AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380016908.01

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MsG0380016908.01.T01 AT3G56760 44.340 212 117 1 10 220 170 381 1.24e-60 200
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MsG0380016908.01.T01 AT3G01090 40.000 220 122 4 2 219 77 288 6.85e-43 152
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MsG0380016908.01.T01 AT4G24400 39.720 214 116 6 10 219 52 256 2.82e-42 149
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MsG0380016908.01.T01 AT1G76040 60.606 99 39 0 122 220 29 127 3.03e-39 138
MsG0380016908.01.T01 AT1G48260 38.462 208 113 6 14 215 58 256 3.49e-39 140
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MsG0380016908.01.T01 AT2G26980 37.054 224 128 6 2 220 49 264 9.09e-39 139
MsG0380016908.01.T01 AT2G26980 37.383 214 121 6 2 210 49 254 1.04e-38 135
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MsG0380016908.01.T01 AT5G01810 35.683 227 132 7 2 223 47 264 9.16e-37 134
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MsG0380016908.01.T01 AT1G48260 40.782 179 92 5 43 215 1 171 1.43e-36 132
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MsG0380016908.01.T01 AT5G21222 35.268 224 132 7 2 220 48 263 7.01e-36 134
MsG0380016908.01.T01 AT5G21222 35.268 224 132 7 2 220 48 263 7.01e-36 134
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MsG0380016908.01.T01 AT2G37840 31.004 229 148 4 10 233 54 277 5.91e-31 120
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MsG0380016908.01.T01 AT1G29230 35.349 215 119 9 14 220 121 323 5.69e-30 117
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MsG0380016908.01.T01 AT5G04510 34.466 206 106 7 29 218 105 297 1.57e-28 109
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MsG0380016908.01.T01 AT4G33950 31.963 219 144 3 5 219 54 271 2.66e-28 110
MsG0380016908.01.T01 AT3G08730 32.086 187 118 4 29 214 195 373 4.04e-28 111
MsG0380016908.01.T01 AT3G08730 32.086 187 118 4 29 214 195 373 4.04e-28 111
MsG0380016908.01.T01 AT2G45490 31.795 195 125 4 13 206 67 254 5.51e-28 107
MsG0380016908.01.T01 AT1G10940 32.883 222 135 6 10 219 43 262 9.44e-28 108
MsG0380016908.01.T01 AT3G08720 32.086 187 118 4 29 214 201 379 1.05e-27 110
MsG0380016908.01.T01 AT3G08720 32.086 187 118 4 29 214 201 379 1.05e-27 110
MsG0380016908.01.T01 AT3G08720 32.086 187 118 4 29 214 201 379 1.05e-27 110
MsG0380016908.01.T01 AT3G08720 32.086 187 118 4 29 214 201 379 1.05e-27 110
MsG0380016908.01.T01 AT2G34180 36.757 185 104 7 41 220 130 306 1.71e-27 109
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MsG0380016908.01.T01 AT3G10540 34.483 203 102 7 29 213 106 295 2.25e-27 109
MsG0380016908.01.T01 AT1G45160 34.842 221 103 6 40 227 742 954 2.77e-27 110
MsG0380016908.01.T01 AT5G62310 35.981 214 92 6 40 216 826 1031 3.79e-27 109
MsG0380016908.01.T01 AT3G50500 31.944 216 141 5 10 221 62 275 1.28e-26 105
MsG0380016908.01.T01 AT5G66880 32.110 218 142 5 10 223 61 276 4.30e-26 104
MsG0380016908.01.T01 AT5G66880 32.110 218 142 5 10 223 61 276 4.30e-26 104
