AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180001124.01

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MsG0180001124.01.T01 AT5G39030 49.169 301 147 3 321 617 482 780 8.56e-100 323
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MsG0180001124.01.T01 AT1G66980 48.802 334 157 6 315 641 815 1141 1.75e-97 323
MsG0180001124.01.T01 AT1G66980 48.802 334 157 6 315 641 817 1143 1.93e-97 323
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MsG0180001124.01.T01 AT1G66930 37.857 420 196 13 209 617 241 606 9.53e-78 260
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MsG0180001124.01.T01 AT1G56120 35.884 379 226 9 269 642 652 1018 5.12e-61 220
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MsG0180001124.01.T01 AT5G18500 40.136 294 162 8 321 606 154 441 3.61e-60 209
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MsG0180001124.01.T01 AT5G18500 40.136 294 162 8 321 606 154 441 3.61e-60 209
MsG0180001124.01.T01 AT4G00960 38.413 315 181 7 337 642 62 372 6.43e-60 205
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MsG0180001124.01.T01 AT1G09440 38.699 292 169 7 321 606 145 432 3.75e-58 203
MsG0180001124.01.T01 AT1G53420 36.257 342 205 8 269 603 561 896 1.19e-57 210
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MsG0180001124.01.T01 AT5G40380 35.989 364 208 11 266 615 249 601 3.22e-57 205
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MsG0180001124.01.T01 AT4G23270 33.241 361 229 6 286 637 276 633 1.18e-56 203
MsG0180001124.01.T01 AT4G04570 36.212 359 207 9 265 615 283 627 1.26e-56 203
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MsG0180001124.01.T01 AT5G06740 35.806 310 180 8 318 614 327 630 2.05e-56 203
MsG0180001124.01.T01 AT4G23200 33.143 350 221 6 286 627 289 633 2.59e-56 202
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MsG0180001124.01.T01 AT4G01330 38.356 292 170 6 321 606 150 437 4.09e-55 195
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MsG0180001124.01.T01 AT4G23190 32.591 359 220 7 273 615 207 559 4.76e-55 197
MsG0180001124.01.T01 AT4G01330 38.356 292 170 6 321 606 150 437 4.86e-55 195
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MsG0180001124.01.T01 AT1G07650 37.748 302 177 7 321 615 666 963 9.47e-55 202
MsG0180001124.01.T01 AT4G23310 36.964 303 182 5 319 615 494 793 1.01e-54 200
MsG0180001124.01.T01 AT1G07650 37.748 302 177 7 321 615 672 969 1.17e-54 202
MsG0180001124.01.T01 AT1G11300 33.420 386 235 10 270 642 437 813 1.19e-54 200
MsG0180001124.01.T01 AT4G23190 32.591 359 220 7 273 615 285 637 1.26e-54 198
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MsG0180001124.01.T01 AT4G11490 34.194 310 195 5 319 622 307 613 1.31e-54 197
MsG0180001124.01.T01 AT3G26940 35.593 295 174 6 321 603 62 352 1.35e-54 192
MsG0180001124.01.T01 AT1G60800 40.206 291 164 6 320 603 288 575 1.53e-54 197
MsG0180001124.01.T01 AT1G11300 35.692 325 198 5 321 642 482 798 1.89e-54 199
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MsG0180001124.01.T01 AT1G56720 36.644 292 175 7 321 606 167 454 4.18e-54 193
MsG0180001124.01.T01 AT1G56720 36.644 292 175 7 321 606 167 454 4.18e-54 193
MsG0180001124.01.T01 AT4G23320 32.659 346 219 7 278 615 129 468 4.24e-54 193
MsG0180001124.01.T01 AT4G23320 32.659 346 219 7 278 615 129 468 4.24e-54 193
MsG0180001124.01.T01 AT4G23260 34.754 305 186 6 319 615 314 613 4.78e-54 196
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MsG0180001124.01.T01 AT4G23260 34.754 305 186 6 319 615 325 624 5.39e-54 196
MsG0180001124.01.T01 AT4G23320 32.659 346 219 7 278 615 150 489 5.75e-54 193
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MsG0180001124.01.T01 AT4G33430 38.225 293 168 7 320 603 276 564 6.91e-54 195
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MsG0180001124.01.T01 AT1G61440 37.179 312 183 9 321 625 471 776 7.90e-54 197
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MsG0180001124.01.T01 AT1G29750 37.427 342 194 9 268 603 626 953 8.29e-54 199
MsG0180001124.01.T01 AT4G23180 33.621 348 212 9 307 643 326 665 8.78e-54 196
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MsG0180001124.01.T01 AT4G04510 34.167 360 223 8 274 625 276 629 1.07e-53 195
MsG0180001124.01.T01 AT4G38830 36.601 306 181 7 319 615 330 631 1.13e-53 195
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MsG0180001124.01.T01 AT4G23130 35.314 303 187 5 319 615 330 629 1.32e-53 195
MsG0180001124.01.T01 AT5G45780 36.416 346 201 8 264 603 241 573 1.34e-53 194
MsG0180001124.01.T01 AT4G23160 32.853 347 215 8 307 644 337 674 1.36e-53 195
MsG0180001124.01.T01 AT4G33430 38.225 293 168 7 320 603 323 611 1.47e-53 195
MsG0180001124.01.T01 AT1G70740 34.324 370 208 11 296 641 17 375 1.59e-53 189
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MsG0180001124.01.T01 AT1G61430 34.940 332 203 9 304 628 437 762 2.67e-53 196
MsG0180001124.01.T01 AT1G61430 34.940 332 203 9 304 628 437 762 2.67e-53 196
MsG0180001124.01.T01 AT1G65800 32.095 377 219 8 271 615 440 811 2.87e-53 196
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MsG0180001124.01.T01 AT1G53430 38.062 289 169 6 321 603 657 941 4.13e-53 197
MsG0180001124.01.T01 AT1G56145 33.156 377 214 8 268 615 628 995 5.14e-53 197
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MsG0180001124.01.T01 AT5G03140 33.616 354 215 9 269 612 314 657 6.31e-53 194
MsG0180001124.01.T01 AT2G42960 34.259 324 197 8 321 632 171 490 6.62e-53 189
MsG0180001124.01.T01 AT2G42960 34.259 324 197 8 321 632 171 490 6.62e-53 189
MsG0180001124.01.T01 AT2G42960 34.259 324 197 8 321 632 171 490 6.62e-53 189
MsG0180001124.01.T01 AT2G42960 34.259 324 197 8 321 632 171 490 6.62e-53 189
MsG0180001124.01.T01 AT1G34210 38.908 293 166 8 320 603 292 580 6.76e-53 192
MsG0180001124.01.T01 AT1G34210 38.908 293 166 8 320 603 292 580 6.76e-53 192
MsG0180001124.01.T01 AT4G23250 34.098 305 188 6 319 615 345 644 9.47e-53 193
