AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0280006904.01

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MsG0280006904.01.T01 AT3G29160 45.113 266 142 2 3 267 11 273 1.05e-78 253
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MsG0280006904.01.T01 AT3G01090 44.828 261 140 2 8 267 38 295 8.83e-78 251
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MsG0280006904.01.T01 AT4G04720 35.581 267 158 7 12 269 80 341 3.24e-44 162
MsG0280006904.01.T01 AT1G50700 34.672 274 165 7 12 276 73 341 3.62e-44 162
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MsG0280006904.01.T01 AT5G66210 32.852 277 168 9 12 276 62 332 1.96e-42 157
MsG0280006904.01.T01 AT3G57530 34.191 272 157 8 11 269 62 324 2.79e-42 155
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MsG0280006904.01.T01 AT3G57530 34.191 272 157 8 11 269 62 324 9.69e-42 155
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MsG0280006904.01.T01 AT3G10660 32.967 273 164 9 12 275 186 448 1.84e-41 156
MsG0280006904.01.T01 AT4G04700 34.507 284 165 9 12 279 28 306 1.92e-41 154
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MsG0280006904.01.T01 AT4G21940 34.457 267 161 7 12 269 102 363 6.14e-40 150
MsG0280006904.01.T01 AT4G21940 34.457 267 161 7 12 269 102 363 6.94e-40 150
MsG0280006904.01.T01 AT3G51850 33.333 279 164 8 11 276 53 322 1.65e-39 149
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MsG0280006904.01.T01 AT1G48490 32.075 318 180 8 7 293 823 1135 1.73e-39 152
MsG0280006904.01.T01 AT1G48490 32.075 318 180 8 7 293 823 1135 1.73e-39 152
MsG0280006904.01.T01 AT1G48490 32.075 318 180 8 7 293 824 1136 1.73e-39 152
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MsG0280006904.01.T01 AT5G57565 56.757 111 45 1 72 182 19 126 2.96e-39 139
MsG0280006904.01.T01 AT3G51850 33.333 279 164 8 11 276 53 322 3.61e-39 148
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MsG0280006904.01.T01 AT2G35890 32.852 277 170 8 1 267 121 391 7.37e-39 147
MsG0280006904.01.T01 AT2G17290 33.333 264 162 7 12 266 85 343 9.53e-39 147
MsG0280006904.01.T01 AT2G17290 33.333 264 162 7 12 266 85 343 9.53e-39 147
MsG0280006904.01.T01 AT4G04695 34.507 284 165 9 12 279 28 306 9.96e-39 146
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MsG0280006904.01.T01 AT4G04740 35.039 254 149 9 26 269 83 330 1.70e-38 146
MsG0280006904.01.T01 AT4G04740 35.039 254 149 9 26 269 83 330 1.70e-38 146
MsG0280006904.01.T01 AT4G04740 35.039 254 149 9 26 269 83 330 1.70e-38 146
MsG0280006904.01.T01 AT4G04740 35.039 254 149 9 26 269 83 330 1.70e-38 146
MsG0280006904.01.T01 AT4G04740 35.039 254 149 9 26 269 83 330 1.70e-38 146
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MsG0280006904.01.T01 AT4G38230 32.576 264 164 7 12 266 54 312 2.17e-38 146
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MsG0280006904.01.T01 AT3G45240 31.538 260 167 5 16 266 112 369 3.50e-38 143
MsG0280006904.01.T01 AT3G45240 31.538 260 167 5 16 266 112 369 3.50e-38 143
MsG0280006904.01.T01 AT3G04530 29.478 268 175 6 8 266 7 269 4.56e-38 140
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MsG0280006904.01.T01 AT1G30640 32.353 306 156 7 12 267 27 331 1.55e-37 142
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MsG0280006904.01.T01 AT1G08650 31.321 265 168 7 10 266 13 271 5.56e-37 137
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MsG0280006904.01.T01 AT1G30640 32.248 307 155 8 12 267 120 424 8.33e-37 142
MsG0280006904.01.T01 AT4G04710 33.955 268 155 8 12 267 36 293 3.89e-36 139
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MsG0280006904.01.T01 AT3G45780 29.043 303 178 6 1 267 652 953 6.40e-36 141
