AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180001732.01

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MsG0180001732.01.T01 AT4G23270 61.661 313 119 1 22 333 305 617 1.12e-136 404
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MsG0180001732.01.T01 AT4G11460 59.615 312 125 1 21 331 324 635 6.88e-136 404
MsG0180001732.01.T01 AT4G11530 55.114 352 155 2 18 368 327 676 9.20e-136 402
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MsG0180001732.01.T01 AT4G23310 55.587 349 150 2 21 368 486 830 4.68e-135 405
MsG0180001732.01.T01 AT4G23290 55.182 357 154 4 16 368 293 647 1.65e-134 398
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MsG0180001732.01.T01 AT4G11480 53.977 352 160 2 19 368 300 651 8.34e-134 397
MsG0180001732.01.T01 AT4G23290 55.182 357 154 4 16 368 336 690 1.04e-133 398
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MsG0180001732.01.T01 AT4G23190 58.991 317 125 3 18 330 247 562 1.43e-133 394
MsG0180001732.01.T01 AT4G23320 59.105 313 127 1 18 329 158 470 1.53e-133 391
MsG0180001732.01.T01 AT4G23320 59.105 313 127 1 18 329 158 470 1.53e-133 391
MsG0180001732.01.T01 AT4G23240 58.654 312 124 3 21 329 6 315 1.59e-133 385
MsG0180001732.01.T01 AT4G23320 59.105 313 127 1 18 329 179 491 1.97e-133 392
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MsG0180001732.01.T01 AT4G05200 53.351 373 163 6 5 368 323 693 7.83e-133 395
MsG0180001732.01.T01 AT4G23190 58.991 317 125 3 18 330 325 640 1.80e-132 394
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MsG0180001732.01.T01 AT4G04510 52.514 358 148 5 11 368 315 650 3.43e-122 367
MsG0180001732.01.T01 AT4G04500 58.958 307 121 3 29 330 331 637 1.80e-119 360
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MsG0180001732.01.T01 AT1G11340 59.801 301 116 3 31 329 503 800 1.74e-118 362
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MsG0180001732.01.T01 AT4G03230 58.974 312 119 5 31 339 678 983 2.01e-117 364
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MsG0180001732.01.T01 AT1G61430 57.947 302 124 3 31 331 454 753 1.63e-114 351
MsG0180001732.01.T01 AT4G23210 52.903 310 140 3 23 331 340 644 1.64e-114 348
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MsG0180001732.01.T01 AT1G67520 50.720 347 153 8 14 351 264 601 4.65e-112 340
MsG0180001732.01.T01 AT1G61430 57.377 305 124 4 31 331 477 779 4.87e-112 345
MsG0180001732.01.T01 AT4G27290 54.464 336 144 5 1 330 466 798 5.65e-112 345
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MsG0180001732.01.T01 AT1G61490 55.592 304 132 3 31 333 452 753 7.31e-112 344
MsG0180001732.01.T01 AT1G61490 55.592 304 132 3 31 333 478 779 1.32e-111 344
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MsG0180001732.01.T01 AT1G61490 55.592 304 132 3 31 333 478 779 1.32e-111 344
MsG0180001732.01.T01 AT1G61490 55.592 304 132 3 31 333 478 779 1.32e-111 344
MsG0180001732.01.T01 AT4G23130 67.521 234 74 1 13 246 316 547 2.12e-111 337
MsG0180001732.01.T01 AT1G61370 53.822 314 142 3 17 329 475 786 3.62e-111 343
MsG0180001732.01.T01 AT1G61390 56.579 304 127 3 31 333 508 807 5.47e-111 343
MsG0180001732.01.T01 AT1G11280 55.096 314 136 3 19 329 469 780 1.36e-110 341
MsG0180001732.01.T01 AT1G11280 55.096 314 136 3 19 329 479 790 1.41e-110 342
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MsG0180001732.01.T01 AT1G11280 55.096 314 136 3 19 329 491 802 2.30e-110 341
MsG0180001732.01.T01 AT1G61400 54.088 318 135 4 31 339 488 803 4.09e-110 340
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MsG0180001732.01.T01 AT1G61360 55.592 304 130 4 31 331 405 706 2.90e-108 333
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MsG0180001732.01.T01 AT1G61420 53.311 302 138 3 31 331 484 783 1.12e-105 328
