AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0280006435.01

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MsG0280006435.01.T01 AT1G56130 39.721 287 142 4 35 294 534 816 1.18e-52 190
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MsG0280006435.01.T01 AT2G35620 33.333 285 160 4 35 293 292 572 1.15e-51 184
MsG0280006435.01.T01 AT2G35620 33.333 285 160 4 35 293 292 572 1.15e-51 184
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MsG0280006435.01.T01 AT1G55610 35.811 296 152 6 32 293 844 1135 8.12e-51 185
MsG0280006435.01.T01 AT3G53810 36.897 290 152 5 34 294 334 621 9.47e-51 182
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MsG0280006435.01.T01 AT4G04540 37.895 285 140 6 34 289 340 616 6.07e-50 180
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MsG0280006435.01.T01 AT4G05200 35.275 309 168 5 13 292 331 636 1.40e-49 179
MsG0280006435.01.T01 AT4G21230 35.831 307 164 5 35 312 321 623 1.51e-49 179
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MsG0280006435.01.T01 AT1G61390 33.542 319 174 5 7 292 308 621 4.73e-49 177
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MsG0280006435.01.T01 AT5G01950 37.288 295 143 7 32 293 611 896 7.99e-49 179
MsG0280006435.01.T01 AT5G01950 37.288 295 143 7 32 293 611 896 7.99e-49 179
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MsG0280006435.01.T01 AT1G61420 34.667 300 156 5 26 292 325 617 2.41e-48 176
MsG0280006435.01.T01 AT1G17230 32.919 322 179 6 35 323 787 1104 2.52e-48 178
MsG0280006435.01.T01 AT4G23140 34.713 314 165 5 19 295 321 631 2.55e-48 176
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MsG0280006435.01.T01 AT5G18610 35.197 304 162 6 21 292 57 357 2.61e-48 173
MsG0280006435.01.T01 AT5G18610 35.197 304 162 6 21 292 57 357 2.61e-48 173
MsG0280006435.01.T01 AT1G17230 34.828 290 153 5 35 292 787 1072 2.64e-48 178
MsG0280006435.01.T01 AT4G11460 33.871 310 167 6 18 292 315 621 4.00e-48 176
MsG0280006435.01.T01 AT4G23320 36.678 289 150 5 34 292 170 455 4.17e-48 172
MsG0280006435.01.T01 AT4G23320 36.678 289 150 5 34 292 170 455 4.17e-48 172
MsG0280006435.01.T01 AT1G61480 34.343 297 163 4 25 292 474 767 4.53e-48 176
MsG0280006435.01.T01 AT1G61420 34.667 300 156 5 26 292 473 765 4.70e-48 176
MsG0280006435.01.T01 AT1G61420 34.667 300 156 5 26 292 475 767 4.85e-48 176
MsG0280006435.01.T01 AT1G61420 34.667 300 156 5 26 292 475 767 4.85e-48 176
MsG0280006435.01.T01 AT1G74360 34.130 293 153 5 33 292 800 1085 4.99e-48 177
MsG0280006435.01.T01 AT1G24030 35.789 285 147 7 43 293 4 286 5.00e-48 167
MsG0280006435.01.T01 AT4G11530 34.722 288 157 4 34 292 339 624 5.07e-48 175
MsG0280006435.01.T01 AT4G38830 36.700 297 153 5 34 298 331 624 5.18e-48 175
MsG0280006435.01.T01 AT1G61610 35.517 290 154 4 35 295 513 798 7.00e-48 176
MsG0280006435.01.T01 AT4G23320 36.678 289 150 5 34 292 191 476 8.20e-48 172
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MsG0280006435.01.T01 AT4G21400 36.678 289 146 6 40 295 354 638 2.20e-47 173
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MsG0280006435.01.T01 AT3G16030 36.735 294 150 6 35 296 392 681 2.85e-47 173
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MsG0280006435.01.T01 AT5G24080 35.986 289 151 4 35 294 393 676 4.82e-47 173
MsG0280006435.01.T01 AT4G23250 34.194 310 169 5 14 292 321 626 5.90e-47 174
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MsG0280006435.01.T01 AT1G79620 38.047 297 133 6 35 293 652 935 9.25e-47 173
MsG0280006435.01.T01 AT4G23280 34.576 295 160 5 34 298 331 622 9.63e-47 171
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MsG0280006435.01.T01 AT1G61500 34.122 296 163 4 26 292 470 762 1.15e-46 172
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MsG0280006435.01.T01 AT3G13690 34.028 288 159 4 35 294 399 683 1.32e-46 172
