AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380011889.01

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MsG0380011889.01.T01 AT1G67520 44.059 404 172 8 368 728 121 513 2.55e-96 313
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MsG0380011889.01.T01 AT4G03230 23.754 341 212 8 93 424 29 330 1.36e-24 110
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MsG0380011889.01.T01 AT4G03230 46.914 81 32 1 736 816 857 926 8.14e-12 69.7
MsG0380011889.01.T01 AT4G23230 54.514 288 119 4 434 714 271 553 5.49e-95 310
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MsG0380011889.01.T01 AT1G67520 44.059 404 172 8 368 728 336 728 2.70e-94 314
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MsG0380011889.01.T01 AT4G23190 56.180 267 112 2 439 701 210 475 2.85e-94 307
MsG0380011889.01.T01 AT1G67520 44.059 404 172 8 368 728 329 721 3.65e-94 313
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MsG0380011889.01.T01 AT4G23240 51.282 312 135 4 395 702 241 539 7.31e-93 306
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MsG0380011889.01.T01 AT4G05200 54.513 277 114 2 433 702 298 569 1.65e-92 305
MsG0380011889.01.T01 AT4G05200 43.038 79 34 1 736 814 532 599 2.71e-13 74.3
MsG0380011889.01.T01 AT4G23180 63.274 226 81 1 486 709 336 561 1.77e-92 305
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MsG0380011889.01.T01 AT4G23320 50.294 340 146 7 364 699 85 405 2.06e-92 300
MsG0380011889.01.T01 AT4G23130 63.519 233 81 1 471 699 309 541 2.91e-92 304
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MsG0380011889.01.T01 AT4G23130 45.882 85 36 3 736 820 511 585 1.57e-11 68.6
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MsG0380011889.01.T01 AT4G11900 33.543 635 350 22 3 584 8 623 3.68e-92 303
MsG0380011889.01.T01 AT4G23270 62.185 238 86 1 466 699 290 527 8.40e-92 302
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MsG0380011889.01.T01 AT4G23270 62.185 238 86 1 466 699 290 527 9.10e-92 302
MsG0380011889.01.T01 AT4G23260 67.281 217 71 0 486 702 316 532 1.69e-91 301
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MsG0380011889.01.T01 AT4G23160 46.341 82 33 1 736 817 526 596 6.87e-14 76.3
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MsG0380011889.01.T01 AT4G11470 48.718 78 24 3 736 810 511 575 4.26e-12 70.5
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MsG0380011889.01.T01 AT4G21410 51.342 298 131 3 416 699 138 435 2.03e-86 285
MsG0380011889.01.T01 AT4G04570 46.154 351 171 5 364 702 208 552 5.09e-86 287
MsG0380011889.01.T01 AT4G00970 48.204 334 160 7 372 699 221 547 5.70e-86 285
MsG0380011889.01.T01 AT4G23220 55.639 266 107 4 440 700 279 538 6.25e-86 287
MsG0380011889.01.T01 AT4G23220 46.053 76 31 1 735 810 502 567 3.50e-12 70.5
MsG0380011889.01.T01 AT3G12000 39.459 370 213 6 37 397 48 415 1.51e-85 279
MsG0380011889.01.T01 AT4G21410 51.342 298 131 3 416 699 263 560 2.26e-85 286
MsG0380011889.01.T01 AT4G00970 48.204 334 160 7 372 699 221 547 1.20e-84 284
MsG0380011889.01.T01 AT4G04540 56.735 245 106 0 458 702 284 528 1.33e-84 283
MsG0380011889.01.T01 AT4G00960 63.380 213 76 1 486 696 44 256 1.75e-84 271
MsG0380011889.01.T01 AT4G00960 63.426 216 77 1 486 699 44 259 2.46e-84 274
MsG0380011889.01.T01 AT4G04510 53.558 267 119 2 441 706 285 547 1.31e-83 280
MsG0380011889.01.T01 AT4G04510 53.558 267 119 2 441 706 287 549 1.70e-83 280
MsG0380011889.01.T01 AT4G21400 60.177 226 88 1 476 699 339 564 9.75e-83 279
MsG0380011889.01.T01 AT4G21400 62.212 217 80 1 485 699 336 552 1.73e-82 278
MsG0380011889.01.T01 AT4G23210 58.036 224 92 1 486 709 348 569 1.86e-78 265
MsG0380011889.01.T01 AT4G23300 56.388 227 95 1 477 699 328 554 5.31e-78 266
MsG0380011889.01.T01 AT4G21400 55.102 245 80 2 485 699 209 453 7.64e-78 263
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MsG0380011889.01.T01 AT3G16030 30.508 649 361 16 4 584 8 634 1.06e-76 261
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MsG0380011889.01.T01 AT3G26940 47.907 215 111 1 485 698 61 275 5.12e-58 204
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MsG0380011889.01.T01 AT2G18470 46.047 215 114 2 484 698 270 482 5.00e-56 204
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MsG0380011889.01.T01 AT5G40380 47.137 227 108 2 448 663 254 479 1.93e-55 199
MsG0380011889.01.T01 AT4G02010 38.538 301 168 5 426 712 300 597 2.91e-55 204
MsG0380011889.01.T01 AT1G01540 42.105 228 130 2 486 712 142 368 3.51e-55 198
MsG0380011889.01.T01 AT5G10530 39.610 308 158 7 419 709 252 548 6.13e-55 201
MsG0380011889.01.T01 AT3G24790 46.352 233 121 4 483 712 32 263 8.77e-55 194
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MsG0380011889.01.T01 AT3G24790 46.352 233 121 4 483 712 50 281 1.19e-54 194
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MsG0380011889.01.T01 AT1G09440 42.105 228 130 2 486 712 145 371 1.03e-53 194
MsG0380011889.01.T01 AT1G76370 45.175 228 122 3 480 705 57 283 1.80e-53 191
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MsG0380011889.01.T01 AT1G56720 41.228 228 132 2 486 712 167 393 4.76e-53 192
MsG0380011889.01.T01 AT1G56720 41.228 228 132 2 486 712 167 393 4.76e-53 192
MsG0380011889.01.T01 AT1G56720 41.228 228 132 2 486 712 167 393 4.76e-53 192
MsG0380011889.01.T01 AT5G13160 48.858 219 108 4 483 698 71 288 7.07e-53 191
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MsG0380011889.01.T01 AT2G42960 42.358 229 128 3 486 712 171 397 3.36e-52 190
MsG0380011889.01.T01 AT2G42960 42.358 229 128 3 486 712 171 397 3.36e-52 190
MsG0380011889.01.T01 AT2G42960 42.358 229 128 3 486 712 171 397 3.36e-52 190
MsG0380011889.01.T01 AT4G02410 42.500 240 130 4 465 698 317 554 4.49e-52 194
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MsG0380011889.01.T01 AT5G18610 48.858 219 108 4 483 698 68 285 5.71e-52 190
MsG0380011889.01.T01 AT5G18610 48.858 219 108 4 483 698 68 285 5.71e-52 190
MsG0380011889.01.T01 AT5G59270 41.410 227 132 1 486 712 356 581 8.21e-52 193
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MsG0380011889.01.T01 AT4G02420 41.250 240 133 4 465 698 312 549 8.44e-52 192
MsG0380011889.01.T01 AT5G59270 41.410 227 132 1 486 712 337 562 8.57e-52 192
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MsG0380011889.01.T01 AT2G37050 38.535 314 175 7 399 698 494 803 1.55e-51 195
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MsG0380011889.01.T01 AT5G18500 41.228 228 132 2 486 712 154 380 6.03e-51 186
MsG0380011889.01.T01 AT5G18500 41.228 228 132 2 486 712 154 380 6.03e-51 186
MsG0380011889.01.T01 AT5G18500 41.228 228 132 2 486 712 154 380 6.03e-51 186
MsG0380011889.01.T01 AT5G18500 41.228 228 132 2 486 712 154 380 6.03e-51 186
MsG0380011889.01.T01 AT5G18500 41.228 228 132 2 486 712 154 380 6.03e-51 186
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MsG0380011889.01.T01 AT5G15730 43.128 211 115 2 486 696 104 309 2.70e-50 183
MsG0380011889.01.T01 AT1G16150 41.393 244 133 2 468 702 394 636 3.16e-50 189
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MsG0380011889.01.T01 AT3G28690 42.017 238 126 2 485 712 62 297 4.36e-50 182
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MsG0380011889.01.T01 AT4G17660 41.532 248 130 5 475 712 68 310 2.88e-49 179
