AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0080048086.01

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MsG0080048086.01.T01 AT1G61990 28.997 369 209 8 386 714 53 408 4.81e-32 129
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MsG0080048086.01.T01 AT1G61990 28.997 369 209 8 386 714 53 408 4.81e-32 129
MsG0080048086.01.T01 AT1G61990 26.768 396 205 6 8 363 25 375 2.42e-31 127
MsG0080048086.01.T01 AT1G61970 27.324 355 210 9 386 700 53 399 2.50e-31 127
MsG0080048086.01.T01 AT1G61970 27.224 371 180 10 32 358 53 377 1.97e-29 122
MsG0080048086.01.T01 AT1G61970 27.324 355 210 9 386 700 53 399 2.50e-31 127
MsG0080048086.01.T01 AT1G61970 27.224 371 180 10 32 358 53 377 1.97e-29 122
MsG0080048086.01.T01 AT1G61970 27.324 355 210 9 386 700 53 399 2.50e-31 127
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MsG0080048086.01.T01 AT1G62120 26.923 364 194 6 29 356 54 381 9.26e-30 123
MsG0080048086.01.T01 AT1G62120 26.829 328 201 6 386 677 57 381 1.79e-25 110
MsG0080048086.01.T01 AT3G46950 28.996 269 180 4 366 632 32 291 3.48e-24 107
MsG0080048086.01.T01 AT3G46950 28.114 281 159 5 32 311 53 291 2.67e-23 104
MsG0080048086.01.T01 AT1G61960 28.417 278 161 3 32 308 53 293 4.10e-23 103
MsG0080048086.01.T01 AT1G61960 29.796 245 167 3 386 629 53 293 5.73e-22 100
MsG0080048086.01.T01 AT1G62150 26.573 286 157 4 32 308 59 300 6.81e-23 103
MsG0080048086.01.T01 AT1G62150 27.755 245 173 4 386 629 59 300 1.80e-20 95.5
MsG0080048086.01.T01 AT1G62085 27.554 323 172 7 32 339 56 331 4.48e-22 100
MsG0080048086.01.T01 AT1G62085 27.000 300 214 4 332 629 1 297 2.29e-21 98.6
MsG0080048086.01.T01 AT1G62085 27.554 323 172 7 32 339 56 331 4.48e-22 100
MsG0080048086.01.T01 AT1G62085 27.000 300 214 4 332 629 1 297 2.29e-21 98.6
MsG0080048086.01.T01 AT1G62010 25.228 329 170 5 64 356 71 359 1.80e-20 95.1
MsG0080048086.01.T01 AT1G62010 25.472 318 193 6 397 677 49 359 2.97e-19 91.3
MsG0080048086.01.T01 AT1G62110 25.784 287 160 4 32 309 53 295 2.06e-20 95.5
MsG0080048086.01.T01 AT1G62110 25.407 307 209 6 332 630 1 295 2.00e-19 92.4
MsG0080048086.01.T01 AT5G23930 27.459 244 164 5 378 619 48 280 7.48e-19 90.5
MsG0080048086.01.T01 AT5G23930 23.232 396 190 9 32 356 56 408 3.62e-16 82.4
MsG0080048086.01.T01 AT1G56380 24.806 387 208 16 351 683 4 361 5.17e-14 75.1
MsG0080048086.01.T01 AT1G56380 25.788 349 226 13 32 362 28 361 6.07e-13 72.0
MsG0080048086.01.T01 AT1G56380 25.356 351 192 14 386 683 17 350 7.94e-14 74.3
MsG0080048086.01.T01 AT1G56380 25.788 349 226 13 32 362 17 350 5.16e-13 72.0
MsG0080048086.01.T01 AT2G44020 20.708 367 266 8 9 357 82 441 1.09e-12 71.6

Find 135 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 418 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ATCAATTTGATGGTTGATTT+TGG 0.116384 contig1end:+16497 MsG0080048086.01.T01:CDS
TCCTATCTTATCAACAATTT+TGG 0.127009 contig1end:+16071 MsG0080048086.01.T01:CDS
CACTCAAGGCCATCTATATT+TGG 0.148576 contig1end:+11319 MsG0080048086.01.T01:CDS
GATCCTTCATTGACTACTTT+TGG 0.148781 contig1end:+11391 MsG0080048086.01.T01:CDS
ATCAGTTTGATGACTGATTT+TGG 0.150667 contig1end:+11265 MsG0080048086.01.T01:CDS
TTAATTTGGTGATGAGATTT+TGG 0.155421 contig1end:+11560 MsG0080048086.01.T01:CDS
CGAACAAGGCCATCTATATT+TGG 0.170334 contig1end:+16551 MsG0080048086.01.T01:CDS
TTCAATTGATAAGATTAATT+TGG 0.211307 contig1end:+11546 MsG0080048086.01.T01:CDS
AAGCTACTTTGTAAAATTCT+AGG 0.214273 contig1end:-16344 MsG0080048086.01.T01:intergenic
TTAGTTATAGTTTACATAAA+AGG 0.215972 contig1end:+11635 MsG0080048086.01.T01:CDS
AAACTATAACTAAACATATT+TGG 0.236813 contig1end:-11625 MsG0080048086.01.T01:intergenic
TGGAGGAAGTAAAGAGTTTA+GGG 0.240494 contig1end:+11365 MsG0080048086.01.T01:CDS
GACCCTTCAACGACCGCTTT+TGG 0.242026 contig1end:+16623 MsG0080048086.01.T01:CDS
TTGGAGGAAGTAAAGAGTTT+AGG 0.267899 contig1end:+11364 MsG0080048086.01.T01:CDS
TTTCTCGGTCGTAATGCTTT+TGG 0.287185 contig1end:+10650 MsG0080048086.01.T01:CDS
AACTGATTTGATTAAATCAT+TGG 0.289242 contig1end:+11345 MsG0080048086.01.T01:CDS
TTGTTTGCTTAATTCGATAT+TGG 0.297090 contig1end:+16432 MsG0080048086.01.T01:CDS
ATGACTGAGTCAGGATTATC+TGG 0.299623 contig1end:-16152 MsG0080048086.01.T01:intergenic
ATTGAAGTCAACATCAAATT+AGG 0.302705 contig1end:-11529 MsG0080048086.01.T01:intergenic
AAGATGTTATTCGAGTATTT+AGG 0.310453 contig1end:+16732 MsG0080048086.01.T01:CDS
ATGAGGTAGGATACGGTAAA+TGG 0.313971 contig1end:-10728 MsG0080048086.01.T01:intergenic
AAACCGTTATTCGAGTATTT+AGG 0.319173 contig1end:+11500 MsG0080048086.01.T01:CDS
AAGCTAATGTGTAAAATTGT+AGG 0.327956 contig1end:-11112 MsG0080048086.01.T01:intergenic
TAGAGGTAACCCTCAGTTCT+TGG 0.332921 contig1end:+10997 MsG0080048086.01.T01:CDS
AACTGATTTGATTAAGTCAT+TGG 0.334181 contig1end:+16577 MsG0080048086.01.T01:CDS
ATTTGATGTCTTTAAGAAAT+GGG 0.334222 contig1end:+11465 MsG0080048086.01.T01:CDS
GAAGCTTTGAGTGCGGATTC+AGG 0.344614 contig1end:-10770 MsG0080048086.01.T01:intergenic
GCAAACAATGATATCCTTGT+TGG 0.346453 contig1end:-16417 MsG0080048086.01.T01:intergenic
TTGGAGGAAGTTAAGGGCTT+AGG 0.351722 contig1end:+16596 MsG0080048086.01.T01:CDS
ATTAGACACAATAAGGTGAT+AGG 0.358420 contig1end:-16474 MsG0080048086.01.T01:intergenic
AATTTGATGTCTTTAAGAAA+TGG 0.359065 contig1end:+11464 MsG0080048086.01.T01:CDS
CGATTCTCAGAATAAGTAAA+TGG 0.361831 contig1end:-11733 MsG0080048086.01.T01:intergenic