MsG0180001732.01.T01 AT4G00970 64.286 252 83 4 14 260 313 562 3.82e-104 318
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MsG0180001732.01.T01 AT1G29730 44.518 301 165 2 31 330 628 927 8.27e-76 252
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MsG0180001732.01.T01 AT4G11900 61.340 194 69 1 16 209 516 703 1.11e-71 237
MsG0180001732.01.T01 AT4G11900 61.658 193 68 1 16 208 516 702 2.38e-71 236
MsG0180001732.01.T01 AT4G11900 61.658 193 68 1 16 208 516 702 2.38e-71 236
MsG0180001732.01.T01 AT4G23210 57.527 186 77 1 23 208 340 523 3.23e-71 231
MsG0180001732.01.T01 AT4G23210 57.527 186 77 1 23 208 340 523 3.23e-71 231
MsG0180001732.01.T01 AT1G11340 64.607 178 63 0 31 208 571 748 3.23e-71 236
MsG0180001732.01.T01 AT4G11900 61.658 193 68 1 16 208 516 702 4.31e-71 236
MsG0180001732.01.T01 AT4G23210 57.368 190 77 2 23 210 340 527 5.26e-71 231
MsG0180001732.01.T01 AT2G42960 42.612 291 159 5 31 317 171 457 5.33e-71 230
MsG0180001732.01.T01 AT2G42960 42.612 291 159 5 31 317 171 457 5.33e-71 230
MsG0180001732.01.T01 AT2G42960 42.612 291 159 5 31 317 171 457 5.33e-71 230
MsG0180001732.01.T01 AT2G42960 42.612 291 159 5 31 317 171 457 5.33e-71 230
MsG0180001732.01.T01 AT1G52290 49.765 213 105 2 31 243 131 341 1.40e-70 226
MsG0180001732.01.T01 AT1G70460 41.980 293 162 5 30 317 340 629 1.53e-70 234
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MsG0180001732.01.T01 AT4G34440 42.069 290 163 4 31 317 300 587 2.00e-70 233
MsG0180001732.01.T01 AT1G70530 52.511 219 103 1 28 246 308 525 2.38e-70 229
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MsG0180001732.01.T01 AT3G13690 41.237 291 166 5 31 319 399 686 4.49e-67 225
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MsG0180001732.01.T01 AT2G18470 38.621 290 173 4 31 317 272 559 3.37e-64 216
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MsG0180001732.01.T01 AT5G24080 38.411 302 178 6 29 327 391 687 6.61e-63 214
MsG0180001732.01.T01 AT3G53810 38.050 318 185 6 14 324 314 626 1.09e-62 212
MsG0180001732.01.T01 AT4G32710 49.302 215 102 3 31 241 377 588 1.17e-62 213
MsG0180001732.01.T01 AT2G28590 45.299 234 126 2 16 247 71 304 1.28e-62 203
MsG0180001732.01.T01 AT1G26150 47.887 213 109 2 31 243 418 628 1.42e-62 211
MsG0180001732.01.T01 AT1G01540 47.826 207 106 2 36 241 147 352 2.14e-62 204
MsG0180001732.01.T01 AT5G24080 38.411 302 178 6 29 327 518 814 2.81e-62 214
MsG0180001732.01.T01 AT4G02420 38.961 308 180 7 30 334 337 639 2.88e-62 211
MsG0180001732.01.T01 AT1G34210 38.235 306 182 6 20 320 282 585 4.00e-62 210
MsG0180001732.01.T01 AT1G34210 38.235 306 182 6 20 320 282 585 4.00e-62 210
MsG0180001732.01.T01 AT5G65600 40.968 310 164 7 30 326 337 640 5.03e-62 211
MsG0180001732.01.T01 AT5G07280 41.219 279 160 4 34 310 909 1185 1.03e-61 214
MsG0180001732.01.T01 AT5G10530 39.404 302 174 6 30 326 322 619 1.19e-61 209
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MsG0180001732.01.T01 AT5G01550 38.782 312 176 7 14 317 348 652 2.86e-61 209
MsG0180001732.01.T01 AT5G01560 40.594 303 166 6 21 317 341 635 3.21e-61 209
MsG0180001732.01.T01 AT3G02810 38.033 305 172 8 31 326 52 348 4.56e-61 206
MsG0180001732.01.T01 AT1G71830 37.582 306 184 6 20 320 279 582 5.01e-61 207
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MsG0180001732.01.T01 AT5G15730 38.776 294 164 6 21 311 92 372 5.60e-61 202
MsG0180001732.01.T01 AT3G25560 38.111 307 184 4 16 320 285 587 6.24e-61 207
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MsG0180001732.01.T01 AT3G25560 38.111 307 184 4 16 320 285 587 8.17e-61 207
MsG0180001732.01.T01 AT3G05140 38.127 299 174 7 28 322 127 418 9.54e-61 202
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MsG0180001732.01.T01 AT5G60300 40.065 307 176 6 30 335 331 630 9.94e-61 208
