AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar XinJiangDaYe / MS.gene54583

Query id Subject id identity % alignment length mismatches gap openings q. start q. end s. start s. end e-value bit score
MS.gene54583.t1 MTR_4g066380 84.807 362 25 4 1 362 1 332 0.0 568
MS.gene54583.t1 MTR_4g067010 83.721 344 30 4 1 343 1 319 0.0 566
MS.gene54583.t1 MTR_4g066460 83.430 344 37 4 1 342 1 326 0.0 548
MS.gene54583.t1 MTR_6g047570 66.197 355 91 9 1 345 1 336 3.01e-153 435
MS.gene54583.t1 MTR_0011s0260 64.171 374 89 7 1 344 1 359 1.07e-144 414
MS.gene54583.t1 MTR_0011s0210 64.000 375 90 7 1 345 1 360 2.14e-143 411
MS.gene54583.t1 MTR_0250s0040 58.410 327 70 7 23 345 1 265 1.82e-119 347
MS.gene54583.t1 MTR_0246s0020 54.381 388 125 8 1 345 1 379 1.50e-115 341
MS.gene54583.t1 MTR_0246s0020 52.368 380 127 9 1 337 1 369 4.17e-103 309
MS.gene54583.t1 MTR_4g098035 48.378 370 138 11 1 345 1 342 2.44e-94 285
MS.gene54583.t1 MTR_0246s0050 47.701 348 130 10 22 345 2 321 8.67e-87 265
MS.gene54583.t1 MTR_6g047550 57.087 254 71 5 1 234 1 236 1.33e-81 250
MS.gene54583.t1 MTR_5g014520 43.109 341 148 12 17 341 20 330 1.96e-63 206
MS.gene54583.t1 MTR_5g014560 46.725 229 101 6 121 341 89 304 2.17e-52 176
MS.gene54583.t1 MTR_5g014600 35.328 351 181 10 13 340 7 334 2.24e-46 161
MS.gene54583.t1 MTR_4g097920 36.704 267 144 6 97 343 52 313 6.78e-44 154
MS.gene54583.t1 MTR_4g097920 36.704 267 144 6 97 343 67 328 1.05e-43 154
MS.gene54583.t1 MTR_4g097940 37.079 267 143 6 97 343 67 328 1.99e-43 153
MS.gene54583.t1 MTR_2g104490 36.042 283 159 7 60 339 43 306 2.16e-42 150
MS.gene54583.t1 MTR_4g009540 41.748 206 102 6 152 341 128 331 3.96e-42 150
MS.gene54583.t1 MTR_2g104550 38.397 237 134 4 109 340 82 311 2.08e-41 148
MS.gene54583.t1 MTR_2g010450 43.784 185 98 2 163 343 171 353 3.54e-41 148
MS.gene54583.t1 MTR_8g009020 38.367 245 129 5 109 341 89 323 6.16e-41 147
MS.gene54583.t1 MTR_4g092700 36.641 262 148 5 94 343 78 333 4.26e-40 145
MS.gene54583.t1 MTR_4g097950 45.699 186 89 4 168 342 67 251 3.74e-39 140
MS.gene54583.t1 MTR_4g009110 36.614 254 132 6 102 341 112 350 1.43e-38 141
MS.gene54583.t1 MTR_5g014640 39.899 198 116 2 146 340 126 323 1.90e-38 140
MS.gene54583.t1 MTR_2g104490 38.222 225 128 5 100 320 70 287 2.96e-36 134
MS.gene54583.t1 MTR_2g104650 44.624 186 94 4 160 337 81 265 7.08e-36 132
MS.gene54583.t1 MTR_4g009540 41.530 183 93 5 152 320 128 310 1.30e-34 129
MS.gene54583.t1 MTR_2g104560 38.579 197 102 6 157 342 38 226 1.35e-34 127
MS.gene54583.t1 MTR_7g080780 37.264 212 124 3 130 341 114 316 4.84e-34 128
MS.gene54583.t1 MTR_7g080780 36.792 212 125 3 130 341 127 329 6.44e-34 128
MS.gene54583.t1 MTR_8g069740 42.105 171 90 4 157 319 96 265 4.63e-33 124
MS.gene54583.t1 MTR_8g009010 34.061 229 112 3 109 336 77 267 1.06e-30 119
