AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380015483.01

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MsG0380015483.01.T01 AT5G54590 44.574 258 109 8 382 626 102 338 7.51e-55 193
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MsG0380015483.01.T01 AT1G52290 36.164 365 182 11 270 611 28 364 2.16e-54 194
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MsG0380015483.01.T01 AT1G24030 45.133 226 98 6 383 589 50 268 1.09e-52 183
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MsG0380015483.01.T01 AT2G30740 41.224 245 123 4 383 610 59 299 1.09e-51 182
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MsG0380015483.01.T01 AT2G28970 43.697 238 113 5 383 607 469 698 2.79e-51 190
MsG0380015483.01.T01 AT1G52540 44.595 222 104 4 383 591 25 240 2.80e-51 181
MsG0380015483.01.T01 AT1G23540 41.288 264 123 7 383 626 359 610 2.87e-51 189
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MsG0380015483.01.T01 AT3G09830 41.637 281 127 7 343 600 40 306 4.15e-51 182
MsG0380015483.01.T01 AT5G01950 48.889 225 91 6 383 589 529 747 4.86e-51 190
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MsG0380015483.01.T01 AT4G02010 46.121 232 106 4 373 589 358 585 7.81e-51 188
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MsG0380015483.01.T01 AT3G59350 42.449 245 120 6 383 610 59 299 9.55e-51 180
MsG0380015483.01.T01 AT1G55610 37.386 329 173 6 276 589 754 1064 9.75e-51 190
MsG0380015483.01.T01 AT1G55610 37.386 329 173 6 276 589 754 1064 9.75e-51 190
MsG0380015483.01.T01 AT4G34440 42.412 257 125 6 383 626 300 546 1.19e-50 187
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MsG0380015483.01.T01 AT5G01950 48.889 225 91 6 383 589 614 832 1.25e-50 189
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MsG0380015483.01.T01 AT3G24550 43.443 244 110 6 383 610 268 499 1.50e-50 186
MsG0380015483.01.T01 AT4G13190 42.336 274 125 8 341 589 10 275 1.51e-50 180
MsG0380015483.01.T01 AT5G49770 48.649 222 95 2 383 591 622 837 1.84e-50 189
MsG0380015483.01.T01 AT5G37450 44.444 243 112 4 364 589 397 633 2.14e-50 187
MsG0380015483.01.T01 AT4G01330 44.796 221 102 5 383 589 150 364 2.93e-50 181
MsG0380015483.01.T01 AT5G18610 40.351 285 148 6 323 589 7 287 3.41e-50 182
MsG0380015483.01.T01 AT5G18610 40.351 285 148 6 323 589 7 287 3.41e-50 182
MsG0380015483.01.T01 AT5G18610 40.351 285 148 6 323 589 7 287 3.41e-50 182
MsG0380015483.01.T01 AT5G38990 37.861 346 181 8 253 583 399 725 3.86e-50 187
MsG0380015483.01.T01 AT4G01330 44.796 221 102 5 383 589 150 364 4.06e-50 181
MsG0380015483.01.T01 AT1G14370 41.107 253 117 6 381 610 72 315 4.22e-50 180
MsG0380015483.01.T01 AT4G01330 44.796 221 102 5 383 589 150 364 4.27e-50 181
MsG0380015483.01.T01 AT3G59350 42.449 245 120 6 383 610 116 356 4.46e-50 180
MsG0380015483.01.T01 AT3G59350 42.449 245 120 6 383 610 101 341 4.76e-50 179
MsG0380015483.01.T01 AT3G59350 42.449 245 120 6 383 610 101 341 4.76e-50 179
MsG0380015483.01.T01 AT1G01540 44.344 221 103 6 383 589 142 356 4.76e-50 179
MsG0380015483.01.T01 AT3G59350 42.449 245 120 6 383 610 101 341 4.87e-50 178
MsG0380015483.01.T01 AT3G18810 41.634 257 127 5 383 626 325 571 5.01e-50 185
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MsG0380015483.01.T01 AT5G37450 41.948 267 123 5 364 604 624 884 8.08e-50 187
MsG0380015483.01.T01 AT3G46330 42.857 231 111 5 379 595 552 775 8.15e-50 186
MsG0380015483.01.T01 AT5G37450 41.948 267 123 5 364 604 576 836 8.25e-50 187
MsG0380015483.01.T01 AT2G39360 39.759 249 124 4 383 615 475 713 8.57e-50 186
MsG0380015483.01.T01 AT2G01820 45.291 223 101 5 383 589 573 790 9.78e-50 187
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MsG0380015483.01.T01 AT5G03320 38.462 299 154 6 326 600 11 303 1.10e-49 179
MsG0380015483.01.T01 AT3G09780 40.068 292 119 7 341 614 466 719 1.16e-49 185
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MsG0380015483.01.T01 AT1G51805 36.808 307 153 5 301 594 506 784 1.66e-49 186
MsG0380015483.01.T01 AT1G66150 44.595 222 104 4 383 589 576 793 1.99e-49 186
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MsG0380015483.01.T01 AT1G06700 40.408 245 125 4 383 610 56 296 2.71e-49 176
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MsG0380015483.01.T01 AT1G06700 40.408 245 125 4 383 610 56 296 2.71e-49 176
MsG0380015483.01.T01 AT5G61350 44.545 220 108 2 383 589 513 731 3.03e-49 184
MsG0380015483.01.T01 AT1G01540 44.344 221 103 6 383 589 142 356 3.12e-49 179
MsG0380015483.01.T01 AT1G49270 41.667 264 122 8 383 626 324 575 4.09e-49 182
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MsG0380015483.01.T01 AT3G62220 42.259 239 121 4 386 610 60 295 4.29e-49 175
MsG0380015483.01.T01 AT2G20300 45.455 220 97 3 383 589 337 546 4.45e-49 183
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MsG0380015483.01.T01 AT1G69790 40.945 254 116 6 381 611 59 301 5.75e-49 176
MsG0380015483.01.T01 AT1G17910 41.200 250 126 4 353 589 414 655 5.91e-49 183
MsG0380015483.01.T01 AT1G51860 36.709 316 145 9 298 594 511 790 6.34e-49 184
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MsG0380015483.01.T01 AT1G25390 45.249 221 100 5 383 589 279 492 6.38e-49 181
MsG0380015483.01.T01 AT3G53590 40.876 274 129 5 358 604 584 851 6.81e-49 184
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MsG0380015483.01.T01 AT5G39000 36.571 350 178 8 250 583 397 718 9.27e-49 183
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MsG0380015483.01.T01 AT3G55450 41.732 254 119 6 380 610 83 330 1.16e-48 176
MsG0380015483.01.T01 AT1G51910 37.255 306 137 9 298 589 508 772 1.19e-48 183
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MsG0380015483.01.T01 AT2G47060 41.473 258 133 5 368 610 45 299 1.29e-48 174
MsG0380015483.01.T01 AT2G11520 42.793 222 106 4 383 589 213 428 1.29e-48 178