MsG0280006435.01.T01 AT4G23290 37.153 288 150 4 34 292 350 635 1.53e-46 171
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MsG0280006435.01.T01 AT4G39400 35.948 306 152 8 21 293 862 1156 1.73e-46 172
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MsG0280006435.01.T01 AT2G33170 33.333 309 163 7 23 292 795 1099 3.93e-46 172
MsG0280006435.01.T01 AT1G49100 33.333 306 160 6 20 292 556 850 4.23e-46 171
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MsG0280006435.01.T01 AT5G10520 34.202 307 161 7 35 309 141 438 7.39e-46 165
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MsG0280006435.01.T01 AT1G49730 34.169 319 155 10 12 292 327 628 8.80e-46 169
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MsG0280006435.01.T01 AT1G61490 34.843 287 155 4 35 292 452 735 1.11e-45 169
MsG0280006435.01.T01 AT1G61490 34.843 287 155 4 35 292 478 761 1.17e-45 169
MsG0280006435.01.T01 AT1G61490 34.843 287 155 4 35 292 478 761 1.17e-45 169
MsG0280006435.01.T01 AT1G61490 34.843 287 155 4 35 292 478 761 1.17e-45 169
MsG0280006435.01.T01 AT1G61490 34.843 287 155 4 35 292 478 761 1.17e-45 169
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MsG0280006435.01.T01 AT1G61360 34.146 287 159 3 35 292 405 690 1.33e-45 169
MsG0280006435.01.T01 AT1G61360 34.146 287 159 3 35 292 405 690 1.33e-45 169
MsG0280006435.01.T01 AT1G61360 34.146 287 159 3 35 292 486 771 1.46e-45 169
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MsG0280006435.01.T01 AT1G61430 33.798 287 158 4 35 292 454 737 1.92e-45 169
MsG0280006435.01.T01 AT1G61430 33.798 287 158 4 35 292 454 737 1.92e-45 169
MsG0280006435.01.T01 AT3G28690 32.997 297 158 6 35 293 14 307 1.98e-45 162
MsG0280006435.01.T01 AT5G62230 36.396 283 143 5 39 292 640 914 2.27e-45 169
MsG0280006435.01.T01 AT3G46330 33.762 311 163 9 14 289 531 833 2.46e-45 169
MsG0280006435.01.T01 AT2G01820 33.861 316 163 7 35 313 573 879 2.50e-45 169
MsG0280006435.01.T01 AT1G61430 33.798 287 158 4 35 292 477 760 2.51e-45 168
MsG0280006435.01.T01 AT3G59700 33.762 311 162 5 34 304 325 631 2.53e-45 167
MsG0280006435.01.T01 AT3G46330 33.226 310 166 7 14 289 507 809 2.56e-45 169
MsG0280006435.01.T01 AT4G23270 35.294 289 154 5 34 292 313 598 2.57e-45 167
MsG0280006435.01.T01 AT5G13160 35.616 292 149 7 35 292 74 360 2.75e-45 164
MsG0280006435.01.T01 AT4G23270 35.294 289 154 5 34 292 313 598 2.84e-45 167
MsG0280006435.01.T01 AT4G23270 35.294 289 154 5 34 292 313 598 2.84e-45 167
MsG0280006435.01.T01 AT5G62230 36.396 283 143 5 39 292 592 866 2.88e-45 169
MsG0280006435.01.T01 AT1G70130 33.893 298 168 2 24 294 311 606 2.99e-45 167
MsG0280006435.01.T01 AT4G23310 35.640 289 153 5 34 292 455 740 3.39e-45 168
MsG0280006435.01.T01 AT4G23310 35.640 289 153 5 34 292 495 780 3.50e-45 168
MsG0280006435.01.T01 AT3G09010 37.652 247 120 4 22 239 23 264 4.15e-45 159
MsG0280006435.01.T01 AT1G61380 34.146 287 157 4 35 292 329 612 4.54e-45 166
MsG0280006435.01.T01 AT5G10530 32.432 296 173 3 24 292 312 607 4.67e-45 166
MsG0280006435.01.T01 AT3G28690 32.997 297 158 6 35 293 63 356 5.50e-45 162
MsG0280006435.01.T01 AT4G00970 34.333 300 162 5 30 297 327 623 5.64e-45 166
MsG0280006435.01.T01 AT1G61400 34.146 287 157 4 35 292 488 771 5.94e-45 167
MsG0280006435.01.T01 AT1G61550 33.798 287 158 4 35 292 477 760 7.16e-45 167
MsG0280006435.01.T01 AT1G61380 34.146 287 157 4 35 292 476 759 7.55e-45 167
MsG0280006435.01.T01 AT5G61480 32.026 306 165 7 26 293 698 998 8.17e-45 167
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MsG0280006435.01.T01 AT5G56890 33.677 291 158 5 35 293 711 998 1.15e-44 167
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MsG0280006435.01.T01 AT5G60300 36.364 286 151 5 34 292 331 612 1.43e-44 166
MsG0280006435.01.T01 AT5G65600 31.847 314 169 7 23 292 316 628 1.48e-44 165