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MsG0180001124.01.T01 AT1G29730 38.235 306 168 7 321 615 661 956 3.48e-52 194
MsG0180001124.01.T01 AT1G61370 36.102 313 188 8 321 627 489 795 3.68e-52 193
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MsG0180001124.01.T01 AT4G23250 34.098 305 188 6 319 615 340 639 7.87e-52 193
MsG0180001124.01.T01 AT1G65790 36.806 288 170 5 336 615 524 807 8.38e-52 192
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MsG0180001124.01.T01 AT4G04490 34.524 336 205 7 270 602 283 606 9.62e-52 189
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MsG0180001124.01.T01 AT1G11330 32.345 371 215 10 276 615 443 808 1.44e-51 191
MsG0180001124.01.T01 AT1G61430 34.627 335 203 10 304 628 460 788 1.54e-51 191
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MsG0180001124.01.T01 AT4G11480 31.680 363 226 7 292 639 283 638 1.94e-51 189
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MsG0180001124.01.T01 AT4G11900 39.527 296 170 7 325 615 529 820 5.62e-51 190
MsG0180001124.01.T01 AT4G11480 32.312 359 224 8 292 639 283 633 5.79e-51 187
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MsG0180001124.01.T01 AT4G11460 32.915 319 205 5 319 631 332 647 7.48e-51 187
MsG0180001124.01.T01 AT5G39000 39.249 293 166 8 320 603 505 794 7.88e-51 189
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MsG0180001124.01.T01 AT1G61490 34.824 313 193 7 321 627 452 759 1.04e-50 188
MsG0180001124.01.T01 AT1G61490 34.824 313 193 7 321 627 478 785 1.10e-50 189
MsG0180001124.01.T01 AT1G61490 34.824 313 193 7 321 627 478 785 1.10e-50 189
MsG0180001124.01.T01 AT1G61490 34.824 313 193 7 321 627 478 785 1.10e-50 189
MsG0180001124.01.T01 AT1G61490 34.824 313 193 7 321 627 478 785 1.10e-50 189
MsG0180001124.01.T01 AT1G61420 36.824 296 176 7 326 615 339 629 1.17e-50 187
MsG0180001124.01.T01 AT2G13800 37.755 294 168 8 320 603 145 433 1.21e-50 183
MsG0180001124.01.T01 AT2G13800 37.755 294 168 8 320 603 145 433 1.21e-50 183
MsG0180001124.01.T01 AT4G11460 32.710 321 206 5 319 631 332 650 1.21e-50 187
MsG0180001124.01.T01 AT1G61420 36.824 296 176 7 326 615 337 627 1.29e-50 186
MsG0180001124.01.T01 AT4G04570 39.927 273 155 6 265 534 283 549 1.31e-50 185
MsG0180001124.01.T01 AT5G63940 32.792 308 197 5 321 622 350 653 1.39e-50 187
MsG0180001124.01.T01 AT5G15730 38.435 294 168 7 310 602 94 375 1.41e-50 182
MsG0180001124.01.T01 AT5G15730 38.435 294 168 7 310 602 94 375 1.41e-50 182
MsG0180001124.01.T01 AT4G23140 33.333 357 209 10 307 643 329 676 1.51e-50 187
MsG0180001124.01.T01 AT1G61480 34.494 316 197 7 321 631 484 794 1.54e-50 188
MsG0180001124.01.T01 AT1G61400 36.570 309 177 9 321 615 488 791 2.21e-50 188
MsG0180001124.01.T01 AT1G67520 35.974 303 183 6 321 615 247 546 2.27e-50 184
MsG0180001124.01.T01 AT1G11340 35.092 379 220 11 257 615 426 798 2.32e-50 188
MsG0180001124.01.T01 AT4G00960 44.976 209 103 5 337 536 62 267 2.52e-50 176
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MsG0180001124.01.T01 AT1G67520 35.974 303 183 6 321 615 276 575 2.54e-50 185
MsG0180001124.01.T01 AT1G61420 35.599 309 188 7 326 628 487 790 2.71e-50 187
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MsG0180001124.01.T01 AT1G61420 35.599 309 188 7 326 628 489 792 2.92e-50 187
MsG0180001124.01.T01 AT4G21400 35.691 311 183 7 323 622 351 655 3.11e-50 186
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MsG0180001124.01.T01 AT4G11470 32.133 361 221 8 290 634 304 656 4.01e-50 185
MsG0180001124.01.T01 AT5G54590 37.153 288 165 7 319 602 101 376 4.38e-50 180
MsG0180001124.01.T01 AT5G54590 37.153 288 165 7 319 602 101 376 4.38e-50 180
MsG0180001124.01.T01 AT5G54590 37.153 288 165 7 319 602 101 376 4.38e-50 180
MsG0180001124.01.T01 AT4G21400 33.156 377 201 12 287 622 178 544 4.39e-50 183
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MsG0180001124.01.T01 AT3G20530 40.611 229 129 5 321 544 70 296 5.66e-50 176
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MsG0180001124.01.T01 AT2G13800 36.977 311 173 9 320 612 262 567 5.79e-50 184
MsG0180001124.01.T01 AT5G15730 38.095 294 167 7 310 602 94 373 5.88e-50 180
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MsG0180001124.01.T01 AT5G62710 33.239 352 214 12 269 605 206 551 6.51e-50 183
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MsG0180001124.01.T01 AT4G03230 38.621 290 159 8 336 615 538 818 7.58e-50 186
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MsG0180001124.01.T01 AT1G67520 35.974 303 183 6 321 615 441 740 8.51e-50 186
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MsG0180001124.01.T01 AT1G61500 35.082 305 189 6 326 625 466 766 9.41e-50 186
MsG0180001124.01.T01 AT1G69790 36.213 301 167 9 321 604 61 353 9.73e-50 177
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MsG0180001124.01.T01 AT4G03230 38.621 290 159 8 336 615 595 875 1.07e-49 186
MsG0180001124.01.T01 AT4G27290 39.179 268 156 5 336 599 470 734 1.10e-49 186
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MsG0180001124.01.T01 AT4G03230 38.621 290 159 8 336 615 695 975 1.18e-49 187
MsG0180001124.01.T01 AT5G38990 38.591 298 161 10 320 603 512 801 1.19e-49 186
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MsG0180001124.01.T01 AT4G27290 39.179 268 156 5 336 599 516 780 1.69e-49 185
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MsG0180001124.01.T01 AT5G59670 35.862 290 174 6 320 604 553 835 3.61e-49 184
MsG0180001124.01.T01 AT1G23540 38.095 294 164 8 321 603 359 645 3.82e-49 183
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MsG0180001124.01.T01 AT1G48210 35.294 289 174 5 325 603 60 345 4.10e-49 176
MsG0180001124.01.T01 AT1G48210 35.294 289 174 5 325 603 60 345 4.10e-49 176
MsG0180001124.01.T01 AT1G61440 34.421 337 183 10 321 625 471 801 4.99e-49 184
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MsG0180001124.01.T01 AT5G18610 35.526 304 183 8 321 615 71 370 6.88e-49 179
