AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar XinJiangDaYe / MS.gene54213


Find 307 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 447 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-GE



Chromosome Type Strat End Strand Name
chr5.1 gene 6802417 6808414 6802417 ID=MS.gene54213
chr5.1 mRNA 6802417 6808414 6802417 ID=MS.gene54213.t1;Parent=MS.gene54213
chr5.1 exon 6808367 6808414 6808367 ID=MS.gene54213.t1.exon1;Parent=MS.gene54213.t1
chr5.1 CDS 6808367 6808414 6808367 ID=cds.MS.gene54213.t1;Parent=MS.gene54213.t1
chr5.1 exon 6808197 6808286 6808197 ID=MS.gene54213.t1.exon2;Parent=MS.gene54213.t1
chr5.1 CDS 6808197 6808286 6808197 ID=cds.MS.gene54213.t1;Parent=MS.gene54213.t1
chr5.1 exon 6808039 6808091 6808039 ID=MS.gene54213.t1.exon3;Parent=MS.gene54213.t1
chr5.1 CDS 6808039 6808091 6808039 ID=cds.MS.gene54213.t1;Parent=MS.gene54213.t1
chr5.1 exon 6807754 6807829 6807754 ID=MS.gene54213.t1.exon4;Parent=MS.gene54213.t1
chr5.1 CDS 6807754 6807829 6807754 ID=cds.MS.gene54213.t1;Parent=MS.gene54213.t1
chr5.1 exon 6807469 6807530 6807469 ID=MS.gene54213.t1.exon5;Parent=MS.gene54213.t1
chr5.1 CDS 6807469 6807530 6807469 ID=cds.MS.gene54213.t1;Parent=MS.gene54213.t1
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chr5.1 exon 6807134 6807193 6807134 ID=MS.gene54213.t1.exon7;Parent=MS.gene54213.t1
chr5.1 CDS 6807134 6807193 6807134 ID=cds.MS.gene54213.t1;Parent=MS.gene54213.t1
chr5.1 exon 6805375 6806997 6805375 ID=MS.gene54213.t1.exon8;Parent=MS.gene54213.t1
chr5.1 CDS 6805375 6806997 6805375 ID=cds.MS.gene54213.t1;Parent=MS.gene54213.t1
chr5.1 exon 6804275 6805144 6804275 ID=MS.gene54213.t1.exon9;Parent=MS.gene54213.t1
chr5.1 CDS 6804275 6805144 6804275 ID=cds.MS.gene54213.t1;Parent=MS.gene54213.t1
chr5.1 exon 6802417 6803523 6802417 ID=MS.gene54213.t1.exon10;Parent=MS.gene54213.t1
chr5.1 CDS 6802417 6803523 6802417 ID=cds.MS.gene54213.t1;Parent=MS.gene54213.t1
Gene Sequence

>MS.gene54213

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Protein sequence

>MS.gene54213.t1

MNQYHIYEAIGRGRYSTVYKGRKKNTVEYFAIKSVDKSYKNKVLQEVRILHTLDHQNVLNFYSWYETSAHLWLVLEYCVGGDLLSILRQDSQLPEDSVNELACDLVRALQYLHSNGIIYCDLKPSNILLDENGCTKLCDFGLARRLKEISKVPSSSLPQAKRGTPSYMAPELFDDGGVHSYASDFWALGCVLYECYAGRPPFVGRELTQLVKSIISDPTPPLPGNPSPPFVNLINSLLVKDPAERIQWHELCGHAFWKTKFTLVSLPPQPAFDDMTELHAKQCLSERNGDKSSHNRTPPKYREKDVKGARGIETPTRATPNGHKTQTKGSGRTLEAKQKDPSIIKKGLNLLRMSIIAKSNLQKENEKENYRRPLPNGSEKDADVKIENTDMELDFNENSEEDALDETDGSEHTPSVPNEKMESNFQNQGKADDTENDIRRLDTPSVTTPASDDSRSFVHESTPDRPDISAISPSVSPLVKKQRLKDDLGSGLDSDSSRSSNDISHVIWHPSDLSVRPVMPSRKVDKGSEVIPSLPFEVLQAPEFVKMPKEQLEALQNRIIAILNGSTSIGEKQNVVRYLETLSSNADAANILTNGPIMLILVKLLRQSKASALRVQLASLIGLLIRHSTFVDDSLASSGILGSLMDGLRDRQEKVRRFSMAALGELLFYISTQSADSRDNTPLESPSKDNRTVHGWQVPNSLISLVSSILRKGEDDITQLYALRTIENICSQGGAWVGRLTSQEVISNLCYIYRAAGKLESMRLTAGSCLVRLVRFNPPSIQSVIEKLSFKDLASALVKGSPREQQISLNLLNTAMLGSHMITNVGRYLIQLAEDKNLIPSLLALVEQGSEVLKGKALVFVAFLCKHGRRWLPQFFCSHKLLSVVDRLGKEKDAFVRQCLDAFLHIVASTIPGLLDIITGDIQQMMGGRRHGHISSLTSRSAPKSNIHLFPVVLHLLESSAFNHKVVTLPVLRQLANLIKLVEAPFQGRDDFQITLLRILESLTEESSVILANPDIFLREILPSLTVLYKGNKDGDARFLCLKIFFDVMIILLSEPVEEEQRLNDLKFVSITHFIPLYPTLIEDEDPIPIFAQKLLVMLLEFSFISIPDILHLKTILQCFEFLLGDLSNANVNNVKLCLALASAPEMESKLLSQLKVVRRVGNFLEFVCAKGMEELLEPTLGLCRAFLARSVSCTKGFSYTTEPTLLGDCPEVSGAVDPQQCIRDIADFGSNVGVFLELSGETSVADIASQCVVLLLKAAPREATTGLLTNLPKVIVILESWSKDTPHLTVQRMLHALGYACKQYLLHAMILSISIPDISRIEVIVSGLKNSSVPALANTARLAALELQRLPRCV