GTCAGATTCAGAAGCACCTT+TGG 0.364937 contig1end:-10960 MsG0080048086.01.T01:intergenic
AATTGATATTAGACACAATA+AGG 0.377379 contig1end:-16481 MsG0080048086.01.T01:intergenic
TGTGTCTAATATCAATTTGA+TGG 0.381516 contig1end:+16487 MsG0080048086.01.T01:CDS
AAGAAGTTGAGAACTGAATC+AGG 0.382302 contig1end:-10824 MsG0080048086.01.T01:intergenic
GACATTGTCCGCATGGTTAG+AGG 0.397781 contig1end:+10980 MsG0080048086.01.T01:CDS
TAAGTCATTGGAGGAAGTTA+AGG 0.400812 contig1end:+16589 MsG0080048086.01.T01:CDS
AAGTTGACGTCTTTATCAAA+TGG 0.402844 contig1end:+16696 MsG0080048086.01.T01:CDS
ATCAGATGAAGAAGCACCTT+TGG 0.404344 contig1end:-11065 MsG0080048086.01.T01:intergenic
TAGTTATAGTTTACATAAAA+GGG 0.406121 contig1end:+11636 MsG0080048086.01.T01:CDS
ACCAAAATTGTTGATAAGAT+AGG 0.407072 contig1end:-16072 MsG0080048086.01.T01:intergenic
AATGGATGAGTAACATACTT+TGG 0.408464 contig1end:+16666 MsG0080048086.01.T01:CDS
TTGGGTAAATCAAATGGGTT+GGG 0.411373 contig1end:+16811 MsG0080048086.01.T01:CDS
TGGAGGAAGTTAAGGGCTTA+GGG 0.415402 contig1end:+16597 MsG0080048086.01.T01:CDS
AAGAAGTTGATGACTGAGTC+AGG 0.417996 contig1end:-16161 MsG0080048086.01.T01:intergenic
TCATTTAGGTTGGGATTCCT+TGG 0.419185 contig1end:+11588 MsG0080048086.01.T01:CDS
AGTTGACGTCTTTATCAAAT+GGG 0.424416 contig1end:+16697 MsG0080048086.01.T01:CDS
AATTGCAAAACTGAGGCTCT+TGG 0.425012 contig1end:-16896 MsG0080048086.01.T01:intergenic
GTCCCAAAAGCGGTCGTTGA+AGG 0.427635 contig1end:-16626 MsG0080048086.01.T01:intergenic
AGATCAATACATTACACATT+TGG 0.428401 contig1end:-17101 MsG0080048086.01.T01:intergenic
TTGGGTCAATCATTTAGGTT+GGG 0.436055 contig1end:+11579 MsG0080048086.01.T01:CDS
TCAGTTGAACCAAATATAGA+TGG 0.441181 contig1end:-11328 None:intergenic
TCAGTTGAACCAAATATAGA+TGG 0.441181 contig1end:-16560 None:intergenic
TCAATGTTGAAAGCATTTCT+CGG 0.441510 contig1end:+10635 None:intergenic
AAGTCATTGGAGGAAGTTAA+GGG 0.446904 contig1end:+16590 MsG0080048086.01.T01:CDS
CATTTACTTATTCTGAGAAT+CGG 0.448897 contig1end:+11734 MsG0080048086.01.T01:CDS
ATGGATGAGTAACATACTTT+GGG 0.450437 contig1end:+16667 MsG0080048086.01.T01:CDS
TTTGGGTAAATCAAATGGGT+TGG 0.461072 contig1end:+16810 MsG0080048086.01.T01:CDS
ACATACGCAATATCATCAAA+AGG 0.472800 contig1end:+10873 MsG0080048086.01.T01:CDS
TTTGGGTCAATCATTTAGGT+TGG 0.474131 contig1end:+11578 MsG0080048086.01.T01:CDS
TATGTTACTCATCCATTGCT+TGG 0.480966 contig1end:-16660 MsG0080048086.01.T01:intergenic
AGCTACTTTGTAAAATTCTA+GGG 0.484426 contig1end:-16343 MsG0080048086.01.T01:intergenic
AGCTAATGTGTAAAATTGTA+GGG 0.492224 contig1end:-11111 MsG0080048086.01.T01:intergenic
TCAAATGGGTTGGGATCCCT+TGG 0.493727 contig1end:+16820 MsG0080048086.01.T01:CDS
TCAATACATTACACATTTGG+TGG 0.494508 contig1end:-17098 MsG0080048086.01.T01:intergenic
TACTCGAATAACGGTTTCAT+CGG 0.500961 contig1end:-11494 MsG0080048086.01.T01:intergenic
AAACTAAAAGAAAACATAAG+TGG 0.504288 contig1end:-16857 MsG0080048086.01.T01:intergenic
AGCTTAATTCCAAGAACTGA+GGG 0.508231 contig1end:-11006 MsG0080048086.01.T01:intergenic
TTTGATGTCTTTAAGAAATG+GGG 0.510130 contig1end:+11466 MsG0080048086.01.T01:CDS
AATTGCAAAACTGAGGCCCT+TGG 0.520839 contig1end:-11664 MsG0080048086.01.T01:intergenic
GTGAAGAGGTGGTAGTGGTA+AGG 0.521046 contig1end:-10703 MsG0080048086.01.T01:intergenic
GAAAGGTTTGCGAAAGAAGA+AGG 0.527252 contig1end:+16928 MsG0080048086.01.T01:CDS
TACATAAAAGGGTCATTCCA+AGG 0.527481 contig1end:+11647 MsG0080048086.01.T01:CDS
TGAGGTAGGATACGGTAAAT+GGG 0.529833 contig1end:-10727 MsG0080048086.01.T01:intergenic
ATAAGATAGGATACAGCAAA+TGG 0.529947 contig1end:-16059 MsG0080048086.01.T01:intergenic
ATATCCTCAGAATAAGCAAA+TGG 0.530372 contig1end:-16965 MsG0080048086.01.T01:intergenic
TACATTACACATTTGGTGGA+TGG 0.530490 contig1end:-17094 MsG0080048086.01.T01:intergenic
GAAAGCTTTCAACCTCAAGC+AGG 0.544441 contig1end:+16115 MsG0080048086.01.T01:CDS
TTTGATGATGATGCGTGTGT+TGG 0.546473 contig1end:-16207 MsG0080048086.01.T01:intergenic
CATACGCAATATCATCAAAA+GGG 0.549145 contig1end:+10874 MsG0080048086.01.T01:CDS
TGGAAATTTAGCAAGTGCCA+AGG 0.550727 contig1end:-11605 MsG0080048086.01.T01:intergenic
GCCCCAAAAGTAGTCAATGA+AGG 0.551784 contig1end:-11394 MsG0080048086.01.T01:intergenic
CTCTTTGGAAGCTTTGAGTG+CGG 0.552416 contig1end:-10777 MsG0080048086.01.T01:intergenic
GTAGGGTTTGAAGTTAACAA+TGG 0.555837 contig1end:-11094 MsG0080048086.01.T01:intergenic
AACTGATATTAGCCACCGTA+AGG 0.557576 contig1end:-11249 MsG0080048086.01.T01:intergenic
TGATTTGATTAAGTCATTGG+AGG 0.558497 contig1end:+16580 MsG0080048086.01.T01:CDS
TTGCTAGATTGCTTCGAACA+AGG 0.560619 contig1end:+16537 MsG0080048086.01.T01:CDS
TGGAGAATTAATAAGTGCCA+AGG 0.561400 contig1end:-16837 MsG0080048086.01.T01:intergenic
TTTCAGCTTTAAGGAGGAGT+CGG 0.563069 contig1end:+17006 MsG0080048086.01.T01:CDS
ACGTCTTTATCAAATGGGGT+TGG 0.563703 contig1end:+16702 MsG0080048086.01.T01:CDS
TTGCTAGATTGCTTCACTCA+AGG 0.565363 contig1end:+11305 MsG0080048086.01.T01:CDS
TACGGTAAATGGGTGTGAAG+AGG 0.567945 contig1end:-10717 MsG0080048086.01.T01:intergenic
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CRISPR-GE

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! ATCAACTTCTTAAAAAACCA+TGG + contig1end:16173-16192 MsG0080048086.01.T01:CDS 25.0%
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!! TAAATCTTATGTGTCATTCA+TGG + contig1end:14383-14402 MsG0080048086.01.T01:intron 25.0%
!! TACAATTTTACACATTAGCT+TGG + contig1end:11114-11133 MsG0080048086.01.T01:CDS 25.0%
