AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0280006458.01

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MsG0280006458.01.T01 AT5G58300 35.071 211 119 6 1 209 342 536 4.58e-30 118
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MsG0280006458.01.T01 AT4G39400 35.570 149 88 3 8 151 870 1015 1.07e-19 88.6
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MsG0280006458.01.T01 AT2G23300 34.437 151 87 4 6 151 445 588 3.10e-17 81.3
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MsG0280006458.01.T01 AT4G04540 32.749 171 101 4 8 168 340 506 3.78e-17 80.9
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MsG0280006458.01.T01 AT5G06820 33.333 147 88 4 22 166 421 559 5.19e-17 80.5
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MsG0280006458.01.T01 AT4G27290 34.074 135 85 2 17 151 512 642 6.99e-17 80.1
MsG0280006458.01.T01 AT1G61400 33.108 148 90 3 9 151 488 631 7.15e-17 80.1
MsG0280006458.01.T01 AT1G16110 31.507 146 95 2 21 166 437 577 8.26e-17 79.7
MsG0280006458.01.T01 AT3G28040 35.862 145 80 6 13 151 723 860 8.43e-17 80.1
MsG0280006458.01.T01 AT2G26330 34.586 133 77 3 22 151 654 779 8.44e-17 80.1
MsG0280006458.01.T01 AT4G03230 35.526 152 89 3 5 151 602 749 1.05e-16 79.7
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MsG0280006458.01.T01 AT4G03230 35.526 152 89 3 5 151 574 721 1.08e-16 79.7
MsG0280006458.01.T01 AT4G03230 35.526 152 89 3 5 151 509 656 1.11e-16 79.7
MsG0280006458.01.T01 AT1G61480 33.784 148 89 3 9 151 484 627 1.12e-16 79.3
MsG0280006458.01.T01 AT3G28450 30.899 178 102 6 1 170 287 451 1.12e-16 79.3
MsG0280006458.01.T01 AT4G03230 35.526 152 89 3 5 151 517 664 1.14e-16 79.3
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MsG0280006458.01.T01 AT1G61390 35.556 135 83 2 17 151 521 651 8.42e-16 77.0
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MsG0280006458.01.T01 AT3G59350 30.159 189 116 6 17 199 114 292 9.57e-15 73.6
MsG0280006458.01.T01 AT4G23210 32.500 160 103 2 19 175 361 518 9.62e-15 73.6
MsG0280006458.01.T01 AT4G23210 32.500 160 103 2 19 175 361 518 9.62e-15 73.6
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MsG0280006458.01.T01 AT5G54590 32.308 130 83 3 22 151 119 243 9.87e-15 73.6
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MsG0280006458.01.T01 AT4G23190 31.111 135 89 2 17 151 273 403 1.05e-14 73.6
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MsG0280006458.01.T01 AT1G34210 33.562 146 90 4 22 166 311 450 2.35e-14 72.4
MsG0280006458.01.T01 AT4G23180 33.077 130 83 2 22 151 354 479 2.66e-14 72.4
