AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0280007239.01

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MsG0280007239.01.T01 AT1G55610 30.583 412 236 11 75 451 665 1061 1.31e-33 135
MsG0280007239.01.T01 AT2G41820 27.835 485 276 16 46 465 352 827 1.40e-33 135
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MsG0280007239.01.T01 AT2G13800 27.345 501 280 17 14 470 41 501 3.72e-32 130
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MsG0280007239.01.T01 AT5G63710 26.464 427 239 11 72 451 91 489 1.56e-29 122
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MsG0280007239.01.T01 AT5G63710 33.750 160 81 7 9 166 22 158 2.13e-11 66.6
MsG0280007239.01.T01 AT5G63710 26.464 427 239 11 72 451 56 454 1.69e-29 122
MsG0280007239.01.T01 AT5G63710 33.750 160 81 7 9 166 22 158 2.13e-11 66.6
MsG0280007239.01.T01 AT4G22130 28.665 457 255 19 73 469 26 471 1.88e-29 122
MsG0280007239.01.T01 AT5G63710 26.464 427 239 11 72 451 92 490 1.92e-29 122
MsG0280007239.01.T01 AT5G63710 33.750 160 81 7 9 166 58 194 2.92e-11 66.2
MsG0280007239.01.T01 AT5G06940 29.902 408 218 17 75 451 415 785 2.91e-29 122
MsG0280007239.01.T01 AT5G06940 33.803 142 87 3 45 183 245 382 6.11e-11 65.5
MsG0280007239.01.T01 AT4G28490 26.875 480 262 14 72 472 450 919 3.46e-29 122
MsG0280007239.01.T01 AT4G28490 36.025 161 85 8 27 179 50 200 1.56e-12 70.5
MsG0280007239.01.T01 AT4G28490 33.803 142 66 5 75 188 381 522 3.37e-11 66.2
MsG0280007239.01.T01 AT3G19700 28.033 478 222 16 73 473 484 916 3.77e-29 122
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MsG0280007239.01.T01 AT5G10020 35.802 162 86 6 38 188 407 561 3.99e-12 69.3
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MsG0280007239.01.T01 AT4G37250 29.323 266 121 7 261 472 441 693 4.71e-24 106
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MsG0280007239.01.T01 AT2G33170 36.607 112 68 2 75 183 495 606 1.64e-12 70.5
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MsG0280007239.01.T01 AT2G33170 40.517 116 59 3 75 183 543 655 6.04e-12 68.9
MsG0280007239.01.T01 AT5G38210 32.743 226 121 9 263 467 346 561 1.15e-23 105
MsG0280007239.01.T01 AT5G38210 33.636 220 115 9 263 461 364 573 1.18e-23 105
MsG0280007239.01.T01 AT5G38210 32.743 226 121 9 263 467 352 567 1.27e-23 104
MsG0280007239.01.T01 AT4G23160 32.569 218 124 8 270 468 360 573 1.29e-23 104
MsG0280007239.01.T01 AT3G56370 32.323 198 109 5 275 451 684 877 1.30e-23 105
MsG0280007239.01.T01 AT3G09010 31.193 218 126 7 271 465 48 264 1.45e-23 101
MsG0280007239.01.T01 AT5G49780 35.106 188 104 5 287 457 552 738 1.50e-23 105
MsG0280007239.01.T01 AT5G38560 31.197 234 132 8 239 451 313 538 1.52e-23 104
MsG0280007239.01.T01 AT5G49780 35.106 188 104 5 287 457 651 837 1.56e-23 105