!! TAGAATTTTACAAAGTAGCT+TGG + contig1end:16346-16365 MsG0080048086.01.T01:CDS 25.0%
!! TAGGGAATAAATCTTCATTT+TGG + contig1end:15048-15067 MsG0080048086.01.T01:intron 25.0%
!! TAGTTTTTGATAGAACACTA+TGG + contig1end:12991-13010 MsG0080048086.01.T01:intron 25.0%
!! TATTGCAAAATTAGAGTGTT+CGG + contig1end:15204-15223 MsG0080048086.01.T01:intron 25.0%
!! TCCTATCTTATCAACAATTT+TGG + contig1end:16071-16090 MsG0080048086.01.T01:CDS 25.0%
!! TTAAAGCATGATTTGTAAAG+AGG + contig1end:12527-12546 MsG0080048086.01.T01:intron 25.0%
!! TTAGTTCTTCCTTGTTTATT+TGG + contig1end:12167-12186 MsG0080048086.01.T01:intron 25.0%
!! TTGAAGTACTTATTCTTTCT+AGG + contig1end:11930-11949 MsG0080048086.01.T01:intron 25.0%
!! TTGCAATTTCTTTTGATGAA+AGG + contig1end:11679-11698 MsG0080048086.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTCAATTTTTACTCTCCAA+AGG + contig1end:10944-10963 MsG0080048086.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTGATGTCTTTAAGAAATG+GGG + contig1end:11466-11485 MsG0080048086.01.T01:CDS 25.0%
!!! AACTGATTTGATTAAGTCAT+TGG + contig1end:16577-16596 MsG0080048086.01.T01:CDS 25.0%
!!! AGTTCTTCAATCATTTTTTG+TGG - contig1end:14411-14430 MsG0080048086.01.T01:intergenic 25.0%
!!! AGTTTTTGGGTAAATCAAAT+GGG + contig1end:16806-16825 MsG0080048086.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATCAATTTGATGGTTGATTT+TGG + contig1end:16497-16516 MsG0080048086.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATGGATTTTGTTTGTTACAA+TGG - contig1end:15635-15654 MsG0080048086.01.T01:intergenic 25.0%
!!! GTTCTTCAATCATTTTTTGT+GGG - contig1end:14410-14429 MsG0080048086.01.T01:intergenic 25.0%
!!! TAATCTGTTGATGAGTTTTT+GGG + contig1end:16793-16812 MsG0080048086.01.T01:CDS 25.0%
!!! TAATTTGGTGATGAGATTTT+GGG + contig1end:11561-11580 MsG0080048086.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTAAATCTTCATTTTGGTAG+TGG + contig1end:15072-15091 MsG0080048086.01.T01:intron 25.0%
!!! TTAATCTGTTGATGAGTTTT+TGG + contig1end:16792-16811 MsG0080048086.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTAATTTGGTGATGAGATTT+TGG + contig1end:11560-11579 MsG0080048086.01.T01:CDS 25.0%
AAAAATTTCTTGGGCAAAAC+AGG + contig1end:12820-12839 MsG0080048086.01.T01:intron 30.0%
AAAACCAACAATGTGATGAA+GGG + contig1end:13157-13176 MsG0080048086.01.T01:intron 30.0%
AAAATTTCTTGGGCAAAACA+GGG + contig1end:12821-12840 MsG0080048086.01.T01:intron 30.0%
AAACCGTTATTCGAGTATTT+AGG + contig1end:11500-11519 MsG0080048086.01.T01:CDS 30.0%
AAACTAGACTCTTAGTAAGA+TGG - contig1end:12499-12518 MsG0080048086.01.T01:intergenic 30.0%
AAGTTGACGTCTTTATCAAA+TGG + contig1end:16696-16715 MsG0080048086.01.T01:CDS 30.0%
AATGGATGAGTAACATACTT+TGG + contig1end:16666-16685 MsG0080048086.01.T01:CDS 30.0%
ACATACGCAATATCATCAAA+AGG + contig1end:10873-10892 MsG0080048086.01.T01:CDS 30.0%
AGAATTCAAATTTGTCGATG+AGG - contig1end:10748-10767 MsG0080048086.01.T01:intergenic 30.0%
AGACCTAAATACTCGAATAA+CGG - contig1end:11506-11525 MsG0080048086.01.T01:intergenic 30.0%
AGTTGACGTCTTTATCAAAT+GGG + contig1end:16697-16716 MsG0080048086.01.T01:CDS 30.0%
ATAAGATAGGATACAGCAAA+TGG - contig1end:16062-16081 MsG0080048086.01.T01:intergenic 30.0%
ATATCCTCAGAATAAGCAAA+TGG - contig1end:16968-16987 MsG0080048086.01.T01:intergenic 30.0%
ATCAAAGAAGGAACAAGATA+AGG - contig1end:11910-11929 MsG0080048086.01.T01:intergenic 30.0%
ATGGATGAGTAACATACTTT+GGG + contig1end:16667-16686 MsG0080048086.01.T01:CDS 30.0%
ATGTCGAATTAAGCAAACAA+CGG - contig1end:11200-11219 MsG0080048086.01.T01:intergenic 30.0%
ATTAGACACAATAAGGTGAT+AGG - contig1end:16477-16496 MsG0080048086.01.T01:intergenic 30.0%
CAAAAAAACCCATCATACAA+TGG - contig1end:13503-13522 MsG0080048086.01.T01:intergenic 30.0%
CAAAAGAAATTGCAAAACTG+AGG - contig1end:11674-11693 MsG0080048086.01.T01:intergenic 30.0%
CAACTTTGATTGAACGAAAA+AGG + contig1end:13397-13416 MsG0080048086.01.T01:intron 30.0%
CATACGCAATATCATCAAAA+GGG + contig1end:10874-10893 MsG0080048086.01.T01:CDS 30.0%
CATCAAAATTAGCTGAGAAT+AGG + contig1end:14751-14770 MsG0080048086.01.T01:intron 30.0%
CGATTCTCAGAATAAGTAAA+TGG - contig1end:11736-11755 MsG0080048086.01.T01:intergenic 30.0%
CTGTTTAATCTCATTGCATA+TGG - contig1end:12373-12392 MsG0080048086.01.T01:intergenic 30.0%
GAAAATGTGTAAATAGTCAC+GGG + contig1end:12556-12575 MsG0080048086.01.T01:intron 30.0%
GATTAGTATTGCTACAAACA+TGG - contig1end:14589-14608 MsG0080048086.01.T01:intergenic 30.0%
GCTAAAGACGGAAAAATAAA+AGG - contig1end:14894-14913 MsG0080048086.01.T01:intergenic 30.0%
GGAAAATGTGTAAATAGTCA+CGG + contig1end:12555-12574 MsG0080048086.01.T01:intron 30.0%
TAACAGTGGAATAATATCAG+AGG - contig1end:16315-16334 MsG0080048086.01.T01:intergenic 30.0%
TAATCATATTGCGTGATAAC+AGG + contig1end:14604-14623 MsG0080048086.01.T01:intron 30.0%
TCAATACATTACACATTTGG+TGG - contig1end:17101-17120 MsG0080048086.01.T01:intergenic 30.0%
TCAGTTGAACCAAATATAGA+TGG - contig1end:11331-11350 MsG0080048086.01.T01:intergenic 30.0%
TGAATTAATTACGTAACCGT+TGG + contig1end:13992-14011 MsG0080048086.01.T01:intron 30.0%
TGATGGAAATTGACATTGAT+TGG + contig1end:12647-12666 MsG0080048086.01.T01:intron 30.0%
TGATTTGATTAAGTCATTGG+AGG + contig1end:16580-16599 MsG0080048086.01.T01:CDS 30.0%
TGTCAAATTCTCTTTCTGTT+TGG + contig1end:13449-13468 MsG0080048086.01.T01:intron 30.0%
TTAGACACAATAAGGTGATA+GGG - contig1end:16476-16495 MsG0080048086.01.T01:intergenic 30.0%
