AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180005541.01

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MsG0180005541.01.T01 AT3G19700 33.013 312 179 5 5 310 288 575 4.67e-31 132
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MsG0180005541.01.T01 AT2G41820 37.313 268 143 3 18 283 244 488 6.37e-34 140
MsG0180005541.01.T01 AT2G41820 29.967 307 182 2 169 442 61 367 3.77e-33 138
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MsG0180005541.01.T01 AT4G08850 37.150 428 258 4 27 443 117 544 8.97e-63 230
MsG0180005541.01.T01 AT4G08850 34.803 431 241 7 52 444 93 521 6.96e-53 200
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MsG0180005541.01.T01 AT2G24130 31.532 444 228 10 77 444 67 510 2.53e-41 164
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MsG0180005541.01.T01 AT1G34420 31.121 437 253 11 22 442 101 505 8.44e-42 166
MsG0180005541.01.T01 AT1G34420 29.708 377 200 9 143 459 103 474 6.97e-27 118
MsG0180005541.01.T01 AT1G34420 37.374 198 113 4 8 204 401 588 2.72e-23 107
MsG0180005541.01.T01 AT1G34420 31.095 283 137 4 21 300 361 588 1.86e-22 104
MsG0180005541.01.T01 AT1G34420 34.694 196 126 2 18 212 382 576 2.87e-17 87.4
MsG0180005541.01.T01 AT3G47110 31.473 842 443 19 18 746 119 939 1.34e-86 298
MsG0180005541.01.T01 AT3G47110 26.733 303 152 4 195 442 82 369 9.82e-20 95.5
MsG0180005541.01.T01 AT1G12460 32.392 673 395 14 196 812 69 737 1.86e-84 286
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MsG0180005541.01.T01 AT1G12460 35.019 257 155 4 61 307 76 330 1.32e-27 120
MsG0180005541.01.T01 AT1G12460 35.859 198 125 2 18 213 135 332 5.81e-25 112
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MsG0180005541.01.T01 AT5G65240 30.675 163 106 2 164 326 38 193 1.03e-13 75.5
MsG0180005541.01.T01 AT5G65240 43.269 104 59 0 18 121 78 181 1.99e-12 71.6
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MsG0180005541.01.T01 AT3G17420 49.351 231 112 2 521 746 127 357 1.35e-60 214
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MsG0180005541.01.T01 AT1G69990 39.860 143 81 3 32 173 69 207 1.11e-11 68.9
MsG0180005541.01.T01 AT1G69990 34.247 146 95 1 164 308 35 180 2.18e-11 68.2
MsG0180005541.01.T01 AT1G23540 46.154 234 124 1 525 756 349 582 3.25e-60 218
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MsG0180005541.01.T01 AT1G56720 46.847 222 116 1 535 754 169 390 3.32e-60 213
MsG0180005541.01.T01 AT1G56720 46.847 222 116 1 535 754 169 390 3.32e-60 213
MsG0180005541.01.T01 AT1G56720 46.847 222 116 1 535 754 169 390 3.32e-60 213
MsG0180005541.01.T01 AT1G51805 36.745 381 223 10 379 746 381 756 6.31e-60 220
MsG0180005541.01.T01 AT1G51805 36.745 381 223 10 379 746 405 780 6.75e-60 220
MsG0180005541.01.T01 AT3G24550 48.341 211 109 0 536 746 271 481 7.31e-60 216
MsG0180005541.01.T01 AT3G24540 48.095 210 109 0 537 746 175 384 8.75e-60 212
MsG0180005541.01.T01 AT1G52290 46.226 212 114 0 536 747 134 345 1.04e-59 212
MsG0180005541.01.T01 AT1G10620 47.867 211 110 0 536 746 361 571 1.50e-59 216
MsG0180005541.01.T01 AT1G27190 34.101 434 257 9 333 743 76 503 2.18e-59 214
MsG0180005541.01.T01 AT1G27190 35.503 169 92 4 141 297 56 219 1.17e-11 68.9
MsG0180005541.01.T01 AT1G26150 49.537 216 109 0 536 751 421 636 2.45e-59 214
MsG0180005541.01.T01 AT5G16900 39.394 396 213 11 382 764 419 800 2.78e-59 218
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MsG0180005541.01.T01 AT4G23740 35.878 131 82 2 195 324 69 198 5.26e-15 79.7
MsG0180005541.01.T01 AT4G23740 37.500 136 83 2 32 165 72 207 9.14e-14 75.9
MsG0180005541.01.T01 AT4G23740 29.268 205 110 8 118 318 44 217 8.33e-12 69.3
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MsG0180005541.01.T01 AT2G42960 46.729 214 112 1 535 746 173 386 7.34e-56 201
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MsG0180005541.01.T01 AT2G18470 47.393 211 111 0 537 747 276 486 1.38e-55 204
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MsG0180005541.01.T01 AT2G31880 38.168 131 78 3 36 164 95 224 9.90e-13 72.4
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MsG0180005541.01.T01 AT2G31880 31.579 133 90 1 194 326 87 218 4.91e-11 67.0
MsG0180005541.01.T01 AT4G33430 46.977 215 111 2 535 746 326 540 3.77e-54 200
MsG0180005541.01.T01 AT1G07550 37.057 367 209 7 382 746 415 761 8.53e-54 202
MsG0180005541.01.T01 AT1G34210 46.512 215 112 2 535 746 295 509 9.83e-54 198
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MsG0180005541.01.T01 AT1G24030 44.298 228 116 4 535 751 66 293 3.97e-51 184
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MsG0180005541.01.T01 AT2G47060 47.511 221 103 5 537 747 65 282 7.29e-51 183
MsG0180005541.01.T01 AT3G24790 44.813 241 123 4 537 773 39 273 7.80e-51 183
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MsG0180005541.01.T01 AT3G53240 32.576 528 300 14 27 505 347 867 8.89e-51 193
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MsG0180005541.01.T01 AT3G53240 27.577 359 185 10 150 442 65 414 2.41e-23 107
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MsG0180005541.01.T01 AT1G17240 32.898 459 254 12 33 437 100 558 3.35e-42 166
MsG0180005541.01.T01 AT1G17240 31.227 269 157 7 195 439 96 360 4.83e-20 96.3
