AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380014900.01

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MsG0380014900.01.T01 AT1G11300 28.095 840 479 31 3 798 6 764 2.36e-74 258
MsG0380014900.01.T01 AT4G21390 27.541 846 493 33 12 794 13 801 7.97e-74 258
MsG0380014900.01.T01 AT4G11900 28.622 849 495 26 5 792 10 808 1.62e-73 257
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MsG0380014900.01.T01 AT4G21380 28.892 848 454 33 20 795 33 803 1.07e-72 254
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MsG0380014900.01.T01 AT4G11900 29.352 787 448 24 64 792 3 739 2.14e-70 247
MsG0380014900.01.T01 AT1G61390 26.824 850 480 29 5 794 24 791 3.77e-70 247
MsG0380014900.01.T01 AT4G21390 27.750 800 467 31 12 750 13 762 7.98e-70 245
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MsG0380014900.01.T01 AT1G11340 28.728 731 420 24 33 710 100 782 1.02e-68 243
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MsG0380014900.01.T01 AT1G11280 27.170 795 472 25 37 794 54 778 1.71e-68 242
MsG0380014900.01.T01 AT1G61360 28.464 801 471 30 35 794 34 773 2.09e-68 242
MsG0380014900.01.T01 AT1G61440 27.889 796 468 31 35 794 31 756 2.28e-68 242
MsG0380014900.01.T01 AT1G11330 26.499 834 482 28 22 795 34 796 2.85e-68 242
MsG0380014900.01.T01 AT4G32300 44.850 301 138 9 504 793 482 765 5.12e-68 241
MsG0380014900.01.T01 AT1G11330 26.435 836 482 28 22 795 34 798 5.83e-68 241
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MsG0380014900.01.T01 AT5G35370 31.707 164 105 5 27 188 42 200 5.06e-15 80.1
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MsG0380014900.01.T01 AT1G61490 26.771 833 492 31 5 794 6 763 1.54e-66 237
MsG0380014900.01.T01 AT1G61490 26.771 833 492 31 5 794 6 763 1.54e-66 237
MsG0380014900.01.T01 AT1G61490 26.771 833 492 31 5 794 6 763 1.54e-66 237
MsG0380014900.01.T01 AT1G11350 27.360 837 475 30 23 798 25 789 5.46e-66 236
MsG0380014900.01.T01 AT1G61430 27.020 792 479 27 35 794 15 739 1.56e-65 233
MsG0380014900.01.T01 AT1G61430 27.020 792 479 27 35 794 15 739 1.56e-65 233
MsG0380014900.01.T01 AT1G61430 27.020 792 479 27 35 794 15 739 1.56e-65 233
MsG0380014900.01.T01 AT1G61430 26.988 830 496 30 5 794 6 765 2.53e-65 233
MsG0380014900.01.T01 AT1G61490 27.086 827 471 33 5 794 6 737 1.16e-64 231
MsG0380014900.01.T01 AT1G61490 27.086 827 471 33 5 794 6 737 1.16e-64 231
MsG0380014900.01.T01 AT1G11330 26.631 751 428 25 22 710 34 723 2.46e-64 229
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MsG0380014900.01.T01 AT1G11280 26.847 812 465 30 37 794 44 780 5.64e-64 229
MsG0380014900.01.T01 AT1G61440 27.017 818 472 31 35 794 31 781 1.90e-63 228
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MsG0380014900.01.T01 AT1G61430 27.591 743 441 26 5 710 6 688 2.49e-63 226
MsG0380014900.01.T01 AT5G02800 43.000 300 146 8 505 792 61 347 2.29e-62 214
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MsG0380014900.01.T01 AT1G61500 25.939 825 512 29 3 794 6 764 6.79e-62 223
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MsG0380014900.01.T01 AT1G61500 26.187 779 480 26 46 794 33 746 1.19e-61 223
MsG0380014900.01.T01 AT1G61430 27.480 746 441 27 5 710 6 691 2.35e-61 221
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MsG0380014900.01.T01 AT3G26940 42.193 301 152 8 505 793 62 352 3.09e-61 213
MsG0380014900.01.T01 AT1G11410 27.262 818 478 29 33 792 42 800 3.23e-61 222
MsG0380014900.01.T01 AT1G61550 26.900 829 494 31 8 794 4 762 3.63e-61 221
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MsG0380014900.01.T01 AT1G61420 26.456 790 478 29 45 794 43 769 5.78e-61 221
MsG0380014900.01.T01 AT5G20050 38.284 303 169 4 504 793 92 389 1.14e-60 212
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MsG0380014900.01.T01 AT3G24790 42.193 301 155 7 501 792 49 339 3.28e-59 206
MsG0380014900.01.T01 AT1G60800 36.254 331 188 8 474 793 257 575 5.57e-59 212
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MsG0380014900.01.T01 AT3G25560 40.134 299 159 8 502 793 297 582 3.44e-58 210
MsG0380014900.01.T01 AT1G61400 24.939 826 518 26 5 794 22 781 3.83e-58 213
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MsG0380014900.01.T01 AT1G61360 28.209 748 440 28 87 794 2 692 8.17e-58 211
MsG0380014900.01.T01 AT1G61360 28.209 748 440 28 87 794 2 692 8.17e-58 211
MsG0380014900.01.T01 AT2G20300 38.667 300 170 5 503 799 335 623 1.68e-57 210
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MsG0380014900.01.T01 AT5G01950 38.689 305 161 7 500 794 524 812 2.64e-57 211
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MsG0380014900.01.T01 AT4G32710 42.140 299 154 7 505 793 377 666 4.70e-57 208
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MsG0380014900.01.T01 AT5G01950 38.689 305 161 7 500 794 609 897 9.36e-57 210
MsG0380014900.01.T01 AT5G01950 38.689 305 161 7 500 794 609 897 9.36e-57 210
MsG0380014900.01.T01 AT5G01950 38.689 305 161 7 500 794 609 897 9.36e-57 210
MsG0380014900.01.T01 AT3G58690 37.624 303 168 7 501 792 71 363 1.22e-56 199
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MsG0380014900.01.T01 AT1G56720 39.535 301 162 6 505 797 167 455 1.85e-56 202
MsG0380014900.01.T01 AT1G56720 39.535 301 162 6 505 797 167 455 1.85e-56 202
MsG0380014900.01.T01 AT1G56720 39.535 301 162 6 505 797 167 455 1.85e-56 202
MsG0380014900.01.T01 AT1G56720 39.535 301 162 6 505 797 167 455 1.85e-56 202
MsG0380014900.01.T01 AT5G54590 35.404 322 175 6 476 792 83 376 2.03e-56 200
MsG0380014900.01.T01 AT5G54590 35.404 322 175 6 476 792 83 376 2.03e-56 200
MsG0380014900.01.T01 AT5G54590 35.404 322 175 6 476 792 83 376 2.03e-56 200
MsG0380014900.01.T01 AT5G01020 39.073 302 160 8 505 793 57 347 2.03e-56 199
MsG0380014900.01.T01 AT2G13800 40.199 301 161 7 502 793 143 433 2.05e-56 201
MsG0380014900.01.T01 AT2G13800 40.199 301 161 7 502 793 143 433 2.05e-56 201
MsG0380014900.01.T01 AT3G17420 39.203 301 163 7 505 797 142 430 3.40e-56 200