MsG0380016908.01.T01 AT3G50500 32.287 223 138 7 10 221 62 282 8.72e-26 103
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MsG0380016908.01.T01 AT3G45240 32.710 214 131 6 11 219 158 363 1.49e-25 103
MsG0380016908.01.T01 AT2G23030 31.651 218 143 4 10 223 43 258 1.49e-25 102
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MsG0380016908.01.T01 AT3G63280 32.632 190 116 7 43 227 79 261 4.36e-23 97.4
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MsG0380016908.01.T01 AT5G28290 31.500 200 117 7 43 233 79 267 1.10e-21 93.6
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MsG0380016908.01.T01 AT1G54610 37.647 170 90 7 12 172 162 324 1.41e-21 93.2
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MsG0380016908.01.T01 AT4G14350 30.472 233 115 5 25 214 176 404 1.70e-21 92.8
MsG0380016908.01.T01 AT4G14350 30.472 233 115 5 25 214 176 404 1.70e-21 92.8
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MsG0380016908.01.T01 AT3G04810 31.959 194 112 7 43 227 79 261 2.06e-21 92.8
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MsG0380016908.01.T01 AT1G54510 34.021 194 108 8 43 227 79 261 3.60e-21 92.0
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MsG0380016908.01.T01 AT1G51660 30.734 218 132 9 12 220 122 329 1.22e-17 81.3
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MsG0380016908.01.T01 AT1G09000 28.910 211 139 6 15 220 122 326 3.58e-17 80.5
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MsG0380016908.01.T01 AT1G32320 27.160 243 149 7 1 228 76 305 5.51e-17 78.6
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MsG0380016908.01.T01 AT3G05050 33.962 159 93 6 12 163 182 335 7.35e-17 79.7
MsG0380016908.01.T01 AT2G43790 28.462 260 139 9 8 231 103 351 9.20e-17 79.0
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MsG0380016908.01.T01 AT4G13020 27.731 238 137 7 13 221 48 279 1.45e-16 78.2
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MsG0380016908.01.T01 AT4G13020 27.778 252 142 8 1 221 46 288 1.66e-16 78.2
MsG0380016908.01.T01 AT4G13020 27.731 238 137 7 13 221 56 287 1.80e-16 78.2
MsG0380016908.01.T01 AT4G13020 27.731 238 137 7 13 221 56 287 1.81e-16 78.2
MsG0380016908.01.T01 AT4G13020 27.731 238 137 7 13 221 48 279 1.87e-16 78.2
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MsG0380016908.01.T01 AT1G53570 28.972 214 134 8 14 220 263 465 3.85e-16 77.4
MsG0380016908.01.T01 AT1G53570 28.972 214 134 8 14 220 263 465 4.16e-16 77.4
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MsG0380016908.01.T01 AT3G58640 30.631 222 131 10 4 207 587 803 4.23e-16 77.4
MsG0380016908.01.T01 AT4G36450 29.098 244 130 10 12 220 76 311 4.26e-16 76.6
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MsG0380016908.01.T01 AT2G23080 26.295 251 139 8 19 231 80 322 1.23e-15 75.1
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MsG0380016908.01.T01 AT5G63370 29.817 218 110 9 42 221 377 589 3.12e-15 74.7
MsG0380016908.01.T01 AT5G63370 35.772 123 71 4 53 172 256 373 3.33e-15 74.3
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MsG0380016908.01.T01 AT5G39420 31.737 167 104 5 12 172 149 311 4.63e-15 74.3