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MsG0180005541.01.T01 AT2G28590 47.005 217 111 3 535 747 88 304 2.55e-49 177
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MsG0180005541.01.T01 AT3G20530 46.445 211 108 3 541 746 78 288 4.28e-49 176
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MsG0180005541.01.T01 AT1G06700 43.946 223 114 4 535 747 58 279 5.29e-49 178
MsG0180005541.01.T01 AT1G06700 43.946 223 114 4 535 747 58 279 5.29e-49 178
MsG0180005541.01.T01 AT5G47850 35.952 331 176 6 535 844 433 748 5.83e-49 186
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MsG0180005541.01.T01 AT3G46290 41.065 263 144 5 538 795 478 734 6.84e-49 187
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MsG0180005541.01.T01 AT2G34930 28.860 544 287 8 17 465 362 900 1.03e-48 187
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MsG0180005541.01.T01 AT5G01950 36.770 291 177 2 535 819 531 820 1.25e-48 186
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MsG0180005541.01.T01 AT5G01950 34.978 223 142 2 18 238 31 252 4.79e-23 105
MsG0180005541.01.T01 AT5G01950 34.632 231 146 5 85 312 2 230 2.36e-22 103
MsG0180005541.01.T01 AT5G01950 31.325 249 168 3 18 264 7 254 6.39e-22 102
MsG0180005541.01.T01 AT5G01950 31.474 251 165 6 40 286 5 252 2.16e-18 90.9
MsG0180005541.01.T01 AT5G01950 30.726 179 107 2 275 451 2 165 5.59e-15 80.1
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MsG0180005541.01.T01 AT1G66880 41.961 255 135 5 521 767 566 815 2.02e-48 186
MsG0180005541.01.T01 AT4G31100 42.986 221 124 1 537 755 436 656 2.11e-48 185
MsG0180005541.01.T01 AT1G51790 31.695 407 241 9 352 752 410 785 2.18e-48 186
MsG0180005541.01.T01 AT1G51790 31.695 407 241 9 352 752 410 785 2.18e-48 186
MsG0180005541.01.T01 AT3G04690 42.797 236 133 2 512 746 485 719 2.24e-48 185
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MsG0180005541.01.T01 AT5G39000 47.847 209 103 3 537 739 510 718 2.62e-46 179
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MsG0180005541.01.T01 AT1G56145 31.250 304 173 10 40 326 3 287 2.73e-23 107
MsG0180005541.01.T01 AT1G56145 29.924 264 153 6 18 278 53 287 9.69e-19 92.4
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MsG0180005541.01.T01 AT5G37450 31.157 337 190 9 8 329 50 359 1.20e-25 114
MsG0180005541.01.T01 AT5G37450 34.470 264 165 6 75 335 79 337 3.25e-25 113
MsG0180005541.01.T01 AT5G37450 32.057 209 131 3 247 445 82 289 3.73e-19 93.6
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MsG0180005541.01.T01 AT4G04220 30.303 495 275 12 3 454 124 591 8.17e-42 165
MsG0180005541.01.T01 AT4G04220 29.518 498 272 9 20 444 218 709 1.55e-41 164
MsG0180005541.01.T01 AT4G04220 29.782 413 210 11 18 381 363 744 4.08e-34 141
MsG0180005541.01.T01 AT4G04220 31.944 360 208 7 98 444 103 438 3.48e-31 132
MsG0180005541.01.T01 AT4G04220 30.814 344 223 6 137 466 95 437 6.95e-28 121
MsG0180005541.01.T01 AT4G04220 38.710 93 57 0 3 95 641 733 1.40e-11 68.9
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MsG0180005541.01.T01 AT5G37450 42.735 234 126 2 533 761 598 828 4.30e-46 179
MsG0180005541.01.T01 AT5G37450 32.075 212 134 3 192 394 75 285 1.47e-25 114
MsG0180005541.01.T01 AT5G37450 30.742 283 156 6 8 276 50 306 1.52e-24 110
MsG0180005541.01.T01 AT5G37450 29.630 189 116 3 258 445 69 241 4.90e-16 83.6
MsG0180005541.01.T01 AT1G56145 37.500 264 155 2 482 742 628 884 4.39e-46 179
MsG0180005541.01.T01 AT1G56145 32.248 307 181 6 141 443 91 374 1.44e-35 146
MsG0180005541.01.T01 AT1G56145 31.210 314 193 6 67 365 85 390 3.05e-26 116
MsG0180005541.01.T01 AT1G56145 28.261 276 159 4 195 446 95 355 8.42e-26 115
MsG0180005541.01.T01 AT1G56145 31.169 308 176 10 36 326 102 390 4.47e-24 109
MsG0180005541.01.T01 AT1G56145 29.924 264 153 6 18 278 156 390 6.62e-19 92.8
MsG0180005541.01.T01 AT1G56145 35.821 134 74 3 340 461 105 238 2.90e-14 77.8
MsG0180005541.01.T01 AT5G61350 35.821 268 164 2 537 797 517 783 5.03e-46 178
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MsG0180005541.01.T01 AT5G49780 46.237 186 99 1 563 747 552 737 5.88e-46 178
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MsG0180005541.01.T01 AT5G49780 30.040 253 135 6 203 413 2 254 1.17e-14 79.0
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MsG0180005541.01.T01 AT5G49780 31.696 224 132 6 234 439 60 280 6.30e-14 76.6
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MsG0180005541.01.T01 AT1G16260 43.128 211 119 1 536 745 381 591 1.47e-45 176
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Find 208 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 358 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
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GAGTCTTAAGGTTTGGAATT+TGG 0.185539 1:-93051522 None:intergenic
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TCTTGGTATCATCACATTAT+TGG 0.223753 1:+93054694 MsG0180005541.01.T01:CDS
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TCTCCTATTTGCCAGTTATC+TGG 0.255960 1:+93051910 MsG0180005541.01.T01:CDS
AGTCTTAAGGTTTGGAATTT+GGG 0.258870 1:-93051521 None:intergenic
CATGCCTCAACTTATGTTCT+TGG 0.261865 1:+93055576 MsG0180005541.01.T01:CDS
GTTCCTAGATTTAGTTGGTT+TGG 0.262478 1:+93056445 MsG0180005541.01.T01:three_prime_UTR
