AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180005370.01

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MsG0180005370.01.T01 AT1G07880 38.916 203 116 4 196 394 39 237 1.43e-41 152
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MsG0180005370.01.T01 AT1G06390 33.333 297 170 9 196 482 76 354 3.42e-41 155
MsG0180005370.01.T01 AT1G01560 33.225 307 168 7 196 487 46 330 3.83e-41 153
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MsG0180005370.01.T01 AT5G14640 33.016 315 179 10 178 482 66 358 6.30e-41 154
MsG0180005370.01.T01 AT2G42880 33.518 361 191 12 196 539 31 359 2.09e-40 154
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MsG0180005370.01.T01 AT3G18040 32.181 376 217 12 196 559 24 373 6.70e-40 154
MsG0180005370.01.T01 AT5G19010 31.481 378 217 13 196 559 31 380 9.64e-40 154
MsG0180005370.01.T01 AT2G30980 32.381 315 181 10 178 482 64 356 1.08e-39 151
MsG0180005370.01.T01 AT2G42880 33.518 361 191 12 196 539 31 359 1.12e-39 154
MsG0180005370.01.T01 AT3G05840 32.063 315 182 10 178 482 65 357 1.50e-39 150
MsG0180005370.01.T01 AT3G05840 32.063 315 182 10 178 482 65 357 1.50e-39 150
MsG0180005370.01.T01 AT5G26751 32.063 315 182 10 178 482 61 353 1.87e-39 150
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MsG0180005370.01.T01 AT3G18040 32.181 376 217 12 196 559 138 487 3.51e-39 154
MsG0180005370.01.T01 AT1G01560 37.611 226 129 5 196 412 46 268 7.47e-39 145
MsG0180005370.01.T01 AT1G01560 37.611 226 129 5 196 412 46 268 7.47e-39 145
MsG0180005370.01.T01 AT1G18150 32.979 376 214 11 196 559 110 459 9.76e-39 151
MsG0180005370.01.T01 AT1G18150 32.979 376 214 11 196 559 110 459 9.76e-39 151
MsG0180005370.01.T01 AT1G18150 32.979 376 214 11 196 559 110 459 9.76e-39 151
MsG0180005370.01.T01 AT2G01450 34.768 302 166 9 196 482 22 307 3.48e-38 148
MsG0180005370.01.T01 AT2G01450 34.768 302 166 9 196 482 22 307 3.48e-38 148
MsG0180005370.01.T01 AT2G01450 34.768 302 166 9 196 482 22 307 3.48e-38 148
MsG0180005370.01.T01 AT2G01450 34.768 302 166 9 196 482 22 307 3.48e-38 148
MsG0180005370.01.T01 AT3G14720 35.082 305 168 10 193 482 27 316 5.14e-38 146
MsG0180005370.01.T01 AT3G14720 35.082 305 168 10 193 482 27 316 5.14e-38 146
MsG0180005370.01.T01 AT4G19110 34.538 249 131 7 244 482 1 227 5.39e-38 146
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MsG0180005370.01.T01 AT1G53510 33.721 344 186 13 193 522 27 342 1.23e-37 149
MsG0180005370.01.T01 AT3G61160 30.341 323 196 9 170 482 83 386 1.27e-37 145
MsG0180005370.01.T01 AT3G14720 34.615 312 160 12 193 482 27 316 2.16e-37 147
MsG0180005370.01.T01 AT4G00720 28.922 408 252 13 90 482 38 422 2.42e-37 145
MsG0180005370.01.T01 AT4G18710 35.565 239 128 7 196 426 40 260 5.37e-37 139
MsG0180005370.01.T01 AT3G61160 30.000 320 195 9 170 479 83 383 2.13e-36 141
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MsG0180005370.01.T01 AT3G61160 33.475 236 131 7 196 423 115 332 1.10e-34 135
MsG0180005370.01.T01 AT1G09840 33.730 252 145 8 241 482 1 240 1.81e-33 130
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MsG0180005370.01.T01 AT5G66850 35.468 203 119 5 196 389 352 551 5.82e-32 132
MsG0180005370.01.T01 AT1G53570 32.995 197 125 5 196 389 220 412 1.23e-29 124
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MsG0180005370.01.T01 AT1G53570 32.995 197 125 5 196 389 220 412 1.29e-29 124
MsG0180005370.01.T01 AT1G53570 32.995 197 125 5 196 389 220 412 1.84e-29 124
MsG0180005370.01.T01 AT1G53570 32.995 197 125 5 196 389 220 412 1.90e-29 124
MsG0180005370.01.T01 AT1G53570 32.995 197 125 5 196 389 220 412 1.90e-29 124
MsG0180005370.01.T01 AT1G53570 32.995 197 125 5 196 389 220 412 1.93e-29 124
MsG0180005370.01.T01 AT3G18040 32.063 315 178 11 255 559 2 290 2.70e-29 121
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MsG0180005370.01.T01 AT1G63700 31.731 208 126 6 196 391 406 609 3.44e-29 124
MsG0180005370.01.T01 AT3G06030 28.283 297 161 9 196 481 74 329 9.88e-29 122
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MsG0180005370.01.T01 AT3G07980 33.498 203 125 6 192 389 20 217 1.06e-27 120
MsG0180005370.01.T01 AT1G54960 29.961 257 146 10 145 387 33 269 1.07e-27 119
MsG0180005370.01.T01 AT1G54960 29.961 257 146 10 145 387 33 269 1.07e-27 119
MsG0180005370.01.T01 AT5G10930 30.464 302 158 11 196 488 18 276 1.48e-27 116
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MsG0180005370.01.T01 AT5G35410 34.043 235 133 11 196 414 17 245 9.59e-27 113
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MsG0180005370.01.T01 AT1G09000 32.500 200 123 7 196 387 75 270 1.26e-26 115
MsG0180005370.01.T01 AT3G08720 34.500 200 123 6 196 393 146 339 1.54e-26 114
MsG0180005370.01.T01 AT3G08720 34.500 200 123 6 196 393 146 339 1.54e-26 114
MsG0180005370.01.T01 AT3G08720 34.500 200 123 6 196 393 146 339 1.54e-26 114
MsG0180005370.01.T01 AT3G08720 34.500 200 123 6 196 393 146 339 1.54e-26 114
MsG0180005370.01.T01 AT5G35410 34.043 235 133 11 196 414 17 245 2.36e-26 113
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MsG0180005370.01.T01 AT2G25090 33.333 204 122 5 196 388 21 221 4.18e-26 112
MsG0180005370.01.T01 AT4G08470 34.518 197 117 6 196 387 309 498 4.26e-26 113
MsG0180005370.01.T01 AT1G30270 35.025 197 118 6 196 387 37 228 7.14e-26 112
MsG0180005370.01.T01 AT1G30270 35.025 197 118 6 196 387 37 228 8.39e-26 111
MsG0180005370.01.T01 AT5G67380 29.588 267 160 10 229 482 111 362 9.04e-26 110