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MsG0280006458.01.T01 AT2G42960 32.237 152 93 4 17 166 184 327 2.83e-14 72.0
MsG0280006458.01.T01 AT2G42960 32.237 152 93 4 17 166 184 327 2.83e-14 72.0
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MsG0280006458.01.T01 AT1G56720 32.192 146 93 3 21 166 184 323 5.15e-14 71.2
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MsG0280006458.01.T01 AT4G21400 33.077 130 83 2 22 151 355 480 8.77e-14 70.9
MsG0280006458.01.T01 AT5G66790 27.517 149 101 3 22 170 320 461 8.79e-14 70.9
MsG0280006458.01.T01 AT1G29740 33.077 130 82 3 22 151 683 807 8.80e-14 71.2
MsG0280006458.01.T01 AT1G07650 32.061 131 85 3 22 151 471 598 9.50e-14 70.9
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MsG0280006458.01.T01 AT4G11460 30.597 134 89 2 18 151 348 477 9.84e-14 70.9
MsG0280006458.01.T01 AT1G29740 33.077 130 82 3 22 151 683 807 1.02e-13 70.9
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MsG0280006458.01.T01 AT5G54590 33.333 111 71 1 22 132 119 226 1.13e-13 69.3
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MsG0280006458.01.T01 AT1G61430 34.586 133 80 3 22 151 495 623 1.22e-13 70.5
MsG0280006458.01.T01 AT1G77280 33.846 130 82 3 22 151 410 535 1.25e-13 70.5
MsG0280006458.01.T01 AT1G77280 33.846 130 82 3 22 151 410 535 1.25e-13 70.5
MsG0280006458.01.T01 AT1G07650 32.061 131 85 3 22 151 690 817 1.27e-13 70.5
MsG0280006458.01.T01 AT1G11050 31.343 134 86 2 22 151 301 432 1.27e-13 70.5
MsG0280006458.01.T01 AT1G11280 33.333 150 91 3 7 151 491 636 1.29e-13 70.5
MsG0280006458.01.T01 AT1G23540 31.507 146 90 4 22 166 377 513 1.30e-13 70.5
MsG0280006458.01.T01 AT4G39110 30.405 148 93 5 9 151 514 656 1.35e-13 70.5
MsG0280006458.01.T01 AT1G48210 29.255 188 117 7 17 199 69 245 1.38e-13 69.3
MsG0280006458.01.T01 AT1G48210 29.255 188 117 7 17 199 69 245 1.38e-13 69.3
MsG0280006458.01.T01 AT1G48210 29.255 188 117 7 17 199 69 245 1.38e-13 69.3
MsG0280006458.01.T01 AT5G62710 32.593 135 82 3 20 151 316 444 1.42e-13 70.1
MsG0280006458.01.T01 AT1G11130 34.043 141 85 4 22 157 503 640 1.46e-13 70.5
MsG0280006458.01.T01 AT5G60300 32.895 152 92 3 5 151 328 474 1.50e-13 70.1
MsG0280006458.01.T01 AT5G60300 32.895 152 92 3 5 151 328 474 1.50e-13 70.1
MsG0280006458.01.T01 AT2G20850 32.576 132 84 3 22 151 484 612 1.51e-13 70.1
MsG0280006458.01.T01 AT3G46330 31.707 164 105 4 7 170 533 689 1.54e-13 70.1
MsG0280006458.01.T01 AT4G33430 32.727 165 99 5 8 166 323 481 1.56e-13 70.1