GGCTATGCACTTACTCCTTA+TGG 0.263525 1:+93055139 MsG0180005541.01.T01:CDS
TTCCTAGATTTAGTTGGTTT+GGG 0.285855 1:+93056446 MsG0180005541.01.T01:three_prime_UTR
CTTTCATCAACTGCTTTGAT+TGG 0.286483 1:-93054748 None:intergenic
ATCCATTACCTGTATTGATT+TGG 0.288849 1:+93055934 MsG0180005541.01.T01:CDS
AAGTTGCTTCAGCTTTGATA+TGG 0.296325 1:-93051352 None:intergenic
CTAGACGTCCGTGCATATTC+AGG 0.302458 1:-93055618 None:intergenic
GGCAGCATTCCTCCAGAAAT+TGG 0.305772 1:+93054006 MsG0180005541.01.T01:CDS
ACCCAATTTCCACATAATAA+AGG 0.309195 1:-93054514 None:intergenic
TTGCCAATGCTTTCTGGAAT+AGG 0.310440 1:-93052079 None:intergenic
AGATCCCTCAAGGTGATTAT+TGG 0.313852 1:-93053151 None:intergenic
AGGTCCGTTGTCCGCTGAAT+TGG 0.313965 1:+93053822 MsG0180005541.01.T01:CDS
TAAACTTGTCATTCTTCATA+TGG 0.316051 1:+93054888 MsG0180005541.01.T01:CDS
GGGACAGCACCACAGAAAAT+TGG 0.316294 1:+93056132 MsG0180005541.01.T01:CDS
GGTGAAATTCCGAATGAGTT+TGG 0.326879 1:+93053009 MsG0180005541.01.T01:CDS
AAACCAGATAACTGGCAAAT+AGG 0.335439 1:-93051913 None:intergenic
CATCAACTGCTTTGATTGGA+TGG 0.336546 1:-93054744 None:intergenic
AAATAGAAAGGATGGCCATT+TGG 0.339236 1:+93056361 MsG0180005541.01.T01:three_prime_UTR
TGAAGAAATCCAATGTTATA+AGG 0.346224 1:-93052259 None:intergenic
GATGTCCCTGTGAACAATTC+GGG 0.356218 1:-93055466 None:intergenic
GGTCCGTTGTCCGCTGAATT+GGG 0.357125 1:+93053823 MsG0180005541.01.T01:CDS
CCACAGTTCCCAATTTCATC+TGG 0.361288 1:-93051166 None:intergenic
AATAGAAAGGATGGCCATTT+GGG 0.363755 1:+93056362 MsG0180005541.01.T01:three_prime_UTR
TTTCTTAAATCACCAATTGC+TGG 0.364140 1:-93050855 None:intergenic
ACTTACAGAGTCTTAAGGTT+TGG 0.372278 1:-93051529 None:intergenic
GTGAAATTCCGAATGAGTTT+GGG 0.372675 1:+93053010 MsG0180005541.01.T01:CDS
ATATCATATAATCAGATTAC+TGG 0.374336 1:+93052229 MsG0180005541.01.T01:CDS
TCCTTTATTATGTGGAAATT+GGG 0.376222 1:+93054513 MsG0180005541.01.T01:CDS
TGCATCAAACCAATCACTTC+TGG 0.382919 1:-93052518 None:intergenic
TGATGTCCCTGTGAACAATT+CGG 0.383538 1:-93055467 None:intergenic
CGATTCCAACTTGCATCAAT+TGG 0.383555 1:+93055719 MsG0180005541.01.T01:CDS
CACTGAAGGTAAAACTTGAT+TGG 0.385630 1:+93055376 MsG0180005541.01.T01:CDS
ATATGAAGAATGACAAGTTT+AGG 0.387640 1:-93054886 None:intergenic
TTTGCCAGTTATCTGGTTTG+TGG 0.389271 1:+93051917 MsG0180005541.01.T01:CDS
TGAGAACTTACAGAGTCTTA+AGG 0.391011 1:-93051534 None:intergenic
CTCAGTGAGAAATTTATCAT+AGG 0.395430 1:+93054956 MsG0180005541.01.T01:CDS
ATGGATTGGCAATACACATT+TGG 0.396369 1:+93054907 MsG0180005541.01.T01:CDS
AGCTGACAACAAACTTTACT+TGG 0.400504 1:-93056068 None:intergenic
AGATACCAAGGCTACTCTAT+TGG 0.402698 1:+93051741 MsG0180005541.01.T01:CDS
ATTGGAAATCCTTTATTATG+TGG 0.403593 1:+93054505 MsG0180005541.01.T01:CDS
CCTTATATTCCTAAATCAAA+AGG 0.409110 1:+93054553 MsG0180005541.01.T01:CDS
AGCCAAATCAATACAGGTAA+TGG 0.419227 1:-93055936 None:intergenic
GCTGAGTCAGAGAGAGCTCT+TGG 0.422428 1:-93056227 None:intergenic
AACAATAGAAAGAAAGCTTA+AGG 0.423102 1:+93056392 MsG0180005541.01.T01:three_prime_UTR
CAGCTGATTTAAGGCTGTGC+AGG 0.424966 1:-93053193 None:intergenic
TGGGATAACGTGGAAGGAAT+AGG 0.426475 1:-93051502 None:intergenic
CTGGAGGAATGCTGCCTGAC+AGG 0.427820 1:-93053999 None:intergenic
AAATCAGATGTCTATAGCTT+TGG 0.429569 1:+93055651 MsG0180005541.01.T01:CDS
TCTAGATAACCAACAGATGC+TGG 0.429592 1:-93053657 None:intergenic
ACATGGCAAATGGCTCGCTC+TGG 0.430139 1:+93055182 MsG0180005541.01.T01:CDS
TCAAGCTTCCCAAACTCATT+CGG 0.430405 1:-93053018 None:intergenic
AGTACCACAAACCAGATAAC+TGG 0.430666 1:-93051921 None:intergenic
TACAATCGCTTGACTGCAAT+GGG 0.432938 1:-93055028 None:intergenic
TTGCAAGGGAATAAACTAAC+TGG 0.439614 1:+93051136 MsG0180005541.01.T01:CDS
TTTGCTTGATGAGAACTTTG+AGG 0.440448 1:+93055503 MsG0180005541.01.T01:CDS
ATTAAGACAAAAGTTAATGA+AGG 0.448061 1:+93056276 MsG0180005541.01.T01:three_prime_UTR
GGCTAGCGCATGAAGTAGCC+AGG 0.452709 1:+93056018 MsG0180005541.01.T01:CDS
CTTGCTCGAAATAAGCTCAT+AGG 0.455547 1:+93051716 MsG0180005541.01.T01:CDS
ACTGAAGGTAAAACTTGATT+GGG 0.455784 1:+93055377 MsG0180005541.01.T01:CDS
GTCAAATCCCAGATGAAATT+GGG 0.456491 1:+93051158 MsG0180005541.01.T01:CDS
ACAATTTGTCTAATGCTCAA+TGG 0.456691 1:+93056179 MsG0180005541.01.T01:CDS
CTGAATATGCACGGACGTCT+AGG 0.459752 1:+93055619 MsG0180005541.01.T01:CDS
GAAACGGAGCTTGAAACAAT+TGG 0.460274 1:+93055082 MsG0180005541.01.T01:CDS
TTGAGTCATAACCATCTTGA+AGG 0.461101 1:+93053802 MsG0180005541.01.T01:CDS
TTGTCATTCTTCATATGGAT+TGG 0.463038 1:+93054893 MsG0180005541.01.T01:CDS
TTCAGCTTTGATATGGAGAA+AGG 0.466364 1:-93051345 None:intergenic
CTTTGAAGTTATTTGCAGAA+AGG 0.467368 1:-93053467 None:intergenic
TCGCTTGACTGCAATGGGTC+GGG 0.467968 1:-93055023 None:intergenic
TACCCAAACCAACTAAATCT+AGG 0.474941 1:-93056448 None:intergenic
CAAACTTTACTTGGAGGTTG+AGG 0.476178 1:-93056059 None:intergenic
GCAATTGAATGATAATCATC+TGG 0.476208 1:+93052984 MsG0180005541.01.T01:CDS
TATTGTTCTATAAACCCAAA+TGG 0.477539 1:-93056376 None:intergenic
TATCATCACATTATTGGCTA+TGG 0.477813 1:+93054700 MsG0180005541.01.T01:CDS
CACTTGTTCCTAGATTTAGT+TGG 0.481234 1:+93056440 MsG0180005541.01.T01:three_prime_UTR
ATGTCTTTCAACAACCTGTC+AGG 0.487618 1:+93053985 MsG0180005541.01.T01:CDS
GGGAAGATACCAGAAGTGAT+TGG 0.488621 1:+93052509 MsG0180005541.01.T01:CDS