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MsG0380015483.01.T01 AT4G00330 39.474 266 132 5 343 589 71 326 1.49e-48 175
MsG0380015483.01.T01 AT5G15080 39.921 253 120 4 382 611 129 372 1.60e-48 177
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MsG0380015483.01.T01 AT1G07570 35.669 314 164 7 321 611 2 300 1.68e-48 175
MsG0380015483.01.T01 AT1G07570 35.669 314 164 7 321 611 2 300 1.68e-48 175
MsG0380015483.01.T01 AT2G19230 43.277 238 106 8 368 591 550 772 1.76e-48 183
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MsG0380015483.01.T01 AT2G47060 42.917 240 120 4 385 610 63 299 2.87e-48 174
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MsG0380015483.01.T01 AT2G28250 43.028 251 114 6 382 610 197 440 4.27e-48 177
MsG0380015483.01.T01 AT2G28250 43.028 251 114 6 382 610 197 440 4.27e-48 177
MsG0380015483.01.T01 AT2G28250 43.028 251 114 6 382 610 197 440 4.27e-48 177
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MsG0380015483.01.T01 AT2G28250 43.028 251 114 6 382 610 197 440 4.27e-48 177
MsG0380015483.01.T01 AT2G29000 43.460 237 114 4 366 589 538 767 4.45e-48 181
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MsG0380015483.01.T01 AT1G07570 36.545 301 154 6 334 611 25 311 4.71e-48 174
MsG0380015483.01.T01 AT2G28930 41.270 252 116 6 383 610 60 303 5.21e-48 174
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MsG0380015483.01.T01 AT2G18470 44.545 220 102 4 383 589 272 484 5.87e-48 178
MsG0380015483.01.T01 AT2G18470 44.545 220 102 4 383 589 272 484 5.87e-48 178
MsG0380015483.01.T01 AT3G46410 46.231 199 96 3 396 594 4 191 6.13e-48 170
MsG0380015483.01.T01 AT5G49780 45.333 225 103 3 383 594 643 860 6.34e-48 181
MsG0380015483.01.T01 AT3G46420 41.393 244 119 4 388 618 526 758 7.07e-48 181
MsG0380015483.01.T01 AT4G04570 33.742 326 165 6 275 587 97 384 7.51e-48 173
MsG0380015483.01.T01 AT1G51890 42.358 229 111 5 379 594 492 712 7.80e-48 180
MsG0380015483.01.T01 AT2G23200 46.847 222 91 6 385 589 478 689 8.12e-48 180
MsG0380015483.01.T01 AT2G28930 41.270 252 116 6 383 610 68 311 8.39e-48 174
MsG0380015483.01.T01 AT1G69730 40.400 250 129 4 353 589 407 649 8.90e-48 180
MsG0380015483.01.T01 AT3G17410 41.423 239 123 4 386 610 60 295 1.15e-47 172
MsG0380015483.01.T01 AT3G17410 41.423 239 123 4 386 610 60 295 1.15e-47 172
MsG0380015483.01.T01 AT4G11900 44.292 219 104 3 383 588 456 669 1.17e-47 179
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MsG0380015483.01.T01 AT1G51790 38.224 259 136 5 350 594 534 782 1.24e-47 180
MsG0380015483.01.T01 AT1G76360 41.833 251 114 7 383 610 151 392 1.24e-47 174
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MsG0380015483.01.T01 AT1G61430 40.870 230 117 3 381 596 452 676 9.07e-47 177
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MsG0380015483.01.T01 AT5G18500 41.364 220 111 3 383 589 154 368 1.59e-46 171
MsG0380015483.01.T01 AT5G18500 41.364 220 111 3 383 589 154 368 1.59e-46 171
MsG0380015483.01.T01 AT5G18500 41.364 220 111 3 383 589 154 368 1.59e-46 171
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MsG0380015483.01.T01 AT1G51880 41.558 231 111 6 369 586 571 790 1.83e-46 177
MsG0380015483.01.T01 AT1G65800 35.216 301 159 6 305 587 441 723 1.86e-46 176
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MsG0380015483.01.T01 AT4G31110 41.667 228 115 3 376 590 434 656 2.94e-46 175
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MsG0380015483.01.T01 AT4G22130 33.907 407 220 12 221 589 204 599 5.61e-46 174
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MsG0380015483.01.T01 AT5G15730 43.519 216 99 5 383 585 104 309 5.86e-46 169
MsG0380015483.01.T01 AT1G67520 38.095 252 138 3 349 587 450 696 5.91e-46 175
MsG0380015483.01.T01 AT1G61370 39.076 238 123 4 383 606 489 718 6.00e-46 175
MsG0380015483.01.T01 AT1G61400 39.916 238 126 3 381 601 486 723 6.45e-46 174
MsG0380015483.01.T01 AT3G53840 37.586 290 157 4 348 616 299 585 6.71e-46 172
MsG0380015483.01.T01 AT1G61490 39.149 235 124 3 381 601 326 555 7.04e-46 173
MsG0380015483.01.T01 AT1G61420 40.367 218 112 2 383 587 332 544 7.07e-46 173
MsG0380015483.01.T01 AT5G45780 43.723 231 107 6 381 598 243 463 7.09e-46 171
MsG0380015483.01.T01 AT1G67520 38.095 252 138 3 349 587 457 703 7.40e-46 174
MsG0380015483.01.T01 AT1G61420 40.367 218 112 2 383 587 334 546 7.51e-46 173
MsG0380015483.01.T01 AT5G15730 43.519 216 97 5 383 585 104 307 7.59e-46 168
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MsG0380015483.01.T01 AT4G34500 40.991 222 111 6 383 589 133 349 1.33e-45 168
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MsG0380015483.01.T01 AT1G48210 39.583 240 128 4 385 610 58 294 1.83e-45 166
MsG0380015483.01.T01 AT1G48210 39.583 240 128 4 385 610 58 294 1.83e-45 166
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MsG0380015483.01.T01 AT1G61420 40.367 218 112 2 383 587 484 696 2.14e-45 173
MsG0380015483.01.T01 AT1G61490 39.149 235 124 3 381 601 450 679 2.22e-45 172
MsG0380015483.01.T01 AT1G61490 39.149 235 124 3 381 601 450 679 2.22e-45 172
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MsG0380015483.01.T01 AT1G61490 39.149 235 124 3 381 601 476 705 2.26e-45 173
MsG0380015483.01.T01 AT1G61490 39.149 235 124 3 381 601 476 705 2.26e-45 173
MsG0380015483.01.T01 AT1G71830 42.857 231 105 5 376 588 283 504 2.29e-45 171
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MsG0380015483.01.T01 AT1G48210 40.367 218 117 2 385 589 58 275 2.32e-45 164
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MsG0380015483.01.T01 AT2G14510 39.405 269 135 7 363 615 538 794 2.61e-45 173
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MsG0380015483.01.T01 AT1G09440 40.833 240 110 7 383 609 145 365 3.08e-45 167
MsG0380015483.01.T01 AT2G42960 41.176 238 113 6 383 605 171 396 3.16e-45 168