MS.gene54583.t1 MTR_2g104530 35.870 184 109 3 157 336 91 269 3.44e-29 114
MS.gene54583.t1 MTR_2g104590 35.238 210 105 7 138 337 32 220 1.90e-27 108
MS.gene54583.t1 MTR_2g104500 34.951 206 107 7 157 341 73 272 2.92e-27 109
MS.gene54583.t1 MTR_4g009510 37.059 170 93 5 173 339 45 203 4.61e-25 101
MS.gene54583.t1 MTR_5g014550 47.619 126 55 3 201 319 54 175 7.36e-23 95.1
MS.gene54583.t1 MTR_7g451650 35.948 153 77 2 194 339 57 195 1.54e-22 94.4
MS.gene54583.t1 MTR_4g009420 34.706 170 79 4 178 339 50 195 2.38e-21 91.3
MS.gene54583.t1 MTR_7g050350 34.694 147 75 2 200 339 1 133 1.90e-20 86.7
MS.gene54583.t1 MTR_7g451650 34.694 147 75 2 200 339 1 133 1.90e-20 86.7
MS.gene54583.t1 MTR_8g024790 30.178 169 108 4 143 304 263 428 1.45e-16 81.3
MS.gene54583.t1 MTR_1g072320 31.250 144 84 2 171 301 470 611 1.51e-16 81.6
MS.gene54583.t1 MTR_8g067280 30.723 166 91 2 163 304 444 609 2.81e-16 80.9
MS.gene54583.t1 MTR_7g451650 33.333 138 71 2 194 324 57 180 5.38e-15 73.2
MS.gene54583.t1 MTR_5g030430 30.539 167 98 3 156 304 474 640 1.05e-14 75.9
MS.gene54583.t1 MTR_3g030700 31.613 155 98 2 173 319 198 352 4.41e-14 73.2
MS.gene54583.t1 MTR_8g024770 28.108 185 104 6 116 277 214 392 5.06e-14 73.6
MS.gene54583.t1 MTR_3g498695 28.649 185 118 3 173 344 300 483 8.63e-14 72.8
MS.gene54583.t1 MTR_8g064700 26.627 169 108 4 161 317 234 398 9.25e-14 72.4
MS.gene54583.t1 MTR_4g009420 31.973 147 69 3 194 332 65 188 1.14e-13 69.7
MS.gene54583.t1 MTR_7g117670 29.560 159 103 2 167 321 394 547 3.12e-13 71.2
MS.gene54583.t1 MTR_3g498695 28.649 185 117 4 173 344 300 482 5.96e-13 70.1
MS.gene54583.t1 MTR_7g096350 34.234 111 63 1 138 238 312 422 9.01e-13 69.7
MS.gene54583.t1 MTR_8g027495 45.833 72 35 1 171 238 458 529 3.16e-12 68.2
MS.gene54583.t1 MTR_3g104100 26.452 155 101 2 173 314 197 351 1.47e-11 65.5
Query id Subject id identity % alignment length mismatches gap openings q. start q. end s. start s. end e-value bit score
MS.gene54583.t1 AT4G37850 42.157 204 104 6 151 343 128 328 1.19e-39 144
MS.gene54583.t1 AT4G37850 42.157 204 104 6 151 343 128 328 1.19e-39 144
MS.gene54583.t1 AT2G22760 39.362 188 107 3 160 340 108 295 1.13e-37 137
MS.gene54583.t1 AT2G22750 33.053 357 189 13 8 342 4 332 2.05e-33 127
MS.gene54583.t1 AT2G22760 40.719 167 93 2 160 320 108 274 3.41e-33 125
MS.gene54583.t1 AT2G22750 38.136 236 123 5 129 342 70 304 4.26e-33 125
MS.gene54583.t1 AT2G22750 38.136 236 123 5 129 342 94 328 4.82e-33 126
MS.gene54583.t1 AT2G22750 33.053 357 188 14 8 342 4 331 3.63e-32 124
MS.gene54583.t1 AT2G22750 38.136 236 122 6 129 342 70 303 6.67e-32 122
MS.gene54583.t1 AT2G22770 36.702 188 101 1 170 339 131 318 1.05e-31 122
MS.gene54583.t1 AT5G46760 31.658 199 104 7 156 324 396 592 6.75e-20 91.7