MsG0280007239.01.T01 AT5G49780 29.240 171 105 5 24 184 47 211 5.04e-11 65.9
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MsG0280007239.01.T01 AT3G13690 31.200 250 147 8 246 470 384 633 4.71e-23 103
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MsG0280007239.01.T01 AT2G42960 28.378 222 135 6 270 468 184 404 4.83e-23 102
MsG0280007239.01.T01 AT2G42960 28.378 222 135 6 270 468 184 404 4.83e-23 102
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MsG0280007239.01.T01 AT1G53430 32.161 199 116 5 271 451 630 827 6.81e-23 103
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MsG0280007239.01.T01 AT1G55200 30.682 264 158 8 232 470 338 601 8.75e-23 102
MsG0280007239.01.T01 AT1G55200 30.682 264 158 8 232 470 338 601 8.75e-23 102
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MsG0280007239.01.T01 AT1G77280 33.333 201 115 3 275 457 410 609 2.63e-22 100
MsG0280007239.01.T01 AT4G04540 33.333 195 111 6 275 451 330 523 2.65e-22 100
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MsG0280007239.01.T01 AT1G09440 29.817 218 129 7 274 468 162 378 5.22e-22 99.0
MsG0280007239.01.T01 AT1G16120 35.897 195 107 6 274 451 434 627 5.31e-22 100
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MsG0280007239.01.T01 AT4G27290 30.769 195 116 6 275 451 471 664 6.04e-22 99.8
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MsG0280007239.01.T01 AT4G05200 33.673 196 109 7 275 451 353 546 6.63e-22 99.8
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MsG0280007239.01.T01 AT4G05200 33.673 196 109 7 275 451 371 564 6.75e-22 99.8
MsG0280007239.01.T01 AT4G33430 28.700 223 132 5 274 470 341 562 7.17e-22 99.4
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MsG0280007239.01.T01 AT1G61360 33.166 199 114 7 275 455 423 620 1.71e-21 98.6
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MsG0280007239.01.T01 AT5G37450 31.754 211 122 6 275 464 661 870 5.59e-19 90.9
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MsG0280007239.01.T01 AT1G29750 34.266 143 84 4 46 185 125 260 9.39e-13 71.2
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MsG0280007239.01.T01 AT2G18470 28.311 219 136 6 272 470 287 504 4.73e-20 94.0
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MsG0280007239.01.T01 AT4G31110 33.333 213 121 7 258 450 440 651 1.33e-19 92.8
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MsG0280007239.01.T01 AT3G16030 31.034 203 115 5 270 451 549 747 1.62e-19 92.4
MsG0280007239.01.T01 AT5G49470 32.487 197 114 5 272 452 494 687 1.71e-19 92.0
MsG0280007239.01.T01 AT5G49470 32.487 197 114 5 272 452 494 687 1.85e-19 92.0
MsG0280007239.01.T01 AT4G01330 26.432 227 139 8 274 474 167 391 1.86e-19 91.3
MsG0280007239.01.T01 AT5G49470 32.487 197 114 5 272 452 494 687 1.87e-19 92.0
