AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180005685.01

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MsG0180005685.01.T01 AT4G21410 43.399 606 304 15 1 580 87 679 4.20e-163 481
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MsG0180005685.01.T01 AT4G23270 43.911 583 305 8 1 580 82 645 1.12e-160 474
MsG0180005685.01.T01 AT3G45860 44.901 608 288 13 1 580 88 676 1.21e-160 474
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MsG0180005685.01.T01 AT4G23190 41.549 568 296 11 1 539 1 561 2.69e-145 432
MsG0180005685.01.T01 AT4G11460 42.478 565 298 9 1 543 78 637 3.08e-145 436
MsG0180005685.01.T01 AT4G23190 41.434 572 299 11 1 543 79 643 4.86e-144 432
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MsG0180005685.01.T01 AT4G23320 47.380 458 222 7 87 542 54 494 4.37e-138 412
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MsG0180005685.01.T01 AT1G11330 45.521 413 199 7 184 580 440 842 1.36e-112 355
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MsG0180005685.01.T01 AT1G61490 47.525 404 187 8 182 580 421 804 1.77e-112 354
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MsG0180005685.01.T01 AT1G61430 47.631 401 191 7 182 580 397 780 3.49e-110 347
MsG0180005685.01.T01 AT1G61430 47.631 401 191 7 182 580 397 780 3.49e-110 347
MsG0180005685.01.T01 AT1G61380 47.368 399 191 7 185 580 423 805 4.02e-110 348
MsG0180005685.01.T01 AT1G61420 46.914 405 191 8 182 580 421 807 6.22e-110 347
MsG0180005685.01.T01 AT1G61430 47.631 401 191 7 182 580 420 803 9.73e-110 347
MsG0180005685.01.T01 AT1G61440 49.727 366 171 7 186 547 415 771 1.00e-109 347
MsG0180005685.01.T01 AT1G61500 52.322 323 151 3 241 562 461 781 1.07e-109 346
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MsG0180005685.01.T01 AT1G61420 46.683 407 191 8 182 580 421 809 1.26e-109 347
MsG0180005685.01.T01 AT1G61440 49.185 368 175 7 186 547 415 776 1.29e-109 346
MsG0180005685.01.T01 AT1G11300 46.809 376 179 5 184 547 430 796 1.42e-109 347
MsG0180005685.01.T01 AT1G61500 52.322 323 151 3 241 562 484 804 1.52e-109 347
MsG0180005685.01.T01 AT1G61500 52.322 323 151 3 241 562 479 799 1.57e-109 346
MsG0180005685.01.T01 AT1G61400 46.359 412 188 8 182 580 431 822 9.65e-109 345
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MsG0180005685.01.T01 AT1G61360 45.876 388 197 7 185 561 341 726 1.04e-103 329
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MsG0180005685.01.T01 AT1G61360 45.876 388 197 7 185 561 422 807 6.03e-103 330
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MsG0180005685.01.T01 AT4G27290 48.087 366 175 7 184 539 437 797 3.73e-102 328
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MsG0180005685.01.T01 AT1G67520 51.961 306 136 5 241 539 276 577 1.89e-101 320
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MsG0180005685.01.T01 AT1G61430 53.265 291 130 5 182 470 420 706 2.98e-88 288
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MsG0180005685.01.T01 AT4G23210 39.556 450 228 14 7 419 85 527 1.71e-87 281
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MsG0180005685.01.T01 AT1G56130 38.965 367 211 7 161 525 460 815 9.44e-77 261
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MsG0180005685.01.T01 AT4G11890 43.934 305 157 6 239 539 28 322 1.62e-76 247
MsG0180005685.01.T01 AT4G11890 43.934 305 157 6 239 539 25 319 2.61e-76 246
MsG0180005685.01.T01 AT5G40380 32.903 465 258 12 2 452 90 514 3.06e-76 252
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MsG0180005685.01.T01 AT1G29740 42.151 344 182 4 181 524 621 947 2.03e-75 259
MsG0180005685.01.T01 AT1G29720 36.911 382 230 4 152 524 563 942 4.40e-75 258
MsG0180005685.01.T01 AT4G02410 36.639 363 217 5 166 524 273 626 5.65e-75 252
MsG0180005685.01.T01 AT1G29730 46.479 284 151 1 241 524 661 943 1.13e-74 257
MsG0180005685.01.T01 AT4G02420 39.185 319 183 4 212 529 318 626 1.16e-74 251