! AATTCAAATGGTCTTGCATT+TGG + contig1end:12120-12139 MsG0080048086.01.T01:intron 30.0%
! ACTTTGGCAATAACATTTTG+TGG - contig1end:16262-16281 MsG0080048086.01.T01:intergenic 30.0%
! ATGGAAATTGACATTGATTG+GGG + contig1end:12649-12668 MsG0080048086.01.T01:intron 30.0%
! CTATTCTCAGCTAATTTTGA+TGG - contig1end:14753-14772 MsG0080048086.01.T01:intergenic 30.0%
! CTTTATTTGCAAATGAGCTT+TGG - contig1end:13902-13921 MsG0080048086.01.T01:intergenic 30.0%
! CTTTGGCAATAACATTTTGT+GGG - contig1end:16261-16280 MsG0080048086.01.T01:intergenic 30.0%
! GATGGAAATTGACATTGATT+GGG + contig1end:12648-12667 MsG0080048086.01.T01:intron 30.0%
! TGTGTTGATGTTTGATACAA+GGG + contig1end:13072-13091 MsG0080048086.01.T01:intron 30.0%
! TTGTGTTGATGTTTGATACA+AGG + contig1end:13071-13090 MsG0080048086.01.T01:intron 30.0%
! TTGTTTGTTACAATGGCAAA+TGG - contig1end:15628-15647 MsG0080048086.01.T01:intergenic 30.0%
! TTTGGCAATAACATTTTGTG+GGG - contig1end:16260-16279 MsG0080048086.01.T01:intergenic 30.0%
! TTTGTGTTATTCATGTCATG+CGG + contig1end:13323-13342 MsG0080048086.01.T01:intron 30.0%
!! AAGGTTCTTTAAAACTGACA+AGG + contig1end:11171-11190 MsG0080048086.01.T01:CDS 30.0%
!! AGATTTTGGGTCAATCATTT+AGG + contig1end:11574-11593 MsG0080048086.01.T01:CDS 30.0%
!! ATCAGTTTGATGACTGATTT+TGG + contig1end:11265-11284 MsG0080048086.01.T01:CDS 30.0%
!! ATCCTTCATTGACTACTTTT+GGG + contig1end:11392-11411 MsG0080048086.01.T01:CDS 30.0%
!! CTCACACATAGTCATTTTAA+GGG + contig1end:12294-12313 MsG0080048086.01.T01:intron 30.0%
!! TCAATTTTCAGGCCTAAAAA+TGG - contig1end:14043-14062 MsG0080048086.01.T01:intergenic 30.0%
!! TCTCACACATAGTCATTTTA+AGG + contig1end:12293-12312 MsG0080048086.01.T01:intron 30.0%
!!! ACAAAAGGCTGTTTTTTGTA+CGG + contig1end:13857-13876 MsG0080048086.01.T01:intron 30.0%
!!! CTAAATTTTGGTTCTAGCAT+TGG + contig1end:14429-14448 MsG0080048086.01.T01:intron 30.0%
!!! CTACTTTTAGAACTGTAACA+GGG + contig1end:15017-15036 MsG0080048086.01.T01:intron 30.0%
!!! GAGTTTTTGGGTAAATCAAA+TGG + contig1end:16805-16824 MsG0080048086.01.T01:CDS 30.0%
!!! GGTTTTGAAATAAAGCTCTT+TGG - contig1end:10795-10814 MsG0080048086.01.T01:intergenic 30.0%
!!! TCTACTTTTAGAACTGTAAC+AGG + contig1end:15016-15035 MsG0080048086.01.T01:intron 30.0%
AAACCAACAATGTGATGAAG+GGG + contig1end:13158-13177 MsG0080048086.01.T01:intron 35.0%
AAACTGCACAATCAACTACA+TGG - contig1end:13593-13612 MsG0080048086.01.T01:intergenic 35.0%
AAATTTCTTGGGCAAAACAG+GGG + contig1end:12822-12841 MsG0080048086.01.T01:intron 35.0%
AAGAAGTTGAGAACTGAATC+AGG - contig1end:10827-10846 MsG0080048086.01.T01:intergenic 35.0%
AAGCTTAATTCCAAGAACTG+AGG - contig1end:11010-11029 MsG0080048086.01.T01:intergenic 35.0%
AAGTCATTGGAGGAAGTTAA+GGG + contig1end:16590-16609 MsG0080048086.01.T01:CDS 35.0%
AATCAGGAGATAAGCTTGTA+TGG - contig1end:15819-15838 MsG0080048086.01.T01:intergenic 35.0%
AATGGAATCAAATTGCAGCA+AGG - contig1end:13303-13322 MsG0080048086.01.T01:intergenic 35.0%
AATTCTACATGCCTTTCCAA+CGG - contig1end:14011-14030 MsG0080048086.01.T01:intergenic 35.0%
ACAGAAAGAGAATTTGACAG+AGG - contig1end:13448-13467 MsG0080048086.01.T01:intergenic 35.0%
ACATAAAAGGGTCATTCCAA+GGG + contig1end:11648-11667 MsG0080048086.01.T01:CDS 35.0%
ACATAGTGTAGAACATGCAT+TGG - contig1end:13734-13753 MsG0080048086.01.T01:intergenic 35.0%
AGCTTAATTCCAAGAACTGA+GGG - contig1end:11009-11028 MsG0080048086.01.T01:intergenic 35.0%
ATCACATGTACAACAGTACA+AGG - contig1end:12095-12114 MsG0080048086.01.T01:intergenic 35.0%
ATGCTGCATTTGAGTGAAAA+TGG - contig1end:16008-16027 MsG0080048086.01.T01:intergenic 35.0%
ATGGAATCAAATTGCAGCAA+GGG - contig1end:13302-13321 MsG0080048086.01.T01:intergenic 35.0%
ATTCTTGGGCCAAATAAACA+AGG - contig1end:12179-12198 MsG0080048086.01.T01:intergenic 35.0%
ATTGACGTCAACATCAAACT+AGG - contig1end:16764-16783 MsG0080048086.01.T01:intergenic 35.0%
CAAAACCAACAATGTGATGA+AGG + contig1end:13156-13175 MsG0080048086.01.T01:intron 35.0%
CAAATACAACGGAGAACAAT+GGG + contig1end:11836-11855 MsG0080048086.01.T01:intron 35.0%
CAACTCAGTCAAAACAAAGT+GGG + contig1end:14535-14554 MsG0080048086.01.T01:intron 35.0%
CACAAATATGGTTCTTGCAT+TGG + contig1end:14338-14357 MsG0080048086.01.T01:intron 35.0%
CAGAAAGAGAATTTGACAGA+GGG - contig1end:13447-13466 MsG0080048086.01.T01:intergenic 35.0%
CGCTTTACATTCTGTTAGAA+CGG + contig1end:13264-13283 MsG0080048086.01.T01:intron 35.0%
CTGGGAGAAAAACAATTTGT+TGG - contig1end:15919-15938 MsG0080048086.01.T01:intergenic 35.0%
GAGACATAAAACAGGATTCT+GGG - contig1end:15937-15956 MsG0080048086.01.T01:intergenic 35.0%
GCAAACAATGATATCCTTGT+TGG - contig1end:16420-16439 MsG0080048086.01.T01:intergenic 35.0%
GGAAAGGGGAAAAATTTCTT+GGG + contig1end:12811-12830 MsG0080048086.01.T01:intron 35.0%
GGAGAATTAATAAGTGCCAA+GGG - contig1end:16839-16858 MsG0080048086.01.T01:intergenic 35.0%
GTAGTCTATACTTCAATCCA+TGG + contig1end:12749-12768 MsG0080048086.01.T01:intron 35.0%
GTGTATGATTCCTCGTTTAA+GGG - contig1end:14728-14747 MsG0080048086.01.T01:intergenic 35.0%
GTTGACGTCTTTATCAAATG+GGG + contig1end:16698-16717 MsG0080048086.01.T01:CDS 35.0%
GTTGTGATGAGACATAAAAC+AGG - contig1end:15945-15964 MsG0080048086.01.T01:intergenic 35.0%
TAAGTCATTGGAGGAAGTTA+AGG + contig1end:16589-16608 MsG0080048086.01.T01:CDS 35.0%
TAATTACGTAACCGTTGGAA+AGG + contig1end:13997-14016 MsG0080048086.01.T01:intron 35.0%
TACATAAAAGGGTCATTCCA+AGG + contig1end:11647-11666 MsG0080048086.01.T01:CDS 35.0%