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MsG0380016908.01.T01 AT2G30040 27.358 212 138 8 15 220 64 265 7.24e-15 73.6
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MsG0380016908.01.T01 AT4G26070 24.464 233 158 9 1 220 96 323 1.09e-13 69.7
MsG0380016908.01.T01 AT2G05060 28.947 228 133 9 10 220 55 270 1.14e-13 69.3
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MsG0380016908.01.T01 AT5G40440 27.313 227 154 7 1 221 96 317 1.95e-13 69.3
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MsG0380016908.01.T01 AT1G01560 29.825 171 103 4 1 169 88 243 3.44e-13 67.8
MsG0380016908.01.T01 AT1G57700 32.738 168 101 7 12 172 190 352 3.54e-13 68.9
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MsG0380016908.01.T01 AT5G19010 29.020 255 137 11 6 221 63 312 3.61e-13 68.6
MsG0380016908.01.T01 AT4G14480 28.571 175 106 6 8 167 55 225 4.28e-13 68.6
MsG0380016908.01.T01 AT1G07150 27.703 148 98 4 75 220 134 274 4.67e-13 68.2
MsG0380016908.01.T01 AT4G19110 27.500 240 131 9 27 234 5 233 4.69e-13 68.2
MsG0380016908.01.T01 AT1G07150 27.703 148 98 4 75 220 120 260 4.77e-13 68.2
MsG0380016908.01.T01 AT2G24360 25.758 198 129 6 24 213 187 374 5.09e-13 68.2
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MsG0380016908.01.T01 AT5G57565 39.326 89 48 3 43 131 34 116 6.41e-13 64.3
MsG0380016908.01.T01 AT2G32850 27.706 231 134 11 12 219 70 290 6.71e-13 67.8
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MsG0380016908.01.T01 AT3G59410 29.412 187 101 6 68 233 563 739 8.45e-13 67.8
MsG0380016908.01.T01 AT3G59410 29.412 187 101 6 68 233 563 739 8.45e-13 67.8
MsG0380016908.01.T01 AT3G59410 29.412 187 101 6 68 233 564 740 8.53e-13 67.8
MsG0380016908.01.T01 AT3G59410 29.412 187 101 6 68 233 587 763 8.55e-13 67.8
MsG0380016908.01.T01 AT2G32850 27.706 231 134 11 12 219 70 290 8.56e-13 67.8
MsG0380016908.01.T01 AT3G59410 29.412 187 101 6 68 233 563 739 9.16e-13 67.8
MsG0380016908.01.T01 AT2G05940 32.386 176 100 8 1 163 121 290 1.08e-12 67.0
MsG0380016908.01.T01 AT5G01850 34.286 105 58 2 74 169 149 251 1.11e-12 67.0
MsG0380016908.01.T01 AT5G40540 31.138 167 100 5 14 169 73 235 1.13e-12 66.2
MsG0380016908.01.T01 AT2G17520 27.477 222 135 9 10 220 493 699 1.44e-12 67.0
MsG0380016908.01.T01 AT3G18040 30.899 178 101 7 1 171 180 342 1.85e-12 66.6
MsG0380016908.01.T01 AT5G40540 31.210 157 94 4 24 169 6 159 1.94e-12 65.5
MsG0380016908.01.T01 AT3G18040 30.899 178 101 7 1 171 66 228 2.13e-12 66.2
MsG0380016908.01.T01 AT3G18040 30.899 178 101 7 1 171 71 233 2.18e-12 66.2
MsG0380016908.01.T01 AT3G18040 30.899 178 101 7 1 171 180 342 2.41e-12 66.2
MsG0380016908.01.T01 AT5G40540 32.609 138 80 3 43 169 3 138 3.08e-12 64.7
MsG0380016908.01.T01 AT3G46140 28.500 200 118 9 40 221 173 365 3.11e-12 65.5
MsG0380016908.01.T01 AT4G23320 35.593 118 65 5 53 163 268 381 4.00e-12 65.5
MsG0380016908.01.T01 AT4G23320 35.593 118 65 5 53 163 268 381 4.00e-12 65.5
MsG0380016908.01.T01 AT5G27510 27.350 234 143 8 7 221 40 265 4.68e-12 64.7