MsG0180001124.01.T01 AT5G18610 35.526 304 183 8 321 615 71 370 6.88e-49 179
MsG0180001124.01.T01 AT1G67720 36.422 313 178 9 296 604 583 878 6.97e-49 184
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MsG0180001124.01.T01 AT1G77280 31.153 321 207 5 321 630 392 709 8.07e-49 182
MsG0180001124.01.T01 AT1G52290 35.570 298 167 10 321 603 131 418 8.71e-49 178
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MsG0180001124.01.T01 AT1G61590 38.225 293 161 9 325 603 91 377 1.89e-48 176
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MsG0180001124.01.T01 AT1G25390 30.413 605 327 32 41 612 32 575 2.11e-48 180
MsG0180001124.01.T01 AT1G25390 30.413 605 327 32 41 612 32 575 2.11e-48 180
MsG0180001124.01.T01 AT5G59270 35.667 300 175 9 313 603 348 638 2.14e-48 181
MsG0180001124.01.T01 AT5G59270 35.667 300 175 9 313 603 329 619 2.22e-48 180
MsG0180001124.01.T01 AT1G24650 38.062 289 164 8 319 596 533 817 2.25e-48 182
MsG0180001124.01.T01 AT2G28970 36.552 290 174 5 319 604 467 750 2.38e-48 182
MsG0180001124.01.T01 AT5G48740 32.845 341 219 8 268 604 545 879 2.48e-48 182
MsG0180001124.01.T01 AT5G35960 35.235 298 173 9 321 610 122 407 2.71e-48 175
MsG0180001124.01.T01 AT1G61390 35.599 309 186 9 326 628 345 646 2.82e-48 180
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MsG0180001124.01.T01 AT1G61360 32.831 332 211 8 321 645 405 731 2.89e-48 181
MsG0180001124.01.T01 AT1G61360 32.831 332 211 8 321 645 405 731 2.89e-48 181
MsG0180001124.01.T01 AT4G34440 36.176 340 175 11 321 644 300 613 2.92e-48 180
MsG0180001124.01.T01 AT4G34440 36.176 340 175 11 321 644 300 613 2.92e-48 180
MsG0180001124.01.T01 AT1G61360 32.831 332 211 8 321 645 486 812 3.50e-48 181
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MsG0180001124.01.T01 AT1G68690 33.079 393 203 12 266 609 276 657 2.09e-47 178
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MsG0180001124.01.T01 AT1G55200 37.124 299 163 10 318 603 364 650 3.20e-47 177
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MsG0180001124.01.T01 AT1G11280 34.713 314 191 8 321 626 491 798 4.10e-47 178
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MsG0180001124.01.T01 AT3G13690 37.919 298 162 10 318 603 396 682 1.18e-46 176
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MsG0180001124.01.T01 AT1G31420 34.812 293 178 8 319 605 292 577 1.67e-46 174
MsG0180001124.01.T01 AT4G32710 38.721 297 165 8 321 605 377 668 1.74e-46 176
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MsG0180001124.01.T01 AT1G51880 36.332 289 173 6 320 604 555 836 3.42e-46 176
MsG0180001124.01.T01 AT3G02810 33.562 292 181 7 321 602 52 340 3.49e-46 172
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MsG0180001124.01.T01 AT2G18470 35.836 293 175 7 321 605 272 559 3.84e-46 173
MsG0180001124.01.T01 AT2G18470 35.836 293 175 7 321 605 272 559 3.84e-46 173
MsG0180001124.01.T01 AT1G51805 36.332 289 174 5 320 604 566 848 4.05e-46 176
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MsG0180001124.01.T01 AT2G14510 32.958 355 219 9 271 621 516 855 4.23e-46 176
MsG0180001124.01.T01 AT1G51880 36.332 289 173 6 320 604 581 862 4.31e-46 176
MsG0180001124.01.T01 AT1G70130 35.608 337 194 12 275 603 284 605 4.89e-46 173
MsG0180001124.01.T01 AT2G02800 36.213 301 169 9 321 604 71 365 5.06e-46 169
MsG0180001124.01.T01 AT2G02800 36.213 301 169 9 321 604 71 365 5.06e-46 169
MsG0180001124.01.T01 AT1G78530 39.114 271 147 7 275 536 13 274 5.34e-46 165
MsG0180001124.01.T01 AT3G19700 34.868 304 167 8 328 604 666 965 6.15e-46 176
MsG0180001124.01.T01 AT1G24030 34.915 295 173 9 321 601 50 339 6.24e-46 167
MsG0180001124.01.T01 AT4G02420 32.239 335 205 10 320 642 337 661 6.98e-46 173
MsG0180001124.01.T01 AT1G49100 34.948 289 178 6 320 604 570 852 7.40e-46 175
MsG0180001124.01.T01 AT4G29990 37.847 288 168 6 321 604 564 844 8.51e-46 175
MsG0180001124.01.T01 AT3G15890 34.354 294 184 5 321 608 27 317 8.60e-46 166
MsG0180001124.01.T01 AT5G01540 34.465 383 219 14 270 642 312 672 8.88e-46 173
MsG0180001124.01.T01 AT4G13190 31.447 318 199 7 297 602 35 345 8.91e-46 167
MsG0180001124.01.T01 AT2G14440 32.713 376 225 11 271 642 509 860 9.43e-46 174
MsG0180001124.01.T01 AT1G74360 34.670 349 180 13 287 602 752 1085 1.05e-45 175
MsG0180001124.01.T01 AT1G31420 34.471 293 178 8 319 605 292 576 1.06e-45 171
MsG0180001124.01.T01 AT3G58690 34.812 293 176 7 321 602 75 363 1.07e-45 167
MsG0180001124.01.T01 AT2G37710 32.754 345 205 10 320 645 334 670 1.19e-45 172
MsG0180001124.01.T01 AT4G02010 34.234 333 200 7 322 638 369 698 1.19e-45 173
MsG0180001124.01.T01 AT3G46330 33.025 324 205 7 284 604 500 814 1.21e-45 174
MsG0180001124.01.T01 AT1G16120 32.976 373 221 13 269 621 358 721 1.33e-45 173
MsG0180001124.01.T01 AT3G46330 33.025 324 205 7 284 604 524 838 1.45e-45 174
MsG0180001124.01.T01 AT2G28590 34.708 291 179 7 321 603 86 373 1.47e-45 167
MsG0180001124.01.T01 AT4G29180 30.931 333 207 6 320 634 554 881 1.58e-45 174
MsG0180001124.01.T01 AT4G29180 30.931 333 207 6 320 634 556 883 1.69e-45 174
MsG0180001124.01.T01 AT3G18810 41.256 223 123 5 321 540 325 542 1.69e-45 172
MsG0180001124.01.T01 AT5G02290 35.762 302 171 10 321 604 56 352 1.73e-45 166
MsG0180001124.01.T01 AT5G02290 35.762 302 171 10 321 604 56 352 1.73e-45 166
MsG0180001124.01.T01 AT5G16000 34.463 354 204 11 263 603 246 584 1.73e-45 172
MsG0180001124.01.T01 AT5G60320 36.755 302 175 10 318 613 333 624 1.77e-45 172
MsG0180001124.01.T01 AT2G05940 35.030 334 182 13 321 631 75 396 1.88e-45 168
MsG0180001124.01.T01 AT1G15530 33.770 305 177 11 318 609 346 638 1.93e-45 172
MsG0180001124.01.T01 AT1G14370 34.884 301 173 9 321 604 74 368 1.95e-45 167
MsG0180001124.01.T01 AT4G29180 30.931 333 207 6 320 634 553 880 2.07e-45 174
MsG0180001124.01.T01 AT5G35580 36.242 298 170 10 321 604 64 355 2.11e-45 169
MsG0180001124.01.T01 AT5G35580 36.242 298 170 10 321 604 76 367 2.38e-45 169
MsG0180001124.01.T01 AT2G19230 34.718 337 200 8 274 604 518 840 3.12e-45 173