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MsG0280006435.01.T01 AT4G03230 35.333 300 160 5 23 292 566 861 1.81e-44 166
MsG0280006435.01.T01 AT4G03230 35.333 300 160 5 23 292 566 861 1.81e-44 166
MsG0280006435.01.T01 AT1G11280 32.441 299 168 5 25 292 483 778 1.88e-44 166
MsG0280006435.01.T01 AT3G28690 32.997 297 158 6 35 293 114 407 1.89e-44 162
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MsG0280006435.01.T01 AT1G11280 32.441 299 168 5 25 292 493 788 2.05e-44 166
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MsG0280006435.01.T01 AT4G03230 35.333 300 160 5 23 292 666 961 2.27e-44 166
MsG0280006435.01.T01 AT5G60300 36.364 286 151 5 34 292 331 612 2.42e-44 165
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MsG0280006435.01.T01 AT1G11280 32.441 299 168 5 25 292 481 776 2.64e-44 166
MsG0280006435.01.T01 AT2G26330 33.677 291 156 4 39 300 640 922 3.29e-44 166
MsG0280006435.01.T01 AT1G11303 35.430 302 156 4 20 292 482 773 3.41e-44 165
MsG0280006435.01.T01 AT1G29730 36.154 260 131 5 35 262 661 917 3.45e-44 166
MsG0280006435.01.T01 AT5G63940 31.561 301 172 5 35 305 350 646 3.49e-44 164
MsG0280006435.01.T01 AT4G04960 34.304 309 161 7 21 294 321 622 3.54e-44 164
MsG0280006435.01.T01 AT3G49670 35.971 278 144 5 45 292 688 961 4.70e-44 165
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MsG0280006435.01.T01 AT3G26700 35.395 291 150 4 34 293 66 349 5.09e-44 158
MsG0280006435.01.T01 AT3G26700 35.395 291 150 4 34 293 66 349 5.09e-44 158
MsG0280006435.01.T01 AT1G29730 36.015 261 131 5 35 262 628 885 5.15e-44 165
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MsG0280006435.01.T01 AT3G59740 33.673 294 158 4 34 294 320 609 5.50e-44 163
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MsG0280006435.01.T01 AT1G61400 33.220 295 157 4 35 292 488 779 5.83e-44 164
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MsG0280006435.01.T01 AT5G65700 35.484 279 144 7 45 292 692 965 6.93e-44 165
MsG0280006435.01.T01 AT1G11300 34.768 302 158 4 20 292 467 758 6.99e-44 164
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MsG0280006435.01.T01 AT3G19300 33.333 294 147 7 34 292 315 594 8.98e-44 163
MsG0280006435.01.T01 AT1G11300 34.768 302 158 4 20 292 482 773 9.09e-44 164
MsG0280006435.01.T01 AT3G09830 35.473 296 151 7 35 292 72 365 9.16e-44 159
MsG0280006435.01.T01 AT3G09830 35.473 296 151 7 35 292 72 365 9.16e-44 159
MsG0280006435.01.T01 AT3G09830 35.473 296 151 7 35 292 72 365 9.16e-44 159
MsG0280006435.01.T01 AT1G11330 33.667 300 167 4 28 298 505 801 1.03e-43 164
MsG0280006435.01.T01 AT1G11330 33.667 300 167 4 28 298 503 799 1.07e-43 164
MsG0280006435.01.T01 AT3G08870 30.159 315 182 4 34 317 376 683 1.09e-43 163
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MsG0280006435.01.T01 AT5G02290 32.131 305 162 7 30 293 51 351 3.72e-43 156
MsG0280006435.01.T01 AT1G24650 32.746 284 156 5 36 286 536 817 4.00e-43 162
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MsG0280006435.01.T01 AT5G03320 33.046 348 182 9 35 334 69 413 4.32e-43 157
MsG0280006435.01.T01 AT4G28670 33.333 294 153 7 35 292 319 605 4.44e-43 160
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MsG0280006435.01.T01 AT5G38240 35.314 303 156 10 23 295 313 605 5.16e-43 160
MsG0280006435.01.T01 AT1G65790 35.915 284 146 5 42 292 514 794 5.35e-43 162
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MsG0280006435.01.T01 AT1G51830 33.110 299 154 7 25 289 373 659 6.71e-43 160
MsG0280006435.01.T01 AT1G17750 34.694 294 150 6 37 292 784 1073 6.90e-43 162
MsG0280006435.01.T01 AT4G27290 32.886 298 169 4 21 289 439 734 7.11e-43 161
MsG0280006435.01.T01 AT3G45410 34.965 286 155 4 34 292 329 610 7.91e-43 160
MsG0280006435.01.T01 AT4G27290 32.886 298 169 4 21 289 485 780 8.49e-43 161