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MsG0380015483.01.T01 AT2G42960 41.176 238 113 6 383 605 171 396 3.16e-45 168
MsG0380015483.01.T01 AT2G42960 41.176 238 113 6 383 605 171 396 3.16e-45 168
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MsG0380015483.01.T01 AT2G13790 43.421 228 110 5 376 589 275 497 4.13e-45 170
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MsG0380015483.01.T01 AT1G07550 42.041 245 112 8 363 589 528 760 6.80e-45 172
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MsG0380015483.01.T01 AT1G56720 40.586 239 116 7 383 605 167 395 7.73e-45 167
MsG0380015483.01.T01 AT1G56720 40.586 239 116 7 383 605 167 395 7.73e-45 167
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MsG0380015483.01.T01 AT5G63710 41.256 223 112 4 381 589 240 457 1.80e-44 167
MsG0380015483.01.T01 AT4G27290 37.500 272 148 5 346 600 413 679 1.97e-44 170
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MsG0380015483.01.T01 AT1G61500 39.450 218 114 2 383 587 461 673 2.10e-44 170
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MsG0380015483.01.T01 AT2G25220 38.929 280 143 7 323 589 33 297 2.36e-44 163
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MsG0380015483.01.T01 AT5G11020 36.308 325 161 9 299 610 30 321 2.68e-44 163
MsG0380015483.01.T01 AT3G25560 43.891 221 101 4 383 589 300 511 2.73e-44 168
MsG0380015483.01.T01 AT1G78980 33.499 403 185 11 265 610 245 621 2.73e-44 169
MsG0380015483.01.T01 AT1G61360 40.171 234 119 4 383 601 405 632 2.92e-44 169
MsG0380015483.01.T01 AT1G61360 40.171 234 119 4 383 601 405 632 2.92e-44 169
MsG0380015483.01.T01 AT1G61360 40.171 234 119 4 383 601 405 632 2.92e-44 169
MsG0380015483.01.T01 AT4G04490 39.024 246 126 5 383 615 328 562 3.15e-44 168
MsG0380015483.01.T01 AT5G06740 40.948 232 118 6 381 598 328 554 3.23e-44 168
MsG0380015483.01.T01 AT5G06740 41.453 234 114 7 381 598 316 542 3.23e-44 168
MsG0380015483.01.T01 AT3G25560 43.891 221 101 4 383 589 300 511 3.24e-44 168
MsG0380015483.01.T01 AT5G63710 41.256 223 112 4 381 589 276 493 3.27e-44 167
MsG0380015483.01.T01 AT5G63710 41.256 223 112 4 381 589 275 492 3.40e-44 167
MsG0380015483.01.T01 AT3G16030 39.149 235 122 4 383 603 515 742 3.53e-44 170
MsG0380015483.01.T01 AT1G61360 40.171 234 119 4 383 601 486 713 3.61e-44 169
MsG0380015483.01.T01 AT4G27290 39.370 254 132 5 364 600 477 725 4.35e-44 169
MsG0380015483.01.T01 AT1G61390 40.086 232 120 3 383 601 508 733 5.01e-44 169
MsG0380015483.01.T01 AT2G25220 37.417 302 156 8 301 589 65 346 5.74e-44 163
MsG0380015483.01.T01 AT3G09010 39.076 238 116 6 377 590 20 252 5.76e-44 160
MsG0380015483.01.T01 AT2G25220 37.417 302 156 8 301 589 65 346 5.80e-44 163
MsG0380015483.01.T01 AT3G16030 40.367 218 112 2 383 587 536 748 6.08e-44 169
MsG0380015483.01.T01 AT4G11470 34.843 287 148 6 355 607 293 574 6.76e-44 167
MsG0380015483.01.T01 AT1G16130 38.554 249 132 4 352 587 375 615 7.16e-44 168
MsG0380015483.01.T01 AT1G24030 48.066 181 80 6 413 589 7 177 7.67e-44 158
MsG0380015483.01.T01 AT4G11470 34.843 287 148 6 355 607 298 579 7.96e-44 167
MsG0380015483.01.T01 AT4G35600 39.044 251 120 5 383 610 74 314 8.68e-44 162
MsG0380015483.01.T01 AT4G35600 39.044 251 120 5 383 610 75 315 9.31e-44 162
MsG0380015483.01.T01 AT4G23190 37.143 245 129 4 363 587 311 550 9.40e-44 166
MsG0380015483.01.T01 AT1G07570 44.211 190 99 3 422 611 2 184 9.71e-44 159
MsG0380015483.01.T01 AT1G70740 38.991 218 114 4 383 587 38 249 1.07e-43 162
MsG0380015483.01.T01 AT1G61380 39.908 218 113 2 383 587 329 541 1.18e-43 166
MsG0380015483.01.T01 AT1G21230 35.616 292 158 6 316 589 330 609 1.26e-43 167
MsG0380015483.01.T01 AT1G69910 38.491 265 122 5 383 615 312 567 1.27e-43 166
MsG0380015483.01.T01 AT1G16150 38.000 250 134 4 350 586 381 622 1.29e-43 167
MsG0380015483.01.T01 AT1G11280 39.224 232 122 3 383 600 481 707 1.31e-43 167
MsG0380015483.01.T01 AT1G70740 38.991 218 114 4 383 587 50 261 1.42e-43 162
MsG0380015483.01.T01 AT1G29750 36.491 285 155 7 366 637 639 910 1.42e-43 168
MsG0380015483.01.T01 AT1G11280 39.224 232 122 3 383 600 491 717 1.51e-43 167
MsG0380015483.01.T01 AT1G18390 41.379 261 120 9 353 589 293 544 1.58e-43 166
MsG0380015483.01.T01 AT1G11280 39.224 232 122 3 383 600 493 719 1.62e-43 167
MsG0380015483.01.T01 AT1G11280 39.224 232 122 3 383 600 503 729 1.69e-43 167
MsG0380015483.01.T01 AT1G29750 36.491 285 155 7 366 637 654 925 1.81e-43 168
MsG0380015483.01.T01 AT4G11480 35.252 278 147 5 358 607 287 559 1.85e-43 166
MsG0380015483.01.T01 AT3G09010 39.076 238 116 6 377 590 20 252 2.01e-43 160
MsG0380015483.01.T01 AT5G35580 42.291 227 104 5 383 589 64 283 2.01e-43 163
MsG0380015483.01.T01 AT1G11330 36.704 267 146 4 364 614 488 747 2.16e-43 167
MsG0380015483.01.T01 AT1G11330 36.704 267 146 4 364 614 490 749 2.37e-43 167
MsG0380015483.01.T01 AT5G42440 41.364 220 109 6 382 587 68 281 2.43e-43 159
MsG0380015483.01.T01 AT1G72300 43.668 229 107 6 379 591 787 1009 2.45e-43 168
MsG0380015483.01.T01 AT4G23190 37.143 245 129 4 363 587 233 472 2.56e-43 164
MsG0380015483.01.T01 AT4G23190 37.143 245 129 4 363 587 233 472 2.56e-43 164
MsG0380015483.01.T01 AT5G35580 42.291 227 104 5 383 589 76 295 2.61e-43 163
MsG0380015483.01.T01 AT1G11330 38.333 240 127 3 364 587 490 724 2.66e-43 166
MsG0380015483.01.T01 AT1G21250 38.129 278 139 7 360 616 378 643 2.72e-43 166
MsG0380015483.01.T01 AT1G74360 40.343 233 107 5 383 597 802 1020 2.84e-43 167
MsG0380015483.01.T01 AT1G61380 39.819 221 109 3 383 587 476 688 2.92e-43 167
MsG0380015483.01.T01 AT1G79670 36.863 255 138 5 358 597 349 595 3.12e-43 166
MsG0380015483.01.T01 AT1G18390 41.379 261 120 9 353 589 287 538 3.22e-43 165
MsG0380015483.01.T01 AT4G11480 37.795 254 125 5 382 607 308 556 3.25e-43 165
MsG0380015483.01.T01 AT5G58940 42.152 223 107 4 383 589 135 351 3.58e-43 162
MsG0380015483.01.T01 AT5G58940 42.152 223 107 4 383 589 135 351 3.58e-43 162