MsG0280007239.01.T01 AT4G32710 28.959 221 132 6 274 470 394 613 1.87e-19 92.0
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MsG0280007239.01.T01 AT4G01330 26.432 227 139 8 274 474 167 391 1.90e-19 91.3
MsG0280007239.01.T01 AT4G20450 26.790 433 243 16 75 478 432 819 2.17e-19 92.0
MsG0280007239.01.T01 AT1G17230 24.714 437 224 16 44 412 547 946 2.19e-19 92.0
MsG0280007239.01.T01 AT1G17230 31.351 185 114 7 3 183 29 204 2.22e-13 73.2
MsG0280007239.01.T01 AT1G17230 40.171 117 61 3 72 182 450 563 1.29e-12 70.9
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MsG0280007239.01.T01 AT3G62220 27.083 240 143 6 241 451 37 273 2.38e-19 89.7
MsG0280007239.01.T01 AT1G51810 23.908 435 276 14 75 481 279 686 2.55e-19 91.7
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MsG0280007239.01.T01 AT3G46370 25.576 434 245 17 78 478 327 715 2.58e-19 91.7
MsG0280007239.01.T01 AT1G01540 26.457 223 130 7 274 468 159 375 2.83e-19 90.9
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MsG0280007239.01.T01 AT5G24080 29.204 226 138 7 246 451 379 602 2.87e-19 91.7

Find 91 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 141 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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AAGAAATAACCTTGCAAATC+TGG 0.240365 2:+12430731 None:intergenic
TAAAGAAGTTGGATCTTTAC+AGG 0.242808 2:-12431141 MsG0280007239.01.T01:CDS
TGGACCACTAAAATTGTTAA+AGG 0.244505 2:+12430757 None:intergenic
AAGCAAGATGTTTATGGATT+TGG 0.267147 2:-12429185 MsG0280007239.01.T01:CDS
GACCAAAAGCTTCTCTTGTT+TGG 0.273628 2:+12430116 None:intergenic
TTTGCTTAGTTCTTCTGCTT+TGG 0.309248 2:+12430434 None:intergenic
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ATTCTTCTTGAATTACTAAC+TGG 0.330165 2:-12429158 MsG0280007239.01.T01:CDS
GAGCCTTGTATTAGTGAATA+TGG 0.337313 2:-12429272 MsG0280007239.01.T01:CDS
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AGTGAATGAATTGAAATTAG+AGG 0.348554 2:-12430340 MsG0280007239.01.T01:CDS
AATCACTTATTGTTCTTTCA+AGG 0.349207 2:-12430368 MsG0280007239.01.T01:CDS
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TAACCTTGCAAATCTGGAAT+TGG 0.379932 2:+12430737 None:intergenic
GAACTTTGTTGATCATCCTT+TGG 0.387172 2:+12429242 None:intergenic
CAGCAAGTTGGTTTCCGCTT+AGG 0.388714 2:+12430969 None:intergenic
ATAATAATTCAACTTTGGTC+TGG 0.402634 2:-12431228 MsG0280007239.01.T01:CDS
TCCTTGCAGGGATCAGTGTC+TGG 0.412318 2:+12431202 None:intergenic
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AATTTCAATTCATTCACTAC+TGG 0.434121 2:+12430345 None:intergenic
CCTGAGATTCTAGCCAGGTT+TGG 0.438032 2:+12430866 None:intergenic
TTCGGGACCGTTGCCAAACC+TGG 0.441478 2:-12430879 MsG0280007239.01.T01:CDS
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AAGTTGAATTATTATTCTGC+TGG 0.446252 2:+12431236 None:intergenic
