AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180005688.01

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MsG0180005688.01.T01 AT4G23320 58.935 263 107 1 2 263 229 491 6.86e-110 329
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MsG0180005688.01.T01 AT1G61360 55.805 267 113 4 2 265 442 706 1.53e-91 287
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MsG0180005688.01.T01 AT1G61430 63.731 193 69 1 2 194 517 708 4.55e-76 246
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MsG0180005688.01.T01 AT5G18610 39.416 274 159 5 1 268 108 380 2.10e-55 187
MsG0180005688.01.T01 AT1G10620 39.130 253 148 4 2 250 395 645 5.01e-55 190
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MsG0180005688.01.T01 AT5G02800 41.036 251 142 5 3 249 100 348 5.80e-55 183
MsG0180005688.01.T01 AT3G20530 39.464 261 147 6 1 254 107 363 9.01e-55 182
MsG0180005688.01.T01 AT4G23210 59.574 141 57 0 2 142 383 523 1.02e-54 186
MsG0180005688.01.T01 AT4G23210 59.574 141 57 0 2 142 383 523 1.02e-54 186
MsG0180005688.01.T01 AT3G26940 39.370 254 148 3 2 249 99 352 1.19e-54 183
MsG0180005688.01.T01 AT4G23210 59.310 145 57 1 2 144 383 527 1.21e-54 186
MsG0180005688.01.T01 AT1G07870 39.630 270 157 5 1 266 128 395 1.23e-54 183
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MsG0180005688.01.T01 AT1G01540 38.976 254 151 4 2 253 179 430 1.71e-54 184
MsG0180005688.01.T01 AT4G02420 38.583 254 151 5 2 253 376 626 3.47e-54 187
MsG0180005688.01.T01 AT3G24540 39.370 254 148 5 2 251 208 459 4.09e-54 183
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MsG0180005688.01.T01 AT1G11280 66.423 137 46 0 2 138 530 666 4.95e-54 187
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MsG0180005688.01.T01 AT5G60300 39.777 269 154 6 2 269 369 630 2.28e-51 180
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MsG0180005688.01.T01 AT3G45430 38.007 271 156 7 2 269 369 630 5.73e-50 176
MsG0180005688.01.T01 AT4G32710 48.295 176 88 2 2 175 414 588 1.74e-49 175
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MsG0180005688.01.T01 AT5G38280 38.489 278 161 7 2 274 357 629 3.14e-49 173
MsG0180005688.01.T01 AT3G59750 38.492 252 152 3 2 252 329 578 3.56e-49 173
MsG0180005688.01.T01 AT2G43690 37.597 258 146 6 2 252 325 574 3.72e-49 173
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MsG0180005688.01.T01 AT2G18470 37.600 250 151 4 2 248 309 556 5.31e-49 172
MsG0180005688.01.T01 AT5G03140 37.500 272 150 7 1 261 399 661 5.49e-49 173
MsG0180005688.01.T01 AT2G28590 46.703 182 96 1 1 181 123 304 5.66e-49 166
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MsG0180005688.01.T01 AT4G35600 40.000 250 144 5 1 248 120 365 7.51e-49 168