MsG0280006904.01.T01 AT3G49370 32.963 270 163 8 11 267 141 405 8.14e-36 139
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MsG0280006904.01.T01 AT1G50240 29.368 269 176 6 12 275 6 265 1.61e-34 137
MsG0280006904.01.T01 AT1G03920 31.179 263 139 4 12 233 24 285 3.55e-34 133
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MsG0280006904.01.T01 AT2G20470 31.518 257 135 4 17 233 129 384 1.53e-33 133
MsG0280006904.01.T01 AT4G14350 31.023 303 160 8 12 267 119 419 1.64e-33 132
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MsG0280006904.01.T01 AT1G03920 31.179 263 139 4 12 233 137 398 1.70e-33 133
MsG0280006904.01.T01 AT4G14350 31.023 303 160 8 12 267 119 419 2.01e-33 132
MsG0280006904.01.T01 AT4G14350 31.023 303 160 8 12 267 119 419 2.01e-33 132
MsG0280006904.01.T01 AT4G14350 31.023 303 160 8 12 267 119 419 2.01e-33 132
MsG0280006904.01.T01 AT3G13530 28.261 276 190 5 3 274 11 282 4.09e-32 130
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MsG0280006904.01.T01 AT2G46700 32.609 230 138 7 55 273 8 231 5.96e-32 126
MsG0280006904.01.T01 AT3G07980 28.727 275 188 5 3 273 11 281 2.41e-31 128
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MsG0280006904.01.T01 AT5G18700 27.986 293 183 6 9 295 1 271 4.89e-31 127
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MsG0280006904.01.T01 AT5G57565 59.770 87 35 0 72 158 19 105 9.24e-31 115
MsG0280006904.01.T01 AT4G24100 29.630 297 184 8 12 298 33 314 9.86e-31 125
MsG0280006904.01.T01 AT4G24100 29.630 297 184 8 12 298 33 314 1.05e-30 125
MsG0280006904.01.T01 AT4G24100 29.630 297 184 8 12 298 49 330 1.11e-30 125
MsG0280006904.01.T01 AT4G24100 29.630 297 184 8 12 298 49 330 1.12e-30 125
MsG0280006904.01.T01 AT4G08470 29.845 258 167 8 15 265 306 556 2.07e-30 124
MsG0280006904.01.T01 AT4G08470 29.845 258 167 8 15 265 224 474 3.17e-30 122
MsG0280006904.01.T01 AT3G15220 33.716 261 159 7 17 271 20 272 3.51e-30 124
MsG0280006904.01.T01 AT1G67890 33.610 241 140 8 7 235 354 586 3.68e-30 123
MsG0280006904.01.T01 AT5G49470 31.481 270 157 10 7 262 199 454 4.60e-30 122
MsG0280006904.01.T01 AT1G67890 33.610 241 140 8 7 235 482 714 5.11e-30 123
MsG0280006904.01.T01 AT1G67890 33.610 241 140 8 7 235 482 714 5.11e-30 123
MsG0280006904.01.T01 AT1G53165 37.321 209 118 6 17 220 20 220 5.20e-30 123
MsG0280006904.01.T01 AT1G09000 26.380 326 209 8 15 326 72 380 5.89e-30 123
MsG0280006904.01.T01 AT1G53165 37.321 209 118 6 17 220 20 220 6.04e-30 123
MsG0280006904.01.T01 AT1G53570 29.545 264 172 8 12 267 214 471 6.47e-30 122
MsG0280006904.01.T01 AT1G53570 29.545 264 172 8 12 267 214 471 6.60e-30 122
MsG0280006904.01.T01 AT1G53165 37.321 209 118 6 17 220 20 220 7.14e-30 123
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MsG0280006904.01.T01 AT1G63700 28.030 264 178 5 11 267 399 657 8.72e-30 123
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MsG0280006904.01.T01 AT4G19110 29.252 294 169 9 9 270 1 287 1.02e-23 103
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MsG0280006904.01.T01 AT3G21220 28.782 271 171 8 18 278 76 334 1.14e-23 102
MsG0280006904.01.T01 AT4G29810 27.547 265 174 8 16 268 74 332 1.20e-23 102
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MsG0280006904.01.T01 AT4G13020 30.196 255 162 8 9 256 1 246 3.76e-23 101
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MsG0280006904.01.T01 AT4G12020 25.283 265 173 7 12 265 1618 1868 4.34e-23 103
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MsG0280006904.01.T01 AT4G12020 25.283 265 173 7 12 265 1551 1801 4.63e-23 103
MsG0280006904.01.T01 AT4G35780 27.203 261 177 7 7 262 287 539 4.79e-23 102
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MsG0280006904.01.T01 AT4G22940 31.532 222 136 6 12 224 103 317 5.18e-23 101