MsG0280006458.01.T01 AT3G26940 33.077 130 84 2 22 151 80 206 1.57e-13 69.7
MsG0280006458.01.T01 AT1G11130 34.043 141 85 4 22 157 425 562 1.58e-13 70.1
MsG0280006458.01.T01 AT5G62710 32.593 135 82 3 20 151 282 410 1.59e-13 70.1
MsG0280006458.01.T01 AT3G59420 31.126 151 97 3 22 170 518 663 1.65e-13 70.1
MsG0280006458.01.T01 AT5G18500 33.846 130 83 2 22 151 172 298 1.65e-13 70.1
MsG0280006458.01.T01 AT5G18500 33.846 130 83 2 22 151 172 298 1.65e-13 70.1
MsG0280006458.01.T01 AT5G18500 33.846 130 83 2 22 151 172 298 1.65e-13 70.1
MsG0280006458.01.T01 AT5G18500 33.846 130 83 2 22 151 172 298 1.65e-13 70.1
MsG0280006458.01.T01 AT5G18500 33.846 130 83 2 22 151 172 298 1.65e-13 70.1
MsG0280006458.01.T01 AT5G18500 33.846 130 83 2 22 151 172 298 1.65e-13 70.1
MsG0280006458.01.T01 AT3G46330 31.707 164 105 4 7 170 557 713 1.67e-13 70.1
MsG0280006458.01.T01 AT4G23310 32.308 130 84 2 22 151 474 599 1.71e-13 70.1
MsG0280006458.01.T01 AT4G23310 32.308 130 84 2 22 151 514 639 1.74e-13 70.1
MsG0280006458.01.T01 AT4G33430 32.727 165 99 5 8 166 276 434 1.77e-13 70.1
MsG0280006458.01.T01 AT3G24550 32.680 153 89 5 6 151 265 410 1.93e-13 69.7
MsG0280006458.01.T01 AT1G61370 32.308 130 84 2 22 151 356 481 1.94e-13 69.7
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MsG0280006458.01.T01 AT1G09440 33.588 131 84 2 21 151 162 289 1.97e-13 69.7
MsG0280006458.01.T01 AT1G09440 33.588 131 84 2 21 151 162 289 1.97e-13 69.7
MsG0280006458.01.T01 AT4G23280 32.308 130 84 2 22 151 348 473 1.99e-13 69.7
MsG0280006458.01.T01 AT1G70460 32.414 145 90 4 22 166 359 495 2.02e-13 69.7
MsG0280006458.01.T01 AT5G59700 31.298 131 85 2 21 151 487 612 2.03e-13 70.1
MsG0280006458.01.T01 AT5G60300 32.895 152 92 3 5 151 328 474 2.04e-13 69.7
MsG0280006458.01.T01 AT4G11460 29.710 138 88 3 18 151 348 480 2.05e-13 69.7
MsG0280006458.01.T01 AT2G21480 30.597 134 88 4 18 151 527 655 2.34e-13 69.7
MsG0280006458.01.T01 AT1G07870 32.824 131 84 3 22 151 109 236 2.34e-13 69.3
MsG0280006458.01.T01 AT5G25930 31.410 156 89 6 21 166 690 837 2.45e-13 69.7
MsG0280006458.01.T01 AT4G21410 31.852 135 88 2 17 151 358 488 2.57e-13 69.3
MsG0280006458.01.T01 AT1G07870 32.824 131 84 3 22 151 109 236 2.83e-13 69.3
MsG0280006458.01.T01 AT4G35030 31.298 131 87 2 21 151 109 236 2.96e-13 68.6
MsG0280006458.01.T01 AT4G35030 31.298 131 87 2 21 151 109 236 2.96e-13 68.6
MsG0280006458.01.T01 AT2G19130 30.405 148 97 3 7 151 481 625 3.12e-13 69.3
MsG0280006458.01.T01 AT4G21410 31.852 135 88 2 17 151 233 363 3.15e-13 69.3