AGTGGAAAGACTGAAACAAT+TGG 0.490561 1:-93054252 None:intergenic
CACAGTTCCCAATTTCATCT+GGG 0.491930 1:-93051165 None:intergenic
GAGAAATTTATCATAGGGTA+TGG 0.491991 1:+93054962 MsG0180005541.01.T01:CDS
AAGCAGTTGATGAAAGGATC+TGG 0.492042 1:+93054755 MsG0180005541.01.T01:CDS
TGACAACAAACTTTACTTGG+AGG 0.492827 1:-93056065 None:intergenic
TGACCGGTGATATGGTTGTA+TGG 0.494504 1:+93056513 MsG0180005541.01.T01:three_prime_UTR
TCATTCCAATAGAGTAGCCT+TGG 0.495013 1:-93051746 None:intergenic
TAGTTATGCAGGTACCTTCA+CGG 0.498604 1:+93052829 MsG0180005541.01.T01:intron
GGGGAGATTCCTTATAACAT+TGG 0.500231 1:+93052250 MsG0180005541.01.T01:CDS
GCAGTTATATGTCTCACTCT+TGG 0.502836 1:+93054677 MsG0180005541.01.T01:CDS
TATAATCTTAACAAATAGAA+AGG 0.505708 1:+93056349 MsG0180005541.01.T01:three_prime_UTR
ATTTCCAACATAAACACATA+AGG 0.505808 1:-93056554 None:intergenic
GACATGAGCCAAATCAATAC+AGG 0.506126 1:-93055942 None:intergenic
TTGCTCTGCTTTGCACAAGA+AGG 0.507309 1:+93055981 MsG0180005541.01.T01:CDS
AGGAATATACCAGTCGAGTT+GGG 0.508100 1:+93053488 MsG0180005541.01.T01:CDS
AGGCGGATAGTAACACTGTA+TGG 0.510011 1:+93055892 MsG0180005541.01.T01:CDS
CTTGCCAATAATCACCTTGA+GGG 0.510626 1:+93053147 MsG0180005541.01.T01:CDS
TTTAGACATATTGCCAAGCT+CGG 0.512852 1:-93052878 None:intergenic
TATCATATAATCAGATTACT+GGG 0.514707 1:+93052230 MsG0180005541.01.T01:CDS
GGTTCAATACCTCCCGAGCT+TGG 0.521880 1:+93052865 MsG0180005541.01.T01:CDS
AAGGAATATACCAGTCGAGT+TGG 0.522021 1:+93053487 MsG0180005541.01.T01:CDS
TTAGACATATTGCCAAGCTC+GGG 0.525454 1:-93052877 None:intergenic
TACAGTGTTACTATCCGCCT+TGG 0.528038 1:-93055889 None:intergenic
TCAGTGAGAAATTTATCATA+GGG 0.529030 1:+93054957 MsG0180005541.01.T01:CDS
CTTTCTGCAAATAACTTCAA+AGG 0.529536 1:+93053468 MsG0180005541.01.T01:CDS
ATACAGGTAATGGATACCTC+TGG 0.532063 1:-93055926 None:intergenic
ATCGCTTGACTGCAATGGGT+CGG 0.532758 1:-93055024 None:intergenic
GGAATTTGGGATAACGTGGA+AGG 0.533373 1:-93051508 None:intergenic
AACACCTTATGTGTTTATGT+TGG 0.534315 1:+93056550 MsG0180005541.01.T01:three_prime_UTR
GACAAATTGTTATCCTGCTG+AGG 0.536528 1:-93056166 None:intergenic
GTACAATCGCTTGACTGCAA+TGG 0.537263 1:-93055029 None:intergenic
TTATTATGTGGAAATTGGGT+AGG 0.537470 1:+93054517 MsG0180005541.01.T01:CDS
TGGCAAGACGAGGCAAGGTA+TGG 0.537593 1:+93054775 MsG0180005541.01.T01:CDS
CATGGCAAATGGCTCGCTCT+GGG 0.538901 1:+93055183 MsG0180005541.01.T01:CDS
TTGAAGAACAATCAGTTGAC+TGG 0.539345 1:+93051478 MsG0180005541.01.T01:CDS
CATGCGCTAGCCCTCTCAGA+AGG 0.541231 1:-93056007 None:intergenic
GTAACACTGTATGGAGGCTG+TGG 0.541579 1:+93055901 MsG0180005541.01.T01:CDS
GGATGGACAACAACCTCAGC+AGG 0.541918 1:+93056153 MsG0180005541.01.T01:CDS
TCAAATTCTCTTAAATTGTG+AGG 0.543940 1:-93055061 None:intergenic
ATTGCTGTTGGAGCCGCTGA+AGG 0.545160 1:+93055414 MsG0180005541.01.T01:CDS
AGAAATCTTGTCACATTGCA+TGG 0.547037 1:+93055118 MsG0180005541.01.T01:CDS
ATCTTAACAAATAGAAAGGA+TGG 0.549893 1:+93056353 MsG0180005541.01.T01:three_prime_UTR
ATGATATGACCCAACTCGAC+TGG 0.550887 1:-93053497 None:intergenic
CTAGATAACCAACAGATGCT+GGG 0.551157 1:-93053656 None:intergenic
GTCAGAGGCAATAATTTGAC+TGG 0.553031 1:+93052055 MsG0180005541.01.T01:CDS
TCAAGGTTGCGAAAGGTCGT+TGG 0.558413 1:-93053344 None:intergenic
ACATACCAATTGATGCAAGT+TGG 0.559670 1:-93055724 None:intergenic
CAATCAAAGCAGTTGATGAA+AGG 0.560965 1:+93054749 MsG0180005541.01.T01:CDS
GTCCGTTGTCCGCTGAATTG+GGG 0.562128 1:+93053824 MsG0180005541.01.T01:CDS
TTGAACAACAATGATCTGCA+TGG 0.563670 1:+93054209 MsG0180005541.01.T01:CDS
AGAGCTACTTACTGGGAAGA+AGG 0.565229 1:+93055686 MsG0180005541.01.T01:CDS
TTGATTGGGAAACACGGATG+AGG 0.566647 1:+93055391 MsG0180005541.01.T01:CDS
TGCAGCTGTCCAATTTCTGG+AGG 0.567144 1:-93054015 None:intergenic
GTGCAGGAGCTGATGTTATG+TGG 0.567520 1:-93053177 None:intergenic
AGGTGCATAGTCAAAACTCT+TGG 0.569427 1:-93056095 None:intergenic
TTAAGACAAAAGTTAATGAA+GGG 0.570136 1:+93056277 MsG0180005541.01.T01:three_prime_UTR
TTGCGAGGGAACATGTTGAC+TGG 0.573185 1:+93051880 MsG0180005541.01.T01:CDS
CGCGTGAAGTTCTTTGAAGA+CGG 0.574769 1:-93054388 None:intergenic
ATGTCCCTGTGAACAATTCG+GGG 0.579274 1:-93055465 None:intergenic
GTTTGGAATTTGGGATAACG+TGG 0.580895 1:-93051512 None:intergenic
CAATTTAAGAGAATTTGAAA+CGG 0.580977 1:+93055066 MsG0180005541.01.T01:CDS
GGATCTGGCAAGACGAGGCA+AGG 0.581414 1:+93054770 MsG0180005541.01.T01:CDS
ACACGGATGAGGATTGCTGT+TGG 0.582331 1:+93055402 MsG0180005541.01.T01:CDS
GACATATTGCCAAGCTCGGG+AGG 0.584782 1:-93052874 None:intergenic
TGAACAACAATGATCTGCAT+GGG 0.587179 1:+93054210 MsG0180005541.01.T01:CDS
CAGCACCACAGAAAATTGGA+TGG 0.590054 1:+93056136 MsG0180005541.01.T01:CDS
GGTGAGATATCACCAGCAAT+TGG 0.590876 1:+93050843 MsG0180005541.01.T01:CDS
GGACACGTCCCAGCATCTGT+TGG 0.597895 1:+93053648 MsG0180005541.01.T01:CDS
CTTCACGGAAACATGCTCAC+TGG 0.605074 1:+93052844 MsG0180005541.01.T01:CDS
GGTCCTATTCCAGAAAGCAT+TGG 0.605681 1:+93052076 MsG0180005541.01.T01:CDS
CGGACAACGGACCTTCAAGA+TGG 0.609779 1:-93053813 None:intergenic
ACTTACTGGGAAGAAGGCAG+TGG 0.609980 1:+93055692 MsG0180005541.01.T01:CDS
TCGCTCTGGGATCTTCTACA+TGG 0.612904 1:+93055196 MsG0180005541.01.T01:CDS
ATGCGCTAGCCCTCTCAGAA+GGG 0.614294 1:-93056006 None:intergenic
ACACCATACAACCATATCAC+CGG 0.615806 1:-93056516 None:intergenic