MsG0280006904.01.T01 AT4G26890 28.295 258 161 9 15 263 8 250 5.36e-23 101
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MsG0280006904.01.T01 AT4G13020 29.845 258 165 8 6 256 6 254 7.52e-23 100
MsG0280006904.01.T01 AT3G06630 34.392 189 111 5 7 189 429 610 8.34e-23 101
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MsG0280006904.01.T01 AT3G14720 32.381 210 126 7 10 208 23 227 1.04e-22 100
MsG0280006904.01.T01 AT4G29810 27.907 258 168 8 16 261 83 334 1.63e-22 98.6
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MsG0280006904.01.T01 AT2G17700 27.344 256 175 6 11 262 285 533 2.33e-22 100
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MsG0280006904.01.T01 AT1G01560 29.864 221 146 4 16 231 44 260 2.85e-22 96.7
MsG0280006904.01.T01 AT3G58760 31.416 226 138 7 18 232 172 391 3.06e-22 99.4
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MsG0280006904.01.T01 AT3G58760 31.416 226 138 7 18 232 235 454 3.56e-22 99.4
MsG0280006904.01.T01 AT4G14480 27.660 282 176 6 12 267 15 294 3.59e-22 99.4
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MsG0280006904.01.T01 AT5G28290 25.758 264 178 8 9 263 1 255 3.91e-22 99.8
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MsG0280006904.01.T01 AT1G54510 24.742 291 179 9 9 285 1 265 8.54e-22 98.6
MsG0280006904.01.T01 AT1G54510 24.742 291 179 9 9 285 1 265 8.54e-22 98.6
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MsG0280006904.01.T01 AT3G58640 32.020 203 128 6 14 212 555 751 1.64e-21 98.2
MsG0280006904.01.T01 AT2G43790 30.040 253 153 9 18 256 69 311 1.64e-21 96.3
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MsG0280006904.01.T01 AT2G31010 31.818 198 121 6 14 205 521 710 2.39e-21 97.4
MsG0280006904.01.T01 AT3G46930 28.821 229 143 7 7 227 100 316 2.61e-21 95.1
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MsG0280006904.01.T01 AT1G18150 30.317 221 136 8 10 218 102 316 8.87e-21 95.5
MsG0280006904.01.T01 AT4G12020 23.664 262 165 5 12 265 1618 1852 9.35e-21 96.3
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MsG0280006904.01.T01 AT4G10010 33.880 183 103 5 57 231 20 192 1.01e-20 94.7
MsG0280006904.01.T01 AT3G22750 24.648 284 179 9 7 261 69 346 1.06e-20 94.0
MsG0280006904.01.T01 AT2G18170 26.453 344 202 12 11 344 31 333 1.18e-20 93.6
MsG0280006904.01.T01 AT4G08470 32.948 173 105 6 15 183 306 471 1.24e-20 94.7
MsG0280006904.01.T01 AT1G18350 28.856 201 132 5 17 212 50 244 1.34e-20 92.4
MsG0280006904.01.T01 AT1G57700 33.796 216 138 4 12 224 146 359 1.38e-20 95.1
MsG0280006904.01.T01 AT4G18950 29.832 238 153 8 35 262 178 411 1.40e-20 94.4
MsG0280006904.01.T01 AT2G38620 26.557 305 175 11 9 266 1 303 1.46e-20 92.4
MsG0280006904.01.T01 AT4G14780 24.735 283 181 8 7 262 56 333 1.95e-20 92.8
MsG0280006904.01.T01 AT1G73670 26.646 319 175 12 10 280 88 395 3.30e-20 93.6
MsG0280006904.01.T01 AT3G45640 26.087 299 173 9 18 276 44 334 3.53e-20 92.0
MsG0280006904.01.T01 AT4G24480 30.317 221 133 8 18 225 675 887 4.26e-20 94.0
MsG0280006904.01.T01 AT1G66880 34.328 201 114 8 16 207 971 1162 4.84e-20 94.0
MsG0280006904.01.T01 AT1G66880 34.328 201 114 8 16 207 592 783 4.95e-20 93.6
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MsG0280006904.01.T01 AT3G27580 24.779 339 169 9 12 267 182 517 5.12e-20 93.2
MsG0280006904.01.T01 AT1G67580 29.195 298 154 10 18 268 412 699 5.31e-20 93.6
MsG0280006904.01.T01 AT1G67580 29.195 298 154 10 18 268 412 699 5.31e-20 93.6
MsG0280006904.01.T01 AT5G40440 28.676 272 178 10 10 272 81 345 5.47e-20 92.8
MsG0280006904.01.T01 AT5G40440 28.676 272 178 10 10 272 81 345 5.47e-20 92.8
MsG0280006904.01.T01 AT1G66880 34.328 201 114 8 16 207 350 541 5.69e-20 93.2