MsG0280006458.01.T01 AT1G70520 34.586 133 83 2 19 151 328 456 3.16e-13 69.3
MsG0280006458.01.T01 AT1G70530 32.414 145 91 3 22 166 329 466 3.25e-13 69.3
MsG0280006458.01.T01 AT1G29750 28.462 130 90 2 22 151 672 798 3.28e-13 69.3

Find 55 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 89 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GCAAGCAAAGGCAACAAATT+AGG 0.235090 2:-2193487 None:intergenic
AGTAACTCAGGGATGTTTAT+TGG 0.249970 2:+2194612 MsG0280006458.01.T01:CDS
GGCATTAGGTCATGGAATTA+TGG 0.259858 2:+2193339 MsG0280006458.01.T01:CDS
TTCATCTCAGGACGTTTCTC+TGG 0.263626 2:-2194483 None:intergenic
TGTTGAGGTGAAGGTATTCT+AGG 0.310683 2:-2194046 None:intergenic
TTCCATGAGGGACAATGTTA+TGG 0.328917 2:-2194076 None:intergenic
AGAGCTTCTGCTGAGGCATT+AGG 0.348498 2:+2193325 MsG0280006458.01.T01:CDS
CAGATGGAAGAGATGGAAAC+AGG 0.354812 2:+2193970 MsG0280006458.01.T01:intron
AATCTTGAGTTCCAATTGAA+TGG 0.366265 2:-2193996 None:intergenic
CAAGCAAAGGCAACAAATTA+GGG 0.369454 2:-2193486 None:intergenic
TATAAGGCTATGTTGAATAA+TGG 0.372738 2:+2193370 MsG0280006458.01.T01:CDS
GCATTAGGTCATGGAATTAT+GGG 0.381805 2:+2193340 MsG0280006458.01.T01:CDS
GAAACAGGGTTCCATTCAAT+TGG 0.383187 2:+2193985 MsG0280006458.01.T01:CDS
CCCTGAGTTACTAGTTGAAC+AGG 0.387680 2:-2194601 None:intergenic
GAGCATTAGCTTCTCATCTC+TGG 0.389088 2:-2193521 None:intergenic
AATTATGGGGAATAGTTATA+AGG 0.391590 2:+2193354 MsG0280006458.01.T01:CDS
TGTCAAAAGAGTGCTCTTCC+TGG 0.392539 2:+2194414 MsG0280006458.01.T01:CDS
GTGCTCTTCCTGGGATGTTA+AGG 0.394414 2:+2194424 MsG0280006458.01.T01:CDS
TGATGAGACAAAATTTCAAA+TGG 0.400382 2:+2193291 MsG0280006458.01.T01:CDS
GCAAATTCCTCCTTAGTGAA+TGG 0.434476 2:-2193430 None:intergenic
TACCATGAAGTCGTGAGAAA+AGG 0.458693 2:-2193567 None:intergenic
CTAACAACCTCTTTCATCTC+AGG 0.460907 2:-2194495 None:intergenic
GAAAGAGGTTGTTAGAGAAG+TGG 0.467999 2:+2194503 MsG0280006458.01.T01:CDS
ATCCATAACATTGTCCCTCA+TGG 0.475249 2:+2194074 MsG0280006458.01.T01:CDS
CTCTATAGATATGCACAGAA+TGG 0.483478 2:+2193541 MsG0280006458.01.T01:CDS
TCCTGTTCAACTAGTAACTC+AGG 0.487648 2:+2194600 MsG0280006458.01.T01:CDS
GACCTACCATTGTTGTAAAG+AGG 0.490990 2:+2193392 MsG0280006458.01.T01:CDS
TCATCTCAGGACGTTTCTCT+GGG 0.497839 2:-2194482 None:intergenic
GTCAAAAGAGTGCTCTTCCT+GGG 0.507443 2:+2194415 MsG0280006458.01.T01:CDS
GTTGAGGTGAAGGTATTCTA+GGG 0.512524 2:-2194045 None:intergenic
GATGAGACAAAATTTCAAAT+GGG 0.513928 2:+2193292 MsG0280006458.01.T01:CDS
AGAAGTGGAGAAAATACAAC+AGG 0.519996 2:+2194518 MsG0280006458.01.T01:CDS