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MsG0380011889.01.T01 AT5G37450 40.892 269 150 4 438 698 567 834 7.76e-49 187
MsG0380011889.01.T01 AT5G45780 40.357 280 157 6 421 698 229 500 8.36e-49 183
MsG0380011889.01.T01 AT1G78530 40.377 265 143 4 441 698 15 271 8.72e-49 174
MsG0380011889.01.T01 AT1G61590 41.727 278 136 8 486 753 87 348 1.04e-48 178
MsG0380011889.01.T01 AT5G01020 43.882 237 119 7 484 712 58 288 1.25e-48 178
MsG0380011889.01.T01 AT1G16120 42.358 229 129 2 472 698 401 628 1.28e-48 184
MsG0380011889.01.T01 AT2G28590 45.413 218 117 2 483 698 83 300 1.35e-48 178
MsG0380011889.01.T01 AT1G60800 42.609 230 127 4 486 712 289 516 1.49e-48 182
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MsG0380011889.01.T01 AT1G07570 43.388 242 117 6 486 712 56 292 1.79e-48 177
MsG0380011889.01.T01 AT1G07570 43.388 242 117 6 486 712 56 292 1.79e-48 177
MsG0380011889.01.T01 AT5G47070 44.167 240 117 8 485 712 73 307 2.07e-48 177
MsG0380011889.01.T01 AT5G01550 38.519 270 160 4 433 698 315 582 2.24e-48 183
MsG0380011889.01.T01 AT1G07570 43.388 242 117 6 486 712 67 303 2.27e-48 177
MsG0380011889.01.T01 AT3G01300 42.616 237 124 2 486 712 124 358 3.04e-48 179
MsG0380011889.01.T01 AT3G59700 37.643 263 154 5 441 698 281 538 3.68e-48 182
MsG0380011889.01.T01 AT1G55200 44.091 220 120 3 480 698 361 578 4.26e-48 182
MsG0380011889.01.T01 AT1G55200 44.091 220 120 3 480 698 361 578 4.26e-48 182
MsG0380011889.01.T01 AT1G55200 44.091 220 120 3 480 698 361 578 4.26e-48 182
MsG0380011889.01.T01 AT1G55200 44.091 220 120 3 480 698 361 578 4.26e-48 182
MsG0380011889.01.T01 AT4G39400 42.453 212 121 1 488 698 873 1084 4.35e-48 185
MsG0380011889.01.T01 AT2G37710 43.458 214 118 3 486 698 335 546 4.42e-48 182
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MsG0380011889.01.T01 AT1G79620 38.686 274 150 4 441 698 592 863 5.07e-48 184
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MsG0380011889.01.T01 AT3G13690 42.727 220 123 3 480 698 393 610 5.50e-48 182
MsG0380011889.01.T01 AT3G13690 42.727 220 123 3 480 698 393 610 5.50e-48 182
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MsG0380011889.01.T01 AT2G28930 44.000 225 112 5 486 698 68 290 2.01e-47 175
MsG0380011889.01.T01 AT2G05940 44.395 223 113 5 485 699 74 293 2.25e-47 176
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MsG0380011889.01.T01 AT5G02290 43.096 239 122 5 486 712 56 292 2.37e-47 174
MsG0380011889.01.T01 AT2G11520 44.601 213 115 3 488 698 215 426 2.40e-47 177
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MsG0380011889.01.T01 AT4G04960 39.834 241 137 6 465 698 310 549 4.28e-47 179
MsG0380011889.01.T01 AT5G11020 40.000 225 131 2 474 698 57 277 4.74e-47 172
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MsG0380011889.01.T01 AT5G60300 39.394 264 142 5 441 698 290 541 4.75e-47 179
MsG0380011889.01.T01 AT1G21240 29.434 530 266 18 217 724 197 640 5.19e-47 179
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MsG0380011889.01.T01 AT5G35580 46.637 223 108 5 485 699 75 294 6.08e-47 175
MsG0380011889.01.T01 AT2G02800 42.857 224 114 5 486 698 71 291 6.37e-47 173
MsG0380011889.01.T01 AT2G02800 42.857 224 114 5 486 698 71 291 6.37e-47 173
MsG0380011889.01.T01 AT3G45430 37.943 282 169 5 421 702 270 545 7.35e-47 178
MsG0380011889.01.T01 AT3G45430 37.943 282 169 5 421 702 270 545 7.35e-47 178
MsG0380011889.01.T01 AT3G45430 37.943 282 169 5 421 702 270 545 7.35e-47 178
MsG0380011889.01.T01 AT1G24030 37.447 235 141 3 483 712 47 280 7.53e-47 169
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MsG0380011889.01.T01 AT2G25220 42.254 213 121 1 486 698 134 344 9.49e-47 171
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MsG0380011889.01.T01 AT3G62220 40.426 235 127 3 491 719 62 289 1.03e-46 171
MsG0380011889.01.T01 AT5G11020 40.465 215 125 1 484 698 89 300 1.10e-46 172
MsG0380011889.01.T01 AT1G79670 41.202 233 136 1 483 715 406 637 1.52e-46 178
MsG0380011889.01.T01 AT5G11020 40.000 225 131 2 474 698 118 338 1.55e-46 172
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MsG0380011889.01.T01 AT2G25220 42.254 213 121 1 486 698 85 295 2.10e-46 171
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MsG0380011889.01.T01 AT5G54590 42.925 212 115 3 486 697 103 308 2.20e-46 172
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MsG0380011889.01.T01 AT2G17220 44.344 221 113 3 485 696 73 292 3.29e-46 171
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MsG0380011889.01.T01 AT5G28680 42.453 212 121 1 486 697 509 719 4.03e-46 178
MsG0380011889.01.T01 AT1G70130 43.318 217 120 3 486 701 322 536 4.04e-46 176
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MsG0380011889.01.T01 AT2G25220 42.254 213 121 1 486 698 139 349 5.14e-46 171
MsG0380011889.01.T01 AT1G14370 42.857 224 114 5 486 698 74 294 5.77e-46 171
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MsG0380011889.01.T01 AT2G43690 37.363 273 155 6 434 698 271 535 1.11e-45 175
MsG0380011889.01.T01 AT4G28350 39.098 266 147 7 443 698 290 550 1.14e-45 175
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MsG0380011889.01.T01 AT1G16260 41.121 214 125 1 485 698 377 589 1.43e-45 175
MsG0380011889.01.T01 AT1G72300 42.593 216 119 3 484 698 792 1003 1.48e-45 177
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Find 158 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 465 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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CGTAATCTTGTAAAACTTCT+TGG 0.207911 3:-7468447 MsG0380011889.01.T01:CDS
TGCCAAAATTTCAACCAAAA+TGG 0.224209 3:-7469679 MsG0380011889.01.T01:CDS
ATCCCAAAGATAGCAGATTT+TGG 0.231250 3:-7468101 MsG0380011889.01.T01:CDS
CGCCGTTATTCTTGATGAAT+TGG 0.246505 3:+7470291 None:intergenic
AAGCCAAAATCTGCTATCTT+TGG 0.271620 3:+7468098 None:intergenic
GACCCATGCGCCGCATATTC+TGG 0.272888 3:+7463632 None:intergenic
CCTTCCAAGCATTCACATAT+TGG 0.273760 3:+7469707 None:intergenic
ATTGTGCAGTTGTTGGATTC+AGG 0.279637 3:-7470256 MsG0380011889.01.T01:CDS
GGAGTTATTGCATTCATAAT+AGG 0.288422 3:-7469049 MsG0380011889.01.T01:CDS
AAGTTAGGAGAAGGTGGTTT+TGG 0.296558 3:-7468676 MsG0380011889.01.T01:CDS
GATCCATGCACTGCATATTC+TGG 0.304232 3:+7467885 None:intergenic
GAACTTCACAACGTCTTAAA+TGG 0.308698 3:-7469835 MsG0380011889.01.T01:CDS
GGAAGTCTTGTTATTCTTGA+TGG 0.312213 3:-7470337 MsG0380011889.01.T01:CDS
GGTCGGATCAGACACAAAAT+TGG 0.314529 3:-7469814 MsG0380011889.01.T01:CDS
CTACATCACCTAAACCTTCT+TGG 0.317455 3:-7467774 MsG0380011889.01.T01:CDS
TTGTCGTTCCCTTTGCAATT+TGG 0.318358 3:+7470026 None:intergenic
CTGAAAAGTAACTTGGTTAC+TGG 0.326138 3:-7470142 MsG0380011889.01.T01:CDS
AAGCGTGCTTGGACTGTTGC+AGG 0.326451 3:-7469070 MsG0380011889.01.T01:CDS
CATTTCAGGCATGGAGACTA+TGG 0.334412 3:-7463243 MsG0380011889.01.T01:intron
CGATGATGAGGCCAGAAAAT+AGG 0.336092 3:-7463179 None:intergenic
CCGTATTGCATAAACTGATT+TGG 0.339917 3:+7470538 None:intergenic
TCAGCATATGGAGAGAAAAT+TGG 0.343425 3:-7469001 MsG0380011889.01.T01:intron
CATATAGATATCTCACTTCT+TGG 0.354855 3:-7470117 MsG0380011889.01.T01:CDS
TAAAACATTACCTTGTAAAC+TGG 0.374752 3:+7468652 None:intergenic
AGAAGAAAGTATACACCATT+AGG 0.377003 3:+7470611 None:intergenic
GGCTTAGCCAGATCATTTAT+GGG 0.377541 3:-7468080 MsG0380011889.01.T01:CDS