TACCTGGAAGAAAAACATCA+GGG - contig1end:12732-12751 MsG0080048086.01.T01:intergenic 35.0%
TACTCGAATAACGGTTTCAT+CGG - contig1end:11497-11516 MsG0080048086.01.T01:intergenic 35.0%
TAGACCATTTGCTTATTCTG+AGG + contig1end:16961-16980 MsG0080048086.01.T01:CDS 35.0%
TAGTTGCAATTTCGATGCAT+AGG + contig1end:12031-12050 MsG0080048086.01.T01:intron 35.0%
TATGTTACTCATCCATTGCT+TGG - contig1end:16663-16682 MsG0080048086.01.T01:intergenic 35.0%
TCTAACAGAATGTAAAGCGA+AGG - contig1end:13263-13282 MsG0080048086.01.T01:intergenic 35.0%
TGAGACATAAAACAGGATTC+TGG - contig1end:15938-15957 MsG0080048086.01.T01:intergenic 35.0%
TGCTGCATTTGAGTGAAAAT+GGG - contig1end:16007-16026 MsG0080048086.01.T01:intergenic 35.0%
TGGAAAGGGGAAAAATTTCT+TGG + contig1end:12810-12829 MsG0080048086.01.T01:intron 35.0%
TGGAGAATTAATAAGTGCCA+AGG - contig1end:16840-16859 MsG0080048086.01.T01:intergenic 35.0%
TGGAGGAAGTAAAGAGTTTA+GGG + contig1end:11365-11384 MsG0080048086.01.T01:CDS 35.0%
TGGGGATTTCATACATCAAT+TGG + contig1end:12667-12686 MsG0080048086.01.T01:intron 35.0%
TGTTCGGTTAGAAAACTCAA+TGG + contig1end:15220-15239 MsG0080048086.01.T01:intron 35.0%
TTCAAATTTGTCGATGAGGT+AGG - contig1end:10744-10763 MsG0080048086.01.T01:intergenic 35.0%
TTGGAGGAAGTAAAGAGTTT+AGG + contig1end:11364-11383 MsG0080048086.01.T01:CDS 35.0%
TTTGGGTAAATCAAATGGGT+TGG + contig1end:16810-16829 MsG0080048086.01.T01:CDS 35.0%
TTTGGGTCAATCATTTAGGT+TGG + contig1end:11578-11597 MsG0080048086.01.T01:CDS 35.0%
! AACTGAATCAGGTTTTTGTG+AGG - contig1end:10816-10835 MsG0080048086.01.T01:intergenic 35.0%
! ACAAAAAACAGCCTTTTGTC+AGG - contig1end:13856-13875 MsG0080048086.01.T01:intergenic 35.0%
! ATGTCTTTAAGAAATGGGGT+TGG + contig1end:11470-11489 MsG0080048086.01.T01:CDS 35.0%
! CAAGTGTGTTTTCAGCTTTA+AGG + contig1end:11765-11784 MsG0080048086.01.T01:intron 35.0%
! CGACTAATTTGTGTTATCAC+TGG + contig1end:12857-12876 MsG0080048086.01.T01:intron 35.0%
! GTAGGGTTTGAAGTTAACAA+TGG - contig1end:11097-11116 MsG0080048086.01.T01:intergenic 35.0%
! TACATTACACATTTGGTGGA+TGG - contig1end:17097-17116 MsG0080048086.01.T01:intergenic 35.0%
! TAGGTTCTTGATAACCAACA+AGG + contig1end:16403-16422 MsG0080048086.01.T01:CDS 35.0%
! TTGGGTAAATCAAATGGGTT+GGG + contig1end:16811-16830 MsG0080048086.01.T01:CDS 35.0%
! TTGGGTCAATCATTTAGGTT+GGG + contig1end:11579-11598 MsG0080048086.01.T01:CDS 35.0%
! TTTAGAACTGTAACAGGGAA+CGG + contig1end:15022-15041 MsG0080048086.01.T01:intron 35.0%
!! AGTTGGTAGCTTAACTATCA+GGG + contig1end:15686-15705 MsG0080048086.01.T01:intron 35.0%
!! ATATCATCAAAAGGGTACCA+TGG + contig1end:10882-10901 MsG0080048086.01.T01:CDS 35.0%
!! GATCCTTCATTGACTACTTT+TGG + contig1end:11391-11410 MsG0080048086.01.T01:CDS 35.0%
!! TCATCATCAAAAAAGCACCT+TGG + contig1end:16219-16238 MsG0080048086.01.T01:CDS 35.0%
!! TCCTTCATTGACTACTTTTG+GGG + contig1end:11393-11412 MsG0080048086.01.T01:CDS 35.0%
!! TTCTCAGCTAATTTTGATGG+AGG - contig1end:14750-14769 MsG0080048086.01.T01:intergenic 35.0%
!! TTTCAGCTTTAAGGAGGAAT+CGG + contig1end:11774-11793 MsG0080048086.01.T01:intron 35.0%
!! TTTTAATTGCCATCGCCTTA+CGG + contig1end:11234-11253 MsG0080048086.01.T01:CDS 35.0%
AAACCCATCATACAATGGGA+AGG - contig1end:13498-13517 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
AAATATGTGGGGTCTACTGT+GGG + contig1end:14293-14312 MsG0080048086.01.T01:intron 40.0%
AACCAACAATGTGATGAAGG+GGG + contig1end:13159-13178 MsG0080048086.01.T01:intron 40.0%
AACTCGTTCTACCTGACAAA+AGG + contig1end:13842-13861 MsG0080048086.01.T01:intron 40.0%
AACTGATATTAGCCACCGTA+AGG - contig1end:11252-11271 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
AATTGCAAAACTGAGGCTCT+TGG - contig1end:16899-16918 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
ACCAACTGAGGTACAATCAT+AGG - contig1end:15673-15692 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
ACGTCTTTATCAAATGGGGT+TGG + contig1end:16702-16721 MsG0080048086.01.T01:CDS 40.0%
ATCACCTTCCCATTGTATGA+TGG + contig1end:13491-13510 MsG0080048086.01.T01:intron 40.0%
ATGACTGAGTCAGGATTATC+TGG - contig1end:16155-16174 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
ATGAGGTAGGATACGGTAAA+TGG - contig1end:10731-10750 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
ATGTGTAAATAGTCACGGGT+CGG + contig1end:12560-12579 MsG0080048086.01.T01:intron 40.0%
ATTCTTTCTAGGCCAGGATA+AGG + contig1end:11941-11960 MsG0080048086.01.T01:intron 40.0%
ATTGCTACAAACATGGACCA+TGG - contig1end:14582-14601 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
CACTCAAGGCCATCTATATT+TGG + contig1end:11319-11338 MsG0080048086.01.T01:CDS 40.0%
CCAACTCAGTCAAAACAAAG+TGG + contig1end:14534-14553 MsG0080048086.01.T01:intron 40.0%
CCATCAGTTTCTTCTACCAT+GGG - contig1end:12633-12652 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
CGAACAAGGCCATCTATATT+TGG + contig1end:16551-16570 MsG0080048086.01.T01:CDS 40.0%
CTACCTGGAAGAAAAACATC+AGG - contig1end:12733-12752 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
CTAGACTCTTAGTAAGATGG+TGG - contig1end:12496-12515 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
GAAAGGTTTGCGAAAGAAGA+AGG + contig1end:16928-16947 MsG0080048086.01.T01:CDS 40.0%
GAAGCAATCCGTTTAGAAAG+CGG + contig1end:12467-12486 MsG0080048086.01.T01:intron 40.0%
GACAATGACGTAAGAAACCA+TGG + contig1end:14562-14581 MsG0080048086.01.T01:intron 40.0%
GAGAATAGGTTTAGCATTGC+AGG + contig1end:14765-14784 MsG0080048086.01.T01:intron 40.0%
