AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180000657.01

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MsG0180000657.01.T01 AT1G51810 33.824 204 110 3 162 342 487 688 2.70e-25 107
MsG0180000657.01.T01 AT1G10620 36.313 179 85 4 188 339 433 609 3.28e-25 107
MsG0180000657.01.T01 AT1G01540 38.356 146 67 2 188 310 217 362 3.44e-25 105
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MsG0180000657.01.T01 AT1G01540 35.119 168 86 2 188 332 217 384 4.34e-25 105
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MsG0180000657.01.T01 AT5G58940 40.123 162 72 3 195 332 219 379 5.88e-25 105
MsG0180000657.01.T01 AT5G58940 40.123 162 72 3 195 332 219 379 5.88e-25 105
MsG0180000657.01.T01 AT5G58940 40.123 162 72 3 195 332 219 379 5.88e-25 105
MsG0180000657.01.T01 AT5G58940 40.123 162 72 3 195 332 219 379 5.88e-25 105
MsG0180000657.01.T01 AT3G59110 38.621 145 66 2 188 309 253 397 6.26e-25 105
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MsG0180000657.01.T01 AT3G46400 35.754 179 90 3 188 343 639 815 8.36e-25 106
MsG0180000657.01.T01 AT2G11520 40.491 163 70 5 195 332 296 456 8.49e-25 105
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MsG0180000657.01.T01 AT1G09440 35.119 168 86 2 188 332 220 387 8.92e-25 105
MsG0180000657.01.T01 AT1G51850 38.122 181 86 4 188 345 621 798 9.01e-25 105
MsG0180000657.01.T01 AT4G29990 34.673 199 103 5 158 332 606 801 9.14e-25 105
MsG0180000657.01.T01 AT1G51850 38.122 181 86 4 188 345 641 818 9.99e-25 105
MsG0180000657.01.T01 AT2G37050 43.478 138 55 2 188 302 667 804 1.17e-24 105
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MsG0180000657.01.T01 AT2G42960 37.931 145 67 2 188 309 246 390 1.20e-24 104
MsG0180000657.01.T01 AT2G42960 37.931 145 67 2 188 309 246 390 1.20e-24 104
MsG0180000657.01.T01 AT2G42960 37.931 145 67 2 188 309 246 390 1.20e-24 104
MsG0180000657.01.T01 AT2G02800 43.796 137 54 3 188 302 156 291 1.21e-24 104
MsG0180000657.01.T01 AT2G02800 43.796 137 54 3 188 302 156 291 1.21e-24 104
MsG0180000657.01.T01 AT2G37050 43.478 138 55 2 188 302 666 803 1.24e-24 105
MsG0180000657.01.T01 AT1G51880 39.375 160 72 3 196 332 662 819 1.30e-24 105
MsG0180000657.01.T01 AT1G51880 39.375 160 72 3 196 332 654 811 1.37e-24 105
MsG0180000657.01.T01 AT2G17220 38.824 170 81 3 188 334 157 326 1.45e-24 103
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MsG0180000657.01.T01 AT1G68690 37.647 170 75 3 188 328 440 607 1.45e-24 105
MsG0180000657.01.T01 AT1G68690 37.647 170 75 3 188 328 440 607 1.45e-24 105
MsG0180000657.01.T01 AT2G17220 38.824 170 81 3 188 334 158 327 1.48e-24 103
MsG0180000657.01.T01 AT1G51880 39.375 160 72 3 196 332 636 793 1.67e-24 105
MsG0180000657.01.T01 AT4G29180 36.646 161 78 3 196 333 651 810 1.69e-24 105
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MsG0180000657.01.T01 AT4G01330 38.356 146 67 2 188 310 225 370 1.75e-24 104
MsG0180000657.01.T01 AT5G56790 37.714 175 85 2 187 338 452 625 1.76e-24 105
MsG0180000657.01.T01 AT4G29180 36.646 161 78 3 196 333 648 807 1.78e-24 105
MsG0180000657.01.T01 AT4G01330 38.356 146 67 2 188 310 225 370 1.79e-24 104
MsG0180000657.01.T01 AT1G54820 34.615 208 100 5 165 336 184 391 1.79e-24 103