GGTAATGACAGAGATTTGCA+AGG 0.616830 1:+93051121 MsG0180005541.01.T01:intron
GCAAAGCAGAGCAAGTTGAA+AGG 0.620784 1:-93055972 None:intergenic
TGAAGAATGACAAGTTTAGG+AGG 0.621173 1:-93054883 None:intergenic
CAGACTCTCAAGGTTGCGAA+AGG 0.624229 1:-93053351 None:intergenic
GCTAGCGCATGAAGTAGCCA+GGG 0.625465 1:+93056019 MsG0180005541.01.T01:CDS
AAGAAGGAACCCTTCTGAGA+GGG 0.625597 1:+93055997 MsG0180005541.01.T01:CDS
TTCCCCAATTCAGCGGACAA+CGG 0.627130 1:-93053826 None:intergenic
GTTTGACACAGGTCCACTGA+AGG 0.628857 1:+93055362 MsG0180005541.01.T01:intron
AGCTCATAGGAGAGATACCA+AGG 0.629172 1:+93051729 MsG0180005541.01.T01:CDS
GTAATGACAGAGATTTGCAA+GGG 0.631602 1:+93051122 MsG0180005541.01.T01:intron
CAGTGAGCATGTTTCCGTGA+AGG 0.632160 1:-93052843 None:intergenic
ATTGAATGATAATCATCTGG+TGG 0.632386 1:+93052987 MsG0180005541.01.T01:CDS
ACAAGTAAGTCAGACTCTCA+AGG 0.637612 1:-93053361 None:intergenic
TCTTGCCAATAATCACCTTG+AGG 0.639026 1:+93053146 MsG0180005541.01.T01:CDS
TAAAACTTGATTGGGAAACA+CGG 0.640518 1:+93055385 MsG0180005541.01.T01:CDS
CAATGATGCAGTGGATTGCG+AGG 0.640592 1:+93051865 MsG0180005541.01.T01:intron
GTGCATGGAAATCAGTTAAG+CGG 0.644477 1:+93053314 MsG0180005541.01.T01:CDS
TCTGAGATTCCCCAATTCAG+CGG 0.648172 1:-93053833 None:intergenic
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CRISPR-GE

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! TTCTTTATTACTTATTGTGC+TGG + Chr1:93051232-93051251 MsG0180005541.01.T01:intron 25.0%
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ACCCAATTTCCACATAATAA+AGG - Chr1:93054517-93054536 None:intergenic 30.0%
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GTTTGTGAAATGAAATCCAT+TGG + Chr1:93054575-93054594 MsG0180005541.01.T01:intron 30.0%
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! TTCCTAGATTTAGTTGGTTT+GGG + Chr1:93056446-93056465 MsG0180005541.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
! TTTGAGTTTCACTTCCATAA+TGG + Chr1:93052651-93052670 MsG0180005541.01.T01:intron 30.0%
! TTTTATGAGTACATGGCAAA+TGG + Chr1:93055172-93055191 MsG0180005541.01.T01:CDS 30.0%
!! AAAAATGTCTTGTTTGACAC+AGG + Chr1:93055351-93055370 MsG0180005541.01.T01:intron 30.0%
!! ATCCATTACCTGTATTGATT+TGG + Chr1:93055934-93055953 MsG0180005541.01.T01:CDS 30.0%
!! CTTTGAAGTTATTTGCAGAA+AGG - Chr1:93053470-93053489 None:intergenic 30.0%
!! TCTCTCATACTTTTGATTGA+AGG + Chr1:93050921-93050940 MsG0180005541.01.T01:intron 30.0%
!! TGAAGTATTGCAATATCTGT+AGG + Chr1:93051766-93051785 MsG0180005541.01.T01:intron 30.0%
!!! ATTGACACTTATTTTGTGAC+CGG + Chr1:93056497-93056516 MsG0180005541.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
!!! GTAGATATTTTCTGATTTGG+AGG + Chr1:93053879-93053898 MsG0180005541.01.T01:intron 30.0%
!!! TCTCCTTTTTTATGAGTACA+TGG + Chr1:93055165-93055184 MsG0180005541.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTTCTTTTTAGGTCACTTCA+AGG + Chr1:93052473-93052492 MsG0180005541.01.T01:intron 30.0%
AAACCAGATAACTGGCAAAT+AGG - Chr1:93051916-93051935 None:intergenic 35.0%
AAATAGAAAGGATGGCCATT+TGG + Chr1:93056361-93056380 MsG0180005541.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
AAGTTGTTTATCCTAGTGGA+TGG + Chr1:93053923-93053942 MsG0180005541.01.T01:intron 35.0%
AATAGAAAGGATGGCCATTT+GGG + Chr1:93056362-93056381 MsG0180005541.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
ACACTTGTATACAGTACTAG+AGG - Chr1:93054990-93055009 None:intergenic 35.0%
ACATACCAATTGATGCAAGT+TGG - Chr1:93055727-93055746 None:intergenic 35.0%
ACTTACAGAGTCTTAAGGTT+TGG - Chr1:93051532-93051551 None:intergenic 35.0%
AGAAATCTTGTCACATTGCA+TGG + Chr1:93055118-93055137 MsG0180005541.01.T01:CDS 35.0%
AGCCAAATCAATACAGGTAA+TGG - Chr1:93055939-93055958 None:intergenic 35.0%
AGCTGACAACAAACTTTACT+TGG - Chr1:93056071-93056090 None:intergenic 35.0%
AGGATCCAAAATAGCCATTA+TGG - Chr1:93052668-93052687 None:intergenic 35.0%
AGTGGAAAGACTGAAACAAT+TGG - Chr1:93054255-93054274 None:intergenic 35.0%
AGTTCCAAGAACATAAGTTG+AGG - Chr1:93055583-93055602 None:intergenic 35.0%
ATAAAACGTACAGAGATGCA+AGG - Chr1:93054044-93054063 None:intergenic 35.0%
ATCGAGTTATGAATCACGAT+AGG - Chr1:93056258-93056277 None:intergenic 35.0%
CACTGAAGGTAAAACTTGAT+TGG + Chr1:93055376-93055395 MsG0180005541.01.T01:CDS 35.0%
CACTTGTTCCTAGATTTAGT+TGG + Chr1:93056440-93056459 MsG0180005541.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
CATATTGACAGTCTCAAAGA+GGG + Chr1:93052379-93052398 MsG0180005541.01.T01:intron 35.0%
CTTTCATCAACTGCTTTGAT+TGG - Chr1:93054751-93054770 None:intergenic 35.0%
GATTTGAGTGAGAATCAGTT+AGG + Chr1:93052702-93052721 MsG0180005541.01.T01:intron 35.0%
GTAATGACAGAGATTTGCAA+GGG + Chr1:93051122-93051141 MsG0180005541.01.T01:intron 35.0%
GTCAAATCCCAGATGAAATT+GGG + Chr1:93051158-93051177 MsG0180005541.01.T01:CDS 35.0%
GTGAAATTCCGAATGAGTTT+GGG + Chr1:93053010-93053029 MsG0180005541.01.T01:CDS 35.0%
GTGATTAATCGAATGCTACT+TGG + Chr1:93054797-93054816 MsG0180005541.01.T01:intron 35.0%
GTTCCTAGATTTAGTTGGTT+TGG + Chr1:93056445-93056464 MsG0180005541.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
TACCCAAACCAACTAAATCT+AGG - Chr1:93056451-93056470 None:intergenic 35.0%
TCATATTGACAGTCTCAAAG+AGG + Chr1:93052378-93052397 MsG0180005541.01.T01:intron 35.0%
TGAACAACAATGATCTGCAT+GGG + Chr1:93054210-93054229 MsG0180005541.01.T01:CDS 35.0%