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MsG0180005688.01.T01 AT1G66910 38.113 265 156 5 2 261 373 634 8.31e-47 167
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MsG0180005688.01.T01 AT1G66980 35.889 287 171 6 1 282 856 1134 1.94e-46 167
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MsG0180005688.01.T01 AT1G66980 35.889 287 171 6 1 282 829 1107 2.06e-46 167
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MsG0180005688.01.T01 AT3G45440 37.175 269 163 6 2 269 367 630 2.81e-45 162
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MsG0180005688.01.T01 AT4G00340 37.308 260 144 8 1 248 507 759 7.22e-45 162
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MsG0180005688.01.T01 AT4G34500 36.293 259 149 6 1 250 169 420 1.29e-44 157
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MsG0180005688.01.T01 AT3G45420 35.616 292 165 9 2 279 375 657 1.96e-44 160
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MsG0180005688.01.T01 AT5G10290 37.165 261 151 6 2 254 315 570 2.00e-44 160
MsG0180005688.01.T01 AT3G02130 36.842 247 148 6 1 244 881 1122 2.02e-44 162
MsG0180005688.01.T01 AT5G35370 35.379 277 157 6 1 258 539 812 2.18e-44 161
MsG0180005688.01.T01 AT3G02130 36.842 247 148 6 1 244 898 1139 2.19e-44 162
MsG0180005688.01.T01 AT5G60280 37.500 248 151 4 2 249 363 606 2.33e-44 160
MsG0180005688.01.T01 AT5G49770 35.156 256 153 5 1 250 658 906 2.34e-44 161
MsG0180005688.01.T01 AT2G18470 44.318 176 96 2 2 177 309 482 2.66e-44 158
MsG0180005688.01.T01 AT5G60320 38.247 251 150 5 2 251 373 619 2.97e-44 160
MsG0180005688.01.T01 AT2G39660 38.491 265 154 6 1 260 101 361 3.52e-44 155
MsG0180005688.01.T01 AT4G28350 36.641 262 146 6 2 253 373 624 3.55e-44 160
MsG0180005688.01.T01 AT3G28690 36.111 252 152 5 2 249 61 307 3.87e-44 154
MsG0180005688.01.T01 AT1G15530 38.492 252 148 6 2 250 386 633 4.02e-44 159
MsG0180005688.01.T01 AT5G45780 37.647 255 146 6 1 248 281 529 4.68e-44 158
MsG0180005688.01.T01 AT4G17660 38.800 250 136 5 2 244 125 364 4.69e-44 154
MsG0180005688.01.T01 AT1G07570 38.645 251 141 7 1 244 102 346 5.41e-44 155
MsG0180005688.01.T01 AT1G07570 38.645 251 141 7 1 244 102 346 5.41e-44 155
MsG0180005688.01.T01 AT1G07570 38.645 251 141 7 1 244 102 346 5.41e-44 155
MsG0180005688.01.T01 AT1G07570 38.645 251 141 7 1 244 113 357 5.44e-44 155
MsG0180005688.01.T01 AT3G28690 36.111 252 152 5 2 249 110 356 7.24e-44 155
MsG0180005688.01.T01 AT1G66150 37.692 260 146 8 2 250 613 867 7.34e-44 160
MsG0180005688.01.T01 AT4G29050 35.857 251 155 4 2 249 370 617 7.93e-44 159
MsG0180005688.01.T01 AT4G39110 36.475 244 151 4 2 244 551 791 8.14e-44 160
MsG0180005688.01.T01 AT2G26290 37.450 251 152 5 2 250 120 367 8.76e-44 155