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MsG0180005685.01.T01 AT5G06740 36.387 382 225 8 189 556 280 657 3.46e-74 249
MsG0180005685.01.T01 AT1G16670 43.310 284 155 3 246 525 34 315 4.58e-74 241
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MsG0180005685.01.T01 AT4G23160 39.886 351 195 6 1 340 681 1026 2.71e-72 251
MsG0180005685.01.T01 AT5G02800 42.907 289 160 4 241 525 61 348 4.94e-72 236
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MsG0180005685.01.T01 AT1G55200 40.550 291 168 4 241 529 367 654 6.35e-72 244
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MsG0180005685.01.T01 AT3G25560 36.314 369 221 7 170 529 223 586 1.57e-71 242
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MsG0180005685.01.T01 AT3G45430 35.955 356 215 5 186 541 284 626 2.44e-71 242
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MsG0180005685.01.T01 AT2G42960 38.671 331 197 4 238 566 168 494 2.18e-70 235
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MsG0180005685.01.T01 AT1G29750 43.706 286 157 3 241 524 654 937 4.75e-68 238
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MsG0180005685.01.T01 AT1G56720 40.328 305 176 4 232 534 158 458 2.03e-67 227
MsG0180005685.01.T01 AT1G56720 40.328 305 176 4 232 534 158 458 2.03e-67 227
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MsG0180005685.01.T01 AT5G18610 38.323 334 178 7 241 567 71 383 4.85e-67 227
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MsG0180005685.01.T01 AT5G18500 40.199 301 174 4 238 536 151 447 6.65e-66 223
MsG0180005685.01.T01 AT5G18500 40.199 301 174 4 238 536 151 447 6.65e-66 223
MsG0180005685.01.T01 AT5G18500 40.199 301 174 4 238 536 151 447 6.65e-66 223
MsG0180005685.01.T01 AT5G18500 40.199 301 174 4 238 536 151 447 6.65e-66 223
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MsG0180005685.01.T01 AT4G11900 48.249 257 117 4 173 418 452 703 1.35e-65 227
MsG0180005685.01.T01 AT1G29730 51.304 230 110 2 241 469 628 856 2.42e-65 230
MsG0180005685.01.T01 AT5G03140 37.366 372 212 10 175 537 298 657 2.44e-65 227
MsG0180005685.01.T01 AT4G11900 48.438 256 116 4 173 417 452 702 3.28e-65 226
MsG0180005685.01.T01 AT4G11900 48.438 256 116 4 173 417 452 702 3.28e-65 226
MsG0180005685.01.T01 AT5G37450 39.867 301 170 3 241 537 416 709 5.37e-65 226
MsG0180005685.01.T01 AT4G11900 48.438 256 116 4 173 417 452 702 5.43e-65 226
MsG0180005685.01.T01 AT4G01330 38.435 294 177 3 238 529 147 438 6.55e-65 220
MsG0180005685.01.T01 AT4G01330 38.435 294 177 3 238 529 147 438 7.29e-65 220
MsG0180005685.01.T01 AT1G67520 58.989 178 72 1 241 417 484 661 7.49e-65 224
MsG0180005685.01.T01 AT4G01330 38.435 294 177 3 238 529 147 438 8.31e-65 219
MsG0180005685.01.T01 AT5G60320 34.840 376 227 7 202 575 307 666 8.74e-65 224
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MsG0180005685.01.T01 AT4G13190 36.056 355 211 7 210 553 25 374 1.48e-64 216
MsG0180005685.01.T01 AT1G76370 38.562 306 184 3 219 521 41 345 2.56e-64 216
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MsG0180005685.01.T01 AT1G79620 36.911 382 202 11 161 521 568 931 5.45e-64 227
MsG0180005685.01.T01 AT5G37450 39.867 301 170 3 241 537 595 888 6.44e-64 226
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MsG0180005685.01.T01 AT5G37450 39.867 301 170 3 241 537 619 912 1.00e-63 226
MsG0180005685.01.T01 AT1G07870 38.870 301 179 4 228 524 78 377 1.05e-63 218
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MsG0180005685.01.T01 AT2G18470 37.716 289 171 3 241 524 272 556 1.08e-63 221
MsG0180005685.01.T01 AT4G04960 38.906 329 186 7 246 566 340 661 1.11e-63 222
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MsG0180005685.01.T01 AT5G10290 39.796 294 172 4 240 529 277 569 2.67e-63 219
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MsG0180005685.01.T01 AT5G24080 33.978 362 211 9 192 541 346 691 2.69e-63 222
MsG0180005685.01.T01 AT4G34440 37.201 293 167 3 241 524 300 584 3.13e-63 220