MsG0380015483.01.T01 AT5G58940 42.152 223 107 4 383 589 135 351 3.58e-43 162
MsG0380015483.01.T01 AT5G58940 42.152 223 107 4 383 589 135 351 3.58e-43 162
MsG0380015483.01.T01 AT2G13800 43.439 221 106 5 383 589 146 361 3.59e-43 162
MsG0380015483.01.T01 AT2G13800 43.439 221 106 5 383 589 146 361 3.59e-43 162
MsG0380015483.01.T01 AT4G23190 37.143 245 129 4 363 587 311 550 3.64e-43 165
MsG0380015483.01.T01 AT1G79670 36.863 255 138 5 358 597 386 632 3.73e-43 166
MsG0380015483.01.T01 AT2G19210 40.506 237 115 6 368 591 555 778 3.89e-43 167
MsG0380015483.01.T01 AT5G16000 38.202 267 131 6 347 588 253 510 6.19e-43 164
MsG0380015483.01.T01 AT5G66790 39.918 243 121 5 383 610 302 534 6.80e-43 164
MsG0380015483.01.T01 AT5G65240 41.778 225 104 6 383 589 272 487 6.93e-43 164
MsG0380015483.01.T01 AT1G11340 41.096 219 109 3 383 587 503 715 7.49e-43 166
MsG0380015483.01.T01 AT4G20140 45.000 220 99 8 387 586 943 1160 7.66e-43 166
MsG0380015483.01.T01 AT2G19130 44.700 217 102 6 383 587 483 693 8.06e-43 166
MsG0380015483.01.T01 AT1G61550 41.096 219 109 3 383 587 477 689 8.09e-43 165
MsG0380015483.01.T01 AT1G70530 43.578 218 104 4 383 587 311 522 8.78e-43 162
MsG0380015483.01.T01 AT4G11530 40.773 233 119 4 382 600 339 566 8.81e-43 164
MsG0380015483.01.T01 AT1G11340 41.096 219 109 3 383 587 571 783 9.39e-43 165
MsG0380015483.01.T01 AT2G23450 40.329 243 116 6 383 610 336 564 9.44e-43 164
MsG0380015483.01.T01 AT2G23450 40.329 243 116 6 383 610 336 564 9.44e-43 164
MsG0380015483.01.T01 AT5G65240 41.778 225 104 6 383 589 272 487 1.13e-42 163
MsG0380015483.01.T01 AT1G70520 39.689 257 134 5 383 626 313 561 1.34e-42 163
MsG0380015483.01.T01 AT2G13800 43.439 221 106 5 383 589 263 478 1.40e-42 162
MsG0380015483.01.T01 AT2G13800 43.439 221 106 5 383 589 263 478 1.40e-42 162
MsG0380015483.01.T01 AT4G03230 39.908 218 113 2 383 587 513 725 1.63e-42 165
MsG0380015483.01.T01 AT2G28940 42.387 243 110 5 383 600 90 327 1.69e-42 160
MsG0380015483.01.T01 AT1G56145 38.017 242 115 3 379 586 671 911 1.81e-42 165

Find 140 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 199 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GCACAATAATTTATTGTTTA+TGG 0.040892 3:-70852927 MsG0380015483.01.T01:CDS
AGCTTTGGTATTGTGTATTT+TGG 0.165284 3:-70852649 MsG0380015483.01.T01:CDS
TTCTCATTCCAGAACAAAAT+TGG 0.204287 3:-70852679 MsG0380015483.01.T01:CDS
GACATTGACAACAGGATTAT+TGG 0.237869 3:-70852992 MsG0380015483.01.T01:CDS
ATCTGAGGCGGTCGAGTTAA+TGG 0.251494 3:-70851914 None:intergenic
ACAGCAAGAGTATCTGATTT+TGG 0.252678 3:-70852236 MsG0380015483.01.T01:CDS
GAAAGGTTACAGAACGAGTT+TGG 0.281915 3:-70853586 MsG0380015483.01.T01:CDS
GTAGCAATTTGTTGAATTCA+TGG 0.301902 3:-70852382 MsG0380015483.01.T01:CDS
TTGTAATCAATATCAGATTC+TGG 0.303644 3:+70852197 None:intergenic
CTGGTGAATTGATGAAATTT+TGG 0.307646 3:-70851974 MsG0380015483.01.T01:CDS
GTCATTAGAGTAAAGTCTTT+TGG 0.309346 3:+70853819 None:intergenic
GTTTAGTCTTTCTGAGCTTA+TGG 0.311235 3:-70852716 MsG0380015483.01.T01:CDS
TCAGCCTCTGCCCATGCTTT+AGG 0.320640 3:-70854060 MsG0380015483.01.T01:CDS
GATAAGAACAATGTAGAAAA+AGG 0.338490 3:-70852404 MsG0380015483.01.T01:CDS
TGAACTGGTGGAGGCGGCGG+CGG 0.345958 3:+70853063 None:intergenic
GTATTACTTGAATTGTTAAC+TGG 0.352145 3:-70852077 MsG0380015483.01.T01:CDS
TTTGATGGATTTCAGCCATC+TGG 0.353041 3:-70853709 MsG0380015483.01.T01:CDS
AAAATTGGTGCTGGAAGCTT+TGG 0.353530 3:-70852664 MsG0380015483.01.T01:CDS
GAACTGGTGGAGGCGGCGGC+GGG 0.358212 3:+70853064 None:intergenic
CTACTACCTCTTGTGACTGT+TGG 0.369301 3:+70852859 None:intergenic
CGATGTTGGAGAACATTTGA+TGG 0.370891 3:-70853724 MsG0380015483.01.T01:CDS
CAATTCAGTTCAATTTCATC+TGG 0.371034 3:-70853679 MsG0380015483.01.T01:CDS
TATATCGATCCCGAGTACTA+TGG 0.371524 3:-70852146 MsG0380015483.01.T01:CDS
TTATGGACAGGTGTTTGTTT+TGG 0.371644 3:-70852910 MsG0380015483.01.T01:CDS
GTAACTACAGTTTACATTGC+TGG 0.374385 3:-70853861 MsG0380015483.01.T01:CDS
TCTTGATGCTTTGTTGATGA+AGG 0.383243 3:+70852751 None:intergenic
GGAGAAAGATGAGAGGCTTT+TGG 0.396134 3:-70852471 MsG0380015483.01.T01:CDS
GGTGCTGGTGGAGGTTGAAC+TGG 0.400000 3:+70853048 None:intergenic
TGGTTCACAAGTTCGTTGTT+GGG 0.401224 3:-70853626 MsG0380015483.01.T01:CDS
CTGGTTCACAAGTTCGTTGT+TGG 0.401575 3:-70853627 MsG0380015483.01.T01:CDS
ACCGTATGCGGGATCGTATC+AGG 0.410822 3:-70854000 MsG0380015483.01.T01:CDS
TGAAAGATAGAAGATGATTA+TGG 0.414051 3:+70854080 None:intergenic
AAAGGTTACAGAACGAGTTT+GGG 0.418468 3:-70853585 MsG0380015483.01.T01:CDS
ACAGCAAAGAGTGATGTATA+TGG 0.418796 3:-70852110 MsG0380015483.01.T01:CDS
TGTTGAATTCATGGAAAATG+AGG 0.422497 3:-70852373 MsG0380015483.01.T01:CDS
GTTTGTGGTTTGAATTCAAC+TGG 0.429555 3:-70853523 MsG0380015483.01.T01:CDS
TAACTACAGTTTACATTGCT+GGG 0.436145 3:-70853860 MsG0380015483.01.T01:CDS
ATATCTCTATGAATTATTGA+AGG 0.436982 3:+70852293 None:intergenic
GGTTGAACTGGTGGAGGCGG+CGG 0.447971 3:+70853060 None:intergenic
TTTGCAATTGTTGGATCAGT+GGG 0.447991 3:-70852967 MsG0380015483.01.T01:CDS
ACATTCTTCTTGATTCAACT+TGG 0.448542 3:-70852259 MsG0380015483.01.T01:CDS
TGTAAAGGAAGTAACAGTTC+TGG 0.449659 3:-70853490 MsG0380015483.01.T01:CDS
GGAGGAGAAGGTGCCGGTGC+TGG 0.451196 3:+70853033 None:intergenic
TGTGCTACTGTGGTTGGTGT+TGG 0.451954 3:-70853754 MsG0380015483.01.T01:CDS
ATAATTTATTGTTTATGGAC+AGG 0.456252 3:-70852922 MsG0380015483.01.T01:CDS
ACGATCCCGCATACGGTGGC+AGG 0.459084 3:+70854006 None:intergenic
CATGTTTGTGCTACTGTGGT+TGG 0.460023 3:-70853760 MsG0380015483.01.T01:CDS
TTATTAGAGAATCTCTCTGT+TGG 0.461965 3:-70853790 MsG0380015483.01.T01:CDS
GAAGGTGCCGGTGCTGGTGG+AGG 0.467641 3:+70853039 None:intergenic
GGAGGTTGAACTGGTGGAGG+CGG 0.474987 3:+70853057 None:intergenic
TCTGCCCATGCTTTAGGCTC+CGG 0.477212 3:-70854054 MsG0380015483.01.T01:CDS
ATTGAAGAAAATGAAACGTT+GGG 0.482901 3:+70853922 None:intergenic
TCATTACTTTCCGCCGGCGG+TGG 0.483683 3:+70851937 None:intergenic