MsG0180001124.01.T01 AT4G13190 35.102 245 153 4 297 537 35 277 3.27e-45 163
MsG0180001124.01.T01 AT1G49270 41.964 224 121 6 321 540 324 542 3.44e-45 171
MsG0180001124.01.T01 AT1G24030 37.069 232 134 5 321 544 50 277 4.26e-45 162
MsG0180001124.01.T01 AT1G79620 35.294 289 176 7 321 603 652 935 4.37e-45 173
MsG0180001124.01.T01 AT1G79620 35.294 289 176 7 321 603 626 909 4.70e-45 173
MsG0180001124.01.T01 AT1G17230 33.143 350 205 11 274 604 735 1074 4.72e-45 173
MsG0180001124.01.T01 AT1G17230 33.143 350 205 11 274 604 735 1074 4.99e-45 173
MsG0180001124.01.T01 AT1G51830 31.897 348 219 8 268 604 317 657 5.45e-45 171
MsG0180001124.01.T01 AT1G51810 34.983 303 185 7 308 604 425 721 5.62e-45 171
MsG0180001124.01.T01 AT1G29730 41.597 238 122 6 321 550 628 856 6.27e-45 172
MsG0180001124.01.T01 AT1G51830 31.897 348 219 8 268 604 324 664 6.71e-45 171
MsG0180001124.01.T01 AT1G29730 41.597 238 121 6 321 550 661 888 6.88e-45 172
MsG0180001124.01.T01 AT1G24030 35.740 277 161 8 337 601 14 285 7.29e-45 162
MsG0180001124.01.T01 AT5G15080 34.884 301 173 8 320 603 129 423 8.10e-45 167
MsG0180001124.01.T01 AT1G48210 39.726 219 123 3 325 536 60 276 8.36e-45 162
MsG0180001124.01.T01 AT1G48210 39.726 219 123 3 325 536 60 276 8.36e-45 162
MsG0180001124.01.T01 AT1G48210 39.726 219 123 3 325 536 60 276 8.36e-45 162
MsG0180001124.01.T01 AT3G28690 34.667 300 173 8 321 603 14 307 8.47e-45 164
MsG0180001124.01.T01 AT4G22130 33.670 297 182 8 316 602 237 528 8.77e-45 168
MsG0180001124.01.T01 AT1G11330 35.540 287 153 8 276 534 443 725 8.78e-45 171
MsG0180001124.01.T01 AT5G65700 35.689 283 174 4 337 615 700 978 1.01e-44 172
MsG0180001124.01.T01 AT5G65700 35.689 283 174 4 337 615 700 978 1.01e-44 172
MsG0180001124.01.T01 AT3G46400 32.184 348 215 11 270 604 508 847 1.06e-44 171
MsG0180001124.01.T01 AT2G07180 35.119 336 183 12 321 642 78 392 1.09e-44 166
MsG0180001124.01.T01 AT2G07180 35.119 336 183 12 321 642 78 392 1.09e-44 166
MsG0180001124.01.T01 AT1G26150 42.544 228 120 6 321 542 418 640 1.09e-44 169
MsG0180001124.01.T01 AT5G56460 37.168 339 182 14 297 612 40 370 1.09e-44 165
MsG0180001124.01.T01 AT2G19230 34.627 335 204 7 274 604 518 841 1.10e-44 172
MsG0180001124.01.T01 AT5G63710 34.364 291 181 5 320 603 276 563 1.11e-44 169
MsG0180001124.01.T01 AT1G61430 39.914 233 134 4 304 533 437 666 1.12e-44 170
MsG0180001124.01.T01 AT1G61430 39.914 233 134 4 304 533 460 689 1.13e-44 170
MsG0180001124.01.T01 AT1G61430 39.914 233 134 4 304 533 460 689 1.13e-44 170
MsG0180001124.01.T01 AT5G61480 30.938 320 200 7 319 624 707 1019 1.19e-44 172
MsG0180001124.01.T01 AT5G63710 34.364 291 181 5 320 603 241 528 1.22e-44 168
MsG0180001124.01.T01 AT5G63710 34.364 291 181 5 320 603 241 528 1.22e-44 168

Find 126 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 172 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AATCCAAAAGTTTCTGATTT+TGG 0.076615 1:-16317437 MsG0180001124.01.T01:CDS
GGTAAATCTCTGTTGCAATT+TGG 0.161754 1:-16318839 MsG0180001124.01.T01:CDS
AAAGCTGATGTTTATAGTTT+TGG 0.174080 1:-16317299 MsG0180001124.01.T01:CDS
TGTATGCTCTTGCAGATTAC+TGG 0.223781 1:-16318457 MsG0180001124.01.T01:intron
ATTCGTCGTATGATGTATTA+TGG 0.225192 1:-16318725 MsG0180001124.01.T01:CDS
ATCCCTCCTTATTATTCTTT+AGG 0.240648 1:-16319034 MsG0180001124.01.T01:CDS
AATTGATCATAAACCCAAAA+AGG 0.242446 1:+16317200 None:intergenic
CAACTTTACCATAAGACTTT+TGG 0.245777 1:-16319086 MsG0180001124.01.T01:CDS
AATCCAAAATCAGAAACTTT+TGG 0.258030 1:+16317434 None:intergenic
TCTTTGTAAGAGTACCTTAT+AGG 0.261040 1:+16317890 None:intergenic
AAAGAGTTAGATATGGATTA+AGG 0.267816 1:-16316764 MsG0180001124.01.T01:three_prime_UTR
ATTATGGATTTGAACTTTCT+TGG 0.273120 1:-16318709 MsG0180001124.01.T01:CDS
GAACCAATTTGATCTGGTTT+TGG 0.275493 1:-16316892 MsG0180001124.01.T01:three_prime_UTR
TCTTGTAGCAGTCAAATTAT+TGG 0.278750 1:-16317780 MsG0180001124.01.T01:CDS
CTTTCGTCGCCACATTCTTT+AGG 0.288709 1:+16319205 None:intergenic
TTCAAATCATGAAACGAAAT+TGG 0.296152 1:-16317144 MsG0180001124.01.T01:CDS
GTAAATCTCTGTTGCAATTT+GGG 0.301872 1:-16318838 MsG0180001124.01.T01:CDS
ATTAATAATACAATGATAAA+TGG 0.302839 1:+16317989 None:intergenic
AACCAGCCTCACTGTAAATA+TGG 0.315599 1:-16318638 MsG0180001124.01.T01:intron
ACGTTTCTGTAGAAAAGTTC+AGG 0.331542 1:+16317338 None:intergenic
TACGTAGCAACACATATTCT+TGG 0.340358 1:-16316798 MsG0180001124.01.T01:three_prime_UTR
TATGAGTATTCCATCCGATT+TGG 0.345251 1:+16318902 None:intergenic
AGCGGTGTTAAATTTGTTCT+TGG 0.346549 1:-16318016 MsG0180001124.01.T01:CDS
ACCAGATCAAATTGGTTCCT+TGG 0.351845 1:+16316897 None:intergenic
TAGAGTCCTAAAGAATAATA+AGG 0.354208 1:+16319028 None:intergenic
CCATTTCTTTACAGGTGTAT+TGG 0.354385 1:-16318050 MsG0180001124.01.T01:intron
ATCCATATCTAACTCTTTGT+TGG 0.355404 1:+16316769 None:intergenic
TGCAATTTGGGTTGGGAGAC+GGG 0.360091 1:-16318826 MsG0180001124.01.T01:CDS
CTTTGTAAGAGTACCTTATA+GGG 0.363406 1:+16317891 None:intergenic
AGTTTATGTATCTCACTTCT+TGG 0.374886 1:-16318793 MsG0180001124.01.T01:CDS
AAACTAGGCAATGGAGGTTA+TGG 0.381219 1:-16317836 MsG0180001124.01.T01:CDS
ATTGAAATCCAAAAGTCTTA+TGG 0.381459 1:+16319078 None:intergenic
ATAATAGCATCATCCCTATA+AGG 0.400424 1:-16317904 MsG0180001124.01.T01:CDS
AGTCCAAAACCAGATCAAAT+TGG 0.404912 1:+16316889 None:intergenic
AAATTGCATGCCATTTCTCT+TGG 0.406069 1:-16317557 MsG0180001124.01.T01:CDS
GCATCAAGGTCAGGCTGATT+AGG 0.409447 1:+16317008 None:intergenic
GGTTGTTGTCCTCACATGAT+AGG 0.411311 1:+16319176 None:intergenic
AAGGAAGAACTTGGATGTAT+TGG 0.413893 1:-16317249 MsG0180001124.01.T01:CDS
TCTCTCTATGTTGGTGGCTA+TGG 0.416454 1:-16318860 MsG0180001124.01.T01:CDS
GTTTATGTATCTCACTTCTT+GGG 0.417499 1:-16318792 MsG0180001124.01.T01:CDS
CTTCATAGTACAAAATCAAT+TGG 0.418307 1:+16319155 None:intergenic
TGTGGCTTTGTGGTGTATAC+AGG 0.421271 1:-16317105 MsG0180001124.01.T01:CDS
AACCAACAAAGAGTTAGATA+TGG 0.425669 1:-16316771 MsG0180001124.01.T01:three_prime_UTR