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MsG0180000657.01.T01 AT4G29180 36.646 161 78 3 196 333 649 808 1.91e-24 105
MsG0180000657.01.T01 AT4G39110 39.560 182 84 3 188 344 589 769 1.95e-24 105
MsG0180000657.01.T01 AT1G69790 45.522 134 52 3 188 301 146 278 2.00e-24 102
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MsG0180000657.01.T01 AT5G28680 41.875 160 69 3 196 332 592 750 2.18e-24 104
MsG0180000657.01.T01 AT1G69790 45.522 134 52 3 188 301 157 289 2.21e-24 102
MsG0180000657.01.T01 AT3G46420 35.673 171 85 3 196 343 602 770 2.55e-24 104
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MsG0180000657.01.T01 AT3G13690 37.931 174 84 2 188 338 474 646 2.56e-24 104
MsG0180000657.01.T01 AT3G13690 37.931 174 84 2 188 338 474 646 2.56e-24 104
MsG0180000657.01.T01 AT1G51890 37.500 168 79 4 196 340 368 532 2.57e-24 104
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MsG0180000657.01.T01 AT2G28930 36.932 176 87 4 188 339 145 320 3.23e-24 102
MsG0180000657.01.T01 AT1G51830 36.598 194 98 4 162 332 423 614 3.26e-24 104
MsG0180000657.01.T01 AT2G28970 43.704 135 53 2 188 299 542 676 3.31e-24 104
MsG0180000657.01.T01 AT1G51890 37.500 168 79 4 196 340 640 804 3.38e-24 104
MsG0180000657.01.T01 AT1G51830 36.598 194 98 4 162 332 430 621 3.43e-24 104
MsG0180000657.01.T01 AT5G01020 39.429 175 82 4 188 339 139 312 3.78e-24 102
MsG0180000657.01.T01 AT2G28930 36.932 176 87 4 188 339 142 317 4.01e-24 102
MsG0180000657.01.T01 AT2G21480 38.798 183 84 4 188 344 588 768 4.37e-24 103
MsG0180000657.01.T01 AT1G51805 37.143 175 79 3 162 305 614 788 4.88e-24 103
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MsG0180000657.01.T01 AT1G51805 37.143 175 79 3 162 305 590 764 5.10e-24 103
MsG0180000657.01.T01 AT3G58690 40.805 174 73 5 188 332 150 322 5.36e-24 102
MsG0180000657.01.T01 AT2G28930 36.932 176 87 4 188 339 153 328 5.45e-24 102
MsG0180000657.01.T01 AT1G20650 37.427 171 83 3 188 334 141 311 6.39e-24 101
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MsG0180000657.01.T01 AT1G51870 44.186 129 49 2 196 301 601 729 7.05e-24 103
MsG0180000657.01.T01 AT5G38990 41.667 168 72 3 195 336 596 763 7.27e-24 103
MsG0180000657.01.T01 AT3G20530 36.628 172 84 3 188 334 146 317 7.39e-24 101
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MsG0180000657.01.T01 AT3G28690 41.060 151 64 3 188 315 148 296 7.57e-24 102
MsG0180000657.01.T01 AT2G26330 42.308 130 53 1 195 302 718 847 7.92e-24 103
MsG0180000657.01.T01 AT1G51870 44.186 129 49 2 196 301 653 781 8.01e-24 103
MsG0180000657.01.T01 AT1G72300 34.973 183 95 3 188 347 866 1047 8.38e-24 103
MsG0180000657.01.T01 AT3G28690 41.060 151 64 3 188 315 199 347 8.41e-24 102
MsG0180000657.01.T01 AT1G24650 34.928 209 111 3 162 345 586 794 8.54e-24 103
MsG0180000657.01.T01 AT3G46410 35.294 170 82 4 196 342 58 222 8.66e-24 99.8
MsG0180000657.01.T01 AT3G01300 40.789 152 65 3 188 316 209 358 8.85e-24 102
MsG0180000657.01.T01 AT4G23130 41.304 138 58 2 188 302 407 544 9.43e-24 102
MsG0180000657.01.T01 AT3G20530 38.710 155 70 3 188 317 146 300 9.61e-24 99.8
MsG0180000657.01.T01 AT5G59650 42.336 137 56 2 188 301 642 778 9.72e-24 102
MsG0180000657.01.T01 AT5G59650 42.336 137 56 2 188 301 650 786 1.05e-23 102
MsG0180000657.01.T01 AT4G29450 43.077 130 50 3 196 302 649 777 1.11e-23 102
