGAAAATGTGAAGTTCAAATACTAGACTTTCTAGCATTCATGTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAGCTGCTATATGCAGCGAAGAAATATTTCCCGAATGTATCCCGAAGTGACGTGTACAATGTATATATATTGAGGTGAAGATTTAAATTCCGGTTTTTATGGAATAAAGGGTGGGTGGTAGTTTAATTAACCAATCACAGCAATTTGCAATGAGTTCGGGAAGCGCTTCTTCGCTGTGTTTTGCATTTTTCTTTTTCTTTTTTTCCGATTTTTTTTTTTTATGATAAAAGATTTTTTATATTTTTTTTAGAAAATGATAAAAGACTATTTAGGGACAATGGCTAACTAGGCCTATAAATGGTCCGGTCAGCATAATTGATCGGTCATGCCATATTCATGGTTGAAATCATCAAAATGGGAAATAACTGCTGTGGTCTGGTTTGATCAGTGTCACTTACTACTGCATCAAGCTTGCTATTGTTAGAGCATCCACAATAGACGGGAAGCACTTGGGTGACATTATGTCACCGTGACATTAAATCTGGGCCACACAACACACATTGTCACACAACATCTGGGCCACACAACACATACAACACATCTGGGCCACACAGCACAACACCTTTGTGTGGCCCAGATTTAATGTCACGGTGACTTAATGTCACCCAAGTATTTTCCACAATAAGCATACTTATTTTTTTTGGTACTTAAATAGGTTTCACGCGTACACATCATTTATTTATAATTTTTTAATTTTAATAGTAGTATCTAAGAAACATTTAATCTCTCAAACCCAATATGTCACACAAATATCTTGAATGAGACCCATTATTCAACTATCAATAACTTTATATCATTACATTTTAATTTTTTAATATTAAAAAAATGTGGGTCCTACATAAGATTAGAGGTCTTAAGTGAGACCTTGAGTCTTACAAGACCCCGAAAAAGTTTATCCCCAATAGAGTACTTAATAAGTACCAAATGTTAAATGTTTAAGATCCTTCCATTGAAGATGGTTTTGGGGAGACGATATTTCCTTCTGTGTGTAAGTTTACGATGATTATCTTATGGGGATAAAAAAGAGAAAGAATAACACGCTAAATATAACAACATGCATGGTTAGTCTTACAATAGAAGTGGTTTATATGTCTCCGTGAGTTTAACTCAATTGACAAGTACACGGAAAAAAAAGTGGTTTATGTATTAAATGAATTTAGATATTTGGTGAATATGCAATATCCGGTATCTTGAGGGGCCAATAAGTTTGTTACTTTGAAATACGTGAACCAAATATTATGTCATGGAATTTCTATGTGTCTGCAGCATCAAATTAAACATATGTGCGATTTTATGACCGACAAGTGAGGGAAAGTATACATTTTCCACGAAATTGTTAATAGATTATAAAAAATCTAAGTGGATATACAACCAAAACATCAAAGGATTGAAAGAAGATTTTATTTGAAATTCAACACGACAAGAGTTTCTACTGAAAATTCAAACAATAATTTTGGAAATTAACATTGACAACGCGCTTTATATTTTGGTTGATGTTATTAGCTGGATTTGATTTAGATGCTACTGACTTCCTCTCTTTCTTGAATCACTCAAGTAAACGTGTTTGACTTAAGCACTTATGCTATTAGTCAACAAATTTATTGTTTTTTTAAGCGGCTTGAACCGTTGGGTCAGAGAAAGCCTCAAGGCTAAAAGTTAATTGCAAAATTACCTATCAACGAGATCTTCATATCTTCTATAGAATTCAAACTTAGGTGCTTGAAGAATATTAGTCTAGTCCTTACCAACTGGACCGACCTTTATATGTAACAACCAAATAATCATCTATATGCTACTTTTCCTCCAAAAAAGTTATAAAGAAGCCAAAACATAAATTTTTTTAAAGCTCATCTTATTTAGCATTTAAGAAATTTAGATACAAAAATGCTACATAAATTCATGAATGCTAACACATGTTTTGTTATGTACATATTTTTCTCAAACATTTTACACATAGTAGTTAATGCTGAGAATACTAGTTATGTCCCCTCAGAAAACATAGTTATCAATTGTGGCTCTAACACATCTCAACTTGTTCAATATGATGGTAGAATCTGGAATGGTGACATTGATTCACCATATGTACCATCCTATGAAGACATCATCAACAAGTCCTTAACAGCAAAAGCCGCTTCTTCAAATCTTCAATCCATTCCTGAAGTTCCTTATATGACAGCTAGAATCTTTCAATCTGAATTTACATATAGATTTAATGTAACTTCAGGTCCGAAATTCATACGCCTTCATTTCTACCCTTTTTCTTATTTGGATTTTAACATGTCAAAAGCTTTCTTATCAGTCACTGCTGGCAACTTCACTCTTCTGCATAACTTTAGTGTTTCTCTCAATGCAGATTACTTTAACTTAGCATATTTAATGAAAGAATTTGTTGTGCATGTAAAAGGAAATAGTTTGGAACTTACTTTCACTCCATCATCAAATGATTCTGATGCATATGCATTTGTGAATGGTATTGAAGTTGTTTCAATACCAAATGGTTTATACATTGGTGGTGATGATTCCCCTATTCCTTTAGTTGGCCAGGATACACAAGTTGTTTACATTTATAATGATTCAGCTATGGAAAATTTGTATAGATTGAATGTAGGAGGGGAACAAATTCAACCGAAATATGATACCGATATGTTTCGCAATTGGGATATCGATGATGGTTACATCTTTGGGGCGGGATATGGTATTAAACCCTTCAATAAGAGCATGAAAGTTTTGTATACTGATCATGTTCCGGAATATACTGCTCCTGATGATGTCTACCGCACGTCGCGTTCCATGGCTTCATTTGAGGAGGGACTTGTCAATTTAAATTACAATCTAACATGGTTTTTTGAAGTTGATTCTGGCTTCCTGTATCTAATTAGGCTTCATTTCTGCGAAATTTTTTATGAAATAACTAGGGTGAATGAGGTGGTTTTTTCGGTTTTTTTGAATAATCAGACAGCTGAAGAGTTTGATCCAA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Protein sequence

>MS.gene035144.t1

MVNMGNSKNAFGSWLDDINYISGSQAGTILNCKGASNMNQRFLDSNDYNYSAPYELYWSARTMSSSNGDSNMRCNLTWSFSVDSGFKYLVRLHFCEISMSRLCCNGFCRDYVDLTHPNLESKPKYADAILNGVEIIKLSDSNFNLAASFQLKNERLHNKKKFPIFIVVVASTLGSTLGLFVTFFILRRKGWTVIKRGTLNSTAKGEEKIQVKVISGNCYQFTLAEIISATNNFNDDLVIGEGGFGKVYKGMIMLDGVTNVAIKRAKPSSRQGLKEFQNEINFHSFYHMNLVSLLGYCQESIELIIVYEYMDQGPLCDHLYKKQKQSLSWNKRLEICVGAARGIHYLHTGRKNPVIHRDIKSSNILLDQNLVPKVADFGLSRMVNSIYHTHVSTEVKVLSGRPAVNSMAVEEENEKVGLVEWAMSCYQSGTIDKLVDSCLEGKIGQECLMAFVEIGVKCLASKSSERPTMGEVVINAENTSYVPSENIVINCGSNTSQLVQYDGRIWNGDIDSPYVPSYEDIINKSLTAKAASSNLQSIPEVPYMTARIFQSEFTYRFNVTSGPKFIRLHFYPFSYLDFNMSKAFLSVTAGNFTLLHNFSVSLNADYFNLAYLMKEFVVHVKGNSLELTFTPSSNDSDAYAFVNGIEVVSIPNGLYIGGDDSPIPLVGQDTQVVYIYNDSAMENLYRLNVGGEQIQPKYDTDMFRNWDIDDGYIFGAGYGIKPFNKSMKVLYTDHVPEYTAPDDVYRTSRSMASFEEGLTAEEFDPIAIGGGPGVAIYRDYVVVDKKNLAGLNPSGKKFGSSGTDTPHVVQKVKSSKKLKFILIGCGLGAVTIPILLCLVLLKFKIKVATNDFNEALLIGTGGFGSVYKGSLDDGASFVAIKRADLMSQQGVIEFETEIHLLSRVRHNNLVSLVGYCNEDDEMILVYDFMSNGNLYDQLHLKQKDQHQPHLSWIQRLEICIGVARGLHYLHTGTKPTIIHRDIKTTNILLDHNWIAKISDFGLSKESYTSLGTTIVKGSTGYLDPEYYQRRVLTEKSDLYSLGVVLLEVLSARQALSPCDDDDEHLSLAEWAKYCFENGNVEEIVDPNLEGNIVKECLELYLGVAMKCLAERGVERPSTSDALQNLFMALQIQKNGSNVQDDLQDYSDLTPGIEFSDIMMPVGR