MsG0280006904.01.T01 AT1G07880 29.167 216 138 7 18 225 39 247 6.34e-20 89.4
MsG0280006904.01.T01 AT3G04810 23.897 272 193 7 9 273 1 265 6.43e-20 92.8
MsG0280006904.01.T01 AT3G04810 23.897 272 193 7 9 273 1 265 6.43e-20 92.8
MsG0280006904.01.T01 AT3G04810 23.897 272 193 7 9 273 1 265 6.43e-20 92.8
MsG0280006904.01.T01 AT4G24480 30.415 217 133 8 18 225 675 882 6.72e-20 93.2
MsG0280006904.01.T01 AT1G18040 26.014 296 185 7 1 266 1 292 7.29e-20 91.7
MsG0280006904.01.T01 AT3G58760 32.642 193 116 6 18 202 172 358 7.34e-20 91.3
MsG0280006904.01.T01 AT4G24480 30.415 217 133 8 18 225 675 882 7.40e-20 93.2
MsG0280006904.01.T01 AT5G40440 28.676 272 178 10 10 272 63 327 7.52e-20 92.4
MsG0280006904.01.T01 AT5G40440 28.676 272 178 10 10 272 63 327 7.52e-20 92.4
MsG0280006904.01.T01 AT5G40440 28.676 272 178 10 10 272 63 327 7.52e-20 92.4
MsG0280006904.01.T01 AT2G38620 32.075 212 123 7 9 201 1 210 7.74e-20 89.4
MsG0280006904.01.T01 AT2G38620 32.075 212 123 7 9 201 1 210 7.74e-20 89.4
MsG0280006904.01.T01 AT1G59580 29.596 223 145 5 11 226 31 248 7.87e-20 91.3
MsG0280006904.01.T01 AT1G59580 29.596 223 145 5 11 226 31 248 7.87e-20 91.3
MsG0280006904.01.T01 AT3G58760 32.642 193 116 6 18 202 235 421 8.70e-20 91.7
MsG0280006904.01.T01 AT3G58760 32.642 193 116 6 18 202 235 421 8.70e-20 91.7
MsG0280006904.01.T01 AT1G09600 33.491 212 132 4 18 224 169 376 9.78e-20 92.4
MsG0280006904.01.T01 AT5G01850 30.370 270 155 12 14 262 20 277 1.00e-19 90.1
MsG0280006904.01.T01 AT5G64960 30.043 233 138 7 18 228 32 261 1.10e-19 92.0
MsG0280006904.01.T01 AT1G10210 29.596 223 145 5 11 226 31 248 1.30e-19 90.5
MsG0280006904.01.T01 AT1G10210 29.596 223 145 5 11 226 31 248 1.30e-19 90.5
MsG0280006904.01.T01 AT1G10210 29.596 223 145 5 11 226 31 248 1.30e-19 90.5
MsG0280006904.01.T01 AT5G03730 28.244 262 158 10 18 272 557 795 1.37e-19 92.0
MsG0280006904.01.T01 AT5G03730 28.244 262 158 10 18 272 557 795 1.37e-19 92.0
MsG0280006904.01.T01 AT5G39030 30.303 231 144 8 17 240 503 723 1.44e-19 92.0
MsG0280006904.01.T01 AT4G26070 25.940 266 181 8 13 267 68 328 1.45e-19 90.1
MsG0280006904.01.T01 AT1G07880 27.148 291 171 12 18 293 39 303 1.45e-19 90.1
MsG0280006904.01.T01 AT5G10270 29.437 231 142 5 12 224 26 253 1.45e-19 91.7
MsG0280006904.01.T01 AT4G26070 25.940 266 181 8 13 267 56 316 1.57e-19 89.7
MsG0280006904.01.T01 AT4G11330 29.381 194 124 5 16 202 47 234 1.60e-19 90.1
MsG0280006904.01.T01 AT5G49660 27.636 275 168 8 16 262 660 931 1.68e-19 92.0
MsG0280006904.01.T01 AT5G39030 30.303 231 144 8 17 240 497 717 1.72e-19 92.0
MsG0280006904.01.T01 AT4G26070 25.940 266 181 8 13 267 69 329 1.73e-19 89.7
MsG0280006904.01.T01 AT4G26070 25.940 266 181 8 13 267 69 329 1.73e-19 89.7

Find 84 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 94 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GCTTCCCTCGAGACACTTTA+TGG 0.150517 2:-7792562 None:intergenic
TTTCAATGATAGAAATTTAA+TGG 0.175141 2:+7792901 MsG0280006904.01.T01:CDS
GACCAAAATCAGCAACTTTA+AGG 0.175840 2:-7792709 None:intergenic
GTTGAGGTGAACAAAATTTC+TGG 0.188405 2:+7793487 MsG0280006904.01.T01:CDS
GACCTTAAAGTTGCTGATTT+TGG 0.204194 2:+7792707 MsG0280006904.01.T01:CDS
ACAATCAGTTGGTAGATTTA+AGG 0.223163 2:+7793357 MsG0280006904.01.T01:CDS
TTAATAGTAATTCTTGTTCT+TGG 0.224320 2:-7793019 None:intergenic
TCTTCGGGACTTGATCTTTC+GGG 0.230666 2:+7793241 MsG0280006904.01.T01:CDS
CTCTTCGGGACTTGATCTTT+CGG 0.239725 2:+7793240 MsG0280006904.01.T01:CDS
TGTTATTCTCTTTGTTCTAT+TGG 0.255232 2:+7792865 MsG0280006904.01.T01:CDS
CTTCTCTAAGTGAAATTGTT+TGG 0.262221 2:+7793554 MsG0280006904.01.T01:CDS
TTTAAGGTGATGAAGCAAAA+TGG 0.269689 2:+7793373 MsG0280006904.01.T01:CDS
CATTGGAATATAGGAAATTC+TGG 0.292599 2:+7793515 MsG0280006904.01.T01:CDS