TTACATGACCAAGAAGGTTT+AGG 0.383746 3:+7467766 None:intergenic
AGCCAAAATCTGCTATCTTT+GGG 0.388083 3:+7468099 None:intergenic
ATTGGTCTGGTGGGTGCCTC+AGG 0.394950 3:-7469646 MsG0380011889.01.T01:CDS
GGAGTTCCAGATGACACCTT+TGG 0.399105 3:+7470312 None:intergenic
AATTATTGACGGGATTGCTC+GGG 0.410276 3:-7468210 MsG0380011889.01.T01:CDS
CTTTCCAATATGTGAATGCT+TGG 0.420269 3:-7469711 MsG0380011889.01.T01:CDS
AGACGTTGTGAAGTTCCATA+TGG 0.421194 3:+7469842 None:intergenic
CAAGAAGTGAGATATCTATA+TGG 0.428532 3:+7470118 None:intergenic
TACCAAGATGTTGACGTGTC+TGG 0.429175 3:+7469563 None:intergenic
TTGGATTCAGGAAACCTTGT+TGG 0.430455 3:-7470244 MsG0380011889.01.T01:CDS
ATGGCTCCAAAGGTGTCATC+TGG 0.433337 3:-7470318 MsG0380011889.01.T01:CDS
ATCAGTTATTGTGCAGTTGT+TGG 0.436970 3:-7470263 MsG0380011889.01.T01:CDS
GTTGTACTTGAGATAATTAG+TGG 0.437234 3:-7467825 MsG0380011889.01.T01:CDS
GCCAAGAGATTGCTGTTAAG+AGG 0.437950 3:-7468542 MsG0380011889.01.T01:CDS
GTGGGAGTGGCTGCTTACTT+TGG 0.439476 3:-7469451 MsG0380011889.01.T01:CDS
AGTGTTCTGTTTAGAGAAAG+TGG 0.451386 3:+7470576 None:intergenic
CCTGGTAACACTTTCCTACC+TGG 0.454651 3:-7470172 MsG0380011889.01.T01:CDS
ATCGAAAACTCGCCGTCAGC+AGG 0.458165 3:+7470079 None:intergenic
ACGTACAGGAGTATTTCTAT+TGG 0.459642 3:+7470393 None:intergenic
AACGCCAATACTTTGGCATA+TGG 0.460932 3:-7470453 MsG0380011889.01.T01:CDS
GATACTCTTGTTTCAGCAGC+TGG 0.461871 3:-7470514 MsG0380011889.01.T01:CDS
CAAAACTTACATGACTAAGA+AGG 0.463066 3:+7463507 None:intergenic
AGAGAAACTTGAAGCGTGCT+TGG 0.463148 3:-7469081 MsG0380011889.01.T01:CDS
AAATTATTGACGGGATTGCT+CGG 0.464042 3:-7468211 MsG0380011889.01.T01:CDS
GGAACGACAACTATATTTAG+AGG 0.468825 3:-7470013 MsG0380011889.01.T01:CDS
AGATAAGATGCCAATCCTAA+TGG 0.470942 3:-7470626 MsG0380011889.01.T01:exon
CCTCAACTCCAAATTGCAAA+GGG 0.471222 3:-7470034 MsG0380011889.01.T01:CDS
TTCTCTGATACAAATAAGTT+AGG 0.471343 3:-7468691 MsG0380011889.01.T01:CDS
AGAGTTGTGCTAAATCCATA+TGG 0.472204 3:-7469857 MsG0380011889.01.T01:CDS
AAAGTAATCCAAGCTTCTGT+TGG 0.474079 3:+7468377 None:intergenic
TGGATTCAGGAAACCTTGTT+GGG 0.474562 3:-7470243 MsG0380011889.01.T01:CDS
TAATCATCACACTGGTCTGC+AGG 0.474853 3:+7469773 None:intergenic
GTTATTCTTGATGGCTCCAA+AGG 0.475658 3:-7470328 MsG0380011889.01.T01:CDS
TTGGTCTCCCATAAATGATC+TGG 0.475912 3:+7468073 None:intergenic
AAGAGGCTTTGTAATACATC+GGG 0.483961 3:-7468525 MsG0380011889.01.T01:CDS
GATCCACAACGCCAATACTT+TGG 0.484461 3:-7470460 MsG0380011889.01.T01:CDS
CCCTTTGCAATTTGGAGTTG+AGG 0.485126 3:+7470034 None:intergenic
ATTCATGCCCAACAGAAGCT+TGG 0.487316 3:-7468385 MsG0380011889.01.T01:CDS
GCCTCTTAACAGCAATCTCT+TGG 0.487518 3:+7468541 None:intergenic
CCAAATCAGTTTATGCAATA+CGG 0.488383 3:-7470538 MsG0380011889.01.T01:CDS
CCAATATGTGAATGCTTGGA+AGG 0.494173 3:-7469707 MsG0380011889.01.T01:CDS
TAAATGTCTTGTCCTACGTC+AGG 0.498025 3:+7469398 None:intergenic
TTGAATTGTCACACTGGGGA+TGG 0.501883 3:-7469614 MsG0380011889.01.T01:CDS
GGGGCTGCTATATCTGCATC+AGG 0.504204 3:-7468189 MsG0380011889.01.T01:CDS
ACTCGATTGGACAAAGCGCT+TGG 0.504412 3:-7468234 MsG0380011889.01.T01:CDS
TGTACCATATGCCAAAGTAT+TGG 0.504775 3:+7470449 None:intergenic
CTCCAATTCATCAAGAATAA+CGG 0.508761 3:-7470293 MsG0380011889.01.T01:CDS
CACGAAGTAAATTACTCGAT+TGG 0.509586 3:-7468247 MsG0380011889.01.T01:CDS
CCTCCAGAATATGCGGCGCA+TGG 0.509866 3:-7463635 MsG0380011889.01.T01:CDS
AAGTAATCCAAGCTTCTGTT+GGG 0.512838 3:+7468378 None:intergenic
TGCCAGACACGTCAACATCT+TGG 0.513042 3:-7469565 MsG0380011889.01.T01:CDS
GTCGGATCAGACACAAAATT+GGG 0.514166 3:-7469813 MsG0380011889.01.T01:CDS
TCCTCAACTCCAAATTGCAA+AGG 0.514920 3:-7470035 MsG0380011889.01.T01:CDS
TGTTTGTATCTTTCCCAACA+AGG 0.515050 3:+7470230 None:intergenic
ACAAATAAGTTAGGAGAAGG+TGG 0.517726 3:-7468682 MsG0380011889.01.T01:CDS
AAAGTATACACCATTAGGAT+TGG 0.518835 3:+7470616 None:intergenic
GTATTAGTCACATCAGCATA+TGG 0.518889 3:-7469013 MsG0380011889.01.T01:CDS
GCTAAAACAAATAGAGTGAT+GGG 0.519895 3:-7468044 MsG0380011889.01.T01:CDS
TGGAAGTCATCGGATTGGTC+TGG 0.520125 3:-7469659 MsG0380011889.01.T01:CDS
CAAAATTGAATTGTCACACT+GGG 0.527375 3:-7469619 MsG0380011889.01.T01:CDS
GGCTAAAACAAATAGAGTGA+TGG 0.530358 3:-7468045 MsG0380011889.01.T01:CDS
ACAAAATTGAATTGTCACAC+TGG 0.530753 3:-7469620 MsG0380011889.01.T01:CDS
ACTTTGGTTTAACAATATTG+TGG 0.531505 3:-7469435 MsG0380011889.01.T01:CDS
AATAGTGTGTGACAAGATAG+AGG 0.532729 3:+7463471 None:intergenic
ATTTGTTGCATTAGTGATGG+TGG 0.533348 3:+7468717 None:intergenic
GAAACATTACTAGGGTGTAA+TGG 0.535222 3:-7468571 MsG0380011889.01.T01:intron
CTCCAGAATATGCGGCGCAT+GGG 0.535494 3:-7463634 MsG0380011889.01.T01:CDS
AAGCGCTTGGAAATTATTGA+CGG 0.542058 3:-7468221 MsG0380011889.01.T01:CDS
CAAAACTTACATGACCAAGA+AGG 0.543072 3:+7467760 None:intergenic
GTTGTACTTGAGATAATTAG+CGG 0.543279 3:-7463572 MsG0380011889.01.T01:CDS
TCAACCAAAATGGAAGTCAT+CGG 0.543394 3:-7469669 MsG0380011889.01.T01:CDS
ATTGCTGTTGAGTTACGTAC+AGG 0.545683 3:+7470379 None:intergenic
CCAGGTAGGAAAGTGTTACC+AGG 0.546885 3:+7470172 None:intergenic
GCAGCTGGAATATATGAAGC+TGG 0.546889 3:-7470499 MsG0380011889.01.T01:CDS
AAGTCATCGGATTGGTCTGG+TGG 0.547885 3:-7469656 MsG0380011889.01.T01:CDS
AGCGCTTGGAAATTATTGAC+GGG 0.551089 3:-7468220 MsG0380011889.01.T01:CDS
AATGAAGCTGAAAAGTAACT+TGG 0.554502 3:-7470149 MsG0380011889.01.T01:CDS
GGAGACTATGGATTGAAGAA+AGG 0.556754 3:-7463231 MsG0380011889.01.T01:CDS
ATTATTGACGGGATTGCTCG+GGG 0.557681 3:-7468209 MsG0380011889.01.T01:CDS
ATGCCAAAGTATTGGCGTTG+TGG 0.560332 3:+7470457 None:intergenic
GCAAATTCTGATAGCAGAGA+TGG 0.561618 3:-7469473 MsG0380011889.01.T01:CDS
GCAACCCACACAATAGTCCT+TGG 0.562603 3:+7470415 None:intergenic
TTCACAACGTCTTAAATGGT+CGG 0.564620 3:-7469831 MsG0380011889.01.T01:CDS
GATACAAATAAGTTAGGAGA+AGG 0.574202 3:-7468685 MsG0380011889.01.T01:CDS
AGAGAAGGAAGATGGTGACT+TGG 0.574934 3:-7468758 MsG0380011889.01.T01:CDS
CCTCCAGAATATGCAGTGCA+TGG 0.575365 3:-7467888 MsG0380011889.01.T01:CDS
CAAAATGGAAGTCATCGGAT+TGG 0.576694 3:-7469664 MsG0380011889.01.T01:CDS
TACTAGGGTGTAATGGCAGA+TGG 0.577261 3:-7468564 MsG0380011889.01.T01:intron
CTTTGTAATACATCGGGACA+AGG 0.577508 3:-7468519 MsG0380011889.01.T01:CDS
TCCTCTGAAGATCCTGCTGA+CGG 0.582517 3:-7470091 MsG0380011889.01.T01:CDS
GTGATTTGTTGCATTAGTGA+TGG 0.583895 3:+7468714 None:intergenic
ATGGATTGAAGAAAGGCCAC+TGG 0.584614 3:-7463224 MsG0380011889.01.T01:CDS
CTATATTTAGAGGAGGGTCG+TGG 0.587777 3:-7470003 MsG0380011889.01.T01:CDS
AGAAGGTTTAGGTGATGTAG+AGG 0.590561 3:+7467777 None:intergenic
TAAGAGGCTTTGTAATACAT+CGG 0.592004 3:-7468526 MsG0380011889.01.T01:CDS
GATAGCAGAGATGGTGGGAG+TGG 0.598270 3:-7469464 MsG0380011889.01.T01:CDS
TATCACCAAGGACTATTGTG+TGG 0.600081 3:-7470420 MsG0380011889.01.T01:CDS
GTGTTCTGTTTAGAGAAAGT+GGG 0.603464 3:+7470577 None:intergenic
AGTCATCGGATTGGTCTGGT+GGG 0.605620 3:-7469655 MsG0380011889.01.T01:CDS
ATGCTGAAACTCACTGATCG+AGG 0.606211 3:-7470358 MsG0380011889.01.T01:CDS
CGACTCGCATCTTCAGAACT+CGG 0.611492 3:-7469371 MsG0380011889.01.T01:intron
TTTAGAGGAGGGTCGTGGAA+CGG 0.616941 3:-7469998 MsG0380011889.01.T01:CDS
AATTCTGATAGCAGAGATGG+TGG 0.616958 3:-7469470 MsG0380011889.01.T01:CDS
TGACATATTATACGATGATG+AGG 0.616961 3:-7463191 MsG0380011889.01.T01:CDS
TACTTGAGATAATTAGCGGT+AGG 0.624536 3:-7463568 MsG0380011889.01.T01:CDS
TACATCGGGACAAGGAGTTG+AGG 0.626175 3:-7468511 MsG0380011889.01.T01:CDS