GGATCTTGTTGTTGAGGTGA+AGG 0.529336 2:-2194055 None:intergenic
ACTTTATCAGATGGAAGAGA+TGG 0.538361 2:+2193963 MsG0280006458.01.T01:intron
AGACTTAAAACCATTCACTA+AGG 0.550110 2:+2193420 MsG0280006458.01.T01:CDS
ATAGAGCTGTGAGAGAAGAA+TGG 0.550432 2:+2194361 MsG0280006458.01.T01:CDS
ACACTTGATGTCAGAAGATG+AGG 0.571768 2:+2194542 MsG0280006458.01.T01:CDS
TGCAACAACCTTAACATCCC+AGG 0.571927 2:-2194432 None:intergenic
TGTTATGGATCTTGTTGTTG+AGG 0.575641 2:-2194061 None:intergenic
GAAACGTCCTGAGATGAAAG+AGG 0.578646 2:+2194488 MsG0280006458.01.T01:CDS
TCTGCTGAGGCATTAGGTCA+TGG 0.581923 2:+2193331 MsG0280006458.01.T01:CDS
AAGACTTCAAATTTCCATGA+GGG 0.585520 2:-2194088 None:intergenic
TAGCAATGAGATGTATTGAA+AGG 0.592174 2:+2194457 MsG0280006458.01.T01:CDS
CTTAAAACCATTCACTAAGG+AGG 0.610571 2:+2193423 MsG0280006458.01.T01:CDS
CATTAGGTCATGGAATTATG+GGG 0.616117 2:+2193341 MsG0280006458.01.T01:CDS
ATTATCAGTGGCAAGAGGCG+TGG 0.617234 2:+2194016 MsG0280006458.01.T01:CDS
TCTTAACCTCTTTACAACAA+TGG 0.618870 2:-2193398 None:intergenic
AACCTCTTTACAACAATGGT+AGG 0.620331 2:-2193394 None:intergenic
CCTGTTCAACTAGTAACTCA+GGG 0.623274 2:+2194601 MsG0280006458.01.T01:CDS
GAATGATAGTAAGCAAGCAA+AGG 0.640031 2:-2193499 None:intergenic
TTGGAACTCAAGATTATCAG+TGG 0.640720 2:+2194004 MsG0280006458.01.T01:CDS
AGATGGAAGAGATGGAAACA+GGG 0.652786 2:+2193971 MsG0280006458.01.T01:intron
GAAGACTTCAAATTTCCATG+AGG 0.653778 2:-2194089 None:intergenic
ACTTCTTAGAGCTTCTGCTG+AGG 0.655336 2:+2193318 MsG0280006458.01.T01:CDS
TCAAGATTATCAGTGGCAAG+AGG 0.663540 2:+2194011 MsG0280006458.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ACAATAATGTATAGTTACAA+AGG + Chr2:2193898-2193917 MsG0280006458.01.T01:intron 20.0%
!! CAATAATGTATAGTTACAAA+GGG + Chr2:2193899-2193918 MsG0280006458.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTTAATAGAACTTGTAACT+GGG + Chr2:2194278-2194297 MsG0280006458.01.T01:intron 20.0%
! AATTATGGGGAATAGTTATA+AGG + Chr2:2193354-2193373 MsG0280006458.01.T01:CDS 25.0%
! ACAGATTCAGAATGAAAAAA+AGG - Chr2:2193610-2193629 None:intergenic 25.0%
! GATGAGACAAAATTTCAAAT+GGG + Chr2:2193292-2193311 MsG0280006458.01.T01:CDS 25.0%
! TATAAGGCTATGTTGAATAA+TGG + Chr2:2193370-2193389 MsG0280006458.01.T01:CDS 25.0%
! TGATGAGACAAAATTTCAAA+TGG + Chr2:2193291-2193310 MsG0280006458.01.T01:CDS 25.0%
!! CTTTTAATAGAACTTGTAAC+TGG + Chr2:2194277-2194296 MsG0280006458.01.T01:intron 25.0%
!!! AGCTTTTAGCTTATACTAAT+TGG + Chr2:2193750-2193769 MsG0280006458.01.T01:intron 25.0%
!!! GTTTTACATAGTCTTAACAT+AGG + Chr2:2193846-2193865 MsG0280006458.01.T01:intron 25.0%