MsG0180005370.01.T01 AT1G01140 30.909 220 138 6 196 404 25 241 1.02e-25 111
MsG0180005370.01.T01 AT1G01140 32.821 195 125 5 196 387 25 216 1.55e-25 110
MsG0180005370.01.T01 AT1G01140 32.821 195 125 5 196 387 25 216 1.80e-25 110
MsG0180005370.01.T01 AT3G08730 33.500 200 125 6 196 393 140 333 2.17e-25 110
MsG0180005370.01.T01 AT3G08730 33.500 200 125 6 196 393 140 333 2.17e-25 110
MsG0180005370.01.T01 AT2G32510 32.828 198 120 5 196 389 9 197 2.27e-25 108
MsG0180005370.01.T01 AT5G45820 35.533 197 118 7 196 388 18 209 3.43e-25 109
MsG0180005370.01.T01 AT4G08500 34.010 197 118 6 196 387 339 528 6.56e-25 110
MsG0180005370.01.T01 AT2G23070 27.063 303 190 10 193 483 135 418 7.26e-25 108
MsG0180005370.01.T01 AT5G21326 28.049 328 183 10 196 510 19 306 7.55e-25 108
MsG0180005370.01.T01 AT4G08470 33.503 197 119 6 196 387 227 416 9.26e-25 108
MsG0180005370.01.T01 AT4G18700 33.846 195 122 5 196 387 32 222 9.36e-25 108
MsG0180005370.01.T01 AT4G12020 32.195 205 108 8 196 387 1624 1810 1.12e-24 110
MsG0180005370.01.T01 AT4G12020 32.195 205 108 8 196 387 1632 1818 1.13e-24 110
MsG0180005370.01.T01 AT1G05100 32.836 201 117 6 196 387 9 200 1.25e-24 105
MsG0180005370.01.T01 AT2G23080 26.821 302 190 8 193 482 37 319 1.33e-24 105
MsG0180005370.01.T01 AT4G12020 32.195 205 108 8 196 387 1557 1743 1.37e-24 110
MsG0180005370.01.T01 AT3G50000 29.043 303 182 11 193 482 107 389 2.14e-24 106
MsG0180005370.01.T01 AT4G30960 33.846 195 122 5 196 387 30 220 2.84e-24 106
MsG0180005370.01.T01 AT5G01810 35.354 198 115 6 196 387 18 208 3.16e-24 106
MsG0180005370.01.T01 AT5G01810 35.354 198 115 6 196 387 18 208 3.16e-24 106
MsG0180005370.01.T01 AT5G01810 35.354 198 115 6 196 387 18 208 3.37e-24 105
MsG0180005370.01.T01 AT3G25840 28.614 332 193 14 184 482 612 932 3.63e-24 108
MsG0180005370.01.T01 AT2G38490 36.316 190 112 5 196 381 34 218 3.86e-24 106
MsG0180005370.01.T01 AT3G25840 28.614 332 193 14 184 482 350 670 4.67e-24 107
MsG0180005370.01.T01 AT5G67380 28.713 303 183 11 193 482 113 395 5.79e-24 105
MsG0180005370.01.T01 AT3G53640 29.248 359 204 16 160 482 295 639 1.01e-23 106
MsG0180005370.01.T01 AT5G04510 32.273 220 126 8 197 401 51 262 1.77e-23 102
MsG0180005370.01.T01 AT2G26980 33.333 198 120 6 196 387 20 211 3.88e-23 100
MsG0180005370.01.T01 AT2G26980 32.821 195 125 5 196 387 20 211 3.96e-23 102
MsG0180005370.01.T01 AT4G08480 31.795 195 121 6 198 387 509 696 4.72e-23 105
MsG0180005370.01.T01 AT5G57630 29.592 196 130 5 196 389 18 207 4.91e-23 102
MsG0180005370.01.T01 AT2G26980 31.250 224 145 6 167 387 4 221 5.02e-23 103
MsG0180005370.01.T01 AT5G57630 29.592 196 130 5 196 389 18 207 5.06e-23 102
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MsG0180005370.01.T01 AT1G53165 26.937 271 177 7 196 452 21 284 9.56e-23 103
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MsG0180005370.01.T01 AT5G21222 33.838 198 119 6 196 387 19 210 2.35e-21 99.8
MsG0180005370.01.T01 AT5G21222 33.838 198 119 6 196 387 19 210 2.35e-21 99.8
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MsG0180005370.01.T01 AT2G43700 33.333 207 125 9 196 395 316 516 4.22e-19 92.0
MsG0180005370.01.T01 AT2G43700 33.333 207 125 9 196 395 316 516 4.22e-19 92.0
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MsG0180005370.01.T01 AT1G54510 28.718 195 133 4 192 384 6 196 4.90e-19 91.7
MsG0180005370.01.T01 AT1G54510 28.718 195 133 4 192 384 6 196 4.90e-19 91.7
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MsG0180005370.01.T01 AT4G18950 28.295 258 158 12 135 387 118 353 2.35e-18 89.0
MsG0180005370.01.T01 AT5G35980 30.493 223 132 8 192 401 122 334 3.10e-18 89.7
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MsG0180005370.01.T01 AT3G04810 24.828 290 176 7 195 482 9 258 4.39e-18 89.0
MsG0180005370.01.T01 AT4G36070 30.693 202 126 8 186 380 68 262 4.46e-18 88.6
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MsG0180005370.01.T01 AT3G29160 30.928 194 127 5 196 387 26 214 5.25e-18 88.2
MsG0180005370.01.T01 AT5G04870 25.743 303 177 12 195 490 155 416 5.28e-18 88.6
MsG0180005370.01.T01 AT5G55090 28.358 201 128 7 196 392 12 200 5.78e-18 87.4
MsG0180005370.01.T01 AT4G12020 30.337 178 96 7 196 363 1632 1791 6.73e-18 89.0
MsG0180005370.01.T01 AT4G12020 30.337 178 96 7 196 363 1632 1791 6.73e-18 89.0
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MsG0180005370.01.T01 AT3G63280 29.167 192 130 4 195 384 9 196 7.63e-17 84.7
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MsG0180005370.01.T01 AT1G48490 28.182 220 128 6 196 389 834 1049 1.65e-16 84.3
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MsG0180005370.01.T01 AT4G04710 28.155 206 129 7 195 389 41 238 8.46e-16 80.9
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MsG0180005370.01.T01 AT1G79640 24.161 298 186 7 189 482 13 274 8.95e-16 81.6
MsG0180005370.01.T01 AT5G49470 32.292 192 116 6 195 377 470 656 9.67e-16 81.6
MsG0180005370.01.T01 AT2G20470 28.333 240 122 10 193 389 127 359 9.95e-16 81.3
MsG0180005370.01.T01 AT2G20470 28.333 240 122 10 193 389 127 359 9.95e-16 81.3
MsG0180005370.01.T01 AT1G79640 24.161 298 186 7 189 482 13 274 1.01e-15 81.3
MsG0180005370.01.T01 AT1G79640 24.161 298 186 7 189 482 13 274 1.01e-15 81.3
MsG0180005370.01.T01 AT1G79640 24.161 298 186 7 189 482 13 274 1.01e-15 81.3
MsG0180005370.01.T01 AT1G79640 24.161 298 186 8 189 482 16 277 1.01e-15 81.3
MsG0180005370.01.T01 AT1G79640 24.161 298 186 8 189 482 13 274 1.05e-15 81.3