GAGGTACAATCATAGGACAA+CGG - contig1end:15666-15685 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
GATAGTTAAGCTACCAACTG+AGG - contig1end:15685-15704 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
GATATTGCGTATGTCTGAGT+CGG - contig1end:10867-10886 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
GATGTCACATGTCCATATGA+TGG + contig1end:15094-15113 MsG0080048086.01.T01:intron 40.0%
GCAAACACTATGTCACTATC+TGG + contig1end:15846-15865 MsG0080048086.01.T01:intron 40.0%
GCAAATACAACGGAGAACAA+TGG + contig1end:11835-11854 MsG0080048086.01.T01:intron 40.0%
GGATTGAAGTATAGACTACC+TGG - contig1end:12748-12767 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
GGTGTATGATTCCTCGTTTA+AGG - contig1end:14729-14748 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
GGTTGTGATGAAAGTAACCA+AGG - contig1end:16239-16258 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
GTACTTATTCTTTCTAGGCC+AGG + contig1end:11935-11954 MsG0080048086.01.T01:intron 40.0%
GTATTGCAGGAAAGAATCCA+TGG - contig1end:10902-10921 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
GTGAAAATGGGAATGAGAAG+TGG - contig1end:15995-16014 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
TATCAGGGACATTATGTGCA+AGG + contig1end:15701-15720 MsG0080048086.01.T01:intron 40.0%
TATTGAAACGAACCTGCTTG+AGG - contig1end:16130-16149 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
TCACCTTCCCATTGTATGAT+GGG + contig1end:13492-13511 MsG0080048086.01.T01:intron 40.0%
TCCATCAGTTTCTTCTACCA+TGG - contig1end:12634-12653 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
TCCTATGATTGTACCTCAGT+TGG + contig1end:15669-15688 MsG0080048086.01.T01:intron 40.0%
TCGGTTAGAAAACTCAATGG+AGG + contig1end:15223-15242 MsG0080048086.01.T01:intron 40.0%
TCTCATCCAATCTGCTTGTT+GGG + contig1end:12428-12447 MsG0080048086.01.T01:intron 40.0%
TGACTGAGTCAGGATTATCT+GGG - contig1end:16154-16173 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
TGAGGTAGGATACGGTAAAT+GGG - contig1end:10730-10749 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
TGAGTGAAGCAATCTAGCAA+TGG - contig1end:11305-11324 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
TGCAATGCTCAACCATCATA+TGG - contig1end:15109-15128 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
TGGAAATTTAGCAAGTGCCA+AGG - contig1end:11608-11627 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
TGTAACAGGGAACGGAATTA+GGG + contig1end:15030-15049 MsG0080048086.01.T01:intron 40.0%
TGTTCGAAGCAATCTAGCAA+TGG - contig1end:16537-16556 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
TGTTGGAGTTTGAAAAGCCA+TGG - contig1end:16193-16212 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
TTCTTTCTAGGCCAGGATAA+GGG + contig1end:11942-11961 MsG0080048086.01.T01:intron 40.0%
TTGCTAGATTGCTTCACTCA+AGG + contig1end:11305-11324 MsG0080048086.01.T01:CDS 40.0%
TTGCTAGATTGCTTCGAACA+AGG + contig1end:16537-16556 MsG0080048086.01.T01:CDS 40.0%
TTTGTCGATGAGGTAGGATA+CGG - contig1end:10738-10757 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
! ATCCCTGATGTTTTTCTTCC+AGG + contig1end:12727-12746 MsG0080048086.01.T01:intron 40.0%
! GAAATTTTTCCCCTTTCCAC+CGG - contig1end:12809-12828 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
! GTTCAATGTGAGTGTTGTGT+TGG - contig1end:15878-15897 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
! TTTCTCGGTCGTAATGCTTT+TGG + contig1end:10650-10669 MsG0080048086.01.T01:CDS 40.0%
!! AAGAAGTTGATGACTGAGTC+AGG - contig1end:16164-16183 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
!! AATCGTTTTGTGGGTATTGC+AGG - contig1end:10915-10934 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
!! ACTTTGGGAGAATCGTTTTG+TGG - contig1end:10925-10944 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
!! ATCAGATGAAGAAGCACCTT+TGG - contig1end:11068-11087 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
!! CAGTTGGTAGCTTAACTATC+AGG + contig1end:15685-15704 MsG0080048086.01.T01:intron 40.0%
!! CTTTGGGAGAATCGTTTTGT+GGG - contig1end:10924-10943 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
!! TCATTTAGGTTGGGATTCCT+TGG + contig1end:11588-11607 MsG0080048086.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTCAGCTTTAAGGAGGAGT+CGG + contig1end:17006-17025 MsG0080048086.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTGATGATGATGCGTGTGT+TGG - contig1end:16210-16229 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
!!! CCACTTTGTTTTGACTGAGT+TGG - contig1end:14537-14556 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
!!! CTTTGTTTTGACTGAGTTGG+AGG - contig1end:14534-14553 MsG0080048086.01.T01:intergenic 40.0%
!!! GTGTGTTTTCAGCTTTAAGG+AGG + contig1end:11768-11787 MsG0080048086.01.T01:intron 40.0%
AATGTGATGAAGGGGGATCA+TGG + contig1end:13166-13185 MsG0080048086.01.T01:intron 45.0%
AATTGCAAAACTGAGGCCCT+TGG - contig1end:11667-11686 MsG0080048086.01.T01:intergenic 45.0%
ACAATACCAACCCCTTATCC+TGG - contig1end:11956-11975 MsG0080048086.01.T01:intergenic 45.0%
AGCGGATCATGTCTTAAAGG+AGG + contig1end:14671-14690 MsG0080048086.01.T01:intron 45.0%
ATATGGAATCCGGTGGAAAG+GGG + contig1end:12797-12816 MsG0080048086.01.T01:intron 45.0%
ATCCCCCTTCATCACATTGT+TGG - contig1end:13164-13183 MsG0080048086.01.T01:intergenic 45.0%
ATGGACCATAGTCATCGAAG+AGG + contig1end:12768-12787 MsG0080048086.01.T01:intron 45.0%
ATGTGATGAAGGGGGATCAT+GGG + contig1end:13167-13186 MsG0080048086.01.T01:intron 45.0%