MsG0180000657.01.T01 AT2G39660 39.474 152 69 3 188 316 140 291 1.11e-23 101
MsG0180000657.01.T01 AT1G70530 33.333 171 89 3 195 343 393 560 1.17e-23 102
MsG0180000657.01.T01 AT5G54380 34.615 208 112 3 157 341 542 748 1.18e-23 102
MsG0180000657.01.T01 AT1G51860 44.186 129 49 2 196 301 510 638 1.22e-23 102
MsG0180000657.01.T01 AT1G51860 38.750 160 73 3 196 332 654 811 1.25e-23 102
MsG0180000657.01.T01 AT1G31420 39.695 131 55 2 195 303 376 504 1.26e-23 102
MsG0180000657.01.T01 AT5G02800 38.506 174 81 4 188 336 137 309 1.27e-23 100
MsG0180000657.01.T01 AT4G23130 41.304 138 58 2 188 302 403 540 1.31e-23 102
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MsG0180000657.01.T01 AT2G02220 35.714 182 88 3 188 343 797 975 1.39e-23 102
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MsG0180000657.01.T01 AT3G09830 39.877 163 74 3 195 334 164 325 2.45e-23 100
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MsG0180000657.01.T01 AT1G55200 38.095 168 80 2 188 332 442 608 2.82e-23 101
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MsG0180000657.01.T01 AT5G37450 41.844 141 54 3 195 308 701 840 3.13e-23 101
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MsG0180000657.01.T01 AT3G24790 34.615 182 95 3 188 345 129 310 4.98e-23 99.0
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MsG0180000657.01.T01 AT2G35620 39.695 131 55 2 195 303 374 502 7.50e-23 100
MsG0180000657.01.T01 AT2G35620 39.695 131 55 2 195 303 374 502 7.50e-23 100
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MsG0180000657.01.T01 AT4G11480 34.254 181 95 3 188 344 387 567 2.00e-22 99.0
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MsG0180000657.01.T01 AT1G06700 37.931 174 79 4 188 332 132 305 2.09e-22 97.1
MsG0180000657.01.T01 AT4G13190 36.264 182 92 3 188 345 46 227 2.12e-22 95.9
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MsG0180000657.01.T01 AT4G04540 38.732 142 64 2 188 306 416 557 3.50e-22 98.2
MsG0180000657.01.T01 AT1G11340 31.579 209 118 3 162 347 552 758 3.51e-22 98.2
MsG0180000657.01.T01 AT1G56120 36.464 181 90 3 188 344 607 786 3.66e-22 98.2
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MsG0180000657.01.T01 AT2G18470 43.165 139 54 3 188 303 347 483 6.31e-22 97.4
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MsG0180000657.01.T01 AT5G15730 39.130 138 58 3 188 303 177 310 7.47e-22 96.3
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MsG0180000657.01.T01 AT2G07180 42.143 140 56 4 188 304 160 297 1.40e-21 95.5
MsG0180000657.01.T01 AT1G69910 36.066 183 75 5 188 339 398 569 1.41e-21 96.3
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MsG0180000657.01.T01 AT5G18610 37.427 171 83 3 188 334 147 317 1.53e-21 95.9
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MsG0180000657.01.T01 AT3G20200 39.130 138 58 2 192 303 517 654 2.67e-21 95.5
MsG0180000657.01.T01 AT1G07870 42.857 140 54 4 188 302 167 305 2.77e-21 95.1
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MsG0180000657.01.T01 AT4G23270 39.130 138 61 2 188 302 389 526 2.92e-21 95.5
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MsG0180000657.01.T01 AT1G78940 38.028 142 62 2 192 307 441 582 3.04e-21 95.5