TTCCAGAACAAAATTGGTGC+TGG 0.486599 3:-70852673 MsG0380015483.01.T01:CDS
TGTGACAGAGAGGGTGGTGC+CGG 0.491153 3:+70854035 None:intergenic
AAACACTTGGTTAGACTGGT+TGG 0.491374 3:-70852503 MsG0380015483.01.T01:CDS
GAAGATGATTATGGCGGTGA+CGG 0.492865 3:+70854089 None:intergenic
GGAGAAGGTGCCGGTGCTGG+TGG 0.495261 3:+70853036 None:intergenic
CGAGAATAATGAGGCGGCAG+AGG 0.495489 3:-70852780 MsG0380015483.01.T01:CDS
TCATAAACACTTGGTTAGAC+TGG 0.496503 3:-70852507 MsG0380015483.01.T01:CDS
CGATCGAAGACATTGACAAC+AGG 0.496835 3:-70853000 MsG0380015483.01.T01:CDS
TGTTGAAAACTTCTCCTTCA+CGG 0.503967 3:+70853950 None:intergenic
AAGAGTGATGTATATGGACT+TGG 0.506757 3:-70852104 MsG0380015483.01.T01:CDS
CATCAACAAAGCATCAAGAA+AGG 0.506922 3:-70852747 MsG0380015483.01.T01:CDS
GACTCCCCTGCCACCGTATG+CGG 0.509553 3:-70854012 MsG0380015483.01.T01:CDS
TGTGCTGTTAGAAGATTGAA+TGG 0.512390 3:-70853400 MsG0380015483.01.T01:intron
GTGTATGATTACATGAAGAA+TGG 0.515261 3:-70852449 MsG0380015483.01.T01:CDS
ACCTGATACGATCCCGCATA+CGG 0.516814 3:+70853999 None:intergenic
TTGATGGATTTCAGCCATCT+GGG 0.517383 3:-70853708 MsG0380015483.01.T01:CDS
CGAGACGATCGAGGAGGAGA+AGG 0.520396 3:+70853021 None:intergenic
ACTCCCCTGCCACCGTATGC+GGG 0.527491 3:-70854011 MsG0380015483.01.T01:CDS
GCTGGTGGTTCAAATGTTTG+TGG 0.527825 3:-70853538 MsG0380015483.01.T01:CDS
ATATTTAGGAATGGTGAAGA+TGG 0.528107 3:-70852044 MsG0380015483.01.T01:CDS
ATCAACAAAGCATCAAGAAA+GGG 0.533466 3:-70852746 MsG0380015483.01.T01:CDS
AGTTCAACCTCCACCAGCAC+CGG 0.537971 3:-70853046 MsG0380015483.01.T01:CDS
GCAATCAAGAGAGGCGAACC+AGG 0.541652 3:-70852601 MsG0380015483.01.T01:intron
GGAGCCTAAAGCATGGGCAG+AGG 0.541756 3:+70854056 None:intergenic
GATTGAAGAAAATGAAACGT+TGG 0.542296 3:+70853921 None:intergenic
TAAATTCAAACCATAGTACT+CGG 0.548153 3:+70852136 None:intergenic
GGTTCACAAGTTCGTTGTTG+GGG 0.549218 3:-70853625 MsG0380015483.01.T01:CDS
TGGCGGTGACGGCGATGAGA+TGG 0.551935 3:+70854100 None:intergenic
AGGGGAGTCTGTGACAGAGA+GGG 0.554864 3:+70854026 None:intergenic
GGCGGTGACGGCGATGAGAT+GGG 0.558015 3:+70854101 None:intergenic
GCAATTGTTGGATCAGTGGG+AGG 0.558961 3:-70852964 MsG0380015483.01.T01:CDS
GATCCCGCATACGGTGGCAG+GGG 0.561546 3:+70854008 None:intergenic
AATTCACCAGCCAAAATAGC+AGG 0.563947 3:+70851987 None:intergenic
AAAAGAGCTATATTTAGGAA+TGG 0.564167 3:-70852053 MsG0380015483.01.T01:CDS
AAGAAAATGAAACGTTGGGA+AGG 0.567111 3:+70853926 None:intergenic
GGTGGAGGTTGAACTGGTGG+AGG 0.567527 3:+70853054 None:intergenic
GATCGAGGAGGAGAAGGTGC+CGG 0.568122 3:+70853027 None:intergenic
CTCAAGAGTTGGACCACCGC+CGG 0.571942 3:-70851950 MsG0380015483.01.T01:CDS
TTTAGGAATGGTGAAGATGG+AGG 0.574960 3:-70852041 MsG0380015483.01.T01:CDS
GTGTTGGAACAGTGCGATGT+TGG 0.575871 3:-70853738 MsG0380015483.01.T01:CDS
TCAGATTCATTACTTTCCGC+CGG 0.576421 3:+70851931 None:intergenic
GATTCATTACTTTCCGCCGG+CGG 0.577691 3:+70851934 None:intergenic
ATTGCTTTGGATGCTTCAAG+AGG 0.577734 3:-70852344 MsG0380015483.01.T01:CDS
CGATCCCGCATACGGTGGCA+GGG 0.585172 3:+70854007 None:intergenic
ATAATGAGGCGGCAGAGGAG+TGG 0.585564 3:-70852775 MsG0380015483.01.T01:CDS
TGGATTTCAGCCATCTGGGT+CGG 0.589546 3:-70853704 MsG0380015483.01.T01:CDS
GGTGCCGGAGCCTAAAGCAT+GGG 0.590731 3:+70854050 None:intergenic
GCAAAATCAACTATACTCAA+AGG 0.591578 3:+70852014 None:intergenic
ATTGTGAGGAGAAAGATGAG+AGG 0.593707 3:-70852478 MsG0380015483.01.T01:CDS
CACATTCAGTGTTACCGTGA+AGG 0.601759 3:-70853964 MsG0380015483.01.T01:CDS
TCTATGTTGAGTATTGTAGC+TGG 0.601801 3:-70853556 MsG0380015483.01.T01:CDS
GATTGCTACCTCGCGACCAT+CGG 0.601965 3:+70852618 None:intergenic
GTTCTGGAATGAGAAATTGT+TGG 0.604159 3:+70852687 None:intergenic
TGGTGCCGGAGCCTAAAGCA+TGG 0.604786 3:+70854049 None:intergenic
GTTCTGTAACCTTTCAGCAA+CGG 0.605469 3:+70853594 None:intergenic
GTCTTCGATCGAGACGATCG+AGG 0.605679 3:+70853012 None:intergenic
GCGTTTACATCATAAACACT+TGG 0.607052 3:-70852516 MsG0380015483.01.T01:CDS
AAATCAGTCATTATGCGTCA+AGG 0.610447 3:-70852805 MsG0380015483.01.T01:CDS
AACTCAAAAGCACCACCTTG+TGG 0.611936 3:+70853454 None:intergenic
AAAGCATCAAGAAAGGGCAG+AGG 0.612493 3:-70852740 MsG0380015483.01.T01:CDS
AGCAACAGTTCAAATTCGAG+TGG 0.620187 3:-70852838 MsG0380015483.01.T01:CDS
AAAATTAGCCGATGGTCGCG+AGG 0.624368 3:-70852626 MsG0380015483.01.T01:CDS
GCTGGTGGAGGTTGAACTGG+TGG 0.624656 3:+70853051 None:intergenic
AAATTCAAACCATAGTACTC+GGG 0.630084 3:+70852137 None:intergenic
GGCGGAAAGTAATGAATCTG+AGG 0.636265 3:-70851929 MsG0380015483.01.T01:CDS
AAGAGTTGGACCACCGCCGG+CGG 0.639207 3:-70851947 MsG0380015483.01.T01:CDS
GGAGTCTGTGACAGAGAGGG+TGG 0.639961 3:+70854029 None:intergenic
ATGTTGAGTATTGTAGCTGG+TGG 0.640534 3:-70853553 MsG0380015483.01.T01:CDS
GTGCAACCAACAGTCACAAG+AGG 0.641669 3:-70852865 MsG0380015483.01.T01:CDS
CAGGGGAGTCTGTGACAGAG+AGG 0.642207 3:+70854025 None:intergenic
GAGATGGGTGGTGACAGAGA+TGG 0.647228 3:+70854116 None:intergenic
TGGGTGGTGACAGAGATGGA+AGG 0.648065 3:+70854120 None:intergenic
GTGGTGACAGAGATGGAAGG+TGG 0.652122 3:+70854123 None:intergenic
CGCGAGGTAGCAATCAAGAG+AGG 0.653331 3:-70852610 MsG0380015483.01.T01:CDS
GAGTTTGGTGATATAGCACT+TGG 0.658664 3:-70853436 MsG0380015483.01.T01:CDS
CTGAATTGATCCGACCCAGA+TGG 0.658671 3:+70853694 None:intergenic
GTCAAGGTTCGAGAATAATG+AGG 0.658835 3:-70852789 MsG0380015483.01.T01:CDS
TAGACTGGTTGGTTATTGTG+AGG 0.670429 3:-70852492 MsG0380015483.01.T01:CDS
GGTCAAATTGATGTTCCACA+AGG 0.685053 3:-70853469 MsG0380015483.01.T01:CDS
AAGATAGAAGATGATTATGG+CGG 0.687498 3:+70854083 None:intergenic
CAAATTGATGTTCCACAAGG+TGG 0.691980 3:-70853466 MsG0380015483.01.T01:CDS
ATAGCACTTGGTGATGAACA+TGG 0.695564 3:-70853424 MsG0380015483.01.T01:CDS
GGTGACGGCGATGAGATGGG+TGG 0.696964 3:+70854104 None:intergenic
GGAAAGTAATGAATCTGAGG+CGG 0.699753 3:-70851926 MsG0380015483.01.T01:CDS
TGATACGATCCCGCATACGG+TGG 0.704241 3:+70854002 None:intergenic
AAGGTTCGAGAATAATGAGG+CGG 0.714702 3:-70852786 MsG0380015483.01.T01:CDS