MsG0180005370.01.T01 AT5G49470 32.292 192 116 6 195 377 496 682 1.07e-15 81.6
MsG0180005370.01.T01 AT5G49470 32.292 192 116 6 195 377 496 682 1.10e-15 81.3
MsG0180005370.01.T01 AT2G20470 28.333 240 122 10 193 389 127 359 1.13e-15 80.9
MsG0180005370.01.T01 AT3G22420 27.178 287 182 8 119 384 9 289 1.17e-15 81.3
MsG0180005370.01.T01 AT1G29750 29.386 228 143 9 195 411 686 906 1.25e-15 81.6
MsG0180005370.01.T01 AT4G23230 29.500 200 128 8 195 387 342 535 1.26e-15 80.9
MsG0180005370.01.T01 AT5G10520 29.082 196 126 8 196 384 159 348 1.31e-15 79.7
MsG0180005370.01.T01 AT5G49470 32.292 192 116 6 195 377 496 682 1.32e-15 81.3
MsG0180005370.01.T01 AT4G04960 30.660 212 133 8 196 398 353 559 1.37e-15 80.9
MsG0180005370.01.T01 AT1G29750 29.386 228 143 9 195 411 671 891 1.41e-15 81.3
MsG0180005370.01.T01 AT5G49470 32.292 192 116 6 195 377 369 555 1.44e-15 80.9
MsG0180005370.01.T01 AT3G05140 30.093 216 129 11 196 400 197 401 1.65e-15 80.1
MsG0180005370.01.T01 AT4G04960 30.660 212 133 8 196 398 353 559 1.65e-15 80.5
MsG0180005370.01.T01 AT2G17290 28.500 200 132 6 195 389 90 283 1.72e-15 80.5
MsG0180005370.01.T01 AT2G17290 28.500 200 132 6 195 389 90 283 1.72e-15 80.5
MsG0180005370.01.T01 AT3G20410 27.536 207 139 6 195 396 96 296 1.73e-15 80.5
MsG0180005370.01.T01 AT3G20410 27.536 207 139 6 195 396 96 296 1.73e-15 80.5
MsG0180005370.01.T01 AT3G23310 25.820 244 127 8 193 389 123 359 1.81e-15 80.5
MsG0180005370.01.T01 AT1G49160 27.723 202 134 6 189 384 27 222 1.88e-15 80.1
MsG0180005370.01.T01 AT5G35960 29.798 198 126 8 196 387 140 330 1.93e-15 79.3
MsG0180005370.01.T01 AT1G29730 30.303 198 127 6 195 387 678 869 2.00e-15 80.9
MsG0180005370.01.T01 AT4G23160 30.000 200 127 9 195 387 364 557 2.01e-15 80.5
MsG0180005370.01.T01 AT3G53810 31.000 200 122 7 196 387 353 544 2.07e-15 80.5
MsG0180005370.01.T01 AT3G05140 30.093 216 129 11 196 400 149 353 2.08e-15 79.7
MsG0180005370.01.T01 AT4G00970 30.348 201 127 9 195 387 349 544 2.30e-15 80.1
MsG0180005370.01.T01 AT5G16500 29.832 238 146 11 162 387 47 275 2.32e-15 80.1
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MsG0180005370.01.T01 AT2G40860 28.667 300 169 10 196 477 36 308 2.44e-15 80.1
MsG0180005370.01.T01 AT5G35960 29.798 198 126 8 196 387 140 330 2.47e-15 79.3
MsG0180005370.01.T01 AT3G51850 27.053 207 134 9 192 389 54 252 2.48e-15 79.0
MsG0180005370.01.T01 AT2G43850 25.194 258 164 10 158 406 178 415 2.53e-15 79.7
MsG0180005370.01.T01 AT1G29730 30.303 198 127 6 195 387 678 869 2.54e-15 80.5
MsG0180005370.01.T01 AT4G28980 36.709 158 80 6 189 336 21 168 2.60e-15 79.3
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MsG0180005370.01.T01 AT4G28980 36.709 158 80 6 189 336 21 168 2.60e-15 79.3
MsG0180005370.01.T01 AT4G28980 31.765 170 96 5 347 508 289 446 1.55e-14 77.0
MsG0180005370.01.T01 AT4G28980 36.709 158 80 6 189 336 21 168 2.60e-15 79.3
MsG0180005370.01.T01 AT4G28980 31.765 170 96 5 347 508 289 446 1.55e-14 77.0
MsG0180005370.01.T01 AT2G43850 25.194 258 164 10 158 406 178 415 2.63e-15 79.3
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MsG0180005370.01.T01 AT1G03920 25.311 241 129 7 193 389 140 373 2.77e-15 79.7
MsG0180005370.01.T01 AT1G03920 25.311 241 129 7 193 389 27 260 2.77e-15 79.3
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MsG0180005370.01.T01 AT4G04740 31.282 195 113 9 205 389 84 267 2.87e-15 79.7
MsG0180005370.01.T01 AT4G04740 31.282 195 113 9 205 389 84 267 2.87e-15 79.7
MsG0180005370.01.T01 AT4G04740 31.282 195 113 9 205 389 84 267 2.87e-15 79.7
MsG0180005370.01.T01 AT4G04740 31.282 195 113 9 205 389 84 267 2.87e-15 79.7
MsG0180005370.01.T01 AT4G04740 31.282 195 113 9 205 389 84 267 2.87e-15 79.7
MsG0180005370.01.T01 AT4G04490 30.734 218 136 10 179 387 327 538 3.19e-15 79.7
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MsG0180005370.01.T01 AT2G43850 24.806 258 165 10 158 406 178 415 3.49e-15 79.0
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MsG0180005370.01.T01 AT4G29050 31.034 203 129 7 196 392 364 561 3.57e-15 79.7
MsG0180005370.01.T01 AT4G29050 31.034 203 129 7 196 392 350 547 3.63e-15 79.7
MsG0180005370.01.T01 AT1G50700 26.570 207 141 6 195 396 78 278 3.68e-15 79.0
MsG0180005370.01.T01 AT4G11460 31.500 200 124 9 195 387 276 469 3.68e-15 79.7
MsG0180005370.01.T01 AT3G06640 30.570 193 120 6 195 378 451 638 3.74e-15 79.7
MsG0180005370.01.T01 AT3G06640 30.570 193 120 6 195 378 451 638 3.93e-15 79.7

Find 138 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 244 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ATCAACTACTTTATGCTTTC+TGG 0.084599 1:-90919748 None:intergenic
GCCATGAATTTAATGCTTTC+AGG 0.144591 1:-90920741 None:intergenic
ATGCTTCAGATTGCAGATTT+TGG 0.170533 1:+90921123 MsG0180005370.01.T01:CDS
CTCCTTGCAGAAATGTTTAA+AGG 0.178844 1:+90921282 MsG0180005370.01.T01:CDS
GTATCTGCCATCATCTTTCT+TGG 0.182544 1:-90923175 None:intergenic
CTATTTCTCTCACCATTTCT+TGG 0.186192 1:+90923048 MsG0180005370.01.T01:CDS
CCCAATGTAGTAAAACTTAA+AGG 0.202851 1:+90920798 MsG0180005370.01.T01:CDS
TATATGCATCAATTGCTTTC+AGG 0.205976 1:+90921024 MsG0180005370.01.T01:CDS
GACAGGTTCAAAATGGAAAA+TGG 0.211244 1:+90919618 MsG0180005370.01.T01:CDS
CAGGCGTTCTCGTACATTTA+TGG 0.211592 1:+90922730 MsG0180005370.01.T01:CDS
CAAGAAATGGTGAGAGAAAT+AGG 0.222748 1:-90923047 None:intergenic
TTGATTTGGACTATAATAAT+TGG 0.230481 1:-90921151 None:intergenic
GTTGGTGTAATCTTCCAATT+TGG 0.232943 1:-90920558 None:intergenic