MsG0180005688.01.T01 AT5G45780 37.647 255 146 6 1 248 324 572 9.41e-44 158
MsG0180005688.01.T01 AT4G29050 35.857 251 155 4 2 249 384 631 1.01e-43 159
MsG0180005688.01.T01 AT5G18910 33.074 257 162 5 1 255 216 464 1.29e-43 156
MsG0180005688.01.T01 AT5G35960 36.364 253 151 5 1 251 158 402 1.35e-43 154
MsG0180005688.01.T01 AT2G17220 38.462 247 147 5 1 244 119 363 1.37e-43 154
MsG0180005688.01.T01 AT5G53890 36.694 248 153 4 3 248 780 1025 1.40e-43 159
MsG0180005688.01.T01 AT1G48210 34.646 254 157 4 3 249 94 345 1.44e-43 153
MsG0180005688.01.T01 AT1G48210 34.646 254 157 4 3 249 94 345 1.44e-43 153
MsG0180005688.01.T01 AT1G48210 34.646 254 157 4 3 249 94 345 1.44e-43 153
MsG0180005688.01.T01 AT1G48210 34.646 254 157 4 3 249 94 345 1.44e-43 153
MsG0180005688.01.T01 AT5G63940 35.897 234 147 3 17 248 401 633 1.55e-43 158
MsG0180005688.01.T01 AT1G16260 35.200 250 159 3 1 249 405 652 1.57e-43 158
MsG0180005688.01.T01 AT2G17220 38.462 247 147 5 1 244 118 362 1.60e-43 154
MsG0180005688.01.T01 AT2G01950 35.714 266 150 3 2 248 863 1126 1.72e-43 159
MsG0180005688.01.T01 AT1G16260 35.200 250 159 3 1 249 414 661 1.72e-43 158
MsG0180005688.01.T01 AT1G16260 35.200 250 159 3 1 249 414 661 1.72e-43 158
MsG0180005688.01.T01 AT4G18250 37.079 267 159 6 2 261 382 646 1.97e-43 158
MsG0180005688.01.T01 AT3G25560 37.647 255 153 4 1 253 336 586 2.01e-43 157
MsG0180005688.01.T01 AT1G51805 35.743 249 156 2 2 249 602 847 2.04e-43 159
MsG0180005688.01.T01 AT5G49760 35.200 250 149 4 1 244 655 897 2.09e-43 159
MsG0180005688.01.T01 AT3G25560 37.647 255 153 4 1 253 337 587 2.27e-43 157

Find 49 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 77 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AGTCTTGATTTCTTCATATT+TGG 0.198632 1:-94935981 MsG0180005688.01.T01:intron
AGTCCTAAGATATCCGATTT+TGG 0.228948 1:-94935652 MsG0180005688.01.T01:CDS
CTGAATCGTGCTTTCCTTGT+TGG 0.234324 1:+94935802 None:intergenic
CATTGGATTACTCTGTATTC+AGG 0.284790 1:-94934879 MsG0180005688.01.T01:CDS
AAACGCTACAATATCATAAA+AGG 0.295669 1:-94935772 MsG0180005688.01.T01:CDS
AAATCGGATGTCTATAGTTT+TGG 0.309605 1:-94935220 MsG0180005688.01.T01:CDS
AATCCAAAATCGGATATCTT+AGG 0.319216 1:+94935649 None:intergenic
TTACTTGGTTTCAGTCTAGA+AGG 0.344584 1:-94936044 MsG0180005688.01.T01:CDS
CGAAATCTAGTCAGGTTACT+TGG 0.358979 1:-94936059 MsG0180005688.01.T01:CDS
TAGATTTCGATGTTGAAGTT+TGG 0.364903 1:+94936073 None:intergenic
TCTCCATGCATAGCATATTC+AGG 0.381418 1:+94935253 None:intergenic
TCTACATGTAGCTGCATGTC+TGG 0.388817 1:+94934737 None:intergenic
TTAGCAAGACTGTTTGTTAT+CGG 0.405654 1:-94935628 MsG0180005688.01.T01:CDS
TCTTTCAGGCATGGAGAAGC+TGG 0.410472 1:-94934979 MsG0180005688.01.T01:intron
CAGTCTTGCTAATCCAAAAT+CGG 0.426042 1:+94935639 None:intergenic
