AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar XinJiangDaYe / MS.gene35231


Find 146 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 368 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-GE



Chromosome Type Strat End Strand Name
chr6.2 gene 1939097 1945075 1939097 ID=MS.gene35231
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chr6.2 exon 1939648 1939756 1939648 ID=MS.gene35231.t1.exon17;Parent=MS.gene35231.t1
chr6.2 CDS 1939648 1939756 1939648 ID=cds.MS.gene35231.t1;Parent=MS.gene35231.t1
chr6.2 exon 1939518 1939569 1939518 ID=MS.gene35231.t1.exon18;Parent=MS.gene35231.t1
chr6.2 CDS 1939518 1939569 1939518 ID=cds.MS.gene35231.t1;Parent=MS.gene35231.t1
chr6.2 exon 1939097 1939141 1939097 ID=MS.gene35231.t1.exon19;Parent=MS.gene35231.t1
chr6.2 CDS 1939097 1939141 1939097 ID=cds.MS.gene35231.t1;Parent=MS.gene35231.t1
Gene Sequence

>MS.gene35231

ATGGAGCGAATTTCAGAAAAACGATATCCTCTCAGTGCAAAAGATTACAAGTTATATGAAGAAGTTGGGGAAGGCGTTAGTGCCTCGGTATACCGGGCTCTCTGCATTCCACTCAATGAGATTGTTGCCATCAAAGTTCTTGATCTCGAGAAGTGCAATAACGATTTGGTACGTGGGGTAGTCCCTTGTACAATTTGTAATGTTTATTGTTTTCAGTTTCCTCTTGCCTGTGCTGAATTTTATTGCATGTTTGGTTATTATTGGTCAAGTGATCCAACACTTTTTATTTCTAAAGCTGTGAAGTATATCGTGCTTGTTTGAGTTTGCCAAACTGCTATGGGATGAGGTTCTTTTTATGCGAGGCTCTGTTGAATCCAGTCACCCTTATTTAACCTAATGTTATATATAGTATCATTATATTGTTTTCATATTGTACTTGATTATCTTATCACTTAAGCTGTCTTGCTACATGTTTGGAGTCAATGTCTTAAGAACCTATAAAATTATAATTCCTGTCATTATTACACTATTTGGTGCTACATCATGTATTTGTGTCTGTTCAGTTGTTTGCTCTTTAAGTCTGGTGAGTTATTGTACTTCATTATCTTATCACTTAAGTTGTCTTGCTACATGTTTGGAGTCAATGTCTTAGGAACCTATAAATGGATAATTCCTGTCATTATTACACTATTTGGTGCTACATCATGTATTTGTGTATGTTCAGTTGTTTGCTCTTTAAGTCTGGTGAGTTAATATGTGTACTTGCACAGTTGCCTCCATTTTCTATAATACAAGAAAAATTTCTATCCCTGTTCACTGTCCCATAAATAATTGTGCAAATGTTTATTCTATTGCCGTACACTATAAATATTGCGGGATTGTATTCCATTGCTGTACATTCATAATGATGGGTGCACAAATATATGCAGGATGGAATTCGGAGAGAGGTACAGACCATGAGCTTGATTGATCATCCAAATCTTTTACGGGCACATTGTTCTTTTACCGCTGGGCACAGTCTTTGGGTTGTGATGCCATTCATGTCAGGGGGCTCTTGCCTTCATATAATGAAATCTTCCTTTCCTGAGGGTTTTGATGAACCTGTTATTGCAACTGTATTACGCGAGGTTCTCAAAGCTCTTGTTTATCTCCATGCCCACGGGCACATACATAGAGATGTTAAGGTATTGTGCTACATCTTAACTTATACTAATTGTCACCTTTTTAACAGATATGCACCCTTTTGATAGTGTATATTGAGAATTTTTCAGTTAGAATTCTTAATTATTATAAACTAGGTGGAATAGTGAGATTGAATGATTTTAAAAGAACTTAGTTTCTGCTTTTGTGCTGCTTGTAAGACTGTATCTGAAACCCAGTATTAATTTATTTTTATTTCCGTGAATTTTTATCTGCCTTTTCTCCACATGTTTGTATTCACTGTGTCCTCTTTTTATCCTCTTTCAAACATTCTTAACTATGCAGGCTGGGAATATTTTGCTTGATGCTAATGGTTCAGTCAAAATGGCTGACTTTGGAGTGTCTGCATGTATGTTTGATACTGGAGACAGGCAACGTTCAAGAAATACTTTTGTTGGAACACCTTGCTGGTACCATTTTCTTTCTACCAAGTCTTTGTAGTTTTTCATGTGAAATCTGGCTACCCTCGTATGAGTGAGACTGTTTAAGCTATACATTATGCTAATTTTACACAGGATGGCTCCTGAAGTTATGCAGCAATTGCATGGATATGATTTTAAGTGAGTGCCTTCTATTCTCTTCCTCCATCCACTGATGATTTTTTTTTCCTTTAAAAAGGATCTTGCTCCATGATATCTTAGTTTTTGTTGAGTTTTTTATATTTTCATTTTCTCTATTAACAGAGCAGATATATGGTCATTTGGTATAACAGCACTTGAACTTGCTCATGGTCATGCCCCATTTTCCAAGTATCCGCCTATGAAAGTAATTTACTTCTCCTGTTTCTTCTAAATTTGTTTGCATGTGTCTACTGATTCCACTGTGAGCTAAGAGTTCAATTCTTTCCCTTATTTTCTTGGATGCAGGTTTTGCTTATGACTTTGCAGAATGCCCCTCCAGGTCTTGATTATGAAAGAGACAAGAGATTTTCAAAGGTTTGTGGTGTTCACTCAAAACTATGTATCACCTGTTACTTAGAAAGGTATTTATATATAGATTGTTCTTCTTTCTTTCAGTCTTTCAAAGAGTTAGTTGCCACCTGCTTAGTCAAAGACCCAAAGAAGCGTCCAAGTTCAGAAAAGCTTTTAAAGCACCACTTCTTTAAACATGCACGTGCGACCGAATATCTATCTCGCACCATTCTCGAGGGCCTTGCTCCATTAGGAGATCGTTTTAGACAGCTGAAGGTTTGATGTTCAATTCTCAATTCTTCTGTTCTGTGTAAAATTGTTTGGGTAATAATACCGTTCCTCTGATTTGCTTGTGTGTTCTAGGCTAAAGAGGCAGATTTATTAATGCAAAACAAGGCTCTTTATGAGGATATGGAGCAATTATCTCAGGTAGGTCGATTATAAATCCCCTCTGGTTTGTGCTTGCTTCTGGCATGGTCTATACAGAAGTGGTTTTTATGAGTGCTGTCTTAAATGCATGTCATTTTGCCTTATTTCCCTTTCTGCGCTGTATCTGATTTAAATTTGTAATTTTCAATTAGACCTTGAGGGTTTAAGAATATGCTATATTTGACCATGCAACAATTTTAATTACAGAAAGAATATATTCGAGGAATTAGTGCATGGAATTTTAACCTGGAAGATTTAAAAAGTCAAGCTGCTCTTGTAAGTATTTTCACCTTTCTATTTTTTGTGATCTATTTAAACTAGATGGGGAAGTTAGTCATTATTACAAACATTTTTGTGTTGACAACAGATCCAAGATGAAGACATGTCAAATGCAGAAGAGCCAGATGTGGCTAAGAAGAATGAAGACACATCAAATGACTTAAAGGTTCCCGCGGAGGACCTTTCTGCCTCTAATCATTCAGATGGTACATCCACACTGGACAAAGAGGTACTGTTGTCCTAAATTAGCTTATCATTTGCATTTGGTTCTTTTTGAACTCTAATGTATTTGTGTTGCATCTTATTTCAGGATGGATTCAACAATCTTCAGGATTTGGAAAGTTCGCTTGCTTCATTTCCTATGAAACCTCTTCAAGCACTCAAGTATGCTCATCTCGTACATTTGTTTTTCCATTTCCTACTTATTTAGCGCTATCTTTTCAAGTGTTGGTACTTGGTATTGTGACTAGTTAAAGATTGGGTTTTTATTTTACTTAATGCTGTCTCATTTTGTTATTAAAGTAAAGTATTTGCCGAAAAAACCAGGCCTTTCATTTATCACTCGTATTAATTTTTCATTAAATTTCTGTATATATGATGTGTCCATCTTTTTACTATCCTATGATCTATATAAAATCTCGTTTATAGTTCATGCAATGTTATTTCAGATCATTTTCTTCATTCATATATAAAAACATAATATCTATACAATTATTTTTGTATGAAAAAGAATTAAAAGATAAATTGAGACGTAGCAAATGGTAGACGTTTAAACAATCAATTGATTTTGTTTTTGGCTGCAAATTTTAATTCTTCCTTGTATTTTCAAGAATTATGTAATAATTTAGCAATTCAGTTTCAAAGAGAAAATATTATTTCTGATATGCAATTTATGCAGAGGTTGTTTTGATGTTGGTGACGATGATGCCAATAATACTAGCCCAAGAGATTTGGATCACGGCTATGGAAGGATTGATAATGAAAGTGCTGGGCCAAGTAATTTGTCACCTCAAAATGCTCAGCCTAAGAAGTTTTTGAGTGGCTCTTTACAATCTGATAATTTTGCCAAAAAGGTTACGGATGGGGACAGGTAACTTTTTCCTTTGACAGTTTTTTTTTTTCTTCATCTATCTCTGCTTTACATTTATTTTGAACGTGTTACTAGAGCTTTTATTTGGACAGTTCCATGCAAATTAATTATTTTTTCTCACCTCTACATGAGTTTTTTGAGCTTGTTACCAGAACTTCTATACATATATCTATTTGGAAATGAACTTCTTACCAAATTGAATTTATGTTAGTAGAACTTGCAAATGCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTAAGTATATATTTTAGTTTCTTTACTACTGCTGCATATTTGACTGAGTTGCATTATTACTATTAGTGTACTAATTATGTATTGTGTATCTTGAAAGGGATTATGTACAAACAAAATATCCTTCCGAGCGTAATCACAGTGGTCCATTATATCGGCAGAGGAGAGAAATCAACAACTTTCCATCGGGTACATATATACTTTTATGCAAATGTGATTGGTGTTTTGATAATCTTTTAAGTTTTTTTCGTCTTATCAACAAGTTTTGTAGTTGTTTTATCTGAAAAATAAGACCGGGAAATGGCTCTTAAATAATTGTTTCAATGCTGCTTCCATATGCAGTTGATGACACATCTGAAGGAGCAATTGTCCAGCGCAGGGGGCGGTTTAAGGTCACATCTGCAGATCCCAGTTCAATGGTATGTATTATATGGCAGATATTTTTTTCCTGCCCAATACTCTTGTTACCTCTAACAAGTTTTTTTTGCATGATGAATCATCATAGGATGCGGTTATTTATCTTTCAATCCTGAATTTCTCCATTAATTTCTAATTTAGAGCTTTCAAGTCTTATTATCTGCACGCTTAACTATTAACATCTGTATTGTTATATTGAGACTAAATGAAATTATGGTTGGATTTCGACGTGCCATGATGTTTGATTTCATTGACATTGAGGATGGAACTTAAGCGATTTATGTTTTAGGCATTGACTTTGTAATCATTGCCCTTTTTTTCTCCTCATTCAGGGTCTTTCAAACAACACTTCTGGCCCAGTTGCCGTAAGTCCTACTCCTACCAGTCC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Protein sequence