TTCGATCGAGACGATCGAGG+AGG 0.715086 3:+70853015 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATAATTTATTGTTTATGGAC+AGG - Chr3:70853127-70853146 MsG0380015483.01.T01:intron 20.0%
!! ATATCTCTATGAATTATTGA+AGG + Chr3:70853759-70853778 None:intergenic 20.0%
!! GCACAATAATTTATTGTTTA+TGG - Chr3:70853122-70853141 MsG0380015483.01.T01:intron 20.0%
! AAAAGAGCTATATTTAGGAA+TGG - Chr3:70853996-70854015 MsG0380015483.01.T01:CDS 25.0%
! AATGAGGATAAAAATTGCTT+TGG - Chr3:70853692-70853711 MsG0380015483.01.T01:CDS 25.0%
! ATTGAAGAAAATGAAACGTT+GGG + Chr3:70852130-70852149 None:intergenic 25.0%
! GATAAGAACAATGTAGAAAA+AGG - Chr3:70853645-70853664 MsG0380015483.01.T01:CDS 25.0%
! GTATTACTTGAATTGTTAAC+TGG - Chr3:70853972-70853991 MsG0380015483.01.T01:CDS 25.0%
! TAAATTCAAACCATAGTACT+CGG + Chr3:70853916-70853935 None:intergenic 25.0%
! TCAATCATTATGTTCTATTC+AGG - Chr3:70852920-70852939 MsG0380015483.01.T01:CDS 25.0%
! TGAAAGATAGAAGATGATTA+TGG + Chr3:70851972-70851991 None:intergenic 25.0%
! TTGTAATCAATATCAGATTC+TGG + Chr3:70853855-70853874 None:intergenic 25.0%
!! TTTCTGTGGATTTTATTGAA+GGG - Chr3:70852704-70852723 MsG0380015483.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTTCTGTGGATTTTATTGA+AGG - Chr3:70852703-70852722 MsG0380015483.01.T01:CDS 25.0%
!!! AATTTTTCTGTTGTTTGTTG+GGG - Chr3:70852783-70852802 MsG0380015483.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATATTTTTAAGCTTTGTACC+TGG + Chr3:70853469-70853488 None:intergenic 25.0%
!!! CAATTTTTCTGTTGTTTGTT+GGG - Chr3:70852782-70852801 MsG0380015483.01.T01:CDS 25.0%
!!! TATTTTTGTGGTTTAAGGTT+TGG - Chr3:70852166-70852185 MsG0380015483.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTATTGGTTTTTGCAATTGT+TGG - Chr3:70853073-70853092 MsG0380015483.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTGAATTCAACTGGTTTTT+TGG - Chr3:70852534-70852553 MsG0380015483.01.T01:intron 25.0%
AAATTCAAACCATAGTACTC+GGG + Chr3:70853915-70853934 None:intergenic 30.0%
AAGATAGAAGATGATTATGG+CGG + Chr3:70851969-70851988 None:intergenic 30.0%
ACATTCTTCTTGATTCAACT+TGG - Chr3:70853790-70853809 MsG0380015483.01.T01:CDS 30.0%
ATATTTAGGAATGGTGAAGA+TGG - Chr3:70854005-70854024 MsG0380015483.01.T01:CDS 30.0%
CAATTCAGTTCAATTTCATC+TGG - Chr3:70852370-70852389 MsG0380015483.01.T01:CDS 30.0%
CCAACAAACAACAGAAAAAT+TGG + Chr3:70852784-70852803 None:intergenic 30.0%
CTGGAAAAAGAGCTATATTT+AGG - Chr3:70853991-70854010 MsG0380015483.01.T01:CDS 30.0%
GAACATAATGATTGAGAATC+AGG + Chr3:70852915-70852934 None:intergenic 30.0%
GATTGAAGAAAATGAAACGT+TGG + Chr3:70852131-70852150 None:intergenic 30.0%
GCAAAATCAACTATACTCAA+AGG + Chr3:70854038-70854057 None:intergenic 30.0%
GTGTATGATTACATGAAGAA+TGG - Chr3:70853600-70853619 MsG0380015483.01.T01:CDS 30.0%
TAACTACAGTTTACATTGCT+GGG - Chr3:70852189-70852208 MsG0380015483.01.T01:CDS 30.0%
TGTTGAATTCATGGAAAATG+AGG - Chr3:70853676-70853695 MsG0380015483.01.T01:CDS 30.0%
TTATTAGAGAATCTCTCTGT+TGG - Chr3:70852259-70852278 MsG0380015483.01.T01:CDS 30.0%
TTCTCATTCCAGAACAAAAT+TGG - Chr3:70853370-70853389 MsG0380015483.01.T01:intron 30.0%
! ATCAACAAAGCATCAAGAAA+GGG - Chr3:70853303-70853322 MsG0380015483.01.T01:intron 30.0%
! CTGGTGAATTGATGAAATTT+TGG - Chr3:70854075-70854094 MsG0380015483.01.T01:CDS 30.0%
! CTGGTTCAAATTTTTCTTGT+GGG - Chr3:70852389-70852408 MsG0380015483.01.T01:CDS 30.0%
! GTCATTAGAGTAAAGTCTTT+TGG + Chr3:70852233-70852252 None:intergenic 30.0%
! GTTTCATTTTCTTCAATCTC+CGG - Chr3:70852133-70852152 MsG0380015483.01.T01:CDS 30.0%
! TTCTGTGGATTTTATTGAAG+GGG - Chr3:70852705-70852724 MsG0380015483.01.T01:CDS 30.0%
!! AGCTTTGGTATTGTGTATTT+TGG - Chr3:70853400-70853419 MsG0380015483.01.T01:intron 30.0%
!! CCAATTTTTCTGTTGTTTGT+TGG - Chr3:70852781-70852800 MsG0380015483.01.T01:CDS 30.0%
!! GTAGCAATTTGTTGAATTCA+TGG - Chr3:70853667-70853686 MsG0380015483.01.T01:CDS 30.0%
!! TATTTTGGAAAATTAGCCGA+TGG - Chr3:70853415-70853434 MsG0380015483.01.T01:CDS 30.0%
!! TCTGGTTCAAATTTTTCTTG+TGG - Chr3:70852388-70852407 MsG0380015483.01.T01:CDS 30.0%
!!! ACTGGTTTTTTGGTTTGTAA+AGG - Chr3:70852544-70852563 MsG0380015483.01.T01:intron 30.0%
!!! GAAGCTATTTTTGTGGTTTA+AGG - Chr3:70852161-70852180 MsG0380015483.01.T01:CDS 30.0%
!!! TCTGGTTCTAATTTTACTTG+TGG - Chr3:70852747-70852766 MsG0380015483.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTCTTTTGAGTTGATTGTTC+TGG - Chr3:70852729-70852748 MsG0380015483.01.T01:CDS 30.0%
AAAGGTTACAGAACGAGTTT+GGG - Chr3:70852464-70852483 MsG0380015483.01.T01:CDS 35.0%
AAATCAGTCATTATGCGTCA+AGG - Chr3:70853244-70853263 MsG0380015483.01.T01:intron 35.0%
AAGAAAATGAAACGTTGGGA+AGG + Chr3:70852126-70852145 None:intergenic 35.0%
AAGAGTGATGTATATGGACT+TGG - Chr3:70853945-70853964 MsG0380015483.01.T01:CDS 35.0%
ACAAAAATAGCTTCTTCCAC+CGG + Chr3:70852155-70852174 None:intergenic 35.0%
ACAGCAAAGAGTGATGTATA+TGG - Chr3:70853939-70853958 MsG0380015483.01.T01:CDS 35.0%
CTACAAGAAGATTGAACACA+AGG + Chr3:70852876-70852895 None:intergenic 35.0%
GACATTGACAACAGGATTAT+TGG - Chr3:70853057-70853076 MsG0380015483.01.T01:CDS 35.0%
GCGTTTACATCATAAACACT+TGG - Chr3:70853533-70853552 MsG0380015483.01.T01:CDS 35.0%
GTAACTACAGTTTACATTGC+TGG - Chr3:70852188-70852207 MsG0380015483.01.T01:CDS 35.0%
GTTTGTGGTTTGAATTCAAC+TGG - Chr3:70852526-70852545 MsG0380015483.01.T01:CDS 35.0%
TACAAACCAACAAAAACAGC+AGG - Chr3:70853870-70853889 MsG0380015483.01.T01:CDS 35.0%
TCATAAACACTTGGTTAGAC+TGG - Chr3:70853542-70853561 MsG0380015483.01.T01:CDS 35.0%
TGTAAAGGAAGTAACAGTTC+TGG - Chr3:70852559-70852578 MsG0380015483.01.T01:intron 35.0%
TGTTGAAAACTTCTCCTTCA+CGG + Chr3:70852102-70852121 None:intergenic 35.0%
TTTGCAATTGTTGGATCAGT+GGG - Chr3:70853082-70853101 MsG0380015483.01.T01:CDS 35.0%
! AATGGTTCTGTTGTTTGTTG+GGG - Chr3:70852667-70852686 MsG0380015483.01.T01:CDS 35.0%
! CATCAACAAAGCATCAAGAA+AGG - Chr3:70853302-70853321 MsG0380015483.01.T01:intron 35.0%