ATTGGGATGCAGTGGATATA+TGG 0.426595 1:-94935278 MsG0180005688.01.T01:intron
TTATAGGAAGTGGAACTAGA+AGG 0.430610 1:-94934763 MsG0180005688.01.T01:CDS
TAATGTAGGTGAAACAAGAT+TGG 0.465646 1:-94934714 MsG0180005688.01.T01:CDS
ACTGAAATCTATCGAGGGTA+TGG 0.476863 1:+94934659 None:intergenic
TTAGTTCTTGAGATTATATG+TGG 0.497198 1:-94935193 MsG0180005688.01.T01:CDS
TTCAACATCGAAATCTAGTC+AGG 0.497717 1:-94936067 MsG0180005688.01.T01:CDS
GACAAATGATTGCTGTCAAA+AGG 0.504175 1:-94936154 None:intergenic
TATTGCTTGCTTTGAGATCA+CGG 0.511107 1:+94935695 None:intergenic
AAGGAAAGCACGATTCAGTT+GGG 0.515246 1:-94935797 MsG0180005688.01.T01:CDS
GCATGGAGAAGCTGGACAGA+GGG 0.524079 1:-94934971 MsG0180005688.01.T01:CDS
CAAGGAAAGCACGATTCAGT+TGG 0.530316 1:-94935798 MsG0180005688.01.T01:CDS
CAGCTACATGTAGATAATGT+AGG 0.539245 1:-94934728 MsG0180005688.01.T01:CDS
TTTGTTATCGGTCAAACTCA+AGG 0.542474 1:-94935616 MsG0180005688.01.T01:CDS
TACTTGGTTTCAGTCTAGAA+GGG 0.552047 1:-94936043 MsG0180005688.01.T01:CDS
GGAAATACAAATAGAATCGT+CGG 0.555379 1:-94935595 MsG0180005688.01.T01:CDS
ATGGATCAGTAATTGTAACT+TGG 0.562308 1:+94934678 None:intergenic
CTTAATTGATAGACCAACCA+TGG 0.564690 1:-94934852 MsG0180005688.01.T01:CDS
CATGAGTGCAACGGAAGCCA+TGG 0.566953 1:+94934835 None:intergenic
CTACATGTAGCTGCATGTCT+GGG 0.572765 1:+94934738 None:intergenic
AAATTCTGACCAAGGAGATG+TGG 0.579514 1:-94936123 MsG0180005688.01.T01:CDS
TGTGAAATGTTGTTTAACGA+CGG 0.601276 1:+94934926 None:intergenic
GCACCTGAATATGCTATGCA+TGG 0.605333 1:-94935256 MsG0180005688.01.T01:CDS
AGTTCTTCTTTATCTTCACG+AGG 0.611560 1:-94935740 MsG0180005688.01.T01:CDS
ACTATTAAGCATGAGTGCAA+CGG 0.616528 1:+94934826 None:intergenic
CCACTTCCTATAAAATACGC+AGG 0.620536 1:+94934773 None:intergenic
TTATGACTGAAATCTATCGA+GGG 0.621510 1:+94934654 None:intergenic
ATTATGACTGAAATCTATCG+AGG 0.623855 1:+94934653 None:intergenic
GGCATGGAGAAGCTGGACAG+AGG 0.628404 1:-94934972 MsG0180005688.01.T01:CDS
ATAATGAGATGCATCCACAT+TGG 0.631790 1:-94934896 MsG0180005688.01.T01:CDS
AGTGCAACGGAAGCCATGGT+TGG 0.634397 1:+94934839 None:intergenic
CATGGAGAAGCTGGACAGAG+GGG 0.655044 1:-94934970 MsG0180005688.01.T01:CDS
TTGTCAACAAATTCTGACCA+AGG 0.665504 1:-94936131 MsG0180005688.01.T01:CDS
TTGTATATGTAGATCCAACA+AGG 0.682463 1:-94935816 MsG0180005688.01.T01:intron
GAATACAGAGTAATCCAATG+TGG 0.710761 1:+94934882 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TGAATTTCAAAACTATATAT+TGG + Chr1:94934969-94934988 None:intergenic 15.0%
!! ACATTATTGTAGAAATTGAT+TGG - Chr1:94935775-94935794 MsG0180005688.01.T01:CDS 20.0%
!! CTAAAAATCTTAAGCATATT+CGG + Chr1:94935261-94935280 None:intergenic 20.0%
!!! AAGAAATCAAGACTTTTATT+TGG + Chr1:94934829-94934848 None:intergenic 20.0%