MsG0280006435.01.T01 AT4G04510 34.915 295 154 6 34 298 326 612 8.68e-43 160
MsG0280006435.01.T01 AT1G21590 30.897 301 174 5 35 305 357 653 9.03e-43 160
MsG0280006435.01.T01 AT4G04510 34.915 295 154 6 34 298 328 614 9.20e-43 160
MsG0280006435.01.T01 AT5G16900 33.447 293 151 6 34 293 562 843 1.01e-42 161
MsG0280006435.01.T01 AT5G16900 33.447 293 151 6 34 293 562 843 1.01e-42 161
MsG0280006435.01.T01 AT1G28440 33.443 305 152 7 35 296 667 963 1.09e-42 161
MsG0280006435.01.T01 AT4G04570 40.930 215 97 3 34 219 171 384 1.15e-42 155
MsG0280006435.01.T01 AT4G29050 32.333 300 172 4 24 294 321 618 1.18e-42 160
MsG0280006435.01.T01 AT5G38990 33.442 308 167 7 19 293 499 801 1.20e-42 161
MsG0280006435.01.T01 AT1G65800 33.770 305 166 5 21 292 497 798 1.30e-42 161
MsG0280006435.01.T01 AT4G29050 32.333 300 172 4 24 294 335 632 1.52e-42 159
MsG0280006435.01.T01 AT4G29450 31.803 305 165 5 34 299 555 855 1.53e-42 160
MsG0280006435.01.T01 AT3G45430 34.602 289 158 5 34 295 331 615 1.64e-42 159
MsG0280006435.01.T01 AT3G45430 34.602 289 158 5 34 295 331 615 1.64e-42 159
MsG0280006435.01.T01 AT3G45430 34.602 289 158 5 34 295 331 615 1.64e-42 159
MsG0280006435.01.T01 AT1G21590 30.897 301 174 5 35 305 397 693 1.75e-42 160
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MsG0280006435.01.T01 AT2G28250 33.779 299 159 5 32 292 195 492 5.65e-42 157
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MsG0280006435.01.T01 AT3G59750 34.021 291 158 4 34 294 290 576 7.38e-42 157
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MsG0280006435.01.T01 AT4G00330 31.757 296 166 5 33 294 105 398 9.53e-42 153
MsG0280006435.01.T01 AT5G49770 36.000 300 159 5 23 293 610 905 1.05e-41 158
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Find 78 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 367 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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CATGATACTACTGCTGTCTT+CGG 0.451383 2:+1928069 MsG0280006435.01.T01:CDS
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ATATCCAATTTGCATTAGAA+TGG 0.455321 2:-1928645 None:intergenic
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AACACCTTGTTCAGATTACA+AGG 0.460835 2:+1927280 MsG0280006435.01.T01:CDS
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ACACTTCCATTAGCCATGTA+AGG 0.492449 2:-1927564 None:intergenic
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CRISPR-GE

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! CAACTTTGAAGAACATTGTT+AGG - Chr2:1931644-1931663 None:intergenic 30.0%
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!! TAATTCTTTGAAATGTGCAG+TGG - Chr2:1932799-1932818 None:intergenic 30.0%
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!!! TAGTAAAGCTTGTTTTAGGA+TGG + Chr2:1932716-1932735 MsG0280006435.01.T01:intron 30.0%
AAAGTATGTCATACAGGAAG+CGG - Chr2:1932130-1932149 None:intergenic 35.0%
AACACCTTGTTCAGATTACA+AGG + Chr2:1927280-1927299 MsG0280006435.01.T01:CDS 35.0%
AAGTTCCCTTCCATTGAAAA+GGG - Chr2:1931980-1931999 None:intergenic 35.0%
AATGAAAATGAACCATCCAC+TGG - Chr2:1933351-1933370 None:intergenic 35.0%
ACATCACGGTGAATAATCTT+AGG - Chr2:1927961-1927980 None:intergenic 35.0%
ACATCTTAGGTCTTTCCATA+GGG - Chr2:1928516-1928535 None:intergenic 35.0%
ACTAAGTAGGACAGTACTTT+AGG + Chr2:1929474-1929493 MsG0280006435.01.T01:intron 35.0%
AGGGTTTGTGTTCTGTTATT+AGG + Chr2:1930739-1930758 MsG0280006435.01.T01:intron 35.0%
AGTGAAGTCATAGGATCTTA+TGG + Chr2:1930389-1930408 MsG0280006435.01.T01:intron 35.0%
ATGAAAATGAACCATCCACT+GGG - Chr2:1933350-1933369 None:intergenic 35.0%
ATGACATAACGACTTACACA+CGG - Chr2:1931732-1931751 None:intergenic 35.0%
ATTAATGCATGCCATAGTGT+TGG - Chr2:1928347-1928366 None:intergenic 35.0%
CACACCATATGCAAAAACAT+CGG - Chr2:1928151-1928170 None:intergenic 35.0%