CAACTTAGTGGGATAAGGCT+TGG + contig1end:13039-13058 MsG0080048086.01.T01:intron 45.0%
CCCATGGTAGAAGAAACTGA+TGG + contig1end:12630-12649 MsG0080048086.01.T01:intron 45.0%
CTCTCATCCAATCTGCTTGT+TGG + contig1end:12427-12446 MsG0080048086.01.T01:intron 45.0%
CTGTAACAGGGAACGGAATT+AGG + contig1end:15029-15048 MsG0080048086.01.T01:intron 45.0%
CTTATCCCACTAAGTTGCGT+CGG - contig1end:13036-13055 MsG0080048086.01.T01:intergenic 45.0%
GAAAGCTTTCAACCTCAAGC+AGG + contig1end:16115-16134 MsG0080048086.01.T01:CDS 45.0%
GAAATATGTGGGGTCTACTG+TGG + contig1end:14292-14311 MsG0080048086.01.T01:intron 45.0%
GACTGAGTCAGGATTATCTG+GGG - contig1end:16153-16172 MsG0080048086.01.T01:intergenic 45.0%
GATATGGAATCCGGTGGAAA+GGG + contig1end:12796-12815 MsG0080048086.01.T01:intron 45.0%
GCATTGCAGGCAATGTTGTT+TGG + contig1end:14778-14797 MsG0080048086.01.T01:intron 45.0%
GCCCCAAAAGTAGTCAATGA+AGG - contig1end:11397-11416 MsG0080048086.01.T01:intergenic 45.0%
GGATACAGCAAATGGTTGTG+TGG - contig1end:16054-16073 MsG0080048086.01.T01:intergenic 45.0%
GTCAGCGGATCATGTCTTAA+AGG + contig1end:14668-14687 MsG0080048086.01.T01:intron 45.0%
GTGACATGATCCCTTAAACG+AGG + contig1end:14715-14734 MsG0080048086.01.T01:intron 45.0%
GTGGAGCTACACAACAAGAA+CGG + contig1end:14644-14663 MsG0080048086.01.T01:intron 45.0%
TACGGTAAATGGGTGTGAAG+AGG - contig1end:10720-10739 MsG0080048086.01.T01:intergenic 45.0%
TAGAGGTAACCCTCAGTTCT+TGG + contig1end:10997-11016 MsG0080048086.01.T01:CDS 45.0%
TAGGACAACGGAAACGCAAA+TGG - contig1end:15654-15673 MsG0080048086.01.T01:intergenic 45.0%
TCAGGTAGAACGAGTTCTTG+TGG - contig1end:13838-13857 MsG0080048086.01.T01:intergenic 45.0%
TCTTCGATGACTATGGTCCA+TGG - contig1end:12769-12788 MsG0080048086.01.T01:intergenic 45.0%
TCTTTCTAGGCCAGGATAAG+GGG + contig1end:11943-11962 MsG0080048086.01.T01:intron 45.0%
TGAATCTGACATTGTCCGCA+TGG + contig1end:10973-10992 MsG0080048086.01.T01:CDS 45.0%
TGGACCATAGTCATCGAAGA+GGG + contig1end:12769-12788 MsG0080048086.01.T01:intron 45.0%
TGGAGGAAGTTAAGGGCTTA+GGG + contig1end:16597-16616 MsG0080048086.01.T01:CDS 45.0%
TTGGAGGAAGTTAAGGGCTT+AGG + contig1end:16596-16615 MsG0080048086.01.T01:CDS 45.0%
TTTGTACGGACAGCAGAACA+TGG + contig1end:13871-13890 MsG0080048086.01.T01:intron 45.0%
! AGCATTGGAGAACATCCACT+TGG + contig1end:13788-13807 MsG0080048086.01.T01:intron 45.0%
!! AGTGTTTGCTGTGTGGAATC+AGG - contig1end:15835-15854 MsG0080048086.01.T01:intergenic 45.0%
!! CTCTTTGGAAGCTTTGAGTG+CGG - contig1end:10780-10799 MsG0080048086.01.T01:intergenic 45.0%
!! GCTGCTTTGAAAGCCAAGAA+AGG + contig1end:11415-11434 MsG0080048086.01.T01:CDS 45.0%
!! GGATAAGGGGTTGGTATTGT+TGG + contig1end:11956-11975 MsG0080048086.01.T01:intron 45.0%
!! GTCAGATTCAGAAGCACCTT+TGG - contig1end:10963-10982 MsG0080048086.01.T01:intergenic 45.0%
!! GTGACATAGTGTTTGCTGTG+TGG - contig1end:15842-15861 MsG0080048086.01.T01:intergenic 45.0%
!! AAATATTGTATATTAAAATT+TGG - contig1end:15742-15761 MsG0080048086.01.T01:intergenic 5.0%
AACGAACCAGTGCTTTCCCA+TGG + contig1end:12614-12633 MsG0080048086.01.T01:intron 50.0%
AGGAGACTGACAACCATACG+TGG + contig1end:14691-14710 MsG0080048086.01.T01:intron 50.0%
ATGTAGCCGACGCAACTTAG+TGG + contig1end:13027-13046 MsG0080048086.01.T01:intron 50.0%
CACCAAAGCAGTCCCAAAAG+CGG - contig1end:16639-16658 MsG0080048086.01.T01:intergenic 50.0%
CATAGTCATCGAAGAGGGAG+AGG + contig1end:12774-12793 MsG0080048086.01.T01:intron 50.0%
CATCGAAGAGGGAGAGGATA+TGG + contig1end:12780-12799 MsG0080048086.01.T01:intron 50.0%
CATGCGGATCAGTTGACATC+TGG + contig1end:13339-13358 MsG0080048086.01.T01:intron 50.0%
CGACGCAACTTAGTGGGATA+AGG + contig1end:13034-13053 MsG0080048086.01.T01:intron 50.0%
CTAGGGTGTGCAGTTAACAG+TGG - contig1end:16329-16348 MsG0080048086.01.T01:intergenic 50.0%
CTCTCCCTCTTCGATGACTA+TGG - contig1end:12776-12795 MsG0080048086.01.T01:intergenic 50.0%
GAACATCCACTTGGCATCCA+AGG + contig1end:13797-13816 MsG0080048086.01.T01:intron 50.0%
GACATTGTCCGCATGGTTAG+AGG + contig1end:10980-10999 MsG0080048086.01.T01:CDS 50.0%
GAGACTGACAACCATACGTG+GGG + contig1end:14693-14712 MsG0080048086.01.T01:intron 50.0%
GAGGGAGAGGATATGGAATC+CGG + contig1end:12787-12806 MsG0080048086.01.T01:intron 50.0%
GAGGGTTACCTCTAACCATG+CGG - contig1end:10991-11010 MsG0080048086.01.T01:intergenic 50.0%
GCAATCCGTTTAGAAAGCGG+AGG + contig1end:12470-12489 MsG0080048086.01.T01:intron 50.0%
GGAGACTGACAACCATACGT+GGG + contig1end:14692-14711 MsG0080048086.01.T01:intron 50.0%
GGATATGGAATCCGGTGGAA+AGG + contig1end:12795-12814 MsG0080048086.01.T01:intron 50.0%
GGGACATTATGTGCAAGGAG+CGG + contig1end:15706-15725 MsG0080048086.01.T01:intron 50.0%
GGTAAATGGGTGTGAAGAGG+TGG - contig1end:10717-10736 MsG0080048086.01.T01:intergenic 50.0%
GGTAGAACGAGTTCTTGTGG+TGG - contig1end:13835-13854 MsG0080048086.01.T01:intergenic 50.0%
TAATTGCCATCGCCTTACGG+TGG + contig1end:11237-11256 MsG0080048086.01.T01:CDS 50.0%
TATTAGCCACCGTAAGGCGA+TGG - contig1end:11246-11265 MsG0080048086.01.T01:intergenic 50.0%
TCCCAAAAGCGGTCGTTGAA+GGG - contig1end:16628-16647 MsG0080048086.01.T01:intergenic 50.0%
TGTAGCCGACGCAACTTAGT+GGG + contig1end:13028-13047 MsG0080048086.01.T01:intron 50.0%
TTGGCATCCAAGGTGGAGAA+CGG + contig1end:13807-13826 MsG0080048086.01.T01:intron 50.0%
! CACAACAAGAACGGTGTCAG+CGG + contig1end:14653-14672 MsG0080048086.01.T01:intron 50.0%