!!! ATATTTTACTTACAGTTGAT+CGG + Chr1:94935303-94935322 None:intergenic 20.0%
!!! TATTGTGATATGTTTTCATA+AGG + Chr1:94935417-94935436 None:intergenic 20.0%
! AAACGCTACAATATCATAAA+AGG - Chr1:94935044-94935063 MsG0180005688.01.T01:intron 25.0%
! AGTCTTGATTTCTTCATATT+TGG - Chr1:94934835-94934854 MsG0180005688.01.T01:CDS 25.0%
! CAGATAACCAAAATAAGATA+AGG + Chr1:94935804-94935823 None:intergenic 25.0%
! TTGATTTCTTCATATTTGGT+AGG - Chr1:94934839-94934858 MsG0180005688.01.T01:CDS 25.0%
!! AACAATATATTCTGAGAGTT+TGG - Chr1:94935355-94935374 MsG0180005688.01.T01:intron 25.0%
!! AATAGTGCAAACATTTTTCA+TGG - Chr1:94935653-94935672 MsG0180005688.01.T01:CDS 25.0%
!! ATAGTGCAAACATTTTTCAT+GGG - Chr1:94935654-94935673 MsG0180005688.01.T01:CDS 25.0%
!! TGATATGTTTTCATAAGGTT+GGG + Chr1:94935412-94935431 None:intergenic 25.0%
!! TTAGTTCTTGAGATTATATG+TGG - Chr1:94935623-94935642 MsG0180005688.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTCATTAAGCTTGTTGATT+GGG - Chr1:94935521-94935540 MsG0180005688.01.T01:intron 25.0%
!!! TTTTCATTAAGCTTGTTGAT+TGG - Chr1:94935520-94935539 MsG0180005688.01.T01:intron 25.0%
AATCCAAAATCGGATATCTT+AGG + Chr1:94935170-94935189 None:intergenic 30.0%
ATGGATCAGTAATTGTAACT+TGG + Chr1:94936141-94936160 None:intergenic 30.0%
GGAAATACAAATAGAATCGT+CGG - Chr1:94935221-94935240 MsG0180005688.01.T01:CDS 30.0%
TAATGTAGGTGAAACAAGAT+TGG - Chr1:94936102-94936121 MsG0180005688.01.T01:CDS 30.0%
TAGATTTCGATGTTGAAGTT+TGG + Chr1:94934746-94934765 None:intergenic 30.0%
TTGTATATGTAGATCCAACA+AGG - Chr1:94935000-94935019 MsG0180005688.01.T01:intron 30.0%
! AAATCGGATGTCTATAGTTT+TGG - Chr1:94935596-94935615 MsG0180005688.01.T01:CDS 30.0%
! GTGATATGTTTTCATAAGGT+TGG + Chr1:94935413-94935432 None:intergenic 30.0%
! TAGTGCAAACATTTTTCATG+GGG - Chr1:94935655-94935674 MsG0180005688.01.T01:CDS 30.0%
! TCAAAACCTGCGTATTTTAT+AGG - Chr1:94936037-94936056 MsG0180005688.01.T01:CDS 30.0%
! TGGAGAATTTTCGGTAAAAT+CGG - Chr1:94935580-94935599 MsG0180005688.01.T01:intron 30.0%
! TGTGAAATGTTGTTTAACGA+CGG + Chr1:94935893-94935912 None:intergenic 30.0%
!! AGTTGCACAATTACTTTTCT+TGG - Chr1:94934889-94934908 MsG0180005688.01.T01:CDS 30.0%
!! ATAAAATACGCAGGTTTTGA+AGG + Chr1:94936037-94936056 None:intergenic 30.0%
!! TTAGCAAGACTGTTTGTTAT+CGG - Chr1:94935188-94935207 MsG0180005688.01.T01:CDS 30.0%
!! TTGGTGACCTTATCTTATTT+TGG - Chr1:94935794-94935813 MsG0180005688.01.T01:CDS 30.0%
ACTATTAAGCATGAGTGCAA+CGG + Chr1:94935993-94936012 None:intergenic 35.0%
AGCATATTCGGAAACTTACT+AGG + Chr1:94935249-94935268 None:intergenic 35.0%
AGTTCTTCTTTATCTTCACG+AGG - Chr1:94935076-94935095 MsG0180005688.01.T01:intron 35.0%
ATAATGAGATGCATCCACAT+TGG - Chr1:94935920-94935939 MsG0180005688.01.T01:intron 35.0%