MsG0180001732.01.T01 AT5G03140 38.562 306 175 7 30 327 361 661 1.00e-60 207
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MsG0180001732.01.T01 AT5G15730 38.776 294 162 7 21 311 92 370 5.81e-60 199
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MsG0180001732.01.T01 AT5G42440 38.790 281 168 4 36 314 74 352 2.92e-59 196
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MsG0180001732.01.T01 AT5G11020 38.298 282 168 4 31 310 95 372 6.51e-59 196
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MsG0180001732.01.T01 AT2G13800 36.928 306 186 6 20 320 252 555 8.20e-59 201
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MsG0180001732.01.T01 AT3G45430 38.511 309 178 7 30 335 331 630 9.43e-59 202
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MsG0180001732.01.T01 AT1G66150 38.235 306 173 8 22 316 567 867 2.78e-58 203
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MsG0180001732.01.T01 AT2G23950 37.500 312 188 5 12 320 267 574 2.32e-56 194
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MsG0180001732.01.T01 AT5G53890 36.577 298 177 5 19 314 738 1025 3.77e-56 198
MsG0180001732.01.T01 AT4G17660 38.721 297 156 6 31 311 79 365 3.79e-56 188
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MsG0180001732.01.T01 AT1G66980 39.649 285 165 5 49 328 811 1093 4.63e-56 198
MsG0180001732.01.T01 AT1G15530 40.068 292 164 7 30 316 348 633 4.68e-56 194
MsG0180001732.01.T01 AT1G66980 39.649 285 165 5 49 328 838 1120 5.95e-56 197
MsG0180001732.01.T01 AT1G69790 37.459 307 172 8 18 310 47 347 6.29e-56 187
MsG0180001732.01.T01 AT2G39660 38.585 311 172 7 31 326 55 361 7.88e-56 188
MsG0180001732.01.T01 AT1G66980 39.649 285 165 5 49 328 840 1122 8.34e-56 197
MsG0180001732.01.T01 AT1G07570 38.776 294 163 7 31 310 56 346 1.07e-55 188
MsG0180001732.01.T01 AT1G07570 38.776 294 163 7 31 310 56 346 1.07e-55 188
MsG0180001732.01.T01 AT1G07570 38.776 294 163 7 31 310 56 346 1.07e-55 188
MsG0180001732.01.T01 AT4G00340 38.384 297 161 10 31 314 451 738 1.17e-55 195
MsG0180001732.01.T01 AT1G69790 37.459 307 172 8 18 310 58 358 1.19e-55 187
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MsG0180001732.01.T01 AT1G07570 38.776 294 163 7 31 310 67 357 1.68e-55 187
MsG0180001732.01.T01 AT1G69270 35.548 301 190 4 16 314 234 532 1.86e-55 190
MsG0180001732.01.T01 AT5G35370 37.143 315 172 8 30 324 504 812 1.89e-55 195
MsG0180001732.01.T01 AT3G46760 36.455 299 171 8 30 324 37 320 1.89e-55 185
MsG0180001732.01.T01 AT1G16130 37.545 277 170 3 39 314 412 686 1.96e-55 194
MsG0180001732.01.T01 AT5G63930 37.201 293 169 6 31 314 792 1078 3.33e-55 195
MsG0180001732.01.T01 AT5G63930 37.201 293 169 6 31 314 728 1014 3.66e-55 195
MsG0180001732.01.T01 AT4G29050 37.241 290 175 5 30 315 331 617 4.66e-55 192
MsG0180001732.01.T01 AT1G16260 32.727 330 201 4 5 315 325 652 5.55e-55 192
MsG0180001732.01.T01 AT4G39400 36.424 302 177 5 17 314 865 1155 6.53e-55 194
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MsG0180001732.01.T01 AT5G16000 35.599 309 191 4 16 320 285 589 6.82e-55 191
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MsG0180001732.01.T01 AT1G16260 32.727 330 201 4 5 315 334 661 7.47e-55 192
MsG0180001732.01.T01 AT1G16260 32.727 330 201 4 5 315 334 661 7.47e-55 192
MsG0180001732.01.T01 AT2G17220 38.832 291 165 6 31 310 74 362 7.80e-55 186
MsG0180001732.01.T01 AT2G17220 38.832 291 165 6 31 310 75 363 7.82e-55 186
MsG0180001732.01.T01 AT3G02130 36.027 297 182 5 18 311 832 1123 9.81e-55 194
MsG0180001732.01.T01 AT3G02130 36.027 297 182 5 18 311 849 1140 9.95e-55 194
MsG0180001732.01.T01 AT1G55610 37.931 290 174 3 30 314 846 1134 1.11e-54 194
MsG0180001732.01.T01 AT1G55610 37.931 290 174 3 30 314 846 1134 1.11e-54 194
