AlfalfaGEDB | MsG0180001314.01

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180001314.01

KEGG: K11420
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Nr:

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Swissprot:

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Trembl:

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TFs/TRs:

Gene ID	Type	Classification
MsG0180001314.01.T04	TR	SET
MsG0180001314.01.T05	TR	SET
MsG0180001314.01.T06	TR	SET

Protein Kinases:

Gene ID	Type	Classification

Network:

Co-expression Network

Gene1	Gene2	correlation coefficient	p_value	FDR

PPI

Gene1	Gene2	Type

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MsG0180001314.01.T06	AT2G33290	56.858	401	169	3	2	400	245	643	4.32e-163	473
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MsG0180001314.01.T06	AT5G13960	34.729	406	241	9	7	395	62	460	1.17e-69	228
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MsG0180001314.01.T06	AT2G35160	35.101	396	216	11	5	394	403	763	2.99e-64	220
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MsG0180001314.01.T06	AT2G24740	34.343	396	230	13	7	396	353	724	7.70e-53	188
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MsG0180001314.01.T06	AT2G23740	33.511	188	105	5	213	395	1184	1356	2.91e-19	90.9
MsG0180001314.01.T06	AT2G23740	33.511	188	105	5	213	395	1177	1349	2.94e-19	90.9
MsG0180001314.01.T06	AT3G03750	30.288	208	119	6	189	395	141	323	5.08e-17	82.4
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MsG0180001314.01.T06	AT1G04050	26.282	312	148	10	146	397	409	698	4.69e-16	80.9
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MsG0180001314.01.T06	AT5G47160	39.655	116	64	3	1	113	295	407	1.12e-12	69.7
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MsG0180001314.01.T06	AT5G43990	24.013	304	160	12	146	396	326	611	2.37e-12	69.3

Find 134 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 159 sgRNAs with CRISPR-GE

CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence	on_target_score	Position	Region
CCCCATTCCGTCCACCTATT+TGG	0.145551	1:-19313915	None:intergenic
GTTGGAAGTGTTTAGATCTT+TGG	0.227926	1:+19313752	MsG0180001314.01.T07:CDS
CTATGATTCGGTTCGTGTTT+TGG	0.241861	1:+19312747	MsG0180001314.01.T02:CDS
AGAAGCCCGCTTTGACTATA+AGG	0.293128	1:-19313633	None:intergenic
ACAAATTGAACCATCAGATT+TGG	0.317584	1:-19314062	None:intergenic
AGAGATTTCAGCCTTGATTA+TGG	0.322787	1:+19314155	MsG0180001314.01.T07:CDS
AGGATTGTTGGCGCGATTCC+CGG	0.341645	1:+19312874	MsG0180001314.01.T02:CDS
CCATTTGAACTCATACTTCC+AGG	0.343923	1:-19312985	None:intergenic
TCAAGCTAAGATGGGTAGTT+TGG	0.350493	1:+19313341	MsG0180001314.01.T07:CDS
TCCAAATAGGTGGACGGAAT+GGG	0.353796	1:+19313914	MsG0180001314.01.T07:CDS
TTGTGTGTGGTTGGTTTACA+TGG	0.355893	1:+19312934	MsG0180001314.01.T02:CDS
GGATGGAGCGTGTTGGTATA+AGG	0.360343	1:+19313442	MsG0180001314.01.T07:CDS
GTGTTTAGATCTTTGGAAAC+TGG	0.365217	1:+19313759	MsG0180001314.01.T07:CDS
ATGGAGAGGAGTATGCATTA+TGG	0.365705	1:+19313156	MsG0180001314.01.T07:CDS
TAGATCTTTGGAAACTGGTT+GGG	0.370326	1:+19313764	MsG0180001314.01.T07:CDS
TGCATTTGTTTCATGAGAAA+TGG	0.371968	1:+19313600	MsG0180001314.01.T07:CDS
CTTGTTCGAATGACGGATCT+AGG	0.373790	1:+19312673	MsG0180001314.01.T02:CDS
GTAAATGTGTGGGCAGTTGC+AGG	0.381411	1:+19313571	MsG0180001314.01.T07:CDS
GATGTTGGTAAAAGTGGTTT+TGG	0.382231	1:+19313285	MsG0180001314.01.T07:CDS
TCCATCCCGTTGGAAATATC+AGG	0.385210	1:-19313426	None:intergenic
GAAGGTACTTCTTCAACTTC+AGG	0.391726	1:+19313213	MsG0180001314.01.T07:CDS
CATTTATATGCGAGTACAGC+GGG	0.395589	1:+19313820	MsG0180001314.01.T07:CDS
TAAATGTGCCAGCTTGAATA+AGG	0.408878	1:-19313803	None:intergenic
TGGAGAGGAGTATGCATTAT+GGG	0.415278	1:+19313157	MsG0180001314.01.T07:CDS
GCTACTAGTGTGATTGTGTC+TGG	0.438326	1:+19313018	MsG0180001314.01.T02:CDS
GCTGGGATCGATTATTTGCC+TGG	0.440591	1:+19312967	MsG0180001314.01.T02:CDS
GGTAAGGTTTATGTTTATGA+TGG	0.443436	1:+19313234	MsG0180001314.01.T07:CDS
CACAACAAGGGCTTAATCAT+AGG	0.446724	1:+19313730	MsG0180001314.01.T07:CDS
GTAGCTGTCCGCCTCATTGT+CGG	0.447353	1:+19313697	MsG0180001314.01.T07:CDS
CACATCACCAATACATATCC+CGG	0.453791	1:-19312893	None:intergenic
AAATTCAAAGGAAGAATTGA+TGG	0.457852	1:-19313981	None:intergenic
GACTAGGATGGTCTATGATT+CGG	0.457902	1:+19312735	MsG0180001314.01.T02:CDS
TGTATAAGATTGTTGAAAGC+TGG	0.458955	1:+19313259	MsG0180001314.01.T07:CDS
CCTGGAAGTATGAGTTCAAA+TGG	0.460753	1:+19312985	MsG0180001314.01.T02:CDS
GATTGTGTCTGGTGGATATG+AGG	0.460947	1:+19313029	MsG0180001314.01.T02:CDS
GATTGATGATCAAGCTAAGA+TGG	0.462647	1:+19313332	MsG0180001314.01.T07:CDS
AATCGCAATATGAGGATTGT+TGG	0.469750	1:+19312862	MsG0180001314.01.T02:CDS
ATACACATAGGTTTATAATC+AGG	0.471074	1:-19313396	None:intergenic
GGATTGTTGGCGCGATTCCC+GGG	0.474543	1:+19312875	MsG0180001314.01.T02:CDS
TTCCAAATAGGTGGACGGAA+TGG	0.475724	1:+19313913	MsG0180001314.01.T07:CDS
CACCTATTTGGAAAACGATT+CGG	0.477175	1:-19313903	None:intergenic
TACTTCTTCAACTTCAGGTA+AGG	0.478043	1:+19313218	MsG0180001314.01.T07:CDS
AGGTGATGTTATTATTCTCT+CGG	0.481641	1:+19313065	MsG0180001314.01.T02:CDS
GTTATTATTCTCTCGGGTCA+TGG	0.481758	1:+19313072	MsG0180001314.01.T02:CDS