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MsG0180000657.01.T01 AT1G07560 34.118 170 86 3 155 301 600 766 3.88e-21 95.1
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MsG0180000657.01.T01 AT5G65700 41.727 139 57 3 188 303 759 896 4.40e-21 95.1
MsG0180000657.01.T01 AT4G35600 36.994 173 82 5 188 336 160 329 4.65e-21 94.0
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MsG0180000657.01.T01 AT4G32300 33.908 174 92 2 188 338 555 728 4.81e-21 95.1
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MsG0180000657.01.T01 AT3G59350 36.464 181 86 4 188 339 177 357 4.86e-21 93.6
MsG0180000657.01.T01 AT1G34300 40.000 140 61 2 188 304 546 685 5.16e-21 94.7
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MsG0180000657.01.T01 AT2G47060 35.882 170 80 3 188 328 135 304 5.33e-21 93.2
MsG0180000657.01.T01 AT4G22130 38.158 152 71 2 188 316 319 470 5.47e-21 94.4
MsG0180000657.01.T01 AT4G23310 39.855 138 60 2 188 302 531 668 6.02e-21 94.7
MsG0180000657.01.T01 AT2G47060 35.465 172 81 4 188 329 135 306 6.23e-21 92.4
MsG0180000657.01.T01 AT4G27290 31.977 172 94 3 188 336 528 699 6.34e-21 94.7
MsG0180000657.01.T01 AT1G49730 40.714 140 57 3 188 302 390 528 6.37e-21 94.4
MsG0180000657.01.T01 AT4G27290 31.977 172 94 3 188 336 574 745 6.62e-21 94.4
MsG0180000657.01.T01 AT4G23310 39.855 138 60 2 188 302 571 708 6.69e-21 94.4
MsG0180000657.01.T01 AT4G20270 40.714 140 58 3 188 303 775 913 6.90e-21 94.7
MsG0180000657.01.T01 AT4G04500 36.747 166 81 4 159 301 380 544 7.17e-21 94.4
MsG0180000657.01.T01 AT3G59350 38.235 170 76 4 188 328 192 361 7.23e-21 93.2
MsG0180000657.01.T01 AT1G07550 40.741 135 58 1 196 308 630 764 7.33e-21 94.4
MsG0180000657.01.T01 AT5G10290 34.078 179 90 5 157 311 326 500 7.71e-21 94.0
MsG0180000657.01.T01 AT5G10290 34.078 179 90 5 157 311 326 500 7.71e-21 94.0
MsG0180000657.01.T01 AT2G23950 33.333 156 79 2 188 321 363 515 7.75e-21 94.0
MsG0180000657.01.T01 AT2G47060 35.882 170 80 3 188 328 135 304 7.77e-21 93.2
MsG0180000657.01.T01 AT4G22130 38.158 152 71 2 188 316 460 611 7.99e-21 94.4
MsG0180000657.01.T01 AT1G70740 32.934 167 90 1 188 332 125 291 8.87e-21 93.2
MsG0180000657.01.T01 AT1G60800 29.609 179 103 2 188 343 298 476 8.94e-21 94.0
MsG0180000657.01.T01 AT1G72760 35.632 174 74 4 196 340 450 614 8.97e-21 94.0
MsG0180000657.01.T01 AT1G61370 35.762 151 74 2 188 315 413 563 9.20e-21 94.0
MsG0180000657.01.T01 AT4G23280 39.130 138 61 2 188 302 405 542 1.04e-20 94.0
MsG0180000657.01.T01 AT3G62220 36.196 163 75 3 195 328 138 300 1.08e-20 92.0
MsG0180000657.01.T01 AT3G62220 36.196 163 75 3 195 328 138 300 1.08e-20 92.0
MsG0180000657.01.T01 AT1G74360 37.226 137 61 2 188 302 882 1015 1.08e-20 94.0
MsG0180000657.01.T01 AT1G72760 35.632 174 74 4 196 340 459 623 1.11e-20 93.6
MsG0180000657.01.T01 AT1G61370 35.762 151 74 2 188 315 564 714 1.17e-20 94.0
MsG0180000657.01.T01 AT4G23280 39.130 138 61 2 188 302 407 544 1.17e-20 93.6
MsG0180000657.01.T01 AT1G29720 34.831 178 92 3 188 343 736 911 1.18e-20 94.0
MsG0180000657.01.T01 AT2G33170 38.931 131 57 2 195 303 898 1027 1.25e-20 94.0
MsG0180000657.01.T01 AT2G33170 38.931 131 57 2 195 303 898 1027 1.25e-20 94.0
MsG0180000657.01.T01 AT1G71830 32.749 171 91 3 188 334 366 536 1.26e-20 93.6