ACAATGTCTTACATTCCTCA+AGG 0.642778 3:+7469525 None:intergenic
TGACATGAGCTTGAGCCTTG+AGG 0.643565 3:-7469540 MsG0380011889.01.T01:CDS
CCATGCACTGCATATTCTGG+AGG 0.645390 3:+7467888 None:intergenic
ACGACAACTATATTTAGAGG+AGG 0.646325 3:-7470010 MsG0380011889.01.T01:CDS
CGACAACTATATTTAGAGGA+GGG 0.647945 3:-7470009 MsG0380011889.01.T01:CDS
GTTAGAGTTGATACCGCACA+AGG 0.648304 3:+7469748 None:intergenic
ATGTCAGCTATGAACTCCAG+TGG 0.649803 3:+7463208 None:intergenic
ATCACCAAGGACTATTGTGT+GGG 0.651931 3:-7470419 MsG0380011889.01.T01:CDS
ATTCTGGAGGCATATATCCA+CGG 0.653571 3:+7463648 None:intergenic
GCCGTCAGCAGGATCTTCAG+AGG 0.663902 3:+7470090 None:intergenic
ATATATGCCTCCAGAATATG+CGG 0.676135 3:-7463642 MsG0380011889.01.T01:CDS
GAAGGTTTAGGTGATGTAGA+GGG 0.676314 3:+7467778 None:intergenic
ACAAGGCATAATCATCACAC+TGG 0.677116 3:+7469765 None:intergenic
TCGATGAGGATAGATACTCA+CGG 0.677931 3:-7470061 MsG0380011889.01.T01:CDS
CCATGCGCCGCATATTCTGG+AGG 0.679755 3:+7463635 None:intergenic
TTATTGACGGGATTGCTCGG+GGG 0.692869 3:-7468208 MsG0380011889.01.T01:CDS
ATGAGAAAACATCCTGACGT+AGG 0.705927 3:-7469410 MsG0380011889.01.T01:CDS
ATTAGTGGTAGAAAGAATCG+CGG 0.707511 3:-7467810 MsG0380011889.01.T01:CDS
TGTGATGATTATGCCTTGTG+CGG 0.717485 3:-7469761 MsG0380011889.01.T01:CDS
ATTCTGATAGCAGAGATGGT+GGG 0.725459 3:-7469469 MsG0380011889.01.T01:CDS
CAATTCATCAAGAATAACGG+CGG 0.729202 3:-7470290 MsG0380011889.01.T01:CDS
ATTTATGGGAGACCAAGCTG+AGG 0.738425 3:-7468066 MsG0380011889.01.T01:CDS
GGTACAAGAACATATCACCA+AGG 0.742464 3:-7470432 MsG0380011889.01.T01:CDS
AAAATTGAATTGTCACACTG+GGG 0.742610 3:-7469618 MsG0380011889.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TATATATATATATATATATA+TGG + Chr3:7467958-7467939 None:intergenic 0.0%
!! ATAAATCATATAAATTATTC+AGG + Chr3:7466728-7466747 None:intergenic 10.0%
!! ATATAAAAAAGTTAATTCAT+CGG - Chr3:7465027-7465046 MsG0380011889.01.T01:intron 10.0%
!! ATATATATATATATAGAGTT+AGG - Chr3:7468760-7468779 MsG0380011889.01.T01:CDS 10.0%
!! ATTAAATTAATTAATTCAAG+GGG + Chr3:7469228-7469247 None:intergenic 10.0%
!! CTATATATATATATATATAG+AGG + Chr3:7468775-7468756 None:intergenic 10.0%
!! GAATTATTTATTTCAATTTA+TGG - Chr3:7469830-7469849 MsG0380011889.01.T01:CDS 10.0%
!!! ATATTTTTGTTCAAATAAAA+AGG - Chr3:7469683-7469702 MsG0380011889.01.T01:CDS 10.0%
!! AATAAGAAGATAAATTAACT+TGG + Chr3:7465197-7465216 None:intergenic 15.0%
!! ACTAATCTTATAAAATTGAA+AGG - Chr3:7469399-7469418 MsG0380011889.01.T01:CDS 15.0%
!! ATAATAAGATTTATTCATGT+TGG - Chr3:7466408-7466427 MsG0380011889.01.T01:intron 15.0%
!! CTAATCTTATAAAATTGAAA+GGG - Chr3:7469400-7469419 MsG0380011889.01.T01:CDS 15.0%
!! TAATCTTATAAAATTGAAAG+GGG - Chr3:7469401-7469420 MsG0380011889.01.T01:CDS 15.0%
!! TTATATGATTTATGAAGATA+TGG - Chr3:7466735-7466754 MsG0380011889.01.T01:intron 15.0%
!!! TCTTATTATTTTTGAAGATA+TGG + Chr3:7466397-7466416 None:intergenic 15.0%
!!! TGTAAATTTTATGTCATTTT+AGG - Chr3:7466311-7466330 MsG0380011889.01.T01:intron 15.0%
!!! TTGATAAATCTTTATTTTGA+AGG + Chr3:7466239-7466258 None:intergenic 15.0%
!!! TTTTGTAAAATAATTGTTTC+AGG - Chr3:7468258-7468277 MsG0380011889.01.T01:intron 15.0%
!! AATCATATAAATTATTCAGG+TGG + Chr3:7466725-7466744 None:intergenic 20.0%
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!! ATCATATAAATTATTCAGGT+GGG + Chr3:7466724-7466743 None:intergenic 20.0%
!! CATTATTAGGTGTAAAAATT+TGG + Chr3:7469155-7469174 None:intergenic 20.0%
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!! TACATATCAATTGAGTAAAT+TGG - Chr3:7468379-7468398 MsG0380011889.01.T01:CDS 20.0%
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!!! TTTTAGTCTTTGGTAATATT+TGG - Chr3:7469973-7469992 MsG0380011889.01.T01:CDS 20.0%
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! ACCATTTGATTAAAAGCTAA+TGG - Chr3:7468022-7468041 MsG0380011889.01.T01:intron 25.0%
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! ACCTTCATGTTCAAATAAAA+AGG - Chr3:7469725-7469744 MsG0380011889.01.T01:CDS 25.0%
! AGAAAAAAAAAACCACTTGT+TGG + Chr3:7466811-7466830 None:intergenic 25.0%
! ATACAAAAGTAGGTAAAGAA+TGG - Chr3:7467674-7467693 MsG0380011889.01.T01:intron 25.0%
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! ATTGAAACTATTGAGAAGTA+TGG + Chr3:7468421-7468440 None:intergenic 25.0%
! CAAAAATGAAGTAAAGTTGA+TGG - Chr3:7465335-7465354 MsG0380011889.01.T01:intron 25.0%
! CAAACAAAGTAAACACAAAA+CGG - Chr3:7467197-7467216 MsG0380011889.01.T01:intron 25.0%
! CCAAGAAAATTGGAAATTTA+TGG + Chr3:7468882-7468901 None:intergenic 25.0%
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! CTACAAATCAATTACAATGA+TGG + Chr3:7469338-7469357 None:intergenic 25.0%
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! TAAAACATTACCTTGTAAAC+TGG + Chr3:7465170-7465189 None:intergenic 25.0%
! TAAAACTGAGAGCAATAATT+TGG + Chr3:7465494-7465513 None:intergenic 25.0%
! TAAAGAAACCTAAGTCAAAT+GGG + Chr3:7469131-7469150 None:intergenic 25.0%
! TACACCTAATAATGATTCTA+AGG - Chr3:7469161-7469180 MsG0380011889.01.T01:intron 25.0%
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! TTCTCTGATACAAATAAGTT+AGG - Chr3:7465128-7465147 MsG0380011889.01.T01:intron 25.0%
!! AAAAGAAGAAGCATAATTTC+TGG + Chr3:7468226-7468245 None:intergenic 25.0%
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!! ACTTTGGTTTAACAATATTG+TGG - Chr3:7464384-7464403 MsG0380011889.01.T01:intron 25.0%
!! AGTTTTCACGTGAAAAAAAT+TGG + Chr3:7469096-7469115 None:intergenic 25.0%
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!! CCATAAATTTCCAATTTTCT+TGG - Chr3:7468879-7468898 MsG0380011889.01.T01:intron 25.0%
!! CTTATTCTTTTTATGATCTG+AGG + Chr3:7464720-7464739 None:intergenic 25.0%
!! TACAAACATGGATTAAATAC+CGG - Chr3:7466621-7466640 MsG0380011889.01.T01:intron 25.0%
!! TTATTTTCATCCTCAGATTA+AGG - Chr3:7467498-7467517 MsG0380011889.01.T01:intron 25.0%
!! TTTTGCAAAATAATTGGTAC+CGG - Chr3:7468285-7468304 MsG0380011889.01.T01:intron 25.0%
!! TTTTGTTGCAATAAATCTTC+TGG - Chr3:7466143-7466162 MsG0380011889.01.T01:intron 25.0%
!!! AAATCTGATGTTTTTAGCTT+TGG - Chr3:7465967-7465986 MsG0380011889.01.T01:intron 25.0%
!!! AAATCTGCTGTTTTTAGTTT+TGG - Chr3:7470220-7470239 MsG0380011889.01.T01:CDS 25.0%
!!! ACCATTAGCTTTTAATCAAA+TGG + Chr3:7468026-7468045 None:intergenic 25.0%
!!! ACCTTTTTATTTGAACATGA+AGG + Chr3:7469729-7469748 None:intergenic 25.0%
!!! ACGCTCTTTATTTTCATTTT+AGG - Chr3:7468913-7468932 MsG0380011889.01.T01:intron 25.0%
!!! AGCTTGGATTACTTTATTTT+TGG - Chr3:7465450-7465469 MsG0380011889.01.T01:intron 25.0%
!!! ATTATTCTGGTTTTAGTCTT+TGG - Chr3:7469963-7469982 MsG0380011889.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATTTTAGTACTTACCTTACT+CGG + Chr3:7465223-7465242 None:intergenic 25.0%
!!! ATTTTATGTCATTTTAGGCA+TGG - Chr3:7466316-7466335 MsG0380011889.01.T01:intron 25.0%
!!! CGCTCTTTATTTTCATTTTA+GGG - Chr3:7468914-7468933 MsG0380011889.01.T01:intron 25.0%
!!! GGTCTTTTTTGCAAAATAAT+TGG - Chr3:7468279-7468298 MsG0380011889.01.T01:intron 25.0%
!!! TCTGTAATATACATCGATTT+CGG - Chr3:7469872-7469891 MsG0380011889.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTCCATTTTGGTTGAAATTT+TGG + Chr3:7464145-7464164 None:intergenic 25.0%
AAAATTGAATTGTCACACTG+GGG - Chr3:7464201-7464220 MsG0380011889.01.T01:intron 30.0%
AAAGTATACACCATTAGGAT+TGG + Chr3:7463206-7463225 None:intergenic 30.0%