CAATATTTGCACGCCTACTA+TGG 0.234682 1:-90923098 None:intergenic
TTGTTAGGTTCCACCGATTA+TGG 0.235872 1:+90921228 MsG0180005370.01.T01:CDS
TCATCTTTCTTGGTTGCATT+TGG 0.279204 1:-90923165 None:intergenic
TTCTTGGTTGCATTTGGCTT+TGG 0.284631 1:-90923159 None:intergenic
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TCAACTACTTTATGCTTTCT+GGG 0.309047 1:-90919747 None:intergenic
TTAGTTACCTCTGTTCTTCC+AGG 0.314635 1:-90921318 None:intergenic
TCTTCTTCTTTGTAGATTGC+AGG 0.316682 1:-90922384 None:intergenic
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GAGGATACAGTATGTTCTAT+TGG 0.317483 1:-90922782 None:intergenic
GTGAGAGGCTGGTCTTGATT+TGG 0.322276 1:-90921165 None:intergenic
TTTGGCTTTGGCTTGGATAA+TGG 0.331645 1:-90923147 None:intergenic
ATAGTAAGAAGCAGTTGAAT+AGG 0.334832 1:+90919814 MsG0180005370.01.T01:CDS
AGCTTCAGATTCTAATGGTT+TGG 0.343695 1:-90919580 None:intergenic
AGAACATTTACTCTTTGATT+AGG 0.343916 1:+90923257 MsG0180005370.01.T01:CDS
ATGGAGTTGGTATTGATCTA+TGG 0.360931 1:+90921247 MsG0180005370.01.T01:CDS
CATAGTAGGCGTGCAAATAT+TGG 0.374359 1:+90923099 MsG0180005370.01.T01:CDS
GGATATTGTGGCCCTCAAAA+AGG 0.374419 1:+90920698 MsG0180005370.01.T01:CDS
ACATTATCAACCAACCATTT+AGG 0.375138 1:-90919867 None:intergenic
AGAGCTCCTGAATTGTTGTT+AGG 0.375565 1:+90921213 MsG0180005370.01.T01:CDS
GCCTGAAAGCATTAAATTCA+TGG 0.379403 1:+90920740 MsG0180005370.01.T01:CDS
TGGACTAGACAGGTTCAAAA+TGG 0.383410 1:+90919611 MsG0180005370.01.T01:CDS
AAGACCAGCCTCTCACAAAC+AGG 0.387888 1:+90921172 MsG0180005370.01.T01:CDS
AATCACGATATTACAGAGAT+TGG 0.392826 1:+90920770 MsG0180005370.01.T01:CDS
TACTTTATCTGTTCTTTAGC+TGG 0.397873 1:-90922417 None:intergenic
ATTACACCAACTCATAATAT+TGG 0.402341 1:+90920570 MsG0180005370.01.T01:CDS
TCTGTTCTTCCAGGCATGAT+TGG 0.406608 1:-90921309 None:intergenic
TAGTTAGCTTCAGATTCTAA+TGG 0.410824 1:-90919585 None:intergenic
GCACTACCTGGTTCTTCACT+TGG 0.411431 1:-90922970 None:intergenic
GGTTGCATTTGGCTTTGGCT+TGG 0.411616 1:-90923154 None:intergenic
AAACATTGCTGTAGGTTCCT+TGG 0.413796 1:-90920650 None:intergenic
ATCAATACCAACTCCATAAT+CGG 0.414257 1:-90921241 None:intergenic
GTGGAACCTAACAACAATTC+AGG 0.414279 1:-90921219 None:intergenic
AAGAAATGGTGAGAGAAATA+GGG 0.416426 1:-90923046 None:intergenic
AAGTCAAAAGCATGTTGAAA+AGG 0.422552 1:+90919689 MsG0180005370.01.T01:CDS
GTGTAAACCAAGCTGGTGTT+GGG 0.423631 1:+90923013 MsG0180005370.01.T01:CDS
ATTTGTCAAGAGTTATTTCT+CGG 0.427721 1:+90920880 MsG0180005370.01.T01:CDS
CAAACAGGGTTGTGACACTA+TGG 0.431596 1:+90921187 MsG0180005370.01.T01:CDS
TTTGTAAGACTCAGCACTCT+TGG 0.432241 1:-90919919 None:intergenic
AGAAAGCATAAAGTAGTTGA+TGG 0.432593 1:+90919750 MsG0180005370.01.T01:CDS
TCTAAATTCTCTGGTGGAAG+TGG 0.433320 1:-90923220 None:intergenic
CCAATGTAGTAAAACTTAAA+GGG 0.439095 1:+90920799 MsG0180005370.01.T01:CDS
GAATCTGAAGCTAACTATAG+TGG 0.448660 1:+90919591 MsG0180005370.01.T01:CDS
CATAAAAGACCTAAAGAAGA+TGG 0.451710 1:-90921710 None:intergenic
GTCTTACAAAATGATTGATA+AGG 0.455042 1:+90919932 MsG0180005370.01.T01:CDS
GGTATATTAACTCTAAAATC+AGG 0.458952 1:+90922711 MsG0180005370.01.T01:intron
TGGAAGTGGACCTGAAAATC+TGG 0.459448 1:-90923206 None:intergenic
TTCTATGAAGTTGCTCAACC+TGG 0.464438 1:-90921568 None:intergenic
GTAGGATGTGCCAACATGTC+TGG 0.464736 1:-90919977 None:intergenic
AATTCTTCTAACCTGTGGTT+CGG 0.465342 1:-90920919 None:intergenic
CGGATAGATCACAAGCCAAC+GGG 0.465474 1:-90922356 None:intergenic
AAAGTCTTATAGACCAAGTC+TGG 0.466424 1:+90921664 MsG0180005370.01.T01:CDS
ACAGGTTCAAAATGGAAAAT+GGG 0.467530 1:+90919619 MsG0180005370.01.T01:CDS
GTTCCTTCTCAAGTGTTGGC+TGG 0.472470 1:+90919888 MsG0180005370.01.T01:CDS
AGTGTAAACCAAGCTGGTGT+TGG 0.479525 1:+90923012 MsG0180005370.01.T01:CDS
CAACCCTGTTTGTGAGAGGC+TGG 0.482930 1:-90921176 None:intergenic
AGACTTGGTCTATAAGACTT+TGG 0.488230 1:-90921662 None:intergenic
GGTTCCACCGATTATGGAGT+TGG 0.495432 1:+90921234 MsG0180005370.01.T01:CDS
CTTCTGCCAATATTATGAGT+TGG 0.496324 1:-90920576 None:intergenic
TAATGTTCCTTCTCAAGTGT+TGG 0.496525 1:+90919884 MsG0180005370.01.T01:CDS
AAAGGAATTCCAATCATGCC+TGG 0.500566 1:+90921300 MsG0180005370.01.T01:CDS
GATGCAAAATTCCTCTATCA+TGG 0.500586 1:-90921059 None:intergenic
GTACTACTTGTTGCACTACC+TGG 0.504150 1:-90922982 None:intergenic
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GTTGCACACAGAAGATCTAC+TGG 0.510281 1:+90919663 MsG0180005370.01.T01:CDS
GGTTCGGTTAGTCTTTCTCC+TGG 0.513866 1:-90920903 None:intergenic
TTGAAAGTTTCTACCAGACT+TGG 0.515529 1:-90921677 None:intergenic
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ATAAAAGACCTAAAGAAGAT+GGG 0.517900 1:-90921709 None:intergenic
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ATAACTCTTGACAAATCTGT+TGG 0.523896 1:-90920873 None:intergenic
ACATACTGTATCCTCTAAAG+AGG 0.524170 1:+90922790 MsG0180005370.01.T01:CDS
GACGCACTGCCACGGAATGC+AGG 0.524534 1:-90921752 None:intergenic
CTTGGTCTATAAGACTTTGG+AGG 0.526612 1:-90921659 None:intergenic
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TCTTCATTTCCCAGACATGT+TGG 0.531050 1:+90919967 MsG0180005370.01.T01:CDS
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GCACACCGTCACAAGAGTAT+TGG 0.543630 1:+90921606 MsG0180005370.01.T01:CDS
TTCCTTTAAACATTTCTGCA+AGG 0.544166 1:-90921284 None:intergenic
AGCCCCACAAAATCCATAGT+AGG 0.544660 1:+90923085 MsG0180005370.01.T01:CDS
TCGAGACACCGGGGATATTG+TGG 0.546460 1:+90920686 MsG0180005370.01.T01:CDS
TTTGATGATGAGATGGTGGA+TGG 0.547165 1:+90919840 MsG0180005370.01.T01:CDS