AGGATGGAGTTGTGTGTGGT+TGG	0.488005	1:+19312925	MsG0180001314.01.T02:CDS
ATCGGAAAAGCGTCAAATGC+GGG	0.499046	1:+19312699	MsG0180001314.01.T02:CDS
AATGACGGATCTAGGGTTAT+CGG	0.500590	1:+19312681	MsG0180001314.01.T02:CDS
TGTGGCTGAATCGCAATATG+AGG	0.502406	1:+19312854	MsG0180001314.01.T02:CDS
AGATCTTTGGAAACTGGTTG+GGG	0.504345	1:+19313765	MsG0180001314.01.T07:CDS
GGTGATGTTATTATTCTCTC+GGG	0.504399	1:+19313066	MsG0180001314.01.T02:CDS
TGGTGTGATGTTGGTAAAAG+TGG	0.509931	1:+19313279	MsG0180001314.01.T07:CDS
TATCTCCTGATATTTCCAAC+GGG	0.517150	1:+19313421	MsG0180001314.01.T07:CDS
ATTGTGTCTGGTGGATATGA+GGG	0.518375	1:+19313030	MsG0180001314.01.T02:CDS
TCATTTGACCTTATTCAAGC+TGG	0.519192	1:+19313795	MsG0180001314.01.T07:CDS
TAAAACTATGCTGTTTGCGA+TGG	0.519235	1:+19314115	MsG0180001314.01.T07:CDS
CCCCTTGGATGAAAATCAAA+GGG	0.520001	1:-19313534	None:intergenic
GCTTTCCTTATAGTCAAAGC+GGG	0.522811	1:+19313628	MsG0180001314.01.T07:CDS
CGGAACCGTGTTACACAACA+AGG	0.524134	1:+19313717	MsG0180001314.01.T07:CDS
TCTCTCGGGTCATGGTGGGC+AGG	0.526040	1:+19313080	MsG0180001314.01.T02:CDS
TGGAAACTGGTTGGGGAGTG+AGG	0.530566	1:+19313772	MsG0180001314.01.T07:CDS
TGAGGCGGACAGCTACAATC+AGG	0.531632	1:-19313690	None:intergenic
ACAATCACACTAGTAGCAAT+CGG	0.534911	1:-19313012	None:intergenic
GTTGAAAGCTGGTGTGATGT+TGG	0.536898	1:+19313270	MsG0180001314.01.T07:CDS
TCATCAGAAGCTAGAAGGAG+GGG	0.538962	1:+19313125	MsG0180001314.01.T02:CDS
TTAGATCTTTGGAAACTGGT+TGG	0.541400	1:+19313763	MsG0180001314.01.T07:CDS
GCGATTCCCGGGATATGTAT+TGG	0.541933	1:+19312886	MsG0180001314.01.T02:CDS
GAGTATGCATTATGGGATTG+AGG	0.542821	1:+19313164	MsG0180001314.01.T07:CDS
TTGTTCGAATGACGGATCTA+GGG	0.543701	1:+19312674	MsG0180001314.01.T02:CDS
TCCTGATATTTCCAACGGGA+TGG	0.545378	1:+19313425	MsG0180001314.01.T07:CDS
TTATTCTCTCGGGTCATGGT+GGG	0.547783	1:+19313076	MsG0180001314.01.T02:CDS
TCAAGGCTGAAATCTCTCAA+TGG	0.553800	1:-19314149	None:intergenic
CAAAGCGGGCTTCTCTTGAA+AGG	0.554951	1:+19313642	MsG0180001314.01.T07:CDS
ACAAGGGCTTAATCATAGGT+TGG	0.555207	1:+19313734	MsG0180001314.01.T07:CDS
CATCATCTACACCATAATCA+AGG	0.555559	1:-19314166	None:intergenic
AGAAGGAGGGGATCTTGCTA+TGG	0.555793	1:+19313137	MsG0180001314.01.T02:CDS
ATATCTCCTGATATTTCCAA+CGG	0.556018	1:+19313420	MsG0180001314.01.T07:CDS
GCTTCTCTTGAAAGGAAAGC+CGG	0.556611	1:+19313650	MsG0180001314.01.T07:CDS
TTGGCTATGGCTGAAGATGA+AGG	0.558623	1:+19312766	MsG0180001314.01.T02:CDS
AGATCCGTCATTCGAACAAG+TGG	0.563268	1:-19312670	None:intergenic
CGATGAGGAGTCGAGGATTG+TGG	0.563315	1:+19312836	MsG0180001314.01.T02:CDS
CCAAATAGGTGGACGGAATG+GGG	0.564405	1:+19313915	MsG0180001314.01.T07:CDS
GGAAGAATTGATGGATACGA+AGG	0.565248	1:-19313972	None:intergenic
GCATTATGGGATTGAGGTGA+GGG	0.567512	1:+19313170	MsG0180001314.01.T07:CDS
GAAATCTCTCAATGGAGGGA+TGG	0.567762	1:-19314141	None:intergenic
TTACATGGTGAACCACAAGC+TGG	0.570814	1:+19312949	MsG0180001314.01.T02:CDS
CTCTGGACGTGTCTAGAATG+AGG	0.571022	1:+19314006	MsG0180001314.01.T07:CDS
TTCATCAGAAGCTAGAAGGA+GGG	0.573844	1:+19313124	MsG0180001314.01.T02:CDS
GTATAGGATGGAGTTGTGTG+TGG	0.574388	1:+19312921	MsG0180001314.01.T02:CDS
GGCTGAAATCTCTCAATGGA+GGG	0.575518	1:-19314145	None:intergenic