CATCACGGTGAATAATCTTA+GGG - Chr2:1927960-1927979 None:intergenic 35.0%
CCATGTGTAAATTGACACAA+CGG + Chr2:1933275-1933294 MsG0280006435.01.T01:intron 35.0%
CTCAATAATAACAGCTTGAC+TGG + Chr2:1933110-1933129 MsG0280006435.01.T01:CDS 35.0%
CTGCAATTTCAAACTGAAGT+TGG + Chr2:1927459-1927478 MsG0280006435.01.T01:CDS 35.0%
CTTCCAATGAAGAAAGTAAG+TGG + Chr2:1930873-1930892 MsG0280006435.01.T01:intron 35.0%
CTTGCAAATGAAAACCTTTC+TGG + Chr2:1931837-1931856 MsG0280006435.01.T01:CDS 35.0%
CTTGCTTGTATATCCTTACA+TGG + Chr2:1927551-1927570 MsG0280006435.01.T01:CDS 35.0%
GACAAATCATCACATAACTG+GGG + Chr2:1930153-1930172 MsG0280006435.01.T01:intron 35.0%
GCTAGGAAATTTGACAAACT+TGG + Chr2:1932034-1932053 MsG0280006435.01.T01:intron 35.0%
GGAAAGAACACACAAACAAT+TGG - Chr2:1932892-1932911 None:intergenic 35.0%
GGGTTTGTGTTCTGTTATTA+GGG + Chr2:1930740-1930759 MsG0280006435.01.T01:intron 35.0%
GGTATCATACCGAATACATT+GGG + Chr2:1932089-1932108 MsG0280006435.01.T01:intron 35.0%
GTATATCCTTACATGGCTAA+TGG + Chr2:1927558-1927577 MsG0280006435.01.T01:CDS 35.0%
GTGACAAATCATCACATAAC+TGG + Chr2:1930151-1930170 MsG0280006435.01.T01:intron 35.0%
GTTGGATTAAGTGAAGTCAT+AGG + Chr2:1930380-1930399 MsG0280006435.01.T01:intron 35.0%
TAAGTTCCCTTCCATTGAAA+AGG - Chr2:1931981-1932000 None:intergenic 35.0%
TATTTGCAGCTTTCACATCA+CGG - Chr2:1927975-1927994 None:intergenic 35.0%
TCACGAAGTTTATCTCTTTC+TGG - Chr2:1928772-1928791 None:intergenic 35.0%
TCCAGTAACAAAAACGTTCT+AGG + Chr2:1927339-1927358 MsG0280006435.01.T01:CDS 35.0%
TCTCAGACAACAATCTAGAA+GGG + Chr2:1933319-1933338 MsG0280006435.01.T01:intron 35.0%
TGGATTATCACATCTAATCG+AGG - Chr2:1932768-1932787 None:intergenic 35.0%
TGGTATCATACCGAATACAT+TGG + Chr2:1932088-1932107 MsG0280006435.01.T01:intron 35.0%
TTAAGGTTGCCCAATGTATT+CGG - Chr2:1932101-1932120 None:intergenic 35.0%
TTGAAACCAGATTACCAGAA+AGG - Chr2:1931854-1931873 None:intergenic 35.0%
TTGCGAAATAATCATAGGCT+GGG + Chr2:1931488-1931507 MsG0280006435.01.T01:intron 35.0%
TTTGCGAAATAATCATAGGC+TGG + Chr2:1931487-1931506 MsG0280006435.01.T01:intron 35.0%
! AACAAAAACGTTCTAGGTAG+AGG + Chr2:1927345-1927364 MsG0280006435.01.T01:CDS 35.0%
! ACAAAACTGACCTATTTTGC+AGG - Chr2:1929780-1929799 None:intergenic 35.0%
! ACCTAGAACGTTTTTGTTAC+TGG - Chr2:1927343-1927362 None:intergenic 35.0%
! ACTAGTCTCTCATACATACA+AGG - Chr2:1929005-1929024 None:intergenic 35.0%
! AGAGAAGAAGTTTGAAACAC+TGG + Chr2:1928408-1928427 MsG0280006435.01.T01:CDS 35.0%
! ATTATTTGCACTGACCTGAT+AGG - Chr2:1933381-1933400 None:intergenic 35.0%
! CAAAACTGACCTATTTTGCA+GGG + Chr2:1930246-1930265 MsG0280006435.01.T01:intron 35.0%
! CAAAACTGACCTATTTTGCA+GGG - Chr2:1930265-1930246 None:intergenic 35.0%
! CTGCAAAAATAGGTCAGTTT+TGG + Chr2:1929836-1929855 MsG0280006435.01.T01:intron 35.0%
! CTTCAAGTTTCTGATTTGAC+TGG + Chr2:1932689-1932708 MsG0280006435.01.T01:intron 35.0%
! GAGCTTGATGGTATTTCTAA+AGG + Chr2:1932826-1932845 MsG0280006435.01.T01:intron 35.0%
! GGGAAATTATGATGATGATG+AGG + Chr2:1928447-1928466 MsG0280006435.01.T01:CDS 35.0%
! GGTAATCTGGTTTCAAATCT+TGG + Chr2:1931858-1931877 MsG0280006435.01.T01:CDS 35.0%
! GGTTGTTTCCAAAATCTTGT+CGG - Chr2:1928612-1928631 None:intergenic 35.0%
! GTGTTTGTTTGGTTTCACAA+TGG + Chr2:1931002-1931021 MsG0280006435.01.T01:intron 35.0%
! TCAAATTTCCTAGCTCTTCT+GGG - Chr2:1932028-1932047 None:intergenic 35.0%
! TGAAAACCTTTCTGGTAATC+TGG + Chr2:1931845-1931864 MsG0280006435.01.T01:CDS 35.0%
!! AAGACCGATGTTTTTGCATA+TGG + Chr2:1928144-1928163 MsG0280006435.01.T01:CDS 35.0%
!! TGTTTTTGCATATGGTGTGA+TGG + Chr2:1928152-1928171 MsG0280006435.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTATTGGTTGTCAAGTTGG+AGG + Chr2:1928945-1928964 MsG0280006435.01.T01:intron 35.0%
!! TTTTTGGTCCCTGCAAAAAT+AGG + Chr2:1929886-1929905 MsG0280006435.01.T01:intron 35.0%