AAGTTGTTAGATGCATCTTA+TGG - Chr3:7467860-7467879 MsG0380011889.01.T01:CDS 30.0%
AATGAAGCTGAAAAGTAACT+TGG - Chr3:7463670-7463689 MsG0380011889.01.T01:CDS 30.0%
AATTGACGATACCATAACTT+AGG - Chr3:7467776-7467795 MsG0380011889.01.T01:CDS 30.0%
ACAAAATTGAATTGTCACAC+TGG - Chr3:7464199-7464218 MsG0380011889.01.T01:intron 30.0%
ACCTGAAGTAACAATTTAAG+TGG + Chr3:7465006-7465025 None:intergenic 30.0%
ACGTGAAAAAAATTGGTTGA+AGG + Chr3:7469089-7469108 None:intergenic 30.0%
ACTTTACTGGTGTGAATAAT+TGG + Chr3:7469037-7469056 None:intergenic 30.0%
AGAAATACACCAGAATAACA+TGG + Chr3:7467293-7467312 None:intergenic 30.0%
AGAGCAATCTAATCTTATGA+TGG - Chr3:7469524-7469543 MsG0380011889.01.T01:CDS 30.0%
ATAAATGTCAGTCAACAAGA+AGG + Chr3:7464691-7464710 None:intergenic 30.0%
ATAGAAGCTTACTATAACGA+AGG + Chr3:7464667-7464686 None:intergenic 30.0%
ATTCACACCAGTAAAGTAAT+TGG - Chr3:7469040-7469059 MsG0380011889.01.T01:CDS 30.0%
ATTCTCTACACCAAGAAAAT+TGG + Chr3:7468892-7468911 None:intergenic 30.0%
ATTGTGTTTACATGTTGAGT+AGG + Chr3:7467709-7467728 None:intergenic 30.0%
CAAAACTTACATGACTAAGA+AGG + Chr3:7470315-7470334 None:intergenic 30.0%
CAAAATTGAATTGTCACACT+GGG - Chr3:7464200-7464219 MsG0380011889.01.T01:intron 30.0%
CAAGAAAAAACAACGAAGTT+CGG + Chr3:7470151-7470170 None:intergenic 30.0%
CAAGAAGTGAGATATCTATA+TGG + Chr3:7463704-7463723 None:intergenic 30.0%
CATATAATGTCCTTAATCTG+AGG + Chr3:7467511-7467530 None:intergenic 30.0%
CATATAGATATCTCACTTCT+TGG - Chr3:7463702-7463721 MsG0380011889.01.T01:CDS 30.0%
CATCGAATGAAAATTGAGTA+TGG - Chr3:7466271-7466290 MsG0380011889.01.T01:intron 30.0%
CCAAATCAGTTTATGCAATA+CGG - Chr3:7463281-7463300 MsG0380011889.01.T01:intron 30.0%
CGTAATCTTGTAAAACTTCT+TGG - Chr3:7465372-7465391 MsG0380011889.01.T01:intron 30.0%
CTACATATATCTAACTGACA+AGG + Chr3:7464502-7464521 None:intergenic 30.0%
CTCCAATTCATCAAGAATAA+CGG - Chr3:7463526-7463545 MsG0380011889.01.T01:CDS 30.0%
CTTTGGATCTCAATTTCAAT+TGG + Chr3:7468473-7468492 None:intergenic 30.0%
GAAATACACCAGAATAACAT+GGG + Chr3:7467292-7467311 None:intergenic 30.0%
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GATACAAATAAGTTAGGAGA+AGG - Chr3:7465134-7465153 MsG0380011889.01.T01:intron 30.0%
GCAAGATAGAATTACAAACA+TGG - Chr3:7466609-7466628 MsG0380011889.01.T01:intron 30.0%
GCTAAAACAAATAGAGTGAT+GGG - Chr3:7465775-7465794 MsG0380011889.01.T01:intron 30.0%
GGAGTTATTGCATTCATAAT+AGG - Chr3:7464770-7464789 MsG0380011889.01.T01:intron 30.0%
GGCTCATAATTCTCATTAAA+AGG - Chr3:7468853-7468872 MsG0380011889.01.T01:intron 30.0%
GGTTGGATTTATATGTAACT+TGG - Chr3:7467052-7467071 MsG0380011889.01.T01:intron 30.0%
GTTGTACTTGAGATAATTAG+CGG - Chr3:7465994-7466013 MsG0380011889.01.T01:intron 30.0%
GTTGTACTTGAGATAATTAG+TGG - Chr3:7465994-7466013 MsG0380011889.01.T01:intron 30.0%
TAACACTAATTTCAACGATG+TGG - Chr3:7468517-7468536 MsG0380011889.01.T01:CDS 30.0%
TACAACAGAAACCAGAAAAT+AGG - Chr3:7466442-7466461 MsG0380011889.01.T01:intron 30.0%
TACTTGAAAGGGTCTTTAAA+AGG + Chr3:7467321-7467340 None:intergenic 30.0%
TAGCATAGTGAATCAACTTA+TGG + Chr3:7467391-7467410 None:intergenic 30.0%
TAGTTTCAATTTCATAGCAC+AGG - Chr3:7468431-7468450 MsG0380011889.01.T01:CDS 30.0%
TCCATTACAAAAGTAGATGA+AGG - Chr3:7468494-7468513 MsG0380011889.01.T01:CDS 30.0%
TCTAACAAAAGCCTAAGTTA+TGG + Chr3:7467790-7467809 None:intergenic 30.0%
TGACATATTATACGATGATG+AGG - Chr3:7470628-7470647 MsG0380011889.01.T01:exon 30.0%
TGAGGATGAAAATAAGAAGA+TGG + Chr3:7467493-7467512 None:intergenic 30.0%
TGCAACAAAATAGAGATAGA+AGG + Chr3:7466133-7466152 None:intergenic 30.0%
TGCCAAAATTTCAACCAAAA+TGG - Chr3:7464140-7464159 MsG0380011889.01.T01:intron 30.0%
TGGATTTATATGTAACTTGG+TGG - Chr3:7467055-7467074 MsG0380011889.01.T01:intron 30.0%
TTCTCATGTAATTATGTGGT+TGG - Chr3:7467035-7467054 MsG0380011889.01.T01:intron 30.0%
TTGATAAATCCTTTCTGTGA+AGG + Chr3:7470493-7470512 None:intergenic 30.0%
TTGTACTTCAATCAATTTGC+AGG + Chr3:7466954-7466973 None:intergenic 30.0%
TTTGTAGAGGATCTAATGTT+TGG - Chr3:7466991-7467010 MsG0380011889.01.T01:intron 30.0%
! AATTCAATTTTGTTCTCCTG+AGG + Chr3:7464192-7464211 None:intergenic 30.0%
! AATTTCTTTTACCTTCCAGA+AGG + Chr3:7470414-7470433 None:intergenic 30.0%
! ACCACTTAAATTGTTACTTC+AGG - Chr3:7465002-7465021 MsG0380011889.01.T01:intron 30.0%
! ACCTAATAATGATTCTAAGG+CGG - Chr3:7469164-7469183 MsG0380011889.01.T01:intron 30.0%
! AGAAGAAAGTATACACCATT+AGG + Chr3:7463211-7463230 None:intergenic 30.0%
! ATCTGTGGTTTTTATGCTAA+AGG - Chr3:7466476-7466495 MsG0380011889.01.T01:intron 30.0%
! CAAAAGTTATTCCCTTTTTC+TGG - Chr3:7469485-7469504 MsG0380011889.01.T01:CDS 30.0%
! CGTTTTGTGTTTACTTTGTT+TGG + Chr3:7467199-7467218 None:intergenic 30.0%
! GTGATTTCTTTTATCCACTA+AGG - Chr3:7469616-7469635 MsG0380011889.01.T01:CDS 30.0%
! GTGGTTGTATAATTTGAGAT+CGG + Chr3:7469015-7469034 None:intergenic 30.0%
! TAAGAGGCTTTGTAATACAT+CGG - Chr3:7465293-7465312 MsG0380011889.01.T01:intron 30.0%
! TAAGTGGTTGATGTTAACAA+AGG + Chr3:7464990-7465009 None:intergenic 30.0%
! TCTGTGGTTTTTATGCTAAA+GGG - Chr3:7466477-7466496 MsG0380011889.01.T01:intron 30.0%
! TTGGTAATATTTGGTCACAT+TGG - Chr3:7469982-7470001 MsG0380011889.01.T01:CDS 30.0%
!! ACCTTCATCTACTTTTGTAA+TGG + Chr3:7468498-7468517 None:intergenic 30.0%
!! ATCCACTTATTTTTCAGAAG+CGG - Chr3:7467814-7467833 MsG0380011889.01.T01:CDS 30.0%
!! ATTTTATGTCATTTCAGGCA+TGG - Chr3:7470567-7470586 MsG0380011889.01.T01:CDS 30.0%
!! CTACTTTTGTAATGGAACTT+TGG + Chr3:7468490-7468509 None:intergenic 30.0%
!! CTTTACCTACTTTTGTATGT+GGG + Chr3:7467672-7467691 None:intergenic 30.0%
!! TCATTGTCAAGCTTTAAAGT+GGG + Chr3:7467352-7467371 None:intergenic 30.0%
!! TCTTTACCTACTTTTGTATG+TGG + Chr3:7467673-7467692 None:intergenic 30.0%
!! TTCATTGTCAAGCTTTAAAG+TGG + Chr3:7467353-7467372 None:intergenic 30.0%
!!! ATACCCACTAGTTTTTATGT+GGG + Chr3:7467904-7467923 None:intergenic 30.0%
!!! CTTATCATAACTTTTTCACC+TGG + Chr3:7464848-7464867 None:intergenic 30.0%
!!! GCTTATTTTGTGATTTGTAG+AGG - Chr3:7466978-7466997 MsG0380011889.01.T01:intron 30.0%
!!! TGATATGTTTTTTCTTGCAG+TGG - Chr3:7465901-7465920 MsG0380011889.01.T01:intron 30.0%
AAAACCACAGATGACATGTT+AGG + Chr3:7466468-7466487 None:intergenic 35.0%
AAACCTAAGTCAAATGGGAT+CGG + Chr3:7469126-7469145 None:intergenic 35.0%
AAAGTAATCCAAGCTTCTGT+TGG + Chr3:7465445-7465464 None:intergenic 35.0%
AAATTATTGACGGGATTGCT+CGG - Chr3:7465608-7465627 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
AAGCCAAAATCTGCTATCTT+TGG + Chr3:7465724-7465743 None:intergenic 35.0%
AAGCGCTTGGAAATTATTGA+CGG - Chr3:7465598-7465617 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
AAGTAAACACAAAACGGACA+AGG - Chr3:7467203-7467222 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
AAGTAATCCAAGCTTCTGTT+GGG + Chr3:7465444-7465463 None:intergenic 35.0%
AATAGTGTGTGACAAGATAG+AGG + Chr3:7470351-7470370 None:intergenic 35.0%
ACAAATAAGTTAGGAGAAGG+TGG - Chr3:7465137-7465156 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
ACAATGTCTTACATTCCTCA+AGG + Chr3:7464297-7464316 None:intergenic 35.0%
ACATGAACAAAAATGGTGGT+GGG + Chr3:7468149-7468168 None:intergenic 35.0%
ACGACAACTATATTTAGAGG+AGG - Chr3:7463809-7463828 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
ACTCCCACATAAAAACTAGT+GGG - Chr3:7467898-7467917 MsG0380011889.01.T01:CDS 35.0%