MsG0380014900.01.T01 AT1G51830 33.953 430 237 11 381 789 249 652 4.17e-56 205
MsG0380014900.01.T01 AT1G51830 33.953 430 237 11 381 789 256 659 4.26e-56 205
MsG0380014900.01.T01 AT3G20530 39.735 302 156 8 505 793 70 358 4.42e-56 197
MsG0380014900.01.T01 AT3G01300 38.608 316 159 9 502 797 121 421 4.65e-56 201
MsG0380014900.01.T01 AT1G26150 40.550 291 159 6 505 789 418 700 4.74e-56 206
MsG0380014900.01.T01 AT1G23540 39.000 300 167 7 500 792 354 644 5.08e-56 205
MsG0380014900.01.T01 AT5G06740 36.913 298 173 6 503 792 316 606 8.46e-56 204
MsG0380014900.01.T01 AT3G19300 39.394 297 161 5 501 792 312 594 8.92e-56 204
MsG0380014900.01.T01 AT5G06740 36.913 298 173 6 503 792 328 618 1.07e-55 203
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MsG0380014900.01.T01 AT2G13800 40.199 301 161 7 502 793 260 550 1.49e-55 202
MsG0380014900.01.T01 AT2G07180 42.020 307 154 11 505 798 78 373 1.54e-55 198
MsG0380014900.01.T01 AT2G07180 42.020 307 154 11 505 798 78 373 1.54e-55 198
MsG0380014900.01.T01 AT1G11340 27.403 697 405 24 33 676 100 748 1.54e-55 204
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MsG0380014900.01.T01 AT1G68690 38.644 295 168 6 505 794 365 651 1.94e-55 203
MsG0380014900.01.T01 AT1G68690 38.644 295 168 6 505 794 365 651 1.94e-55 203
MsG0380014900.01.T01 AT1G75820 38.019 313 175 8 489 792 665 967 1.97e-55 207
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MsG0380014900.01.T01 AT5G45780 34.571 350 201 10 457 793 196 530 6.06e-55 199
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MsG0380014900.01.T01 AT4G11900 28.240 733 425 24 5 676 10 702 9.72e-55 201
MsG0380014900.01.T01 AT4G11900 28.240 733 425 24 5 676 10 702 1.02e-54 202
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MsG0380014900.01.T01 AT4G34440 39.731 297 160 8 505 793 300 585 1.06e-54 201
MsG0380014900.01.T01 AT4G11900 28.240 733 425 24 5 676 10 702 1.18e-54 201
MsG0380014900.01.T01 AT4G11900 28.240 733 425 24 5 676 10 702 1.18e-54 201
MsG0380014900.01.T01 AT3G05140 38.158 304 165 8 500 796 174 461 1.32e-54 197
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MsG0380014900.01.T01 AT1G09440 38.079 302 165 7 505 797 145 433 1.33e-54 196
MsG0380014900.01.T01 AT5G45780 34.571 350 201 10 457 793 239 573 1.37e-54 199
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MsG0380014900.01.T01 AT1G69790 37.126 334 172 11 486 799 54 369 3.00e-54 192
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MsG0380014900.01.T01 AT5G18500 38.762 307 156 9 505 797 154 442 6.42e-54 194
MsG0380014900.01.T01 AT5G18500 38.762 307 156 9 505 797 154 442 6.42e-54 194
MsG0380014900.01.T01 AT5G18500 38.762 307 156 9 505 797 154 442 6.42e-54 194
MsG0380014900.01.T01 AT5G18500 38.762 307 156 9 505 797 154 442 6.42e-54 194
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MsG0380014900.01.T01 AT5G18610 40.000 300 155 8 505 792 71 357 6.56e-54 195
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MsG0380014900.01.T01 AT1G55610 37.662 308 172 6 502 799 844 1141 6.65e-54 202
MsG0380014900.01.T01 AT4G23270 37.624 303 172 6 499 794 308 600 6.66e-54 198
MsG0380014900.01.T01 AT4G23270 37.624 303 172 6 499 794 308 600 6.66e-54 198
MsG0380014900.01.T01 AT4G39400 38.079 302 164 7 502 793 868 1156 6.82e-54 203
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MsG0380014900.01.T01 AT1G34210 39.203 301 164 7 502 793 290 580 1.20e-53 197
MsG0380014900.01.T01 AT1G56120 37.791 344 186 11 458 792 654 978 1.23e-53 201
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MsG0380014900.01.T01 AT1G17230 37.458 299 167 6 503 792 785 1072 1.44e-53 201
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MsG0380014900.01.T01 AT5G02290 34.743 331 176 11 486 793 38 351 1.62e-53 191
MsG0380014900.01.T01 AT1G71830 38.870 301 165 7 502 793 287 577 1.66e-53 196
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MsG0380014900.01.T01 AT5G65700 39.568 278 150 6 521 792 700 965 3.00e-53 200
MsG0380014900.01.T01 AT5G18910 36.913 298 166 8 502 793 177 458 3.33e-53 193
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MsG0380014900.01.T01 AT2G42960 37.874 301 167 6 505 797 171 459 3.70e-53 192
MsG0380014900.01.T01 AT2G42960 37.874 301 167 6 505 797 171 459 3.70e-53 192
MsG0380014900.01.T01 AT1G56130 36.364 341 195 9 458 792 638 962 3.75e-53 200
MsG0380014900.01.T01 AT4G13190 39.799 299 161 7 503 792 57 345 3.82e-53 189
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MsG0380014900.01.T01 AT2G28250 37.299 311 174 8 504 800 197 500 4.09e-53 194
MsG0380014900.01.T01 AT2G28250 37.299 311 174 8 504 800 197 500 4.09e-53 194
MsG0380014900.01.T01 AT2G28250 37.299 311 174 8 504 800 197 500 4.09e-53 194
MsG0380014900.01.T01 AT2G28250 37.299 311 174 8 504 800 197 500 4.09e-53 194
MsG0380014900.01.T01 AT1G56145 34.648 355 210 9 444 792 617 955 4.31e-53 200
MsG0380014900.01.T01 AT3G28690 36.943 314 165 8 499 793 57 356 4.78e-53 190
MsG0380014900.01.T01 AT4G01330 37.338 308 161 9 503 796 148 437 4.84e-53 191
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MsG0380014900.01.T01 AT2G18470 38.870 301 167 7 501 793 266 557 4.17e-52 192
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MsG0380014900.01.T01 AT1G06700 38.614 303 161 7 505 793 56 347 2.28e-51 184
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MsG0380014900.01.T01 AT2G30740 39.604 303 158 7 505 793 59 350 5.03e-51 183
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MsG0380014900.01.T01 AT1G55200 37.584 298 167 8 503 793 365 650 1.52e-50 189
MsG0380014900.01.T01 AT5G63930 34.254 362 207 10 454 797 735 1083 1.58e-50 192
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MsG0380014900.01.T01 AT2G18890 35.452 299 167 8 505 793 56 338 1.93e-50 182
MsG0380014900.01.T01 AT3G09010 41.270 252 133 6 499 742 28 272 1.97e-50 179
MsG0380014900.01.T01 AT4G02630 36.755 302 168 8 505 796 150 438 2.07e-50 185
MsG0380014900.01.T01 AT1G51880 37.752 347 186 12 455 792 527 852 2.08e-50 191