TCCAACACTTTATCCATTGA+AGG 0.426238 1:+16317065 None:intergenic
TCCAAGGAACCAATTTGATC+TGG 0.428132 1:-16316898 MsG0180001124.01.T01:three_prime_UTR
ATCTCTGTTGCAATTTGGGT+TGG 0.428505 1:-16318834 MsG0180001124.01.T01:CDS
TTCTTTACAGGTGTATTGGT+TGG 0.430830 1:-16318046 MsG0180001124.01.T01:intron
ATATTCTCGTACAATGTAGA+TGG 0.434914 1:-16319307 MsG0180001124.01.T01:CDS
CTTTAGGACTGTCTTTCAAT+CGG 0.440304 1:+16319221 None:intergenic
ATATATGAATTTATGCCAAA+TGG 0.442371 1:-16317638 MsG0180001124.01.T01:CDS
GTCAATGAAGTTGCTACCAT+TGG 0.447994 1:-16317728 MsG0180001124.01.T01:CDS
TTGTATTATTAATCAACAAA+TGG 0.449663 1:-16317979 MsG0180001124.01.T01:CDS
CTCATTGGTTATTGTGTGGA+AGG 0.452716 1:-16317677 MsG0180001124.01.T01:CDS
TCTCTGTTGCAATTTGGGTT+GGG 0.454152 1:-16318833 MsG0180001124.01.T01:CDS
GTTAATGTTGTGCAACTCAT+TGG 0.458430 1:-16317692 MsG0180001124.01.T01:CDS
GATGAAGATGCTAATAGAAC+TGG 0.461486 1:-16316972 MsG0180001124.01.T01:CDS
TTGCAATTTGGGTTGGGAGA+CGG 0.462617 1:-16318827 MsG0180001124.01.T01:CDS
CGGATGGAATACTCATACAT+TGG 0.462887 1:-16318896 MsG0180001124.01.T01:CDS
GGTAGTTCATTGTATTCCTC+TGG 0.463161 1:-16316951 MsG0180001124.01.T01:CDS
TAACAGCACGACAAGGGTTA+AGG 0.463192 1:+16319339 None:intergenic
AAAATCTCGATCAGTGGACT+TGG 0.463682 1:+16317751 None:intergenic
TCATCTAGAAGGATGTTATG+AGG 0.465122 1:+16317467 None:intergenic
TCGAGCCACTCCAAGAGAAA+TGG 0.467364 1:+16317547 None:intergenic
TGATGGAGATGGCAAATAGA+AGG 0.467596 1:-16317268 MsG0180001124.01.T01:CDS
ATAGTTGCACGTTTATCGTT+CGG 0.471074 1:-16318419 MsG0180001124.01.T01:CDS
ACCTAGCGATCGTCCTTCAA+TGG 0.472837 1:-16317078 MsG0180001124.01.T01:CDS
TGGGATGTTGTTGATGGAGA+TGG 0.473656 1:-16317279 MsG0180001124.01.T01:CDS
AAATGATGATTGTGGCTTTG+TGG 0.482887 1:-16317115 MsG0180001124.01.T01:CDS
GACTGTCTTTCAATCGGAAA+GGG 0.486294 1:+16319227 None:intergenic
AACTTTCTTGGCTCAATAGT+CGG 0.487247 1:-16318697 MsG0180001124.01.T01:CDS
GTATCGATAATAGGCTAGGT+AGG 0.488875 1:+16318976 None:intergenic
GGCAAATAGAAGGAAGAACT+TGG 0.489646 1:-16317258 MsG0180001124.01.T01:CDS
AACCATATTTACAGTGAGGC+TGG 0.498688 1:+16318636 None:intergenic
GCATGCCATTTCTCTTGGAG+TGG 0.499899 1:-16317552 MsG0180001124.01.T01:CDS
GCACGTTTATCGTTCGGCAT+AGG 0.500305 1:-16318413 MsG0180001124.01.T01:intron
GTGAATTCTCTCTATGTTGG+TGG 0.505478 1:-16318866 MsG0180001124.01.T01:CDS
AAGAGGAACCATTGGATACA+TGG 0.506102 1:-16317363 MsG0180001124.01.T01:CDS
ACATCTTGTGCATCAAGGTC+AGG 0.511849 1:+16316999 None:intergenic
CGTTTCTGTAGAAAAGTTCA+GGG 0.518395 1:+16317339 None:intergenic
TCTTGGGATGTTGAAAATGA+TGG 0.522317 1:-16318776 MsG0180001124.01.T01:CDS
TGTGTGAATTCTCTCTATGT+TGG 0.525413 1:-16318869 MsG0180001124.01.T01:CDS
ATTGGCTGATCAATCTAGCC+AGG 0.526773 1:-16317231 MsG0180001124.01.T01:CDS
CTCAATAGTCGGTGTAAACA+TGG 0.530061 1:-16318686 MsG0180001124.01.T01:CDS
CTTGTACATCTTGTGCATCA+AGG 0.537841 1:+16316994 None:intergenic
ATTACTGGAATAACGCGGCT+TGG 0.541735 1:-16318442 MsG0180001124.01.T01:CDS
TCCTTCAATGGATAAAGTGT+TGG 0.542890 1:-16317066 MsG0180001124.01.T01:CDS
ACTGCAGCAAGAGGAACCAT+TGG 0.545613 1:-16317371 MsG0180001124.01.T01:CDS
GAACAATTCAAGACAAAACT+AGG 0.546680 1:-16317851 MsG0180001124.01.T01:CDS
GTCCTAAAGAATAATAAGGA+GGG 0.553991 1:+16319032 None:intergenic
ATTTCTCTTGGAGTGGCTCG+AGG 0.554666 1:-16317545 MsG0180001124.01.T01:CDS
GGACTGTCTTTCAATCGGAA+AGG 0.555052 1:+16319226 None:intergenic
TCCATTGAAGGACGATCGCT+AGG 0.561465 1:+16317077 None:intergenic
GTATTGGTTGGTTTGCTTAG+CGG 0.567735 1:-16318034 MsG0180001124.01.T01:CDS
GTTTATGATCAATTACAAGA+TGG 0.570123 1:-16317191 MsG0180001124.01.T01:CDS
CTAAAGAATGTGGCGACGAA+AGG 0.572954 1:-16319204 MsG0180001124.01.T01:CDS
GGCATTGAGTACTTGCACCA+TGG 0.573951 1:-16317524 MsG0180001124.01.T01:CDS
ATGATCAGTAACTGATTCCA+AGG 0.576948 1:-16316914 MsG0180001124.01.T01:exon
ATGAAGTTGCTACCATTGGA+AGG 0.579433 1:-16317724 MsG0180001124.01.T01:CDS
TTCAAGACAAAACTAGGCAA+TGG 0.579669 1:-16317845 MsG0180001124.01.T01:CDS
TGTGAGCTGTCCAAATCGGA+TGG 0.582998 1:-16318912 MsG0180001124.01.T01:CDS
TCGTCAACATATGTTTAGTG+TGG 0.589387 1:+16318948 None:intergenic
TATATGTGAGCTGTCCAAAT+CGG 0.593439 1:-16318916 MsG0180001124.01.T01:CDS
ATTGACAAAATCTCGATCAG+TGG 0.594381 1:+16317745 None:intergenic
TATCGATAATAGGCTAGGTA+GGG 0.595832 1:+16318977 None:intergenic
AGTCCTAAAGAATAATAAGG+AGG 0.598645 1:+16319031 None:intergenic
TTCAGGGGCCATGTATCCAA+TGG 0.608436 1:+16317355 None:intergenic
AAGACAAAACTAGGCAATGG+AGG 0.609196 1:-16317842 MsG0180001124.01.T01:CDS
GGCAAAGAAAATGATGATTG+TGG 0.613675 1:-16317123 MsG0180001124.01.T01:CDS
TGTCTTTCAATCGGAAAGGG+TGG 0.614015 1:+16319230 None:intergenic
GTGTCATTAACTGCAGCAAG+AGG 0.618722 1:-16317380 MsG0180001124.01.T01:CDS
GTATTAGTAACAGCACGACA+AGG 0.628217 1:+16319332 None:intergenic
AACATGAGTCATGTTCAAGA+AGG 0.631084 1:-16319273 MsG0180001124.01.T01:CDS
AACATGATGAATCCTTCCAA+TGG 0.635884 1:+16317712 None:intergenic
AAACATCTATCTATGTATGA+CGG 0.636058 1:-16317950 MsG0180001124.01.T01:CDS
AAAGACAGTCCTAAAGAATG+TGG 0.636442 1:-16319214 MsG0180001124.01.T01:CDS
ATCAGTAACTGATGTACCAG+AGG 0.638071 1:+16316935 None:intergenic
TATTAGTAACAGCACGACAA+GGG 0.651789 1:+16319333 None:intergenic
TTTAAAGGACAACTTCGAAG+TGG 0.652539 1:-16317806 MsG0180001124.01.T01:CDS
ATAGTCGGTGTAAACATGGT+CGG 0.654652 1:-16318682 MsG0180001124.01.T01:CDS
GAGTCATGTTCAAGAAGGTG+CGG 0.657869 1:-16319268 MsG0180001124.01.T01:CDS
GCAACTCATTGGTTATTGTG+TGG 0.667073 1:-16317681 MsG0180001124.01.T01:CDS
TATGAAGCTGAAGAATACCA+TGG 0.674114 1:-16319139 MsG0180001124.01.T01:CDS
AAGGTACAACCTATCATGTG+AGG 0.692861 1:-16319185 MsG0180001124.01.T01:CDS
TGCAGATTACTGGAATAACG+CGG 0.699052 1:-16318447 MsG0180001124.01.T01:intron
TACCAACCATATTTACAGTG+AGG 0.723604 1:+16318632 None:intergenic
GTTTCTGTAGAAAAGTTCAG+GGG 0.727693 1:+16317340 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATTAATAATACAATGATAAA+TGG + Chr1:16318036-16318055 None:intergenic 10.0%
!! TAAAAAAACAAACTTATATA+AGG - Chr1:16317914-16317933 MsG0180001124.01.T01:CDS 10.0%