ACTGAGAGCAATAATTTGGT+TGG + Chr3:7465490-7465509 None:intergenic 35.0%
AGAGATGCTACAAATAGCAT+AGG - Chr3:7466546-7466565 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
AGAGTTGTGCTAAATCCATA+TGG - Chr3:7463962-7463981 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
AGATAAGATGCCAATCCTAA+TGG - Chr3:7463193-7463212 MsG0380011889.01.T01:CDS 35.0%
AGCCAAAATCTGCTATCTTT+GGG + Chr3:7465723-7465742 None:intergenic 35.0%
AGTGACATGAACAAAAATGG+TGG + Chr3:7468153-7468172 None:intergenic 35.0%
AGTGTTCTGTTTAGAGAAAG+TGG + Chr3:7463246-7463265 None:intergenic 35.0%
ATATATGCCTCCAGAATATG+CGG - Chr3:7465924-7465943 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
ATCAGTTATTGTGCAGTTGT+TGG - Chr3:7463556-7463575 MsG0380011889.01.T01:CDS 35.0%
ATTAGTGGTAGAAAGAATCG+CGG - Chr3:7466009-7466028 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
CAAAACTTACATGACCAAGA+AGG + Chr3:7466062-7466081 None:intergenic 35.0%
CAAATTTCAGCACATTTGAC+CGG + Chr3:7466643-7466662 None:intergenic 35.0%
CAATTCATCAAGAATAACGG+CGG - Chr3:7463529-7463548 MsG0380011889.01.T01:CDS 35.0%
CACAAAAAAGAGAAGGAAGA+TGG - Chr3:7465053-7465072 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
CACAAAGACATCATATGATG+TGG + Chr3:7466761-7466780 None:intergenic 35.0%
CACGAAGTAAATTACTCGAT+TGG - Chr3:7465572-7465591 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
CCGTATTGCATAAACTGATT+TGG + Chr3:7463284-7463303 None:intergenic 35.0%
CGACAACTATATTTAGAGGA+GGG - Chr3:7463810-7463829 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
CTAACTCATATCACGACAAT+TGG - Chr3:7470445-7470464 MsG0380011889.01.T01:CDS 35.0%
CTGAAAAGTAACTTGGTTAC+TGG - Chr3:7463677-7463696 MsG0380011889.01.T01:CDS 35.0%
CTTTCCAATATGTGAATGCT+TGG - Chr3:7464108-7464127 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
CTTTCTATCCAACTAGCATA+CGG - Chr3:7467459-7467478 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
GAAACATTACTAGGGTGTAA+TGG - Chr3:7465248-7465267 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
GAACTTCACAACGTCTTAAA+TGG - Chr3:7463984-7464003 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
GACAAGGCAAAAGATGTAAT+AGG + Chr3:7464486-7464505 None:intergenic 35.0%
GAGAAGGAACAAATTGATGA+TGG - Chr3:7468570-7468589 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
GGAACGACAACTATATTTAG+AGG - Chr3:7463806-7463825 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
GGCTAAAACAAATAGAGTGA+TGG - Chr3:7465774-7465793 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
GTAAAATACTCAGCTGTTCT+GGG + Chr3:7466702-7466721 None:intergenic 35.0%
GTATTAGTCACATCAGCATA+TGG - Chr3:7464806-7464825 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
GTGAGAAGAAACATTCTTGA+AGG + Chr3:7468993-7469012 None:intergenic 35.0%
GTGTTCTGTTTAGAGAAAGT+GGG + Chr3:7463245-7463264 None:intergenic 35.0%
GTTGCAATAAATCTTCTGGA+AGG - Chr3:7466147-7466166 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
TAAGTGAAGATTCCAACAAG+TGG - Chr3:7466796-7466815 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
TACTTGAGATAATTAGCGGT+AGG - Chr3:7470251-7470270 MsG0380011889.01.T01:CDS 35.0%
TCAACCAAAATGGAAGTCAT+CGG - Chr3:7464150-7464169 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
TCAGCATATGGAGAGAAAAT+TGG - Chr3:7464818-7464837 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
TCCGCCTTAGAATCATTATT+AGG + Chr3:7469168-7469187 None:intergenic 35.0%
TCTATCTTGTCACACACTAT+TGG - Chr3:7470350-7470369 MsG0380011889.01.T01:CDS 35.0%
TGATACGATTTGCAGTATAC+TGG + Chr3:7467430-7467449 None:intergenic 35.0%
TGCTTCAATCTCATTGTTAG+AGG - Chr3:7466587-7466606 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
TGTACCATATGCCAAAGTAT+TGG + Chr3:7463373-7463392 None:intergenic 35.0%
TGTTACCCACATACAAAAGT+AGG - Chr3:7467664-7467683 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
TGTTTGTATCTTTCCCAACA+AGG + Chr3:7463592-7463611 None:intergenic 35.0%
TTACATGACCAAGAAGGTTT+AGG + Chr3:7466056-7466075 None:intergenic 35.0%
TTACTGGTGTGAATAATTGG+TGG + Chr3:7469034-7469053 None:intergenic 35.0%
TTCAAACGGACACAAATGTT+TGG + Chr3:7469910-7469929 None:intergenic 35.0%
TTCACAACGTCTTAAATGGT+CGG - Chr3:7463988-7464007 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
TTGTTGGAATCTTCACTTAC+TGG + Chr3:7466795-7466814 None:intergenic 35.0%
TTTGTATGTGGGTAACATCT+TGG + Chr3:7467661-7467680 None:intergenic 35.0%
! AAGAGGCTTTGTAATACATC+GGG - Chr3:7465294-7465313 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
! ATCCCAAAGATAGCAGATTT+TGG - Chr3:7465718-7465737 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
! ATCTTTTCACTGGATCTACT+TGG - Chr3:7463846-7463865 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
! ATTTGTTGCATTAGTGATGG+TGG + Chr3:7465105-7465124 None:intergenic 35.0%
! CAAATAAAAAGGTGCACACT+TGG - Chr3:7469694-7469713 MsG0380011889.01.T01:CDS 35.0%
! CGTTCTTTGAGAAGATGATA+TGG + Chr3:7467734-7467753 None:intergenic 35.0%
! TACCGCTTCTGAAAAATAAG+TGG + Chr3:7467819-7467838 None:intergenic 35.0%
! TCTTCTTATTTCACCGAGTA+AGG - Chr3:7465207-7465226 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
! TTCCCTTTTTCTGGACAAAT+CGG - Chr3:7469494-7469513 MsG0380011889.01.T01:CDS 35.0%
! TTCCGATTTGTCCAGAAAAA+GGG + Chr3:7469499-7469518 None:intergenic 35.0%
! TTGAAGGTTGATTACATTGC+TGG + Chr3:7468977-7468996 None:intergenic 35.0%
! TTTCCGATTTGTCCAGAAAA+AGG + Chr3:7469500-7469519 None:intergenic 35.0%
! TTTTGTCGCAATAAACCTTC+TGG - Chr3:7470396-7470415 MsG0380011889.01.T01:CDS 35.0%
!! AAGGAACAAATTGATGATGG+TGG - Chr3:7468573-7468592 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
!! ACGTACAGGAGTATTTCTAT+TGG + Chr3:7463429-7463448 None:intergenic 35.0%
!! AGGAACAAATTGATGATGGT+GGG - Chr3:7468574-7468593 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
!! ATGATTCTAAGGCGGAAAAA+AGG - Chr3:7469172-7469191 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
!! CATAGCTTTGAAAAACCCTT+TGG + Chr3:7467081-7467100 None:intergenic 35.0%
!! GAAGCTGGATTTTTCAACTT+TGG - Chr3:7463335-7463354 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
!! GGAAGTCTTGTTATTCTTGA+TGG - Chr3:7463482-7463501 MsG0380011889.01.T01:intron 35.0%
!! GGATTAGCCAGATCATTTAT+GGG - Chr3:7469757-7469776 MsG0380011889.01.T01:CDS 35.0%
!! GTGATTTGTTGCATTAGTGA+TGG + Chr3:7465108-7465127 None:intergenic 35.0%
!! TGGATTAGCCAGATCATTTA+TGG - Chr3:7469756-7469775 MsG0380011889.01.T01:CDS 35.0%
!! TGTTTGGCTTGACTATTACT+TGG + Chr3:7467183-7467202 None:intergenic 35.0%
!! TTACTTTTCAGCTTCATTCC+AGG + Chr3:7463668-7463687 None:intergenic 35.0%
!!! CATACCCACTAGTTTTTATG+TGG + Chr3:7467905-7467924 None:intergenic 35.0%
!!! CTTTATTTTGAAGGTCTGTG+TGG + Chr3:7466230-7466249 None:intergenic 35.0%
!!! TATTTGTTTTAGCCTCAGCT+TGG + Chr3:7465768-7465787 None:intergenic 35.0%
!!! TGGGAAAGTTTTGATTATCC+TGG - Chr3:7463629-7463648 MsG0380011889.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTCGGATCTTGTTTTGTTGA+TGG + Chr3:7468184-7468203 None:intergenic 35.0%
AACGCCAATACTTTGGCATA+TGG - Chr3:7463366-7463385 MsG0380011889.01.T01:intron 40.0%
AATTATTGACGGGATTGCTC+GGG - Chr3:7465609-7465628 MsG0380011889.01.T01:intron 40.0%
AATTCTGATAGCAGAGATGG+TGG - Chr3:7464349-7464368 MsG0380011889.01.T01:intron 40.0%
ACAAGGCATAATCATCACAC+TGG + Chr3:7464057-7464076 None:intergenic 40.0%