TGAAGAATGACAAGTTTAGG+AGG - Chr1:93054886-93054905 None:intergenic 35.0%
TGACAACAAACTTTACTTGG+AGG - Chr1:93056068-93056087 None:intergenic 35.0%
TGAGAACTTACAGAGTCTTA+AGG - Chr1:93051537-93051556 None:intergenic 35.0%
TTGAACAACAATGATCTGCA+TGG + Chr1:93054209-93054228 MsG0180005541.01.T01:CDS 35.0%
TTGAAGAACAATCAGTTGAC+TGG + Chr1:93051478-93051497 MsG0180005541.01.T01:CDS 35.0%
TTGAGTCATAACCATCTTGA+AGG + Chr1:93053802-93053821 MsG0180005541.01.T01:CDS 35.0%
TTGCAAGGGAATAAACTAAC+TGG + Chr1:93051136-93051155 MsG0180005541.01.T01:CDS 35.0%
TTGCCTGGAAAAATTAAGCT+TGG - Chr1:93052968-93052987 None:intergenic 35.0%
TTTAGACATATTGCCAAGCT+CGG - Chr1:93052881-93052900 None:intergenic 35.0%
TTTCCAAGTATAGGAGGAAT+CGG - Chr1:93052731-93052750 None:intergenic 35.0%
TTTGAGTGAGAATCAGTTAG+GGG + Chr1:93052704-93052723 MsG0180005541.01.T01:intron 35.0%
TTTGCTTGATGAGAACTTTG+AGG + Chr1:93055503-93055522 MsG0180005541.01.T01:CDS 35.0%
! AAGTTGCTTCAGCTTTGATA+TGG - Chr1:93051355-93051374 None:intergenic 35.0%
! AGAAGCGCAAAAATCATAAC+AGG - Chr1:93054289-93054308 None:intergenic 35.0%
! CAATCAAGTTTTACCTTCAG+TGG - Chr1:93055378-93055397 None:intergenic 35.0%
! CACTTCCATAATGGCTATTT+TGG + Chr1:93052660-93052679 MsG0180005541.01.T01:intron 35.0%
! GAGTCTTAAGGTTTGGAATT+TGG - Chr1:93051525-93051544 None:intergenic 35.0%
! TTCAGCTTTGATATGGAGAA+AGG - Chr1:93051348-93051367 None:intergenic 35.0%
! TTCTTTTGCAGTAATGTGCA+TGG + Chr1:93053299-93053318 MsG0180005541.01.T01:intron 35.0%
! TTTTCAGATATTGTCCAAGG+CGG + Chr1:93055875-93055894 MsG0180005541.01.T01:intron 35.0%
! TTTTGCTAGAGCTACTTACT+GGG + Chr1:93055679-93055698 MsG0180005541.01.T01:CDS 35.0%
!! ACATGTGTCAGTGTTATTTC+GGG - Chr1:93050958-93050977 None:intergenic 35.0%
!! ATGGATTGGCAATACACATT+TGG + Chr1:93054907-93054926 MsG0180005541.01.T01:CDS 35.0%
!! CAATCAAAGCAGTTGATGAA+AGG + Chr1:93054749-93054768 MsG0180005541.01.T01:CDS 35.0%
!! GACATGTGTCAGTGTTATTT+CGG - Chr1:93050959-93050978 None:intergenic 35.0%
!! TGATTTTTCAGTGATGTCAG+AGG + Chr1:93052040-93052059 MsG0180005541.01.T01:intron 35.0%
!! TTATTTTGTGACCGGTGATA+TGG + Chr1:93056505-93056524 MsG0180005541.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
!!! CTCAATGGTTTGTTCGTTTT+GGG + Chr1:93056194-93056213 MsG0180005541.01.T01:CDS 35.0%
!!! TCAATGGTTTGTTCGTTTTG+GGG + Chr1:93056195-93056214 MsG0180005541.01.T01:CDS 35.0%
!!! TCTAAGCGTTTTAGTTATGC+AGG + Chr1:93052818-93052837 MsG0180005541.01.T01:intron 35.0%
AAACAATTGGTGAGCTGTTC+TGG - Chr1:93054242-93054261 None:intergenic 40.0%
AAGATAAGCAAGTCCTTCAG+CGG - Chr1:93055430-93055449 None:intergenic 40.0%
AAGGAATATACCAGTCGAGT+TGG + Chr1:93053487-93053506 MsG0180005541.01.T01:CDS 40.0%
AAGTAGTGAAATAAGCACCC+TGG - Chr1:93056039-93056058 None:intergenic 40.0%
ACAAGTAAGTCAGACTCTCA+AGG - Chr1:93053364-93053383 None:intergenic 40.0%
ACACCATACAACCATATCAC+CGG - Chr1:93056519-93056538 None:intergenic 40.0%
ACATCGATCCTGAATATGCA+CGG + Chr1:93055610-93055629 MsG0180005541.01.T01:CDS 40.0%
ACTAAATTCCCCACAACAGT+TGG - Chr1:93053238-93053257 None:intergenic 40.0%
AGATACCAAGGCTACTCTAT+TGG + Chr1:93051741-93051760 MsG0180005541.01.T01:CDS 40.0%
AGATCCCTCAAGGTGATTAT+TGG - Chr1:93053154-93053173 None:intergenic 40.0%
AGGAATATACCAGTCGAGTT+GGG + Chr1:93053488-93053507 MsG0180005541.01.T01:CDS 40.0%
AGGTGCATAGTCAAAACTCT+TGG - Chr1:93056098-93056117 None:intergenic 40.0%
AGTACCACAAACCAGATAAC+TGG - Chr1:93051924-93051943 None:intergenic 40.0%
ATGTCTTTCAACAACCTGTC+AGG + Chr1:93053985-93054004 MsG0180005541.01.T01:CDS 40.0%
CAAACTTTACTTGGAGGTTG+AGG - Chr1:93056062-93056081 None:intergenic 40.0%
CAAATCCCTACAACAATGCA+AGG - Chr1:93052688-93052707 None:intergenic 40.0%
CACAGTTCCCAATTTCATCT+GGG - Chr1:93051168-93051187 None:intergenic 40.0%
CATCAACTGCTTTGATTGGA+TGG - Chr1:93054747-93054766 None:intergenic 40.0%
CATGCCTCAACTTATGTTCT+TGG + Chr1:93055576-93055595 MsG0180005541.01.T01:CDS 40.0%
CATGTGTAAACGTAACAAGC+GGG - Chr1:93051041-93051060 None:intergenic 40.0%
CGATTCCAACTTGCATCAAT+TGG + Chr1:93055719-93055738 MsG0180005541.01.T01:CDS 40.0%
CTAGATAACCAACAGATGCT+GGG - Chr1:93053659-93053678 None:intergenic 40.0%
CTTGCCAATAATCACCTTGA+GGG + Chr1:93053147-93053166 MsG0180005541.01.T01:CDS 40.0%
CTTGCTCGAAATAAGCTCAT+AGG + Chr1:93051716-93051735 MsG0180005541.01.T01:CDS 40.0%
CTTGGAAATCTGTCTTTCAC+CGG + Chr1:93052743-93052762 MsG0180005541.01.T01:intron 40.0%
GAAACGGAGCTTGAAACAAT+TGG + Chr1:93055082-93055101 MsG0180005541.01.T01:CDS 40.0%
GACAAATTGTTATCCTGCTG+AGG - Chr1:93056169-93056188 None:intergenic 40.0%
GACAGATTTCCAAGTATAGG+AGG - Chr1:93052737-93052756 None:intergenic 40.0%
GACATGAGCCAAATCAATAC+AGG - Chr1:93055945-93055964 None:intergenic 40.0%
GCAGTTATATGTCTCACTCT+TGG + Chr1:93054677-93054696 MsG0180005541.01.T01:CDS 40.0%
GCATGTGTAAACGTAACAAG+CGG - Chr1:93051042-93051061 None:intergenic 40.0%
GGGGAGATTCCTTATAACAT+TGG + Chr1:93052250-93052269 MsG0180005541.01.T01:CDS 40.0%
GGTAATGACAGAGATTTGCA+AGG + Chr1:93051121-93051140 MsG0180005541.01.T01:intron 40.0%
GGTCAAATCCCAGATGAAAT+TGG + Chr1:93051157-93051176 MsG0180005541.01.T01:CDS 40.0%
GGTGAAATTCCGAATGAGTT+TGG + Chr1:93053009-93053028 MsG0180005541.01.T01:CDS 40.0%