!!! TTTTTTTTTTCTTTTCAATT+TGG - Chr1:16317443-16317462 MsG0180001124.01.T01:CDS 10.0%
!! AGTTGTATAAATAGTAATAT+TGG - Chr1:16317759-16317778 MsG0180001124.01.T01:CDS 15.0%
!! GTTGTATAAATAGTAATATT+GGG - Chr1:16317760-16317779 MsG0180001124.01.T01:CDS 15.0%
!! TTGTATTATTAATCAACAAA+TGG - Chr1:16318043-16318062 MsG0180001124.01.T01:intron 15.0%
!!! ATTTTTAGTACAAGAAATTA+AGG - Chr1:16317686-16317705 MsG0180001124.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTTTAAAAAGAACAGAATAT+GGG + Chr1:16317827-16317846 None:intergenic 15.0%
!!! TTTTTAAAAAGAACAGAATA+TGG + Chr1:16317828-16317847 None:intergenic 15.0%
!! ATATATGAATTTATGCCAAA+TGG - Chr1:16318384-16318403 MsG0180001124.01.T01:intron 20.0%
!! TTTAAAAAGAACAGAATATG+GGG + Chr1:16317826-16317845 None:intergenic 20.0%
!!! ATACGTAGCATTATATTTTT+CGG - Chr1:16317871-16317890 MsG0180001124.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATTGTACATAATATTTTCCA+TGG + Chr1:16316903-16316922 None:intergenic 20.0%
!!! TGATATCTTGTTATGTTTTA+AGG - Chr1:16319304-16319323 MsG0180001124.01.T01:CDS 20.0%
! AAACATCTATCTATGTATGA+CGG - Chr1:16318072-16318091 MsG0180001124.01.T01:intron 25.0%
! AATTGATCATAAACCCAAAA+AGG + Chr1:16318825-16318844 None:intergenic 25.0%
! ATTATGGATTTGAACTTTCT+TGG - Chr1:16317313-16317332 MsG0180001124.01.T01:CDS 25.0%
! ATTGAAATCCAAAAGTCTTA+TGG + Chr1:16316947-16316966 None:intergenic 25.0%
! ATTGATCATAAACCCAAAAA+GGG + Chr1:16318824-16318843 None:intergenic 25.0%
! CTTCATAGTACAAAATCAAT+TGG + Chr1:16316870-16316889 None:intergenic 25.0%
! GTTTATGATCAATTACAAGA+TGG - Chr1:16318831-16318850 MsG0180001124.01.T01:CDS 25.0%
! TAGAGTCCTAAAGAATAATA+AGG + Chr1:16316997-16317016 None:intergenic 25.0%
! TTCAAATCATGAAACGAAAT+TGG - Chr1:16318878-16318897 MsG0180001124.01.T01:CDS 25.0%
! TTTCAATTCCATTTCTTTAC+AGG - Chr1:16317964-16317983 MsG0180001124.01.T01:CDS 25.0%
!! AAAGAGTTAGATATGGATTA+AGG - Chr1:16319258-16319277 MsG0180001124.01.T01:CDS 25.0%
!! AAAGCTGATGTTTATAGTTT+TGG - Chr1:16318723-16318742 MsG0180001124.01.T01:CDS 25.0%
!! AAGCTGATGTTTATAGTTTT+GGG - Chr1:16318724-16318743 MsG0180001124.01.T01:CDS 25.0%
!! AATCCAAAAGTTTCTGATTT+TGG - Chr1:16318585-16318604 MsG0180001124.01.T01:intron 25.0%
!! AATCCAAAATCAGAAACTTT+TGG + Chr1:16318591-16318610 None:intergenic 25.0%
!! GATTGAAATTTTCATCTAGA+AGG + Chr1:16318569-16318588 None:intergenic 25.0%
!!! CTTATTTTTCTTTAGACTTG+TGG - Chr1:16319339-16319358 MsG0180001124.01.T01:CDS 25.0%
!!! TAGTTTTGTCTTGAATTGTT+CGG + Chr1:16318172-16318191 None:intergenic 25.0%
!!! TATTTTTCAAGTGATCCATT+TGG + Chr1:16318402-16318421 None:intergenic 25.0%
AACCAACAAAGAGTTAGATA+TGG - Chr1:16319251-16319270 MsG0180001124.01.T01:CDS 30.0%
AGACATCATACTAAAAGACT+CGG + Chr1:16317712-16317731 None:intergenic 30.0%
AGTCCTAAAGAATAATAAGG+AGG + Chr1:16316994-16317013 None:intergenic 30.0%
AGTTTATGTATCTCACTTCT+TGG - Chr1:16317229-16317248 MsG0180001124.01.T01:CDS 30.0%
ATAATAGCATCATCCCTATA+AGG - Chr1:16318118-16318137 MsG0180001124.01.T01:intron 30.0%
ATATTCTCGTACAATGTAGA+TGG - Chr1:16316715-16316734 MsG0180001124.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
ATCCATATCTAACTCTTTGT+TGG + Chr1:16319256-16319275 None:intergenic 30.0%
ATCCCTCCTTATTATTCTTT+AGG - Chr1:16316988-16317007 MsG0180001124.01.T01:CDS 30.0%
ATTCGTCGTATGATGTATTA+TGG - Chr1:16317297-16317316 MsG0180001124.01.T01:CDS 30.0%
GAACAATTCAAGACAAAACT+AGG - Chr1:16318171-16318190 MsG0180001124.01.T01:intron 30.0%
GTAAATCTCTGTTGCAATTT+GGG - Chr1:16317184-16317203 MsG0180001124.01.T01:CDS 30.0%
GTCCTAAAGAATAATAAGGA+GGG + Chr1:16316993-16317012 None:intergenic 30.0%
GTTTATGTATCTCACTTCTT+GGG - Chr1:16317230-16317249 MsG0180001124.01.T01:CDS 30.0%
TCTTGTAGCAGTCAAATTAT+TGG - Chr1:16318242-16318261 MsG0180001124.01.T01:intron 30.0%
! ATGCAATTTTTCACAACTCA+AGG + Chr1:16318454-16318473 None:intergenic 30.0%
! ATTGACTTAAGAGAATGTGA+GGG + Chr1:16317643-16317662 None:intergenic 30.0%
! CAACTTTACCATAAGACTTT+TGG - Chr1:16316936-16316955 MsG0180001124.01.T01:CDS 30.0%
! GAATTTTCATATCACATCCA+TGG + Chr1:16318518-16318537 None:intergenic 30.0%
! TCGAAGTTGTCCTTTAAAAA+CGG + Chr1:16318214-16318233 None:intergenic 30.0%
!! CTTTGTAAGAGTACCTTATA+GGG + Chr1:16318134-16318153 None:intergenic 30.0%
!! GTGGTTTTTGTATCGATAAT+AGG + Chr1:16317058-16317077 None:intergenic 30.0%
!! TCTTTGTAAGAGTACCTTAT+AGG + Chr1:16318135-16318154 None:intergenic 30.0%
!! TTTTGTATCGATAATAGGCT+AGG + Chr1:16317053-16317072 None:intergenic 30.0%
!!! ACATTTTTGGTTTTCCAAAG+TGG + Chr1:16316660-16316679 None:intergenic 30.0%
!!! GGGCAATATTTTTAGATTGA+AGG - Chr1:16317780-16317799 MsG0180001124.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTTCTGATTTTGGATTAGCT+AGG - Chr1:16318595-16318614 MsG0180001124.01.T01:intron 30.0%
AAAGACAGTCCTAAAGAATG+TGG - Chr1:16316808-16316827 MsG0180001124.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
AACATGAGTCATGTTCAAGA+AGG - Chr1:16316749-16316768 MsG0180001124.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
AACATGATGAATCCTTCCAA+TGG + Chr1:16318313-16318332 None:intergenic 35.0%
AACTTTCTTGGCTCAATAGT+CGG - Chr1:16317325-16317344 MsG0180001124.01.T01:CDS 35.0%
AAGGAAGAACTTGGATGTAT+TGG - Chr1:16318773-16318792 MsG0180001124.01.T01:CDS 35.0%
ACGTTTCTGTAGAAAAGTTC+AGG + Chr1:16318687-16318706 None:intergenic 35.0%
AGTCCAAAACCAGATCAAAT+TGG + Chr1:16319136-16319155 None:intergenic 35.0%
ATAGTTGCACGTTTATCGTT+CGG - Chr1:16317603-16317622 MsG0180001124.01.T01:CDS 35.0%
ATTGACAAAATCTCGATCAG+TGG + Chr1:16318280-16318299 None:intergenic 35.0%
CCAATACACCTGTAAAGAAA+TGG + Chr1:16317975-16317994 None:intergenic 35.0%
CCATTTCTTTACAGGTGTAT+TGG - Chr1:16317972-16317991 MsG0180001124.01.T01:CDS 35.0%
CGTTTCTGTAGAAAAGTTCA+GGG + Chr1:16318686-16318705 None:intergenic 35.0%
GATGAAGATGCTAATAGAAC+TGG - Chr1:16319050-16319069 MsG0180001124.01.T01:CDS 35.0%
GGCAAAGAAAATGATGATTG+TGG - Chr1:16318899-16318918 MsG0180001124.01.T01:CDS 35.0%