MsG0380016908.01.T01 AT4G23320 35.593 118 65 5 53 163 289 402 4.69e-12 65.5
MsG0380016908.01.T01 AT2G31800 26.728 217 137 6 3 207 225 431 5.11e-12 65.1
MsG0380016908.01.T01 AT1G73670 28.627 255 133 10 1 221 138 377 5.32e-12 65.1
MsG0380016908.01.T01 AT2G45910 30.899 178 106 7 41 206 547 719 5.64e-12 65.5
MsG0380016908.01.T01 AT2G45910 30.899 178 106 7 41 206 547 719 5.64e-12 65.5
MsG0380016908.01.T01 AT2G40580 30.047 213 111 9 42 234 89 283 5.79e-12 64.7
MsG0380016908.01.T01 AT1G18150 32.022 178 99 7 1 171 152 314 6.29e-12 65.1
MsG0380016908.01.T01 AT1G18150 32.022 178 99 7 1 171 152 314 6.29e-12 65.1
MsG0380016908.01.T01 AT1G18150 32.022 178 99 7 1 171 152 314 6.29e-12 65.1
MsG0380016908.01.T01 AT3G14720 30.337 178 102 7 1 171 73 235 7.96e-12 64.7
MsG0380016908.01.T01 AT3G14720 30.337 178 102 7 1 171 73 235 7.96e-12 64.7
MsG0380016908.01.T01 AT1G65790 29.940 167 100 6 7 163 558 717 1.34e-11 64.3
MsG0380016908.01.T01 AT5G66710 29.609 179 108 7 4 170 109 281 1.35e-11 63.9
MsG0380016908.01.T01 AT3G22750 27.660 188 117 8 43 221 170 347 1.37e-11 63.9
MsG0380016908.01.T01 AT4G27290 30.952 168 99 6 6 163 549 709 1.42e-11 64.3
MsG0380016908.01.T01 AT1G53510 28.829 222 127 10 1 210 73 275 1.43e-11 63.9
MsG0380016908.01.T01 AT3G18040 37.037 108 58 4 71 171 41 145 1.46e-11 63.9
MsG0380016908.01.T01 AT3G14720 30.337 178 102 7 1 171 73 235 1.54e-11 63.9
MsG0380016908.01.T01 AT4G27290 30.952 168 99 6 6 163 503 663 1.72e-11 63.9
MsG0380016908.01.T01 AT3G45790 29.101 189 109 9 40 210 173 354 1.74e-11 63.5
MsG0380016908.01.T01 AT1G65800 29.940 167 100 6 7 163 562 721 1.82e-11 63.9
MsG0380016908.01.T01 AT3G51630 29.730 148 99 3 40 184 100 245 1.87e-11 63.5
MsG0380016908.01.T01 AT3G51630 29.730 148 99 3 40 184 100 245 1.87e-11 63.5
MsG0380016908.01.T01 AT3G46930 34.737 95 58 2 74 167 213 304 1.98e-11 63.2
MsG0380016908.01.T01 AT4G18710 41.000 100 54 3 74 170 141 238 2.08e-11 62.8
MsG0380016908.01.T01 AT3G63260 26.374 182 125 5 43 220 183 359 2.13e-11 63.2
MsG0380016908.01.T01 AT4G23150 31.875 160 93 7 15 163 380 534 2.42e-11 63.5
MsG0380016908.01.T01 AT4G31170 27.950 161 109 4 14 171 179 335 2.45e-11 63.2
MsG0380016908.01.T01 AT4G31170 27.950 161 109 4 14 171 179 335 2.45e-11 63.2
MsG0380016908.01.T01 AT4G31170 27.950 161 109 4 14 171 179 335 2.45e-11 63.2
MsG0380016908.01.T01 AT4G31170 27.950 161 109 4 14 171 179 335 2.45e-11 63.2
MsG0380016908.01.T01 AT4G31170 27.950 161 109 4 14 171 179 335 2.45e-11 63.2
MsG0380016908.01.T01 AT4G31170 27.950 161 109 4 14 171 179 335 2.45e-11 63.2
MsG0380016908.01.T01 AT4G31170 27.950 161 109 4 14 171 179 335 2.45e-11 63.2
MsG0380016908.01.T01 AT2G41910 34.483 145 75 7 41 168 83 224 2.59e-11 62.8
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MsG0380016908.01.T01 AT3G46930 34.737 95 58 2 74 167 274 365 2.74e-11 63.2
MsG0380016908.01.T01 AT4G28860 33.571 140 76 5 43 169 80 215 3.34e-11 62.8
MsG0380016908.01.T01 AT3G46930 34.737 95 58 2 74 167 309 400 3.49e-11 62.8
MsG0380016908.01.T01 AT3G46930 34.737 95 58 2 74 167 309 400 3.53e-11 62.8