MsG0380014900.01.T01 AT4G21400 37.417 302 166 9 507 797 339 628 2.13e-50 188
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MsG0380014900.01.T01 AT1G07570 35.144 313 168 9 502 793 53 351 2.40e-50 182
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MsG0380014900.01.T01 AT1G29740 38.851 296 160 8 505 792 665 947 4.08e-50 191
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MsG0380014900.01.T01 AT1G66910 36.013 311 181 6 490 793 323 622 8.77e-50 186
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MsG0380014900.01.T01 AT3G59350 38.158 304 161 8 505 793 101 392 1.01e-49 181
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MsG0380014900.01.T01 AT1G48210 35.873 315 179 6 491 793 42 345 1.03e-49 179
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MsG0380014900.01.T01 AT1G48210 35.873 315 179 6 491 793 42 345 1.03e-49 179
MsG0380014900.01.T01 AT1G48210 35.873 315 179 6 491 793 42 345 1.03e-49 179
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MsG0380014900.01.T01 AT5G63710 36.213 301 172 7 502 793 275 564 2.38e-49 184
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MsG0380014900.01.T01 AT3G13690 36.913 298 169 8 503 793 397 682 3.24e-49 186
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MsG0380014900.01.T01 AT1G77280 35.314 303 176 7 503 796 390 681 2.09e-48 184
MsG0380014900.01.T01 AT5G38280 36.545 301 170 8 502 793 318 606 2.35e-48 182
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MsG0380014900.01.T01 AT3G09830 37.419 310 168 10 499 792 66 365 2.53e-48 177
MsG0380014900.01.T01 AT3G09830 37.419 310 168 10 499 792 66 365 2.53e-48 177
MsG0380014900.01.T01 AT3G53380 33.724 341 203 9 466 792 320 651 2.65e-48 183
MsG0380014900.01.T01 AT4G34500 35.294 306 168 9 505 796 133 422 2.73e-48 177
MsG0380014900.01.T01 AT2G47060 36.937 333 155 8 505 793 61 382 2.77e-48 176
MsG0380014900.01.T01 AT3G21630 37.162 296 169 7 504 794 309 592 2.82e-48 181
MsG0380014900.01.T01 AT2G23950 39.098 266 153 5 455 713 235 498 2.86e-48 179
MsG0380014900.01.T01 AT4G00970 31.063 367 231 9 442 795 264 621 3.12e-48 182
MsG0380014900.01.T01 AT4G28490 34.018 341 190 10 474 793 639 965 3.16e-48 185
MsG0380014900.01.T01 AT1G18390 38.235 306 160 10 500 792 327 616 3.23e-48 182
MsG0380014900.01.T01 AT1G74360 37.710 297 163 8 505 792 802 1085 3.60e-48 185
MsG0380014900.01.T01 AT4G21410 32.723 382 220 13 437 795 267 634 4.43e-48 182
MsG0380014900.01.T01 AT4G13190 43.750 240 120 6 503 733 57 290 4.67e-48 172
MsG0380014900.01.T01 AT5G62710 31.461 356 212 8 457 793 207 549 4.90e-48 180
MsG0380014900.01.T01 AT4G11490 35.117 299 177 7 504 795 308 596 5.26e-48 181
MsG0380014900.01.T01 AT4G21400 34.043 329 168 8 507 797 212 529 5.79e-48 179
MsG0380014900.01.T01 AT3G59740 36.039 308 174 8 501 797 317 612 6.50e-48 181
MsG0380014900.01.T01 AT1G70740 32.673 303 181 7 505 792 38 332 6.66e-48 176
MsG0380014900.01.T01 AT1G61420 25.912 548 341 15 266 794 116 617 7.10e-48 181
MsG0380014900.01.T01 AT4G32000 33.746 323 188 7 477 792 139 442 7.36e-48 177
MsG0380014900.01.T01 AT5G15730 32.692 312 178 8 486 792 89 373 7.42e-48 176
MsG0380014900.01.T01 AT4G28670 36.877 301 167 7 505 794 319 607 7.50e-48 180
MsG0380014900.01.T01 AT1G67720 37.241 290 163 6 510 793 601 877 9.34e-48 183
MsG0380014900.01.T01 AT1G78530 35.862 290 167 7 510 793 69 345 1.02e-47 173
MsG0380014900.01.T01 AT1G18390 38.235 306 160 10 500 792 321 610 1.08e-47 180
MsG0380014900.01.T01 AT5G02070 36.503 326 180 10 485 793 329 644 1.10e-47 180
MsG0380014900.01.T01 AT2G48010 34.605 367 199 11 455 796 211 561 1.30e-47 179
MsG0380014900.01.T01 AT1G51820 31.354 421 249 11 388 789 183 582 1.42e-47 179
MsG0380014900.01.T01 AT2G43230 38.127 299 160 7 509 793 103 390 1.45e-47 174
MsG0380014900.01.T01 AT5G49770 39.604 303 160 8 501 794 618 906 1.54e-47 182
MsG0380014900.01.T01 AT2G18470 43.154 241 121 6 501 733 266 498 1.58e-47 177
MsG0380014900.01.T01 AT5G62710 31.461 356 212 8 457 793 241 583 1.70e-47 179
MsG0380014900.01.T01 AT1G70520 38.511 309 159 11 505 797 313 606 1.72e-47 179
MsG0380014900.01.T01 AT5G15730 32.484 314 178 8 486 792 89 375 1.87e-47 175
MsG0380014900.01.T01 AT5G15730 32.484 314 178 8 486 792 89 375 1.87e-47 175
MsG0380014900.01.T01 AT2G19230 36.888 347 184 9 457 793 518 839 1.90e-47 182
MsG0380014900.01.T01 AT4G11460 35.548 301 177 8 499 792 253 543 1.92e-47 179
MsG0380014900.01.T01 AT4G35600 37.459 307 166 10 502 793 71 366 2.23e-47 174
MsG0380014900.01.T01 AT2G43230 38.127 299 160 7 509 793 137 424 2.33e-47 175
MsG0380014900.01.T01 AT2G28590 42.975 242 121 7 505 736 86 320 2.39e-47 171
MsG0380014900.01.T01 AT4G23130 35.974 303 177 7 499 794 322 614 2.45e-47 179
MsG0380014900.01.T01 AT4G35600 37.459 307 166 10 502 793 72 367 2.49e-47 174
MsG0380014900.01.T01 AT4G21400 34.043 329 168 8 507 797 313 630 2.53e-47 179
MsG0380014900.01.T01 AT5G38240 34.769 325 196 9 471 793 275 585 2.55e-47 179
MsG0380014900.01.T01 AT5G38240 34.769 325 196 9 471 793 229 539 2.61e-47 178
MsG0380014900.01.T01 AT4G23130 35.974 303 177 7 499 794 326 618 2.80e-47 179
MsG0380014900.01.T01 AT1G29720 36.610 295 169 7 505 793 661 943 3.15e-47 182
MsG0380014900.01.T01 AT1G26970 39.179 268 135 9 539 796 2 251 3.30e-47 170
MsG0380014900.01.T01 AT1G49100 37.627 295 166 6 503 792 569 850 3.46e-47 181
MsG0380014900.01.T01 AT4G23160 35.430 302 171 9 504 795 346 633 3.52e-47 179
MsG0380014900.01.T01 AT3G59750 37.333 300 168 9 501 792 287 574 3.59e-47 178
MsG0380014900.01.T01 AT5G57670 34.797 296 169 7 505 792 255 534 3.70e-47 177
MsG0380014900.01.T01 AT5G38240 34.769 325 196 9 471 793 293 603 4.02e-47 178
MsG0380014900.01.T01 AT4G23140 35.880 301 171 8 504 795 338 625 4.11e-47 179
MsG0380014900.01.T01 AT4G05200 32.213 357 218 9 451 794 275 620 4.12e-47 179
MsG0380014900.01.T01 AT4G11460 35.548 301 177 8 499 792 328 618 4.56e-47 179
MsG0380014900.01.T01 AT1G66920 35.216 301 172 9 502 793 294 580 5.31e-47 177