GGTAAATCTCTGTTGCAATT+TGG - Chr1:16317183-16317202 MsG0180001124.01.T01:CDS 35.0%
GTTAATGTTGTGCAACTCAT+TGG - Chr1:16318330-16318349 MsG0180001124.01.T01:intron 35.0%
GTTTCTGTAGAAAAGTTCAG+GGG + Chr1:16318685-16318704 None:intergenic 35.0%
TACCAACCATATTTACAGTG+AGG + Chr1:16317393-16317412 None:intergenic 35.0%
TACGTAGCAACACATATTCT+TGG - Chr1:16319224-16319243 MsG0180001124.01.T01:CDS 35.0%
TATATGTGAGCTGTCCAAAT+CGG - Chr1:16317106-16317125 MsG0180001124.01.T01:CDS 35.0%
TATCGATAATAGGCTAGGTA+GGG + Chr1:16317048-16317067 None:intergenic 35.0%
TATGAAGCTGAAGAATACCA+TGG - Chr1:16316883-16316902 MsG0180001124.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
TATGAGTATTCCATCCGATT+TGG + Chr1:16317123-16317142 None:intergenic 35.0%
TATTAGTAACAGCACGACAA+GGG + Chr1:16316692-16316711 None:intergenic 35.0%
TCATCTAGAAGGATGTTATG+AGG + Chr1:16318558-16318577 None:intergenic 35.0%
TCCAACACTTTATCCATTGA+AGG + Chr1:16318960-16318979 None:intergenic 35.0%
TCCTTCAATGGATAAAGTGT+TGG - Chr1:16318956-16318975 MsG0180001124.01.T01:CDS 35.0%
TCGTCAACATATGTTTAGTG+TGG + Chr1:16317077-16317096 None:intergenic 35.0%
TCTTGGGATGTTGAAAATGA+TGG - Chr1:16317246-16317265 MsG0180001124.01.T01:CDS 35.0%
TGTGTGAATTCTCTCTATGT+TGG - Chr1:16317153-16317172 MsG0180001124.01.T01:CDS 35.0%
TTCAAGACAAAACTAGGCAA+TGG - Chr1:16318177-16318196 MsG0180001124.01.T01:intron 35.0%
TTTAAAGGACAACTTCGAAG+TGG - Chr1:16318216-16318235 MsG0180001124.01.T01:intron 35.0%
! AAATGATGATTGTGGCTTTG+TGG - Chr1:16318907-16318926 MsG0180001124.01.T01:CDS 35.0%
! AAATTGCATGCCATTTCTCT+TGG - Chr1:16318465-16318484 MsG0180001124.01.T01:intron 35.0%
! AGCGGTGTTAAATTTGTTCT+TGG - Chr1:16318006-16318025 MsG0180001124.01.T01:CDS 35.0%
! AGGGTTAAGGAAGACATTTT+TGG + Chr1:16316673-16316692 None:intergenic 35.0%
! ATGATCAGTAACTGATTCCA+AGG - Chr1:16319108-16319127 MsG0180001124.01.T01:CDS 35.0%
! CCAGGTTTATTTCCCTTTTT+GGG - Chr1:16318809-16318828 MsG0180001124.01.T01:CDS 35.0%
! GAACTTTTCTACAGAAACGT+TGG - Chr1:16318687-16318706 MsG0180001124.01.T01:CDS 35.0%
! GACACAATGCTTTTATCTGT+AGG + Chr1:16318627-16318646 None:intergenic 35.0%
! TTCTTTACAGGTGTATTGGT+TGG - Chr1:16317976-16317995 MsG0180001124.01.T01:CDS 35.0%
!! CATTGACTTAAGAGAATGTG+AGG + Chr1:16317644-16317663 None:intergenic 35.0%
!! CTTTAGGACTGTCTTTCAAT+CGG + Chr1:16316804-16316823 None:intergenic 35.0%
!! GAACCAATTTGATCTGGTTT+TGG - Chr1:16319130-16319149 MsG0180001124.01.T01:CDS 35.0%
!! GGTTATGGATCCGTTTTTAA+AGG - Chr1:16318201-16318220 MsG0180001124.01.T01:intron 35.0%
!!! TAGTTTTGGGATGTTGTTGA+TGG - Chr1:16318737-16318756 MsG0180001124.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTGATCTGGTTTTGGACTTT+TGG - Chr1:16319138-16319157 MsG0180001124.01.T01:CDS 35.0%
AAACTAGGCAATGGAGGTTA+TGG - Chr1:16318186-16318205 MsG0180001124.01.T01:intron 40.0%
AACCAGCCTCACTGTAAATA+TGG - Chr1:16317384-16317403 MsG0180001124.01.T01:CDS 40.0%
AACCATATTTACAGTGAGGC+TGG + Chr1:16317389-16317408 None:intergenic 40.0%
AAGACAAAACTAGGCAATGG+AGG - Chr1:16318180-16318199 MsG0180001124.01.T01:intron 40.0%
AAGAGGAACCATTGGATACA+TGG - Chr1:16318659-16318678 MsG0180001124.01.T01:CDS 40.0%
AAGGTACAACCTATCATGTG+AGG - Chr1:16316837-16316856 MsG0180001124.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
AGCCTCACTGTAAATATGGT+TGG - Chr1:16317388-16317407 MsG0180001124.01.T01:CDS 40.0%
ATAGTCGGTGTAAACATGGT+CGG - Chr1:16317340-16317359 MsG0180001124.01.T01:CDS 40.0%
ATCAGTAACTGATGTACCAG+AGG + Chr1:16319090-16319109 None:intergenic 40.0%
ATCTCTGTTGCAATTTGGGT+TGG - Chr1:16317188-16317207 MsG0180001124.01.T01:CDS 40.0%
ATGAAGTTGCTACCATTGGA+AGG - Chr1:16318298-16318317 MsG0180001124.01.T01:intron 40.0%
CCCAAAAAGGGAAATAAACC+TGG + Chr1:16318812-16318831 None:intergenic 40.0%
CGGATGGAATACTCATACAT+TGG - Chr1:16317126-16317145 MsG0180001124.01.T01:CDS 40.0%
CTCAATAGTCGGTGTAAACA+TGG - Chr1:16317336-16317355 MsG0180001124.01.T01:CDS 40.0%
CTCACTCTAACAAATGGATG+TGG + Chr1:16317508-16317527 None:intergenic 40.0%
CTTGTACATCTTGTGCATCA+AGG + Chr1:16319031-16319050 None:intergenic 40.0%
GACTGTCTTTCAATCGGAAA+GGG + Chr1:16316798-16316817 None:intergenic 40.0%
GGCAAATAGAAGGAAGAACT+TGG - Chr1:16318764-16318783 MsG0180001124.01.T01:CDS 40.0%
GGTAGTTCATTGTATTCCTC+TGG - Chr1:16319071-16319090 MsG0180001124.01.T01:CDS 40.0%
GTAGCACTCACTCTAACAAA+TGG + Chr1:16317514-16317533 None:intergenic 40.0%
GTATTAGTAACAGCACGACA+AGG + Chr1:16316693-16316712 None:intergenic 40.0%
GTCAATGAAGTTGCTACCAT+TGG - Chr1:16318294-16318313 MsG0180001124.01.T01:intron 40.0%
GTGAATTCTCTCTATGTTGG+TGG - Chr1:16317156-16317175 MsG0180001124.01.T01:CDS 40.0%
TCCAAGGAACCAATTTGATC+TGG - Chr1:16319124-16319143 MsG0180001124.01.T01:CDS 40.0%
TGATGGAGATGGCAAATAGA+AGG - Chr1:16318754-16318773 MsG0180001124.01.T01:CDS 40.0%
TGCAGATTACTGGAATAACG+CGG - Chr1:16317575-16317594 MsG0180001124.01.T01:CDS 40.0%
TGTATGCTCTTGCAGATTAC+TGG - Chr1:16317565-16317584 MsG0180001124.01.T01:CDS 40.0%
! AAAATCTCGATCAGTGGACT+TGG + Chr1:16318274-16318293 None:intergenic 40.0%
! ACCAGATCAAATTGGTTCCT+TGG + Chr1:16319128-16319147 None:intergenic 40.0%
! CTCATTGGTTATTGTGTGGA+AGG - Chr1:16318345-16318364 MsG0180001124.01.T01:intron 40.0%
! GCAACTCATTGGTTATTGTG+TGG - Chr1:16318341-16318360 MsG0180001124.01.T01:intron 40.0%
! GCCAGGTTTATTTCCCTTTT+TGG - Chr1:16318808-16318827 MsG0180001124.01.T01:CDS 40.0%
! GTATCGATAATAGGCTAGGT+AGG + Chr1:16317049-16317068 None:intergenic 40.0%
! TCTCTGTTGCAATTTGGGTT+GGG - Chr1:16317189-16317208 MsG0180001124.01.T01:CDS 40.0%
!! GTATTGGTTGGTTTGCTTAG+CGG - Chr1:16317988-16318007 MsG0180001124.01.T01:CDS 40.0%
ACATCTTGTGCATCAAGGTC+AGG + Chr1:16319026-16319045 None:intergenic 45.0%
ATTACTGGAATAACGCGGCT+TGG - Chr1:16317580-16317599 MsG0180001124.01.T01:CDS 45.0%
ATTGGCTGATCAATCTAGCC+AGG - Chr1:16318791-16318810 MsG0180001124.01.T01:CDS 45.0%
CTAAAGAATGTGGCGACGAA+AGG - Chr1:16316818-16316837 MsG0180001124.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