MsG0180001732.01.T01 AT5G38990 35.312 320 195 6 3 314 485 800 1.61e-54 192
MsG0180001732.01.T01 AT3G28690 36.455 299 171 6 31 315 14 307 1.86e-54 184
MsG0180001732.01.T01 AT2G35620 38.112 286 168 5 34 317 296 574 1.94e-54 189
MsG0180001732.01.T01 AT2G35620 38.112 286 168 5 34 317 296 574 1.94e-54 189
MsG0180001732.01.T01 AT2G35620 38.112 286 168 5 34 317 296 574 1.94e-54 189
MsG0180001732.01.T01 AT2G35620 38.112 286 168 5 34 317 296 574 1.94e-54 189
MsG0180001732.01.T01 AT5G60270 36.455 299 180 6 29 324 327 618 1.96e-54 190
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MsG0180001732.01.T01 AT2G05940 37.755 294 171 7 31 315 75 365 2.48e-54 186
MsG0180001732.01.T01 AT2G28930 37.500 312 177 8 14 310 42 350 2.56e-54 184
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MsG0180001732.01.T01 AT2G43700 35.548 301 177 7 30 324 299 588 2.74e-54 189
MsG0180001732.01.T01 AT2G43700 35.548 301 177 7 30 324 299 588 2.74e-54 189
MsG0180001732.01.T01 AT2G43700 35.548 301 177 7 30 324 299 588 2.74e-54 189
MsG0180001732.01.T01 AT2G28930 37.500 312 177 8 14 310 39 347 3.14e-54 184
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MsG0180001732.01.T01 AT2G43690 37.374 297 168 8 30 318 324 610 4.13e-54 189
MsG0180001732.01.T01 AT1G52540 33.846 325 200 7 13 329 10 327 4.40e-54 182
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MsG0180001732.01.T01 AT1G74360 38.567 293 162 7 31 314 802 1085 5.98e-54 192

Find 66 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 120 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AGTCTTGATTTCTTCATATT+TGG 0.198632 1:-26171541 MsG0180001732.01.T01:intron
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AACCCAAAGATATCAGATTT+TGG 0.210582 1:-26170946 MsG0180001732.01.T01:CDS
AAACCAAAATCTGATATCTT+TGG 0.229630 1:+26170943 None:intergenic
TTCAATTGTGCTTTCCTTGT+TGG 0.248760 1:+26171096 None:intergenic
AAACTTGGACAAGGTGGATT+TGG 0.262545 1:-26171879 MsG0180001732.01.T01:CDS
TGTCATACATGAAAACTAAT+TGG 0.265418 1:-26172028 None:intergenic
TAATGTTGGTGCAACAAAAT+TGG 0.269374 1:-26169602 MsG0180001732.01.T01:CDS
AAGCGCTACAATATCATAAA+AGG 0.287703 1:-26171066 MsG0180001732.01.T01:CDS
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AAATCAGATGTCTATAGTTT+TGG 0.309605 1:-26170110 MsG0180001732.01.T01:CDS
AACCAAAATCTGATATCTTT+GGG 0.320045 1:+26170944 None:intergenic
TTGTCCAAGTTTATTTGAAT+TGG 0.321397 1:+26171890 None:intergenic
ACAGCAATCATTTGTCCATT+AGG 0.329216 1:+26171721 None:intergenic
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CTACTTGGTTTCAGTCTAGA+AGG 0.344601 1:-26171604 MsG0180001732.01.T01:CDS
TAGATTTCGATGTTGAAGTT+TGG 0.352532 1:+26171633 None:intergenic
GTGGATTTGGAATTGTTTAT+CGG 0.361563 1:-26171866 MsG0180001732.01.T01:CDS
ATTGGCATGCAGTGGATATA+TGG 0.379971 1:-26170168 MsG0180001732.01.T01:intron
TTCTCCAATTCAAATAAACT+TGG 0.397732 1:-26171894 MsG0180001732.01.T01:CDS
TCTTTCAGGCATGGAGAAGC+TGG 0.410472 1:-26169867 MsG0180001732.01.T01:intron
ATGGGAAAACATGATGATAA+AGG 0.417136 1:-26171987 MsG0180001732.01.T01:CDS
TTTCAGGGTAAAATGCCTAA+TGG 0.417807 1:-26171736 MsG0180001732.01.T01:intron
TTATAGGAAGTGGAACTAGA+AGG 0.430610 1:-26169651 MsG0180001732.01.T01:CDS
TTGGTTCTTGAGATTATTAG+TGG 0.433617 1:-26170083 MsG0180001732.01.T01:CDS
ACCAAAATCTACCGAGGGTA+TGG 0.433845 1:+26169547 None:intergenic
TTCAACATCGAAATCTAGTT+AGG 0.463247 1:-26171627 MsG0180001732.01.T01:CDS
CCACTTCCTATAAAATATGC+AGG 0.467201 1:+26169661 None:intergenic
TGGATTTGGAATTGTTTATC+GGG 0.467624 1:-26171865 MsG0180001732.01.T01:intron
AAGGAAAGCACAATTGAATT+GGG 0.471497 1:-26171091 MsG0180001732.01.T01:CDS
TCAATCTGAAGCTGCATATC+CGG 0.472134 1:+26169625 None:intergenic
CGTGAAGATAAAGAAGGCCT+CGG 0.476631 1:+26171037 None:intergenic
GACAAATGATTGCTGTCAAA+AGG 0.504175 1:-26171714 MsG0180001732.01.T01:CDS