AATCTTCTCCTCGACGAAAA+TGG 0.298418 2:+7792683 MsG0280006904.01.T01:CDS
CGCTTTGTCGAACACTTTGA+TGG 0.299426 2:-7792384 None:intergenic
TCGTAGAATTCGACAATGTT+AGG 0.301964 2:-7792476 None:intergenic
TTCTCTAAGTGAAATTGTTT+GGG 0.331043 2:+7793555 MsG0280006904.01.T01:CDS
CTGGAGACACATTGGAATAT+AGG 0.335575 2:+7793506 MsG0280006904.01.T01:CDS
GTAATTCTTGTTCTTGGATC+AGG 0.349634 2:-7793013 None:intergenic
ATTCTCTTTGTTCTATTGGC+AGG 0.351667 2:+7792869 MsG0280006904.01.T01:CDS
CAAAATAGTTGGTTTAGAAA+AGG 0.364794 2:+7793052 MsG0280006904.01.T01:CDS
TTGAAACAATATAGTTTCAT+AGG 0.368669 2:-7793196 None:intergenic
TGATATCATATCACTCTCTT+CGG 0.373531 2:+7793225 MsG0280006904.01.T01:CDS
AGAGTGGAGGGATTTGAGAC+AGG 0.382784 2:+7793403 MsG0280006904.01.T01:CDS
TTAGAGAAGGCTTTAAGTAT+TGG 0.391888 2:-7793540 None:intergenic
TTAAGGTGATGAAGCAAAAT+GGG 0.392020 2:+7793374 MsG0280006904.01.T01:CDS
ATGGAGCCAAGGCAGATATT+TGG 0.395353 2:+7792834 MsG0280006904.01.T01:CDS
AAAATAGTTGGTTTAGAAAA+GGG 0.395590 2:+7793053 MsG0280006904.01.T01:CDS
ACAAGATTATGCAAAATAGT+TGG 0.412838 2:+7793041 MsG0280006904.01.T01:CDS
GATATCATATCACTCTCTTC+GGG 0.414905 2:+7793226 MsG0280006904.01.T01:CDS
CCTTTCTTCTTGATAATCTC+AGG 0.421788 2:-7792806 None:intergenic
GTTCCTTGCATGGTAAACTT+TGG 0.432026 2:-7792339 None:intergenic
TTATCATCGCGACCTTAAAC+CGG 0.434293 2:+7792658 MsG0280006904.01.T01:CDS
CAACAGCTGCAATAAGTTGC+TGG 0.434587 2:-7792613 None:intergenic
TTGTTCTTGGATCAGGATCA+AGG 0.448979 2:-7793006 None:intergenic
GGTTTCATTCTGATGTGAAA+AGG 0.456184 2:+7792969 MsG0280006904.01.T01:CDS
ATCTCAGGTGCTACATAAGC+TGG 0.456892 2:-7792791 None:intergenic
GATCATGAGAGTCGGTTTGA+AGG 0.457408 2:+7792409 MsG0280006904.01.T01:CDS
AGGGAAGCTGAGGGAAGATA+TGG 0.461840 2:+7792577 MsG0280006904.01.T01:CDS
AAACTTTGGCAAAAGTTCCT+TGG 0.463306 2:-7792325 None:intergenic
AATGGGATTGTTAGAGTGGA+GGG 0.464610 2:+7793391 MsG0280006904.01.T01:CDS
CTGTCTTTAAGTTCCTTGCA+TGG 0.478276 2:-7792349 None:intergenic
ATCAAGAAGAAAGGCTATGA+TGG 0.482869 2:+7792815 MsG0280006904.01.T01:CDS
ACAGACATTGGACTTGATAG+TGG 0.486046 2:-7793157 None:intergenic
TGTTCATCTTTAACAGACAT+TGG 0.487603 2:-7793169 None:intergenic
GCAAATCAAGCGTGAAATCT+CGG 0.497301 2:+7792433 MsG0280006904.01.T01:CDS
CCTGAGATTATCAAGAAGAA+AGG 0.507224 2:+7792806 MsG0280006904.01.T01:CDS
ATTAAATTTCTATCATTGAA+AGG 0.511113 2:-7792899 None:intergenic
AATTCTAATGCATAAGTATG+AGG 0.511208 2:+7792286 MsG0280006904.01.T01:CDS
AAAGGGTATAAACAGATTGA+AGG 0.512265 2:+7793070 MsG0280006904.01.T01:CDS
CAAAATTTCTGGAGACACAT+TGG 0.512747 2:+7793498 MsG0280006904.01.T01:CDS
TTGCCAAAGTTTACCATGCA+AGG 0.516097 2:+7792336 MsG0280006904.01.T01:CDS
GAGTGGAGGGATTTGAGACA+GGG 0.518913 2:+7793404 MsG0280006904.01.T01:CDS
CAAACAATTTCACTTAGAGA+AGG 0.527600 2:-7793553 None:intergenic
CGTAGAATTCGACAATGTTA+GGG 0.528401 2:-7792475 None:intergenic
GCAAAATGGGATTGTTAGAG+TGG 0.528621 2:+7793387 MsG0280006904.01.T01:CDS
AAGGCAGATATTTGGTCTTG+TGG 0.540621 2:+7792842 MsG0280006904.01.T01:CDS
TATGAGGTAGGACGCATGCT+TGG 0.549733 2:+7792302 MsG0280006904.01.T01:CDS
TTGATCATTGTCATAGAAGA+GGG 0.555871 2:+7792633 MsG0280006904.01.T01:CDS
ACAAGACCAAATATCTGCCT+TGG 0.556727 2:-7792840 None:intergenic
ACCACATTTATCGCCTACAC+AGG 0.567836 2:+7793093 MsG0280006904.01.T01:CDS
GTAGGACGCATGCTTGGCCA+AGG 0.576999 2:+7792308 MsG0280006904.01.T01:CDS
TGTCGAATTCTACGAGGTCA+TGG 0.580520 2:+7792484 MsG0280006904.01.T01:CDS
GTTGATCATTGTCATAGAAG+AGG 0.586826 2:+7792632 MsG0280006904.01.T01:CDS
TTTGACACAATTGTTGAAGG+TGG 0.587573 2:-7793319 None:intergenic
TTTGCAATGGAACAAGTGAA+AGG 0.588767 2:+7792527 MsG0280006904.01.T01:CDS
CATGCAAGGAACTTAAAGAC+AGG 0.589008 2:+7792350 MsG0280006904.01.T01:CDS