MS.gene54583.t1 AT4G17880 32.093 215 110 5 114 304 350 552 5.62e-19 89.0
MS.gene54583.t1 AT1G32640 29.592 196 118 6 163 344 434 623 1.09e-16 82.0
MS.gene54583.t1 AT1G01260 29.375 160 91 3 161 317 420 560 2.76e-14 74.7
MS.gene54583.t1 AT1G01260 29.375 160 91 3 161 317 420 560 2.76e-14 74.7
MS.gene54583.t1 AT1G01260 29.375 160 91 3 161 317 420 560 2.76e-14 74.7
MS.gene54583.t1 AT2G46510 45.946 74 30 1 163 226 377 450 8.15e-14 73.2
MS.gene54583.t1 AT4G16430 38.235 102 59 1 156 253 301 402 1.64e-13 72.0
MS.gene54583.t1 AT4G09820 27.976 168 97 2 122 289 321 464 1.79e-13 72.0
MS.gene54583.t1 AT4G00870 32.374 139 80 3 150 279 230 363 1.55e-12 68.9
MS.gene54583.t1 AT5G46830 29.412 153 83 4 167 304 335 477 3.82e-12 67.8
MS.gene54583.t1 AT5G41315 28.000 200 112 7 162 333 437 632 1.25e-11 66.6
MS.gene54583.t1 AT5G41315 28.000 200 112 7 162 333 432 627 1.26e-11 66.6
MS.gene54583.t1 AT5G41315 28.000 200 112 7 162 333 440 635 1.35e-11 66.2
MS.gene54583.t1 AT1G12860 29.282 181 118 5 173 344 269 448 3.14e-11 65.1
MS.gene54583.t1 AT3G26744 29.091 165 104 3 172 323 308 472 7.99e-11 63.9
MS.gene54583.t1 AT3G26744 29.091 165 104 3 172 323 308 472 7.99e-11 63.9
MS.gene54583.t1 AT3G26744 29.091 165 104 3 172 323 308 472 7.99e-11 63.9
MS.gene54583.t1 AT1G63650 27.219 169 97 4 171 316 405 570 9.46e-11 63.5
MS.gene54583.t1 AT1G63650 27.219 169 97 4 171 316 405 570 9.46e-11 63.5
MS.gene54583.t1 AT1G63650 27.219 169 97 4 171 316 405 570 9.46e-11 63.5

Find 55 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 0 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ATGACAATATTGAAGTTTAT+TGG 0.177550 4.3:+37612866 MS.gene54583:CDS
CAGCAGCTGGTTAACTGATT+TGG 0.268145 4.3:+37608103 MS.gene54583:CDS
CAAGTGGAAGCAAGAGTATT+AGG 0.274085 4.3:+37612391 MS.gene54583:CDS
TCTTGTTCCTAACCTTAAAA+AGG 0.274757 4.3:+37608945 MS.gene54583:CDS
ATTGATGATACTTTCATTGC+TGG 0.287035 4.3:-37608080 None:intergenic
TCAAGAGCACAAGGGGCTTT+TGG 0.303932 4.3:+37612441 MS.gene54583:CDS
CATCAGCATCAAGGAAATTC+AGG 0.324134 4.3:-37608471 None:intergenic
GATGGTGATGGAGAAATATT+TGG 0.350142 4.3:-37608649 None:intergenic
ATCAGTGTCTCCAACCGAAT+TGG 0.364748 4.3:+37608756 MS.gene54583:CDS
GATAGTGTTGAATGTGTTGT+TGG 0.376948 4.3:+37612358 MS.gene54583:CDS
CTGCAAGAGCAATGAAGGTC+TGG 0.389825 4.3:-37608921 None:intergenic
ACTCTTGCTTCCACTTGAAA+TGG 0.401306 4.3:-37612385 None:intergenic
ATCGCTGCATAGGCATGGTT+TGG 0.409003 4.3:-37612314 None:intergenic
AGAAACCTCAAAAGGGTCAT+TGG 0.411401 4.3:+37608798 MS.gene54583:CDS
AATAGCAGTGTCTTACCCTT+TGG 0.414898 4.3:+37612508 MS.gene54583:CDS
TAGGAAAACAAATGTTGATT+CGG 0.415655 4.3:+37612410 MS.gene54583:CDS
CACTCAACAGAAACCTCAAA+AGG 0.444007 4.3:+37608790 MS.gene54583:CDS
CAAACAACAATGTTTAACTC+TGG 0.449913 4.3:+37608543 MS.gene54583:CDS