GTCAGAGGCAATAATTTGAC+TGG + Chr1:93052055-93052074 MsG0180005541.01.T01:CDS 40.0%
GTGAACTAGTCATCCAAACA+AGG - Chr1:93054102-93054121 None:intergenic 40.0%
GTGCATGGAAATCAGTTAAG+CGG + Chr1:93053314-93053333 MsG0180005541.01.T01:CDS 40.0%
GTTGTTGAAAGACATATCCC+TGG - Chr1:93053980-93053999 None:intergenic 40.0%
TAACAGGCATACTCACAAAG+TGG - Chr1:93054273-93054292 None:intergenic 40.0%
TAAGTAAGAGGCGACATACA+TGG - Chr1:93050889-93050908 None:intergenic 40.0%
TACAATCGCTTGACTGCAAT+GGG - Chr1:93055031-93055050 None:intergenic 40.0%
TAGTTATGCAGGTACCTTCA+CGG + Chr1:93052829-93052848 MsG0180005541.01.T01:intron 40.0%
TATGTGGAATAGATCCCTCA+AGG - Chr1:93053164-93053183 None:intergenic 40.0%
TCAAGCTTCCCAAACTCATT+CGG - Chr1:93053021-93053040 None:intergenic 40.0%
TCATTCCAATAGAGTAGCCT+TGG - Chr1:93051749-93051768 None:intergenic 40.0%
TCGACTCACTATTATGTGTC+AGG + Chr1:93053602-93053621 MsG0180005541.01.T01:intron 40.0%
TCTAGATAACCAACAGATGC+TGG - Chr1:93053660-93053679 None:intergenic 40.0%
TCTCCTATTTGCCAGTTATC+TGG + Chr1:93051910-93051929 MsG0180005541.01.T01:CDS 40.0%
TCTTGCCAATAATCACCTTG+AGG + Chr1:93053146-93053165 MsG0180005541.01.T01:CDS 40.0%
TGATGTCCCTGTGAACAATT+CGG - Chr1:93055470-93055489 None:intergenic 40.0%
TGCATCAAACCAATCACTTC+TGG - Chr1:93052521-93052540 None:intergenic 40.0%
TGGATCCTTGCATTGTTGTA+GGG + Chr1:93052680-93052699 MsG0180005541.01.T01:intron 40.0%
TTAGACATATTGCCAAGCTC+GGG - Chr1:93052880-93052899 None:intergenic 40.0%
TTGGATCCTTGCATTGTTGT+AGG + Chr1:93052679-93052698 MsG0180005541.01.T01:intron 40.0%
TTTGTCAAGCTTGAACCTTG+TGG + Chr1:93050822-93050841 MsG0180005541.01.T01:CDS 40.0%
! AGTTGAGGCATGAGTTTTTG+TGG - Chr1:93055568-93055587 None:intergenic 40.0%
! GTTGTCCATCCAATTTTCTG+TGG - Chr1:93056144-93056163 None:intergenic 40.0%
! GTTTGGAATTTGGGATAACG+TGG - Chr1:93051515-93051534 None:intergenic 40.0%
! GTTTTGCTAGAGCTACTTAC+TGG + Chr1:93055678-93055697 MsG0180005541.01.T01:CDS 40.0%
! TGTTTTGCACAATGATGCAG+TGG + Chr1:93051856-93051875 MsG0180005541.01.T01:intron 40.0%
! TTTGCCAGTTATCTGGTTTG+TGG + Chr1:93051917-93051936 MsG0180005541.01.T01:CDS 40.0%
!! AAGCAGTTGATGAAAGGATC+TGG + Chr1:93054755-93054774 MsG0180005541.01.T01:CDS 40.0%
!! AGGAAAAAAGGCTAGCTTGA+AGG - Chr1:93054829-93054848 None:intergenic 40.0%
!! ATACAGGTAATGGATACCTC+TGG - Chr1:93055929-93055948 None:intergenic 40.0%
!! TTGCCAATGCTTTCTGGAAT+AGG - Chr1:93052082-93052101 None:intergenic 40.0%
!!! GCTCAATGGTTTGTTCGTTT+TGG + Chr1:93056193-93056212 MsG0180005541.01.T01:CDS 40.0%
AGAGCTACTTACTGGGAAGA+AGG + Chr1:93055686-93055705 MsG0180005541.01.T01:CDS 45.0%
AGCTCATAGGAGAGATACCA+AGG + Chr1:93051729-93051748 MsG0180005541.01.T01:CDS 45.0%
AGGCGGATAGTAACACTGTA+TGG + Chr1:93055892-93055911 MsG0180005541.01.T01:CDS 45.0%
AGGGTTCCTTTCTTAGCGAA+TGG + Chr1:93052398-93052417 MsG0180005541.01.T01:intron 45.0%
ATGATATGACCCAACTCGAC+TGG - Chr1:93053500-93053519 None:intergenic 45.0%
ATGTCCCTGTGAACAATTCG+GGG - Chr1:93055468-93055487 None:intergenic 45.0%
CAGCACCACAGAAAATTGGA+TGG + Chr1:93056136-93056155 MsG0180005541.01.T01:CDS 45.0%
CCACAGTTCCCAATTTCATC+TGG - Chr1:93051169-93051188 None:intergenic 45.0%
CCAGATGAAATTGGGAACTG+TGG + Chr1:93051166-93051185 MsG0180005541.01.T01:CDS 45.0%
CGGATAGTAACACTGTATGG+AGG + Chr1:93055895-93055914 MsG0180005541.01.T01:CDS 45.0%
CGTCTTCAAAGAACTTCACG+CGG + Chr1:93054389-93054408 MsG0180005541.01.T01:CDS 45.0%
GATGTCCCTGTGAACAATTC+GGG - Chr1:93055469-93055488 None:intergenic 45.0%
GGAAACAAGACGAGTCATAC+AGG - Chr1:93051204-93051223 None:intergenic 45.0%
GGCTATGCACTTACTCCTTA+TGG + Chr1:93055139-93055158 MsG0180005541.01.T01:CDS 45.0%
GGGAAGATACCAGAAGTGAT+TGG + Chr1:93052509-93052528 MsG0180005541.01.T01:CDS 45.0%
GGTGAGATATCACCAGCAAT+TGG + Chr1:93050843-93050862 MsG0180005541.01.T01:CDS 45.0%
GTACAATCGCTTGACTGCAA+TGG - Chr1:93055032-93055051 None:intergenic 45.0%
GTACAGTTGCCAATGCTTTC+TGG - Chr1:93052088-93052107 None:intergenic 45.0%
TGACCGGTGATATGGTTGTA+TGG + Chr1:93056513-93056532 MsG0180005541.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
TGGGATAACGTGGAAGGAAT+AGG - Chr1:93051505-93051524 None:intergenic 45.0%
TTCTGCAGCTGTCCAATTTC+TGG - Chr1:93054021-93054040 None:intergenic 45.0%
TTGATTGGGAAACACGGATG+AGG + Chr1:93055391-93055410 MsG0180005541.01.T01:CDS 45.0%
TTGCTCTGCTTTGCACAAGA+AGG + Chr1:93055981-93056000 MsG0180005541.01.T01:CDS 45.0%
! AAGAAGGAACCCTTCTGAGA+GGG + Chr1:93055997-93056016 MsG0180005541.01.T01:CDS 45.0%
! AGGCATGAGTTTTTGTGGCT+GGG - Chr1:93055563-93055582 None:intergenic 45.0%
! CGCGTGAAGTTCTTTGAAGA+CGG - Chr1:93054391-93054410 None:intergenic 45.0%
! GCAAAGCAGAGCAAGTTGAA+AGG - Chr1:93055975-93055994 None:intergenic 45.0%
! GCACCTTTTGTTGCCGAAAA+GGG + Chr1:93056112-93056131 MsG0180005541.01.T01:CDS 45.0%
! GGAATTTGGGATAACGTGGA+AGG - Chr1:93051511-93051530 None:intergenic 45.0%
! GGTCCTATTCCAGAAAGCAT+TGG + Chr1:93052076-93052095 MsG0180005541.01.T01:CDS 45.0%
! GTGGGATTTTGCAGCTTCAT+TGG + Chr1:93054487-93054506 MsG0180005541.01.T01:intron 45.0%
! TACAGTGTTACTATCCGCCT+TGG - Chr1:93055892-93055911 None:intergenic 45.0%
! TCTGAGATTCCCCAATTCAG+CGG - Chr1:93053836-93053855 None:intergenic 45.0%
! TGCACCTTTTGTTGCCGAAA+AGG + Chr1:93056111-93056130 MsG0180005541.01.T01:CDS 45.0%