! CTGCTTTGGTGACCAAGCAA+TGG + contig1end:16648-16667 MsG0080048086.01.T01:CDS 50.0%
! CTTCTACCATGGGAAAGCAC+TGG - contig1end:12623-12642 MsG0080048086.01.T01:intergenic 50.0%
!! ACCCTTCAACGACCGCTTTT+GGG + contig1end:16624-16643 MsG0080048086.01.T01:CDS 50.0%
!! ATGGGAAAGCACTGGTTCGT+TGG - contig1end:12615-12634 MsG0080048086.01.T01:intergenic 50.0%
!! GAAGCTTTGAGTGCGGATTC+AGG - contig1end:10773-10792 MsG0080048086.01.T01:intergenic 50.0%
!! GTGAAGAGGTGGTAGTGGTA+AGG - contig1end:10706-10725 MsG0080048086.01.T01:intergenic 50.0%
!! TCAAATGGGTTGGGATCCCT+TGG + contig1end:16820-16839 MsG0080048086.01.T01:CDS 50.0%
CATCCACTTGGCATCCAAGG+TGG + contig1end:13800-13819 MsG0080048086.01.T01:intron 55.0%
CTAGCAGCGCATCTTCACCT+AGG - contig1end:12589-12608 MsG0080048086.01.T01:intergenic 55.0%
GAGCGACCCAACAAGCAGAT+TGG - contig1end:12437-12456 MsG0080048086.01.T01:intergenic 55.0%
GGAGAGGATATGGAATCCGG+TGG + contig1end:12790-12809 MsG0080048086.01.T01:intron 55.0%
GGATCATGTCACCCCACGTA+TGG - contig1end:14707-14726 MsG0080048086.01.T01:intergenic 55.0%
GGTGGCCTCCGCTTTCTAAA+CGG - contig1end:12478-12497 MsG0080048086.01.T01:intergenic 55.0%
GTCCCAAAAGCGGTCGTTGA+AGG - contig1end:16629-16648 MsG0080048086.01.T01:intergenic 55.0%
TCTAGGCCAGGATAAGGGGT+TGG + contig1end:11947-11966 MsG0080048086.01.T01:intron 55.0%
TCTCCACCTTGGATGCCAAG+TGG - contig1end:13806-13825 MsG0080048086.01.T01:intergenic 55.0%
TGGGTGTGAAGAGGTGGTAG+TGG - contig1end:10711-10730 MsG0080048086.01.T01:intergenic 55.0%
! GACCCTTCAACGACCGCTTT+TGG + contig1end:16623-16642 MsG0080048086.01.T01:CDS 55.0%
!!! GACCGCTTTTGGGACTGCTT+TGG + contig1end:16634-16653 MsG0080048086.01.T01:CDS 55.0%
GGTGGAACCGTTCTCCACCT+TGG - contig1end:13817-13836 MsG0080048086.01.T01:intergenic 60.0%
GTTGGGTCGCTCAGAGAGGA+AGG + contig1end:12445-12464 MsG0080048086.01.T01:intron 60.0%
TAGTCACGGGTCGGAGTCCT+AGG + contig1end:12569-12588 MsG0080048086.01.T01:intron 60.0%
! GCTTGTTGGGTCGCTCAGAG+AGG + contig1end:12441-12460 MsG0080048086.01.T01:intron 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
contig1end gene 10638 17120 10638 ID=MsG0080048086.01;Name=MsG0080048086.01
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contig1end CDS 16025 17120 16025 ID=MsG0080048086.01.T01:cds;Parent=MsG0080048086.01.T01
Gene Sequence

>MsG0080048086.01.T01

ATGTTGAAAGCATTTCTCGGTCGTAATGCTTTTGGCATATCAAATTACTCACAAACACTCAGATTCCTTACCACTACCACCTCTTCACACCCATTTACCGTATCCTACCTCATCGACAAATTTGAATTCTCACCTGAATCCGCACTCAAAGCTTCCAAAGAGCTTTATTTCAAAACCTCACAAAAACCTGATTCAGTTCTCAACTTCTTCAAAAATCACAGTTTCACCGACTCAGACATACGCAATATCATCAAAAGGGTACCATGGATTCTTTCCTGCAATACCCACAAAACGATTCTCCCAAAGTTTCAATTTTTACTCTCCAAAGGTGCTTCTGAATCTGACATTGTCCGCATGGTTAGAGGTAACCCTCAGTTCTTGGAATTAAGCTTGAAGAATCATCAAATTAAGTTTGATTATTTTTTATCCAAAGGTGCTTCTTCATCTGATATTGTTCCATTGTTAACTTCAAACCCTACAATTTTACACATTAGCTTGGAGAAACGAATAATCCCTCTTTTTGAATTGTTAAGAAGGTTCTTTAAAACTGACAAGGATACCGTTGTTTGCTTAATTCGACATTCAACTACATTTACTTTTAATTGCCATCGCCTTACGGTGGCTAATATCAGTTTGATGACTGATTTTGGAGTTTCTGATTCTACCATTGCTAGATTGCTTCACTCAAGGCCATCTATATTTGGTTCAACTGATTTGATTAAATCATTGGAGGAAGTAAAGAGTTTAGGGTTTGATCCTTCATTGACTACTTTTGGGGCTGCTTTGAAAGCCAAGAAAGGTATTAGTAAAAAACTTTGGGATGAGAAATTTGATGTCTTTAAGAAATGGGGTTGGTCCGATGAAACCGTTATTCGAGTATTTAGGTCTCAGCCTAATTTGATGTTGACTTCAATTGATAAGATTAATTTGGTGATGAGATTTTGGGTCAATCATTTAGGTTGGGATTCCTTGGCACTTGCTAAATTTCCAAATATGTTTAGTTATAGTTTACATAAAAGGGTCATTCCAAGGGCCTCAGTTTTGCAATTTCTTTTGATGAAAGGTTTGCGAAAAAAGAATGCAAGCTTAGTCACACCATTTACTTATTCTGAGAATCGCATCACAACATCTCAATCAGAATCAACCACACAACCATTTGCTGTATCCTATCTTATCAACAATTTTGGTTTCTCGTCTGAATCAGCTCTGAAAGCTTTCAACCTCAAGCAGGTTCGTTTCAATACCCCAGATAATCCTGACTCAGTCATCAACTTCTTAAAAAACCATGGCTTTTCAAACTCCAACACACGCATCATCATCAAAAAAGCACCTTGGTTACTTTCATCACAACCCCACAAAATGTTATTGCCAAAGTTTCAATTTTTTCTATCTGATGGCGCTTATTCCTCTGATATTATTCCACTGTTAACTGCACACCCTAGAATTTTACAAAGTAGCTTGGAGAAACGAATAATCCCTCTTTTTGAATTATTAAGTAGGTTCTTGATAACCAACAAGGATATCATTGTTTGCTTAATTCGATATTGGACTGCATTTTCTACTAATCCCTATCACCTTATTGTGTCTAATATCAATTTGATGGTTGATTTTGGAGTTTCTGATTCTACCATTGCTAGATTGCTTCGAACAAGGCCATCTATATTTGGTTCAACTGATTTGATTAAGTCATTGGAGGAAGTTAAGGGCTTAGGGTTTGACCCTTCAACGACCGCTTTTGGGACTGCTTTGGTGACCAAGCAATGGATGAGTAACATACTTTGGGATAAGAAAGTTGACGTCTTTATCAAATGGGGTTGGTCTGATGAAGATGTTATTCGAGTATTTAGGAGTCAGCCTAGTTTGATGTTGACGTCAATTGATAAGATTAATCTGTTGATGAGTTTTTGGGTAAATCAAATGGGTTGGGATCCCTTGGCACTTATTAATTCTCCACTTATGTTTTCTTTTAGTTTATCTAAAAGGATCATTCCAAGAGCCTCAGTTTTGCAATTTCTTTTGATGAAAGGTTTGCGAAAGAAGAAGGCGAGCTTAGTTAGACCATTTGCTTATTCTGAGGATATGTTCTTGAACAAGTGTGTTTTCAGCTTTAAGGAGGAGTCGGATTCTCTGTTGAAGCTATATGACGAAAAAATGAAACTTGCAAATACAACGGAGAACAATGTGATGCCATCCACCAAATGTGTAATGTATTGA
Protein sequence

>MsG0080048086.01.T01

MLKAFLGRNAFGISNYSQTLRFLTTTTSSHPFTVSYLIDKFEFSPESALKASKELYFKTSQKPDSVLNFFKNHSFTDSDIRNIIKRVPWILSCNTHKTILPKFQFLLSKGASESDIVRMVRGNPQFLELSLKNHQIKFDYFLSKGASSSDIVPLLTSNPTILHISLEKRIIPLFELLRRFFKTDKDTVVCLIRHSTTFTFNCHRLTVANISLMTDFGVSDSTIARLLHSRPSIFGSTDLIKSLEEVKSLGFDPSLTTFGAALKAKKGISKKLWDEKFDVFKKWGWSDETVIRVFRSQPNLMLTSIDKINLVMRFWVNHLGWDSLALAKFPNMFSYSLHKRVIPRASVLQFLLMKGLRKKNASLVTPFTYSENRITTSQSESTTQPFAVSYLINNFGFSSESALKAFNLKQVRFNTPDNPDSVINFLKNHGFSNSNTRIIIKKAPWLLSSQPHKMLLPKFQFFLSDGAYSSDIIPLLTAHPRILQSSLEKRIIPLFELLSRFLITNKDIIVCLIRYWTAFSTNPYHLIVSNINLMVDFGVSDSTIARLLRTRPSIFGSTDLIKSLEEVKGLGFDPSTTAFGTALVTKQWMSNILWDKKVDVFIKWGWSDEDVIRVFRSQPSLMLTSIDKINLLMSFWVNQMGWDPLALINSPLMFSFSLSKRIIPRASVLQFLLMKGLRKKKASLVRPFAYSEDMFLNKCVFSFKEESDSLLKLYDEKMKLANTTENNVMPSTKCVMY*