MsG0180000657.01.T01 AT3G09010 33.735 166 80 4 165 300 79 244 1.42e-20 90.9
MsG0180000657.01.T01 AT1G60800 29.609 179 103 2 188 343 365 543 1.57e-20 93.2
MsG0180000657.01.T01 AT5G47070 44.366 142 57 5 195 315 167 307 1.80e-20 92.0
MsG0180000657.01.T01 AT1G11410 31.343 201 113 4 162 339 445 643 1.86e-20 93.2
MsG0180000657.01.T01 AT5G59660 35.625 160 75 3 196 332 556 710 1.94e-20 93.2
MsG0180000657.01.T01 AT5G59660 35.625 160 75 3 196 332 559 713 1.95e-20 93.2
MsG0180000657.01.T01 AT1G17230 39.130 138 62 1 188 303 864 1001 1.95e-20 93.2
MsG0180000657.01.T01 AT1G61480 39.041 146 64 3 188 308 559 704 1.97e-20 93.2
MsG0180000657.01.T01 AT1G11410 31.343 201 113 4 162 339 567 765 1.98e-20 93.2
MsG0180000657.01.T01 AT4G23240 32.370 173 93 3 188 336 91 263 2.04e-20 91.3
MsG0180000657.01.T01 AT1G11410 31.343 201 113 4 162 339 560 758 2.10e-20 93.2
MsG0180000657.01.T01 AT1G11410 31.343 201 113 4 162 339 536 734 2.12e-20 93.2
MsG0180000657.01.T01 AT3G02810 35.256 156 75 3 188 317 128 283 2.13e-20 92.8
MsG0180000657.01.T01 AT1G17230 39.130 138 62 1 188 303 864 1001 2.18e-20 93.2
MsG0180000657.01.T01 AT5G59660 35.625 160 75 3 196 332 534 688 2.21e-20 92.8
MsG0180000657.01.T01 AT5G55830 32.057 209 101 8 146 315 373 579 2.21e-20 92.8
MsG0180000657.01.T01 AT1G75820 41.667 132 53 3 195 303 763 893 2.23e-20 93.2
MsG0180000657.01.T01 AT5G59270 31.250 160 88 1 195 332 422 581 2.28e-20 92.8
MsG0180000657.01.T01 AT1G17540 40.909 132 51 2 196 300 477 608 2.36e-20 92.8
MsG0180000657.01.T01 AT5G59270 31.250 160 88 1 195 332 438 597 2.37e-20 92.8
MsG0180000657.01.T01 AT5G59270 31.250 160 88 1 195 332 419 578 2.47e-20 92.8
MsG0180000657.01.T01 AT4G23240 32.558 172 92 3 189 336 399 570 2.85e-20 92.4
MsG0180000657.01.T01 AT1G51890 34.211 190 77 6 196 340 640 826 3.36e-20 92.4
MsG0180000657.01.T01 AT4G33430 36.111 144 69 2 188 308 400 543 3.42e-20 92.4
MsG0180000657.01.T01 AT1G11340 32.778 180 96 3 162 318 620 797 3.58e-20 92.4
MsG0180000657.01.T01 AT4G11480 34.463 177 84 4 188 332 384 560 3.67e-20 92.0
MsG0180000657.01.T01 AT1G51790 33.721 172 88 5 188 336 691 859 3.67e-20 92.4
MsG0180000657.01.T01 AT4G33430 36.111 144 69 2 188 308 353 496 3.71e-20 92.0
MsG0180000657.01.T01 AT1G34210 32.164 171 92 3 188 334 369 539 3.73e-20 92.0
MsG0180000657.01.T01 AT1G34210 32.164 171 92 3 188 334 369 539 3.73e-20 92.0
MsG0180000657.01.T01 AT1G51790 33.721 172 88 5 188 336 639 807 3.80e-20 92.4
MsG0180000657.01.T01 AT1G51790 33.721 172 88 5 188 336 639 807 3.80e-20 92.4
MsG0180000657.01.T01 AT3G45860 36.957 138 64 2 188 302 414 551 3.98e-20 92.0
MsG0180000657.01.T01 AT3G17410 33.516 182 91 4 188 340 131 311 4.05e-20 90.5
MsG0180000657.01.T01 AT3G17410 33.516 182 91 4 188 340 131 311 4.05e-20 90.5
MsG0180000657.01.T01 AT2G43230 33.333 198 103 4 171 339 158 355 4.18e-20 90.9
MsG0180000657.01.T01 AT2G13800 36.111 144 69 2 188 308 222 365 4.47e-20 91.3
MsG0180000657.01.T01 AT2G13800 36.111 144 69 2 188 308 222 365 4.47e-20 91.3
MsG0180000657.01.T01 AT1G69270 32.558 172 90 4 190 337 327 496 4.49e-20 91.7
MsG0180000657.01.T01 AT5G54590 38.406 138 60 3 188 303 176 310 4.63e-20 91.3
MsG0180000657.01.T01 AT5G54590 38.406 138 60 3 188 303 176 310 4.63e-20 91.3
MsG0180000657.01.T01 AT5G54590 38.406 138 60 3 188 303 176 310 4.63e-20 91.3