!!! AAAACTGGCCTATTTTTGCA+GGG - Chr2:1929897-1929916 None:intergenic 35.0%
!!! CAAAACTGACCTATTTTTGC+AGG - Chr2:1929838-1929857 None:intergenic 35.0%
!!! TCGTTATGTCATTTTACCTG+TGG + Chr2:1931740-1931759 MsG0280006435.01.T01:intron 35.0%
!!! TTGTCACTTTTGTGCATATG+TGG + Chr2:1930014-1930033 MsG0280006435.01.T01:intron 35.0%
AAAGCTACTTACCAAGATGG+CGG + Chr2:1932447-1932466 MsG0280006435.01.T01:intron 40.0%
AAGACCTAAGATGTCTGAGA+TGG + Chr2:1928522-1928541 MsG0280006435.01.T01:CDS 40.0%
AATGTGCAGTGGTAGATTGT+TGG - Chr2:1932788-1932807 None:intergenic 40.0%
ACACATACTAATGCACTGAG+TGG + Chr2:1932643-1932662 MsG0280006435.01.T01:intron 40.0%
ACACTTCCATTAGCCATGTA+AGG - Chr2:1927567-1927586 None:intergenic 40.0%
ACTGGTAGATGCAGAGTTAA+AGG + Chr2:1928426-1928445 MsG0280006435.01.T01:CDS 40.0%
AGGTAGAGGTAGATTTGGAA+AGG + Chr2:1927359-1927378 MsG0280006435.01.T01:CDS 40.0%
AGTCATAGGATCTTATGGTG+AGG + Chr2:1930394-1930413 MsG0280006435.01.T01:intron 40.0%
AGTGTAGCATAGTGTTTACG+AGG + Chr2:1927582-1927601 MsG0280006435.01.T01:intron 40.0%
ATGTCATGCAAAAACCACGA+AGG - Chr2:1927521-1927540 None:intergenic 40.0%
CACATACTAATGCACTGAGT+GGG + Chr2:1932644-1932663 MsG0280006435.01.T01:intron 40.0%
CAGTGAGTTAGCAAAGTTTC+AGG - Chr2:1933439-1933458 None:intergenic 40.0%
CATCTTAGGTCTTTCCATAG+GGG - Chr2:1928515-1928534 None:intergenic 40.0%
CATGATACTACTGCTGTCTT+CGG + Chr2:1928069-1928088 MsG0280006435.01.T01:CDS 40.0%
CCGTTGTGTCAATTTACACA+TGG - Chr2:1933278-1933297 None:intergenic 40.0%
CTAACCATCTCAGACATCTT+AGG - Chr2:1928529-1928548 None:intergenic 40.0%
CTCAGACAACAATCTAGAAG+GGG + Chr2:1933320-1933339 MsG0280006435.01.T01:intron 40.0%
CTGAGTATCTCTTAACTGGA+AGG + Chr2:1928112-1928131 MsG0280006435.01.T01:CDS 40.0%
CTGGTAGATGCAGAGTTAAA+GGG + Chr2:1928427-1928446 MsG0280006435.01.T01:CDS 40.0%
CTTCCAGTTAAGAGATACTC+AGG - Chr2:1928114-1928133 None:intergenic 40.0%
CTTGTAGATCAAGAGAGAGA+GGG + Chr2:1930720-1930739 MsG0280006435.01.T01:intron 40.0%
GAAATAATCATAGGCTGGGT+TGG + Chr2:1931492-1931511 MsG0280006435.01.T01:intron 40.0%
GAAGACAGCAGTAGTATCAT+GGG - Chr2:1928070-1928089 None:intergenic 40.0%
GACATCACTGTATTCCAAGA+TGG - Chr2:1933301-1933320 None:intergenic 40.0%
GACATCTTAGGTCTTTCCAT+AGG - Chr2:1928517-1928536 None:intergenic 40.0%
GAGATGGTTAGAATGCTAGA+AGG + Chr2:1928538-1928557 MsG0280006435.01.T01:CDS 40.0%
GATTCACGGATGAACAGAAT+TGG + Chr2:1931452-1931471 MsG0280006435.01.T01:intron 40.0%
GCAGCAGCGATAATGAAAAT+AGG - Chr2:1932343-1932362 None:intergenic 40.0%
GTCTCAGACAACAATCTAGA+AGG + Chr2:1933318-1933337 MsG0280006435.01.T01:intron 40.0%
GTGATATTGCTTGATTGGGT+AGG + Chr2:1928237-1928256 MsG0280006435.01.T01:intron 40.0%
GTGTGCATAGTAAAGCAACT+TGG - Chr2:1928486-1928505 None:intergenic 40.0%
TCTAGAAGAGTTCATCTTGC+TGG - Chr2:1928695-1928714 None:intergenic 40.0%
TCTATGTTGCGCTCCAAAAT+AGG + Chr2:1933084-1933103 MsG0280006435.01.T01:intron 40.0%
TCTTGGCGTTCTCTCAAATT+TGG + Chr2:1931875-1931894 MsG0280006435.01.T01:CDS 40.0%
TCTTGTAGATCAAGAGAGAG+AGG + Chr2:1930719-1930738 MsG0280006435.01.T01:intron 40.0%
TCTTTCATCGTATTCAAGGG+AGG - Chr2:1932525-1932544 None:intergenic 40.0%
TGAACTAATAACTGGACCGA+GGG + Chr2:1928179-1928198 MsG0280006435.01.T01:CDS 40.0%
TGAAGTTGGATTGATCAGCA+TGG + Chr2:1927473-1927492 MsG0280006435.01.T01:CDS 40.0%
TGGTTTCATGTTACATGCAG+TGG + Chr2:1931695-1931714 MsG0280006435.01.T01:intron 40.0%
TTATGGTGAGGTTGTCACAT+TGG + Chr2:1930406-1930425 MsG0280006435.01.T01:intron 40.0%
TTGAACTAATAACTGGACCG+AGG + Chr2:1928178-1928197 MsG0280006435.01.T01:CDS 40.0%
TTTCATGTTACATGCAGTGG+TGG + Chr2:1931698-1931717 MsG0280006435.01.T01:intron 40.0%
TTTGACAAACTTGGAGAGCT+TGG + Chr2:1932043-1932062 MsG0280006435.01.T01:intron 40.0%
! AGGTAGCATGTCCATTGATT+AGG + Chr2:1928892-1928911 MsG0280006435.01.T01:intron 40.0%
! AGTTTATCTCTTTCTGGCAG+AGG - Chr2:1928766-1928785 None:intergenic 40.0%