MsG0380016908.01.T01 AT3G46930 34.737 95 58 2 74 167 274 365 3.56e-11 62.8
MsG0380016908.01.T01 AT2G01450 28.652 178 110 7 6 171 54 226 3.69e-11 62.8
MsG0380016908.01.T01 AT2G01450 28.652 178 110 7 6 171 54 226 3.69e-11 62.8
MsG0380016908.01.T01 AT2G01450 28.652 178 110 7 6 171 54 226 3.69e-11 62.8
MsG0380016908.01.T01 AT2G01450 28.652 178 110 7 6 171 54 226 3.69e-11 62.8
MsG0380016908.01.T01 AT2G42880 30.337 178 102 7 1 171 73 235 3.87e-11 62.8
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MsG0380016908.01.T01 AT1G21590 26.667 225 120 8 16 220 438 637 4.22e-11 62.8
MsG0380016908.01.T01 AT3G06620 33.125 160 96 7 14 167 538 692 4.46e-11 62.8
MsG0380016908.01.T01 AT2G42880 30.337 178 102 7 1 171 73 235 4.58e-11 62.4
MsG0380016908.01.T01 AT1G29730 31.447 159 89 7 16 163 688 837 4.67e-11 62.8
MsG0380016908.01.T01 AT5G06740 27.374 179 114 6 11 177 369 543 5.33e-11 62.4
MsG0380016908.01.T01 AT2G19470 31.613 155 73 6 36 178 90 223 5.45e-11 62.0
MsG0380016908.01.T01 AT4G04960 28.319 226 125 12 24 220 400 617 5.89e-11 62.4
MsG0380016908.01.T01 AT5G06740 27.374 179 114 6 11 177 381 555 5.89e-11 62.4
MsG0380016908.01.T01 AT1G29720 34.014 147 82 6 27 163 728 869 5.96e-11 62.4
MsG0380016908.01.T01 AT5G11850 26.941 219 141 9 15 224 654 862 6.37e-11 62.4
MsG0380016908.01.T01 AT4G28540 33.333 120 64 4 71 178 112 227 6.79e-11 62.0
MsG0380016908.01.T01 AT1G67890 30.380 158 102 5 14 167 531 684 7.30e-11 62.0
MsG0380016908.01.T01 AT4G28860 33.571 140 76 5 43 169 80 215 8.09e-11 61.6
MsG0380016908.01.T01 AT4G08800 32.308 130 66 5 61 178 72 191 9.03e-11 60.8
MsG0380016908.01.T01 AT1G67890 30.380 158 102 5 14 167 531 684 9.40e-11 61.6
MsG0380016908.01.T01 AT1G67890 30.380 158 102 5 14 167 531 684 9.40e-11 61.6

Find 47 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 103 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ACTCTCAAAATTATTGATTT+TGG 0.045337 3:+89328824 MsG0380016908.01.T01:CDS
AACTATATTTCTAATCAATT+TGG 0.216435 3:-89328711 None:intergenic
ACACAAGGTTATCAGGTTTA+AGG 0.233777 3:-89328778 None:intergenic
TAAGCGGGGTGCCTCCGTTT+TGG 0.249111 3:+89329709 MsG0380016908.01.T01:CDS
ATTGAAGATTGTCATTCTAA+TGG 0.314634 3:+89328740 MsG0380016908.01.T01:CDS
TTGAAGATTGTCATTCTAAT+GGG 0.318373 3:+89328741 MsG0380016908.01.T01:CDS
GTATCAAACACAAGGTTATC+AGG 0.324211 3:-89328785 None:intergenic
AATAAGATACTTGCTCTATA+AGG 0.327797 3:-89330009 None:intergenic
CTGTTTGTTGATCCCCTCCT+TGG 0.331288 3:-89329845 None:intergenic
ACCTCTGGTGCAGTATAGCC+TGG 0.423907 3:-89329621 None:intergenic
GCACTCCAAATGTCTGCTTC+AGG 0.426410 3:-89329663 None:intergenic
ATGGACCTGAAGCAGACATT+TGG 0.437988 3:+89329658 MsG0380016908.01.T01:CDS
GTTTGATAGGATTGTGAAGA+AGG 0.439249 3:+89328664 MsG0380016908.01.T01:CDS
GAAACATTTAGTCAAGTTGT+TGG 0.446071 3:+89329594 MsG0380016908.01.T01:CDS
TTGATTAGAAATATAGTTGA+GGG 0.460590 3:+89328716 MsG0380016908.01.T01:CDS
AGTCAAGTTGTTGGAACCCC+AGG 0.470655 3:+89329603 MsG0380016908.01.T01:CDS
AAGGTGGTGAGTTGTTTGAT+AGG 0.480005 3:+89328651 MsG0380016908.01.T01:CDS
GATGAAACTATTACGCATTG+AGG 0.492378 3:+89328505 None:intergenic