TACATGGTGAACCACAAGCT+GGG	0.577042	1:+19312950	MsG0180001314.01.T02:CDS
GGGATGTTGTTCGAAGGACT+AGG	0.579467	1:+19312719	MsG0180001314.01.T02:CDS
ACTAGTGTGATTGTGTCTGG+TGG	0.586852	1:+19313021	MsG0180001314.01.T02:CDS
TGCATTATGGGATTGAGGTG+AGG	0.587036	1:+19313169	MsG0180001314.01.T07:CDS
ATGGTGGGCAGGATAAGAAT+CGG	0.592281	1:+19313091	MsG0180001314.01.T02:CDS
ATTATTCTCTCGGGTCATGG+TGG	0.592834	1:+19313075	MsG0180001314.01.T02:CDS
TAGCTCAACTCCAAATCTGA+TGG	0.593289	1:+19314052	MsG0180001314.01.T07:CDS
ATTGATGATCAAGCTAAGAT+GGG	0.593619	1:+19313333	MsG0180001314.01.T07:CDS
TAAGCCCTTGTTGTGTAACA+CGG	0.598036	1:-19313722	None:intergenic
AGGCTGAAATCTCTCAATGG+AGG	0.598790	1:-19314146	None:intergenic
GATCCCACTTGTTCGAATGA+CGG	0.598813	1:+19312666	MsG0180001314.01.T02:CDS
ACCAACACGCTCCATCCCGT+TGG	0.599403	1:-19313436	None:intergenic
ACAGCGGGGTTGTTCTAACA+AGG	0.600545	1:+19313835	MsG0180001314.01.T07:CDS
ACATCACCAATACATATCCC+GGG	0.600688	1:-19312892	None:intergenic
TTTCATCAGAAGCTAGAAGG+AGG	0.601171	1:+19313123	MsG0180001314.01.T02:CDS
GCAGAAATTATGACTATGAG+TGG	0.602784	1:+19313864	MsG0180001314.01.T07:CDS
ACGTCCAGAGCAAAATTCAA+AGG	0.609054	1:-19313993	None:intergenic
TGTGTGGGCAGTTGCAGGGA+AGG	0.614573	1:+19313576	MsG0180001314.01.T07:CDS
TGAGGGTCATCCGCGCTGTG+AGG	0.617530	1:+19313187	MsG0180001314.01.T07:CDS
GAGGGGATCTTGCTATGGAG+AGG	0.622960	1:+19313142	MsG0180001314.01.T02:CDS
TCAGGAGATATAATACACAT+AGG	0.624086	1:-19313408	None:intergenic
TGAGACAGGTTGTAAATGTG+TGG	0.625021	1:+19313560	MsG0180001314.01.T07:CDS
TATCGGAAAAGCGTCAAATG+CGG	0.625063	1:+19312698	MsG0180001314.01.T02:CDS
ATCCGCGCTGTGAGGTACGA+AGG	0.625946	1:+19313195	MsG0180001314.01.T07:CDS
GGAAGATACTCAAAATACAT+CGG	0.630650	1:-19313495	None:intergenic
AGCTTTCCTTATAGTCAAAG+CGG	0.631436	1:+19313627	MsG0180001314.01.T07:CDS
AAATAATCGATCCCAGCTTG+TGG	0.632977	1:-19312961	None:intergenic
TATGAGGGTGATGTTGATGA+AGG	0.637266	1:+19313045	MsG0180001314.01.T02:CDS
TAAATGTGTGGGCAGTTGCA+GGG	0.639917	1:+19313572	MsG0180001314.01.T07:CDS
AAATGCGGGATGTTGTTCGA+AGG	0.647284	1:+19312713	MsG0180001314.01.T02:CDS
GAGACAGGTTGTAAATGTGT+GGG	0.652888	1:+19313561	MsG0180001314.01.T07:CDS
TGTTGTTCGAAGGACTAGGA+TGG	0.654135	1:+19312723	MsG0180001314.01.T02:CDS
TGAAAGCTTCTGCTACGATG+AGG	0.658793	1:+19312821	MsG0180001314.01.T02:CDS
TCCAACGGGATGGAGCGTGT+TGG	0.665494	1:+19313435	MsG0180001314.01.T07:CDS
GATCCGTCATTCGAACAAGT+GGG	0.669479	1:-19312669	None:intergenic
TCTGCTACGATGAGGAGTCG+AGG	0.674570	1:+19312829	MsG0180001314.01.T02:CDS
ACATTTATATGCGAGTACAG+CGG	0.676169	1:+19313819	MsG0180001314.01.T07:CDS
ACACGGTTCCGACAATGAGG+CGG	0.681770	1:-19313705	None:intergenic
GTGGGCAGGATAAGAATCGG+AGG	0.693208	1:+19313094	MsG0180001314.01.T02:CDS
CAGCGGGGTTGTTCTAACAA+GGG	0.700564	1:+19313836	MsG0180001314.01.T07:CDS
GTAACACGGTTCCGACAATG+AGG	0.703986	1:-19313708	None:intergenic
CGTGTCTAGAATGAGGAATG+TGG	0.710491	1:+19314013	MsG0180001314.01.T07:CDS
ATTTATATGCGAGTACAGCG+GGG	0.724918	1:+19313821	MsG0180001314.01.T07:CDS
TACCTTCGTACCTCACAGCG+CGG	0.749117	1:-19313197	None:intergenic
GGAACCGTGTTACACAACAA+GGG	0.763258	1:+19313718	MsG0180001314.01.T07:CDS