CTGATTTCAAGTTTCCACAA+TGG 0.593678 2:+7792948 MsG0280006904.01.T01:CDS
CTAATGCATAAGTATGAGGT+AGG 0.594406 2:+7792290 MsG0280006904.01.T01:CDS
GAAATTGTTTGGGATTCGCA+AGG 0.596307 2:+7793565 MsG0280006904.01.T01:CDS
TCTGAGATATCGCCCTGTGT+AGG 0.596911 2:-7793106 None:intergenic
AAATGGGATTGTTAGAGTGG+AGG 0.599713 2:+7793390 MsG0280006904.01.T01:CDS
AAGTGTCTCGAGGGAAGCTG+AGG 0.600611 2:+7792567 MsG0280006904.01.T01:CDS
ACATCAGAATGAAACCATTG+TGG 0.605629 2:-7792962 None:intergenic
GAAAGGCTATGATGGAGCCA+AGG 0.612027 2:+7792823 MsG0280006904.01.T01:CDS
GAAGAGACAGCACAATCAGT+TGG 0.618719 2:+7793346 MsG0280006904.01.T01:CDS
AGCTGAGGGAAGATATGGCT+AGG 0.620480 2:+7792582 MsG0280006904.01.T01:CDS
GATCTTCTTCATACAACATG+TGG 0.648173 2:+7792764 MsG0280006904.01.T01:CDS
CCACATTTATCGCCTACACA+GGG 0.654092 2:+7793094 MsG0280006904.01.T01:CDS
AGTGTCTCGAGGGAAGCTGA+GGG 0.660320 2:+7792568 MsG0280006904.01.T01:CDS
CCCTGTGTAGGCGATAAATG+TGG 0.667216 2:-7793094 None:intergenic
AAAGCGATGATCATGAGAGT+CGG 0.667382 2:+7792401 MsG0280006904.01.T01:CDS
GCAATGGAACAAGTGAAAGG+TGG 0.690623 2:+7792530 MsG0280006904.01.T01:CDS
TAACATTGTCGAATTCTACG+AGG 0.811400 2:+7792478 MsG0280006904.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATTAAATTTCTATCATTGAA+AGG - Chr2:7792902-7792921 None:intergenic 15.0%
!! TTTCAATGATAGAAATTTAA+TGG + Chr2:7792901-7792920 MsG0280006904.01.T01:CDS 15.0%
!! TTAATAGTAATTCTTGTTCT+TGG - Chr2:7793022-7793041 None:intergenic 20.0%
!! TTGAAACAATATAGTTTCAT+AGG - Chr2:7793199-7793218 None:intergenic 20.0%
!!! AAAATAGTTGGTTTAGAAAA+GGG + Chr2:7793053-7793072 MsG0280006904.01.T01:CDS 20.0%
!!! AACAAAGATATATTTTGCAA+TGG + Chr2:7792514-7792533 MsG0280006904.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATCTTCATTTTATATTGTTG+AGG + Chr2:7793471-7793490 MsG0280006904.01.T01:CDS 20.0%
! AATTCTAATGCATAAGTATG+AGG + Chr2:7792286-7792305 MsG0280006904.01.T01:CDS 25.0%
! ACAAGATTATGCAAAATAGT+TGG + Chr2:7793041-7793060 MsG0280006904.01.T01:CDS 25.0%
! TGTTATTCTCTTTGTTCTAT+TGG + Chr2:7792865-7792884 MsG0280006904.01.T01:CDS 25.0%
! TTCTCTAAGTGAAATTGTTT+GGG + Chr2:7793555-7793574 MsG0280006904.01.T01:CDS 25.0%
!! CAAAATAGTTGGTTTAGAAA+AGG + Chr2:7793052-7793071 MsG0280006904.01.T01:CDS 25.0%
CAAACAATTTCACTTAGAGA+AGG - Chr2:7793556-7793575 None:intergenic 30.0%
CATTGGAATATAGGAAATTC+TGG + Chr2:7793515-7793534 MsG0280006904.01.T01:CDS 30.0%
CTTCTCTAAGTGAAATTGTT+TGG + Chr2:7793554-7793573 MsG0280006904.01.T01:CDS 30.0%
TGATATCATATCACTCTCTT+CGG + Chr2:7793225-7793244 MsG0280006904.01.T01:CDS 30.0%
TGTTCATCTTTAACAGACAT+TGG - Chr2:7793172-7793191 None:intergenic 30.0%
TTAAGGTGATGAAGCAAAAT+GGG + Chr2:7793374-7793393 MsG0280006904.01.T01:CDS 30.0%
TTGATCATTGTCATAGAAGA+GGG + Chr2:7792633-7792652 MsG0280006904.01.T01:CDS 30.0%
TTTGAAAAAGATACGAGTGA+AGG + Chr2:7793268-7793287 MsG0280006904.01.T01:CDS 30.0%
! AAAGGGTATAAACAGATTGA+AGG + Chr2:7793070-7793089 MsG0280006904.01.T01:CDS 30.0%
! TTTAAGGTGATGAAGCAAAA+TGG + Chr2:7793373-7793392 MsG0280006904.01.T01:CDS 30.0%
!! ACAATCAGTTGGTAGATTTA+AGG + Chr2:7793357-7793376 MsG0280006904.01.T01:CDS 30.0%
!! AGTTTTGACACAATTGTTGA+AGG - Chr2:7793325-7793344 None:intergenic 30.0%
!! TTAGAGAAGGCTTTAAGTAT+TGG - Chr2:7793543-7793562 None:intergenic 30.0%
AAACTTTGGCAAAAGTTCCT+TGG - Chr2:7792328-7792347 None:intergenic 35.0%
ACATCAGAATGAAACCATTG+TGG - Chr2:7792965-7792984 None:intergenic 35.0%
ATCAAGAAGAAAGGCTATGA+TGG + Chr2:7792815-7792834 MsG0280006904.01.T01:CDS 35.0%
ATTCTCTTTGTTCTATTGGC+AGG + Chr2:7792869-7792888 MsG0280006904.01.T01:CDS 35.0%
CCTGAGATTATCAAGAAGAA+AGG + Chr2:7792806-7792825 MsG0280006904.01.T01:CDS 35.0%
CGTAGAATTCGACAATGTTA+GGG - Chr2:7792478-7792497 None:intergenic 35.0%