TTGGCACTGTCTGAAATTGA+AGG 0.493086 3:-89329907 None:intergenic
GAGGTCTTGAACGGGCATTA+TGG 0.493285 3:+89329639 MsG0380016908.01.T01:CDS
TTGAAAGGAATCCGGAGAAA+AGG 0.507068 3:+89329950 MsG0380016908.01.T01:CDS
TAATGCCCGTTCAAGACCTC+TGG 0.511246 3:-89329636 None:intergenic
TTTGATAGGATTGTGAAGAA+GGG 0.526562 3:+89328665 MsG0380016908.01.T01:CDS
GAAGCAGACATTTGGAGTGC+CGG 0.534755 3:+89329666 MsG0380016908.01.T01:CDS
CCTCTGGTGCAGTATAGCCT+GGG 0.536066 3:-89329620 None:intergenic
CTGCACCAGAGGTCTTGAAC+GGG 0.536546 3:+89329631 MsG0380016908.01.T01:CDS
GAAAACTTTGTGAAAATCCA+TGG 0.538160 3:+89328581 MsG0380016908.01.T01:CDS
GATAATTTACCTCCCCAAAA+CGG 0.550561 3:-89329723 None:intergenic
TTCAATTTCAGACAGTGCCA+AGG 0.554669 3:+89329909 MsG0380016908.01.T01:CDS
ATAAATCTTCATAGATACCA+TGG 0.559353 3:-89328598 None:intergenic
ATTGATTAGAAATATAGTTG+AGG 0.590682 3:+89328715 MsG0380016908.01.T01:CDS
TTGATAGGATTGTGAAGAAG+GGG 0.592898 3:+89328666 MsG0380016908.01.T01:CDS
CTCTGGTGCAGTATAGCCTG+GGG 0.599484 3:-89329619 None:intergenic
TTTGTATTTCTTATTAAGCG+GGG 0.602317 3:+89329695 MsG0380016908.01.T01:CDS
TTACGATGATGTTCTGAGAG+AGG 0.603257 3:+89328529 MsG0380016908.01.T01:CDS
ACTGCACCAGAGGTCTTGAA+CGG 0.607574 3:+89329630 MsG0380016908.01.T01:CDS
TGAAGATTGTCATTCTAATG+GGG 0.608301 3:+89328742 MsG0380016908.01.T01:CDS
TAACCTACAGAGACCAAGGA+GGG 0.610754 3:+89329832 MsG0380016908.01.T01:intron
GTTATGGAGCTGTGTGAAGG+TGG 0.614258 3:+89328635 MsG0380016908.01.T01:CDS
TTGATTTGCAGTCTAAGCCG+TGG 0.614559 3:+89329884 MsG0380016908.01.T01:CDS
TTGGTTATGGAGCTGTGTGA+AGG 0.625965 3:+89328632 MsG0380016908.01.T01:CDS
CTGTCTGAAATTGAAGGCCA+CGG 0.632704 3:-89329901 None:intergenic
CCCAGGCTATACTGCACCAG+AGG 0.637073 3:+89329620 MsG0380016908.01.T01:CDS
TAAGAAATACAAAATAACGC+CGG 0.669744 3:-89329685 None:intergenic
AACCTACAGAGACCAAGGAG+GGG 0.676140 3:+89329833 MsG0380016908.01.T01:intron
AATTTACCTCCCCAAAACGG+AGG 0.704130 3:-89329720 None:intergenic
TTAACCTACAGAGACCAAGG+AGG 0.760856 3:+89329831 MsG0380016908.01.T01:intron

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
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!! TTAAGTATATATATCATGAA+AGG - Chr3:89329552-89329571 None:intergenic 15.0%
!!! AACTATATTTCTAATCAATT+TGG - Chr3:89328714-89328733 None:intergenic 15.0%
!!! ATTTTGTATTTCTTATTAAG+CGG + Chr3:89329693-89329712 MsG0380016908.01.T01:CDS 15.0%
!!! GAAATTATTTTAAATTTTGG+TGG + Chr3:89328991-89329010 MsG0380016908.01.T01:intron 15.0%
!! ATTGATTAGAAATATAGTTG+AGG + Chr3:89328715-89328734 MsG0380016908.01.T01:CDS 20.0%
!! TTGATTAGAAATATAGTTGA+GGG + Chr3:89328716-89328735 MsG0380016908.01.T01:CDS 20.0%
!!! AAATTATCATTAGTTGATGT+AGG + Chr3:89329738-89329757 MsG0380016908.01.T01:intron 20.0%
!!! ACTCTCAAAATTATTGATTT+TGG + Chr3:89328824-89328843 MsG0380016908.01.T01:CDS 20.0%
!!! AGATTTATTTTCTTTTCACT+TGG + Chr3:89328613-89328632 MsG0380016908.01.T01:CDS 20.0%
!!! CTCTCAAAATTATTGATTTT+GGG + Chr3:89328825-89328844 MsG0380016908.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTTGTATTTCTTATTAAGC+GGG + Chr3:89329694-89329713 MsG0380016908.01.T01:CDS 20.0%