TTTGAGGGCCACAATATCCC+CGG 0.547786 1:-90920694 None:intergenic
TTTGTAGATTGCAGGCAGAC+CGG 0.555349 1:-90922376 None:intergenic
AATGCAACCAAGAAAGATGA+TGG 0.562772 1:+90923168 MsG0180005370.01.T01:CDS
TGTGCAACAAAATCAGAACT+TGG 0.563769 1:-90919648 None:intergenic
TCATCTAGTGTAAACCAAGC+TGG 0.564073 1:+90923006 MsG0180005370.01.T01:CDS
AATGGTCCCCAACACCAGCT+TGG 0.568387 1:-90923020 None:intergenic
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TAACTTTCTAAATTCTCTGG+TGG 0.578505 1:-90923226 None:intergenic
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ACACCAGCCAACACTTGAGA+AGG 0.588403 1:-90919891 None:intergenic
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AGCTTTATAAACATTGCTGT+AGG 0.596223 1:-90920658 None:intergenic
AAAGCTCTAGATCGAGACAC+CGG 0.597776 1:+90920675 MsG0180005370.01.T01:CDS
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GCTTTGGATCCTGCATTCCG+TGG 0.608680 1:+90921743 MsG0180005370.01.T01:CDS
GAGCTTTAGACGCACTGCCA+CGG 0.609090 1:-90921760 None:intergenic
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CAGGCTGTGATGTATTGAAG+CGG 0.644567 1:-90920722 None:intergenic
CCGGATAGATCACAAGCCAA+CGG 0.646183 1:-90922357 None:intergenic
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GTCACAACCCTGTTTGTGAG+AGG 0.656874 1:-90921180 None:intergenic
AGACCAGCCTCTCACAAACA+GGG 0.676594 1:+90921173 MsG0180005370.01.T01:CDS
GGTATTGAGAAATAATGCTG+AGG 0.677286 1:+90922933 MsG0180005370.01.T01:intron
TATGTTCCAAGTGAAGAACC+AGG 0.684369 1:+90922964 MsG0180005370.01.T01:CDS
AAAAGACCTAAAGAAGATGG+GGG 0.688327 1:-90921707 None:intergenic
AATCATGCCTGGAAGAACAG+AGG 0.702675 1:+90921311 MsG0180005370.01.T01:CDS
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CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATATAAGTTAAATACATACA+TGG - Chr1:90921854-90921873 None:intergenic 15.0%
!! ATTAAAATTTGCATATTAGA+TGG - Chr1:90920504-90920523 None:intergenic 15.0%
!! ATTTCCTAATATAAATCAAT+TGG - Chr1:90920361-90920380 None:intergenic 15.0%
!! ATTTGTTTATTTAATAATGC+TGG + Chr1:90920098-90920117 MsG0180005370.01.T01:intron 15.0%
!! CAAAATTTATATCTAATCAT+CGG - Chr1:90922651-90922670 None:intergenic 15.0%
!! TTGACTTTATAAGATTATTA+AGG - Chr1:90920990-90921009 None:intergenic 15.0%
!!! AATCTTTTGATTGATAAAAA+TGG + Chr1:90921099-90921118 MsG0180005370.01.T01:CDS 15.0%
!!! ATCTTTTGATTGATAAAAAT+GGG + Chr1:90921100-90921119 MsG0180005370.01.T01:CDS 15.0%
!! AACATTATGGTTATTATTTC+AGG + Chr1:90922912-90922931 MsG0180005370.01.T01:intron 20.0%
!! AGTTAATCTATATTTGCATT+TGG + Chr1:90920193-90920212 MsG0180005370.01.T01:intron 20.0%
!! ATGCAAATATAGATTAACTA+TGG - Chr1:90920192-90920211 None:intergenic 20.0%
!! GAAAGAGATATTTGTAAATT+CGG - Chr1:90922316-90922335 None:intergenic 20.0%
!! GATTAGAATTTAACAACTAT+AGG + Chr1:90920235-90920254 MsG0180005370.01.T01:intron 20.0%
!! TAAATACATACATGGATAAA+TGG - Chr1:90921846-90921865 None:intergenic 20.0%
!! TAATCTTATAAAGTCAATGT+AGG + Chr1:90920993-90921012 MsG0180005370.01.T01:intron 20.0%
!! TATAGGAAATTTAACAAGTA+AGG + Chr1:90920252-90920271 MsG0180005370.01.T01:intron 20.0%
!! TATCATTATAAGAACTACTT+TGG + Chr1:90921462-90921481 MsG0180005370.01.T01:intron 20.0%
!! TCATCAAAATAGAAAGAAAA+TGG - Chr1:90922612-90922631 None:intergenic 20.0%
!!! ATATTCTATTTACATTTTGC+AGG + Chr1:90920623-90920642 MsG0180005370.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATTATTTTGCTCTTAGAATT+CGG + Chr1:90921387-90921406 MsG0180005370.01.T01:intron 20.0%
!!! CGATGATTAGATATAAATTT+TGG + Chr1:90922649-90922668 MsG0180005370.01.T01:intron 20.0%
!!! GTATCCAATTGATTTATATT+AGG + Chr1:90920354-90920373 MsG0180005370.01.T01:intron 20.0%
!!! TCCATTTTCTCAAATTATTA+CGG + Chr1:90920022-90920041 MsG0180005370.01.T01:intron 20.0%
!!! TTAGATATAAATTTTGGTAC+TGG + Chr1:90922655-90922674 MsG0180005370.01.T01:intron 20.0%
!!! TTGATTTGGACTATAATAAT+TGG - Chr1:90921154-90921173 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTAACTTTCTAAATTCTC+TGG - Chr1:90923232-90923251 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTTTCATCACAAAATGAT+TGG - Chr1:90922214-90922233 None:intergenic 20.0%
! AACAGAGGTAACTAATAATT+AGG + Chr1:90921326-90921345 MsG0180005370.01.T01:intron 25.0%
! AATGGTATATCTTAGTTTCT+TGG + Chr1:90922509-90922528 MsG0180005370.01.T01:intron 25.0%
! ATAAAAGACCTAAAGAAGAT+GGG - Chr1:90921712-90921731 None:intergenic 25.0%
! ATTACACCAACTCATAATAT+TGG + Chr1:90920570-90920589 MsG0180005370.01.T01:CDS 25.0%
! CCAATGTAGTAAAACTTAAA+GGG + Chr1:90920799-90920818 MsG0180005370.01.T01:CDS 25.0%
! CTGTTTAGAAAAATCCAAAT+TGG + Chr1:90920544-90920563 MsG0180005370.01.T01:intron 25.0%
! CTTTGGTCATATATATCTTT+AGG + Chr1:90921479-90921498 MsG0180005370.01.T01:intron 25.0%
! GTCTTACAAAATGATTGATA+AGG + Chr1:90919932-90919951 MsG0180005370.01.T01:CDS 25.0%
! TATTCACACTATCTATGTAT+TGG - Chr1:90920078-90920097 None:intergenic 25.0%
! TCCGTAATAATTTGAGAAAA+TGG - Chr1:90920026-90920045 None:intergenic 25.0%
! TCTAATGTGAATGTGATTAA+TGG + Chr1:90922491-90922510 MsG0180005370.01.T01:intron 25.0%
!! AAGTTAATCTTTGCTATCAA+AGG + Chr1:90922439-90922458 MsG0180005370.01.T01:intron 25.0%
!! AGCAACTTCATAGAATTTTT+AGG + Chr1:90921576-90921595 MsG0180005370.01.T01:CDS 25.0%
!! ATTTTGCATCGAGATATAAA+AGG + Chr1:90921072-90921091 MsG0180005370.01.T01:CDS 25.0%
!! CAAAGAAAAATATAACTTGC+TGG - Chr1:90920152-90920171 None:intergenic 25.0%