AGAAGGTTTAGGTGATGTAG+AGG + Chr3:7466045-7466064 None:intergenic 40.0%
AGACGTTGTGAAGTTCCATA+TGG + Chr3:7463980-7463999 None:intergenic 40.0%
AGCGCTTGGAAATTATTGAC+GGG - Chr3:7465599-7465618 MsG0380011889.01.T01:intron 40.0%
AGGTTCTTAGAAATCGTGGT+TGG + Chr3:7466934-7466953 None:intergenic 40.0%
ATCACCAAGGACTATTGTGT+GGG - Chr3:7463400-7463419 MsG0380011889.01.T01:intron 40.0%
ATGAGAAAACATCCTGACGT+AGG - Chr3:7464409-7464428 MsG0380011889.01.T01:intron 40.0%
ATGTCAACTATGAACTCCAG+TGG + Chr3:7466363-7466382 None:intergenic 40.0%
ATTCTGATAGCAGAGATGGT+GGG - Chr3:7464350-7464369 MsG0380011889.01.T01:intron 40.0%
ATTGTGCAGTTGTTGGATTC+AGG - Chr3:7463563-7463582 MsG0380011889.01.T01:CDS 40.0%
CAAAATGGAAGTCATCGGAT+TGG - Chr3:7464155-7464174 MsG0380011889.01.T01:intron 40.0%
CACTCCCACATAAAAACTAG+TGG - Chr3:7467897-7467916 MsG0380011889.01.T01:CDS 40.0%
CATGTTCTTAGACATAGCAC+AGG + Chr3:7464627-7464646 None:intergenic 40.0%
CCAATATGTGAATGCTTGGA+AGG - Chr3:7464112-7464131 MsG0380011889.01.T01:intron 40.0%
CCTCAACTCCAAATTGCAAA+GGG - Chr3:7463785-7463804 MsG0380011889.01.T01:intron 40.0%
CCTTCCAAGCATTCACATAT+TGG + Chr3:7464115-7464134 None:intergenic 40.0%
CGCCGTTATTCTTGATGAAT+TGG + Chr3:7463531-7463550 None:intergenic 40.0%
CGGTCAAATGTGCTGAAATT+TGG - Chr3:7466641-7466660 MsG0380011889.01.T01:intron 40.0%
CTAACTCAACCCCACAAAAT+CGG + Chr3:7466909-7466928 None:intergenic 40.0%
CTACATCACCTAAACCTTCT+TGG - Chr3:7466045-7466064 MsG0380011889.01.T01:intron 40.0%
CTTTGTAATACATCGGGACA+AGG - Chr3:7465300-7465319 MsG0380011889.01.T01:intron 40.0%
GAAGGTTTAGGTGATGTAGA+GGG + Chr3:7466044-7466063 None:intergenic 40.0%
GACATGAACAAAAATGGTGG+TGG + Chr3:7468150-7468169 None:intergenic 40.0%
GCAAATTCTGATAGCAGAGA+TGG - Chr3:7464346-7464365 MsG0380011889.01.T01:intron 40.0%
GGCTTAGCCAGATCATTTAT+GGG - Chr3:7465739-7465758 MsG0380011889.01.T01:intron 40.0%
GGTAAAATACTCAGCTGTTC+TGG + Chr3:7466703-7466722 None:intergenic 40.0%
GGTACAAGAACATATCACCA+AGG - Chr3:7463387-7463406 MsG0380011889.01.T01:intron 40.0%
GTCGGATCAGACACAAAATT+GGG - Chr3:7464006-7464025 MsG0380011889.01.T01:intron 40.0%
GTCTTCATCCCATGTTATTC+TGG - Chr3:7467281-7467300 MsG0380011889.01.T01:intron 40.0%
GTGAATGTGAATTGCAAGTG+TGG - Chr3:7468539-7468558 MsG0380011889.01.T01:CDS 40.0%
TAAAATTGAAAGGGGGAAGC+CGG - Chr3:7469409-7469428 MsG0380011889.01.T01:CDS 40.0%
TAAATGTCTTGTCCTACGTC+AGG + Chr3:7464424-7464443 None:intergenic 40.0%
TAGTACTCAAGTAGAGTTGC+AGG - Chr3:7464898-7464917 MsG0380011889.01.T01:intron 40.0%
TATCACCAAGGACTATTGTG+TGG - Chr3:7463399-7463418 MsG0380011889.01.T01:intron 40.0%
TCAATAAATCCGTTGACACC+TGG + Chr3:7468797-7468816 None:intergenic 40.0%
TCAGGAAAAGGAAGAAGAAG+AGG - Chr3:7469592-7469611 MsG0380011889.01.T01:CDS 40.0%
TCCTCAACTCCAAATTGCAA+AGG - Chr3:7463784-7463803 MsG0380011889.01.T01:intron 40.0%
TCGATGAGGATAGATACTCA+CGG - Chr3:7463758-7463777 MsG0380011889.01.T01:intron 40.0%
TGAGGGCTATTTGAGAAATG+TGG + Chr3:7467241-7467260 None:intergenic 40.0%
TGGATTCAGGAAACCTTGTT+GGG - Chr3:7463576-7463595 MsG0380011889.01.T01:CDS 40.0%
TGGCTTAGCCAGATCATTTA+TGG - Chr3:7465738-7465757 MsG0380011889.01.T01:intron 40.0%
TGTCCGATATGAGACTCTTA+TGG + Chr3:7466857-7466876 None:intergenic 40.0%
TGTGATGATTATGCCTTGTG+CGG - Chr3:7464058-7464077 MsG0380011889.01.T01:intron 40.0%
TTAGCATGAGCACTACATTC+TGG + Chr3:7465523-7465542 None:intergenic 40.0%
TTGCAGGTTCTTAGAAATCG+TGG + Chr3:7466938-7466957 None:intergenic 40.0%
TTGGATTCAGGAAACCTTGT+TGG - Chr3:7463575-7463594 MsG0380011889.01.T01:CDS 40.0%
TTGGTCTCCCATAAATGATC+TGG + Chr3:7465749-7465768 None:intergenic 40.0%
TTGGTGGGATATGTAGATGA+GGG + Chr3:7467258-7467277 None:intergenic 40.0%
TTGTCGTTCCCTTTGCAATT+TGG + Chr3:7463796-7463815 None:intergenic 40.0%
! AAGTTAGGAGAAGGTGGTTT+TGG - Chr3:7465143-7465162 MsG0380011889.01.T01:intron 40.0%
! ACAGCACTCAGAACTTTTTG+TGG - Chr3:7463609-7463628 MsG0380011889.01.T01:CDS 40.0%
! ATATGTAACTTGGTGGCCAA+AGG - Chr3:7467062-7467081 MsG0380011889.01.T01:intron 40.0%
! ATTCTGGAGGCATATATCCA+CGG + Chr3:7465921-7465940 None:intergenic 40.0%
! ATTGCTGTTGAGTTACGTAC+AGG + Chr3:7463443-7463462 None:intergenic 40.0%
! CAATCCGATGACTTCCATTT+TGG + Chr3:7464157-7464176 None:intergenic 40.0%
! CAGCACTCAGAACTTTTTGT+GGG - Chr3:7463610-7463629 MsG0380011889.01.T01:CDS 40.0%
! GACATGTTAGGCCTATTTTC+TGG + Chr3:7466456-7466475 None:intergenic 40.0%
! GGAGACTATGGATTGAAGAA+AGG - Chr3:7470588-7470607 MsG0380011889.01.T01:CDS 40.0%
! GGCTTTATCTACAACTCAAG+AGG + Chr3:7467138-7467157 None:intergenic 40.0%
! GTTATTCTTGATGGCTCCAA+AGG - Chr3:7463491-7463510 MsG0380011889.01.T01:CDS 40.0%
! TATGTAACTTGGTGGCCAAA+GGG - Chr3:7467063-7467082 MsG0380011889.01.T01:intron 40.0%
! TCGGAAGCACAAAAAAGAGA+AGG - Chr3:7465046-7465065 MsG0380011889.01.T01:intron 40.0%
! TGGAACGGATATCTTTTCAC+TGG - Chr3:7463836-7463855 MsG0380011889.01.T01:intron 40.0%
! TTTTCAGCTTCATTCCAGGT+AGG + Chr3:7463664-7463683 None:intergenic 40.0%
! TTTTCCTGAACTCACACTCA+CGG + Chr3:7469581-7469600 None:intergenic 40.0%
!! ACAAATTGATGATGGTGGGT+TGG - Chr3:7468578-7468597 MsG0380011889.01.T01:intron 40.0%
!! GGGTGTTGAGATACTTGAAA+GGG + Chr3:7467332-7467351 None:intergenic 40.0%
!! TCCTTTCAAGCCGATTTTGT+GGG - Chr3:7466896-7466915 MsG0380011889.01.T01:intron 40.0%
!! TGGGTGTTGAGATACTTGAA+AGG + Chr3:7467333-7467352 None:intergenic 40.0%
!!! TGGTTTTGGACCAGTTTACA+AGG - Chr3:7465157-7465176 MsG0380011889.01.T01:intron 40.0%
!!! TTCGTTGTTTTTTCTTGCCG+TGG - Chr3:7470154-7470173 MsG0380011889.01.T01:CDS 40.0%
AACCCGGGTTTACTTGGTTT+GGG + Chr3:7466516-7466535 None:intergenic 45.0%
AAGCTACTCCGTATGCTAGT+TGG + Chr3:7467470-7467489 None:intergenic 45.0%
AAGTGTGGAACACACAGAGA+AGG - Chr3:7468554-7468573 MsG0380011889.01.T01:CDS 45.0%
AATGGCGTTGTTGGAGAAGA+TGG + Chr3:7468115-7468134 None:intergenic 45.0%
AGAGAAACTTGAAGCGTGCT+TGG - Chr3:7464738-7464757 MsG0380011889.01.T01:intron 45.0%
AGAGAAGGAAGATGGTGACT+TGG - Chr3:7465061-7465080 MsG0380011889.01.T01:intron 45.0%
ATGCTGAAACTCACTGATCG+AGG - Chr3:7463461-7463480 MsG0380011889.01.T01:intron 45.0%
ATGTCAGCTATGAACTCCAG+TGG + Chr3:7470614-7470633 None:intergenic 45.0%
ATTATTGACGGGATTGCTCG+GGG - Chr3:7465610-7465629 MsG0380011889.01.T01:intron 45.0%
ATTCATGCCCAACAGAAGCT+TGG - Chr3:7465434-7465453 MsG0380011889.01.T01:intron 45.0%
ATTTATGGGAGACCAAGCTG+AGG - Chr3:7465753-7465772 MsG0380011889.01.T01:intron 45.0%
CATTTCAGGCATGGAGACTA+TGG - Chr3:7470576-7470595 MsG0380011889.01.T01:CDS 45.0%
CCGATATGAGACTCTTATGG+CGG + Chr3:7466854-7466873 None:intergenic 45.0%
CCGCCATAAGAGTCTCATAT+CGG - Chr3:7466851-7466870 MsG0380011889.01.T01:intron 45.0%
CTATATTTAGAGGAGGGTCG+TGG - Chr3:7463816-7463835 MsG0380011889.01.T01:intron 45.0%
GATCCACAACGCCAATACTT+TGG - Chr3:7463359-7463378 MsG0380011889.01.T01:intron 45.0%
GATCCATGCACTGCATATTC+TGG + Chr3:7465937-7465956 None:intergenic 45.0%
GCAGCTGGAATATATGAAGC+TGG - Chr3:7463320-7463339 MsG0380011889.01.T01:intron 45.0%
GCCTCTTAACAGCAATCTCT+TGG + Chr3:7465281-7465300 None:intergenic 45.0%
GGAGAGAAAATTGGTAAGCC+AGG - Chr3:7464827-7464846 MsG0380011889.01.T01:intron 45.0%
GGTCGGATCAGACACAAAAT+TGG - Chr3:7464005-7464024 MsG0380011889.01.T01:intron 45.0%
GTATGTGGGTAACATCTTGG+TGG + Chr3:7467658-7467677 None:intergenic 45.0%