MsG0180005685.01.T01 AT4G34440 37.201 293 167 3 241 524 300 584 3.13e-63 220
MsG0180005685.01.T01 AT3G09010 46.789 218 113 2 241 456 34 250 3.59e-63 210
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MsG0180005685.01.T01 AT4G30520 35.817 349 201 7 193 529 240 577 7.67e-63 219
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MsG0180005685.01.T01 AT5G63710 38.218 348 202 9 186 524 184 527 3.07e-62 216
MsG0180005685.01.T01 AT4G34500 38.944 303 177 5 238 536 130 428 3.49e-62 212
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MsG0180005685.01.T01 AT3G53380 38.012 342 187 9 197 524 321 651 4.27e-62 218
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MsG0180005685.01.T01 AT5G02070 36.875 320 183 6 220 526 335 648 9.43e-62 216
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MsG0180005685.01.T01 AT2G19210 34.971 346 213 6 182 524 510 846 1.71e-61 219
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MsG0180005685.01.T01 AT1G07570 38.333 300 168 5 241 526 56 352 2.37e-61 209
MsG0180005685.01.T01 AT1G07570 38.333 300 168 5 241 526 56 352 2.37e-61 209
MsG0180005685.01.T01 AT1G07570 38.333 300 168 5 241 526 67 363 2.60e-61 209
MsG0180005685.01.T01 AT5G16900 37.950 361 204 7 170 524 310 656 2.66e-61 215
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MsG0180005685.01.T01 AT2G19230 35.150 367 211 7 165 524 492 838 3.78e-61 218
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MsG0180005685.01.T01 AT3G28690 38.983 295 167 4 241 524 114 406 4.79e-61 210
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MsG0180005685.01.T01 AT2G13800 40.136 294 171 4 240 529 262 554 4.96e-61 213
MsG0180005685.01.T01 AT2G28930 38.796 299 168 5 241 526 60 356 5.08e-61 208
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MsG0180005685.01.T01 AT2G04300 36.593 317 195 3 206 521 537 848 1.16e-60 216
MsG0180005685.01.T01 AT1G24030 37.809 283 168 5 249 524 4 285 1.41e-60 203
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MsG0180005685.01.T01 AT2G17220 40.333 300 156 6 241 524 75 367 2.00e-60 206
MsG0180005685.01.T01 AT1G70110 39.860 286 169 3 240 524 331 614 2.02e-60 212
MsG0180005685.01.T01 AT4G29990 37.391 345 201 6 186 524 507 842 2.04e-60 216
MsG0180005685.01.T01 AT1G66150 39.308 318 178 10 243 549 578 891 2.18e-60 216
MsG0180005685.01.T01 AT2G28960 38.644 295 175 3 231 524 421 710 2.31e-60 214
MsG0180005685.01.T01 AT1G24030 37.113 291 175 5 241 524 50 339 2.39e-60 204
MsG0180005685.01.T01 AT2G19130 41.254 303 164 9 241 535 483 779 2.76e-60 214
MsG0180005685.01.T01 AT5G35370 34.921 378 209 9 175 521 429 800 3.19e-60 215
MsG0180005685.01.T01 AT1G24030 37.113 291 175 5 241 524 64 353 3.27e-60 204
MsG0180005685.01.T01 AT3G20530 45.833 216 113 3 241 452 70 285 3.39e-60 202
MsG0180005685.01.T01 AT2G11520 36.972 284 176 3 239 520 211 493 4.55e-60 208
MsG0180005685.01.T01 AT1G52540 34.076 314 202 4 241 552 28 338 4.99e-60 203
MsG0180005685.01.T01 AT5G02290 38.983 295 163 5 241 521 56 347 5.24e-60 204
MsG0180005685.01.T01 AT5G02290 38.983 295 163 5 241 521 56 347 5.24e-60 204
MsG0180005685.01.T01 AT5G16500 39.655 290 169 5 241 525 62 350 6.43e-60 210
MsG0180005685.01.T01 AT5G55830 33.693 371 231 7 177 539 292 655 6.63e-60 211
MsG0180005685.01.T01 AT5G40380 30.930 430 243 12 2 417 90 479 6.77e-60 207
MsG0180005685.01.T01 AT1G52540 32.386 352 217 5 203 552 3 335 6.83e-60 203
MsG0180005685.01.T01 AT4G18250 35.340 382 224 10 190 563 306 672 6.84e-60 211
MsG0180005685.01.T01 AT5G16900 37.950 361 204 7 170 524 496 842 9.28e-60 214
MsG0180005685.01.T01 AT5G16900 37.950 361 204 7 170 524 496 842 9.28e-60 214
MsG0180005685.01.T01 AT1G70250 34.974 386 227 10 188 562 402 774 1.23e-59 213
MsG0180005685.01.T01 AT2G37050 39.223 283 166 4 241 520 593 872 1.29e-59 214
MsG0180005685.01.T01 AT2G37050 39.223 283 166 4 241 520 594 873 1.36e-59 214
MsG0180005685.01.T01 AT2G14510 35.376 359 213 7 177 531 494 837 1.39e-59 213