!! TTTTGCATCGAGATATAAAA+GGG + Chr1:90921073-90921092 MsG0180005370.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTTTCTTTGCTTGAATCTA+AGG + Chr1:90920162-90920181 MsG0180005370.01.T01:intron 25.0%
!!! ATTTGTCAAGAGTTATTTCT+CGG + Chr1:90920880-90920899 MsG0180005370.01.T01:CDS 25.0%
!!! CATAGAATTTTTAGGTTATG+TGG + Chr1:90921584-90921603 MsG0180005370.01.T01:CDS 25.0%
!!! CCTTTAAGTTTTACTACATT+GGG - Chr1:90920801-90920820 None:intergenic 25.0%
!!! GGTATATTAACTCTAAAATC+AGG + Chr1:90922711-90922730 MsG0180005370.01.T01:intron 25.0%
!!! TATCATTTTAGTTATGCAGA+CGG + Chr1:90922883-90922902 MsG0180005370.01.T01:intron 25.0%
AACTCATAATATTGGCAGAA+GGG + Chr1:90920578-90920597 MsG0180005370.01.T01:CDS 30.0%
AAGAAAATTCTTCTAACCTG+TGG - Chr1:90920927-90920946 None:intergenic 30.0%
AAGAAATGGTGAGAGAAATA+GGG - Chr1:90923049-90923068 None:intergenic 30.0%
AATCACGATATTACAGAGAT+TGG + Chr1:90920770-90920789 MsG0180005370.01.T01:CDS 30.0%
ACAGGTTCAAAATGGAAAAT+GGG + Chr1:90919619-90919638 MsG0180005370.01.T01:CDS 30.0%
ACATTATCAACCAACCATTT+AGG - Chr1:90919870-90919889 None:intergenic 30.0%
ATAACTCTTGACAAATCTGT+TGG - Chr1:90920876-90920895 None:intergenic 30.0%
ATAGTAAGAAGCAGTTGAAT+AGG + Chr1:90919814-90919833 MsG0180005370.01.T01:CDS 30.0%
ATCAACTACTTTATGCTTTC+TGG - Chr1:90919751-90919770 None:intergenic 30.0%
ATCAATACCAACTCCATAAT+CGG - Chr1:90921244-90921263 None:intergenic 30.0%
CATAAAAGACCTAAAGAAGA+TGG - Chr1:90921713-90921732 None:intergenic 30.0%
CCCAATGTAGTAAAACTTAA+AGG + Chr1:90920798-90920817 MsG0180005370.01.T01:CDS 30.0%
TAAAAGACCTAAAGAAGATG+GGG - Chr1:90921711-90921730 None:intergenic 30.0%
TAACTTTCTAAATTCTCTGG+TGG - Chr1:90923229-90923248 None:intergenic 30.0%
TACAGTGAATGTACAAACTT+GGG - Chr1:90922102-90922121 None:intergenic 30.0%
TACTTTATCTGTTCTTTAGC+TGG - Chr1:90922420-90922439 None:intergenic 30.0%
TATATGCATCAATTGCTTTC+AGG + Chr1:90921024-90921043 MsG0180005370.01.T01:CDS 30.0%
TCAAACTCATGTAATGAAAC+AGG - Chr1:90921883-90921902 None:intergenic 30.0%
TCAACTACTTTATGCTTTCT+GGG - Chr1:90919750-90919769 None:intergenic 30.0%
TCAATATCATGATTCCATGA+TGG - Chr1:90920389-90920408 None:intergenic 30.0%
TGAGTTATGACTAACTTACA+AGG - Chr1:90920324-90920343 None:intergenic 30.0%
TGTTTAAATCATGCATTGCA+TGG - Chr1:90920297-90920316 None:intergenic 30.0%
TTACAGTGAATGTACAAACT+TGG - Chr1:90922103-90922122 None:intergenic 30.0%
TTCCTTTAAACATTTCTGCA+AGG - Chr1:90921287-90921306 None:intergenic 30.0%
TTGAATGTAACTACATGTGT+AGG - Chr1:90919998-90920017 None:intergenic 30.0%
TTTAATACTCACCTCTTTAG+AGG - Chr1:90922804-90922823 None:intergenic 30.0%
TTTATGTACTCTTCTTGCTT+TGG + Chr1:90921727-90921746 MsG0180005370.01.T01:CDS 30.0%
TTTGGATTGCTAATTAAGAG+AGG + Chr1:90920211-90920230 MsG0180005370.01.T01:intron 30.0%
! AAGTCAAAAGCATGTTGAAA+AGG + Chr1:90919689-90919708 MsG0180005370.01.T01:CDS 30.0%
! ACTGTCTGATCTAGAATTAA+TGG + Chr1:90922030-90922049 MsG0180005370.01.T01:intron 30.0%
! AGAAAGCATAAAGTAGTTGA+TGG + Chr1:90919750-90919769 MsG0180005370.01.T01:CDS 30.0%
! AGCTTTATAAACATTGCTGT+AGG - Chr1:90920661-90920680 None:intergenic 30.0%
! AGTCAAAAGCATGTTGAAAA+GGG + Chr1:90919690-90919709 MsG0180005370.01.T01:CDS 30.0%
! ATGATTTAGAACATGCTTGA+TGG + Chr1:90922828-90922847 MsG0180005370.01.T01:intron 30.0%
! ATTGCTTTGCTCTTATTTAC+AGG + Chr1:90922690-90922709 MsG0180005370.01.T01:intron 30.0%
! CAAGCATGTTCTAAATCATA+AGG - Chr1:90922827-90922846 None:intergenic 30.0%
! GGAAGACATTTTTCATTATG+TGG + Chr1:90920119-90920138 MsG0180005370.01.T01:intron 30.0%
! TAGTTAGCTTCAGATTCTAA+TGG - Chr1:90919588-90919607 None:intergenic 30.0%
! TCTATTTACATTTTGCAGGT+AGG + Chr1:90920627-90920646 MsG0180005370.01.T01:CDS 30.0%
! TGATTTAGAACATGCTTGAT+GGG + Chr1:90922829-90922848 MsG0180005370.01.T01:intron 30.0%
! TTTTGATCAGAACCAAGAAA+TGG - Chr1:90923063-90923082 None:intergenic 30.0%
!! CCCTTTAAGTTTTACTACAT+TGG - Chr1:90920802-90920821 None:intergenic 30.0%
!! GAATTGAACATTTTAGCAGT+TGG + Chr1:90920951-90920970 MsG0180005370.01.T01:intron 30.0%
AAAAGACCTAAAGAAGATGG+GGG - Chr1:90921710-90921729 None:intergenic 35.0%
AAAGCATGTTGAAAAGGGTA+AGG + Chr1:90919695-90919714 MsG0180005370.01.T01:CDS 35.0%
AATGCAACCAAGAAAGATGA+TGG + Chr1:90923168-90923187 MsG0180005370.01.T01:CDS 35.0%
AATTCTTCTAACCTGTGGTT+CGG - Chr1:90920922-90920941 None:intergenic 35.0%
ACAATTGCTTCTCCTTAATG+TGG + Chr1:90921807-90921826 MsG0180005370.01.T01:intron 35.0%
AGAAATGGTGAGAGAAATAG+GGG - Chr1:90923048-90923067 None:intergenic 35.0%
AGCCAATATTGAGTCATCAT+GGG - Chr1:90922260-90922279 None:intergenic 35.0%
AGCTTCAGATTCTAATGGTT+TGG - Chr1:90919583-90919602 None:intergenic 35.0%
CAACTCATAATATTGGCAGA+AGG + Chr1:90920577-90920596 MsG0180005370.01.T01:CDS 35.0%
CAAGAAATGGTGAGAGAAAT+AGG - Chr1:90923050-90923069 None:intergenic 35.0%
CAATTGTTGTCTTTACTCAC+CGG - Chr1:90921794-90921813 None:intergenic 35.0%
CACCAAAGATTTAGATCAGA+TGG - Chr1:90921971-90921990 None:intergenic 35.0%
CATCTGATCTAAATCTTTGG+TGG + Chr1:90921969-90921988 MsG0180005370.01.T01:intron 35.0%
CTCCTTGCAGAAATGTTTAA+AGG + Chr1:90921282-90921301 MsG0180005370.01.T01:CDS 35.0%
CTTCTGCCAATATTATGAGT+TGG - Chr1:90920579-90920598 None:intergenic 35.0%
GACAGGTTCAAAATGGAAAA+TGG + Chr1:90919618-90919637 MsG0180005370.01.T01:CDS 35.0%
GACCATCTGATCTAAATCTT+TGG + Chr1:90921966-90921985 MsG0180005370.01.T01:intron 35.0%
GAGGATACAGTATGTTCTAT+TGG - Chr1:90922785-90922804 None:intergenic 35.0%
GATGCAAAATTCCTCTATCA+TGG - Chr1:90921062-90921081 None:intergenic 35.0%
GCCATGAATTTAATGCTTTC+AGG - Chr1:90920744-90920763 None:intergenic 35.0%