TATTGCTTGCTTTGAGATCA+CGG 0.511107 1:+26170989 None:intergenic
GCATGGAGAAGCTGGACAGA+GGG 0.524079 1:-26169859 MsG0180001732.01.T01:CDS
ACATGATGATAAAGGTGAAG+AGG 0.555760 1:-26171979 MsG0180001732.01.T01:CDS
TCAAATAAACTTGGACAAGG+TGG 0.559516 1:-26171885 MsG0180001732.01.T01:CDS
CATCAGTGCAACGGAAGCCA+TGG 0.566953 1:+26169723 None:intergenic
GGAAGTACAAATAGAATCGT+CGG 0.571056 1:-26170889 MsG0180001732.01.T01:CDS
TACTTGGTTTCAGTCTAGAA+GGG 0.574825 1:-26171603 MsG0180001732.01.T01:CDS
TCTCCATGCATCGCATACTC+AGG 0.576996 1:+26170143 None:intergenic
CAGCTTCAGATTGATAATGT+TGG 0.579018 1:-26169616 MsG0180001732.01.T01:CDS
AAATTCTGACCAAGGAGATG+TGG 0.579514 1:-26171683 MsG0180001732.01.T01:CDS
AAGTGGAACTAGAAGGCTAC+CGG 0.582650 1:-26169644 MsG0180001732.01.T01:CDS
GTGAAGATAAAGAAGGCCTC+GGG 0.582787 1:+26171038 None:intergenic
TTTGTTGTTGGTCAAACGGA+AGG 0.587958 1:-26170910 MsG0180001732.01.T01:CDS
ATGGATCAGTAATTGAGACT+TGG 0.589077 1:+26169566 None:intergenic
GCACCTGAGTATGCGATGCA+TGG 0.600937 1:-26170146 MsG0180001732.01.T01:CDS
GTTATTGTGTGAAGCCAACA+TGG 0.605454 1:-26172006 MsG0180001732.01.T01:CDS
AGGCCTTCTTTATCTTCACG+AGG 0.605916 1:-26171034 MsG0180001732.01.T01:CDS
TTTAATGGATAGACCAACCA+TGG 0.605952 1:-26169740 MsG0180001732.01.T01:CDS
ACTATTAAGCATCAGTGCAA+CGG 0.606699 1:+26169714 None:intergenic
CAATTACTGATCCATACCCT+CGG 0.617284 1:-26169558 MsG0180001732.01.T01:CDS
GGCATGGAGAAGCTGGACAG+AGG 0.628404 1:-26169860 MsG0180001732.01.T01:CDS
AGTGCAACGGAAGCCATGGT+TGG 0.634397 1:+26169727 None:intergenic
ATCATAAAAGGCATTGCCCG+AGG 0.635170 1:-26171054 MsG0180001732.01.T01:CDS
AATCCTCGTGAAGATAAAGA+AGG 0.639077 1:+26171031 None:intergenic
ATAATGAGATGCATCCACAT+TGG 0.645215 1:-26169784 MsG0180001732.01.T01:CDS
CATGGAGAAGCTGGACAGAG+GGG 0.655044 1:-26169858 MsG0180001732.01.T01:CDS
AATTCAAATAAACTTGGACA+AGG 0.656573 1:-26171888 MsG0180001732.01.T01:CDS
TTGTCAACAAATTCTGACCA+AGG 0.665504 1:-26171691 MsG0180001732.01.T01:CDS
CTTATGACCAAAATCTACCG+AGG 0.671286 1:+26169541 None:intergenic
TTATGACCAAAATCTACCGA+GGG 0.676746 1:+26169542 None:intergenic
ATATATATGTAGATCCAACA+AGG 0.712579 1:-26171110 MsG0180001732.01.T01:intron
TTATTGTGTGAAGCCAACAT+GGG 0.730183 1:-26172005 MsG0180001732.01.T01:CDS
GAATACAGAGTAAACCAATG+TGG 0.730829 1:+26169770 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! ATTTTACTTTATTTTTTTGA+AGG - Chr1:26170799-26170818 MsG0180001732.01.T01:intron 10.0%
!! AAAAAACATTAATGTTGAAT+TGG - Chr1:26171099-26171118 MsG0180001732.01.T01:CDS 15.0%
!! ACTAAATATATCAAGATTTA+CGG + Chr1:26170726-26170745 None:intergenic 15.0%
!! CTTTACTTATTACTATTATT+AGG - Chr1:26170332-26170351 MsG0180001732.01.T01:intron 15.0%
!! TCATATAAAATCAATTTATG+TGG + Chr1:26170194-26170213 None:intergenic 15.0%
!!! TTATTATAAGTTTTTTTCGT+AGG - Chr1:26170914-26170933 MsG0180001732.01.T01:CDS 15.0%
!! AAGAATAATCAATAGTAAAC+AGG - Chr1:26171060-26171079 MsG0180001732.01.T01:CDS 20.0%
!! AAGATTGATATAAACTTGAT+TGG - Chr1:26170227-26170246 MsG0180001732.01.T01:intron 20.0%
!! ACATTATTGTAGTAATTGAT+TGG - Chr1:26171646-26171665 MsG0180001732.01.T01:CDS 20.0%
!! ACTAATTCAGTTCTTATATA+GGG + Chr1:26171337-26171356 None:intergenic 20.0%
!! TATCCTTTATTAATGTTATG+AGG - Chr1:26171009-26171028 MsG0180001732.01.T01:CDS 20.0%
!! TATTATTACTACGTACAATT+TGG + Chr1:26170157-26170176 None:intergenic 20.0%
!! TTACTATTATTAGGTATGAT+TGG - Chr1:26170341-26170360 MsG0180001732.01.T01:intron 20.0%
!!! AAGAAATCAAGACTTTTATT+TGG + Chr1:26170028-26170047 None:intergenic 20.0%
!!! TGATTTTATATGATTGTACT+AGG - Chr1:26170201-26170220 MsG0180001732.01.T01:intron 20.0%
!!! TTAATTTGAAATATCACAAC+AGG - Chr1:26171362-26171381 MsG0180001732.01.T01:intron 20.0%
! AAACACCAACTACTAAAATA+TGG - Chr1:26170417-26170436 MsG0180001732.01.T01:intron 25.0%