MsG0180005685.01.T01 AT5G59260 36.337 344 194 9 240 574 342 669 1.46e-59 210
MsG0180005685.01.T01 AT2G14510 35.376 359 213 7 177 531 502 845 1.64e-59 213
MsG0180005685.01.T01 AT1G01540 44.167 240 128 5 228 464 128 364 1.96e-59 203
MsG0180005685.01.T01 AT4G02010 39.716 282 162 5 249 524 376 655 2.06e-59 211
MsG0180005685.01.T01 AT2G28960 38.644 295 175 3 231 524 553 842 2.24e-59 213
MsG0180005685.01.T01 AT4G32000 34.865 370 231 7 161 525 37 401 2.26e-59 204
MsG0180005685.01.T01 AT1G51820 34.302 344 206 6 193 521 244 582 2.27e-59 209
MsG0180005685.01.T01 AT1G11280 49.160 238 112 4 185 413 429 666 2.69e-59 209
MsG0180005685.01.T01 AT3G59750 33.967 368 226 8 168 532 228 581 2.90e-59 208
MsG0180005685.01.T01 AT1G06840 33.421 380 230 7 151 524 532 894 2.92e-59 213
MsG0180005685.01.T01 AT1G51850 34.375 352 214 6 181 521 499 844 3.07e-59 212
MsG0180005685.01.T01 AT1G51850 34.375 352 214 6 181 521 479 824 3.24e-59 212
MsG0180005685.01.T01 AT5G48740 35.121 373 219 10 171 533 528 887 3.71e-59 212
MsG0180005685.01.T01 AT5G11020 34.066 364 216 9 188 536 2 356 3.93e-59 202
MsG0180005685.01.T01 AT3G46760 37.748 302 170 7 240 537 37 324 4.65e-59 200
MsG0180005685.01.T01 AT1G61590 37.710 297 169 6 239 524 85 376 6.78e-59 202
MsG0180005685.01.T01 AT5G15080 38.462 299 165 6 240 524 129 422 8.69e-59 204
MsG0180005685.01.T01 AT5G11020 32.576 396 230 11 169 536 31 417 8.98e-59 202
MsG0180005685.01.T01 AT5G11020 34.066 364 216 9 188 536 29 383 1.08e-58 201
MsG0180005685.01.T01 AT4G00340 35.574 357 215 7 177 524 388 738 1.10e-58 210
MsG0180005685.01.T01 AT5G11020 34.066 364 216 9 188 536 25 379 1.12e-58 201
MsG0180005685.01.T01 AT1G76360 38.127 299 164 5 241 524 151 443 1.13e-58 204
MsG0180005685.01.T01 AT5G01950 39.446 289 163 4 241 524 529 810 1.48e-58 210
MsG0180005685.01.T01 AT5G35580 37.755 294 173 4 241 526 64 355 2.07e-58 203
MsG0180005685.01.T01 AT5G38990 39.310 290 170 4 240 524 512 800 2.40e-58 210
MsG0180005685.01.T01 AT5G01950 39.446 289 163 4 241 524 614 895 2.46e-58 210
MsG0180005685.01.T01 AT5G01950 39.446 289 163 4 241 524 614 895 2.46e-58 210
MsG0180005685.01.T01 AT5G01950 39.446 289 163 4 241 524 614 895 2.46e-58 210
MsG0180005685.01.T01 AT5G01950 39.446 289 163 4 241 524 614 895 2.46e-58 210
MsG0180005685.01.T01 AT5G35580 37.755 294 173 4 241 526 76 367 2.52e-58 203
MsG0180005685.01.T01 AT3G05140 36.364 297 182 3 241 536 131 421 2.97e-58 202
MsG0180005685.01.T01 AT1G15530 37.584 298 176 4 240 536 348 636 3.07e-58 206
MsG0180005685.01.T01 AT2G43690 34.366 355 215 8 184 532 235 577 3.26e-58 206
MsG0180005685.01.T01 AT1G51890 34.943 352 213 5 183 524 221 566 3.44e-58 205
MsG0180005685.01.T01 AT2G43700 33.791 364 222 9 174 532 239 588 3.46e-58 206
MsG0180005685.01.T01 AT2G43700 33.791 364 222 9 174 532 239 588 3.46e-58 206
MsG0180005685.01.T01 AT2G43700 33.791 364 222 9 174 532 239 588 3.46e-58 206
MsG0180005685.01.T01 AT2G43700 33.791 364 222 9 174 532 239 588 3.46e-58 206
MsG0180005685.01.T01 AT4G32710 37.543 293 170 5 241 524 377 665 3.54e-58 207
MsG0180005685.01.T01 AT1G30570 35.925 373 208 6 178 521 417 787 3.54e-58 209
MsG0180005685.01.T01 AT3G45440 36.885 366 218 6 167 532 265 617 3.68e-58 206
MsG0180005685.01.T01 AT3G45440 36.885 366 218 6 167 532 265 617 3.68e-58 206
MsG0180005685.01.T01 AT3G45440 36.885 366 218 6 167 532 265 617 3.68e-58 206
MsG0180005685.01.T01 AT1G72540 38.014 292 171 4 241 524 72 361 3.91e-58 201
MsG0180005685.01.T01 AT3G23750 38.462 299 171 7 236 524 559 854 3.95e-58 209
MsG0180005685.01.T01 AT2G43700 33.791 364 222 9 174 532 263 612 3.99e-58 206
MsG0180005685.01.T01 AT1G16130 36.334 311 194 4 212 520 374 682 4.19e-58 207
MsG0180005685.01.T01 AT5G03320 36.449 321 184 5 216 525 52 363 4.37e-58 200
MsG0180005685.01.T01 AT5G03320 36.449 321 184 5 216 525 52 363 4.37e-58 200
MsG0180005685.01.T01 AT1G51820 34.302 344 206 6 193 521 506 844 4.57e-58 209
MsG0180005685.01.T01 AT1G24030 40.948 232 131 3 241 467 50 280 4.79e-58 196