AAAGAGGAGTTAGATGGTGA+TGG 0.464747 4.3:-37608661 None:intergenic
AAACAACAATGTTTAACTCT+GGG 0.467228 4.3:+37608544 MS.gene54583:CDS
TTGATGATACTTTCATTGCT+GGG 0.467665 4.3:-37608079 None:intergenic
TGACTTGCTGAGATTATTTG+TGG 0.472239 4.3:-37608575 None:intergenic
GCTGAGATTATTTGTGGAAG+TGG 0.485912 4.3:-37608569 None:intergenic
AAGAGCTGCAAGAGCAATGA+AGG 0.492283 4.3:-37608926 None:intergenic
AACTGAAAAGAGGAGTTAGA+TGG 0.496291 4.3:-37608667 None:intergenic
AGCAAAAGGCCTCGTGCTCA+TGG 0.502148 4.3:+37608853 MS.gene54583:CDS
AATTTCCTTGATGCTGATGT+AGG 0.503309 4.3:+37608475 MS.gene54583:CDS
GGTAACTACCTGAGCAATGA+TGG 0.506977 4.3:-37612551 None:intergenic
TTCCTTGATGCTGATGTAGG+AGG 0.513457 4.3:+37608478 MS.gene54583:CDS
TGACATTACCATCATTGCTC+AGG 0.520672 4.3:+37612543 MS.gene54583:CDS
TGCAAGAGCAATGAAGGTCT+GGG 0.523923 4.3:-37608920 None:intergenic
CGTTGAATCATATTTGAAGC+CGG 0.535217 4.3:+37617615 MS.gene54583:CDS
AAGGCCTCGTGCTCATGGTA+AGG 0.535577 4.3:+37608858 MS.gene54583:CDS
TCCTTGATGCTGATGTAGGA+GGG 0.555978 4.3:+37608479 MS.gene54583:CDS
GCATCCGCTGAAGTCTGTGC+CGG 0.560686 4.3:-37617634 None:intergenic
AAGTATCATCAATCAGCAGC+TGG 0.573007 4.3:+37608090 MS.gene54583:CDS
TTAAGGAACTGGAACGGAGA+AGG 0.575849 4.3:+37617579 MS.gene54583:intron
GTCAAGTGTAGAATCTCCAA+AGG 0.576619 4.3:-37612524 None:intergenic
TCTTCATCGCTGCATAGGCA+TGG 0.581383 4.3:-37612319 None:intergenic
AAGAATCTTCATCGCTGCAT+AGG 0.581886 4.3:-37612324 None:intergenic
ACCCTCCTACATCAGCATCA+AGG 0.584158 4.3:-37608480 None:intergenic
TGGTATTTGAAACTGAAAAG+AGG 0.585974 4.3:-37608677 None:intergenic
ACTCAACAGAAACCTCAAAA+GGG 0.587077 4.3:+37608791 MS.gene54583:CDS
TACAATGTCAAGAGCACAAG+GGG 0.594830 4.3:+37612434 MS.gene54583:CDS
AGACTTCAGCGGATGCTGCA+AGG 0.600912 4.3:+37617641 MS.gene54583:CDS
TGTTGGTTCACCATTTCAAG+TGG 0.611743 4.3:+37612375 MS.gene54583:CDS
GATACAATGTCAAGAGCACA+AGG 0.611765 4.3:+37612432 MS.gene54583:CDS
TCATGGTAAGGATCACATCA+TGG 0.611981 4.3:+37608870 MS.gene54583:CDS
TCAAGTGTAGAATCTCCAAA+GGG 0.613125 4.3:-37612523 None:intergenic
CGAATACAATATATTTGCTG+AGG 0.615306 4.3:+37608441 MS.gene54583:CDS
AACAACAATGTTTAACTCTG+GGG 0.649069 4.3:+37608545 MS.gene54583:CDS
GAAGCCGGCACAGACTTCAG+CGG 0.650437 4.3:+37617630 MS.gene54583:CDS
CTCCTCTTAAGGAACTGGAA+CGG 0.655275 4.3:+37617573 MS.gene54583:intron
TGATCCTTACCATGAGCACG+AGG 0.705697 4.3:-37608862 None:intergenic
ATACAATGTCAAGAGCACAA+GGG 0.744485 4.3:+37612433 MS.gene54583:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content


Chromosome Type Strat End Strand Name
chr4.3 gene 37608062 37617669 37608062 ID=MS.gene54583
chr4.3 mRNA 37608062 37617669 37608062 ID=MS.gene54583.t1;Parent=MS.gene54583
chr4.3 exon 37608062 37608124 37608062 ID=MS.gene54583.t1.exon1;Parent=MS.gene54583.t1