GCTCAAATGATAAGTGTACT+CGG + Chr1:90921348-90921367 MsG0180005370.01.T01:intron 35.0%
GGGAATATGTTTCCACAAAT+TGG - Chr1:90921925-90921944 None:intergenic 35.0%
GTTGGTGTAATCTTCCAATT+TGG - Chr1:90920561-90920580 None:intergenic 35.0%
TAATGTTCCTTCTCAAGTGT+TGG + Chr1:90919884-90919903 MsG0180005370.01.T01:CDS 35.0%
TACAAGAGTTGTCCAATTTG+TGG + Chr1:90921910-90921929 MsG0180005370.01.T01:intron 35.0%
TCAAGATCTGAACCACATTA+AGG - Chr1:90921822-90921841 None:intergenic 35.0%
TCATCTTTCTTGGTTGCATT+TGG - Chr1:90923168-90923187 None:intergenic 35.0%
TCTTCTTCTTTGTAGATTGC+AGG - Chr1:90922387-90922406 None:intergenic 35.0%
TGCATGGTATCATTACTGAA+GGG + Chr1:90922067-90922086 MsG0180005370.01.T01:intron 35.0%
TGTGCAACAAAATCAGAACT+TGG - Chr1:90919651-90919670 None:intergenic 35.0%
TTAGGAAATTGAAGCCATCA+TGG + Chr1:90920372-90920391 MsG0180005370.01.T01:intron 35.0%
TTCCCATGATGACTCAATAT+TGG + Chr1:90922255-90922274 MsG0180005370.01.T01:intron 35.0%
TTGAAAGTTTCTACCAGACT+TGG - Chr1:90921680-90921699 None:intergenic 35.0%
TTGAGCCATATGAACTAAAC+AGG + Chr1:90922538-90922557 MsG0180005370.01.T01:intron 35.0%
TTGCATGGTATCATTACTGA+AGG + Chr1:90922066-90922085 MsG0180005370.01.T01:intron 35.0%
TTTCTCCAATACTCTTGTGA+CGG - Chr1:90921614-90921633 None:intergenic 35.0%
! AAAGTCTTATAGACCAAGTC+TGG + Chr1:90921664-90921683 MsG0180005370.01.T01:CDS 35.0%
! ACATACTGTATCCTCTAAAG+AGG + Chr1:90922790-90922809 MsG0180005370.01.T01:CDS 35.0%
! AGACTTGGTCTATAAGACTT+TGG - Chr1:90921665-90921684 None:intergenic 35.0%
! ATGCTTCAGATTGCAGATTT+TGG + Chr1:90921123-90921142 MsG0180005370.01.T01:CDS 35.0%
! CATGAAGTTTTCATGTTTCC+AGG + Chr1:90921550-90921569 MsG0180005370.01.T01:CDS 35.0%
! CTATTTCTCTCACCATTTCT+TGG + Chr1:90923048-90923067 MsG0180005370.01.T01:CDS 35.0%
! GAATCTGAAGCTAACTATAG+TGG + Chr1:90919591-90919610 MsG0180005370.01.T01:CDS 35.0%
! GATTTAGAACATGCTTGATG+GGG + Chr1:90922830-90922849 MsG0180005370.01.T01:intron 35.0%
! GGTATTGAGAAATAATGCTG+AGG + Chr1:90922933-90922952 MsG0180005370.01.T01:intron 35.0%
! GTAAGCCTGTTTAGTTCATA+TGG - Chr1:90922546-90922565 None:intergenic 35.0%
!! AAAGTAGTTGATGGCAATTG+TGG + Chr1:90919759-90919778 MsG0180005370.01.T01:CDS 35.0%
!! ACTCAATATTGGCTCATACA+AGG + Chr1:90922266-90922285 MsG0180005370.01.T01:intron 35.0%
!! ATGGAGTTGGTATTGATCTA+TGG + Chr1:90921247-90921266 MsG0180005370.01.T01:CDS 35.0%
!! CTAGATTCTGGGATTGAATT+AGG - Chr1:90921421-90921440 None:intergenic 35.0%
!! GCCTGAAAGCATTAAATTCA+TGG + Chr1:90920740-90920759 MsG0180005370.01.T01:CDS 35.0%
!! GTCTAAAGCTCTGAAAAATC+CGG + Chr1:90921772-90921791 MsG0180005370.01.T01:CDS 35.0%
!! TCTAAATCTTTGGTGGTGAT+CGG + Chr1:90921976-90921995 MsG0180005370.01.T01:intron 35.0%
!!! TAGGTGTTTTGATGATGAGA+TGG + Chr1:90919833-90919852 MsG0180005370.01.T01:CDS 35.0%
AAACATTGCTGTAGGTTCCT+TGG - Chr1:90920653-90920672 None:intergenic 40.0%
AAAGGAATTCCAATCATGCC+TGG + Chr1:90921300-90921319 MsG0180005370.01.T01:CDS 40.0%
AATACCAACTCCATAATCGG+TGG - Chr1:90921241-90921260 None:intergenic 40.0%
AGATGAATAACTAGGCTGCA+GGG - Chr1:90921945-90921964 None:intergenic 40.0%
CAATATTTGCACGCCTACTA+TGG - Chr1:90923101-90923120 None:intergenic 40.0%
CATAGTAGGCGTGCAAATAT+TGG + Chr1:90923099-90923118 MsG0180005370.01.T01:CDS 40.0%
CTTGGTCTATAAGACTTTGG+AGG - Chr1:90921662-90921681 None:intergenic 40.0%
GAGCCAATATTGAGTCATCA+TGG - Chr1:90922261-90922280 None:intergenic 40.0%
GATGGTCGAGATGAATAACT+AGG - Chr1:90921953-90921972 None:intergenic 40.0%
GCATGGTATCATTACTGAAG+GGG + Chr1:90922068-90922087 MsG0180005370.01.T01:intron 40.0%
GGCTTGTAAAGAAAAACTGC+AGG - Chr1:90922338-90922357 None:intergenic 40.0%
GGTCGAGATTGATTATTGCA+TGG + Chr1:90922051-90922070 MsG0180005370.01.T01:intron 40.0%
GTATCTGCCATCATCTTTCT+TGG - Chr1:90923178-90923197 None:intergenic 40.0%
GTGGAACCTAACAACAATTC+AGG - Chr1:90921222-90921241 None:intergenic 40.0%
TATCATTACTGAAGGGGATG+TGG + Chr1:90922074-90922093 MsG0180005370.01.T01:intron 40.0%
TATGTTCCAAGTGAAGAACC+AGG + Chr1:90922964-90922983 MsG0180005370.01.T01:CDS 40.0%
TCAATACGAGTTCAGTCTCT+TGG + Chr1:90920458-90920477 MsG0180005370.01.T01:intron 40.0%
TCATCTAGTGTAAACCAAGC+TGG + Chr1:90923006-90923025 MsG0180005370.01.T01:CDS 40.0%
TCATGATTAGCAGCTATACG+TGG - Chr1:90921535-90921554 None:intergenic 40.0%
TCTAAATTCTCTGGTGGAAG+TGG - Chr1:90923223-90923242 None:intergenic 40.0%
TCTTCATTTCCCAGACATGT+TGG + Chr1:90919967-90919986 MsG0180005370.01.T01:CDS 40.0%
TTAGTTACCTCTGTTCTTCC+AGG - Chr1:90921321-90921340 None:intergenic 40.0%
TTCTATGAAGTTGCTCAACC+TGG - Chr1:90921571-90921590 None:intergenic 40.0%
TTTGTAAGACTCAGCACTCT+TGG - Chr1:90919922-90919941 None:intergenic 40.0%
! ACAGAACAGACCAGATTTTC+AGG + Chr1:90923196-90923215 MsG0180005370.01.T01:CDS 40.0%
! ACGCCTACTATGGATTTTGT+GGG - Chr1:90923091-90923110 None:intergenic 40.0%
! AGAGCTCCTGAATTGTTGTT+AGG + Chr1:90921213-90921232 MsG0180005370.01.T01:CDS 40.0%
! ATTGAAGCGGACCTTTTTGA+GGG - Chr1:90920712-90920731 None:intergenic 40.0%
! GTTTTTCTTTACAAGCCCGT+TGG + Chr1:90922341-90922360 MsG0180005370.01.T01:intron 40.0%
! TATTGAAGCGGACCTTTTTG+AGG - Chr1:90920713-90920732 None:intergenic 40.0%
! TGGACTAGACAGGTTCAAAA+TGG + Chr1:90919611-90919630 MsG0180005370.01.T01:CDS 40.0%
! TTCTTGGTTGCATTTGGCTT+TGG - Chr1:90923162-90923181 None:intergenic 40.0%
! TTGTTAGGTTCCACCGATTA+TGG + Chr1:90921228-90921247 MsG0180005370.01.T01:CDS 40.0%
!! CAGACGGTGCTATAACATTA+TGG + Chr1:90922899-90922918 MsG0180005370.01.T01:intron 40.0%