!!! TGTCGGTTCAATAAAAAATA+AGG - Chr2:2193686-2193705 None:intergenic 25.0%
AAGACTTCAAATTTCCATGA+GGG - Chr2:2194091-2194110 None:intergenic 30.0%
AATCTTGAGTTCCAATTGAA+TGG - Chr2:2193999-2194018 None:intergenic 30.0%
AGACTTAAAACCATTCACTA+AGG + Chr2:2193420-2193439 MsG0280006458.01.T01:CDS 30.0%
GTTTACAAATCACCTGAATA+TGG + Chr2:2194205-2194224 MsG0280006458.01.T01:intron 30.0%
TAGCAATGAGATGTATTGAA+AGG + Chr2:2194457-2194476 MsG0280006458.01.T01:CDS 30.0%
TAGTATAAGCTAAAAGCTCA+TGG - Chr2:2193748-2193767 None:intergenic 30.0%
TCTTAACCTCTTTACAACAA+TGG - Chr2:2193401-2193420 None:intergenic 30.0%
TGATAAAGTCATGCACAATT+TGG - Chr2:2193952-2193971 None:intergenic 30.0%
TTACAATGCAATCAGATGTT+TGG + Chr2:2194242-2194261 MsG0280006458.01.T01:intron 30.0%
TTTCTTGCATAACCATATTC+AGG - Chr2:2194220-2194239 None:intergenic 30.0%
AACCTCTTTACAACAATGGT+AGG - Chr2:2193397-2193416 None:intergenic 35.0%
ACTTTATCAGATGGAAGAGA+TGG + Chr2:2193963-2193982 MsG0280006458.01.T01:intron 35.0%
AGAAGTGGAGAAAATACAAC+AGG + Chr2:2194518-2194537 MsG0280006458.01.T01:CDS 35.0%
AGTAACTCAGGGATGTTTAT+TGG + Chr2:2194612-2194631 MsG0280006458.01.T01:CDS 35.0%
CAAGCAAAGGCAACAAATTA+GGG - Chr2:2193489-2193508 None:intergenic 35.0%
CATTAGGTCATGGAATTATG+GGG + Chr2:2193341-2193360 MsG0280006458.01.T01:CDS 35.0%
CTCTATAGATATGCACAGAA+TGG + Chr2:2193541-2193560 MsG0280006458.01.T01:CDS 35.0%
CTTAAAACCATTCACTAAGG+AGG + Chr2:2193423-2193442 MsG0280006458.01.T01:CDS 35.0%
GAAGACTTCAAATTTCCATG+AGG - Chr2:2194092-2194111 None:intergenic 35.0%
GAATGATAGTAAGCAAGCAA+AGG - Chr2:2193502-2193521 None:intergenic 35.0%
GCATTAGGTCATGGAATTAT+GGG + Chr2:2193340-2193359 MsG0280006458.01.T01:CDS 35.0%
TTGGAACTCAAGATTATCAG+TGG + Chr2:2194004-2194023 MsG0280006458.01.T01:CDS 35.0%
TTGTGCATGACTTTATCAGA+TGG + Chr2:2193954-2193973 MsG0280006458.01.T01:intron 35.0%
TTTATTGAACCGACATCGAT+TGG + Chr2:2193691-2193710 MsG0280006458.01.T01:intron 35.0%
! CAATCAGATGTTTGGAGTTA+TGG + Chr2:2194250-2194269 MsG0280006458.01.T01:intron 35.0%
! TATTGGTTGTGCTATTAACG+CGG - Chr2:2194167-2194186 None:intergenic 35.0%
! TTATTGAACCGACATCGATT+GGG + Chr2:2193692-2193711 MsG0280006458.01.T01:intron 35.0%
!! TGTTATGGATCTTGTTGTTG+AGG - Chr2:2194064-2194083 None:intergenic 35.0%
ACACTTGATGTCAGAAGATG+AGG + Chr2:2194542-2194561 MsG0280006458.01.T01:CDS 40.0%
ACCAATAGCAGCTCAACATA+TGG + Chr2:2194180-2194199 MsG0280006458.01.T01:intron 40.0%
ACCATATGTTGAGCTGCTAT+TGG - Chr2:2194184-2194203 None:intergenic 40.0%
AGATGGAAGAGATGGAAACA+GGG + Chr2:2193971-2193990 MsG0280006458.01.T01:intron 40.0%