MsG0380014900.01.T01 AT2G19230 37.069 348 183 10 457 793 518 840 5.33e-47 181
MsG0380014900.01.T01 AT1G51870 33.423 371 209 10 440 789 443 796 5.34e-47 180
MsG0380014900.01.T01 AT4G23320 35.880 301 176 8 499 792 165 455 5.46e-47 175
MsG0380014900.01.T01 AT4G23320 35.880 301 176 8 499 792 165 455 5.46e-47 175
MsG0380014900.01.T01 AT5G47070 37.421 318 165 11 502 799 71 374 5.56e-47 173
MsG0380014900.01.T01 AT1G66920 35.216 301 172 9 502 793 286 572 5.85e-47 177
MsG0380014900.01.T01 AT4G05200 32.213 357 218 9 451 794 293 638 6.07e-47 179
MsG0380014900.01.T01 AT4G04540 38.225 293 158 7 504 789 311 587 6.08e-47 177

Find 150 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 193 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CAACCCAAGGTAGCGGATTT+TGG 0.123434 3:+62203767 MsG0380014900.01.T01:CDS
TGTCGTCAAATGCACTTAAT+TGG 0.136752 3:+62203621 MsG0380014900.01.T01:CDS
CACTATGTTTCTTTATAATA+TGG 0.178406 3:+62203234 MsG0380014900.01.T01:CDS
AAATTATGACATGGTTAAAT+TGG 0.196556 3:+62204096 MsG0380014900.01.T01:CDS
CAAGAGAAGTGGTCGATTTC+AGG 0.196662 3:+62202627 MsG0380014900.01.T01:CDS
GGAATATTTGTTGTCACTTT+TGG 0.205386 3:-62202322 None:intergenic
CTCAAGTTTCAAGTATTTAT+TGG 0.225624 3:+62202406 MsG0380014900.01.T01:CDS
ACTTTAAAGACAAGTGATTA+TGG 0.226191 3:+62202534 MsG0380014900.01.T01:CDS
TCCGGTTCTTGGATTGTTAA+TGG 0.231701 3:-62202706 None:intergenic
GAACTGCTTACATTGTTTAT+AGG 0.240185 3:-62202904 None:intergenic
CTTTGGTTTGCGTCTGGCTT+AGG 0.243054 3:+62203200 MsG0380014900.01.T01:CDS
ACACACTTTCTTCCGGTTCT+TGG 0.258949 3:-62202717 None:intergenic
CGTCATTAACCAAACGATAT+TGG 0.265072 3:-62202956 None:intergenic
AAGAATCATGTTCATGAGTT+TGG 0.268747 3:-62204201 None:intergenic
GGCAAATTGAAAATCCATTC+AGG 0.310479 3:-62203869 None:intergenic
CTTAACCACATGAATTTGAT+TGG 0.317733 3:+62203518 MsG0380014900.01.T01:CDS
GGTGGCAAAACTAGATGTTT+TGG 0.320579 3:+62202485 MsG0380014900.01.T01:CDS
TTTGGTTTGCGTCTGGCTTA+GGG 0.323782 3:+62203201 MsG0380014900.01.T01:CDS
GTCGTCAAATGCACTTAATT+GGG 0.325188 3:+62203622 MsG0380014900.01.T01:CDS
CAAGTCCTTGGCTCGTTAGT+TGG 0.326625 3:+62202430 MsG0380014900.01.T01:CDS
TGCATTTGACGACAAATTAT+CGG 0.334652 3:-62203612 None:intergenic
ATCCGAGATGAAATCTTTGA+TGG 0.347564 3:+62204045 MsG0380014900.01.T01:CDS
TCAACAACTTCACTCATGTT+AGG 0.349850 3:-62204172 None:intergenic
CCTAAGTCACAATTGCGAAA+TGG 0.353601 3:+62202999 MsG0380014900.01.T01:CDS
CTCAGAGAGCACAACAAAAT+AGG 0.353769 3:+62202213 MsG0380014900.01.T01:CDS
TACGTTGAAGACAAAGAAAA+TGG 0.356170 3:+62203161 MsG0380014900.01.T01:CDS
CGCTACCTTGGGTTGGTAAT+CGG 0.357569 3:-62203759 None:intergenic
AAAGACTCATAATGAGAGTT+TGG 0.357881 3:+62203991 MsG0380014900.01.T01:CDS
CTTTAAAGACAAGTGATTAT+GGG 0.361464 3:+62202535 MsG0380014900.01.T01:CDS
CACCCTGCTACTGTTGTTTG+AGG 0.366945 3:-62202466 None:intergenic
CTTGCTGAAGTTAGCGTCAT+TGG 0.367417 3:+62203491 MsG0380014900.01.T01:CDS
ACCCGTCATTGCACTCTTCC+CGG 0.368192 3:-62203948 None:intergenic
GTCAGTTAATACAAGGTTGC+CGG 0.370448 3:-62202106 None:intergenic
TCACCAATGCTACCATTGTT+TGG 0.376796 3:+62202025 MsG0380014900.01.T01:CDS
ATGCTTATTCCTTTGCCATA+TGG 0.377262 3:+62201980 MsG0380014900.01.T01:CDS
CCATTTCGCAATTGTGACTT+AGG 0.380399 3:-62202999 None:intergenic
GAGAGGAACAAGAGGTTATA+TGG 0.383099 3:+62203844 MsG0380014900.01.T01:CDS
CTAAGTCACAATTGCGAAAT+GGG 0.387103 3:+62203000 MsG0380014900.01.T01:CDS
TAGATTGATCCCTGAAAATT+CGG 0.391595 3:-62203032 None:intergenic
CATAGCCTTCCAATATCGTT+TGG 0.397666 3:+62202947 MsG0380014900.01.T01:CDS
TACGTTCTTGCAGGAACAAC+AGG 0.400607 3:+62203305 MsG0380014900.01.T01:CDS
AATCAAGGCTACGTTCTTGC+AGG 0.402593 3:+62203296 MsG0380014900.01.T01:CDS
CAAAATCAACTCAAGTGGTT+TGG 0.404755 3:-62202169 None:intergenic
CCCGCGGTGAATGTGCCTTT+TGG 0.410191 3:-62201937 None:intergenic
GATCAGTGAAGATTATCCTT+TGG 0.413900 3:+62203183 MsG0380014900.01.T01:CDS
GTGCTGCTAGAGATGATTAC+CGG 0.414239 3:+62203929 MsG0380014900.01.T01:CDS
ATATTTACATGAAGAATGTT+TGG 0.415569 3:+62203688 MsG0380014900.01.T01:CDS
TTGTTAATGGAATAGCTATT+CGG 0.416773 3:-62202693 None:intergenic
ATTATCCTTTGGTTTGCGTC+TGG 0.416874 3:+62203194 MsG0380014900.01.T01:CDS
AAGTCCTTGGCTCGTTAGTT+GGG 0.418105 3:+62202431 MsG0380014900.01.T01:CDS
TGAAACTTTGATCAGGAAGT+AGG 0.424135 3:-62202275 None:intergenic
AAGGTAGATGTTTATAGCTA+TGG 0.425528 3:+62203902 MsG0380014900.01.T01:CDS
AAGACACACACACTTTCTTC+CGG 0.425722 3:-62202724 None:intergenic
AGAAAGTGTGTGTGTCTTCC+TGG 0.429827 3:+62202729 MsG0380014900.01.T01:CDS
GTATTTATTGGCCAAGTCCT+TGG 0.431035 3:+62202418 MsG0380014900.01.T01:CDS
TCCATTAACAATCCAAGAAC+CGG 0.432093 3:+62202705 MsG0380014900.01.T01:CDS
TGTGTCTTCCTGGTTATAAC+AGG 0.433289 3:+62202739 MsG0380014900.01.T01:CDS
AAACTTTCCCTTCTCAAAAC+CGG 0.442317 3:+62202087 MsG0380014900.01.T01:CDS
TCATAATTTGATCCGAATGT+AGG 0.458094 3:-62204082 None:intergenic
ACATCTACCTTGGAAGTGAT+TGG 0.459193 3:-62203890 None:intergenic
TTCATCATCATTCTCTCTCT+CGG 0.466575 3:+62201882 MsG0380014900.01.T01:CDS
GATCCTCAAACAACAGTAGC+AGG 0.469424 3:+62202463 MsG0380014900.01.T01:CDS
GGCTGGAGGAACTGTGTACA+AGG 0.470477 3:+62203397 MsG0380014900.01.T01:CDS
CTCTTGCGTCTTCTCTATGA+TGG 0.471036 3:+62202381 MsG0380014900.01.T01:CDS
CATGGGTGAGAGAGAAAAGA+AGG 0.475199 3:+62204017 MsG0380014900.01.T01:CDS
ACAGGATCAATAATCAAGAT+TGG 0.476375 3:+62202757 MsG0380014900.01.T01:CDS
AATCGTGACCAACCAATTAA+CGG 0.476674 3:+62202054 MsG0380014900.01.T01:CDS
AATAAATACTTGAAACTTGA+GGG 0.477558 3:-62202404 None:intergenic
GTTTATAGGTGTAATTTGCT+TGG 0.482812 3:-62202890 None:intergenic
ATGAATGTTGAAAATGTAAG+AGG 0.484616 3:-62201864 None:intergenic
GAACATTACCATCAAAATCA+AGG 0.489679 3:-62202581 None:intergenic
TTGGTTTGTTCGAGAAATGA+TGG 0.491083 3:+62203116 MsG0380014900.01.T01:CDS
CAACCCAAAATCCGCTACCT+TGG 0.496438 3:-62203771 None:intergenic
AACCCAAAATCCGCTACCTT+GGG 0.496813 3:-62203770 None:intergenic
GACATTATAATGTCACCAAA+AGG 0.502368 3:+62201922 MsG0380014900.01.T01:CDS