CRISPR-GE

badsite warning	sgRNA_sequence	Strand	Position	Region	GC_content
!	AAATTCAAAGGAAGAATTGA+TGG	-	Chr1:19313984-19314003	None:intergenic	25.0%
!	ATACACATAGGTTTATAATC+AGG	-	Chr1:19313399-19313418	None:intergenic	25.0%
!!!	TTTTTAAGTTTATGTTGTCG+AGG	+	Chr1:19313310-19313329	MsG0180001314.01.T07:CDS	25.0%
	ACAAATTGAACCATCAGATT+TGG	-	Chr1:19314065-19314084	None:intergenic	30.0%
	AGGTGATGTTATTATTCTCT+CGG	+	Chr1:19313065-19313084	MsG0180001314.01.T02:CDS	30.0%
	ATATCTCCTGATATTTCCAA+CGG	+	Chr1:19313420-19313439	MsG0180001314.01.T07:CDS	30.0%
	GGAAGATACTCAAAATACAT+CGG	-	Chr1:19313498-19313517	None:intergenic	30.0%
	GGTAAGGTTTATGTTTATGA+TGG	+	Chr1:19313234-19313253	MsG0180001314.01.T07:CDS	30.0%
	TCAGGAGATATAATACACAT+AGG	-	Chr1:19313411-19313430	None:intergenic	30.0%
	TGCATTTGTTTCATGAGAAA+TGG	+	Chr1:19313600-19313619	MsG0180001314.01.T07:CDS	30.0%
	TGTATAAGATTGTTGAAAGC+TGG	+	Chr1:19313259-19313278	MsG0180001314.01.T07:CDS	30.0%
!	ATTGATGATCAAGCTAAGAT+GGG	+	Chr1:19313333-19313352	MsG0180001314.01.T07:CDS	30.0%
!!	GTATTTTGAGTATCTTCCTA+GGG	+	Chr1:19313500-19313519	MsG0180001314.01.T07:CDS	30.0%
!!	TGATGTGTTTTTGTATAGGA+TGG	+	Chr1:19312909-19312928	MsG0180001314.01.T02:CDS	30.0%
!!	TGTATTTTGAGTATCTTCCT+AGG	+	Chr1:19313499-19313518	MsG0180001314.01.T07:CDS	30.0%
!!!	TTGGTGATGTGTTTTTGTAT+AGG	+	Chr1:19312905-19312924	MsG0180001314.01.T02:CDS	30.0%
	AATCGCAATATGAGGATTGT+TGG	+	Chr1:19312862-19312881	MsG0180001314.01.T02:CDS	35.0%
	ACAATCACACTAGTAGCAAT+CGG	-	Chr1:19313015-19313034	None:intergenic	35.0%
	ACATTTATATGCGAGTACAG+CGG	+	Chr1:19313819-19313838	MsG0180001314.01.T07:CDS	35.0%
	AGAGATTTCAGCCTTGATTA+TGG	+	Chr1:19314155-19314174	MsG0180001314.01.T07:CDS	35.0%
	AGCTTTCCTTATAGTCAAAG+CGG	+	Chr1:19313627-19313646	MsG0180001314.01.T07:CDS	35.0%
	CACCTATTTGGAAAACGATT+CGG	-	Chr1:19313906-19313925	None:intergenic	35.0%
	CATCATCTACACCATAATCA+AGG	-	Chr1:19314169-19314188	None:intergenic	35.0%
	GCAGAAATTATGACTATGAG+TGG	+	Chr1:19313864-19313883	MsG0180001314.01.T07:CDS	35.0%
	GGTGATGTTATTATTCTCTC+GGG	+	Chr1:19313066-19313085	MsG0180001314.01.T02:CDS	35.0%
	TAAATGTGCCAGCTTGAATA+AGG	-	Chr1:19313806-19313825	None:intergenic	35.0%
	TACTTCTTCAACTTCAGGTA+AGG	+	Chr1:19313218-19313237	MsG0180001314.01.T07:CDS	35.0%
	TATCTCCTGATATTTCCAAC+GGG	+	Chr1:19313421-19313440	MsG0180001314.01.T07:CDS	35.0%
	TCATTTGACCTTATTCAAGC+TGG	+	Chr1:19313795-19313814	MsG0180001314.01.T07:CDS	35.0%
!	ATCCGAATCGTTTTCCAAAT+AGG	+	Chr1:19313901-19313920	MsG0180001314.01.T07:CDS	35.0%
!	GATTGATGATCAAGCTAAGA+TGG	+	Chr1:19313332-19313351	MsG0180001314.01.T07:CDS	35.0%
!	GTGTTTAGATCTTTGGAAAC+TGG	+	Chr1:19313759-19313778	MsG0180001314.01.T07:CDS	35.0%
!	GTTTTTCATCAGAAGCTAGA+AGG	+	Chr1:19313120-19313139	MsG0180001314.01.T02:CDS	35.0%
!	TAAAACTATGCTGTTTGCGA+TGG	+	Chr1:19314115-19314134	MsG0180001314.01.T07:CDS	35.0%
!	TAGATCTTTGGAAACTGGTT+GGG	+	Chr1:19313764-19313783	MsG0180001314.01.T07:CDS	35.0%
!	TCTTCCTTTGAATTTTGCTC+TGG	+	Chr1:19313989-19314008	MsG0180001314.01.T07:CDS	35.0%
!	TTAGATCTTTGGAAACTGGT+TGG	+	Chr1:19313763-19313782	MsG0180001314.01.T07:CDS	35.0%
!!	GATGTTGGTAAAAGTGGTTT+TGG	+	Chr1:19313285-19313304	MsG0180001314.01.T07:CDS	35.0%
!!	GTTGGAAGTGTTTAGATCTT+TGG	+	Chr1:19313752-19313771	MsG0180001314.01.T07:CDS	35.0%