CTTTCGTCGCCACATTCTTT+AGG + Chr1:16316820-16316839 None:intergenic 45.0%
GAACAGAATATGGGGATTGC+CGG + Chr1:16317818-16317837 None:intergenic 45.0%
GAGTCATGTTCAAGAAGGTG+CGG - Chr1:16316754-16316773 MsG0180001124.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
GGACTGTCTTTCAATCGGAA+AGG + Chr1:16316799-16316818 None:intergenic 45.0%
GGTTGTTGTCCTCACATGAT+AGG + Chr1:16316849-16316868 None:intergenic 45.0%
TAACAGCACGACAAGGGTTA+AGG + Chr1:16316686-16316705 None:intergenic 45.0%
TGTCTTTCAATCGGAAAGGG+TGG + Chr1:16316795-16316814 None:intergenic 45.0%
! GTGTCATTAACTGCAGCAAG+AGG - Chr1:16318642-16318661 MsG0180001124.01.T01:CDS 45.0%
! TGGGATGTTGTTGATGGAGA+TGG - Chr1:16318743-16318762 MsG0180001124.01.T01:CDS 45.0%
!! TCTCTCTATGTTGGTGGCTA+TGG - Chr1:16317162-16317181 MsG0180001124.01.T01:CDS 45.0%
!! TGTGGCTTTGTGGTGTATAC+AGG - Chr1:16318917-16318936 MsG0180001124.01.T01:CDS 45.0%
!! TTGCAATTTGGGTTGGGAGA+CGG - Chr1:16317195-16317214 MsG0180001124.01.T01:CDS 45.0%
!!! TTGAAGGCCCTTGTTTTTGC+CGG - Chr1:16317796-16317815 MsG0180001124.01.T01:CDS 45.0%
ACCTAGCGATCGTCCTTCAA+TGG - Chr1:16318944-16318963 MsG0180001124.01.T01:CDS 50.0%
ACTGCAGCAAGAGGAACCAT+TGG - Chr1:16318651-16318670 MsG0180001124.01.T01:CDS 50.0%
ATTTCTCTTGGAGTGGCTCG+AGG - Chr1:16318477-16318496 MsG0180001124.01.T01:intron 50.0%
GCACGTTTATCGTTCGGCAT+AGG - Chr1:16317609-16317628 MsG0180001124.01.T01:CDS 50.0%
GCATCAAGGTCAGGCTGATT+AGG + Chr1:16319017-16319036 None:intergenic 50.0%
GGGATTGCCGGCAAAAACAA+GGG + Chr1:16317806-16317825 None:intergenic 50.0%
TCCATTGAAGGACGATCGCT+AGG + Chr1:16318948-16318967 None:intergenic 50.0%
TCGAGCCACTCCAAGAGAAA+TGG + Chr1:16318478-16318497 None:intergenic 50.0%
TGTGAGCTGTCCAAATCGGA+TGG - Chr1:16317110-16317129 MsG0180001124.01.T01:CDS 50.0%
TTCAGGGGCCATGTATCCAA+TGG + Chr1:16318670-16318689 None:intergenic 50.0%
! GCATGCCATTTCTCTTGGAG+TGG - Chr1:16318470-16318489 MsG0180001124.01.T01:intron 50.0%
! GGCATTGAGTACTTGCACCA+TGG - Chr1:16318498-16318517 MsG0180001124.01.T01:intron 50.0%
!! TGCAATTTGGGTTGGGAGAC+GGG - Chr1:16317196-16317215 MsG0180001124.01.T01:CDS 50.0%
GGGGATTGCCGGCAAAAACA+AGG + Chr1:16317807-16317826 None:intergenic 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 16316652 16319392 16316652 ID=MsG0180001124.01;Name=MsG0180001124.01
Chr1 mRNA 16316652 16319392 16316652 ID=MsG0180001124.01.T01;Parent=MsG0180001124.01;Name=MsG0180001124.01.T01;_AED=0.19;_eAED=0.19;_QI=0|0.5|0.33|1|1|1|3|274|645
Chr1 exon 16316652 16318058 16316652 ID=MsG0180001124.01.T01:exon:31306;Parent=MsG0180001124.01.T01
Chr1 exon 16318414 16318464 16318414 ID=MsG0180001124.01.T01:exon:31305;Parent=MsG0180001124.01.T01
Chr1 exon 16318639 16319392 16318639 ID=MsG0180001124.01.T01:exon:31304;Parent=MsG0180001124.01.T01
Chr1 CDS 16318639 16319392 16318639 ID=MsG0180001124.01.T01:cds;Parent=MsG0180001124.01.T01
Chr1 CDS 16318414 16318464 16318414 ID=MsG0180001124.01.T01:cds;Parent=MsG0180001124.01.T01
Chr1 CDS 16316926 16318058 16316926 ID=MsG0180001124.01.T01:cds;Parent=MsG0180001124.01.T01
Chr1 three_prime_UTR 16316652 16316925 16316652 ID=MsG0180001124.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0180001124.01.T01
Gene Sequence

>MsG0180001124.01.T01

TTTTTCCACTTTGGAAAACCAAAAATGTCTTCCTTAACCCTTGTCGTGCTGTTACTAATACTGATATTCTCGTACAATGTAGATGGTGATGATGAACAACATGAGTCATGTTCAAGAAGGTGCGGTGTTCATAACATCAGCCACCCTTTCCGATTGAAAGACAGTCCTAAAGAATGTGGCGACGAAAGGTACAACCTATCATGTGAGGACAACAACCAATTGATTTTGTACTATGAAGCTGAAGAATACCATGGAAAATATTATGTACAATCAATTAATTACAACAACTTTACCATAAGACTTTTGGATTTCAATCTTGCTTCTTCTAATAATTCTATCCCTCCTTATTATTCTTTAGGACTCTATAATTTCAGTTCTAATTTCTTCATCTCACCCTACCTAGCCTATTATCGATACAAAAACCACACTAAACATATGTTGACGAATTCTATGTTATATGTGAGCTGTCCAAATCGGATGGAATACTCATACATTGGTAATTGTGTGAATTCTCTCTATGTTGGTGGCTATGGTAAATCTCTGTTGCAATTTGGGTTGGGAGACGGGTGTCGTATAGAGTTTATGTATCTCACTTCTTGGGATGTTGAAAATGATGGCAACATCAACAACATTTCTTGTACAGACATTCGTCGTATGATGTATTATGGATTTGAACTTTCTTGGCTCAATAGTCGGTGTAAACATGGTCGGTATGCAGTGCTCGATCAATATAACCAGCCTCACTGTAAATATGATTACTGGAATAACGCGGCTTGGATAGTTGCACGTTTATCGTTCGGCATAGGTGTATTGGTTGGTTTGCTTAGCGGTGTTAAATTTGTTCTTGGAGCGCCATTTATCATTGTATTATTAATCAACAAATGGCGACAGAAACATCTATCTATGTATGACGGCGTCGAAGATTTTCTAAGTAGTGATAATAGCATCATCCCTATAAGGTACTCTTACAAAGACATAAAAAAGATAACCGAACAATTCAAGACAAAACTAGGCAATGGAGGTTATGGATCCGTTTTTAAAGGACAACTTCGAAGTGGTCGTCTTGTAGCAGTCAAATTATTGGACAGAGCCAAGTCCACTGATCGAGATTTTGTCAATGAAGTTGCTACCATTGGAAGGATTCATCATGTTAATGTTGTGCAACTCATTGGTTATTGTGTGGAAGGTTCAAAACGTGTTCTGATATATGAATTTATGCCAAATGGATCACTTGAAAAATACATATTTTCTCACAGTGAAGAGAGTAATTCCTTGAGTTGTGAAAAATTGCATGCCATTTCTCTTGGAGTGGCTCGAGGCATTGAGTACTTGCACCATGGATGTGATATGAAAATTCTACACTTTGATATAAAGCCTCATAACATCCTTCTAGATGAAAATTTCAATCCAAAAGTTTCTGATTTTGGATTAGCTAGGCTTTGTCCTACAGATAAAAGCATTGTGTCATTAACTGCAGCAAGAGGAACCATTGGATACATGGCCCCTGAACTTTTCTACAGAAACGTTGGCACAATATCTCACAAAGCTGATGTTTATAGTTTTGGGATGTTGTTGATGGAGATGGCAAATAGAAGGAAGAACTTGGATGTATTGGCTGATCAATCTAGCCAGGTTTATTTCCCTTTTTGGGTTTATGATCAATTACAAGATGGAAGAGAAATAACAATTGATAATGCTTCAAATCATGAAACGAAATTGGCAAAGAAAATGATGATTGTGGCTTTGTGGTGTATACAGGCAAAACCTAGCGATCGTCCTTCAATGGATAAAGTGTTGGAGATGCTTGAAGAAGAAGATGAAGATTTGCAAATGCCTAATCAGCCTGACCTTGATGCACAAGATGTACAAGATGAAGATGCTAATAGAACTGGTAGTTCATTGTATTCCTCTGGTACATCAGTTACTGATGATCAGTAA
Protein sequence

>MsG0180001124.01.T01

FFHFGKPKMSSLTLVVLLLILIFSYNVDGDDEQHESCSRRCGVHNISHPFRLKDSPKECGDERYNLSCEDNNQLILYYEAEEYHGKYYVQSINYNNFTIRLLDFNLASSNNSIPPYYSLGLYNFSSNFFISPYLAYYRYKNHTKHMLTNSMLYVSCPNRMEYSYIGNCVNSLYVGGYGKSLLQFGLGDGCRIEFMYLTSWDVENDGNINNISCTDIRRMMYYGFELSWLNSRCKHGRYAVLDQYNQPHCKYDYWNNAAWIVARLSFGIGVLVGLLSGVKFVLGAPFIIVLLINKWRQKHLSMYDGVEDFLSSDNSIIPIRYSYKDIKKITEQFKTKLGNGGYGSVFKGQLRSGRLVAVKLLDRAKSTDRDFVNEVATIGRIHHVNVVQLIGYCVEGSKRVLIYEFMPNGSLEKYIFSHSEESNSLSCEKLHAISLGVARGIEYLHHGCDMKILHFDIKPHNILLDENFNPKVSDFGLARLCPTDKSIVSLTAARGTIGYMAPELFYRNVGTISHKADVYSFGMLLMEMANRRKNLDVLADQSSQVYFPFWVYDQLQDGREITIDNASNHETKLAKKMMIVALWCIQAKPSDRPSMDKVLEMLEEEDEDLQMPNQPDLDAQDVQDEDANRTGSSLYSSGTSVTDDQ*