Find 72 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 188 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ACTGCCAAAGTGTCAGATTT+TGG 0.190922 1:+9314026 MsG0180000657.01.T01:CDS
GCAAATTGTAGAAACACTTT+AGG 0.256518 1:+9313057 MsG0180000657.01.T01:CDS
CTCCTTCCTTTGTTCCATTC+CGG 0.261127 1:-9313112 None:intergenic
ACCTGTGCCTCCAGGAAGTA+TGG 0.265334 1:-9312725 None:intergenic
TAAATTTGTGATTCAATTCA+AGG 0.315189 1:+9311822 MsG0180000657.01.T01:CDS
ACATTCACTACTTTCCTTGC+AGG 0.316108 1:-9312639 None:intergenic
GGCAATGCATCCATTGATAA+TGG 0.317607 1:+9311858 MsG0180000657.01.T01:CDS
TCCATTCCGGTTTGCCCCTC+GGG 0.319685 1:-9313099 None:intergenic
TAACTTGGAAAACTCGTCTT+AGG 0.323972 1:+9313896 MsG0180000657.01.T01:CDS
TCCGGCCTACCAAAACAAAA+AGG 0.328116 1:-9314212 None:intergenic
TTTCCTATCCCAAATGGATA+TGG 0.328298 1:-9311985 None:intergenic
CAAATTGTAGAAACACTTTA+GGG 0.335236 1:+9313058 MsG0180000657.01.T01:CDS
GCAAGACTTCTTCTCTCTTC+CGG 0.341200 1:-9314230 None:intergenic
TAACAATTCCATATCCATTT+GGG 0.342044 1:+9311977 MsG0180000657.01.T01:CDS
TTCCATTCCGGTTTGCCCCT+CGG 0.365288 1:-9313100 None:intergenic
TTAACAATTCCATATCCATT+TGG 0.380950 1:+9311976 MsG0180000657.01.T01:CDS
TGAAGGAAATCCATACTTCC+TGG 0.381180 1:+9312715 MsG0180000657.01.T01:CDS
AGTGCTAACATTCTCTTAGA+TGG 0.388143 1:+9313996 MsG0180000657.01.T01:CDS
AGAAACAGAAGTTCCTTTGT+TGG 0.394108 1:+9313807 MsG0180000657.01.T01:CDS
GCAAGGAACTATTGGCTACT+TGG 0.404154 1:+9314097 MsG0180000657.01.T01:CDS
GTTCTTGTGGAGCTGCTAAC+GGG 0.406982 1:+9314182 MsG0180000657.01.T01:CDS
ATCTGACACTTTGGCAGTGT+TGG 0.423535 1:-9314021 None:intergenic
AAAAGTGATGTATATAGCTT+TGG 0.431286 1:+9314155 MsG0180000657.01.T01:CDS
ACAATGGTGCAAGGAACTAT+TGG 0.435711 1:+9314089 MsG0180000657.01.T01:CDS
GTTGAATTTCCTATCCCAAA+TGG 0.441531 1:-9311991 None:intergenic
AAATTATTCAAGATGGTATG+TGG 0.441902 1:+9314294 MsG0180000657.01.T01:CDS
AAGTGTTTACAAGGCTTTGA+AGG 0.446150 1:+9312698 MsG0180000657.01.T01:CDS
TTCTGTCCCGAGGGGCAAAC+CGG 0.447190 1:+9313093 MsG0180000657.01.T01:CDS
GGTAGGACTTGTTGAGGTTG+AGG 0.455596 1:-9311928 None:intergenic
GTGTTTGAAATTATTCAAGA+TGG 0.465307 1:+9314287 MsG0180000657.01.T01:CDS
AGGACAGTAGGTAGTACTAT+TGG 0.471386 1:-9313163 None:intergenic
GCTAATGAAACCATTATCAA+TGG 0.473344 1:-9311868 None:intergenic
TCCATACTTCCTGGAGGCAC+AGG 0.482185 1:+9312724 MsG0180000657.01.T01:CDS
TACAGATGCAAGTGTTTACA+AGG 0.484621 1:+9312689 MsG0180000657.01.T01:CDS
GTTGCATTGGATGAACTTGC+TGG 0.485732 1:-9313139 None:intergenic
TGGCTTGTTTGCATATACTC+TGG 0.486208 1:-9314122 None:intergenic
AAGAAAACAACAAGAGATCA+AGG 0.486545 1:+9314321 MsG0180000657.01.T01:CDS
GTAAGACGAATGATCTAACT+TGG 0.495721 1:+9313881 MsG0180000657.01.T01:CDS
ATTCAAGGCAATGAAACTAA+AGG 0.497402 1:+9311837 MsG0180000657.01.T01:CDS
AGTTCTTGTGGAGCTGCTAA+CGG 0.504976 1:+9314181 MsG0180000657.01.T01:CDS
AGCTCCAAAATCTGACACTT+TGG 0.506090 1:-9314030 None:intergenic
GTTTATGAGTTTGTTAGCAA+TGG 0.511518 1:+9313829 MsG0180000657.01.T01:CDS
TAGTACTATTGGAGTTGCAT+TGG 0.514298 1:-9313152 None:intergenic
ATTCCATATCCATTTGGGAT+AGG 0.517727 1:+9311982 MsG0180000657.01.T01:CDS
ATAGTACTACCTACTGTCCT+TGG 0.533379 1:+9313166 MsG0180000657.01.T01:CDS
CAACCTCAACAAGTCCTACC+AGG 0.536862 1:+9311931 MsG0180000657.01.T01:CDS