CAGCTACATGTAGATAATGT+AGG - Chr1:94936088-94936107 MsG0180005688.01.T01:CDS 35.0%
CAGTCTTGCTAATCCAAAAT+CGG + Chr1:94935180-94935199 None:intergenic 35.0%
CATTGGATTACTCTGTATTC+AGG - Chr1:94935937-94935956 MsG0180005688.01.T01:intron 35.0%
CTTAATTGATAGACCAACCA+TGG - Chr1:94935964-94935983 MsG0180005688.01.T01:intron 35.0%
GAATACAGAGTAATCCAATG+TGG + Chr1:94935937-94935956 None:intergenic 35.0%
GCATTTGAGCAAATTCTTTC+AGG - Chr1:94935823-94935842 MsG0180005688.01.T01:intron 35.0%
TACTTGGTTTCAGTCTAGAA+GGG - Chr1:94934773-94934792 MsG0180005688.01.T01:CDS 35.0%
TTACTTGGTTTCAGTCTAGA+AGG - Chr1:94934772-94934791 MsG0180005688.01.T01:CDS 35.0%
TTATAGGAAGTGGAACTAGA+AGG - Chr1:94936053-94936072 MsG0180005688.01.T01:CDS 35.0%
TTCAACATCGAAATCTAGTC+AGG - Chr1:94934749-94934768 MsG0180005688.01.T01:CDS 35.0%
TTGTCAACAAATTCTGACCA+AGG - Chr1:94934685-94934704 MsG0180005688.01.T01:CDS 35.0%
! AGTCCTAAGATATCCGATTT+TGG - Chr1:94935164-94935183 MsG0180005688.01.T01:CDS 35.0%
! TGCTATGCATGGAGAATTTT+CGG - Chr1:94935571-94935590 MsG0180005688.01.T01:intron 35.0%
! TTTGTTATCGGTCAAACTCA+AGG - Chr1:94935200-94935219 MsG0180005688.01.T01:CDS 35.0%
! TTTTGAATTCCACATCTCCT+TGG + Chr1:94934705-94934724 None:intergenic 35.0%
!! TATTGCTTGCTTTGAGATCA+CGG + Chr1:94935124-94935143 None:intergenic 35.0%
AAATTCTGACCAAGGAGATG+TGG - Chr1:94934693-94934712 MsG0180005688.01.T01:CDS 40.0%
ATTGGGATGCAGTGGATATA+TGG - Chr1:94935538-94935557 MsG0180005688.01.T01:intron 40.0%
CCACTTCCTATAAAATACGC+AGG + Chr1:94936046-94936065 None:intergenic 40.0%
CGAAATCTAGTCAGGTTACT+TGG - Chr1:94934757-94934776 MsG0180005688.01.T01:CDS 40.0%
TCTCCATGCATAGCATATTC+AGG + Chr1:94935566-94935585 None:intergenic 40.0%
TGAGCAAATTCTTTCAGGCA+TGG - Chr1:94935828-94935847 MsG0180005688.01.T01:intron 40.0%
! AAGGAAAGCACGATTCAGTT+GGG - Chr1:94935019-94935038 MsG0180005688.01.T01:intron 40.0%
! CATTTTTCATGGGGAGGATA+TGG - Chr1:94935664-94935683 MsG0180005688.01.T01:CDS 40.0%
! CCTGCGTATTTTATAGGAAG+TGG - Chr1:94936043-94936062 MsG0180005688.01.T01:CDS 40.0%
! TGCAAACATTTTTCATGGGG+AGG - Chr1:94935658-94935677 MsG0180005688.01.T01:CDS 40.0%
!! GCTAGTAAATTTTAGCCACG+TGG - Chr1:94934911-94934930 MsG0180005688.01.T01:CDS 40.0%
ATCAACAATCTCGAACCACG+TGG + Chr1:94934929-94934948 None:intergenic 45.0%
CTACATGTAGCTGCATGTCT+GGG + Chr1:94936081-94936100 None:intergenic 45.0%
CTGAATCGTGCTTTCCTTGT+TGG + Chr1:94935017-94935036 None:intergenic 45.0%
GCACCTGAATATGCTATGCA+TGG - Chr1:94935560-94935579 MsG0180005688.01.T01:intron 45.0%
TCTACATGTAGCTGCATGTC+TGG + Chr1:94936082-94936101 None:intergenic 45.0%
! CAAGGAAAGCACGATTCAGT+TGG - Chr1:94935018-94935037 MsG0180005688.01.T01:intron 45.0%
TCTTTCAGGCATGGAGAAGC+TGG - Chr1:94935837-94935856 MsG0180005688.01.T01:intron 50.0%