chr4.3 CDS 37608062 37608124 37608062 ID=cds.MS.gene54583.t1;Parent=MS.gene54583.t1
chr4.3 exon 37608433 37608966 37608433 ID=MS.gene54583.t1.exon2;Parent=MS.gene54583.t1
chr4.3 CDS 37608433 37608966 37608433 ID=cds.MS.gene54583.t1;Parent=MS.gene54583.t1
chr4.3 exon 37612205 37612564 37612205 ID=MS.gene54583.t1.exon3;Parent=MS.gene54583.t1
chr4.3 CDS 37612205 37612564 37612205 ID=cds.MS.gene54583.t1;Parent=MS.gene54583.t1
chr4.3 exon 37612815 37612887 37612815 ID=MS.gene54583.t1.exon4;Parent=MS.gene54583.t1
chr4.3 CDS 37612815 37612887 37612815 ID=cds.MS.gene54583.t1;Parent=MS.gene54583.t1
chr4.3 exon 37617584 37617669 37617584 ID=MS.gene54583.t1.exon5;Parent=MS.gene54583.t1
chr4.3 CDS 37617584 37617669 37617584 ID=cds.MS.gene54583.t1;Parent=MS.gene54583.t1
Gene Sequence

>MS.gene54583

ATGGAGGAAATCAACAACCCAGCAATGAAAGTATCATCAATCAGCAGCTGGTTAACTGATTTGGTAAGAAAATCACATATGGTCGATTATTAATTAATTATTTTGGCTTTAATTAAGTTAAATGTAAGCTAAGTGAAGTTTGAGTTTGAGATCTAACGTAATTTGTGAGTTTGAGATCTTTGTCTTCCACTTCAGAATATCCGTCACAAGGGACATAAGCCTAACCTTAAATAAGAATAAACATAGATCTGAAATATAGTTATACCTTTTCAAATATATCTGTAGACCAAATCTCCAAGATTTGTCTCAACGTTTGGAATAACATAGTCATTAATTAATTAACACTTGAACTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGGAAATGAACGAATACAATATATTTGCTGAGGAATGCAACCTGAATTTCCTTGATGCTGATGTAGGAGGGTTTCTTTCACAAGACATGTCTAATGTATTTCAAGAACAAAACAAACAACAATGTTTAACTCTGGGGTCCACTTCCACAAATAATCTCAGCAAGTCATTCATTCATGAAACAATTGATAATAATGACAAAATCAATGAATCACTTTCACCAAATATTTCTCCATCACCATCTAACTCCTCTTTTCAGTTTCAAATACCATCTTTTGACAACCCCCCAAATTCACCCCCTAGTAACTCAAAAGAGAATGAAACAATATCAGTGTCTCCAACCGAATTGGAAAATATGAATCACTCAACAGAAACCTCAAAAGGGTCATTGGAAAATGAAAAGTTTGAAGCAAAAACCTCAAAAAGCAAAAGGCCTCGTGCTCATGGTAAGGATCACATCATGGCTGAGAGAAATCGAAGAGAGAAACTCACCCAGACCTTCATTGCTCTTGCAGCTCTTGTTCCTAACCTTAAAAAGGTACAATACTTTATTTTCACTTACTCTATTAGCCAACTCTTAAAATCATCAACTATCAACTACTTAGCGTTGATAGTTTGGGTGTACATGTTGCGTTGTAGTTGATCATTCACATATGTGAATGCACAATTTTAATAATTAATATCTTTAATTATTTATCATAACAAATTATAAAAAGTTTATATTTTAAAAATATTGAAGGTGATAAATCCAGCAACTTATATATTAAGATTTCCTCTTGTCAAAAAAAATAAAATAACATTTCCCTTTATATATTGGTCAAAATAGATTACATAGATACTCCTTCCGGTCATTATTATAAAAATTACTTTATAGATACATCGAACAAATTATGTATGTGGTCTATTATGTGGTCTATATTAATAGTCACATACATCACTCATTCCATGTACCTAAAAAATAGTTTTTTGTTTATAATAGTGACCAGGAATTAGGGTACATGGTCAAACATTGACATGTATGGCATGTATTTATGAGCGCAAGGAGTCATAATATAGGAAAATTAATTATATATTTATTACATTCTTATCTTTATATAAAGGGAAATGATATCTTGTGCCCTTAAGGCACAAGTTAAGAAACTAAAGATAGAAATATTTTGTTGAAAATTGTGCATTCAATATTTTAGAAATTTGAAATCTTATCTTTTCAAGACAAAATTTATTATTTAATTCCATTTTTAGATTCTTAACATGTGCCCTCAGGCACAAGTTAACACTACCCTTATATAAAATAAAATGGAAAATGTTAACTTAAGGGCATAAGTTAAGATGCTAAAAGTAAAATTATTTTTTTGAAAATTGTGTATTTAATATTATAAAAATTTAAATATTTATACTTTCAATACAAAATTTATTACTTATTTCCTTTTATAGATCCTTAACTTGTATCCTTAGGTATAAGTTAGCATTACCCAAATAAAATACTCTACAATTTTATTACATTCAATGCAATAGCACCTTGAAAGTAGTCGTATACTTTAGAATTAATGAGTTTATGAACCCGAAACACGGTGGCCTATCAACTTGAACTAAATATCAACTAGAAAAATACAGTACTCCCCCGATTACATTTATAAACAAATACCAACTTTTTAGGTTAATTGAATATCTAATGTATATGATCTATATATAGATCAGATACATTAGTTATTCGATGAATCTAAAAAATTACTTCACTCGGTCTTTTTTATAAAAAAACAAAAGAGACATAAATCATCAAGACCAAGGAAATATATTATAGTTATTTTCATTTAATACACCTCAACATTTAAAATCTTTCCGTGAATACCCTTAAATTAATTACTACTTTTGATTCCACCAACTTACTCCATCCGTTTCAAAATATAAGCAAAACTCATTTTTTAGGTTCATTCATTTAATGATGTATGTGGTCCATAATATAGACCACGTACATCATTAAAAGAATGAATCTAAAAAGTGAATTTTGGTTATATTTTGAAACGGAGGGAGTACTTACTTCTAATATTCTCTGTCATAATAAATAAGGGCACAAATGAAATTTAACTTCAAACACACTTGAAAATTGGTCAATGTTACCTATAAAAAGGACCAAAAAAATATTCACTTATATTTCTTATAAAAAGGGCCGAAGAGGAATATTTTTTTTGCTTATAAATATGACCAGAGTAAGTATTCATTAAAACTATACTCCACTTGTAGTAATTAATACAGCAACAAATTGTAGGTTGTGACCAACAATTAGAATTATCATGAGGGTAAATCAGACACTTTAGTTCAAAATAAATAGGACAGACCACATTCCTTAAAAATGTGATTTTATTGATTTTGTTTATTTTCAACGGAGGGAGTATTAACTTTTCCGTTAATAAATGATCAAAATAAGTTGGGTCATGTTATCTTGTGCCCTAAGGGCACATGTTAAACAATCCAGAAATAGAAATATTCTTTTAAATTTTGTGCATTCAATTAATTAAAAGTTAAAAATTTTATTCTACATTTGACACATTAACTTGTGCCCTTAAGGCACAAGTTAACATTCCCCAAATAAGTTATATAAATAGTGTACATGGTCAAACTTTGACATGTATTTATGAGCGGATGGAGTACTAATATAGGAAAAATAATTACATATTTATTACATTCTTATCTTTCTTTAAAATAAAACAAATCAATTTTATTTAATTCTCTTCTTTTTCTATTTTCTTTGTTAGTTATTTTACATTTTTTATTATATTTTCTCTTTCGATTACTCTTCTTCTTTCTTCTTTTAAAGATGAGTAGTGGAAAGAAAAATATAATAAAAAAATGAAAAAGGTAAAAAAAATAGGAAGGAGAAAAAATAATTAAGGAATTAATGGGTTAGTTTATTATATCATAAAAATGATTGTTAATTTATTGGTTTATTATATCATAAAAATGATTGTTAATTTATTGGTTTAGAAAACAAATACTCCGGAGTATATATCGAAACCCTTACATTTGTGATTGAATCATAAAAGTCCCAAGTAAGAGAATTAATATGTTTGGTTGTTGTATTGAATTTGTTGACAATTACTCTGTAGCAGGGCCGGCCCAATGTATTTTTAGGCCTAAAACGAAATTTTAAAAAAATCCATAAGTTTCCTCAATCGAAAGTGATTCTATATGATGTGTGTCTGACACTAATTAAATATGAGTATTTTGTCAACTAGAAATCAAACTTTGCTTTGTCACAACTTCATTAGCGTGTGACATTTTTAATATATATATATATGTGTGCGCGCGTGCGTGTGTGTGTTGAAAATAATATTTAATATAGACATTATTTACCAATTGTTAGAGATCATAAAATAACAAAATAATATTAAAATGATACAAATATAAATTAATTTTTTACTTTTACAAACTTTGATCACACACTACTTGTCTTAATATATTTAGAACAACCGACATCGAATTACATACCACTTGAGCTTCGAGTGAACATGTTTACAAAATTTGACGTACGAAAATATTTTCAAAGACAAAATAATGAAGCCTAACACGGAGCCTAAAAAATTTGAGGGCCTAAAGCCCCTGCTTTAGTGGCAGTCCCCTTAGACCAGCCCTGCTATGTAGCATTGTTTTACAATTTTATTCTTCATCATATATAACTACTCAAGATAAATCTCTTATATTTTAGAGATAAAGATAAATCTTGGTTACACTGTTTTGTGTTAAACTACTCACTAATTGAATCTGTAAAAATCTGCTAGATGGACAAGCTATCTGTACTAGTTGACACTATTAAATACATGAAAGAGCTTAAAAATCGTTTGGAAGTTGTGGAAGAACAAAACAAGAAAGCAAAAAAAAAGTCATCGACCAAACCATGCCTATGCAGCGATGAAGATTCTTCATCATGTGATGATAGTGTTGAATGTGTTGTTGGTTCACCATTTCAAGTGGAAGCAAGAGTATTAGGAAAACAAATGTTGATTCGGATACAATGTCAAGAGCACAAGGGGCTTTTGGTTAAAATAATGGTCGAAATTCAAAGATTTCAACTATTTGTTGTCAATAGCAGTGTCTTACCCTTTGGAGATTCTACACTTGACATTACCATCATTGCTCAGGTAGTTACCCATCCTTTAAATTGCCATTAAACATATTTTTACCACTTTTAAACTCATGGTTCCATCACTATTACTATTATTATATTGACAAATAGTTGTTTAATTGTTATTATCTTATAATAAGTATTTTATTCTAAGTTGTTTTCTACAATATTTGCTTGCTATATTCATTTTTTTTTTTTGATTTTGGTCTTTTTTTCTCCATGAAATTGACCATTGTATCTAATATTATTTATATAATATTTTATAGTTGGGTGAAGGGTACAACTTGAGCACAAAAGAACTTGTGAAGAACGTACGCATGACAATATTGAAGTTTATTGGTGAGGCCTACATTACCCCTTCATGAATTGGAAGTAATTTACCTCTCATGACAAGTATGATTCGATTCTGGGTTGAAGAAGATGAAGATTACATGTTGAACGAAGAAGATGAAGAAGTTTGATGTTCTTGAGATGAAAATGGTAATTGATTGTAAGAAAAAACCAAATTGGTGAAACCTACATTATCGAATTGAGTGTAATTTACCCCTAATAACAAGTAGGATTTGATTATGGAACAAAGGAGATGGAGATCACATGTTGAACTTGAATGAAGCAGATGAAGAAGTTTGATGTTCTAGAGATGAAAATAGTATTTGATCATAAGAAAAAGATGAAAAAATAAATTTTTCTTTGATAGGGGTAAATTACTCCAAATCAGTAAAGGGTAATGTAGAAAAAACAAGTTTTATGTCATCATAACATACACGAACATGAGCACGTACAAGTGTTCTTGAGCTGCTGGTCAACAAAAGTCACAAATATTTTCAGATTTTCCTTATTTTTGTAGAATGGTTCGACAAATGTGTCTTGGGATGCTCTCATTTATAAAATTTATTTATTTATTTATAATTTTCTTAAACTGTTGAGATAAACATCTTCGTTCTAACATGAAGAAGCAAATCTCTGTAATTTTTAATGACTGATATTGACTTGTTAATTATTATGTTAGTATTTTTTTCTTTGTTAGGACGCAAACTCGGGACCTTTTAACTCCTTACTCTTTTAATTTAAAATAAAAAAATTGAACTATGTATATTGGACAAATAACTCCGGACATCTAATTCAAGTTAAGAAGTTGGATCTTTATTAAAAGCTTGATTTGAAATGTTATATTAAATTAGTGAGATAAACATCTTCATTCTGACGCAAAGATGCAAATCTATATTTTCATAAAACATGGATCTCTATTCAAGTTAAAAATATGTTTATTTATAATTTTCTTAAACCGATGAAATAAACATCTTCGTTTTCACATCAAAATGCACATCTTTGTTTTTGAGAAGTTAAATAAAAATACATGGACCCGCATGTTTAAAGTTGAGCTTGCACATCCTTATTAAAATTGCAAATGAAGCATATCCCTTTATATTGACGCAATTAACACACACGCCGTCAGTTAATCCACCGAAACATTGTTTCTTAATTAAGTAAGGGAAATGTTAACTAGTGCCCCCAGGGCACTGGTTAAGGGAGCAAATATAGTAATTCTTGCATTAAAAGTTGTGTAATCAATGCATTAAAAGTTTCAAAAGTGTATTTTTTGACTTGCAATTTCTTTTTTTGGCTTCCTTAACCAGTGCCCCCGGAGCACTGGTTAACATGACCCATTAATTAATCGTTGAAAATTTTGCTTGAGGGTTCAAGAAAATATTAATTAATTTTCTAGCACCGCACACTAGAACATGGTTGAAATGAAGTCTAGATACGTATCCATGAAGTTTAAAATAATTATTTTAATTTTTAAAATTTTTTTTATCGGTGTGTCAAAAAAAAATTATCGGACAATTATATGATACTCCACATATACATCAAGATACTTACTTCACAGAAACATATTTTAAAAAGGTGTAAGATAAAAAATGAAACAATGTTGTAAAAATTCATTAGAGATATATATGATTCAATTTTAGACATGCATCAGTTAAATTATTTTTTTATAAACCACTTAAAATGATATTTCCTGTGGGTGAATGTAACGAGATGGAGGAGATTCAACTAATCAACATTAAATAAAATTTGTGTTGAGTTCTTCTAATGATGTTTTTGTTGATATACTAACATATGAATGAACATATAATATGATTTATACGAAAACTTTTCATTTTATTTTATTTTGATGACATGTATTATTTATAAAAAAAAAAATGAGATTTATATAATAGTATAATAATGAAGAGTAGTCAATGTTTATTTTCTTCAAATATTTTACATACATATAAGTTTTAGTATAAAATTTTCGTTAACGTATCTTAACCATATTGTATCTTAAATTTTAAAAAATTTCTGTATCCAGATTGCATTGTACATGCACCGCACACGTACCACGTATCCTGACTTCAAATGTTGAAAGTGTGGGTGGAGGACAACGGAATATATACATATACATTTCATGTTGACTAAAAACAAATACATATTTGTTAATTGTGTATAATTATTTGTAAATAATTTTGTAACTTAAATTTAATTAATCTTATACAATGTTTTGACAGTTTTTTAATATATGTTAATTTAATAGCTTATGAAAGTGTGATTATTTTAATAAGATTCTTTTGATACACTCAAATTATTTAGTGTAATTTTTTTTTGAACAAACAAAAATGGTGTATATATTAACAACTAGCAGATAACCCCGCATAAGGCGTGCTAAAAGGGAATCCACTCAACAGTATGTACAATGAGAAGGTGCTAGCCAAATCAGAGCAAAGCAAAGCACCAAAAAAAACAACAACCAGACAAAATTATAGATGGACTCCCATGCAAAGGAGCGGTTGTTTCCACCAGTCATGATAGCACTCAAATATAAAAATTGATACACTCAAATTATTACTTTAAATAAGATTCTTTTGTTTGTCAAAAAAAAAAACGATTCTTTTGATACACTAAAGATCATGTTTATTGATACACTCAAATTATTTAGTGTAATATAAAAATTGTCTGTTACTATTATTATTTTATTATTGTTGTCTTTCTTCTTGTTCATGTTACTATGATTGTTATAATAATAATTATTTTAATAAGATTCTTTTGAATAATTAACAATTTAAACACTGTTCCCTTTTTGTCTAGTACAATTAGTAACAACTACTTTTTTTTGGTTACCGTAGTAACAACTACTAACTACTTTAAGTACCAACTCTTATTGTTTTTTATTATCTTTTTAACAAAAATCAATGCGGACCGCGTGGAGCGTGTGTGTGTTAAGCGTGATGGGAAAAAAATACTCCCTCCGTTCCTTTATAATTGTCACTTTTGCATAAAATTTTTGTTTCTAATTAAATGTCGTTTTCAAAGTTCAAAGTATCATTAAATGTGGCTTTACCTATATTATCCCTATATATTTATTGCAGAGAGAGAAATGTATGAAATGAAGTATTAAATGATTAAGGTTATTATAGGAAAAAGATAAATTGTTGTATCAAAAGTAGTAAAAGTATTTGTTGTCTTGGTTTGTGTAAAAAGTCAAAATGTGACAATTAAAAAGGAACAGAGGGAGTAGTAGAATTTCATTATAATTACGGTTATGCGACCTCGTCTTCATTTGAAAACAGAATATCTTTGTTTCCATTTTTCCATTAATTTTGGAGAAAAAAAAATAGATGACATTGAAAGAAGAAGACTTTAGGGGTTTATTTTTCTATAATACAATTTTTTTTTTATTTGAGGAACTAAAACTAAAAAATTGTAATTGAGAAGGGTTTGAGAGGTTATGGAGGGTTTACATAAATTATTTAAATTTAATCTATATTGTTATAATATTTTTAAAATAAAACATATATTAATCATAAAATTAATTTATCATTCTATAAAAAAATTATTCTTTCAAAAAATGTGATTTTTTCTTTCAATTTTCCCAATATTTCCAACCCTCCAAAGCCCTCATTCCTCTTCTTTCCAAACTCCCAAACAAAGCCTTAAGAAATTACTTATTCACACATGGAATTTATTCTATTAACTCTAACGACAACTAACTGCCGCTCGATATTTTCAACGACAATTAATTACCATTGTCCTAATGACAGTTAACTACTACAAAACAAAAAAAAATTAAAAAAACCTTCAACGGCAATTAAGTGCAGTTGAAATCTCCTCTAAAATCTACACCATTCGATCACTATTATAAGCAAAAACCAACATTTTAAATTTATTAATTAAATGATGTATGTGGTTTATAATAAAGAACATATACATCATTAATTAAATGAATCTAAAATATAGATTTTTGCTTATAATAGTGATCGTAGGGTGTGCTTATTATAGATTTTTGCTTATAATAGTGATCGTAGGGTGTACTAATTGTCCTAATGACAGTTAACTACTACAAAACAAAAAAAAATTAAAAAAACCTTCAACGGCAATTAAGTGCAGTTGAAATCTCCTCTAAAATCTACACCATTCACTACAAGAAATTTGCCATTTAGCAACGACAAAAACCATTGGTAAAGGTTCAAAAAACCGTTGGTATAGGTCATAAAACCTATACCAACGGCCACCTGCTGCCGTCTAGGATACTATGTTTATACCAACGGCAGAAAGCCGTCCCAATAGCTTATACCAACGGATAACTAGCTTGTTGCTAAAGATTTCGGAGCTATAGCAACGACATTTTACACCTGTTTAATTGCTTTAACCAACCTGTATATCCGTTGGTATAGGACTAGACTGCCCGTTGCTATAGGTCTTTTTTTTTTTTTTTACAAATAAATATTTTTGTCTAAACCAAATAGTTTTTTAATAACAAAAGTTTTACACTGTTTTTTTTAATATGCACCACACAATATTTAAAGCAAAATAAAAGAAATTTTCAATTATATTAAATTGTCAAATTAACAAGTCTTACAAACATGTGAAACTAACATCTTACAAACTAACAAAGCTACATGGTACCAAGCTCTTATCCTTGTAGAATTAACTTAATATAACATATTTATGACTTCAGCTCGGATTTCTATTAACGATTTAAGCATCTCCTCTTAAGGAACTGGAACGGAGAAGGTTATAAACACAATCGTTGAATCATATTTGAAGCCGGCACAGACTTCAGCGGATGCTGCAAGGAAGTAA
Protein sequence

>MS.gene54583.t1

MEEINNPAMKVSSISSWLTDLEMNEYNIFAEECNLNFLDADVGGFLSQDMSNVFQEQNKQQCLTLGSTSTNNLSKSFIHETIDNNDKINESLSPNISPSPSNSSFQFQIPSFDNPPNSPPSNSKENETISVSPTELENMNHSTETSKGSLENEKFEAKTSKSKRPRAHGKDHIMAERNRREKLTQTFIALAALVPNLKKMDKLSVLVDTIKYMKELKNRLEVVEEQNKKAKKKSSTKPCLCSDEDSSSCDDSVECVVGSPFQVEARVLGKQMLIRIQCQEHKGLLVKIMVEIQRFQLFVVNSSVLPFGDSTLDITIIAQLGEGYNLSTKELVKNVRMTILKFIGTGTEKVINTIVESYLKPAQTSADAARK