MsG0180005685.01.T01 AT3G45330 37.931 290 175 4 239 527 334 619 5.36e-58 206
MsG0180005685.01.T01 AT4G32000 34.987 383 229 10 161 536 37 406 5.39e-58 200
MsG0180005685.01.T01 AT2G43690 34.366 355 215 8 184 532 271 613 5.47e-58 206
MsG0180005685.01.T01 AT2G43690 34.366 355 215 8 184 532 271 613 5.47e-58 206
MsG0180005685.01.T01 AT3G05140 36.364 297 182 3 241 536 179 469 5.68e-58 202
MsG0180005685.01.T01 AT3G01300 38.462 299 165 6 240 524 123 416 6.45e-58 202
MsG0180005685.01.T01 AT3G45440 36.885 366 218 6 167 532 318 670 8.56e-58 206
MsG0180005685.01.T01 AT5G18910 36.491 285 173 4 241 524 180 457 1.04e-57 202
MsG0180005685.01.T01 AT1G74490 38.206 301 174 6 241 536 79 372 1.05e-57 199
MsG0180005685.01.T01 AT3G21340 35.652 345 201 6 193 521 519 858 1.06e-57 208
MsG0180005685.01.T01 AT4G13190 42.169 249 138 4 210 452 25 273 1.25e-57 195

Find 88 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 245 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GAGTGTAGAAGTTGTCTTTA+TGG 0.154187 1:+94900934 MsG0180005685.01.T01:CDS
GAATCTTCTCTTGCTCTTCT+AGG 0.199420 1:-94902877 None:intergenic
GACATGTCATTAACAGAAAA+TGG 0.202307 1:-94904558 None:intergenic
TTTCCAAGCATTGCATATTC+TGG 0.218994 1:-94904002 None:intergenic
TCAAACCTTATAACACAATT+AGG 0.225509 1:-94901018 None:intergenic
GTTATAAAATGCATTCAAAT+TGG 0.259014 1:+94904348 MsG0180005685.01.T01:CDS
TGTATCCTAATTGTGTTATA+AGG 0.278670 1:+94901013 MsG0180005685.01.T01:CDS
ACAAACGGTTGAAGCTTTCT+TGG 0.285894 1:-94900777 None:intergenic
ATTATAGGAGGAACTGCTTT+AGG 0.289844 1:+94903718 MsG0180005685.01.T01:CDS
AAGATTGGAAAAGGTGGATT+TGG 0.290249 1:+94902149 MsG0180005685.01.T01:CDS
TCTTGGTTTGTCATGTTAGT+TGG 0.294562 1:-94900760 None:intergenic
TTACTATGTTCCCACAATTC+TGG 0.295950 1:-94903893 None:intergenic
ACTTACTTACCTGTCGAATT+AGG 0.321259 1:-94901096 None:intergenic
TTTCTATCGTTCTCTTACTT+TGG 0.343608 1:+94901050 MsG0180005685.01.T01:CDS
AGAAATCTTGTGGCATTGAT+AGG 0.349494 1:+94902848 MsG0180005685.01.T01:CDS
TCCGAGCGCTACAAAATTAT+AGG 0.356195 1:+94903703 MsG0180005685.01.T01:CDS
TTCTCACATGAGAACAAGAT+TGG 0.365817 1:+94902134 MsG0180005685.01.T01:CDS
TGCGTTCCTGCACAACATCT+TGG 0.383113 1:-94900976 None:intergenic
AACAGTGCACTCTTTATTTG+TGG 0.388488 1:-94900635 None:intergenic
AATAATCAAGACTTCCATTT+GGG 0.391813 1:-94902916 None:intergenic
GCCATTGTAGGTCTTGCATT+TGG 0.411169 1:-94904393 None:intergenic
ACGTGAAAGTACCACTTTAG+AGG 0.411584 1:+94902067 MsG0180005685.01.T01:CDS
GAAACGACTGTTGCCATTGT+AGG 0.415376 1:-94904405 None:intergenic
CAATTGCAGTGAACAATGTT+TGG 0.416353 1:-94904290 None:intergenic
AAATAATCAAGACTTCCATT+TGG 0.418479 1:-94902917 None:intergenic
CTTCGAAGAAATTCGCTACA+AGG 0.436459 1:+94900842 MsG0180005685.01.T01:CDS
GCATGATGAGCATAGATTAG+AGG 0.440711 1:-94900587 None:intergenic
AATGTTGGTTCTTGTGGAAA+TGG 0.457850 1:-94904456 None:intergenic
TTTGTCATGTTAGTTGGACT+TGG 0.467987 1:-94900754 None:intergenic
CATGAGAACAAGATTGGAAA+AGG 0.473898 1:+94902140 MsG0180005685.01.T01:CDS
GGTCCTGCAGGCGCTGGAGT+TGG 0.477891 1:-94901075 None:intergenic
CGGTAAAACCACCAGAATTG+TGG 0.482637 1:+94903882 MsG0180005685.01.T01:CDS
TCATCTAATAGAATATTACT+AGG 0.485669 1:-94903796 None:intergenic
GAATTAGGTCCTGCAGGCGC+TGG 0.488089 1:-94901081 None:intergenic
TCTCCAGAATATGCAATGCT+TGG 0.488373 1:+94903999 MsG0180005685.01.T01:CDS
CGTGAAAGTACCACTTTAGA+GGG 0.490781 1:+94902068 MsG0180005685.01.T01:CDS
AAGATTTCTATGTTGTAGCT+TGG 0.491023 1:-94902834 None:intergenic
TAGAGATAATCACTGGGAAA+AGG 0.494329 1:+94904069 MsG0180005685.01.T01:CDS
TCAACGTATCATACAACAAA+CGG 0.495245 1:-94900792 None:intergenic
GTACTATGCAACACAAATGT+TGG 0.500616 1:-94904471 None:intergenic
TCAACAGTTGCAACAGGACC+AGG 0.503412 1:+94900721 MsG0180005685.01.T01:CDS
GGGCAGCAGGAGTCAAGCTC+AGG 0.505267 1:+94904513 MsG0180005685.01.T01:CDS
CACAAGAACAAATGTTAAGC+TGG 0.508999 1:+94903680 MsG0180005685.01.T01:CDS
ATTTACGAATATGTCCCAAA+TGG 0.511822 1:+94902902 MsG0180005685.01.T01:CDS