! GAAATTTTGGACTCAAGAGT+TGG - Chr3:70854088-70854107 MsG0380015483.01.T01:CDS 35.0%
! GAATGGTTCTGTTGTTTGTT+GGG - Chr3:70852666-70852685 MsG0380015483.01.T01:CDS 35.0%
! GTTTAGTCTTTCTGAGCTTA+TGG - Chr3:70853333-70853352 MsG0380015483.01.T01:intron 35.0%
! TCTATGTTGAGTATTGTAGC+TGG - Chr3:70852493-70852512 MsG0380015483.01.T01:CDS 35.0%
! TCTTGATGCTTTGTTGATGA+AGG + Chr3:70853301-70853320 None:intergenic 35.0%
! TGAATGGTTCTGTTGTTTGT+TGG - Chr3:70852665-70852684 MsG0380015483.01.T01:CDS 35.0%
! TGTGCTGTTAGAAGATTGAA+TGG - Chr3:70852649-70852668 MsG0380015483.01.T01:CDS 35.0%
! TTATGGACAGGTGTTTGTTT+TGG - Chr3:70853139-70853158 MsG0380015483.01.T01:intron 35.0%
! TTTTGCAATTGTTGGATCAG+TGG - Chr3:70853081-70853100 MsG0380015483.01.T01:CDS 35.0%
!! GTTCTGGAATGAGAAATTGT+TGG + Chr3:70853365-70853384 None:intergenic 35.0%
!! TCTTGTGGGATTTTGAAAAC+TGG - Chr3:70852403-70852422 MsG0380015483.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTTCATGTTTGTGCTACTG+TGG - Chr3:70852285-70852304 MsG0380015483.01.T01:CDS 35.0%
!!! ACAGCAAGAGTATCTGATTT+TGG - Chr3:70853813-70853832 MsG0380015483.01.T01:CDS 35.0%
AAACACTTGGTTAGACTGGT+TGG - Chr3:70853546-70853565 MsG0380015483.01.T01:CDS 40.0%
AAGGTTCGAGAATAATGAGG+CGG - Chr3:70853263-70853282 MsG0380015483.01.T01:intron 40.0%
AATTCACCAGCCAAAATAGC+AGG + Chr3:70854065-70854084 None:intergenic 40.0%
ACCAACAAAAACAGCAGGAA+CGG - Chr3:70853875-70853894 MsG0380015483.01.T01:CDS 40.0%
AGCAACAGTTCAAATTCGAG+TGG - Chr3:70853211-70853230 MsG0380015483.01.T01:intron 40.0%
ATTGTGAGGAGAAAGATGAG+AGG - Chr3:70853571-70853590 MsG0380015483.01.T01:CDS 40.0%
CAAATTGATGTTCCACAAGG+TGG - Chr3:70852583-70852602 MsG0380015483.01.T01:intron 40.0%
CAATCTTCTTGTAGTGAGTG+TGG - Chr3:70852882-70852901 MsG0380015483.01.T01:CDS 40.0%
CGATGTTGGAGAACATTTGA+TGG - Chr3:70852325-70852344 MsG0380015483.01.T01:CDS 40.0%
GAAAGGTTACAGAACGAGTT+TGG - Chr3:70852463-70852482 MsG0380015483.01.T01:CDS 40.0%
GGAAAGTAATGAATCTGAGG+CGG - Chr3:70854123-70854142 MsG0380015483.01.T01:CDS 40.0%
GGTCAAATTGATGTTCCACA+AGG - Chr3:70852580-70852599 MsG0380015483.01.T01:intron 40.0%
GTCAAGGTTCGAGAATAATG+AGG - Chr3:70853260-70853279 MsG0380015483.01.T01:intron 40.0%
GTGAAAAAACCGTTGCTGAA+AGG - Chr3:70852446-70852465 MsG0380015483.01.T01:CDS 40.0%
GTTCTGTAACCTTTCAGCAA+CGG + Chr3:70852458-70852477 None:intergenic 40.0%
TATATCGATCCCGAGTACTA+TGG - Chr3:70853903-70853922 MsG0380015483.01.T01:CDS 40.0%
TCAGATTCATTACTTTCCGC+CGG + Chr3:70854121-70854140 None:intergenic 40.0%
TCCTTTGTCTCGAATTCTTC+CGG - Chr3:70852848-70852867 MsG0380015483.01.T01:CDS 40.0%
TGGTTCACAAGTTCGTTGTT+GGG - Chr3:70852423-70852442 MsG0380015483.01.T01:CDS 40.0%
TTCCAGAACAAAATTGGTGC+TGG - Chr3:70853376-70853395 MsG0380015483.01.T01:intron 40.0%
TTTAGGAATGGTGAAGATGG+AGG - Chr3:70854008-70854027 MsG0380015483.01.T01:CDS 40.0%
TTTGATCCATTAGACCAACC+AGG + Chr3:70852810-70852829 None:intergenic 40.0%
! ATGTTGAGTATTGTAGCTGG+TGG - Chr3:70852496-70852515 MsG0380015483.01.T01:CDS 40.0%
! ATTGCTTTGGATGCTTCAAG+AGG - Chr3:70853705-70853724 MsG0380015483.01.T01:CDS 40.0%
! GAGTTTGGTGATATAGCACT+TGG - Chr3:70852613-70852632 MsG0380015483.01.T01:CDS 40.0%
! TAGACTGGTTGGTTATTGTG+AGG - Chr3:70853557-70853576 MsG0380015483.01.T01:CDS 40.0%
! TCATTTTCTTCAATCTCCGG+TGG - Chr3:70852136-70852155 MsG0380015483.01.T01:CDS 40.0%
! TTCCAGCACCAATTTTGTTC+TGG + Chr3:70853381-70853400 None:intergenic 40.0%
!! AAAATTGGTGCTGGAAGCTT+TGG - Chr3:70853385-70853404 MsG0380015483.01.T01:intron 40.0%
!! ATAGCACTTGGTGATGAACA+TGG - Chr3:70852625-70852644 MsG0380015483.01.T01:CDS 40.0%
!! GGTTGGTCTAATGGATCAAA+TGG - Chr3:70852810-70852829 MsG0380015483.01.T01:CDS 40.0%
!! TTGATGGATTTCAGCCATCT+GGG - Chr3:70852341-70852360 MsG0380015483.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTGATGGATTTCAGCCATC+TGG - Chr3:70852340-70852359 MsG0380015483.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTTGCAGTGCCTGCTATTT+TGG - Chr3:70854052-70854071 MsG0380015483.01.T01:CDS 40.0%
!!! GGTGGAAGAAGCTATTTTTG+TGG - Chr3:70852154-70852173 MsG0380015483.01.T01:CDS 40.0%
ACAAAAACAGCAGGAACGGT+TGG - Chr3:70853879-70853898 MsG0380015483.01.T01:CDS 45.0%
CACATTCAGTGTTACCGTGA+AGG - Chr3:70852085-70852104 MsG0380015483.01.T01:CDS 45.0%
CCTTTGTCTCGAATTCTTCC+GGG - Chr3:70852849-70852868 MsG0380015483.01.T01:CDS 45.0%
CGATCGAAGACATTGACAAC+AGG - Chr3:70853049-70853068 MsG0380015483.01.T01:CDS 45.0%
CTACTACCTCTTGTGACTGT+TGG + Chr3:70853193-70853212 None:intergenic 45.0%
CTGGTTCACAAGTTCGTTGT+TGG - Chr3:70852422-70852441 MsG0380015483.01.T01:CDS 45.0%
CTTTGTCTCGAATTCTTCCG+GGG - Chr3:70852850-70852869 MsG0380015483.01.T01:CDS 45.0%
GAAGATGATTATGGCGGTGA+CGG + Chr3:70851963-70851982 None:intergenic 45.0%
GCTGGTGGTTCAAATGTTTG+TGG - Chr3:70852511-70852530 MsG0380015483.01.T01:CDS 45.0%
GGCGGAAAGTAATGAATCTG+AGG - Chr3:70854120-70854139 MsG0380015483.01.T01:CDS 45.0%
GGTTCACAAGTTCGTTGTTG+GGG - Chr3:70852424-70852443 MsG0380015483.01.T01:CDS 45.0%
! AAAGCATCAAGAAAGGGCAG+AGG - Chr3:70853309-70853328 MsG0380015483.01.T01:intron 45.0%
! CATGTTTGTGCTACTGTGGT+TGG - Chr3:70852289-70852308 MsG0380015483.01.T01:CDS 45.0%
! CGGAAAAGGGGAATTTTCTG+TGG - Chr3:70852690-70852709 MsG0380015483.01.T01:CDS 45.0%
! GGAGAAAGATGAGAGGCTTT+TGG - Chr3:70853578-70853597 MsG0380015483.01.T01:CDS 45.0%
! TTGTTTGTTGGGGCGGAAAA+GGG - Chr3:70852677-70852696 MsG0380015483.01.T01:CDS 45.0%
!! AACTCAAAAGCACCACCTTG+TGG + Chr3:70852598-70852617 None:intergenic 45.0%
!! GGATCAGTGGGAGGTTTTAT+TGG - Chr3:70853094-70853113 MsG0380015483.01.T01:CDS 45.0%
!!! ACCGTTCCTGCTGTTTTTGT+TGG + Chr3:70853879-70853898 None:intergenic 45.0%
!!! CAAGGTGGTGCTTTTGAGTT+TGG - Chr3:70852598-70852617 MsG0380015483.01.T01:intron 45.0%
AAAATTAGCCGATGGTCGCG+AGG - Chr3:70853423-70853442 MsG0380015483.01.T01:CDS 50.0%