ATAGAGCTGTGAGAGAAGAA+TGG + Chr2:2194361-2194380 MsG0280006458.01.T01:CDS 40.0%
ATCCATAACATTGTCCCTCA+TGG + Chr2:2194074-2194093 MsG0280006458.01.T01:CDS 40.0%
ATGGTGTGGATCTTTGTAGT+TGG + Chr2:2194335-2194354 MsG0280006458.01.T01:intron 40.0%
CCTGTTCAACTAGTAACTCA+GGG + Chr2:2194601-2194620 MsG0280006458.01.T01:CDS 40.0%
CTAACAACCTCTTTCATCTC+AGG - Chr2:2194498-2194517 None:intergenic 40.0%
GAAACAGGGTTCCATTCAAT+TGG + Chr2:2193985-2194004 MsG0280006458.01.T01:CDS 40.0%
GAAAGAGGTTGTTAGAGAAG+TGG + Chr2:2194503-2194522 MsG0280006458.01.T01:CDS 40.0%
GACCTACCATTGTTGTAAAG+AGG + Chr2:2193392-2193411 MsG0280006458.01.T01:CDS 40.0%
GCAAATTCCTCCTTAGTGAA+TGG - Chr2:2193433-2193452 None:intergenic 40.0%
GCAAGCAAAGGCAACAAATT+AGG - Chr2:2193490-2193509 None:intergenic 40.0%
GGCATTAGGTCATGGAATTA+TGG + Chr2:2193339-2193358 MsG0280006458.01.T01:CDS 40.0%
TACCATGAAGTCGTGAGAAA+AGG - Chr2:2193570-2193589 None:intergenic 40.0%
TCAAGATTATCAGTGGCAAG+AGG + Chr2:2194011-2194030 MsG0280006458.01.T01:CDS 40.0%
TCCTGTTCAACTAGTAACTC+AGG + Chr2:2194600-2194619 MsG0280006458.01.T01:CDS 40.0%
TGGTGTGGATCTTTGTAGTT+GGG + Chr2:2194336-2194355 MsG0280006458.01.T01:intron 40.0%
TTCCATGAGGGACAATGTTA+TGG - Chr2:2194079-2194098 None:intergenic 40.0%
! AACCTTTTCTCACGACTTCA+TGG + Chr2:2193565-2193584 MsG0280006458.01.T01:CDS 40.0%
!! GTTGAGGTGAAGGTATTCTA+GGG - Chr2:2194048-2194067 None:intergenic 40.0%
!! TGTTGAGGTGAAGGTATTCT+AGG - Chr2:2194049-2194068 None:intergenic 40.0%
ACTTCTTAGAGCTTCTGCTG+AGG + Chr2:2193318-2193337 MsG0280006458.01.T01:CDS 45.0%
CAGATGGAAGAGATGGAAAC+AGG + Chr2:2193970-2193989 MsG0280006458.01.T01:intron 45.0%
CCCTGAGTTACTAGTTGAAC+AGG - Chr2:2194604-2194623 None:intergenic 45.0%
CGCAGTATCAGTTGTAAGGA+CGG + Chr2:2193716-2193735 MsG0280006458.01.T01:intron 45.0%
GAAACGTCCTGAGATGAAAG+AGG + Chr2:2194488-2194507 MsG0280006458.01.T01:CDS 45.0%
GCAGTATCAGTTGTAAGGAC+GGG + Chr2:2193717-2193736 MsG0280006458.01.T01:intron 45.0%
TCATCTCAGGACGTTTCTCT+GGG - Chr2:2194485-2194504 None:intergenic 45.0%
TGCAACAACCTTAACATCCC+AGG - Chr2:2194435-2194454 None:intergenic 45.0%
TTCATCTCAGGACGTTTCTC+TGG - Chr2:2194486-2194505 None:intergenic 45.0%
! GAGCATTAGCTTCTCATCTC+TGG - Chr2:2193524-2193543 None:intergenic 45.0%
!! GGATCTTGTTGTTGAGGTGA+AGG - Chr2:2194058-2194077 None:intergenic 45.0%
!! GTCAAAAGAGTGCTCTTCCT+GGG + Chr2:2194415-2194434 MsG0280006458.01.T01:CDS 45.0%
!! TGTCAAAAGAGTGCTCTTCC+TGG + Chr2:2194414-2194433 MsG0280006458.01.T01:CDS 45.0%