CATGATGAGCATAGATTAGA+GGG 0.513133 1:-94900586 None:intergenic
TTTCAGTTGCAGCAGTTATG+TGG 0.516960 1:+94900656 MsG0180005685.01.T01:CDS
GATCTTCCAAGATGTTGTGC+AGG 0.517112 1:+94900970 MsG0180005685.01.T01:CDS
ATTGCAGAAGCAGCCACAAT+GGG 0.517896 1:-94901627 None:intergenic
GAACTCAATCGAACCTTGTG+TGG 0.520374 1:-94902789 None:intergenic
GAATCAAATCCGGATGCAAA+AGG 0.523308 1:+94904107 MsG0180005685.01.T01:CDS
AAAGTAAGAGAACGATAGAA+AGG 0.526060 1:-94901048 None:intergenic
GGTAAAACCACCAGAATTGT+GGG 0.531011 1:+94903883 MsG0180005685.01.T01:CDS
AACACAAATGTTGGTTCTTG+TGG 0.535611 1:-94904462 None:intergenic
CTATGTTCCCACAATTCTGG+TGG 0.536779 1:-94903890 None:intergenic
TAAGTCTTACGAATCAAATC+CGG 0.537156 1:+94904097 MsG0180005685.01.T01:CDS
GGAGAAAAGCGAGAACAAGC+AGG 0.542134 1:+94901679 MsG0180005685.01.T01:CDS
CTGTTTGCTTGTATTATCGA+AGG 0.544327 1:+94901658 MsG0180005685.01.T01:CDS
ATGGTCATAGAGATAATCAC+TGG 0.545759 1:+94904062 MsG0180005685.01.T01:CDS
GCACCAACTCCAGCGCCTGC+AGG 0.546407 1:+94901072 MsG0180005685.01.T01:CDS
TTCTAGGGCACTCTTCGTGA+TGG 0.547424 1:+94902731 MsG0180005685.01.T01:intron
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CRISPR-GE

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GAGTGTAGAAGTTGTCTTTA+TGG + Chr1:94900934-94900953 MsG0180005685.01.T01:CDS 35.0%
GCATAATATATGCAAGGTCA+GGG + Chr1:94903104-94903123 MsG0180005685.01.T01:intron 35.0%
GCTACAACATAGAAATCTTG+TGG + Chr1:94902838-94902857 MsG0180005685.01.T01:CDS 35.0%
GGAGGAAATAATGAAAGAGA+AGG - Chr1:94903008-94903027 None:intergenic 35.0%
GTACTATGCAACACAAATGT+TGG - Chr1:94904474-94904493 None:intergenic 35.0%
TAGAGATAATCACTGGGAAA+AGG + Chr1:94904069-94904088 MsG0180005685.01.T01:CDS 35.0%
TATGTGGTATGATGAATGCA+TGG + Chr1:94900672-94900691 MsG0180005685.01.T01:CDS 35.0%
TGACCAATATGTATGAGTTG+TGG - Chr1:94902041-94902060 None:intergenic 35.0%
TGCATAATATATGCAAGGTC+AGG + Chr1:94903103-94903122 MsG0180005685.01.T01:intron 35.0%
TGGATTTGGAGAAGTTTACA+AGG + Chr1:94902163-94902182 MsG0180005685.01.T01:CDS 35.0%
TGGCCGTTAATTTAATGTGT+TGG + Chr1:94903071-94903090 MsG0180005685.01.T01:intron 35.0%
TGGTCATAGAGATAATCACT+GGG + Chr1:94904063-94904082 MsG0180005685.01.T01:CDS 35.0%
TTACTATGTTCCCACAATTC+TGG - Chr1:94903896-94903915 None:intergenic 35.0%
TTATTTCATAGGGACGAACT+AGG + Chr1:94901957-94901976 MsG0180005685.01.T01:intron 35.0%
TTCGAAGAAATTCGCTACAA+GGG + Chr1:94900843-94900862 MsG0180005685.01.T01:CDS 35.0%
TTCTCACATGAGAACAAGAT+TGG + Chr1:94902134-94902153 MsG0180005685.01.T01:CDS 35.0%
TTGTCATGTTAGTTGGACTT+GGG - Chr1:94900756-94900775 None:intergenic 35.0%
TTTGTCATGTTAGTTGGACT+TGG - Chr1:94900757-94900776 None:intergenic 35.0%
! AAAAAGGAAAAAGTGATGGG+GGG + Chr1:94903459-94903478 MsG0180005685.01.T01:intron 35.0%
! AACAGTGCACTCTTTATTTG+TGG - Chr1:94900638-94900657 None:intergenic 35.0%
! AAGATTGGAAAAGGTGGATT+TGG + Chr1:94902149-94902168 MsG0180005685.01.T01:CDS 35.0%
! AGGGATAAGGGTATAATTGT+TGG + Chr1:94902445-94902464 MsG0180005685.01.T01:intron 35.0%
! CTGAATTTTGCAGTTAAGCT+AGG - Chr1:94903287-94903306 None:intergenic 35.0%
! GGATAAGGGTATAATTGTTG+GGG + Chr1:94902447-94902466 MsG0180005685.01.T01:intron 35.0%
! GGGATAAGGGTATAATTGTT+GGG + Chr1:94902446-94902465 MsG0180005685.01.T01:intron 35.0%
! GTCTTGCATTTGGATTTTCT+TGG - Chr1:94904386-94904405 None:intergenic 35.0%
! GTTTTCTTGGAGGAGAATAT+TGG - Chr1:94901706-94901725 None:intergenic 35.0%
! TATTTGAGGCCTCCATAAAT+TGG - Chr1:94902420-94902439 None:intergenic 35.0%
! TCCTATAATTTTGTAGCGCT+CGG - Chr1:94903707-94903726 None:intergenic 35.0%
! TTCTTTTCAACAGTTGCAAC+AGG + Chr1:94900715-94900734 MsG0180005685.01.T01:CDS 35.0%
! TTTCCAAGCATTGCATATTC+TGG - Chr1:94904005-94904024 None:intergenic 35.0%
!! AACACAAATGTTGGTTCTTG+TGG - Chr1:94904465-94904484 None:intergenic 35.0%
!! AATGTTGGTTCTTGTGGAAA+TGG - Chr1:94904459-94904478 None:intergenic 35.0%
!! AGAAATCTTGTGGCATTGAT+AGG + Chr1:94902848-94902867 MsG0180005685.01.T01:CDS 35.0%