! ATTTTCATTATCGCTGCTGC+TGG + Chr2:1932343-1932362 MsG0280006435.01.T01:intron 40.0%
! CAAGTTGGAGGATAAAGTGT+AGG + Chr2:1928957-1928976 MsG0280006435.01.T01:intron 40.0%
! CAGCTTTGCTATAAGCGTAA+TGG - Chr2:1932287-1932306 None:intergenic 40.0%
! CCAAAACTGACCTATTTTGC+AGG + Chr2:1930245-1930264 MsG0280006435.01.T01:intron 40.0%
! CCTGCAAAATAGGTCAGTTT+TGG - Chr2:1929796-1929777 None:intergenic 40.0%
! CTGCAAAAATAGGCCAGTTT+TGG + Chr2:1929896-1929915 MsG0280006435.01.T01:intron 40.0%
! CTGGCTTGCAACTTTAAACA+AGG - Chr2:1930357-1930376 None:intergenic 40.0%
! GAAGCAGTTGTTGGAGATTT+TGG + Chr2:1928015-1928034 MsG0280006435.01.T01:CDS 40.0%
! GAGACATACCGACAAGATTT+TGG + Chr2:1928601-1928620 MsG0280006435.01.T01:CDS 40.0%
! GAGGAATTTGAAGCAGTTGT+TGG + Chr2:1928006-1928025 MsG0280006435.01.T01:CDS 40.0%
! GTAATCTGAACAAGGTGTTC+AGG - Chr2:1927279-1927298 None:intergenic 40.0%
! GTCAAATTTCCTAGCTCTTC+TGG - Chr2:1932029-1932048 None:intergenic 40.0%
! GTTCTAGGTAGAGGTAGATT+TGG + Chr2:1927354-1927373 MsG0280006435.01.T01:CDS 40.0%
! TAGAATGGTGATGATGCATG+CGG - Chr2:1928633-1928652 None:intergenic 40.0%
!! GTTTTGGTCCCTGCAAAAAT+AGG + Chr2:1929826-1929845 MsG0280006435.01.T01:intron 40.0%
!!! ACAGGAAGCGGAGTTTTTTA+AGG - Chr2:1932118-1932137 None:intergenic 40.0%
!!! ACGCGGTTTTAGTTTGAAAC+TGG - Chr2:1927814-1927833 None:intergenic 40.0%
!!! CAAAACTGGCCTATTTTTGC+AGG - Chr2:1929898-1929917 None:intergenic 40.0%
!!! CTTGAGTTGAGACAGGTTTT+AGG + Chr2:1929582-1929601 MsG0280006435.01.T01:intron 40.0%
AAGCTACTTACCAAGATGGC+GGG + Chr2:1932448-1932467 MsG0280006435.01.T01:intron 45.0%
AATGCAAGTAAGCAATCCCC+TGG - Chr2:1927927-1927946 None:intergenic 45.0%
AATGCTAGAAGGCCATGGTT+TGG + Chr2:1928549-1928568 MsG0280006435.01.T01:CDS 45.0%
AATTGACACAACGGCCATCT+TGG + Chr2:1933284-1933303 MsG0280006435.01.T01:intron 45.0%
AGCGTAATGGTCATGTTGAG+AGG - Chr2:1932274-1932293 None:intergenic 45.0%
ATACTAATGCACTGAGTGGG+TGG + Chr2:1932647-1932666 MsG0280006435.01.T01:intron 45.0%
ATCATCACATAACTGGGGTC+AGG + Chr2:1930158-1930177 MsG0280006435.01.T01:intron 45.0%
CGAAGACAGCAGTAGTATCA+TGG - Chr2:1928071-1928090 None:intergenic 45.0%
CTTCACTTAATCCAACGGTC+TGG - Chr2:1930376-1930395 None:intergenic 45.0%
CTTCGCGAAATTCTGTATGC+AGG + Chr2:1928369-1928388 MsG0280006435.01.T01:intron 45.0%
GCACCTGAGTATCTCTTAAC+TGG + Chr2:1928108-1928127 MsG0280006435.01.T01:CDS 45.0%
GCAGGGACTAAAACCAAAAC+TGG - Chr2:1930251-1930232 None:intergenic 45.0%
GCGTAATGGTCATGTTGAGA+GGG - Chr2:1932273-1932292 None:intergenic 45.0%
GGAATTGGTCCCTGCAAAAT+AGG + Chr2:1929767-1929786 MsG0280006435.01.T01:intron 45.0%
GTCAATGAACCTGAAGAAGC+TGG - Chr2:1933541-1933560 None:intergenic 45.0%
GTTAGAATGCTAGAAGGCCA+TGG + Chr2:1928544-1928563 MsG0280006435.01.T01:CDS 45.0%
TACAAAGGCCGCTTAACTGA+TGG + Chr2:1927384-1927403 MsG0280006435.01.T01:CDS 45.0%
TCATCACATAACTGGGGTCA+GGG + Chr2:1930159-1930178 MsG0280006435.01.T01:intron 45.0%
TGAGGTTGTCACATTGGAAG+AGG + Chr2:1930412-1930431 MsG0280006435.01.T01:intron 45.0%
! CCATGGTTTGGCCGAAAAAT+GGG + Chr2:1928561-1928580 MsG0280006435.01.T01:CDS 45.0%
! TATCTCTTTCTGGCAGAGGA+AGG - Chr2:1928762-1928781 None:intergenic 45.0%
!! CAAGAGTGCCATCAGTTAAG+CGG - Chr2:1927395-1927414 None:intergenic 45.0%
!! CATAATTTGCTTCGCCTTCG+TGG + Chr2:1927504-1927523 MsG0280006435.01.T01:CDS 45.0%
!! CTGCCATTGCTCCCATTTTT+CGG - Chr2:1928575-1928594 None:intergenic 45.0%
!! GGTATTGGTCCCTGCAAAAT+AGG - Chr2:1930258-1930277 None:intergenic 45.0%
!!! AGAGGCGCTGGAATGTTTTT+TGG - Chr2:1933505-1933524 None:intergenic 45.0%
!!! ATTAATTTTTTTTTTGTATT+TGG + Chr2:1931806-1931825 MsG0280006435.01.T01:intron 5.0%
!!! TTTTTTTTTTTTATAGTTTT+TGG + Chr2:1929937-1929956 MsG0280006435.01.T01:intron 5.0%
AAAGTTGCAAGCCAGACCGT+TGG + Chr2:1930362-1930381 MsG0280006435.01.T01:intron 50.0%