GTCGCAATAAACCTTCTGGA+AGG - Chr3:7470400-7470419 MsG0380011889.01.T01:CDS 45.0%
GTGAGTGTGAGTTCAGGAAA+AGG - Chr3:7469580-7469599 MsG0380011889.01.T01:CDS 45.0%
TACCAAGATGTTGACGTGTC+TGG + Chr3:7464259-7464278 None:intergenic 45.0%
TACTAGGGTGTAATGGCAGA+TGG - Chr3:7465255-7465274 MsG0380011889.01.T01:intron 45.0%
TAGGCCTAACATGTCATCTG+TGG - Chr3:7466461-7466480 MsG0380011889.01.T01:intron 45.0%
TTCACGTCAAGACTCCTTAG+TGG + Chr3:7469633-7469652 None:intergenic 45.0%
TTGAATTGTCACACTGGGGA+TGG - Chr3:7464205-7464224 MsG0380011889.01.T01:intron 45.0%
! AAGGGGGATTAAAAGTGTGC+AGG - Chr3:7469285-7469304 MsG0380011889.01.T01:intron 45.0%
! AAGGTGCACACTTGGTAACT+TGG - Chr3:7469702-7469721 MsG0380011889.01.T01:CDS 45.0%
! ATGGATTGAAGAAAGGCCAC+TGG - Chr3:7466344-7466363 MsG0380011889.01.T01:intron 45.0%
! CATTTTAGGCATGGCGACTA+TGG - Chr3:7466325-7466344 MsG0380011889.01.T01:intron 45.0%
! CCCTTTGCAATTTGGAGTTG+AGG + Chr3:7463788-7463807 None:intergenic 45.0%
! CGATTTTGTGGGGTTGAGTT+AGG - Chr3:7466907-7466926 MsG0380011889.01.T01:intron 45.0%
! GATACTCTTGTTTCAGCAGC+TGG - Chr3:7463305-7463324 MsG0380011889.01.T01:intron 45.0%
! GCCAAGAGATTGCTGTTAAG+AGG - Chr3:7465277-7465296 MsG0380011889.01.T01:intron 45.0%
! GGCGACTATGGATTGAAGAA+AGG - Chr3:7466337-7466356 MsG0380011889.01.T01:intron 45.0%
! GTTGGTGGGATATGTAGATG+AGG + Chr3:7467259-7467278 None:intergenic 45.0%
! TAATCATCACACTGGTCTGC+AGG + Chr3:7464049-7464068 None:intergenic 45.0%
! TGTCCGATCCCATTTGACTT+AGG - Chr3:7469120-7469139 MsG0380011889.01.T01:intron 45.0%
!! ATGCCAAAGTATTGGCGTTG+TGG + Chr3:7463365-7463384 None:intergenic 45.0%
!! CAAAATCGGCTTGAAAGGAG+AGG + Chr3:7466895-7466914 None:intergenic 45.0%
!! CCTTTCAAGCCGATTTTGTG+GGG - Chr3:7466897-7466916 MsG0380011889.01.T01:intron 45.0%
!! CTCCTTTCAAGCCGATTTTG+TGG - Chr3:7466895-7466914 MsG0380011889.01.T01:intron 45.0%
!! GTTAGAGTTGATACCGCACA+AGG + Chr3:7464074-7464093 None:intergenic 45.0%
!! AAATTAAATTAATTAATTCA+AGG + Chr3:7469230-7469249 None:intergenic 5.0%
!! AATTAAATTAATTAATTCAA+GGG + Chr3:7469229-7469248 None:intergenic 5.0%
!! ATATATATATATATATATAG+AGG - Chr3:7467946-7467965 MsG0380011889.01.T01:intron 5.0%
!! ATTGATTAAAAAAAAATTAA+GGG - Chr3:7470019-7470038 MsG0380011889.01.T01:CDS 5.0%
!! TTATTATCAATTAAAATATT+CGG + Chr3:7468202-7468221 None:intergenic 5.0%
!!! TAATTTAATTTTTTTATTGA+TGG - Chr3:7469239-7469258 MsG0380011889.01.T01:intron 5.0%
!!! TAATTTTTTTTTAATCAATA+TGG + Chr3:7470018-7470037 None:intergenic 5.0%
!!! TATTGATTAAAAAAAAATTA+AGG - Chr3:7470018-7470037 MsG0380011889.01.T01:CDS 5.0%
AACATGGGATGAAGACGCGT+TGG + Chr3:7467277-7467296 None:intergenic 50.0%
AGTTAGGATCCGTTGACACC+AGG - Chr3:7468776-7468795 MsG0380011889.01.T01:CDS 50.0%
ATAGCCGTGAGTGTGAGTTC+AGG - Chr3:7469574-7469593 MsG0380011889.01.T01:CDS 50.0%
ATCTCTTCCTGCGTAGAACC+CGG + Chr3:7466532-7466551 None:intergenic 50.0%
CCACACAGACCTTCACAGAA+AGG - Chr3:7470481-7470500 MsG0380011889.01.T01:CDS 50.0%
CCATGCACTGCATATTCTGG+AGG + Chr3:7465934-7465953 None:intergenic 50.0%
CCTCCAGAATATGCAGTGCA+TGG - Chr3:7465931-7465950 MsG0380011889.01.T01:intron 50.0%
CCTGGTAACACTTTCCTACC+TGG - Chr3:7463647-7463666 MsG0380011889.01.T01:CDS 50.0%
CCTTTCTGTGAAGGTCTGTG+TGG + Chr3:7470484-7470503 None:intergenic 50.0%
CGACTCGCATCTTCAGAACT+CGG - Chr3:7464448-7464467 MsG0380011889.01.T01:intron 50.0%
CTCCCCAAACCAAGTAAACC+CGG - Chr3:7466510-7466529 MsG0380011889.01.T01:intron 50.0%
GAACCCGGGTTTACTTGGTT+TGG + Chr3:7466517-7466536 None:intergenic 50.0%
GACATGAGCAATGGCGTTGT+TGG + Chr3:7468124-7468143 None:intergenic 50.0%
GCAACCCACACAATAGTCCT+TGG + Chr3:7463407-7463426 None:intergenic 50.0%
GCGTTGTTGGAGAAGATGGA+GGG + Chr3:7468111-7468130 None:intergenic 50.0%
GGAGTTCCAGATGACACCTT+TGG + Chr3:7463510-7463529 None:intergenic 50.0%
GGCTTGAAAGGAGAGGATTC+AGG + Chr3:7466888-7466907 None:intergenic 50.0%
TACATCGGGACAAGGAGTTG+AGG - Chr3:7465308-7465327 MsG0380011889.01.T01:intron 50.0%
TCCCCAAACCAAGTAAACCC+GGG - Chr3:7466511-7466530 MsG0380011889.01.T01:intron 50.0%
TGAACTCACACTCACGGCTA+TGG + Chr3:7469575-7469594 None:intergenic 50.0%
TGACATGAGCTTGAGCCTTG+AGG - Chr3:7464279-7464298 MsG0380011889.01.T01:intron 50.0%
TGCCAGACACGTCAACATCT+TGG - Chr3:7464254-7464273 MsG0380011889.01.T01:intron 50.0%
TTATTGACGGGATTGCTCGG+GGG - Chr3:7465611-7465630 MsG0380011889.01.T01:intron 50.0%
TTTAGAGGAGGGTCGTGGAA+CGG - Chr3:7463821-7463840 MsG0380011889.01.T01:intron 50.0%
! ACCCGGGTTTACTTGGTTTG+GGG + Chr3:7466515-7466534 None:intergenic 50.0%
! ACTCGATTGGACAAAGCGCT+TGG - Chr3:7465585-7465604 MsG0380011889.01.T01:intron 50.0%
! TCCTCTGAAGATCCTGCTGA+CGG - Chr3:7463728-7463747 MsG0380011889.01.T01:intron 50.0%
! TGGTGGGTAGACATGAGCAA+TGG + Chr3:7468133-7468152 None:intergenic 50.0%
!! AAGTCATCGGATTGGTCTGG+TGG - Chr3:7464163-7464182 MsG0380011889.01.T01:intron 50.0%
!! AGTCATCGGATTGGTCTGGT+GGG - Chr3:7464164-7464183 MsG0380011889.01.T01:intron 50.0%
!! ATGGCTCCAAAGGTGTCATC+TGG - Chr3:7463501-7463520 MsG0380011889.01.T01:CDS 50.0%
!! CCAGGTAGGAAAGTGTTACC+AGG + Chr3:7463650-7463669 None:intergenic 50.0%
!! CCCCACAAAATCGGCTTGAA+AGG + Chr3:7466900-7466919 None:intergenic 50.0%
!! CTTGGTGGCTAGCTCTAAGA+AGG + Chr3:7467643-7467662 None:intergenic 50.0%
!! TGATGGTGGGTTGGAGAAGA+TGG - Chr3:7468587-7468606 MsG0380011889.01.T01:intron 50.0%
!! TGGAAGTCATCGGATTGGTC+TGG - Chr3:7464160-7464179 MsG0380011889.01.T01:intron 50.0%
AAGCGTGCTTGGACTGTTGC+AGG - Chr3:7464749-7464768 MsG0380011889.01.T01:intron 55.0%
AGTAAACCCGGGTTCTACGC+AGG - Chr3:7466522-7466541 MsG0380011889.01.T01:intron 55.0%
ATCGAAAACTCGCCGTCAGC+AGG + Chr3:7463743-7463762 None:intergenic 55.0%
ATGGGATGAAGACGCGTTGG+TGG + Chr3:7467274-7467293 None:intergenic 55.0%
CCGTTGACACCAGGTGTCAA+CGG - Chr3:7468785-7468804 MsG0380011889.01.T01:CDS 55.0%
CTCCAGAATATGCGGCGCAT+GGG - Chr3:7470185-7470204 MsG0380011889.01.T01:CDS 55.0%
GCGTAGAACCCGGGTTTACT+TGG + Chr3:7466522-7466541 None:intergenic 55.0%
GGCGTTGTTGGAGAAGATGG+AGG + Chr3:7468112-7468131 None:intergenic 55.0%
GGGGCTGCTATATCTGCATC+AGG - Chr3:7465630-7465649 MsG0380011889.01.T01:intron 55.0%
GTGGGAGTGGCTGCTTACTT+TGG - Chr3:7464368-7464387 MsG0380011889.01.T01:intron 55.0%
TCTCTTCCTGCGTAGAACCC+GGG + Chr3:7466531-7466550 None:intergenic 55.0%
! CCGTTGACACCTGGTGTCAA+CGG + Chr3:7468788-7468807 None:intergenic 55.0%
! CTGACGGCGAGTTTTCGATG+AGG - Chr3:7463744-7463763 MsG0380011889.01.T01:intron 55.0%
! TGGGATGAAGACGCGTTGGT+GGG + Chr3:7467273-7467292 None:intergenic 55.0%
!! GATAGCAGAGATGGTGGGAG+TGG - Chr3:7464355-7464374 MsG0380011889.01.T01:intron 55.0%
!! GGTGGGTTGGAGAAGATGGA+GGG - Chr3:7468591-7468610 MsG0380011889.01.T01:intron 55.0%
!! TGGTGGGTTGGAGAAGATGG+AGG - Chr3:7468590-7468609 MsG0380011889.01.T01:intron 55.0%
CCATGCGCCGCATATTCTGG+AGG + Chr3:7470187-7470206 None:intergenic 60.0%
CCTCCAGAATATGCGGCGCA+TGG - Chr3:7470184-7470203 MsG0380011889.01.T01:CDS 60.0%
GACCCATGCGCCGCATATTC+TGG + Chr3:7470190-7470209 None:intergenic 60.0%
GCCGTCAGCAGGATCTTCAG+AGG + Chr3:7463732-7463751 None:intergenic 60.0%
! ATTGGTCTGGTGGGTGCCTC+AGG - Chr3:7464173-7464192 MsG0380011889.01.T01:intron 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 7463180 7470661 7463180 ID=MsG0380011889.01;Name=MsG0380011889.01
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