!! TCTTGGTTTGTCATGTTAGT+TGG - Chr1:94900763-94900782 None:intergenic 35.0%
!!! AATGGACACATTTTTGGTAG+TGG - Chr1:94903143-94903162 None:intergenic 35.0%
!!! ACCTTTTTTGTCTCCAGATA+AGG + Chr1:94903487-94903506 MsG0180005685.01.T01:intron 35.0%
AACGTAGTAAAATGGGTGCA+TGG - Chr1:94903594-94903613 None:intergenic 40.0%
AATCTATGCTCATCATGCGT+CGG + Chr1:94900592-94900611 MsG0180005685.01.T01:CDS 40.0%
ACAAACGGTTGAAGCTTTCT+TGG - Chr1:94900780-94900799 None:intergenic 40.0%
ACGTAGTAAAATGGGTGCAT+GGG - Chr1:94903593-94903612 None:intergenic 40.0%
CATTGTTGCTATACCCATTG+TGG + Chr1:94901614-94901633 MsG0180005685.01.T01:CDS 40.0%
CTTCGAAGAAATTCGCTACA+AGG + Chr1:94900842-94900861 MsG0180005685.01.T01:CDS 40.0%
CTTTCAACAAGTTCCACACA+AGG + Chr1:94902776-94902795 MsG0180005685.01.T01:CDS 40.0%
GAATCAAATCCGGATGCAAA+AGG + Chr1:94904107-94904126 MsG0180005685.01.T01:CDS 40.0%
GAATCTTCTCTTGCTCTTCT+AGG - Chr1:94902880-94902899 None:intergenic 40.0%
GAGAACAAGATTGGAAAAGG+TGG + Chr1:94902143-94902162 MsG0180005685.01.T01:CDS 40.0%
GAGCGCTACAAAATTATAGG+AGG + Chr1:94903706-94903725 MsG0180005685.01.T01:CDS 40.0%
GCATGATGAGCATAGATTAG+AGG - Chr1:94900590-94900609 None:intergenic 40.0%
GCCTTATCTGGAGACAAAAA+AGG - Chr1:94903491-94903510 None:intergenic 40.0%
GGAGGCCTCAAATATTTGTA+GGG + Chr1:94902426-94902445 MsG0180005685.01.T01:intron 40.0%
GGTAAAACCACCAGAATTGT+GGG + Chr1:94903883-94903902 MsG0180005685.01.T01:CDS 40.0%
GGTATGATGAATGCATGGTT+CGG + Chr1:94900677-94900696 MsG0180005685.01.T01:CDS 40.0%
TCAAAAAATTGTTGGGCAGC+AGG + Chr1:94904500-94904519 MsG0180005685.01.T01:CDS 40.0%
TCCAAATGCAAGACCTACAA+TGG + Chr1:94904392-94904411 MsG0180005685.01.T01:CDS 40.0%
TCCGAGCGCTACAAAATTAT+AGG + Chr1:94903703-94903722 MsG0180005685.01.T01:CDS 40.0%
TCTCCAGAATATGCAATGCT+TGG + Chr1:94903999-94904018 MsG0180005685.01.T01:CDS 40.0%
TCTCCTCCAAGAAAACTGTA+AGG + Chr1:94901710-94901729 MsG0180005685.01.T01:intron 40.0%
TGGAGGCCTCAAATATTTGT+AGG + Chr1:94902425-94902444 MsG0180005685.01.T01:intron 40.0%
TGTTACAGGTTTGGAGACAA+TGG + Chr1:94904262-94904281 MsG0180005685.01.T01:intron 40.0%
TTTCAGTTGCAGCAGTTATG+TGG + Chr1:94900656-94900675 MsG0180005685.01.T01:CDS 40.0%
!! ACGTGAAAGTACCACTTTAG+AGG + Chr1:94902067-94902086 MsG0180005685.01.T01:CDS 40.0%
!! CGTGAAAGTACCACTTTAGA+GGG + Chr1:94902068-94902087 MsG0180005685.01.T01:CDS 40.0%
!! GTGAAAGTACCACTTTAGAG+GGG + Chr1:94902069-94902088 MsG0180005685.01.T01:CDS 40.0%
AATCGGGCCTCTAAATTGTC+GGG + Chr1:94902675-94902694 MsG0180005685.01.T01:intron 45.0%
ACATGGCCTCCAATTTATGG+AGG + Chr1:94902408-94902427 MsG0180005685.01.T01:intron 45.0%
ATTGCAGAAGCAGCCACAAT+GGG - Chr1:94901630-94901649 None:intergenic 45.0%
CAATCGGGCCTCTAAATTGT+CGG + Chr1:94902674-94902693 MsG0180005685.01.T01:intron 45.0%
CGGTAAAACCACCAGAATTG+TGG + Chr1:94903882-94903901 MsG0180005685.01.T01:CDS 45.0%
CGTAGTAAAATGGGTGCATG+GGG - Chr1:94903592-94903611 None:intergenic 45.0%
CTATGTTCCCACAATTCTGG+TGG - Chr1:94903893-94903912 None:intergenic 45.0%
GAAACGACTGTTGCCATTGT+AGG - Chr1:94904408-94904427 None:intergenic 45.0%
GAACGGCCCTGTTGTTAAAT+AGG - Chr1:94902361-94902380 None:intergenic 45.0%
GAACTCAATCGAACCTTGTG+TGG - Chr1:94902792-94902811 None:intergenic 45.0%
GACGAGATATAGCTGTCAAG+AGG + Chr1:94902753-94902772 MsG0180005685.01.T01:CDS 45.0%
GATCTTCCAAGATGTTGTGC+AGG + Chr1:94900970-94900989 MsG0180005685.01.T01:CDS 45.0%
GCCATTGTAGGTCTTGCATT+TGG - Chr1:94904396-94904415 None:intergenic 45.0%
GGAACATGGCCTCCAATTTA+TGG + Chr1:94902405-94902424 MsG0180005685.01.T01:intron 45.0%
GGGTATAATTGTTGGGGTGT+AGG + Chr1:94902453-94902472 MsG0180005685.01.T01:intron 45.0%
GTTGACATTGACCAAGATCG+CGG + Chr1:94903862-94903881 MsG0180005685.01.T01:CDS 45.0%
TAAAATAATAGGGAGGGGGG+TGG + Chr1:94903401-94903420 MsG0180005685.01.T01:intron 45.0%
TATTGCAGAAGCAGCCACAA+TGG - Chr1:94901631-94901650 None:intergenic 45.0%
TCACACTCACATAGCTCAAG+AGG - Chr1:94904133-94904152 None:intergenic 45.0%