ACCTGATACGATCCCGCATA+CGG + Chr3:70852053-70852072 None:intergenic 50.0%
CCCGGAAGAATTCGAGACAA+AGG + Chr3:70852852-70852871 None:intergenic 50.0%
CTGAATTGATCCGACCCAGA+TGG + Chr3:70852358-70852377 None:intergenic 50.0%
GAAGATTGAACACAAGGCCC+CGG + Chr3:70852870-70852889 None:intergenic 50.0%
GATTCATTACTTTCCGCCGG+CGG + Chr3:70854118-70854137 None:intergenic 50.0%
GCAATTGTTGGATCAGTGGG+AGG - Chr3:70853085-70853104 MsG0380015483.01.T01:CDS 50.0%
GTGCAACCAACAGTCACAAG+AGG - Chr3:70853184-70853203 MsG0380015483.01.T01:intron 50.0%
GTGTTGGAACAGTGCGATGT+TGG - Chr3:70852311-70852330 MsG0380015483.01.T01:CDS 50.0%
TGGATTTCAGCCATCTGGGT+CGG - Chr3:70852345-70852364 MsG0380015483.01.T01:CDS 50.0%
! GGTTCTGTTGTTTGTTGGGG+CGG - Chr3:70852670-70852689 MsG0380015483.01.T01:CDS 50.0%
! GTTGTTTGTTGGGGCGGAAA+AGG - Chr3:70852676-70852695 MsG0380015483.01.T01:CDS 50.0%
! TCTGTTGTTTGTTGGGGACC+TGG - Chr3:70852789-70852808 MsG0380015483.01.T01:CDS 50.0%
! TGTGCTACTGTGGTTGGTGT+TGG - Chr3:70852295-70852314 MsG0380015483.01.T01:CDS 50.0%
! TGTTTGTTGGGGCGGAAAAG+GGG - Chr3:70852678-70852697 MsG0380015483.01.T01:CDS 50.0%
! TTGTTTGTTGGGGACCTGGT+TGG - Chr3:70852793-70852812 MsG0380015483.01.T01:CDS 50.0%
ACCGTATGCGGGATCGTATC+AGG - Chr3:70852049-70852068 MsG0380015483.01.T01:CDS 55.0%
AGGGGAGTCTGTGACAGAGA+GGG + Chr3:70852026-70852045 None:intergenic 55.0%
AGTTCAACCTCCACCAGCAC+CGG - Chr3:70853003-70853022 MsG0380015483.01.T01:CDS 55.0%
ATAATGAGGCGGCAGAGGAG+TGG - Chr3:70853274-70853293 MsG0380015483.01.T01:intron 55.0%
CGAGAATAATGAGGCGGCAG+AGG - Chr3:70853269-70853288 MsG0380015483.01.T01:intron 55.0%
CGCGAGGTAGCAATCAAGAG+AGG - Chr3:70853439-70853458 MsG0380015483.01.T01:CDS 55.0%
GAGATGGGTGGTGACAGAGA+TGG + Chr3:70851936-70851955 None:intergenic 55.0%
GATTGCTACCTCGCGACCAT+CGG + Chr3:70853434-70853453 None:intergenic 55.0%
GCAATCAAGAGAGGCGAACC+AGG - Chr3:70853448-70853467 MsG0380015483.01.T01:CDS 55.0%
GTCTTCGATCGAGACGATCG+AGG + Chr3:70853040-70853059 None:intergenic 55.0%
GTGGTGACAGAGATGGAAGG+TGG + Chr3:70851929-70851948 None:intergenic 55.0%
TCAGCCTCTGCCCATGCTTT+AGG - Chr3:70851989-70852008 MsG0380015483.01.T01:CDS 55.0%
TGATACGATCCCGCATACGG+TGG + Chr3:70852050-70852069 None:intergenic 55.0%
TGGGTGGTGACAGAGATGGA+AGG + Chr3:70851932-70851951 None:intergenic 55.0%
TTCGATCGAGACGATCGAGG+AGG + Chr3:70853037-70853056 None:intergenic 55.0%
! TCTGCCCATGCTTTAGGCTC+CGG - Chr3:70851995-70852014 MsG0380015483.01.T01:CDS 55.0%
!! TGGGGACCTGGTTGGTCTAA+TGG - Chr3:70852801-70852820 MsG0380015483.01.T01:CDS 55.0%
!!! GCAGTGCCTGCTATTTTGGC+TGG - Chr3:70854056-70854075 MsG0380015483.01.T01:CDS 55.0%
CAGGGGAGTCTGTGACAGAG+AGG + Chr3:70852027-70852046 None:intergenic 60.0%
CGAGACGATCGAGGAGGAGA+AGG + Chr3:70853031-70853050 None:intergenic 60.0%
CTCAAGAGTTGGACCACCGC+CGG - Chr3:70854099-70854118 MsG0380015483.01.T01:CDS 60.0%
GCTGGTGGAGGTTGAACTGG+TGG + Chr3:70853001-70853020 None:intergenic 60.0%
GGAGCCTAAAGCATGGGCAG+AGG + Chr3:70851996-70852015 None:intergenic 60.0%
GGAGGTTGAACTGGTGGAGG+CGG + Chr3:70852995-70853014 None:intergenic 60.0%
GGAGTCTGTGACAGAGAGGG+TGG + Chr3:70852023-70852042 None:intergenic 60.0%
GGTGGAGGTTGAACTGGTGG+AGG + Chr3:70852998-70853017 None:intergenic 60.0%
TCATTACTTTCCGCCGGCGG+TGG + Chr3:70854115-70854134 None:intergenic 60.0%
TGTGACAGAGAGGGTGGTGC+CGG + Chr3:70852017-70852036 None:intergenic 60.0%
! GATCGAGGAGGAGAAGGTGC+CGG + Chr3:70853025-70853044 None:intergenic 60.0%
! GGTGCCGGAGCCTAAAGCAT+GGG + Chr3:70852002-70852021 None:intergenic 60.0%
! TGGTGCCGGAGCCTAAAGCA+TGG + Chr3:70852003-70852022 None:intergenic 60.0%
!! GGTGCTGGTGGAGGTTGAAC+TGG + Chr3:70853004-70853023 None:intergenic 60.0%
AAGAGTTGGACCACCGCCGG+CGG - Chr3:70854102-70854121 MsG0380015483.01.T01:CDS 65.0%
ACGATCCCGCATACGGTGGC+AGG + Chr3:70852046-70852065 None:intergenic 65.0%
ACTCCCCTGCCACCGTATGC+GGG - Chr3:70852038-70852057 MsG0380015483.01.T01:CDS 65.0%
CGATCCCGCATACGGTGGCA+GGG + Chr3:70852045-70852064 None:intergenic 65.0%
GACTCCCCTGCCACCGTATG+CGG - Chr3:70852037-70852056 MsG0380015483.01.T01:CDS 65.0%
GATCCCGCATACGGTGGCAG+GGG + Chr3:70852044-70852063 None:intergenic 65.0%
GGTTGAACTGGTGGAGGCGG+CGG + Chr3:70852992-70853011 None:intergenic 65.0%
! GGCGGTGACGGCGATGAGAT+GGG + Chr3:70851951-70851970 None:intergenic 65.0%
! GGTGACGGCGATGAGATGGG+TGG + Chr3:70851948-70851967 None:intergenic 65.0%
! TGGCGGTGACGGCGATGAGA+TGG + Chr3:70851952-70851971 None:intergenic 65.0%
TGAACTGGTGGAGGCGGCGG+CGG + Chr3:70852989-70853008 None:intergenic 70.0%
!! GAAGGTGCCGGTGCTGGTGG+AGG + Chr3:70853013-70853032 None:intergenic 70.0%
!! GGAGAAGGTGCCGGTGCTGG+TGG + Chr3:70853016-70853035 None:intergenic 70.0%
!! GGAGGAGAAGGTGCCGGTGC+TGG + Chr3:70853019-70853038 None:intergenic 70.0%
GAACTGGTGGAGGCGGCGGC+GGG + Chr3:70852988-70853007 None:intergenic 75.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 70851917 70854154 70851917 ID=MsG0380015483.01;Name=MsG0380015483.01
Chr3 mRNA 70851917 70854154 70851917 ID=MsG0380015483.01.T01;Parent=MsG0380015483.01;Name=MsG0380015483.01.T01;_AED=0.15;_eAED=0.15;_QI=0|0|0|1|1|1|3|0|637
Chr3 exon 70853401 70854154 70853401 ID=MsG0380015483.01.T01:exon:23682;Parent=MsG0380015483.01.T01
Chr3 exon 70852602 70853129 70852602 ID=MsG0380015483.01.T01:exon:23681;Parent=MsG0380015483.01.T01
Chr3 exon 70851917 70852548 70851917 ID=MsG0380015483.01.T01:exon:23680;Parent=MsG0380015483.01.T01
Chr3 CDS 70853401 70854154 70853401 ID=MsG0380015483.01.T01:cds;Parent=MsG0380015483.01.T01
Chr3 CDS 70852602 70853129 70852602 ID=MsG0380015483.01.T01:cds;Parent=MsG0380015483.01.T01
Chr3 CDS 70851917 70852548 70851917 ID=MsG0380015483.01.T01:cds;Parent=MsG0380015483.01.T01
Gene Sequence

>MsG0380015483.01.T01

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Protein sequence

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