!!	TCCCTTTGATTTTCATCCAA+GGG	+	Chr1:19313533-19313552	MsG0180001314.01.T07:CDS	35.0%
!!	TCGCAAACAGCATAGTTTTA+AGG	-	Chr1:19314115-19314134	None:intergenic	35.0%
!!	TTCCCTTTGATTTTCATCCA+AGG	+	Chr1:19313532-19313551	MsG0180001314.01.T07:CDS	35.0%
!!!	GATGGGTAGTTTGGTTTTAA+AGG	+	Chr1:19313350-19313369	MsG0180001314.01.T07:CDS	35.0%
	AAATAATCGATCCCAGCTTG+TGG	-	Chr1:19312964-19312983	None:intergenic	40.0%
	AAGGGAAAAAATGTAGCCCT+AGG	-	Chr1:19313519-19313538	None:intergenic	40.0%
	ACAAGGGCTTAATCATAGGT+TGG	+	Chr1:19313734-19313753	MsG0180001314.01.T07:CDS	40.0%
	ACATCACCAATACATATCCC+GGG	-	Chr1:19312895-19312914	None:intergenic	40.0%
	ACGTCCAGAGCAAAATTCAA+AGG	-	Chr1:19313996-19314015	None:intergenic	40.0%
	ATTTATATGCGAGTACAGCG+GGG	+	Chr1:19313821-19313840	MsG0180001314.01.T07:CDS	40.0%
	CACAACAAGGGCTTAATCAT+AGG	+	Chr1:19313730-19313749	MsG0180001314.01.T07:CDS	40.0%
	CACATCACCAATACATATCC+CGG	-	Chr1:19312896-19312915	None:intergenic	40.0%
	CATTTATATGCGAGTACAGC+GGG	+	Chr1:19313820-19313839	MsG0180001314.01.T07:CDS	40.0%
	CCATTTGAACTCATACTTCC+AGG	-	Chr1:19312988-19313007	None:intergenic	40.0%
	CCCCTTGGATGAAAATCAAA+GGG	-	Chr1:19313537-19313556	None:intergenic	40.0%
	GACTAGGATGGTCTATGATT+CGG	+	Chr1:19312735-19312754	MsG0180001314.01.T02:CDS	40.0%
	GAGACAGGTTGTAAATGTGT+GGG	+	Chr1:19313561-19313580	MsG0180001314.01.T07:CDS	40.0%
	GAGTATGCATTATGGGATTG+AGG	+	Chr1:19313164-19313183	MsG0180001314.01.T07:CDS	40.0%
	GCTTTCCTTATAGTCAAAGC+GGG	+	Chr1:19313628-19313647	MsG0180001314.01.T07:CDS	40.0%
	GGACCACATTCAAAAATGAC+CGG	-	Chr1:19313672-19313691	None:intergenic	40.0%
	GTTATTATTCTCTCGGGTCA+TGG	+	Chr1:19313072-19313091	MsG0180001314.01.T02:CDS	40.0%
	TAGCTCAACTCCAAATCTGA+TGG	+	Chr1:19314052-19314071	MsG0180001314.01.T07:CDS	40.0%
	TCAAGCTAAGATGGGTAGTT+TGG	+	Chr1:19313341-19313360	MsG0180001314.01.T07:CDS	40.0%
	TCAAGGCTGAAATCTCTCAA+TGG	-	Chr1:19314152-19314171	None:intergenic	40.0%
	TGAGACAGGTTGTAAATGTG+TGG	+	Chr1:19313560-19313579	MsG0180001314.01.T07:CDS	40.0%
	TTCATCAGAAGCTAGAAGGA+GGG	+	Chr1:19313124-19313143	MsG0180001314.01.T02:CDS	40.0%
	TTTCATCAGAAGCTAGAAGG+AGG	+	Chr1:19313123-19313142	MsG0180001314.01.T02:CDS	40.0%
!	AGATCTTTGGAAACTGGTTG+GGG	+	Chr1:19313765-19313784	MsG0180001314.01.T07:CDS	40.0%
!	ATGGAGAGGAGTATGCATTA+TGG	+	Chr1:19313156-19313175	MsG0180001314.01.T07:CDS	40.0%
!	ATTGTGTCTGGTGGATATGA+GGG	+	Chr1:19313030-19313049	MsG0180001314.01.T02:CDS	40.0%
!	CCTGGAAGTATGAGTTCAAA+TGG	+	Chr1:19312985-19313004	MsG0180001314.01.T02:CDS	40.0%
!	CGAATCGTTTTCCAAATAGG+TGG	+	Chr1:19313904-19313923	MsG0180001314.01.T07:CDS	40.0%
!	GGAAGAATTGATGGATACGA+AGG	-	Chr1:19313975-19313994	None:intergenic	40.0%
!	TAAGCCCTTGTTGTGTAACA+CGG	-	Chr1:19313725-19313744	None:intergenic	40.0%
!	TATGAGGGTGATGTTGATGA+AGG	+	Chr1:19313045-19313064	MsG0180001314.01.T02:CDS	40.0%
!	TCGTTTTCCAAATAGGTGGA+CGG	+	Chr1:19313908-19313927	MsG0180001314.01.T07:CDS	40.0%
!	TGGAGAGGAGTATGCATTAT+GGG	+	Chr1:19313157-19313176	MsG0180001314.01.T07:CDS	40.0%
!	TGGTGTGATGTTGGTAAAAG+TGG	+	Chr1:19313279-19313298	MsG0180001314.01.T07:CDS	40.0%
!!	AATGACGGATCTAGGGTTAT+CGG	+	Chr1:19312681-19312700	MsG0180001314.01.T02:CDS	40.0%
!!	CCCTTTGATTTTCATCCAAG+GGG	+	Chr1:19313534-19313553	MsG0180001314.01.T07:CDS	40.0%
!!	CCTTTGATTTTCATCCAAGG+GGG	+	Chr1:19313535-19313554	MsG0180001314.01.T07:CDS	40.0%