TGCAGTTAAGCTAGGATCGA+TGG - Chr1:94903279-94903298 None:intergenic 45.0%
TTGAGGCCTCCATAAATTGG+AGG - Chr1:94902417-94902436 None:intergenic 45.0%
! GAATTGCAACCCCTCTAAAG+TGG - Chr1:94902081-94902100 None:intergenic 45.0%
! GTTGGGCCTTACAGTTTTCT+TGG - Chr1:94901719-94901738 None:intergenic 45.0%
!!! ACACATTTTTGGTAGTGGCC+GGG - Chr1:94903138-94903157 None:intergenic 45.0%
!!! GACACATTTTTGGTAGTGGC+CGG - Chr1:94903139-94903158 None:intergenic 45.0%
!!! TATTTTTAAAGATAAATTAA+TGG + Chr1:94903227-94903246 MsG0180005685.01.T01:intron 5.0%
!!! TTTTTTTGAATAAAATAATA+GGG + Chr1:94903391-94903410 MsG0180005685.01.T01:intron 5.0%
!!! TTTTTTTTGAATAAAATAAT+AGG + Chr1:94903390-94903409 MsG0180005685.01.T01:intron 5.0%
AGATGTTGTGCAGGAACGCA+AGG + Chr1:94900979-94900998 MsG0180005685.01.T01:CDS 50.0%
CCGTTCCTTGACAAGAGCAA+CGG + Chr1:94902375-94902394 MsG0180005685.01.T01:intron 50.0%
CCGTTGCTCTTGTCAAGGAA+CGG - Chr1:94902378-94902397 None:intergenic 50.0%
CGTTCCTTGACAAGAGCAAC+GGG + Chr1:94902376-94902395 MsG0180005685.01.T01:intron 50.0%
GAGGGGGGTGGTATAGAAAA+GGG + Chr1:94903413-94903432 MsG0180005685.01.T01:intron 50.0%
GGAGAAAAGCGAGAACAAGC+AGG + Chr1:94901679-94901698 MsG0180005685.01.T01:CDS 50.0%
GGCCTCTAAATTGTCGGGAA+CGG + Chr1:94902680-94902699 MsG0180005685.01.T01:intron 50.0%
TCAACAGTTGCAACAGGACC+AGG + Chr1:94900721-94900740 MsG0180005685.01.T01:CDS 50.0%
TGCGTTCCTGCACAACATCT+TGG - Chr1:94900979-94900998 None:intergenic 50.0%
! CTCAAGAGGCCTTTTGCATC+CGG - Chr1:94904119-94904138 None:intergenic 50.0%
! GGGCCTTACAGTTTTCTTGG+AGG - Chr1:94901716-94901735 None:intergenic 50.0%
!! TGGTGGTTTTACCGCGATCT+TGG - Chr1:94903876-94903895 None:intergenic 50.0%
!! TTCTAGGGCACTCTTCGTGA+TGG + Chr1:94902731-94902750 MsG0180005685.01.T01:intron 50.0%
!!! CACATTTTTGGTAGTGGCCG+GGG - Chr1:94903137-94903156 None:intergenic 50.0%
AAGGTCAGGGGTTCAAACCC+CGG + Chr1:94903117-94903136 MsG0180005685.01.T01:intron 55.0%
AGAGCCCGTTGCTCTTGTCA+AGG - Chr1:94902383-94902402 None:intergenic 55.0%
CCTGCAGGACCTAATTCGAC+AGG + Chr1:94901087-94901106 MsG0180005685.01.T01:CDS 55.0%
CCTGTCGAATTAGGTCCTGC+AGG - Chr1:94901090-94901109 None:intergenic 55.0%
GGACTTGGGAGAACATAGCC+TGG - Chr1:94900742-94900761 None:intergenic 55.0%
GGAGGGGGGTGGTATAGAAA+AGG + Chr1:94903412-94903431 MsG0180005685.01.T01:intron 55.0%
GGCCGTTCCCGACAATTTAG+AGG - Chr1:94902685-94902704 None:intergenic 55.0%
GTTAGGTCGGACGTCTTGAC+TGG + Chr1:94903312-94903331 MsG0180005685.01.T01:intron 55.0%
TGTTGTGCAGGAACGCAAGG+TGG + Chr1:94900982-94901001 MsG0180005685.01.T01:CDS 55.0%
! GACAAGAGCAACGGGCTCTA+TGG + Chr1:94902384-94902403 MsG0180005685.01.T01:intron 55.0%
! GCAACGGGCTCTATGGAACA+TGG + Chr1:94902391-94902410 MsG0180005685.01.T01:intron 55.0%
GAATTAGGTCCTGCAGGCGC+TGG - Chr1:94901084-94901103 None:intergenic 60.0%
GGGCAGCAGGAGTCAAGCTC+AGG + Chr1:94904513-94904532 MsG0180005685.01.T01:CDS 65.0%
GCACCAACTCCAGCGCCTGC+AGG + Chr1:94901072-94901091 MsG0180005685.01.T01:CDS 70.0%
!! GGTCCTGCAGGCGCTGGAGT+TGG - Chr1:94901078-94901097 None:intergenic 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 94900568 94904605 94900568 ID=MsG0180005685.01;Name=MsG0180005685.01
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Chr1 exon 94901583 94901726 94901583 ID=MsG0180005685.01.T01:exon:10296;Parent=MsG0180005685.01.T01
Chr1 exon 94902063 94902184 94902063 ID=MsG0180005685.01.T01:exon:10297;Parent=MsG0180005685.01.T01
Chr1 exon 94902737 94902947 94902737 ID=MsG0180005685.01.T01:exon:10298;Parent=MsG0180005685.01.T01
Chr1 exon 94903677 94903911 94903677 ID=MsG0180005685.01.T01:exon:10299;Parent=MsG0180005685.01.T01
Chr1 exon 94903989 94904142 94903989 ID=MsG0180005685.01.T01:exon:10300;Parent=MsG0180005685.01.T01
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Gene Sequence

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Protein sequence

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