CTAATGCATAAGTATGAGGT+AGG + Chr2:7792290-7792309 MsG0280006904.01.T01:CDS 35.0%
GACCAAAATCAGCAACTTTA+AGG - Chr2:7792712-7792731 None:intergenic 35.0%
GATATCATATCACTCTCTTC+GGG + Chr2:7793226-7793245 MsG0280006904.01.T01:CDS 35.0%
GATCTTCTTCATACAACATG+TGG + Chr2:7792764-7792783 MsG0280006904.01.T01:CDS 35.0%
GGTTTCATTCTGATGTGAAA+AGG + Chr2:7792969-7792988 MsG0280006904.01.T01:CDS 35.0%
GTAATTCTTGTTCTTGGATC+AGG - Chr2:7793016-7793035 None:intergenic 35.0%
GTTGAGGTGAACAAAATTTC+TGG + Chr2:7793487-7793506 MsG0280006904.01.T01:CDS 35.0%
GTTGATCATTGTCATAGAAG+AGG + Chr2:7792632-7792651 MsG0280006904.01.T01:CDS 35.0%
TAACATTGTCGAATTCTACG+AGG + Chr2:7792478-7792497 MsG0280006904.01.T01:CDS 35.0%
TCGTAGAATTCGACAATGTT+AGG - Chr2:7792479-7792498 None:intergenic 35.0%
TTTGACACAATTGTTGAAGG+TGG - Chr2:7793322-7793341 None:intergenic 35.0%
TTTGCAATGGAACAAGTGAA+AGG + Chr2:7792527-7792546 MsG0280006904.01.T01:CDS 35.0%
! CAAAATTTCTGGAGACACAT+TGG + Chr2:7793498-7793517 MsG0280006904.01.T01:CDS 35.0%
! CCTTTCTTCTTGATAATCTC+AGG - Chr2:7792809-7792828 None:intergenic 35.0%
!! CTGATTTCAAGTTTCCACAA+TGG + Chr2:7792948-7792967 MsG0280006904.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTTCCATAAAGTGTCTCGA+GGG + Chr2:7792558-7792577 MsG0280006904.01.T01:CDS 35.0%
!!! GACCTTAAAGTTGCTGATTT+TGG + Chr2:7792707-7792726 MsG0280006904.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTTTGGTCTTAGTGCATTGT+TGG + Chr2:7792724-7792743 MsG0280006904.01.T01:CDS 35.0%
AAAGCGATGATCATGAGAGT+CGG + Chr2:7792401-7792420 MsG0280006904.01.T01:CDS 40.0%
AAATGGGATTGTTAGAGTGG+AGG + Chr2:7793390-7793409 MsG0280006904.01.T01:CDS 40.0%
AATCTTCTCCTCGACGAAAA+TGG + Chr2:7792683-7792702 MsG0280006904.01.T01:CDS 40.0%
AATGGGATTGTTAGAGTGGA+GGG + Chr2:7793391-7793410 MsG0280006904.01.T01:CDS 40.0%
ACAAGACCAAATATCTGCCT+TGG - Chr2:7792843-7792862 None:intergenic 40.0%
ACAGACATTGGACTTGATAG+TGG - Chr2:7793160-7793179 None:intergenic 40.0%
CATGCAAGGAACTTAAAGAC+AGG + Chr2:7792350-7792369 MsG0280006904.01.T01:CDS 40.0%
CTGGAGACACATTGGAATAT+AGG + Chr2:7793506-7793525 MsG0280006904.01.T01:CDS 40.0%
GCAAAATGGGATTGTTAGAG+TGG + Chr2:7793387-7793406 MsG0280006904.01.T01:CDS 40.0%
GCAAATCAAGCGTGAAATCT+CGG + Chr2:7792433-7792452 MsG0280006904.01.T01:CDS 40.0%
GTTCCTTGCATGGTAAACTT+TGG - Chr2:7792342-7792361 None:intergenic 40.0%
TTATCATCGCGACCTTAAAC+CGG + Chr2:7792658-7792677 MsG0280006904.01.T01:CDS 40.0%
TTGCCAAAGTTTACCATGCA+AGG + Chr2:7792336-7792355 MsG0280006904.01.T01:CDS 40.0%
TTGTTCTTGGATCAGGATCA+AGG - Chr2:7793009-7793028 None:intergenic 40.0%
! CTGTCTTTAAGTTCCTTGCA+TGG - Chr2:7792352-7792371 None:intergenic 40.0%
! GAAATTGTTTGGGATTCGCA+AGG + Chr2:7793565-7793584 MsG0280006904.01.T01:CDS 40.0%
! GGAGAAGATTTTCCGGTTTA+AGG - Chr2:7792673-7792692 None:intergenic 40.0%
!! AAGGCAGATATTTGGTCTTG+TGG + Chr2:7792842-7792861 MsG0280006904.01.T01:CDS 40.0%
!! CTTTTCCATAAAGTGTCTCG+AGG + Chr2:7792557-7792576 MsG0280006904.01.T01:CDS 40.0%
ACCACATTTATCGCCTACAC+AGG + Chr2:7793093-7793112 MsG0280006904.01.T01:CDS 45.0%
ATGGAGCCAAGGCAGATATT+TGG + Chr2:7792834-7792853 MsG0280006904.01.T01:CDS 45.0%
CAACAGCTGCAATAAGTTGC+TGG - Chr2:7792616-7792635 None:intergenic 45.0%
CCACATTTATCGCCTACACA+GGG + Chr2:7793094-7793113 MsG0280006904.01.T01:CDS 45.0%
CGCTTTGTCGAACACTTTGA+TGG - Chr2:7792387-7792406 None:intergenic 45.0%
CTCTTCGGGACTTGATCTTT+CGG + Chr2:7793240-7793259 MsG0280006904.01.T01:CDS 45.0%
GAAGAGACAGCACAATCAGT+TGG + Chr2:7793346-7793365 MsG0280006904.01.T01:CDS 45.0%
GCAATGGAACAAGTGAAAGG+TGG + Chr2:7792530-7792549 MsG0280006904.01.T01:CDS 45.0%
TCTTCGGGACTTGATCTTTC+GGG + Chr2:7793241-7793260 MsG0280006904.01.T01:CDS 45.0%