! TGTCCCTTTTCGGCAACAAA+AGG - Chr1:93056118-93056137 None:intergenic 45.0%
!! AATGATGCAGTGGATTGCGA+GGG + Chr1:93051866-93051885 MsG0180005541.01.T01:intron 45.0%
!!! ATCTCCGCAATGCTGCTTTT+GGG + Chr1:93055323-93055342 MsG0180005541.01.T01:intron 45.0%
!!! TATCTCCGCAATGCTGCTTT+TGG + Chr1:93055322-93055341 MsG0180005541.01.T01:intron 45.0%
!!! TTTTATTTTATTTTTTCATT+TGG + Chr1:93051427-93051446 MsG0180005541.01.T01:intron 5.0%
ACACGGATGAGGATTGCTGT+TGG + Chr1:93055402-93055421 MsG0180005541.01.T01:CDS 50.0%
ACTTACTGGGAAGAAGGCAG+TGG + Chr1:93055692-93055711 MsG0180005541.01.T01:CDS 50.0%
AGCACCCAAAAGCAGCATTG+CGG - Chr1:93055330-93055349 None:intergenic 50.0%
AGCACTAGCCAACTGTTGTG+GGG + Chr1:93053227-93053246 MsG0180005541.01.T01:intron 50.0%
ATCGCTTGACTGCAATGGGT+CGG - Chr1:93055027-93055046 None:intergenic 50.0%
CAACCCCCGAATTGTTCACA+GGG + Chr1:93055461-93055480 MsG0180005541.01.T01:CDS 50.0%
CAAGAAGGAACCCTTCTGAG+AGG + Chr1:93055996-93056015 MsG0180005541.01.T01:CDS 50.0%
CAGACTCTCAAGGTTGCGAA+AGG - Chr1:93053354-93053373 None:intergenic 50.0%
CAGTGAGCATGTTTCCGTGA+AGG - Chr1:93052846-93052865 None:intergenic 50.0%
CTAGACGTCCGTGCATATTC+AGG - Chr1:93055621-93055640 None:intergenic 50.0%
CTGAATATGCACGGACGTCT+AGG + Chr1:93055619-93055638 MsG0180005541.01.T01:CDS 50.0%
CTTCACGGAAACATGCTCAC+TGG + Chr1:93052844-93052863 MsG0180005541.01.T01:CDS 50.0%
GAGCACTAGCCAACTGTTGT+GGG + Chr1:93053226-93053245 MsG0180005541.01.T01:intron 50.0%
GCTGGTGATATCTCACCACA+AGG - Chr1:93050840-93050859 None:intergenic 50.0%
GGCAGCATTCCTCCAGAAAT+TGG + Chr1:93054006-93054025 MsG0180005541.01.T01:CDS 50.0%
GGGACAGCACCACAGAAAAT+TGG + Chr1:93056132-93056151 MsG0180005541.01.T01:CDS 50.0%
GTAACACTGTATGGAGGCTG+TGG + Chr1:93055901-93055920 MsG0180005541.01.T01:CDS 50.0%
GTGCAGGAGCTGATGTTATG+TGG - Chr1:93053180-93053199 None:intergenic 50.0%
GTTTGACACAGGTCCACTGA+AGG + Chr1:93055362-93055381 MsG0180005541.01.T01:intron 50.0%
TCAAGGTTGCGAAAGGTCGT+TGG - Chr1:93053347-93053366 None:intergenic 50.0%
TCGCAGTGCCAAAATCAGAG+AGG - Chr1:93055533-93055552 None:intergenic 50.0%
TCGTCGCCATTCGCTAAGAA+AGG - Chr1:93052407-93052426 None:intergenic 50.0%
TGAAAGGATCTGGCAAGACG+AGG + Chr1:93054765-93054784 MsG0180005541.01.T01:CDS 50.0%
TGTCCCTGTGAACAATTCGG+GGG - Chr1:93055467-93055486 None:intergenic 50.0%
TTCCCCAATTCAGCGGACAA+CGG - Chr1:93053829-93053848 None:intergenic 50.0%
TTGCGAGGGAACATGTTGAC+TGG + Chr1:93051880-93051899 MsG0180005541.01.T01:CDS 50.0%
! AGAGCACTAGCCAACTGTTG+TGG + Chr1:93053225-93053244 MsG0180005541.01.T01:intron 50.0%
! CAGCTGATTTAAGGCTGTGC+AGG - Chr1:93053196-93053215 None:intergenic 50.0%
! GAGGCATGAGTTTTTGTGGC+TGG - Chr1:93055564-93055583 None:intergenic 50.0%
! GAGGCTCACCTCTCTGATTT+TGG + Chr1:93055522-93055541 MsG0180005541.01.T01:CDS 50.0%
! GGACCGATTCCTCCTATACT+TGG + Chr1:93052725-93052744 MsG0180005541.01.T01:intron 50.0%
! TGCAGCTGTCCAATTTCTGG+AGG - Chr1:93054018-93054037 None:intergenic 50.0%
!! CAATGATGCAGTGGATTGCG+AGG + Chr1:93051865-93051884 MsG0180005541.01.T01:intron 50.0%
!! TCGCTCTGGGATCTTCTACA+TGG + Chr1:93055196-93055215 MsG0180005541.01.T01:CDS 50.0%
!!! TCTGTGGTGCTGTCCCTTTT+CGG - Chr1:93056128-93056147 None:intergenic 50.0%
ACATGGCAAATGGCTCGCTC+TGG + Chr1:93055182-93055201 MsG0180005541.01.T01:CDS 55.0%
AGGTCCGTTGTCCGCTGAAT+TGG + Chr1:93053822-93053841 MsG0180005541.01.T01:CDS 55.0%
ATGCGCTAGCCCTCTCAGAA+GGG - Chr1:93056009-93056028 None:intergenic 55.0%
CAATTCGGGGGTTGCAGTCA+TGG - Chr1:93055455-93055474 None:intergenic 55.0%
CATGGCAAATGGCTCGCTCT+GGG + Chr1:93055183-93055202 MsG0180005541.01.T01:CDS 55.0%
CGGACAACGGACCTTCAAGA+TGG - Chr1:93053816-93053835 None:intergenic 55.0%
GACATATTGCCAAGCTCGGG+AGG - Chr1:93052877-93052896 None:intergenic 55.0%
GAGTGACACTCACAGCTTGC+CGG - Chr1:93052765-93052784 None:intergenic 55.0%
GCAACCCCCGAATTGTTCAC+AGG + Chr1:93055460-93055479 MsG0180005541.01.T01:CDS 55.0%
GCTAGCGCATGAAGTAGCCA+GGG + Chr1:93056019-93056038 MsG0180005541.01.T01:CDS 55.0%
GCTGAGTCAGAGAGAGCTCT+TGG - Chr1:93056230-93056249 None:intergenic 55.0%
GGATGGACAACAACCTCAGC+AGG + Chr1:93056153-93056172 MsG0180005541.01.T01:CDS 55.0%
GGTCCGTTGTCCGCTGAATT+GGG + Chr1:93053823-93053842 MsG0180005541.01.T01:CDS 55.0%
GGTTCAATACCTCCCGAGCT+TGG + Chr1:93052865-93052884 MsG0180005541.01.T01:CDS 55.0%
GTCCGTTGTCCGCTGAATTG+GGG + Chr1:93053824-93053843 MsG0180005541.01.T01:CDS 55.0%
TATGGAGGCTGTGGATCCAG+AGG + Chr1:93055910-93055929 MsG0180005541.01.T01:CDS 55.0%
TCGCTTGACTGCAATGGGTC+GGG - Chr1:93055026-93055045 None:intergenic 55.0%
! ATTGCTGTTGGAGCCGCTGA+AGG + Chr1:93055414-93055433 MsG0180005541.01.T01:CDS 55.0%
CATGCGCTAGCCCTCTCAGA+AGG - Chr1:93056010-93056029 None:intergenic 60.0%
CTGGAGGAATGCTGCCTGAC+AGG - Chr1:93054002-93054021 None:intergenic 60.0%
GGACACGTCCCAGCATCTGT+TGG + Chr1:93053648-93053667 MsG0180005541.01.T01:CDS 60.0%
GGCTAGCGCATGAAGTAGCC+AGG + Chr1:93056018-93056037 MsG0180005541.01.T01:CDS 60.0%
TCACGCGGTTCGCAGCTGAC+AGG + Chr1:93054404-93054423 MsG0180005541.01.T01:intron 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 93050792 93056580 93050792 ID=MsG0180005541.01;Name=MsG0180005541.01
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