CAATCAGTTGTGAGGAAGAA+TGG 0.448973 2:-12429092 MsG0280007239.01.T01:CDS
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TTTGATTGGAGCAGCAGACT+TGG 0.459443 2:-12429407 MsG0280007239.01.T01:CDS
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GATTCGCTTGAAACATAGTT+CGG 0.472802 2:+12430456 None:intergenic
AATGTTTAGCAAAATGTTTG+AGG 0.475807 2:+12429301 None:intergenic
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TACAACCACTTGAATCCCAT+TGG 0.490251 2:+12430248 None:intergenic
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TGAGGCCTGAGATTCTAGCC+AGG 0.577992 2:+12430861 None:intergenic
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CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
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!! TAAAAAAATCTTGAATTATT+TGG + Chr2:12430712-12430731 None:intergenic 10.0%
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!! GTTTAAAAATATTTAACTCA+AGG + Chr2:12430446-12430465 None:intergenic 15.0%
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!!! AATATTTTTAAACAGTTTCT+TGG - Chr2:12430453-12430472 MsG0280007239.01.T01:CDS 15.0%
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!! ATAAATAGATCCTTGAATTA+AGG - Chr2:12430491-12430510 MsG0280007239.01.T01:CDS 20.0%
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!! TAAACCAATAAATAAAGTGT+AGG + Chr2:12430332-12430351 None:intergenic 20.0%
!! TAAATAGATCCTTGAATTAA+GGG - Chr2:12430492-12430511 MsG0280007239.01.T01:CDS 20.0%
!! TTGTAAAAAGGATTAAAGAT+TGG - Chr2:12430108-12430127 MsG0280007239.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATATCCTACACTTTATTTAT+TGG - Chr2:12430325-12430344 MsG0280007239.01.T01:CDS 20.0%
!!! TATTGGTTTAATTACTTTCT+AGG - Chr2:12430342-12430361 MsG0280007239.01.T01:CDS 20.0%
!!! TCATAATATTTTTTGTAGTC+TGG - Chr2:12429793-12429812 MsG0280007239.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTTGACAAAAAAAAGTTCA+AGG - Chr2:12430558-12430577 MsG0280007239.01.T01:intron 20.0%
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! AATGTTTAGCAAAATGTTTG+AGG + Chr2:12431040-12431059 None:intergenic 25.0%
! AATTTCAATTCATTCACTAC+TGG + Chr2:12429996-12430015 None:intergenic 25.0%
! ACAAATGTCAATAAAGAAGT+TGG - Chr2:12429186-12429205 MsG0280007239.01.T01:CDS 25.0%
! AGTGAATGAATTGAAATTAG+AGG - Chr2:12429998-12430017 MsG0280007239.01.T01:intron 25.0%
! ATAATAATTCAACTTTGGTC+TGG - Chr2:12429110-12429129 MsG0280007239.01.T01:CDS 25.0%
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! ATTCTTCTTGAATTACTAAC+TGG - Chr2:12431180-12431199 MsG0280007239.01.T01:CDS 25.0%
! GCAGAATAATAATTCAACTT+TGG - Chr2:12429105-12429124 MsG0280007239.01.T01:CDS 25.0%
! TAATTGAATCCCTTAATTCA+AGG + Chr2:12430504-12430523 None:intergenic 25.0%
! TGAATTACTAACTGGAAAAT+TGG - Chr2:12431188-12431207 MsG0280007239.01.T01:CDS 25.0%