TCCCGAGGGGCAAACCGGAA+TGG 0.541302 1:+9313098 MsG0180000657.01.T01:CDS
GCTACTTCAGTTTGATCAAG+TGG 0.544794 1:-9314065 None:intergenic
TCACACTTGTTTCTGTCCCG+AGG 0.546375 1:+9313083 MsG0180000657.01.T01:CDS
TAGCTTTGGAGTAGTTCTTG+TGG 0.547374 1:+9314169 MsG0180000657.01.T01:CDS
TACAGATAACTATGCCTGCA+AGG 0.557545 1:+9312625 MsG0180000657.01.T01:CDS
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CAGCCTGGTAGGACTTGTTG+AGG 0.572481 1:-9311934 None:intergenic
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CRISPR-GE

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GAGAAGTTCTTTAGGCAGAA+TGG + Chr1:9313493-9313512 MsG0180000657.01.T01:intron 40.0%
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!! CTATGCTGCTGATTTAGTCT+CGG + Chr1:9313368-9313387 MsG0180000657.01.T01:intron 40.0%
!! GGGGAGAAACCTTTTTGTTT+TGG + Chr1:9314203-9314222 MsG0180000657.01.T01:CDS 40.0%
!! TAGCTTTGGAGTAGTTCTTG+TGG + Chr1:9314169-9314188 MsG0180000657.01.T01:CDS 40.0%
!! TATGCTGCTGATTTAGTCTC+GGG + Chr1:9313369-9313388 MsG0180000657.01.T01:intron 40.0%
!! TGGCTTGTTTGCATATACTC+TGG - Chr1:9314125-9314144 None:intergenic 40.0%
!!! ACCTTTTTGTTTTGGTAGGC+CGG + Chr1:9314211-9314230 MsG0180000657.01.T01:CDS 40.0%
!!! AGATTTTGGAGCTTCGAGAT+TGG + Chr1:9314040-9314059 MsG0180000657.01.T01:CDS 40.0%
!!! GTTTTTGGTTCCTAAAGGCT+TGG - Chr1:9313297-9313316 None:intergenic 40.0%
!!! TATTTTTTACCTGTGCCTCC+AGG - Chr1:9312736-9312755 None:intergenic 40.0%
AACCGGAATGGAACAAAGGA+AGG + Chr1:9313110-9313129 MsG0180000657.01.T01:CDS 45.0%
AAGTGTAATTGCAGCCTGGT+AGG - Chr1:9311948-9311967 None:intergenic 45.0%
AGGAAATCCATACTTCCTGG+AGG + Chr1:9312718-9312737 MsG0180000657.01.T01:CDS 45.0%
AGTTCTTGTGGAGCTGCTAA+CGG + Chr1:9314181-9314200 MsG0180000657.01.T01:CDS 45.0%
AGTTGCTTACCAAGGACAGT+AGG - Chr1:9313178-9313197 None:intergenic 45.0%
ATCTGACACTTTGGCAGTGT+TGG - Chr1:9314024-9314043 None:intergenic 45.0%
CAATCGAACTTGAGACCTTG+AGG + Chr1:9313252-9313271 MsG0180000657.01.T01:intron 45.0%
CTCCTTCCTTTGTTCCATTC+CGG - Chr1:9313115-9313134 None:intergenic 45.0%
GATTGTCCCCAATGCCAATT+TGG - Chr1:9313237-9313256 None:intergenic 45.0%
GCAAGACTTCTTCTCTCTTC+CGG - Chr1:9314233-9314252 None:intergenic 45.0%
GCAGAATGGAGGTTCTATGT+TGG + Chr1:9313507-9313526 MsG0180000657.01.T01:intron 45.0%
GCATGCTTAGTTGCTTACCA+AGG - Chr1:9313186-9313205 None:intergenic 45.0%
GGAATGGAACAAAGGAAGGA+GGG + Chr1:9313114-9313133 MsG0180000657.01.T01:CDS 45.0%
GTTGCATTGGATGAACTTGC+TGG - Chr1:9313142-9313161 None:intergenic 45.0%
TCCGGCCTACCAAAACAAAA+AGG - Chr1:9314215-9314234 None:intergenic 45.0%
! ACAGGTGCCACATATTCAAC+AGG + Chr1:9312304-9312323 MsG0180000657.01.T01:intron 45.0%
! CAGGTGCCACATATTCAACA+GGG + Chr1:9312305-9312324 MsG0180000657.01.T01:intron 45.0%
! GCAAGGAACTATTGGCTACT+TGG + Chr1:9314097-9314116 MsG0180000657.01.T01:CDS 45.0%
!! TTGGCTTTCGTCCACTGTTT+TGG - Chr1:9313707-9313726 None:intergenic 45.0%
CAACCTCAACAAGTCCTACC+AGG + Chr1:9311931-9311950 MsG0180000657.01.T01:CDS 50.0%
CCACAAGTGTAATTGCAGCC+TGG - Chr1:9311952-9311971 None:intergenic 50.0%
CCAGGCTGCAATTACACTTG+TGG + Chr1:9311949-9311968 MsG0180000657.01.T01:CDS 50.0%
CGGAATGGAACAAAGGAAGG+AGG + Chr1:9313113-9313132 MsG0180000657.01.T01:CDS 50.0%