ATTATCAGTGGCAAGAGGCG+TGG + Chr2:2194016-2194035 MsG0280006458.01.T01:CDS 50.0%
CTATGTGCTCAGCTCCACAA+GGG + Chr2:2194308-2194327 MsG0280006458.01.T01:intron 50.0%
GGGTCGCAGTATCAGTTGTA+AGG + Chr2:2193712-2193731 MsG0280006458.01.T01:intron 50.0%
GTGCTCTTCCTGGGATGTTA+AGG + Chr2:2194424-2194443 MsG0280006458.01.T01:CDS 50.0%
TAACGCGGCAAGGCTAAAGT+CGG - Chr2:2194152-2194171 None:intergenic 50.0%
TACTGCGACCCAATCGATGT+CGG - Chr2:2193703-2193722 None:intergenic 50.0%
TCAGCTCCACAAGGGACTAA+TGG + Chr2:2194316-2194335 MsG0280006458.01.T01:intron 50.0%
TCCACAAGGGACTAATGGTG+TGG + Chr2:2194321-2194340 MsG0280006458.01.T01:intron 50.0%
TCCACACCATTAGTCCCTTG+TGG - Chr2:2194325-2194344 None:intergenic 50.0%
TCTATGTGCTCAGCTCCACA+AGG + Chr2:2194307-2194326 MsG0280006458.01.T01:intron 50.0%
! AGAGCTTCTGCTGAGGCATT+AGG + Chr2:2193325-2193344 MsG0280006458.01.T01:CDS 50.0%
! GTTGTGCTATTAACGCGGCA+AGG - Chr2:2194162-2194181 None:intergenic 50.0%
! TCTGCTGAGGCATTAGGTCA+TGG + Chr2:2193331-2193350 MsG0280006458.01.T01:CDS 50.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr2 gene 2193280 2194647 2193280 ID=MsG0280006458.01;Name=MsG0280006458.01
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Chr2 exon 2193280 2193586 2193280 ID=MsG0280006458.01.T01:exon:331;Parent=MsG0280006458.01.T01
Chr2 exon 2193973 2194115 2193973 ID=MsG0280006458.01.T01:exon:332;Parent=MsG0280006458.01.T01
Chr2 exon 2194354 2194647 2194354 ID=MsG0280006458.01.T01:exon:333;Parent=MsG0280006458.01.T01
Chr2 CDS 2193280 2193586 2193280 ID=MsG0280006458.01.T01:cds;Parent=MsG0280006458.01.T01
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Gene Sequence

>MsG0280006458.01.T01

ATGTTCTTTAATGATGAGACAAAATTTCAAATGGGAGAACTTCTTAGAGCTTCTGCTGAGGCATTAGGTCATGGAATTATGGGGAATAGTTATAAGGCTATGTTGAATAATGGACCTACCATTGTTGTAAAGAGGTTAAGAGACTTAAAACCATTCACTAAGGAGGAATTTGCAAAGATAGTGAAAATGATTGCTGATCTTAAACACCCTAATTTGTTGCCTTTGCTTGCTTACTATCATTCCAGAGATGAGAAGCTAATGCTCTATAGATATGCACAGAATGGAAACCTTTTCTCACGACTTCATGATGGAAGAGATGGAAACAGGGTTCCATTCAATTGGAACTCAAGATTATCAGTGGCAAGAGGCGTGGCTCGAGCCCTAGAATACCTTCACCTCAACAACAAGATCCATAACATTGTCCCTCATGGAAATTTGAAGTCTTCAAATTTGGGTCATAGAGCTGTGAGAGAAGAATGGACTGCTGAAATATTTGACAAAGAAATATCTTGTCAAAAGAGTGCTCTTCCTGGGATGTTAAGGTTGTTGCAGATAGCAATGAGATGTATTGAAAGGTTCCCAGAGAAACGTCCTGAGATGAAAGAGGTTGTTAGAGAAGTGGAGAAAATACAACAGGTACACTTGATGTCAGAAGATGAGGATGATGTGTCTTGTGATGTGTCTCTAACTGATGATTCCTGTTCAACTAGTAACTCAGGGATGTTTATTGGAGATGAAAGATAG
Protein sequence

>MsG0280006458.01.T01

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