TGCCTTGTGAAACTTTGATC+AGG 0.502998 3:-62202282 None:intergenic
CAATGCTACCATTGTTTGGA+TGG 0.503261 3:+62202029 MsG0380014900.01.T01:CDS
AATAATCAAGATTGGTCTCA+AGG 0.503808 3:+62202765 MsG0380014900.01.T01:CDS
CATAATTTGATCCGAATGTA+GGG 0.507854 3:-62204081 None:intergenic
AACTTTGTTAAAGATAATCA+AGG 0.508707 3:+62203281 MsG0380014900.01.T01:CDS
AAGAGAAGTGGTCGATTTCA+GGG 0.508977 3:+62202628 MsG0380014900.01.T01:CDS
AATCAAGGGTCAATCTTCGT+TGG 0.517001 3:-62202566 None:intergenic
TTTAGTCAAGAGATTGGAAA+GGG 0.519575 3:+62203374 MsG0380014900.01.T01:CDS
CATCCAAACAATGGTAGCAT+TGG 0.521960 3:-62202028 None:intergenic
GAGGTTATATGGCACCTGAA+TGG 0.526359 3:+62203855 MsG0380014900.01.T01:CDS
TTGCATGAAAGTTGGAAGCT+TGG 0.527092 3:-62202795 None:intergenic
CATGAATTTGATTGGAATGT+GGG 0.533104 3:+62203526 MsG0380014900.01.T01:CDS
CAACTAACGAGCCAAGGACT+TGG 0.533335 3:-62202429 None:intergenic
TACCGGGAAGAGTGCAATGA+CGG 0.537572 3:+62203946 MsG0380014900.01.T01:CDS
CAATTTGCCAATCACTTCCA+AGG 0.539670 3:+62203883 MsG0380014900.01.T01:CDS
CTGAAGTTAGCGTCATTGGA+AGG 0.545662 3:+62203495 MsG0380014900.01.T01:CDS
ATAGCTATAAACATCTACCT+TGG 0.547612 3:-62203900 None:intergenic
AGTGACAACAAATATTCCTC+AGG 0.548895 3:+62202327 MsG0380014900.01.T01:CDS
GAAACTTTGATCAGGAAGTA+GGG 0.549439 3:-62202274 None:intergenic
TCGTCAAATGCACTTAATTG+GGG 0.552186 3:+62203623 MsG0380014900.01.T01:CDS
CAAATAGTAGACCCTACATT+CGG 0.554336 3:+62204070 MsG0380014900.01.T01:CDS
GTGTGTTTGAGTGAACCATA+TGG 0.558338 3:-62201995 None:intergenic
CAGGAAGTAGGGTATCTGTT+GGG 0.559765 3:-62202263 None:intergenic
ACGGGTATCTTAATCACAGA+TGG 0.561258 3:+62203965 MsG0380014900.01.T01:CDS
CAATAAATACTTGAAACTTG+AGG 0.561794 3:-62202405 None:intergenic
GTCTGGCTTAGGGGTAATTG+AGG 0.567754 3:+62203211 MsG0380014900.01.T01:CDS
TTGATAATTCAAGTTTCTCG+AGG 0.570723 3:+62203819 MsG0380014900.01.T01:CDS
ACCGGGAAGAGTGCAATGAC+GGG 0.571989 3:+62203947 MsG0380014900.01.T01:CDS
TTGGTTTGCGTCTGGCTTAG+GGG 0.572201 3:+62203202 MsG0380014900.01.T01:CDS
CAACCTTGTATTAACTGACG+CGG 0.575187 3:+62202110 MsG0380014900.01.T01:CDS
TTCCATCAAAGATTTCATCT+CGG 0.576907 3:-62204047 None:intergenic
CGATTACCAACCCAAGGTAG+CGG 0.581024 3:+62203760 MsG0380014900.01.T01:CDS
TCAAGTTTCTCGAGGATGAG+AGG 0.581690 3:+62203827 MsG0380014900.01.T01:CDS
ACATGAATTTGATTGGAATG+TGG 0.583207 3:+62203525 MsG0380014900.01.T01:CDS
AACATTACCATCAAAATCAA+GGG 0.583216 3:-62202580 None:intergenic
TCAGGAAGTAGGGTATCTGT+TGG 0.584196 3:-62202264 None:intergenic
ATTAACCAAACGATATTGGA+AGG 0.584458 3:-62202952 None:intergenic
ATAATCAAGATTGGTCTCAA+GGG 0.585353 3:+62202766 MsG0380014900.01.T01:CDS
CGTGCTTATAGTCGAAAACA+TGG 0.587068 3:+62202603 MsG0380014900.01.T01:CDS
AATCAACATGGGGTAAACGT+TGG 0.587684 3:-62202845 None:intergenic
ATAATGAGAGTTTGGTAACA+TGG 0.587749 3:+62203999 MsG0380014900.01.T01:CDS
TAGTCAAGAGATTGGAAAGG+GGG 0.588611 3:+62203376 MsG0380014900.01.T01:CDS
AGTTGCTTTAAAGTGTGTTG+AGG 0.589771 3:+62204132 MsG0380014900.01.T01:CDS
GAAAACATGGTCAAGAGAAG+TGG 0.595049 3:+62202616 MsG0380014900.01.T01:CDS
TCGTACAAAATCAACTCAAG+TGG 0.595490 3:-62202174 None:intergenic
CAAAATCCGCTACCTTGGGT+TGG 0.596636 3:-62203766 None:intergenic
TACATGAAGAATGTTTGGAG+TGG 0.598965 3:+62203693 MsG0380014900.01.T01:CDS
GACCCGCGTCAGTTAATACA+AGG 0.606221 3:-62202113 None:intergenic
GCATCCCAACTAACGAGCCA+AGG 0.606625 3:-62202435 None:intergenic
CCAAAAGGCACATTCACCGC+GGG 0.610257 3:+62201937 MsG0380014900.01.T01:CDS
TAATGAGAGTTTGGTAACAT+GGG 0.611250 3:+62204000 MsG0380014900.01.T01:CDS
ATTATCTGATAATAGAGTCG+TGG 0.617934 3:+62203424 MsG0380014900.01.T01:CDS
TTGAGTGAACCATATGGCAA+AGG 0.618128 3:-62201989 None:intergenic
GGTTGTCTAAGTTAGTACAA+AGG 0.619400 3:+62203789 MsG0380014900.01.T01:CDS
TGCTGCTAGAGATGATTACC+GGG 0.619690 3:+62203930 MsG0380014900.01.T01:CDS
TATCGTTTGGTTAATGACGA+AGG 0.620972 3:+62202960 MsG0380014900.01.T01:CDS
TTATTGATCCTGTTATAACC+AGG 0.630015 3:-62202747 None:intergenic
AAACAATGGTAGCATTGGTG+AGG 0.632812 3:-62202023 None:intergenic
ATGAATTTGATTGGAATGTG+GGG 0.633806 3:+62203527 MsG0380014900.01.T01:CDS
ACATTCCAATCAAATTCATG+TGG 0.634865 3:-62203523 None:intergenic
AACCTTGTATTAACTGACGC+GGG 0.642264 3:+62202111 MsG0380014900.01.T01:CDS
TCGAGGATGAGAGGAACAAG+AGG 0.643739 3:+62203836 MsG0380014900.01.T01:CDS
TTCCTGATCAAAGTTTCACA+AGG 0.646838 3:+62202280 MsG0380014900.01.T01:CDS
CTAAGCCAGACGCAAACCAA+AGG 0.652550 3:-62203199 None:intergenic
ACGATTTGCCATCCAAACAA+TGG 0.659623 3:-62202037 None:intergenic
ATTCGGATCAAATTATGACA+TGG 0.660598 3:+62204087 MsG0380014900.01.T01:CDS
ATCCTCAAACAACAGTAGCA+GGG 0.662044 3:+62202464 MsG0380014900.01.T01:CDS
TGACTCCGATTACCAACCCA+AGG 0.669032 3:+62203754 MsG0380014900.01.T01:CDS
ACCTACGGGGTAAAAGCCCG+CGG 0.683342 3:-62201953 None:intergenic
GCTGGAGGAACTGTGTACAA+GGG 0.684631 3:+62203398 MsG0380014900.01.T01:CDS
AGACTGCATGAAGCAAACAA+AGG 0.688678 3:+62203455 MsG0380014900.01.T01:CDS
TGAATTTGATTGGAATGTGG+GGG 0.693312 3:+62203528 MsG0380014900.01.T01:CDS
ACCAAAAGGCACATTCACCG+CGG 0.696089 3:+62201936 MsG0380014900.01.T01:CDS
CTCAAACAACAGTAGCAGGG+TGG 0.700746 3:+62202467 MsG0380014900.01.T01:CDS
TTAGTCAAGAGATTGGAAAG+GGG 0.701851 3:+62203375 MsG0380014900.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAATTATGACATGGTTAAAT+TGG + Chr3:62204096-62204115 MsG0380014900.01.T01:CDS 20.0%
!! AACTTTGTTAAAGATAATCA+AGG + Chr3:62203281-62203300 MsG0380014900.01.T01:CDS 20.0%
!! AATAAATACTTGAAACTTGA+GGG - Chr3:62202407-62202426 None:intergenic 20.0%
!! ATATTTACATGAAGAATGTT+TGG + Chr3:62203688-62203707 MsG0380014900.01.T01:CDS 20.0%
!! CACTATGTTTCTTTATAATA+TGG + Chr3:62203234-62203253 MsG0380014900.01.T01:CDS 20.0%
! AACATTACCATCAAAATCAA+GGG - Chr3:62202583-62202602 None:intergenic 25.0%
! ATGAATGTTGAAAATGTAAG+AGG - Chr3:62201867-62201886 None:intergenic 25.0%
! CAATAAATACTTGAAACTTG+AGG - Chr3:62202408-62202427 None:intergenic 25.0%
! GTATCCATAAAAATCAACAT+GGG - Chr3:62202859-62202878 None:intergenic 25.0%