GAAGTAGCCACAATGGTGCA+AGG + Chr1:9314080-9314099 MsG0180000657.01.T01:CDS 50.0%
GGCAAACCGGAATGGAACAA+AGG + Chr1:9313106-9313125 MsG0180000657.01.T01:CDS 50.0%
GTTCTTGTGGAGCTGCTAAC+GGG + Chr1:9314182-9314201 MsG0180000657.01.T01:CDS 50.0%
TCGAACTTGAGACCTTGAGG+AGG + Chr1:9313255-9313274 MsG0180000657.01.T01:intron 50.0%
TCGTCTTAGGATAGCTGCAG+AGG + Chr1:9313909-9313928 MsG0180000657.01.T01:CDS 50.0%
TTCAGGACTTCGATACCCCT+AGG - Chr1:9312092-9312111 None:intergenic 50.0%
TTCTTGTGGAGCTGCTAACG+GGG + Chr1:9314183-9314202 MsG0180000657.01.T01:CDS 50.0%
!! ACACTTGTTTCTGTCCCGAG+GGG + Chr1:9313085-9313104 MsG0180000657.01.T01:CDS 50.0%
!! AGGTTTAGGGTGTTGCCAAG+TGG + Chr1:9312392-9312411 MsG0180000657.01.T01:intron 50.0%
!! CACACTTGTTTCTGTCCCGA+GGG + Chr1:9313084-9313103 MsG0180000657.01.T01:CDS 50.0%
!! GGTAGGACTTGTTGAGGTTG+AGG - Chr1:9311931-9311950 None:intergenic 50.0%
!! TCACACTTGTTTCTGTCCCG+AGG + Chr1:9313083-9313102 MsG0180000657.01.T01:CDS 50.0%
ACCTGTGCCTCCAGGAAGTA+TGG - Chr1:9312728-9312747 None:intergenic 55.0%
AGGATAGCTGCAGAGGTAGC+TGG + Chr1:9313916-9313935 MsG0180000657.01.T01:intron 55.0%
CTCTCAGGTCCCAAGCCTTT+AGG + Chr1:9313284-9313303 MsG0180000657.01.T01:intron 55.0%
TCTTGTGGAGCTGCTAACGG+GGG + Chr1:9314184-9314203 MsG0180000657.01.T01:CDS 55.0%
! TCCATACTTCCTGGAGGCAC+AGG + Chr1:9312724-9312743 MsG0180000657.01.T01:CDS 55.0%
! TGAGAGTGTGCTCCTCCTCA+AGG - Chr1:9313270-9313289 None:intergenic 55.0%
! TTCCATTCCGGTTTGCCCCT+CGG - Chr1:9313103-9313122 None:intergenic 55.0%
! TTGAGGAGGAGCACACTCTC+AGG + Chr1:9313269-9313288 MsG0180000657.01.T01:intron 55.0%
!! CAGCCTGGTAGGACTTGTTG+AGG - Chr1:9311937-9311956 None:intergenic 55.0%
TTCTGTCCCGAGGGGCAAAC+CGG + Chr1:9313093-9313112 MsG0180000657.01.T01:CDS 60.0%
! TCCATTCCGGTTTGCCCCTC+GGG - Chr1:9313102-9313121 None:intergenic 60.0%
TCCCGAGGGGCAAACCGGAA+TGG + Chr1:9313098-9313117 MsG0180000657.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 9311781 9314349 9311781 ID=MsG0180000657.01;Name=MsG0180000657.01
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Gene Sequence

>MsG0180000657.01.T01

ATGCCACAAGACACTAAAAAATCCTATCATTTTTCTACTACTAAATTTGTGATTCAATTCAAGGCAATGAAACTAAAGGCAATGCATCCATTGATAATGGTTTCATTAGCACTTTTGATAAAAACAATTGCATTTGCATCTGATCAACCTCAACCTCAACAAGTCCTACCAGGCTGCAATTACACTTGTGGAGATTTAACAATTCCATATCCATTTGGGATAGGAAATTCAACAGCACAACATCATGCACCATCACAAACTACAGATAACTATGCCTGCAAGGAAAGTAGTGAATGTGTTGATAAAGATTCAGATTATGACGGTTACAGATGCAAGTGTTTACAAGGCTTTGAAGGAAATCCATACTTCCTGGAGGCACAGACATTGACGAATGTGCAACAAAAAACTCATGTATGCAAAAATAAAGCAAATTGTAGAAACACTTTAGGGAATCACACTTGTTTCTGTCCCGAGGGGCAAACCGGAATGGAACAAAGGAAGGAGGGTGCCAGCAAGTTCATCCAATGCAACTCCAATAGTACTACCTACTGTCCTTGGGTGTGTCTAGAAACAGAAGTTCCTTTGTTGGTTTATGAGTTTGTTAGCAATGGTACTCTTTCTGAATTTCTTCGCACACAAGGTAAGACGAATGATCTAACTTGGAAAACTCGTCTTAGGATAGCTGCAGAGAGTGCTAACATTCTCTTAGATGGAACCAACACTGCCAAAGTGTCAGATTTTGGAGCTTCGAGATTGGTTCCACTTGATCAAACTGAAGTAGCCACAATGGTGCAAGGAACTATTGGCTACTTGGATCCAGAGTATATGCAAACAAGCCAATTAACTGAGAAAAGTGATGTATATAGCTTTGGAGTAGTTCTTGTGGAGCTGCTAACGGGGGAGAAACCTTTTTGTTTTGGTAGGCCGGAAGAGAGAAGAAGTCTTGCTACGCACTTTTTATCTTGCTTGAAAAAGGATAATGTGTTTGAAATTATTCAAGATGGTATGTGGAATGAAGAAAACAACAAGAGATCAAGGATGTAG
Protein sequence

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