! AATAAGATACTTGCTCTATA+AGG - Chr3:89330012-89330031 None:intergenic 25.0%
! ATAAATCTTCATAGATACCA+TGG - Chr3:89328601-89328620 None:intergenic 25.0%
! ATAGAGAGAAAAAAAAAACC+TGG - Chr3:89328869-89328888 None:intergenic 25.0%
! ATTGAAGATTGTCATTCTAA+TGG + Chr3:89328740-89328759 MsG0380016908.01.T01:CDS 25.0%
! CAACAAGCATACTATATATT+TGG - Chr3:89329387-89329406 None:intergenic 25.0%
! TAAGAAATACAAAATAACGC+CGG - Chr3:89329688-89329707 None:intergenic 25.0%
! TTGAAGATTGTCATTCTAAT+GGG + Chr3:89328741-89328760 MsG0380016908.01.T01:CDS 25.0%
! TTTGTATTTCTTATTAAGCG+GGG + Chr3:89329695-89329714 MsG0380016908.01.T01:CDS 25.0%
!! AACAAATTGATGTGATTTTC+AGG + Chr3:89329570-89329589 MsG0380016908.01.T01:intron 25.0%
!! AATATATAGTATGCTTGTTG+AGG + Chr3:89329387-89329406 MsG0380016908.01.T01:intron 25.0%
!! ATTTTCTTTTCACTTGGTTA+TGG + Chr3:89328619-89328638 MsG0380016908.01.T01:CDS 25.0%
!!! TGATTTGAATCTTGTTGTTT+TGG + Chr3:89329019-89329038 MsG0380016908.01.T01:intron 25.0%
AAAAATGCTTGAAAGGAATC+CGG + Chr3:89329942-89329961 MsG0380016908.01.T01:CDS 30.0%
GAAAACTTTGTGAAAATCCA+TGG + Chr3:89328581-89328600 MsG0380016908.01.T01:CDS 30.0%
TACTTCGAAAAATGCTTGAA+AGG + Chr3:89329935-89329954 MsG0380016908.01.T01:CDS 30.0%
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TTGTAGAGTTCCTAATTGAT+GGG + Chr3:89329110-89329129 MsG0380016908.01.T01:intron 30.0%
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TTTGATAGGATTGTGAAGAA+GGG + Chr3:89328665-89328684 MsG0380016908.01.T01:CDS 30.0%
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! ATGCTTGTTGAGGAAATAAA+TGG + Chr3:89329397-89329416 MsG0380016908.01.T01:intron 30.0%
! GAAACATTTAGTCAAGTTGT+TGG + Chr3:89329594-89329613 MsG0380016908.01.T01:CDS 30.0%
! TTTTAGCAGTATCAAACACA+AGG - Chr3:89328796-89328815 None:intergenic 30.0%
ACACAAGGTTATCAGGTTTA+AGG - Chr3:89328781-89328800 None:intergenic 35.0%
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ATATATCATGAAAGGGCTTC+TGG - Chr3:89329544-89329563 None:intergenic 35.0%
CAGCACAATATTAGCATTAC+TGG - Chr3:89329803-89329822 None:intergenic 35.0%
CTTGTTGAGGAAATAAATGG+AGG + Chr3:89329400-89329419 MsG0380016908.01.T01:intron 35.0%
GATAATTTACCTCCCCAAAA+CGG - Chr3:89329726-89329745 None:intergenic 35.0%
GTATCAAACACAAGGTTATC+AGG - Chr3:89328788-89328807 None:intergenic 35.0%
GTTGTAGAGTTCCTAATTGA+TGG + Chr3:89329109-89329128 MsG0380016908.01.T01:intron 35.0%
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TGTGTAGTGTATACTCTTTG+AGG - Chr3:89329086-89329105 None:intergenic 35.0%
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!! CATTTTTCGAAGTAGATCCT+TGG - Chr3:89329929-89329948 None:intergenic 35.0%
!! TAAATGGAGGGTACTCAAAT+GGG + Chr3:89329413-89329432 MsG0380016908.01.T01:intron 35.0%
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ACACGACACTAACATTGACA+TGG + Chr3:89329200-89329219 MsG0380016908.01.T01:intron 40.0%
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! TTGGCACTGTCTGAAATTGA+AGG - Chr3:89329910-89329929 None:intergenic 40.0%