! TATCCATAAAAATCAACATG+GGG - Chr3:62202858-62202877 None:intergenic 25.0%
! TTAAAAATACATGGAGTTTG+TGG + Chr3:62202669-62202688 MsG0380014900.01.T01:CDS 25.0%
! TTGTTAATGGAATAGCTATT+CGG - Chr3:62202696-62202715 None:intergenic 25.0%
!! ACAAAATAGGTTTCGTTTTA+TGG + Chr3:62202226-62202245 MsG0380014900.01.T01:CDS 25.0%
!! ACTTTAAAGACAAGTGATTA+TGG + Chr3:62202534-62202553 MsG0380014900.01.T01:CDS 25.0%
!! CAACAACCTTTAAAAATACA+TGG + Chr3:62202660-62202679 MsG0380014900.01.T01:CDS 25.0%
!! CTCAAGTTTCAAGTATTTAT+TGG + Chr3:62202406-62202425 MsG0380014900.01.T01:CDS 25.0%
!! CTTTAAAGACAAGTGATTAT+GGG + Chr3:62202535-62202554 MsG0380014900.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTTATTGTTGCATGAAAGT+TGG - Chr3:62202806-62202825 None:intergenic 25.0%
!!! AAATGTTTTAGTCAAGAGAT+TGG + Chr3:62203368-62203387 MsG0380014900.01.T01:CDS 25.0%
!!! CAAACTCCATGTATTTTTAA+AGG - Chr3:62202669-62202688 None:intergenic 25.0%
!!! CATGTATTTTTAAAGGTTGT+TGG - Chr3:62202662-62202681 None:intergenic 25.0%
AAAGACTCATAATGAGAGTT+TGG + Chr3:62203991-62204010 MsG0380014900.01.T01:CDS 30.0%
AAGAATCATGTTCATGAGTT+TGG - Chr3:62204204-62204223 None:intergenic 30.0%
AAGGTAGATGTTTATAGCTA+TGG + Chr3:62203902-62203921 MsG0380014900.01.T01:CDS 30.0%
ACAGGATCAATAATCAAGAT+TGG + Chr3:62202757-62202776 MsG0380014900.01.T01:CDS 30.0%
ACATGAATTTGATTGGAATG+TGG + Chr3:62203525-62203544 MsG0380014900.01.T01:CDS 30.0%
ACATTCCAATCAAATTCATG+TGG - Chr3:62203526-62203545 None:intergenic 30.0%
ATAGCTATAAACATCTACCT+TGG - Chr3:62203903-62203922 None:intergenic 30.0%
ATGAATTTGATTGGAATGTG+GGG + Chr3:62203527-62203546 MsG0380014900.01.T01:CDS 30.0%
ATTAACCAAACGATATTGGA+AGG - Chr3:62202955-62202974 None:intergenic 30.0%
ATTATCTGATAATAGAGTCG+TGG + Chr3:62203424-62203443 MsG0380014900.01.T01:CDS 30.0%
ATTCGGATCAAATTATGACA+TGG + Chr3:62204087-62204106 MsG0380014900.01.T01:CDS 30.0%
CATAATTTGATCCGAATGTA+GGG - Chr3:62204084-62204103 None:intergenic 30.0%
CATGAATTTGATTGGAATGT+GGG + Chr3:62203526-62203545 MsG0380014900.01.T01:CDS 30.0%
CATGCGAATGTAACAAAAAA+TGG + Chr3:62203089-62203108 MsG0380014900.01.T01:CDS 30.0%
CGTATCCATAAAAATCAACA+TGG - Chr3:62202860-62202879 None:intergenic 30.0%
CTTAACCACATGAATTTGAT+TGG + Chr3:62203518-62203537 MsG0380014900.01.T01:CDS 30.0%
GAACATTACCATCAAAATCA+AGG - Chr3:62202584-62202603 None:intergenic 30.0%
GAACTGCTTACATTGTTTAT+AGG - Chr3:62202907-62202926 None:intergenic 30.0%
GACATTATAATGTCACCAAA+AGG + Chr3:62201922-62201941 MsG0380014900.01.T01:CDS 30.0%
TACGTTGAAGACAAAGAAAA+TGG + Chr3:62203161-62203180 MsG0380014900.01.T01:CDS 30.0%
TAGATTGATCCCTGAAAATT+CGG - Chr3:62203035-62203054 None:intergenic 30.0%
TCATAATTTGATCCGAATGT+AGG - Chr3:62204085-62204104 None:intergenic 30.0%
TGCATTTGACGACAAATTAT+CGG - Chr3:62203615-62203634 None:intergenic 30.0%
TGTAACAAAAAATGGTAGCT+TGG + Chr3:62203097-62203116 MsG0380014900.01.T01:CDS 30.0%
TTATTGATCCTGTTATAACC+AGG - Chr3:62202750-62202769 None:intergenic 30.0%
TTCCATCAAAGATTTCATCT+CGG - Chr3:62204050-62204069 None:intergenic 30.0%
TTTAGTCAAGAGATTGGAAA+GGG + Chr3:62203374-62203393 MsG0380014900.01.T01:CDS 30.0%
! ACAGAAACATGTTCTCTTTT+TGG - Chr3:62203068-62203087 None:intergenic 30.0%
! ATAATGAGAGTTTGGTAACA+TGG + Chr3:62203999-62204018 MsG0380014900.01.T01:CDS 30.0%
! GAGTCAATTAGTATGTTTTG+CGG - Chr3:62203740-62203759 None:intergenic 30.0%
! TAATGAGAGTTTGGTAACAT+GGG + Chr3:62204000-62204019 MsG0380014900.01.T01:CDS 30.0%
! TTGATAATTCAAGTTTCTCG+AGG + Chr3:62203819-62203838 MsG0380014900.01.T01:CDS 30.0%
! TTTGAGCATTTTCCGTTAAT+TGG - Chr3:62202069-62202088 None:intergenic 30.0%
! TTTTAGTCAAGAGATTGGAA+AGG + Chr3:62203373-62203392 MsG0380014900.01.T01:CDS 30.0%
!! AATAATCAAGATTGGTCTCA+AGG + Chr3:62202765-62202784 MsG0380014900.01.T01:CDS 30.0%
!! ATAATCAAGATTGGTCTCAA+GGG + Chr3:62202766-62202785 MsG0380014900.01.T01:CDS 30.0%
!! GTATTTTTAAAGGTTGTTGG+TGG - Chr3:62202659-62202678 None:intergenic 30.0%
!! GTTTATAGGTGTAATTTGCT+TGG - Chr3:62202893-62202912 None:intergenic 30.0%
!!! ATATTTGTTGTCACTTTTGG+AGG - Chr3:62202322-62202341 None:intergenic 30.0%
!!! ATTGTTAGTTTTCGAGTACA+TGG + Chr3:62203574-62203593 MsG0380014900.01.T01:CDS 30.0%
!!! CATTTTTTGTTACATTCGCA+TGG - Chr3:62203091-62203110 None:intergenic 30.0%
!!! GGAATATTTGTTGTCACTTT+TGG - Chr3:62202325-62202344 None:intergenic 30.0%
!!! TTACCCCATGTTGATTTTTA+TGG + Chr3:62202852-62202871 MsG0380014900.01.T01:CDS 30.0%
AAAAAGTTTGTAGAAGCCTG+AGG - Chr3:62202346-62202365 None:intergenic 35.0%
AAACTTTCCCTTCTCAAAAC+CGG + Chr3:62202087-62202106 MsG0380014900.01.T01:CDS 35.0%
AATCGTGACCAACCAATTAA+CGG + Chr3:62202054-62202073 MsG0380014900.01.T01:CDS 35.0%
AGTGACAACAAATATTCCTC+AGG + Chr3:62202327-62202346 MsG0380014900.01.T01:CDS 35.0%
ATCCGAGATGAAATCTTTGA+TGG + Chr3:62204045-62204064 MsG0380014900.01.T01:CDS 35.0%
ATGCTTATTCCTTTGCCATA+TGG + Chr3:62201980-62201999 MsG0380014900.01.T01:CDS 35.0%
CAAAATCAACTCAAGTGGTT+TGG - Chr3:62202172-62202191 None:intergenic 35.0%
CAAATAGTAGACCCTACATT+CGG + Chr3:62204070-62204089 MsG0380014900.01.T01:CDS 35.0%
CGTCATTAACCAAACGATAT+TGG - Chr3:62202959-62202978 None:intergenic 35.0%
CTAAGTCACAATTGCGAAAT+GGG + Chr3:62203000-62203019 MsG0380014900.01.T01:CDS 35.0%
GAAACTTTGATCAGGAAGTA+GGG - Chr3:62202277-62202296 None:intergenic 35.0%
GATCAGTGAAGATTATCCTT+TGG + Chr3:62203183-62203202 MsG0380014900.01.T01:CDS 35.0%
GGCAAATTGAAAATCCATTC+AGG - Chr3:62203872-62203891 None:intergenic 35.0%
GGTTGTCTAAGTTAGTACAA+AGG + Chr3:62203789-62203808 MsG0380014900.01.T01:CDS 35.0%
GTCGTCAAATGCACTTAATT+GGG + Chr3:62203622-62203641 MsG0380014900.01.T01:CDS 35.0%
TACATGAAGAATGTTTGGAG+TGG + Chr3:62203693-62203712 MsG0380014900.01.T01:CDS 35.0%
TATCGTTTGGTTAATGACGA+AGG + Chr3:62202960-62202979 MsG0380014900.01.T01:CDS 35.0%
TCAACAACTTCACTCATGTT+AGG - Chr3:62204175-62204194 None:intergenic 35.0%
TCCATTAACAATCCAAGAAC+CGG + Chr3:62202705-62202724 MsG0380014900.01.T01:CDS 35.0%