! AAACCAAAATCTGATATCTT+TGG + Chr1:26170635-26170654 None:intergenic 25.0%
! AACCAAAATCTGATATCTTT+GGG + Chr1:26170634-26170653 None:intergenic 25.0%
! AATTCAAATAAACTTGGACA+AGG - Chr1:26169687-26169706 MsG0180001732.01.T01:CDS 25.0%
! AGATATATGATTCACAATAC+CGG - Chr1:26169805-26169824 MsG0180001732.01.T01:CDS 25.0%
! AGTCTTGATTTCTTCATATT+TGG - Chr1:26170034-26170053 MsG0180001732.01.T01:CDS 25.0%
! ATATATATGTAGATCCAACA+AGG - Chr1:26170465-26170484 MsG0180001732.01.T01:intron 25.0%
! CACTAATTCAGTTCTTATAT+AGG + Chr1:26171338-26171357 None:intergenic 25.0%
! CAGATAACCAAATTAAGATA+TGG + Chr1:26171675-26171694 None:intergenic 25.0%
! CTGTATTCAAGAACATTTAA+TGG - Chr1:26171820-26171839 MsG0180001732.01.T01:intron 25.0%
! CTTCCTCATAACATTAATAA+AGG + Chr1:26171015-26171034 None:intergenic 25.0%
! TAATCAATAGTAAACAGGTA+TGG - Chr1:26171065-26171084 MsG0180001732.01.T01:CDS 25.0%
! TTCTCCAATTCAAATAAACT+TGG - Chr1:26169681-26169700 MsG0180001732.01.T01:CDS 25.0%
! TTGATTTCTTCATATTTGGT+AGG - Chr1:26170038-26170057 MsG0180001732.01.T01:CDS 25.0%
! TTGTCCAAGTTTATTTGAAT+TGG + Chr1:26169688-26169707 None:intergenic 25.0%
!! AAATCAGATGTCTATAGTTT+TGG - Chr1:26171465-26171484 MsG0180001732.01.T01:intron 25.0%
!! AATAGTGCAAACATTTTTCA+TGG - Chr1:26171522-26171541 MsG0180001732.01.T01:intron 25.0%
!! ATAGTGCAAACATTTTTCAT+GGG - Chr1:26171523-26171542 MsG0180001732.01.T01:intron 25.0%
!! TCAAAACCTGCATATTTTAT+AGG - Chr1:26171908-26171927 MsG0180001732.01.T01:CDS 25.0%
!!! AAAGATATCAGATTTTGGTT+TGG - Chr1:26170634-26170653 MsG0180001732.01.T01:intron 25.0%
!!! ATAAAATATGCAGGTTTTGA+AGG + Chr1:26171908-26171927 None:intergenic 25.0%
!!! ATAAGTTTTTTTCGTAGGTA+CGG - Chr1:26170919-26170938 MsG0180001732.01.T01:CDS 25.0%
!!! CAAAACCATATTTTAGTAGT+TGG + Chr1:26170425-26170444 None:intergenic 25.0%
AACTTGATTGGTATAGTAAC+CGG - Chr1:26170239-26170258 MsG0180001732.01.T01:intron 30.0%
AAGATTTACGGAAACTTACT+AGG + Chr1:26170714-26170733 None:intergenic 30.0%
AAGCGCTACAATATCATAAA+AGG - Chr1:26170509-26170528 MsG0180001732.01.T01:intron 30.0%
ATGGGAAAACATGATGATAA+AGG - Chr1:26169588-26169607 MsG0180001732.01.T01:CDS 30.0%
GACATAAACTAAAACACAGA+AGG - Chr1:26171168-26171187 MsG0180001732.01.T01:intron 30.0%
TAATGTTGGTGCAACAAAAT+TGG - Chr1:26171973-26171992 MsG0180001732.01.T01:CDS 30.0%
TACGAATTAAGCTTGTCTAT+TGG - Chr1:26171389-26171408 MsG0180001732.01.T01:intron 30.0%
TAGATTTCGATGTTGAAGTT+TGG + Chr1:26169945-26169964 None:intergenic 30.0%
TTCAACATCGAAATCTAGTT+AGG - Chr1:26169948-26169967 MsG0180001732.01.T01:intron 30.0%
! AACCCAAAGATATCAGATTT+TGG - Chr1:26170629-26170648 MsG0180001732.01.T01:intron 30.0%
! AAGGAAAGCACAATTGAATT+GGG - Chr1:26170484-26170503 MsG0180001732.01.T01:intron 30.0%
! CGCTAAAACTTGATAACAAT+TGG + Chr1:26170372-26170391 None:intergenic 30.0%
! GTGGATTTGGAATTGTTTAT+CGG - Chr1:26169709-26169728 MsG0180001732.01.T01:CDS 30.0%
! TAGTGCAAACATTTTTCATG+GGG - Chr1:26171524-26171543 MsG0180001732.01.T01:intron 30.0%
! TGGATTTGGAATTGTTTATC+GGG - Chr1:26169710-26169729 MsG0180001732.01.T01:CDS 30.0%
! TTGGTGACCATATCTTAATT+TGG - Chr1:26171665-26171684 MsG0180001732.01.T01:CDS 30.0%
! TTGGTTCTTGAGATTATTAG+TGG - Chr1:26171492-26171511 MsG0180001732.01.T01:intron 30.0%
!! CAATATGCTTTGAAATGGTT+GGG + Chr1:26171209-26171228 None:intergenic 30.0%
!! CATTGCAATATGCTTTGAAA+TGG + Chr1:26171214-26171233 None:intergenic 30.0%
!! TGAATGTTTGTAATTTGCTC+CGG + Chr1:26170261-26170280 None:intergenic 30.0%
!!! TGTCTATAGTTTTGGAGTAT+TGG - Chr1:26171473-26171492 MsG0180001732.01.T01:intron 30.0%
AATCCTCGTGAAGATAAAGA+AGG + Chr1:26170547-26170566 None:intergenic 35.0%
ACAGCAATCATTTGTCCATT+AGG + Chr1:26169857-26169876 None:intergenic 35.0%