>MS.gene35231.t1

MERISEKRYPLSAKDYKLYEEVGEGVSASVYRALCIPLNEIVAIKVLDLEKCNNDLDGIRREVQTMSLIDHPNLLRAHCSFTAGHSLWVVMPFMSGGSCLHIMKSSFPEGFDEPVIATVLREVLKALVYLHAHGHIHRDVKAGNILLDANGSVKMADFGVSACMFDTGDRQRSRNTFVGTPCWMAPEVMQQLHGYDFKADIWSFGITALELAHGHAPFSKYPPMKVLLMTLQNAPPGLDYERDKRFSKSFKELVATCLVKDPKKRPSSEKLLKHHFFKHARATEYLSRTILEGLAPLGDRFRQLKAKEADLLMQNKALYEDMEQLSQKEYIRGISAWNFNLEDLKSQAALIQDEDMSNAEEPDVAKKNEDTSNDLKVPAEDLSASNHSDGTSTLDKEDGFNNLQDLESSLASFPMKPLQALKGCFDVGDDDANNTSPRDLDHGYGRIDNESAGPSNLSPQNAQPKKFLSGSLQSDNFAKKVTDGDRDYVQTKYPSERNHSGPLYRQRREINNFPSVDDTSEGAIVQRRGRFKVTSADPSSMGLSNNTSGPVAVSPTPTSPPNQNSMAASILPSLQCILQQNGLQREEIVKLIKYAEQSYGKNTESIEGGATDALQASPVSTREKELHLQVIQLQQSIGSLVEELQRQKLKNVQLERQLSSMVNKVEK