!!	GAAGGTACTTCTTCAACTTC+AGG	+	Chr1:19313213-19313232	MsG0180001314.01.T07:CDS	40.0%
!!	TATCGGAAAAGCGTCAAATG+CGG	+	Chr1:19312698-19312717	MsG0180001314.01.T02:CDS	40.0%
!!	TTGTGTGTGGTTGGTTTACA+TGG	+	Chr1:19312934-19312953	MsG0180001314.01.T02:CDS	40.0%
!!	TTGTTCGAATGACGGATCTA+GGG	+	Chr1:19312674-19312693	MsG0180001314.01.T02:CDS	40.0%
!!!	AAGCCGGTCATTTTTGAATG+TGG	+	Chr1:19313666-19313685	MsG0180001314.01.T07:CDS	40.0%
!!!	CTATGATTCGGTTCGTGTTT+TGG	+	Chr1:19312747-19312766	MsG0180001314.01.T02:CDS	40.0%
!!!	GGGTAGTTTGGTTTTAAAGG+AGG	+	Chr1:19313353-19313372	MsG0180001314.01.T07:CDS	40.0%
!!!	TAAAGGAGGCTTTTTTGCGT+AGG	+	Chr1:19313367-19313386	MsG0180001314.01.T07:CDS	40.0%
	AAATGCGGGATGTTGTTCGA+AGG	+	Chr1:19312713-19312732	MsG0180001314.01.T02:CDS	45.0%
	ACTAGTGTGATTGTGTCTGG+TGG	+	Chr1:19313021-19313040	MsG0180001314.01.T02:CDS	45.0%
	AGAAGCCCGCTTTGACTATA+AGG	-	Chr1:19313636-19313655	None:intergenic	45.0%
	AGATCCGTCATTCGAACAAG+TGG	-	Chr1:19312673-19312692	None:intergenic	45.0%
	AGGCTGAAATCTCTCAATGG+AGG	-	Chr1:19314149-19314168	None:intergenic	45.0%
	ATTATTCTCTCGGGTCATGG+TGG	+	Chr1:19313075-19313094	MsG0180001314.01.T02:CDS	45.0%
	CCCCCTTGGATGAAAATCAA+AGG	-	Chr1:19313538-19313557	None:intergenic	45.0%
	GAAATCTCTCAATGGAGGGA+TGG	-	Chr1:19314144-19314163	None:intergenic	45.0%
	GATCCCACTTGTTCGAATGA+CGG	+	Chr1:19312666-19312685	MsG0180001314.01.T02:CDS	45.0%
	GATCCGTCATTCGAACAAGT+GGG	-	Chr1:19312672-19312691	None:intergenic	45.0%
	GCATTATGGGATTGAGGTGA+GGG	+	Chr1:19313170-19313189	MsG0180001314.01.T07:CDS	45.0%
	GCTACTAGTGTGATTGTGTC+TGG	+	Chr1:19313018-19313037	MsG0180001314.01.T02:CDS	45.0%
	GCTTCTCTTGAAAGGAAAGC+CGG	+	Chr1:19313650-19313669	MsG0180001314.01.T07:CDS	45.0%
	GGAACCGTGTTACACAACAA+GGG	+	Chr1:19313718-19313737	MsG0180001314.01.T07:CDS	45.0%
	GGCTGAAATCTCTCAATGGA+GGG	-	Chr1:19314148-19314167	None:intergenic	45.0%
	GTATAGGATGGAGTTGTGTG+TGG	+	Chr1:19312921-19312940	MsG0180001314.01.T02:CDS	45.0%
	GTTGAAAGCTGGTGTGATGT+TGG	+	Chr1:19313270-19313289	MsG0180001314.01.T07:CDS	45.0%
	TAAATGTGTGGGCAGTTGCA+GGG	+	Chr1:19313572-19313591	MsG0180001314.01.T07:CDS	45.0%
	TACATGGTGAACCACAAGCT+GGG	+	Chr1:19312950-19312969	MsG0180001314.01.T02:CDS	45.0%
	TCATCAGAAGCTAGAAGGAG+GGG	+	Chr1:19313125-19313144	MsG0180001314.01.T02:CDS	45.0%
	TCCAAATAGGTGGACGGAAT+GGG	+	Chr1:19313914-19313933	MsG0180001314.01.T07:CDS	45.0%
	TCCATCCCGTTGGAAATATC+AGG	-	Chr1:19313429-19313448	None:intergenic	45.0%
	TCCTGATATTTCCAACGGGA+TGG	+	Chr1:19313425-19313444	MsG0180001314.01.T07:CDS	45.0%
	TGAAAGCTTCTGCTACGATG+AGG	+	Chr1:19312821-19312840	MsG0180001314.01.T02:CDS	45.0%
	TGCATTATGGGATTGAGGTG+AGG	+	Chr1:19313169-19313188	MsG0180001314.01.T07:CDS	45.0%
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	TGTTGTTCGAAGGACTAGGA+TGG	+	Chr1:19312723-19312742	MsG0180001314.01.T02:CDS	45.0%
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	TTATTCTCTCGGGTCATGGT+GGG	+	Chr1:19313076-19313095	MsG0180001314.01.T02:CDS	45.0%
	TTCCAAATAGGTGGACGGAA+TGG	+	Chr1:19313913-19313932	MsG0180001314.01.T07:CDS	45.0%
	TTGGCTATGGCTGAAGATGA+AGG	+	Chr1:19312766-19312785	MsG0180001314.01.T02:CDS	45.0%
!	CGTGTCTAGAATGAGGAATG+TGG	+	Chr1:19314013-19314032	MsG0180001314.01.T07:CDS	45.0%
!	GATTGTGTCTGGTGGATATG+AGG	+	Chr1:19313029-19313048	MsG0180001314.01.T02:CDS	45.0%