ACATGATGATAAAGGTGAAG+AGG - Chr1:26169596-26169615 MsG0180001732.01.T01:CDS 35.0%
ACTATTAAGCATCAGTGCAA+CGG + Chr1:26171864-26171883 None:intergenic 35.0%
ATAATGAGATGCATCCACAT+TGG - Chr1:26171791-26171810 MsG0180001732.01.T01:intron 35.0%
ATGGATCAGTAATTGAGACT+TGG + Chr1:26172012-26172031 None:intergenic 35.0%
CCACTTCCTATAAAATATGC+AGG + Chr1:26171917-26171936 None:intergenic 35.0%
GAATACAGAGTAAACCAATG+TGG + Chr1:26171808-26171827 None:intergenic 35.0%
GACAAATGATTGCTGTCAAA+AGG - Chr1:26169861-26169880 MsG0180001732.01.T01:CDS 35.0%
TACTTGGTTTCAGTCTAGAA+GGG - Chr1:26169972-26169991 MsG0180001732.01.T01:intron 35.0%
TCAAATAAACTTGGACAAGG+TGG - Chr1:26169690-26169709 MsG0180001732.01.T01:CDS 35.0%
TTATAGGAAGTGGAACTAGA+AGG - Chr1:26171924-26171943 MsG0180001732.01.T01:CDS 35.0%
TTATTGTGTGAAGCCAACAT+GGG - Chr1:26169570-26169589 MsG0180001732.01.T01:CDS 35.0%
TTCAATTGTGCTTTCCTTGT+TGG + Chr1:26170482-26170501 None:intergenic 35.0%
TTGTCAACAAATTCTGACCA+AGG - Chr1:26169884-26169903 MsG0180001732.01.T01:intron 35.0%
TTTACCCTGAAAACATTCCA+CGG + Chr1:26169831-26169850 None:intergenic 35.0%
TTTCAGGGTAAAATGCCTAA+TGG - Chr1:26169839-26169858 MsG0180001732.01.T01:CDS 35.0%
! ATCATCATGTTTTCCCATGT+TGG + Chr1:26169586-26169605 None:intergenic 35.0%
! CAAGGAAAGCACAATTGAAT+TGG - Chr1:26170483-26170502 MsG0180001732.01.T01:intron 35.0%
! CCTGCATATTTTATAGGAAG+TGG - Chr1:26171914-26171933 MsG0180001732.01.T01:CDS 35.0%
! GGAAGTACAAATAGAATCGT+CGG - Chr1:26170686-26170705 MsG0180001732.01.T01:intron 35.0%
! TTTAATGGATAGACCAACCA+TGG - Chr1:26171835-26171854 MsG0180001732.01.T01:intron 35.0%
! TTTTGAATTCCACATCTCCT+TGG + Chr1:26169904-26169923 None:intergenic 35.0%
!! CAGCTTCAGATTGATAATGT+TGG - Chr1:26171959-26171978 MsG0180001732.01.T01:CDS 35.0%
!! GCAATATGCTTTGAAATGGT+TGG + Chr1:26171210-26171229 None:intergenic 35.0%
!! TATTGCTTGCTTTGAGATCA+CGG + Chr1:26170589-26170608 None:intergenic 35.0%
!!! ACGTTTTGTTGTTGGTCAAA+CGG - Chr1:26170661-26170680 MsG0180001732.01.T01:intron 35.0%
AAATTCTGACCAAGGAGATG+TGG - Chr1:26169892-26169911 MsG0180001732.01.T01:intron 40.0%
ATTGGCATGCAGTGGATATA+TGG - Chr1:26171407-26171426 MsG0180001732.01.T01:intron 40.0%
CAATTACTGATCCATACCCT+CGG - Chr1:26172017-26172036 MsG0180001732.01.T01:CDS 40.0%
CGAAATCTAGTTAGGCTACT+TGG - Chr1:26169956-26169975 MsG0180001732.01.T01:intron 40.0%
CTACTTGGTTTCAGTCTAGA+AGG - Chr1:26169971-26169990 MsG0180001732.01.T01:intron 40.0%
GCATTTGCGCAAATTCTTTC+AGG - Chr1:26171694-26171713 MsG0180001732.01.T01:CDS 40.0%
GTTATTGTGTGAAGCCAACA+TGG - Chr1:26169569-26169588 MsG0180001732.01.T01:CDS 40.0%
! AAACTTGGACAAGGTGGATT+TGG - Chr1:26169696-26169715 MsG0180001732.01.T01:CDS 40.0%
! CATTTTTCATGGGGAGGATA+TGG - Chr1:26171533-26171552 MsG0180001732.01.T01:intron 40.0%
! TCAATCTGAAGCTGCATATC+CGG + Chr1:26171953-26171972 None:intergenic 40.0%
! TGCAAACATTTTTCATGGGG+AGG - Chr1:26171527-26171546 MsG0180001732.01.T01:intron 40.0%
! TGCGATGCATGGAGAATTTT+CGG - Chr1:26171440-26171459 MsG0180001732.01.T01:intron 40.0%
!! TTGGCAAGACGTTTTGTTGT+TGG - Chr1:26170653-26170672 MsG0180001732.01.T01:intron 40.0%
!! TTTGTTGTTGGTCAAACGGA+AGG - Chr1:26170665-26170684 MsG0180001732.01.T01:intron 40.0%
AAGTGGAACTAGAAGGCTAC+CGG - Chr1:26171931-26171950 MsG0180001732.01.T01:CDS 45.0%
AGGCCTTCTTTATCTTCACG+AGG - Chr1:26170541-26170560 MsG0180001732.01.T01:intron 45.0%
CGTGAAGATAAAGAAGGCCT+CGG + Chr1:26170541-26170560 None:intergenic 45.0%
GTGAAGATAAAGAAGGCCTC+GGG + Chr1:26170540-26170559 None:intergenic 45.0%
TGCGCAAATTCTTTCAGGCA+TGG - Chr1:26171699-26171718 MsG0180001732.01.T01:CDS 45.0%
!! ATCATAAAAGGCATTGCCCG+AGG - Chr1:26170521-26170540 MsG0180001732.01.T01:intron 45.0%
ATGATTCACAATACCGGCCG+TGG - Chr1:26169811-26169830 MsG0180001732.01.T01:CDS 50.0%