TGTCGAATTCTACGAGGTCA+TGG + Chr2:7792484-7792503 MsG0280006904.01.T01:CDS 45.0%
! ATCTCAGGTGCTACATAAGC+TGG - Chr2:7792794-7792813 None:intergenic 45.0%
! TAAGGTCACCATTTTCGTCG+AGG - Chr2:7792694-7792713 None:intergenic 45.0%
! TCGTCGAGGAGAAGATTTTC+CGG - Chr2:7792680-7792699 None:intergenic 45.0%
!! GATCATGAGAGTCGGTTTGA+AGG + Chr2:7792409-7792428 MsG0280006904.01.T01:CDS 45.0%
AGCTGAGGGAAGATATGGCT+AGG + Chr2:7792582-7792601 MsG0280006904.01.T01:CDS 50.0%
AGGGAAGCTGAGGGAAGATA+TGG + Chr2:7792577-7792596 MsG0280006904.01.T01:CDS 50.0%
CCCTGTGTAGGCGATAAATG+TGG - Chr2:7793097-7793116 None:intergenic 50.0%
GCTTCCCTCGAGACACTTTA+TGG - Chr2:7792565-7792584 None:intergenic 50.0%
TATGAGGTAGGACGCATGCT+TGG + Chr2:7792302-7792321 MsG0280006904.01.T01:CDS 50.0%
! AGAGTGGAGGGATTTGAGAC+AGG + Chr2:7793403-7793422 MsG0280006904.01.T01:CDS 50.0%
! GAAAGGCTATGATGGAGCCA+AGG + Chr2:7792823-7792842 MsG0280006904.01.T01:CDS 50.0%
! GAGTGGAGGGATTTGAGACA+GGG + Chr2:7793404-7793423 MsG0280006904.01.T01:CDS 50.0%
! TCTGAGATATCGCCCTGTGT+AGG - Chr2:7793109-7793128 None:intergenic 50.0%
AAGTGTCTCGAGGGAAGCTG+AGG + Chr2:7792567-7792586 MsG0280006904.01.T01:CDS 55.0%
AGTGTCTCGAGGGAAGCTGA+GGG + Chr2:7792568-7792587 MsG0280006904.01.T01:CDS 55.0%
GTAGGACGCATGCTTGGCCA+AGG + Chr2:7792308-7792327 MsG0280006904.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr2 gene 7792269 7793606 7792269 ID=MsG0280006904.01;Name=MsG0280006904.01
Chr2 mRNA 7792269 7793606 7792269 ID=MsG0280006904.01.T01;Parent=MsG0280006904.01;Name=MsG0280006904.01.T01;_AED=0.28;_eAED=0.28;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|445
Chr2 exon 7792269 7793606 7792269 ID=MsG0280006904.01.T01:exon:7951;Parent=MsG0280006904.01.T01
Chr2 CDS 7792269 7793606 7792269 ID=MsG0280006904.01.T01:cds;Parent=MsG0280006904.01.T01
Gene Sequence

>MsG0280006904.01.T01

ATGGAGAACAAAGCAACAATTCTAATGCATAAGTATGAGGTAGGACGCATGCTTGGCCAAGGAACTTTTGCCAAAGTTTACCATGCAAGGAACTTAAAGACAGGACAAAATGTTGCCATCAAAGTGTTCGACAAAGCGATGATCATGAGAGTCGGTTTGAAGGAGCAAATCAAGCGTGAAATCTCGGTGATGCGTCTTGTTCGACACCCTAACATTGTCGAATTCTACGAGGTCATGGCAAGCAAAACAAAGATATATTTTGCAATGGAACAAGTGAAAGGTGGTGAGCTTTTCCATAAAGTGTCTCGAGGGAAGCTGAGGGAAGATATGGCTAGGAAATATTTCCAGCAACTTATTGCAGCTGTTGATCATTGTCATAGAAGAGGGATTTATCATCGCGACCTTAAACCGGAAAATCTTCTCCTCGACGAAAATGGTGACCTTAAAGTTGCTGATTTTGGTCTTAGTGCATTGTTGGAATCAAAAAAGAAAGATGATCTTCTTCATACAACATGTGGTACTCCAGCTTATGTAGCACCTGAGATTATCAAGAAGAAAGGCTATGATGGAGCCAAGGCAGATATTTGGTCTTGTGGTGTTATTCTCTTTGTTCTATTGGCAGGTTTTCTTCCTTTCAATGATAGAAATTTAATGGAGATGTATAAGAAGATTGCAAATGCTGATTTCAAGTTTCCACAATGGTTTCATTCTGATGTGAAAAGGCTTCTTTATAGAATCCTTGATCCTGATCCAAGAACAAGAATTACTATTAACAAGATTATGCAAAATAGTTGGTTTAGAAAAGGGTATAAACAGATTGAAGGACCACATTTATCGCCTACACAGGGCGATATCTCAGATGTTCATAATGCATTTGATGATTTGTCACCACTATCAAGTCCAATGTCTGTTAAAGATGAACAATGTCCTATGAAACTATATTGTTTCAATGCATTTGATATCATATCACTCTCTTCGGGACTTGATCTTTCGGGTTTGTTTGAAAAAGATACGAGTGAAGGACAACATGCAAGATTTGCTACAAAAAGACCACCTTCAACAATTGTGTCAAAACTTGAAGAGACAGCACAATCAGTTGGTAGATTTAAGGTGATGAAGCAAAATGGGATTGTTAGAGTGGAGGGATTTGAGACAGGGATAAATGAACAACTCACAATTGATACAGAAATTTTTGAAGTTACATCTTCATTTTATATTGTTGAGGTGAACAAAATTTCTGGAGACACATTGGAATATAGGAAATTCTGGAACCAATACTTAAAGCCTTCTCTAAGTGAAATTGTTTGGGATTCGCAAGGATATGAACAATACGTATAA
Protein sequence

>MsG0280006904.01.T01

MENKATILMHKYEVGRMLGQGTFAKVYHARNLKTGQNVAIKVFDKAMIMRVGLKEQIKREISVMRLVRHPNIVEFYEVMASKTKIYFAMEQVKGGELFHKVSRGKLREDMARKYFQQLIAAVDHCHRRGIYHRDLKPENLLLDENGDLKVADFGLSALLESKKKDDLLHTTCGTPAYVAPEIIKKKGYDGAKADIWSCGVILFVLLAGFLPFNDRNLMEMYKKIANADFKFPQWFHSDVKRLLYRILDPDPRTRITINKIMQNSWFRKGYKQIEGPHLSPTQGDISDVHNAFDDLSPLSSPMSVKDEQCPMKLYCFNAFDIISLSSGLDLSGLFEKDTSEGQHARFATKRPPSTIVSKLEETAQSVGRFKVMKQNGIVRVEGFETGINEQLTIDTEIFEVTSSFYIVEVNKISGDTLEYRKFWNQYLKPSLSEIVWDSQGYEQYV*