!!	ATCGGAAAAGCGTCAAATGC+GGG	+	Chr1:19312699-19312718	MsG0180001314.01.T02:CDS	45.0%
!!	ATGGTGGGCAGGATAAGAAT+CGG	+	Chr1:19313091-19313110	MsG0180001314.01.T02:CDS	45.0%
!!	CTTGTTCGAATGACGGATCT+AGG	+	Chr1:19312673-19312692	MsG0180001314.01.T02:CDS	45.0%
!!!	TTCGGTTCGTGTTTTGGCTA+TGG	+	Chr1:19312753-19312772	MsG0180001314.01.T02:CDS	45.0%
	ACAGCGGGGTTGTTCTAACA+AGG	+	Chr1:19313835-19313854	MsG0180001314.01.T07:CDS	50.0%
	AGAAGGAGGGGATCTTGCTA+TGG	+	Chr1:19313137-19313156	MsG0180001314.01.T02:CDS	50.0%
	AGGATGGAGTTGTGTGTGGT+TGG	+	Chr1:19312925-19312944	MsG0180001314.01.T02:CDS	50.0%
	CAGCGGGGTTGTTCTAACAA+GGG	+	Chr1:19313836-19313855	MsG0180001314.01.T07:CDS	50.0%
	CCAAATAGGTGGACGGAATG+GGG	+	Chr1:19313915-19313934	MsG0180001314.01.T07:CDS	50.0%
	CGGAACCGTGTTACACAACA+AGG	+	Chr1:19313717-19313736	MsG0180001314.01.T07:CDS	50.0%
	GCGATTCCCGGGATATGTAT+TGG	+	Chr1:19312886-19312905	MsG0180001314.01.T02:CDS	50.0%
	GCTGGGATCGATTATTTGCC+TGG	+	Chr1:19312967-19312986	MsG0180001314.01.T02:CDS	50.0%
	GGGATGTTGTTCGAAGGACT+AGG	+	Chr1:19312719-19312738	MsG0180001314.01.T02:CDS	50.0%
	GTAAATGTGTGGGCAGTTGC+AGG	+	Chr1:19313571-19313590	MsG0180001314.01.T07:CDS	50.0%
	GTAACACGGTTCCGACAATG+AGG	-	Chr1:19313711-19313730	None:intergenic	50.0%
!	CAAAGCGGGCTTCTCTTGAA+AGG	+	Chr1:19313642-19313661	MsG0180001314.01.T07:CDS	50.0%
!	CTCTGGACGTGTCTAGAATG+AGG	+	Chr1:19314006-19314025	MsG0180001314.01.T07:CDS	50.0%
!	GGATGGAGCGTGTTGGTATA+AGG	+	Chr1:19313442-19313461	MsG0180001314.01.T07:CDS	50.0%
	ACACGGTTCCGACAATGAGG+CGG	-	Chr1:19313708-19313727	None:intergenic	55.0%
	AGGATTGTTGGCGCGATTCC+CGG	+	Chr1:19312874-19312893	MsG0180001314.01.T02:CDS	55.0%
	CAACCTGTCTCATTCCCCCT+TGG	-	Chr1:19313552-19313571	None:intergenic	55.0%
	CATCCAAGGGGGAATGAGAC+AGG	+	Chr1:19313546-19313565	MsG0180001314.01.T07:CDS	55.0%
	CCCCATTCCGTCCACCTATT+TGG	-	Chr1:19313918-19313937	None:intergenic	55.0%
	CGATGAGGAGTCGAGGATTG+TGG	+	Chr1:19312836-19312855	MsG0180001314.01.T02:CDS	55.0%
	GTAGCTGTCCGCCTCATTGT+CGG	+	Chr1:19313697-19313716	MsG0180001314.01.T07:CDS	55.0%
	GTGGGCAGGATAAGAATCGG+AGG	+	Chr1:19313094-19313113	MsG0180001314.01.T02:CDS	55.0%
	TACCTTCGTACCTCACAGCG+CGG	-	Chr1:19313200-19313219	None:intergenic	55.0%
	TCTGCTACGATGAGGAGTCG+AGG	+	Chr1:19312829-19312848	MsG0180001314.01.T02:CDS	55.0%
	TGAGGCGGACAGCTACAATC+AGG	-	Chr1:19313693-19313712	None:intergenic	55.0%
	TGGAAACTGGTTGGGGAGTG+AGG	+	Chr1:19313772-19313791	MsG0180001314.01.T07:CDS	55.0%
!	GAGGGGATCTTGCTATGGAG+AGG	+	Chr1:19313142-19313161	MsG0180001314.01.T02:CDS	55.0%
	ACCAACACGCTCCATCCCGT+TGG	-	Chr1:19313439-19313458	None:intergenic	60.0%
	ATCCGCGCTGTGAGGTACGA+AGG	+	Chr1:19313195-19313214	MsG0180001314.01.T07:CDS	60.0%
	GGATTGTTGGCGCGATTCCC+GGG	+	Chr1:19312875-19312894	MsG0180001314.01.T02:CDS	60.0%
	TCCAACGGGATGGAGCGTGT+TGG	+	Chr1:19313435-19313454	MsG0180001314.01.T07:CDS	60.0%
	TGTGTGGGCAGTTGCAGGGA+AGG	+	Chr1:19313576-19313595	MsG0180001314.01.T07:CDS	60.0%
	TGAGGGTCATCCGCGCTGTG+AGG	+	Chr1:19313187-19313206	MsG0180001314.01.T07:CDS	65.0%
!!	TCTCTCGGGTCATGGTGGGC+AGG	+	Chr1:19313080-19313099	MsG0180001314.01.T02:CDS	65.0%

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Chr1	gene	19312658	19314223	19312658	ID=MsG0180001314.01;Name=MsG0180001314.01
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