GCTTGTCTATTGGCATGCAG+TGG - Chr1:26171399-26171418 MsG0180001732.01.T01:intron 50.0%
TCTCCATGCATCGCATACTC+AGG + Chr1:26171435-26171454 None:intergenic 50.0%
TCTTTCAGGCATGGAGAAGC+TGG - Chr1:26171708-26171727 MsG0180001732.01.T01:CDS 50.0%
AGTGCAACGGAAGCCATGGT+TGG + Chr1:26171851-26171870 None:intergenic 55.0%
CATCAGTGCAACGGAAGCCA+TGG + Chr1:26171855-26171874 None:intergenic 55.0%
CATGGAGAAGCTGGACAGAG+GGG - Chr1:26171717-26171736 MsG0180001732.01.T01:CDS 55.0%
CCCTGAAAACATTCCACGGC+CGG + Chr1:26169827-26169846 None:intergenic 55.0%
GCACCTGAGTATGCGATGCA+TGG - Chr1:26171429-26171448 MsG0180001732.01.T01:intron 55.0%
GCATGGAGAAGCTGGACAGA+GGG - Chr1:26171716-26171735 MsG0180001732.01.T01:CDS 55.0%
! ACCGGCCGTGGAATGTTTTC+AGG - Chr1:26169823-26169842 MsG0180001732.01.T01:CDS 55.0%
! CCGGCCGTGGAATGTTTTCA+GGG - Chr1:26169824-26169843 MsG0180001732.01.T01:CDS 55.0%
GGCATGGAGAAGCTGGACAG+AGG - Chr1:26171715-26171734 MsG0180001732.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 26169555 26172042 26169555 ID=MsG0180001732.01;Name=MsG0180001732.01
Chr1 mRNA 26169555 26172042 26169555 ID=MsG0180001732.01.T01;Parent=MsG0180001732.01;Name=MsG0180001732.01.T01;_AED=0.45;_eAED=0.45;_QI=0|0|0|1|1|0.8|5|0|368
Chr1 exon 26171866 26172042 26171866 ID=MsG0180001732.01.T01:exon:41045;Parent=MsG0180001732.01.T01
Chr1 exon 26171542 26171752 26171542 ID=MsG0180001732.01.T01:exon:41044;Parent=MsG0180001732.01.T01
Chr1 exon 26170883 26171120 26170883 ID=MsG0180001732.01.T01:exon:41043;Parent=MsG0180001732.01.T01
Chr1 exon 26170025 26170178 26170025 ID=MsG0180001732.01.T01:exon:41042;Parent=MsG0180001732.01.T01
Chr1 exon 26169555 26169881 26169555 ID=MsG0180001732.01.T01:exon:41041;Parent=MsG0180001732.01.T01
Chr1 CDS 26171866 26172042 26171866 ID=MsG0180001732.01.T01:cds;Parent=MsG0180001732.01.T01
Chr1 CDS 26171542 26171752 26171542 ID=MsG0180001732.01.T01:cds;Parent=MsG0180001732.01.T01
Chr1 CDS 26170883 26171120 26170883 ID=MsG0180001732.01.T01:cds;Parent=MsG0180001732.01.T01
Chr1 CDS 26170025 26170178 26170025 ID=MsG0180001732.01.T01:cds;Parent=MsG0180001732.01.T01
Chr1 CDS 26169555 26169881 26169555 ID=MsG0180001732.01.T01:cds;Parent=MsG0180001732.01.T01
Gene Sequence

>MsG0180001732.01.T01

ATGAAAACTAATTGGTTATTGTGTGAAGCCAACATGGGAAAACATGATGATAAAGGTGAAGAGGAAATGACTATTGCTGAGTCATTGCAATTTAACTTTGATATCATACGAGTTGCTACAAGTGATTTCTCCAATTCAAATAAACTTGGACAAGGTGGATTTGGAATTGTTTATCGGGGTAAAATGCCTAATGGACAAATGATTGCTGTCAAAAGGTTGTCAACAAATTCTGACCAAGGAGATGTGGAATTCAAAAATGAAGTACTTTTAGTAGCCAAACTTCAACATCGAAATCTAGTTAGGCTACTTGGTTTCAGTCTAGAAGGGAGAGAAAGATTACTTATTTATGAATTTGTTCCAAATAAAAGTCTTGATTTCTTCATATTTGATCCAACAAGGAAAGCACAATTGAATTGGGAAAAGCGCTACAATATCATAAAAGGCATTGCCCGAGGCCTTCTTTATCTTCACGAGGATTCTCGCTTGCGCATTATACACCGTGATCTCAAAGCAAGCAATATTCTCTTAGATGACGAAATGAACCCAAAGATATCAGATTTTGGTTTGGCAAGACGTTTTGTTGTTGGTCAAACGGAAGGAAGTACAAATAGAATCGTCGGAACCTATGGATATATGGCACCTGAGTATGCGATGCATGGAGAATTTTCGGTGAAATCAGATGTCTATAGTTTTGGAGTATTGGTTCTTGAGATTATTAGTGGTCATAAAAATAGTGCAAACATTTTTCATGGGGAGGATATGGAGTATCTATTGAGCTATGCATGGAGAAGCTGGACAGAGGGGAGAGCAAATGAGATTATAGATTCGTCGTTAAACAACATTTCACAAAATGAAATAATGAGATGCATCCACATTGGTTTACTCTGTATTCAAGAACATTTAATGGATAGACCAACCATGGCTTCCGTTGCACTGATGCTTAATAGTGATTCTATTGCTCTTTCATTACCTTCAAAACCTGCATATTTTATAGGAAGTGGAACTAGAAGGCTACCGGATATGCAGCTTCAGATTGATAATGTTGGTGCAACAAAATTGGATGAATCGATGAACCAAGTCTCAATTACTGATCCATACCCTCGGTAG
Protein sequence

>MsG0180001732.01.T01

MKTNWLLCEANMGKHDDKGEEEMTIAESLQFNFDIIRVATSDFSNSNKLGQGGFGIVYRGKMPNGQMIAVKRLSTNSDQGDVEFKNEVLLVAKLQHRNLVRLLGFSLEGRERLLIYEFVPNKSLDFFIFDPTRKAQLNWEKRYNIIKGIARGLLYLHEDSRLRIIHRDLKASNILLDDEMNPKISDFGLARRFVVGQTEGSTNRIVGTYGYMAPEYAMHGEFSVKSDVYSFGVLVLEIISGHKNSANIFHGEDMEYLLSYAWRSWTEGRANEIIDSSLNNISQNEIMRCIHIGLLCIQEHLMDRPTMASVALMLNSDSIALSLPSKPAYFIGSGTRRLPDMQLQIDNVGATKLDESMNQVSITDPYPR*