TCGTACAAAATCAACTCAAG+TGG - Chr3:62202177-62202196 None:intergenic 35.0%
TCGTCAAATGCACTTAATTG+GGG + Chr3:62203623-62203642 MsG0380014900.01.T01:CDS 35.0%
TGAAACTTTGATCAGGAAGT+AGG - Chr3:62202278-62202297 None:intergenic 35.0%
TGAATTTGATTGGAATGTGG+GGG + Chr3:62203528-62203547 MsG0380014900.01.T01:CDS 35.0%
TGTCGTCAAATGCACTTAAT+TGG + Chr3:62203621-62203640 MsG0380014900.01.T01:CDS 35.0%
TTAGTCAAGAGATTGGAAAG+GGG + Chr3:62203375-62203394 MsG0380014900.01.T01:CDS 35.0%
TTCATCATCATTCTCTCTCT+CGG + Chr3:62201882-62201901 MsG0380014900.01.T01:CDS 35.0%
TTCCTGATCAAAGTTTCACA+AGG + Chr3:62202280-62202299 MsG0380014900.01.T01:CDS 35.0%
! AATAAGCATTTTCACCTACG+GGG - Chr3:62201969-62201988 None:intergenic 35.0%
! AGATTGACCCTTGATTTTGA+TGG + Chr3:62202573-62202592 MsG0380014900.01.T01:CDS 35.0%
! AGCATTTTCCGTTAATTGGT+TGG - Chr3:62202065-62202084 None:intergenic 35.0%
! GAATAAGCATTTTCACCTAC+GGG - Chr3:62201970-62201989 None:intergenic 35.0%
! GGAATAAGCATTTTCACCTA+CGG - Chr3:62201971-62201990 None:intergenic 35.0%
! GTGGCAAAACTAGATGTTTT+GGG + Chr3:62202486-62202505 MsG0380014900.01.T01:CDS 35.0%
! TTCAGTTCACCGAATTTTCA+GGG + Chr3:62203023-62203042 MsG0380014900.01.T01:CDS 35.0%
!! AGTTGCTTTAAAGTGTGTTG+AGG + Chr3:62204132-62204151 MsG0380014900.01.T01:CDS 35.0%
!! GAGTTGATTTTGTACGATAC+AGG + Chr3:62202180-62202199 MsG0380014900.01.T01:CDS 35.0%
!! TTGGTTTGTTCGAGAAATGA+TGG + Chr3:62203116-62203135 MsG0380014900.01.T01:CDS 35.0%
!!! GTTTTCGAGTACATGGAAAA+AGG + Chr3:62203581-62203600 MsG0380014900.01.T01:CDS 35.0%
AACCTTGTATTAACTGACGC+GGG + Chr3:62202111-62202130 MsG0380014900.01.T01:CDS 40.0%
AAGACACACACACTTTCTTC+CGG - Chr3:62202727-62202746 None:intergenic 40.0%
AATCAACATGGGGTAAACGT+TGG - Chr3:62202848-62202867 None:intergenic 40.0%
AATCAAGGGTCAATCTTCGT+TGG - Chr3:62202569-62202588 None:intergenic 40.0%
ACATCTACCTTGGAAGTGAT+TGG - Chr3:62203893-62203912 None:intergenic 40.0%
ACGATTTGCCATCCAAACAA+TGG - Chr3:62202040-62202059 None:intergenic 40.0%
ACGGGTATCTTAATCACAGA+TGG + Chr3:62203965-62203984 MsG0380014900.01.T01:CDS 40.0%
AGACTGCATGAAGCAAACAA+AGG + Chr3:62203455-62203474 MsG0380014900.01.T01:CDS 40.0%
ATCCTCAAACAACAGTAGCA+GGG + Chr3:62202464-62202483 MsG0380014900.01.T01:CDS 40.0%
CAACCTTGTATTAACTGACG+CGG + Chr3:62202110-62202129 MsG0380014900.01.T01:CDS 40.0%
CAATGCTACCATTGTTTGGA+TGG + Chr3:62202029-62202048 MsG0380014900.01.T01:CDS 40.0%
CAATTTGCCAATCACTTCCA+AGG + Chr3:62203883-62203902 MsG0380014900.01.T01:CDS 40.0%
CATAGCCTTCCAATATCGTT+TGG + Chr3:62202947-62202966 MsG0380014900.01.T01:CDS 40.0%
CATCCAAACAATGGTAGCAT+TGG - Chr3:62202031-62202050 None:intergenic 40.0%
CCATTTCGCAATTGTGACTT+AGG - Chr3:62203002-62203021 None:intergenic 40.0%
CCTAAGTCACAATTGCGAAA+TGG + Chr3:62202999-62203018 MsG0380014900.01.T01:CDS 40.0%
CGTGCTTATAGTCGAAAACA+TGG + Chr3:62202603-62202622 MsG0380014900.01.T01:CDS 40.0%
GAAAACATGGTCAAGAGAAG+TGG + Chr3:62202616-62202635 MsG0380014900.01.T01:CDS 40.0%
GAGAGGAACAAGAGGTTATA+TGG + Chr3:62203844-62203863 MsG0380014900.01.T01:CDS 40.0%
GTATTTATTGGCCAAGTCCT+TGG + Chr3:62202418-62202437 MsG0380014900.01.T01:CDS 40.0%
GTCAGTTAATACAAGGTTGC+CGG - Chr3:62202109-62202128 None:intergenic 40.0%
GTGTGTTTGAGTGAACCATA+TGG - Chr3:62201998-62202017 None:intergenic 40.0%
TAGTCAAGAGATTGGAAAGG+GGG + Chr3:62203376-62203395 MsG0380014900.01.T01:CDS 40.0%
TCACCAATGCTACCATTGTT+TGG + Chr3:62202025-62202044 MsG0380014900.01.T01:CDS 40.0%
TCCGGTTCTTGGATTGTTAA+TGG - Chr3:62202709-62202728 None:intergenic 40.0%
TGCCTTGTGAAACTTTGATC+AGG - Chr3:62202285-62202304 None:intergenic 40.0%
TGTGTCTTCCTGGTTATAAC+AGG + Chr3:62202739-62202758 MsG0380014900.01.T01:CDS 40.0%
TTGAGTGAACCATATGGCAA+AGG - Chr3:62201992-62202011 None:intergenic 40.0%
TTGCATGAAAGTTGGAAGCT+TGG - Chr3:62202798-62202817 None:intergenic 40.0%
! AAGAGAAGTGGTCGATTTCA+GGG + Chr3:62202628-62202647 MsG0380014900.01.T01:CDS 40.0%
! CTCAGAGAGCACAACAAAAT+AGG + Chr3:62202213-62202232 MsG0380014900.01.T01:CDS 40.0%
! GGTGGCAAAACTAGATGTTT+TGG + Chr3:62202485-62202504 MsG0380014900.01.T01:CDS 40.0%
! GTTCAGTTCACCGAATTTTC+AGG + Chr3:62203022-62203041 MsG0380014900.01.T01:CDS 40.0%
!! AAACAATGGTAGCATTGGTG+AGG - Chr3:62202026-62202045 None:intergenic 40.0%
!! ATTATCCTTTGGTTTGCGTC+TGG + Chr3:62203194-62203213 MsG0380014900.01.T01:CDS 40.0%
!! CTATTTTGTTGTGCTCTCTG+AGG - Chr3:62202215-62202234 None:intergenic 40.0%
!!! TGTCACTTTTGGAGGAAACA+AGG - Chr3:62202314-62202333 None:intergenic 40.0%
AACCCAAAATCCGCTACCTT+GGG - Chr3:62203773-62203792 None:intergenic 45.0%
AATCAAGGCTACGTTCTTGC+AGG + Chr3:62203296-62203315 MsG0380014900.01.T01:CDS 45.0%
ACACACTTTCTTCCGGTTCT+TGG - Chr3:62202720-62202739 None:intergenic 45.0%
CATGGGTGAGAGAGAAAAGA+AGG + Chr3:62204017-62204036 MsG0380014900.01.T01:CDS 45.0%
CTCTTGCGTCTTCTCTATGA+TGG + Chr3:62202381-62202400 MsG0380014900.01.T01:CDS 45.0%
CTGAAGTTAGCGTCATTGGA+AGG + Chr3:62203495-62203514 MsG0380014900.01.T01:CDS 45.0%
CTTGCTGAAGTTAGCGTCAT+TGG + Chr3:62203491-62203510 MsG0380014900.01.T01:CDS 45.0%
GAGGTTATATGGCACCTGAA+TGG + Chr3:62203855-62203874 MsG0380014900.01.T01:CDS 45.0%
GATCCTCAAACAACAGTAGC+AGG + Chr3:62202463-62202482 MsG0380014900.01.T01:CDS 45.0%
TACGTTCTTGCAGGAACAAC+AGG + Chr3:62203305-62203324 MsG0380014900.01.T01:CDS 45.0%
TCAAGTTTCTCGAGGATGAG+AGG + Chr3:62203827-62203846 MsG0380014900.01.T01:CDS 45.0%
TGCTGCTAGAGATGATTACC+GGG + Chr3:62203930-62203949 MsG0380014900.01.T01:CDS 45.0%
! AAGTCCTTGGCTCGTTAGTT+GGG + Chr3:62202431-62202450 MsG0380014900.01.T01:CDS 45.0%
! AGAAAGTGTGTGTGTCTTCC+TGG + Chr3:62202729-62202748 MsG0380014900.01.T01:CDS 45.0%
! CAAGAGAAGTGGTCGATTTC+AGG + Chr3:62202627-62202646 MsG0380014900.01.T01:CDS 45.0%
! CAGGAAGTAGGGTATCTGTT+GGG - Chr3:62202266-62202285 None:intergenic 45.0%
! GTGCTGCTAGAGATGATTAC+CGG + Chr3:62203929-62203948 MsG0380014900.01.T01:CDS 45.0%
! TCAGGAAGTAGGGTATCTGT+TGG - Chr3:62202267-62202286 None:intergenic 45.0%