! TGTTAAAGGAAACATTGAAA+CGG + Chr2:12429570-12429589 None:intergenic 25.0%
!! ATGTTTATAAGAAACTTGCT+TGG - Chr2:12430832-12430851 MsG0280007239.01.T01:CDS 25.0%
!! ATTTCAAACAACAAGTTTTC+GGG - Chr2:12429442-12429461 MsG0280007239.01.T01:intron 25.0%
!! CATTTCAAACAACAAGTTTT+CGG - Chr2:12429441-12429460 MsG0280007239.01.T01:intron 25.0%
!! CATTTTGCTAAACATTAACA+TGG - Chr2:12431044-12431063 MsG0280007239.01.T01:CDS 25.0%
!! GTTTCCTTTAACAATTTTAG+TGG - Chr2:12429577-12429596 MsG0280007239.01.T01:intron 25.0%
!! TCTTTTCAAATTGTTCAACA+TGG + Chr2:12429416-12429435 None:intergenic 25.0%
!!! ACTAGTACAATTTTTTGTAG+TGG + Chr2:12429673-12429692 None:intergenic 25.0%
AAGAAATAACCTTGCAAATC+TGG + Chr2:12429610-12429629 None:intergenic 30.0%
AAGCAAGATGTTTATGGATT+TGG - Chr2:12431153-12431172 MsG0280007239.01.T01:CDS 30.0%
AAGGACTTATTTCACTTTCA+GGG + Chr2:12430369-12430388 None:intergenic 30.0%
ATCTTACTAACAGTGCTTAA+AGG + Chr2:12429699-12429718 None:intergenic 30.0%
GAACAAATTCTTATGTACTC+AGG - Chr2:12429750-12429769 MsG0280007239.01.T01:intron 30.0%
GATATCAGAAGAAGAATCAA+AGG - Chr2:12429716-12429735 MsG0280007239.01.T01:intron 30.0%
TAAAGAAGTTGGATCTTTAC+AGG - Chr2:12429197-12429216 MsG0280007239.01.T01:CDS 30.0%
TAGAAAATTAGGTGAAACCA+TGG - Chr2:12430761-12430780 MsG0280007239.01.T01:CDS 30.0%
TGGACCACTAAAATTGTTAA+AGG + Chr2:12429584-12429603 None:intergenic 30.0%
TGTGTATAAGAAAGAAGAGT+GGG - Chr2:12429820-12429839 MsG0280007239.01.T01:intron 30.0%
TTGAATGCATTAGCATCATT+AGG + Chr2:12431135-12431154 None:intergenic 30.0%
!! TAAGTTCATTGTTTTGTGCT+AGG + Chr2:12429510-12429529 None:intergenic 30.0%
!! TTTTAATTGCAAAACTGCCA+TGG + Chr2:12430781-12430800 None:intergenic 30.0%
AAATTGCCTATGAAGCAACA+TGG - Chr2:12430866-12430885 MsG0280007239.01.T01:CDS 35.0%
ATAAGGTGATGCTAACCAAT+GGG - Chr2:12430075-12430094 MsG0280007239.01.T01:CDS 35.0%
ATGATAGGAAGAGGAAAGAA+TGG - Chr2:12430044-12430063 MsG0280007239.01.T01:intron 35.0%
CAAGGACTTATTTCACTTTC+AGG + Chr2:12430370-12430389 None:intergenic 35.0%
CTGTGTATAAGAAAGAAGAG+TGG - Chr2:12429819-12429838 MsG0280007239.01.T01:intron 35.0%
CTTTACAGGTTCAATTTGTC+TGG - Chr2:12429211-12429230 MsG0280007239.01.T01:CDS 35.0%
GAACTTTGTTGATCATCCTT+TGG + Chr2:12431099-12431118 None:intergenic 35.0%
GATTCGCTTGAAACATAGTT+CGG + Chr2:12429885-12429904 None:intergenic 35.0%
GCACAAAACAATGAACTTAG+TGG - Chr2:12429511-12429530 MsG0280007239.01.T01:intron 35.0%
GCATTCAAGCAAGATGTTTA+TGG - Chr2:12431147-12431166 MsG0280007239.01.T01:CDS 35.0%
GGAAAATTGGTGAAGAGTAA+TGG - Chr2:12431201-12431220 MsG0280007239.01.T01:CDS 35.0%
GGATTCAAGTGGTTGTAAAA+AGG - Chr2:12430096-12430115 MsG0280007239.01.T01:CDS 35.0%
GGTCAACATGGTATTATTCA+TGG - Chr2:12431003-12431022 MsG0280007239.01.T01:CDS 35.0%