! GCTTGTTGATTGGGATGCAG+TGG - Chr1:94935530-94935549 MsG0180005688.01.T01:intron 50.0%
AGTGCAACGGAAGCCATGGT+TGG + Chr1:94935980-94935999 None:intergenic 55.0%
CATGAGTGCAACGGAAGCCA+TGG + Chr1:94935984-94936003 None:intergenic 55.0%
CATGGAGAAGCTGGACAGAG+GGG - Chr1:94935846-94935865 MsG0180005688.01.T01:intron 55.0%
GCATGGAGAAGCTGGACAGA+GGG - Chr1:94935845-94935864 MsG0180005688.01.T01:intron 55.0%
GGCATGGAGAAGCTGGACAG+AGG - Chr1:94935844-94935863 MsG0180005688.01.T01:intron 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 94934667 94936171 94934667 ID=MsG0180005688.01;Name=MsG0180005688.01
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Chr1 exon 94935982 94936171 94935982 ID=MsG0180005688.01.T01:exon:10332;Parent=MsG0180005688.01.T01
Chr1 exon 94935589 94935826 94935589 ID=MsG0180005688.01.T01:exon:10331;Parent=MsG0180005688.01.T01
Chr1 exon 94935135 94935288 94935135 ID=MsG0180005688.01.T01:exon:10330;Parent=MsG0180005688.01.T01
Chr1 exon 94934667 94934993 94934667 ID=MsG0180005688.01.T01:exon:10329;Parent=MsG0180005688.01.T01
Chr1 CDS 94935982 94936171 94935982 ID=MsG0180005688.01.T01:cds;Parent=MsG0180005688.01.T01
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Chr1 CDS 94935135 94935288 94935135 ID=MsG0180005688.01.T01:cds;Parent=MsG0180005688.01.T01
Chr1 CDS 94934667 94934993 94934667 ID=MsG0180005688.01.T01:cds;Parent=MsG0180005688.01.T01
Gene Sequence

>MsG0180005688.01.T01

ATGATTGCTGTCAAAAGGTTGTCAACAAATTCTGACCAAGGAGATGTGGAATTCAAAAATGAAGTACTTTTAGTAGCCAAACTTCAACATCGAAATCTAGTCAGGTTACTTGGTTTCAGTCTAGAAGGGAGAGAAAGACTACTTATTTATGAATTTGTTCCAAATAAAAGTCTTGATTTCTTCATATTTGATCCAACAAGGAAAGCACGATTCAGTTGGGAAAAACGCTACAATATCATAAAAGGTATTTCTCGAGTTCTTCTTTATCTTCACGAGGATTCTCGCTTGCGCATTATACACCGTGATCTCAAAGCAAGCAATATTCTCTTAGACGACGAGATGAGTCCTAAGATATCCGATTTTGGATTAGCAAGACTGTTTGTTATCGGTCAAACTCAAGGAAATACAAATAGAATCGTCGGAACCTATGGATATATGGCACCTGAATATGCTATGCATGGAGAATTTTCGGTAAAATCGGATGTCTATAGTTTTGGAGTATTAGTTCTTGAGATTATATGTGGTCATAAAAATAGTGCAAACATTTTTCATGGGGAGGATATGGAGTATCTATTGAGCTATGCATGGAGAAGCTGGACAGAGGGGAGAGCAAATGAGATTATAGATCCGTCGTTAAACAACATTTCACAAAATGAAATAATGAGATGCATCCACATTGGATTACTCTGTATTCAGGAAAACTTAATTGATAGACCAACCATGGCTTCCGTTGCACTCATGCTTAATAGTAATTCTCTTACTCTTTCAATACCTTCAAAACCTGCGTATTTTATAGGAAGTGGAACTAGAAGGCTCCCAGACATGCAGCTACATGTAGATAATGTAGGTGAAACAAGATTGGATGAATCATTGAACCAAGTTACAATTACTGATCCATACCCTCGATAG
Protein sequence

>MsG0180005688.01.T01

MIAVKRLSTNSDQGDVEFKNEVLLVAKLQHRNLVRLLGFSLEGRERLLIYEFVPNKSLDFFIFDPTRKARFSWEKRYNIIKGISRVLLYLHEDSRLRIIHRDLKASNILLDDEMSPKISDFGLARLFVIGQTQGNTNRIVGTYGYMAPEYAMHGEFSVKSDVYSFGVLVLEIICGHKNSANIFHGEDMEYLLSYAWRSWTEGRANEIIDPSLNNISQNEIMRCIHIGLLCIQENLIDRPTMASVALMLNSNSLTLSIPSKPAYFIGSGTRRLPDMQLHVDNVGETRLDESLNQVTITDPYPR*