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TGTGTTCGTGCTCCAAATCA+TGG - Chr3:89329173-89329192 None:intergenic 45.0%
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! CTGTCTGAAATTGAAGGCCA+CGG - Chr3:89329904-89329923 None:intergenic 45.0%
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!! TTGATTTGCAGTCTAAGCCG+TGG + Chr3:89329884-89329903 MsG0380016908.01.T01:CDS 45.0%
!!! AAAGAAATTATTTTAAATTT+TGG + Chr3:89328988-89329007 MsG0380016908.01.T01:intron 5.0%
AACCTACAGAGACCAAGGAG+GGG + Chr3:89329833-89329852 MsG0380016908.01.T01:intron 50.0%
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GAGGTCTTGAACGGGCATTA+TGG + Chr3:89329639-89329658 MsG0380016908.01.T01:CDS 50.0%
GCACTCCAAATGTCTGCTTC+AGG - Chr3:89329666-89329685 None:intergenic 50.0%
GTTATGGAGCTGTGTGAAGG+TGG + Chr3:89328635-89328654 MsG0380016908.01.T01:CDS 50.0%
TAATGCCCGTTCAAGACCTC+TGG - Chr3:89329639-89329658 None:intergenic 50.0%
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! CTGTTTGTTGATCCCCTCCT+TGG - Chr3:89329848-89329867 None:intergenic 50.0%
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ACCTCTGGTGCAGTATAGCC+TGG - Chr3:89329624-89329643 None:intergenic 55.0%
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CCTCTGGTGCAGTATAGCCT+GGG - Chr3:89329623-89329642 None:intergenic 55.0%
CTCTGGTGCAGTATAGCCTG+GGG - Chr3:89329622-89329641 None:intergenic 55.0%
CTGCACCAGAGGTCTTGAAC+GGG + Chr3:89329631-89329650 MsG0380016908.01.T01:CDS 55.0%
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CCCAGGCTATACTGCACCAG+AGG + Chr3:89329620-89329639 MsG0380016908.01.T01:CDS 60.0%
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Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 89328506 89330038 89328506 ID=MsG0380016908.01;Name=MsG0380016908.01
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Chr3 exon 89329842 89330038 89329842 ID=MsG0380016908.01.T01:exon:3254;Parent=MsG0380016908.01.T01
Chr3 CDS 89328506 89328869 89328506 ID=MsG0380016908.01.T01:cds;Parent=MsG0380016908.01.T01
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Gene Sequence

>MsG0380016908.01.T01

ATGAAACTATTACGCATTGAGGATTACGATGATGTTCTGAGAGAGGTTCTAATAATGCAACATTTATCAAAAAGCGAAAACTTTGTGAAAATCCATGGTATCTATGAAGATTTATTTTCTTTTCACTTGGTTATGGAGCTGTGTGAAGGTGGTGAGTTGTTTGATAGGATTGTGAAGAAGGGGCGTTATAGTGAGAGAAAAGCTGCCAAATTGATTAGAAATATAGTTGAGGGTATTGAAGATTGTCATTCTAATGGGGTTATGCATAGAGACCTTAAACCTGATAACCTTGTGTTTGATACTGCTAAAAAAGATGCAACTCTCAAAATTATTGATTTTGGGTTGTCTACTTTTTACAAGCCAGGTGAAACATTTAGTCAAGTTGTTGGAACCCCAGGCTATACTGCACCAGAGGTCTTGAACGGGCATTATGGACCTGAAGCAGACATTTGGAGTGCCGGCGTTATTTTGTATTTCTTATTAAGCGGGGTGCCTCCGTTTTGGGGAGAGACCAAGGAGGGGATCAACAAACAGATTTTGCAAGGAAGGCTTGATTTGCAGTCTAAGCCGTGGCCTTCAATTTCAGACAGTGCCAAGGATCTACTTCGAAAAATGCTTGAAAGGAATCCGGAGAAAAGGTTCACAGCTCATCAAGTGCTCAGTAAGTCTAAACTTCCTTATAGAGCAAGTATCTTATTTATATGA
Protein sequence

>MsG0380016908.01.T01

MKLLRIEDYDDVLREVLIMQHLSKSENFVKIHGIYEDLFSFHLVMELCEGGELFDRIVKKGRYSERKAAKLIRNIVEGIEDCHSNGVMHRDLKPDNLVFDTAKKDATLKIIDFGLSTFYKPGETFSQVVGTPGYTAPEVLNGHYGPEADIWSAGVILYFLLSGVPPFWGETKEGINKQILQGRLDLQSKPWPSISDSAKDLLRKMLERNPEKRFTAHQVLSKSKLPYRASILFI*