!! CTAACTATAGTGGACTAGAC+AGG + Chr1:90919601-90919620 MsG0180005370.01.T01:CDS 40.0%
!! GGTATTGATCTATGGAGTGT+TGG + Chr1:90921255-90921274 MsG0180005370.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTGATGATGAGATGGTGGA+TGG + Chr1:90919840-90919859 MsG0180005370.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTGGCTTTGGCTTGGATAA+TGG - Chr1:90923150-90923169 None:intergenic 40.0%
!!! GTGTTTTGATGATGAGATGG+TGG + Chr1:90919836-90919855 MsG0180005370.01.T01:CDS 40.0%
AATCATGCCTGGAAGAACAG+AGG + Chr1:90921311-90921330 MsG0180005370.01.T01:CDS 45.0%
AGAAAGACTAACCGAACCAC+AGG + Chr1:90920908-90920927 MsG0180005370.01.T01:CDS 45.0%
AGCCCCACAAAATCCATAGT+AGG + Chr1:90923085-90923104 MsG0180005370.01.T01:CDS 45.0%
AGTGTAAACCAAGCTGGTGT+TGG + Chr1:90923012-90923031 MsG0180005370.01.T01:CDS 45.0%
CAAACAGGGTTGTGACACTA+TGG + Chr1:90921187-90921206 MsG0180005370.01.T01:CDS 45.0%
CAGGCGTTCTCGTACATTTA+TGG + Chr1:90922730-90922749 MsG0180005370.01.T01:CDS 45.0%
CAGGCTGTGATGTATTGAAG+CGG - Chr1:90920725-90920744 None:intergenic 45.0%
CTTCAGCATTGCCATGATAG+AGG + Chr1:90921048-90921067 MsG0180005370.01.T01:CDS 45.0%
GACCTATCGAGCTAGATTCT+GGG - Chr1:90921432-90921451 None:intergenic 45.0%
GAGATGAATAACTAGGCTGC+AGG - Chr1:90921946-90921965 None:intergenic 45.0%
GCTGTACTGCATTCTTGAAG+TGG - Chr1:90920829-90920848 None:intergenic 45.0%
GGATATTGTGGCCCTCAAAA+AGG + Chr1:90920698-90920717 MsG0180005370.01.T01:CDS 45.0%
GTGAGAGAAATAGGGGTGAA+TGG - Chr1:90923041-90923060 None:intergenic 45.0%
GTGTAAACCAAGCTGGTGTT+GGG + Chr1:90923013-90923032 MsG0180005370.01.T01:CDS 45.0%
GTTGCACACAGAAGATCTAC+TGG + Chr1:90919663-90919682 MsG0180005370.01.T01:CDS 45.0%
TAGGATGTGCCAACATGTCT+GGG - Chr1:90919979-90919998 None:intergenic 45.0%
TCTGTTCTTCCAGGCATGAT+TGG - Chr1:90921312-90921331 None:intergenic 45.0%
TGACCTATCGAGCTAGATTC+TGG - Chr1:90921433-90921452 None:intergenic 45.0%
TGGAAGTGGACCTGAAAATC+TGG - Chr1:90923209-90923228 None:intergenic 45.0%
TTTGTAGATTGCAGGCAGAC+CGG - Chr1:90922379-90922398 None:intergenic 45.0%
! ATCCCAGAATCTAGCTCGAT+AGG + Chr1:90921427-90921446 MsG0180005370.01.T01:intron 45.0%
! CACGCCTACTATGGATTTTG+TGG - Chr1:90923092-90923111 None:intergenic 45.0%
! CGCCTACTATGGATTTTGTG+GGG - Chr1:90923090-90923109 None:intergenic 45.0%
! GTACTACTTGTTGCACTACC+TGG - Chr1:90922985-90923004 None:intergenic 45.0%
! TACATTTTGCAGGTAGGCCA+AGG + Chr1:90920633-90920652 MsG0180005370.01.T01:CDS 45.0%
! TGTAAACCAAGCTGGTGTTG+GGG + Chr1:90923014-90923033 MsG0180005370.01.T01:CDS 45.0%
!! AAAGCTCTAGATCGAGACAC+CGG + Chr1:90920675-90920694 MsG0180005370.01.T01:CDS 45.0%
!! ATGATGAGATGGTGGATGGT+TGG + Chr1:90919844-90919863 MsG0180005370.01.T01:CDS 45.0%
!! TCAAGAGTTATTTCTCGGCC+AGG + Chr1:90920885-90920904 MsG0180005370.01.T01:CDS 45.0%
!! TTGGCTTGGATAATGGAGGA+AGG - Chr1:90923143-90923162 None:intergenic 45.0%
AAGACCAGCCTCTCACAAAC+AGG + Chr1:90921172-90921191 MsG0180005370.01.T01:CDS 50.0%
ACACCAGCCAACACTTGAGA+AGG - Chr1:90919894-90919913 None:intergenic 50.0%
AGACCAGCCTCTCACAAACA+GGG + Chr1:90921173-90921192 MsG0180005370.01.T01:CDS 50.0%
CCGGATAGATCACAAGCCAA+CGG - Chr1:90922360-90922379 None:intergenic 50.0%
CGGATAGATCACAAGCCAAC+GGG - Chr1:90922359-90922378 None:intergenic 50.0%
GATCTGCCCCCATCTTCTTT+AGG + Chr1:90921701-90921720 MsG0180005370.01.T01:CDS 50.0%
GATGGCAATTGTGGTGCAAG+AGG + Chr1:90919768-90919787 MsG0180005370.01.T01:CDS 50.0%
GTAGGATGTGCCAACATGTC+TGG - Chr1:90919980-90919999 None:intergenic 50.0%
GTCACAACCCTGTTTGTGAG+AGG - Chr1:90921183-90921202 None:intergenic 50.0%
TTTGAGGGCCACAATATCCC+CGG - Chr1:90920697-90920716 None:intergenic 50.0%
! GCACACCGTCACAAGAGTAT+TGG + Chr1:90921606-90921625 MsG0180005370.01.T01:CDS 50.0%
! GCACTACCTGGTTCTTCACT+TGG - Chr1:90922973-90922992 None:intergenic 50.0%
! GGTTCCACCGATTATGGAGT+TGG + Chr1:90921234-90921253 MsG0180005370.01.T01:CDS 50.0%
!! AAGCTCTAGATCGAGACACC+GGG + Chr1:90920676-90920695 MsG0180005370.01.T01:CDS 50.0%
!! CCGTTGGCTTGTGATCTATC+CGG + Chr1:90922357-90922376 MsG0180005370.01.T01:CDS 50.0%
!! GGATGGTTGGCCTAAATGGT+TGG + Chr1:90919857-90919876 MsG0180005370.01.T01:CDS 50.0%
!! GGCTTTGGCTTGGATAATGG+AGG - Chr1:90923147-90923166 None:intergenic 50.0%
!! GGTTCGGTTAGTCTTTCTCC+TGG - Chr1:90920906-90920925 None:intergenic 50.0%
!! GGTTGCATTTGGCTTTGGCT+TGG - Chr1:90923157-90923176 None:intergenic 50.0%
!! GTGAGAGGCTGGTCTTGATT+TGG - Chr1:90921168-90921187 None:intergenic 50.0%
!! GTTCCTTCTCAAGTGTTGGC+TGG + Chr1:90919888-90919907 MsG0180005370.01.T01:CDS 50.0%
!! TGGTGGATGGTTGGCCTAAA+TGG + Chr1:90919853-90919872 MsG0180005370.01.T01:CDS 50.0%
AATGGTCCCCAACACCAGCT+TGG - Chr1:90923023-90923042 None:intergenic 55.0%
CAACCCTGTTTGTGAGAGGC+TGG - Chr1:90921179-90921198 None:intergenic 55.0%
TCGAGACACCGGGGATATTG+TGG + Chr1:90920686-90920705 MsG0180005370.01.T01:CDS 55.0%
! GCTTTGGATCCTGCATTCCG+TGG + Chr1:90921743-90921762 MsG0180005370.01.T01:CDS 55.0%
!! AGCTCTAGATCGAGACACCG+GGG + Chr1:90920677-90920696 MsG0180005370.01.T01:CDS 55.0%
!! GAGCTTTAGACGCACTGCCA+CGG - Chr1:90921763-90921782 None:intergenic 55.0%
GACGCACTGCCACGGAATGC+AGG - Chr1:90921755-90921774 None:intergenic 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 90919564 90923278 90919564 ID=MsG0180005370.01;Name=MsG0180005370.01
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Protein sequence

>MsG0180005370.01.T01

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