GTCTATGAATATCAGCAGAA+TGG - Chr2:12430242-12430261 MsG0280007239.01.T01:CDS 35.0%
GTGCCATATTCACTAATACA+AGG + Chr2:12431072-12431091 None:intergenic 35.0%
TATAAGGTGATGCTAACCAA+TGG - Chr2:12430074-12430093 MsG0280007239.01.T01:CDS 35.0%
TTGGAACAATAGAAAGCAAG+AGG + Chr2:12430206-12430225 None:intergenic 35.0%
TTTGTGCTAGGAACATATTG+AGG + Chr2:12429498-12429517 None:intergenic 35.0%
! AACTATCCATGTTGCTTCAT+AGG + Chr2:12430875-12430894 None:intergenic 35.0%
! AGTTTGTTCAAGCTTCTACA+TGG - Chr2:12430266-12430285 MsG0280007239.01.T01:CDS 35.0%
! GAAGTACTAGATATGCTTTC+AGG - Chr2:12430895-12430914 MsG0280007239.01.T01:CDS 35.0%
! GAGCCTTGTATTAGTGAATA+TGG - Chr2:12431066-12431085 MsG0280007239.01.T01:CDS 35.0%
! TAACCTTGCAAATCTGGAAT+TGG + Chr2:12429604-12429623 None:intergenic 35.0%
! TTCCAAACAAGAGAAGCTTT+TGG - Chr2:12430220-12430239 MsG0280007239.01.T01:CDS 35.0%
! TTCTTTGCAGACAGTTTTCT+TGG - Chr2:12429625-12429644 MsG0280007239.01.T01:intron 35.0%
! TTTGCTTAGTTCTTCTGCTT+TGG + Chr2:12429907-12429926 None:intergenic 35.0%
!! ATGGTATTGACTTGACTGAA+TGG - Chr2:12431220-12431239 MsG0280007239.01.T01:CDS 35.0%
!! TGGTATTGACTTGACTGAAT+GGG - Chr2:12431221-12431240 MsG0280007239.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTTCAGTTACCTCTGAAAG+TGG - Chr2:12429933-12429952 MsG0280007239.01.T01:intron 35.0%
AGTGGATATCCACATAGTCT+TGG + Chr2:12429655-12429674 None:intergenic 40.0%
CAATCAGTTGTGAGGAAGAA+TGG - Chr2:12431246-12431265 MsG0280007239.01.T01:CDS 40.0%
CAGTTCTTGACACAACTCAA+AGG - Chr2:12429079-12429098 MsG0280007239.01.T01:CDS 40.0%
GAACAATAGAAAGCAAGAGG+TGG + Chr2:12430203-12430222 None:intergenic 40.0%
GACCAAAAGCTTCTCTTGTT+TGG + Chr2:12430225-12430244 None:intergenic 40.0%
GCACATCAAAGACCTTTGAT+TGG - Chr2:12430917-12430936 MsG0280007239.01.T01:CDS 40.0%
GCAGAAGAACTAAGCAAATC+TGG - Chr2:12429909-12429928 MsG0280007239.01.T01:intron 40.0%
GTTGTCATCGAGACTAAGAA+AGG + Chr2:12429290-12429309 None:intergenic 40.0%
TACAACCACTTGAATCCCAT+TGG + Chr2:12430093-12430112 None:intergenic 40.0%
TGAATATGGCACTATGCCAA+AGG - Chr2:12431080-12431099 MsG0280007239.01.T01:CDS 40.0%
TTCAACATGGCAAGTGAAGT+AGG + Chr2:12429403-12429422 None:intergenic 40.0%
! AATGGGTTCAATCAGTTGTG+AGG - Chr2:12431238-12431257 MsG0280007239.01.T01:CDS 40.0%
! AGTTACCTCTGAAAGTGGAA+TGG - Chr2:12429938-12429957 MsG0280007239.01.T01:intron 40.0%
! CTTGGTAATCCAAGACTATG+TGG - Chr2:12429643-12429662 MsG0280007239.01.T01:intron 40.0%
AAGGTGAGAGATTCAGCTAG+AGG + Chr2:12429271-12429290 None:intergenic 45.0%
AAGTCTGCTGCTCCAATCAA+AGG + Chr2:12430932-12430951 None:intergenic 45.0%
ACATGGCAAGTGAAGTAGGA+AGG + Chr2:12429399-12429418 None:intergenic 45.0%
ACCATTCCAATGATCCTTGC+AGG + Chr2:12429152-12429171 None:intergenic 45.0%
AGTTGTGAGGAAGAATGGAC+AGG - Chr2:12431251-12431270 MsG0280007239.01.T01:CDS 45.0%
ATTCTAGCCAGGTTTGGCAA+CGG + Chr2:12429469-12429488 None:intergenic 45.0%
CATCAAGAGCTTGGTCAACA+TGG - Chr2:12430991-12431010 MsG0280007239.01.T01:CDS 45.0%
CCATTCCAATGATCCTTGCA+GGG + Chr2:12429151-12429170 None:intergenic 45.0%
CCTCTTCCTATCATTTCAGC+AGG + Chr2:12430038-12430057 None:intergenic 45.0%
CCTGCTGAAATGATAGGAAG+AGG - Chr2:12430035-12430054 MsG0280007239.01.T01:intron 45.0%
CTCGATGACAACAACATCAG+TGG - Chr2:12429298-12429317 MsG0280007239.01.T01:CDS 45.0%
GATGACAACAACATCAGTGG+CGG - Chr2:12429301-12429320 MsG0280007239.01.T01:CDS 45.0%
GCTAACCAATGGGATTCAAG+TGG - Chr2:12430085-12430104 MsG0280007239.01.T01:CDS 45.0%
GCTTTCATGCATCAAGAGCT+TGG - Chr2:12430982-12431001 MsG0280007239.01.T01:CDS 45.0%
GGTCCAATTCCAGATTTGCA+AGG - Chr2:12429598-12429617 MsG0280007239.01.T01:intron 45.0%
TACTCAGGCTATGCTGCATT+AGG - Chr2:12429765-12429784 MsG0280007239.01.T01:intron 45.0%
TAGGAAGGTTTCCAGCAAGT+TGG + Chr2:12429384-12429403 None:intergenic 45.0%
TGAGACCATTCCACTTTCAG+AGG + Chr2:12429946-12429965 None:intergenic 45.0%
TTTGATTGGAGCAGCAGACT+TGG - Chr2:12430931-12430950 MsG0280007239.01.T01:CDS 45.0%
! AGAGCACCTGCTGAAATGAT+AGG - Chr2:12430029-12430048 MsG0280007239.01.T01:intron 45.0%
! GGACAGGTGAAGTGTTTGAT+AGG - Chr2:12431267-12431286 MsG0280007239.01.T01:CDS 45.0%
! GGCGGAATAACATCTGAGAT+CGG - Chr2:12429319-12429338 MsG0280007239.01.T01:CDS 45.0%
CAAGAGGTGGCAGAACATGA+GGG + Chr2:12430190-12430209 None:intergenic 50.0%
CCAAACCTGGCTAGAATCTC+AGG - Chr2:12429472-12429491 MsG0280007239.01.T01:intron 50.0%
CCCTGCAAGGATCATTGGAA+TGG - Chr2:12429148-12429167 MsG0280007239.01.T01:CDS 50.0%
CCTGAGATTCTAGCCAGGTT+TGG + Chr2:12429475-12429494 None:intergenic 50.0%
CTAAGCGGAAACCAACTTGC+TGG - Chr2:12429370-12429389 MsG0280007239.01.T01:CDS 50.0%
CTGATCCCTGCAAGGATCAT+TGG - Chr2:12429143-12429162 MsG0280007239.01.T01:CDS 50.0%
! GTTGGTTTCCGCTTAGGTGA+AGG + Chr2:12429366-12429385 None:intergenic 50.0%
!! CAGCAAGTTGGTTTCCGCTT+AGG + Chr2:12429372-12429391 None:intergenic 50.0%
ACCAGACACTGATCCCTGCA+AGG - Chr2:12429135-12429154 MsG0280007239.01.T01:CDS 55.0%
AGGCTGCAGGTTGCAAAGCA+AGG + Chr2:12429251-12429270 None:intergenic 55.0%
CTCACTCGCCTTCACCTAAG+CGG - Chr2:12429355-12429374 MsG0280007239.01.T01:CDS 55.0%
GAGATTCAGCTAGAGGCTGC+AGG + Chr2:12429264-12429283 None:intergenic 55.0%
GCAAGAGGTGGCAGAACATG+AGG + Chr2:12430191-12430210 None:intergenic 55.0%
TCCTTGCAGGGATCAGTGTC+TGG + Chr2:12429139-12429158 None:intergenic 55.0%
TGAGGCCTGAGATTCTAGCC+AGG + Chr2:12429480-12429499 None:intergenic 55.0%
TTCGGGACCGTTGCCAAACC+TGG - Chr2:12429459-12429478 MsG0280007239.01.T01:intron 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr2 gene 12429061 12431299 12429061 ID=MsG0280007239.01;Name=MsG0280007239.01
Chr2 mRNA 12429061 12431299 12429061 ID=MsG0280007239.01.T01;Parent=MsG0280007239.01;Name=MsG0280007239.01.T01;_AED=0.49;_eAED=0.49;_QI=0|0|0|1|1|1|3|0|481
Chr2 exon 12430714 12431299 12430714 ID=MsG0280007239.01.T01:exon:2918;Parent=MsG0280007239.01.T01
Chr2 exon 12430073 12430549 12430073 ID=MsG0280007239.01.T01:exon:2917;Parent=MsG0280007239.01.T01
Chr2 exon 12429061 12429443 12429061 ID=MsG0280007239.01.T01:exon:2916;Parent=MsG0280007239.01.T01
Chr2 CDS 12430714 12431299 12430714 ID=MsG0280007239.01.T01:cds;Parent=MsG0280007239.01.T01
Chr2 CDS 12430073 12430549 12430073 ID=MsG0280007239.01.T01:cds;Parent=MsG0280007239.01.T01
Chr2 CDS 12429061 12429443 12429061 ID=MsG0280007239.01.T01:cds;Parent=MsG0280007239.01.T01
Gene Sequence

>MsG0280007239.01.T01

ATGAAGAGAACACTAATACAGTTCTTGACACAACTCAAAGGCCAGCAGAATAATAATTCAACTTTGGTCTGGAAACCAGACACTGATCCCTGCAAGGATCATTGGAATGGTGTATACTGTGATGCACAAATGTCAATAAAGAAGTTGGATCTTTACAGGTTCAATTTGTCTGGAACTCTCGACGTTGCCTTGCTTTGCAACCTGCAGCCTCTAGCTGAATCTCTCACCTTTCTTAGTCTCGATGACAACAACATCAGTGGCGGAATAACATCTGAGATCGGAAACTGCAAACAACTCACTCGCCTTCACCTAAGCGGAAACCAACTTGCTGGAAACCTTCCTACTTCACTTGCCATGTTGAACAATTTGAAAAGACTAGACATTTCAAACAACAAGTTTTCGGGACCGTTGCCAAACCTGGCTAGAATCTCAGGCCTCAATATGTTCCTAGCACAAAACAATGAACTTAGTGGAAATATACCAACATTTTATTTCTCTAATTTTGACCGTTTCAATGTTTCCTTTAACAATTTTAGTGGTCCAATTCCAGATTTGCAAGGTTATTTCTTTGCAGACAGTTTTCTTGTCTGGAAGCTGTGTATAAGAAAGAAGAGTGGGAAAAAAGTTCAAACAGAATTGAATGATGATATCGAAAAACCGAACTATGTTTCAAGCGAATCCAAAGCAGAAGAACTAAGCAAATCTGGATTTTCAGTTACCTCTGAAAGTGGAATGGTCTCACAACAATCACTTATTGTTCTTTCAAGGCCAGTAGTGAATGAATTGAAATTAGAGGAGTTGTTGAGAGCACCTGCTGAAATGATAGGAAGAGGAAAGAATGGAAGTCTATATAAGGTGATGCTAACCAATGGGATTCAAGTGGTTGTAAAAAGGATTAAAGATTGGAGTATTTCTAGTGTTGAATTCAAGCAAAGAATGCAACTATTGAATCAAGCAAAACACCCTCATGTTCTGCCACCTCTTGCTTTCTATTGTTCCAAACAAGAGAAGCTTTTGGTCTATGAATATCAGCAGAATGGAAGTTTGTTCAAGCTTCTACATGGCACATCAAAGACCTTTGATTGGAGCAGCAGACTTGGACTTGCATCTACAATTGCTGAAGCATTAGCTTTCATGCATCAAGAGCTTGGTCAACATGGTATTATTCATGGTAACATGAAATCCTCAAACATTTTGCTAAACATTAACATGGAGCCTTGTATTAGTGAATATGGCACTATGCCAAAGGATGATCAACAAAGTTCAACTTTTGCAACTCCTAATGATGCTAATGCATTCAAGCAAGATGTTTATGGATTTGGTGTTATTCTTCTTGAATTACTAACTGGAAAATTGGTGAAGAGTAATGGTATTGACTTGACTGAATGGGTTCAATCAGTTGTGAGGAAGAATGGACAGGTGAAGTGTTTGATAGGTCATTATTGA
Protein sequence

>MsG0280007239.01.T01

MKRTLIQFLTQLKGQQNNNSTLVWKPDTDPCKDHWNGVYCDAQMSIKKLDLYRFNLSGTLDVALLCNLQPLAESLTFLSLDDNNISGGITSEIGNCKQLTRLHLSGNQLAGNLPTSLAMLNNLKRLDISNNKFSGPLPNLARISGLNMFLAQNNELSGNIPTFYFSNFDRFNVSFNNFSGPIPDLQGYFFADSFLVWKLCIRKKSGKKVQTELNDDIEKPNYVSSESKAEELSKSGFSVTSESGMVSQQSLIVLSRPVVNELKLEELLRAPAEMIGRGKNGSLYKVMLTNGIQVVVKRIKDWSISSVEFKQRMQLLNQAKHPHVLPPLAFYCSKQEKLLVYEYQQNGSLFKLLHGTSKTFDWSSRLGLASTIAEALAFMHQELGQHGIIHGNMKSSNILLNINMEPCISEYGTMPKDDQQSSTFATPNDANAFKQDVYGFGVILLELLTGKLVKSNGIDLTEWVQSVVRKNGQVKCLIGHY*