!! TTTGGTTTGCGTCTGGCTTA+GGG + Chr3:62203201-62203220 MsG0380014900.01.T01:CDS 45.0%
!!! AACCCAAGGTAGCGGATTTT+GGG + Chr3:62203768-62203787 MsG0380014900.01.T01:CDS 45.0%
!!! AAGGTTGCCGGTTTTGAGAA+GGG - Chr3:62202097-62202116 None:intergenic 45.0%
CAAAATCCGCTACCTTGGGT+TGG - Chr3:62203769-62203788 None:intergenic 50.0%
CAACCCAAAATCCGCTACCT+TGG - Chr3:62203774-62203793 None:intergenic 50.0%
CAACTAACGAGCCAAGGACT+TGG - Chr3:62202432-62202451 None:intergenic 50.0%
CGATTACCAACCCAAGGTAG+CGG + Chr3:62203760-62203779 MsG0380014900.01.T01:CDS 50.0%
CTAAGCCAGACGCAAACCAA+AGG - Chr3:62203202-62203221 None:intergenic 50.0%
CTCAAACAACAGTAGCAGGG+TGG + Chr3:62202467-62202486 MsG0380014900.01.T01:CDS 50.0%
GACCCGCGTCAGTTAATACA+AGG - Chr3:62202116-62202135 None:intergenic 50.0%
GCTGGAGGAACTGTGTACAA+GGG + Chr3:62203398-62203417 MsG0380014900.01.T01:CDS 50.0%
TCGAGGATGAGAGGAACAAG+AGG + Chr3:62203836-62203855 MsG0380014900.01.T01:CDS 50.0%
TGACTCCGATTACCAACCCA+AGG + Chr3:62203754-62203773 MsG0380014900.01.T01:CDS 50.0%
! ACCAAAAGGCACATTCACCG+CGG + Chr3:62201936-62201955 MsG0380014900.01.T01:CDS 50.0%
! CAAGTCCTTGGCTCGTTAGT+TGG + Chr3:62202430-62202449 MsG0380014900.01.T01:CDS 50.0%
! CACCCTGCTACTGTTGTTTG+AGG - Chr3:62202469-62202488 None:intergenic 50.0%
! GTCTGGCTTAGGGGTAATTG+AGG + Chr3:62203211-62203230 MsG0380014900.01.T01:CDS 50.0%
! TACCGGGAAGAGTGCAATGA+CGG + Chr3:62203946-62203965 MsG0380014900.01.T01:CDS 50.0%
!! AATGTGGGGGTATTGTGCAG+AGG + Chr3:62203541-62203560 MsG0380014900.01.T01:CDS 50.0%
!! ACGCGGGTCATTTTGACGTT+TGG + Chr3:62202127-62202146 MsG0380014900.01.T01:CDS 50.0%
!! ATGTGGGGGTATTGTGCAGA+GGG + Chr3:62203542-62203561 MsG0380014900.01.T01:CDS 50.0%
!! CGCTACCTTGGGTTGGTAAT+CGG - Chr3:62203762-62203781 None:intergenic 50.0%
!! CTTTGGTTTGCGTCTGGCTT+AGG + Chr3:62203200-62203219 MsG0380014900.01.T01:CDS 50.0%
!! TTGGTTTGCGTCTGGCTTAG+GGG + Chr3:62203202-62203221 MsG0380014900.01.T01:CDS 50.0%
!!! CAACCCAAGGTAGCGGATTT+TGG + Chr3:62203767-62203786 MsG0380014900.01.T01:CDS 50.0%
!!! CAAGGTTGCCGGTTTTGAGA+AGG - Chr3:62202098-62202117 None:intergenic 50.0%
ACCCGTCATTGCACTCTTCC+CGG - Chr3:62203951-62203970 None:intergenic 55.0%
CAAGAGATTGGAAAGGGGGC+TGG + Chr3:62203380-62203399 MsG0380014900.01.T01:CDS 55.0%
GCATCCCAACTAACGAGCCA+AGG - Chr3:62202438-62202457 None:intergenic 55.0%
GGCTGGAGGAACTGTGTACA+AGG + Chr3:62203397-62203416 MsG0380014900.01.T01:CDS 55.0%
! ACCGGGAAGAGTGCAATGAC+GGG + Chr3:62203947-62203966 MsG0380014900.01.T01:CDS 55.0%
! CCAAAAGGCACATTCACCGC+GGG + Chr3:62201937-62201956 MsG0380014900.01.T01:CDS 55.0%
ACCTACGGGGTAAAAGCCCG+CGG - Chr3:62201956-62201975 None:intergenic 60.0%
GAGATTGGAAAGGGGGCTGG+AGG + Chr3:62203383-62203402 MsG0380014900.01.T01:CDS 60.0%
! CCCGCGGTGAATGTGCCTTT+TGG - Chr3:62201940-62201959 None:intergenic 60.0%
! ACCGCGGGCTTTTACCCCGT+AGG + Chr3:62201952-62201971 MsG0380014900.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 62201826 62204228 62201826 ID=MsG0380014900.01;Name=MsG0380014900.01
Chr3 mRNA 62201826 62204228 62201826 ID=MsG0380014900.01.T01;Parent=MsG0380014900.01;Name=MsG0380014900.01.T01;_AED=0.30;_eAED=0.30;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|800
Chr3 exon 62201826 62204228 62201826 ID=MsG0380014900.01.T01:exon:6469;Parent=MsG0380014900.01.T01
Chr3 CDS 62201826 62204228 62201826 ID=MsG0380014900.01.T01:cds;Parent=MsG0380014900.01.T01
Gene Sequence

>MsG0380014900.01.T01

ATGGCTTCTTCACTAATCTTCTTTGCTATTCTTATATTCCTCTTACATTTTCAACATTCATCATCATTCTCTCTCTCGGTTGAAAAACACGAAGAAGACATTATAATGTCACCAAAAGGCACATTCACCGCGGGCTTTTACCCCGTAGGTGAAAATGCTTATTCCTTTGCCATATGGTTCACTCAAACACACAAAAACCTCACCAATGCTACCATTGTTTGGATGGCAAATCGTGACCAACCAATTAACGGAAAATGCTCAAAACTTTCCCTTCTCAAAACCGGCAACCTTGTATTAACTGACGCGGGTCATTTTGACGTTTGGTCTACAAACACTAACTCATCCAAACCACTTGAGTTGATTTTGTACGATACAGGAAATCTTGTCCTCAGAGAGCACAACAAAATAGGTTTCGTTTTATGGCAAAGCTTTGATTTCCCAACAGATACCCTACTTCCTGATCAAAGTTTCACAAGGCACATGAACCTTGTTTCCTCCAAAAGTGACAACAAATATTCCTCAGGCTTCTACAAACTTTTTTTCGATAACGACAATCTCTTGCGTCTTCTCTATGATGGCCCTCAAGTTTCAAGTATTTATTGGCCAAGTCCTTGGCTCGTTAGTTGGGATGCTAGTAGATCCTCAAACAACAGTAGCAGGGTGGCAAAACTAGATGTTTTGGGTAACTTTAGTTCTTCTGATGATTTCACTTTAAAGACAAGTGATTATGGGATTGTTCTCCAACGAAGATTGACCCTTGATTTTGATGGTAATGTTCGTGCTTATAGTCGAAAACATGGTCAAGAGAAGTGGTCGATTTCAGGGCAATTCCACCAACAACCTTTAAAAATACATGGAGTTTGTGGACCGAATAGCTATTCCATTAACAATCCAAGAACCGGAAGAAAGTGTGTGTGTCTTCCTGGTTATAACAGGATCAATAATCAAGATTGGTCTCAAGGGTGCAAACCAAGCTTCCAACTTTCATGCAACAATAAAACAGATTCAGAGACTCGCTTCCAACGTTTACCCCATGTTGATTTTTATGGATACGATTATTTGCACCAAGCAAATTACACCTATAAACAATGTAAGCAGTTCTGCTTGCGAATATGTCAATGCATAGCCTTCCAATATCGTTTGGTTAATGACGAAGGTGTTTTTTATTGTTATCCTAAGTCACAATTGCGAAATGGGTTCAGTTCACCGAATTTTCAGGGATCAATCTATTTGCGATTGCCAAAAAGAGAACATGTTTCTGTCCATGCGAATGTAACAAAAAATGGTAGCTTGGTTTGTTCGAGAAATGATGGAGTACAACAACTAAAAAAATCATACGTTGAAGACAAAGAAAATGGATCAGTGAAGATTATCCTTTGGTTTGCGTCTGGCTTAGGGGTAATTGAGGCACTATGTTTCTTTATAATATGGTTCTTCTTATTTAAGAATAGCGAGAACTTTGTTAAAGATAATCAAGGCTACGTTCTTGCAGGAACAACAGGATTTCGAAAATTCACTTACTCTGAATTAAAACAAGCAACAAAATGTTTTAGTCAAGAGATTGGAAAGGGGGCTGGAGGAACTGTGTACAAGGGTTTATTATCTGATAATAGAGTCGTGGCTATAAAGAGACTGCATGAAGCAAACAAAGGAGAGAGTGAATTTCTTGCTGAAGTTAGCGTCATTGGAAGGCTTAACCACATGAATTTGATTGGAATGTGGGGGTATTGTGCAGAGGGAAAACACAGATTGTTAGTTTTCGAGTACATGGAAAAAGGTTCTTTAGCCGATAATTTGTCGTCAAATGCACTTAATTGGGGTAAGAGATATAAAATTGCTCTCAGAACTGCAAAGTGTCTTGCATATTTACATGAAGAATGTTTGGAGTGGATTTTGCATTGTGACATAAAGCCGCAAAACATACTAATTGACTCCGATTACCAACCCAAGGTAGCGGATTTTGGGTTGTCTAAGTTAGTACAAAGGAACAATTTTGATAATTCAAGTTTCTCGAGGATGAGAGGAACAAGAGGTTATATGGCACCTGAATGGATTTTCAATTTGCCAATCACTTCCAAGGTAGATGTTTATAGCTATGGAGTTGTGCTGCTAGAGATGATTACCGGGAAGAGTGCAATGACGGGTATCTTAATCACAGATGGAGAAAAGACTCATAATGAGAGTTTGGTAACATGGGTGAGAGAGAAAAGAAGGAAATTATCCGAGATGAAATCTTTGATGGAACAAATAGTAGACCCTACATTCGGATCAAATTATGACATGGTTAAATTGGAGACTTTGACAATAGTTGCTTTAAAGTGTGTTGAGGAAGAGAAAGACATGAGACCTAACATGAGTGAAGTTGTTGAAATGCTCCAAACTCATGAACATGATTCTTCATGA
Protein sequence

>MsG0380014900.01.T01

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