ACGTGCACTGCAGATTGACA+AGG - Chr2:1931676-1931695 None:intergenic 50.0%
ACTGCGGAAGAATATTGCGC+TGG + Chr2:1927895-1927914 MsG0280006435.01.T01:intron 50.0%
ACTGCTGTCTTCGGTACGAT+TGG + Chr2:1928078-1928097 MsG0280006435.01.T01:CDS 50.0%
ACTTAAAGAGGAACGCGTCG+CGG + Chr2:1927428-1927447 MsG0280006435.01.T01:CDS 50.0%
AGCGCAATATTCTTCCGCAG+TGG - Chr2:1927896-1927915 None:intergenic 50.0%
ATGCACACAAGTGTCCCCTA+TGG + Chr2:1928498-1928517 MsG0280006435.01.T01:CDS 50.0%
CACTGCAGATTGACAAGGGT+AGG - Chr2:1931671-1931690 None:intergenic 50.0%
CATCACATAACTGGGGTCAG+GGG + Chr2:1930160-1930179 MsG0280006435.01.T01:intron 50.0%
CGTGCACTGCAGATTGACAA+GGG - Chr2:1931675-1931694 None:intergenic 50.0%
CTGCGGAAGAATATTGCGCT+GGG + Chr2:1927896-1927915 MsG0280006435.01.T01:intron 50.0%
CTGCTGTCTTCGGTACGATT+GGG + Chr2:1928079-1928098 MsG0280006435.01.T01:CDS 50.0%
GAACCTGAAGAAGCTGGTGA+TGG - Chr2:1933535-1933554 None:intergenic 50.0%
GGAACAATCCCAGAAGAGCT+AGG + Chr2:1932017-1932036 MsG0280006435.01.T01:intron 50.0%
TGGCCGAAAAATGGGAGCAA+TGG + Chr2:1928569-1928588 MsG0280006435.01.T01:CDS 50.0%
TGTGCTAGATCAGAAGCCCT+CGG - Chr2:1928198-1928217 None:intergenic 50.0%
TGTTCATCCGTGAATCGCCT+AGG - Chr2:1931448-1931467 None:intergenic 50.0%
TTAGTGCTTAGTCCGAGCCT+AGG + Chr2:1931428-1931447 MsG0280006435.01.T01:intron 50.0%
TTGTCAATCTGCAGTGCACG+TGG + Chr2:1931675-1931694 MsG0280006435.01.T01:intron 50.0%
! GCCATGGTTTGGCCGAAAAA+TGG + Chr2:1928560-1928579 MsG0280006435.01.T01:CDS 50.0%
!! ACTTACCAAGATGGCGGGAT+TGG + Chr2:1932453-1932472 MsG0280006435.01.T01:intron 50.0%
!! CCCATTTTTCGGCCAAACCA+TGG - Chr2:1928564-1928583 None:intergenic 50.0%
!! CTTACCAAGATGGCGGGATT+GGG + Chr2:1932454-1932473 MsG0280006435.01.T01:intron 50.0%
!! TGGCTCACTTGAGTTGAGAC+AGG + Chr2:1929575-1929594 MsG0280006435.01.T01:intron 50.0%
AAGACCCAATCCCGCCATCT+TGG - Chr2:1932461-1932480 None:intergenic 55.0%
ACTCTCAACCTCCGCTTGAG+TGG + Chr2:1927870-1927889 MsG0280006435.01.T01:intron 55.0%
ATATTGCGCTGGGATCTGCC+AGG + Chr2:1927906-1927925 MsG0280006435.01.T01:intron 55.0%
ATCCGTGAATCGCCTAGGCT+CGG - Chr2:1931443-1931462 None:intergenic 55.0%
ATGCACTGAGTGGGTGGTGA+AGG + Chr2:1932653-1932672 MsG0280006435.01.T01:intron 55.0%
CCACCATCACCAGCTTCTTC+AGG + Chr2:1933529-1933548 MsG0280006435.01.T01:CDS 55.0%
CTTAAAGAGGAACGCGTCGC+GGG + Chr2:1927429-1927448 MsG0280006435.01.T01:CDS 55.0%
TATTGCGCTGGGATCTGCCA+GGG + Chr2:1927907-1927926 MsG0280006435.01.T01:intron 55.0%
TCTAGAAGGGGACTTCCCAG+TGG + Chr2:1933332-1933351 MsG0280006435.01.T01:intron 55.0%
!! CCTGAAGAAGCTGGTGATGG+TGG - Chr2:1933532-1933551 None:intergenic 55.0%
!! GCTGGTGATGGTGGAGAAAG+AGG - Chr2:1933523-1933542 None:intergenic 55.0%
ATTGCGCTGGGATCTGCCAG+GGG + Chr2:1927908-1927927 MsG0280006435.01.T01:intron 60.0%
GAAGGGGACTTCCCAGTGGA+TGG + Chr2:1933336-1933355 MsG0280006435.01.T01:intron 60.0%
GTCCGAGCCTAGGCGATTCA+CGG + Chr2:1931438-1931457 MsG0280006435.01.T01:intron 60.0%
TGTCTTTACCGCGGCAGCTG+AGG + Chr2:1927248-1927267 MsG0280006435.01.T01:CDS 60.0%
TTCCGCAGTGGCCACTCAAG+CGG - Chr2:1927884-1927903 None:intergenic 60.0%
!! GATGGTGGAGAAAGAGGCGC+TGG - Chr2:1933517-1933536 None:intergenic 60.0%
AAAGAGGAACGCGTCGCGGG+TGG + Chr2:1927432-1927451 MsG0280006435.01.T01:CDS 65.0%
AGGATCCTCCTCAGCTGCCG+CGG - Chr2:1927259-1927278 None:intergenic 65.0%
CTCCGCTTGAGTGGCCACTG+CGG + Chr2:1927879-1927898 MsG0280006435.01.T01:intron 65.0%
CTTTACCGCGGCAGCTGAGG+AGG + Chr2:1927251-1927270 MsG0280006435.01.T01:CDS 65.0%
CGCAGTGGCCACTCAAGCGG+AGG - Chr2:1927881-1927900 None:intergenic 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr2 gene 1927201 1933660 1927201 ID=MsG0280006435.01;Name=MsG0280006435.01
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Protein sequence

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