AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0480019031.01


Find 96 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 130 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-GE

Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr4 gene 13530601 13531946 13530601 ID=MsG0480019031.01;Name=MsG0480019031.01
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Chr4 CDS 13530963 13531946 13530963 ID=MsG0480019031.01.T02:cds;Parent=MsG0480019031.01.T02
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Gene Sequence

>MsG0480019031.01.T04

ATGTCCGATAGGGCAAGGATGGCGAACATGCCTATGCCGGAGGCAGCACTGAAATGTCCACGTTGTGAATCAACCAACACAAAATTTTGTTACTTCAACAACTACAGTCTCTCTCAGCCCAGACACTTCTGCAAGACTTGCAGAAGGTACTGGACAAGAGGCGGCGCTCTAAGGAATGTCCCGGTTGGTGGAGGCTTCCGGAGAAACAAGAGATCAAGCAAAAGTAGCAACAATGGAAACTCAACAAAGTCTCCGGCTAGCTCTGACCGCCAAACGGGGAGTGCTAGTTCAACAAACTCAATCACCTCCAATAACAATATCCACTCTTCCGCCGATATATTAGGCCTTACACCTCAAATGTCATCATTGAGGTTCATGACACCTTTACATCATAACTTCAGTAACCCTAATGATTTCGTCGTCGGAGGAGGAGGAGATTTAGGGTTAAACTATGGTTTTAGTTACATGGGAGGAGTAGGTGATTTGGGAAGTGCTTTAGGAGGTAATTCAATTTTATCTTCAAGTGGTTTGGAGCAATGGAGGATGCCAATGTCAATGACTCATCAACAGCATCAATTTCCTTTTTTGGCTAATTTGGAGGGTTCAAATAGTAATTTGTACCCTTTTGAAGGAAATGTTCAAAATCATGAAATGATAACTAGTGGTGGATATGTGAGGCCAAAAGTGATTTCAACTTCTGGAATTATGACTCAACTTGCTTCTGTGAAAATGGAAGATAGTATCAATAGGGGCTTTTTGGGAATTAGCACAGGAAACAATAACAGTAATCAAGGAAGTGAACAATTTTGGAATAGTGCTGTTGTTACTGGTAATTCTGCAGCTAATTGGACTGATCATGTTTCTGGTTTTAGCTCTTCTTCTAATACTACTAGTAACCAGATGTAG

>MsG0480019031.01.T03

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>MsG0480019031.01.T02

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>MsG0480019031.01.T01

ATGGTTTTTACTTCCATACCAGCAGCTTATCTTGATGCAGCCAACTGGCAGCAACAGCAACAGAATCATCATCAGCAACCAGGAAACGGCGGCTCCGTCTCTCAACAACTGCTTCAGACACCACCACCACCACCACCACAGTCACAGTCTCAACCTCATGGAGGAGGATCCACCGGCTCAATTAGGCCAGGATCGATGTCCGATAGGGCAAGGATGGCGAACATGCCTATGCCGGAGGCAGCACTGAAATGTCCACGTTGTGAATCAACCAACACAAAATTTTGTTACTTCAACAACTACAGTCTCTCTCAGCCCAGACACTTCTGCAAGACTTGCAGAAGGTACTGGACAAGAGGCGGCGCTCTAAGGAATGTCCCGGTTGGTGGAGGCTTCCGGAGAAACAAGAGATCAAGCAAAAGTAGCAACAATGGAAACTCAACAAAGTCTCCGGCTAGCTCTGACCGCCAAACGGGGAGTGCTAGTTCAACAAACTCAATCACCTCCAATAACAATATCCACTCTTCCGCCGATATATTAGGCCTTACACCTCAAATGTCATCATTGAGGTTCATGACACCTTTACATCATAACTTCAGTAACCCTAATGATTTCGTCGTCGGAGGAGGAGGAGATTTAGGGTTAAACTATGGTTTTAGTTACATGGGAGGAGTAGGTGATTTGGGAAGTGCTTTAGGAGGTAATTCAATTTTATCTTCAAGTGGTTTGGAGCAATGGAGGATGCCAATGTCAATGACTCATCAACAGCATCAATTTCCTTTTTTGGCTAATTTGGAGGGTTCAAATAGTAATTTGTACCCTTTTGAAGGAAATGTTCAAAATCATGAAATGATAACTAGTGGTGGATATGTGAGGCCAAAAGTGATTTCAACTTCTGGAATTATGACTCAACTTGCTTCTGTGAAAATGGAAGATAGTATCAATAGGGGCTTTTTGGGAATTAGCACAGGAAACAATAACAGTAATCAAGGAAGTGAACAATTTTGGAATAGTGCTGTTGTTACTGGTAATTCTGCAGCTAATTGGACTGATCATGTTTCTGGTTTTAGCTCTTCTTCTAATACTACTAGTAACCAGATGTAG

>MsG0480019031.01.T05

ATGCCGGAGGCAGCACTGAAATGTCCACGTTGTGAATCAACCAACACAAAATTTTGTTACTTCAACAACTACAGTCTCTCTCAGCCCAGACACTTCTGCAAGACTTGCAGAAGGTACTGGACAAGAGGCGGCGCTCTAAGGAATGTCCCGGTTGGTGGAGGCTTCCGGAGAAACAAGAGATCAAGCAAAAGTAGCAACAATGGAAACTCAACAAAGTCTCCGGCTAGCTCTGACCGCCAAACGGGGAGTGCTAGTTCAACAAACTCAATCACCTCCAATAACAATATCCACTCTTCCGCCGATATATTAGGCCTTACACCTCAAATGTCATCATTGAGGTTCATGACACCTTTACATCATAACTTCAGTAACCCTAATGATTTCGTCGTCGGAGGAGGAGGAGATTTAGGGTTAAACTATGGTTTTAGTTACATGGGAGGAGTAGGTGATTTGGGAAGTGCTTTAGGAGGTAATTCAATTTTATCTTCAAGTGGTTTGGAGCAATGGAGGATGCCAATGTCAATGACTCATCAACAGCATCAATTTCCTTTTTTGGCTAATTTGGAGGGTTCAAATAGTAATTTGTACCCTTTTGAAGGAAATGTTCAAAATCATGAAATGATAACTAGTGGTGGATATGTGAGGCCAAAAGTGATTTCAACTTCTGGAATTATGACTCAACTTGCTTCTGTGAAAATGGAAGATAGTATCAATAGGGGCTTTTTGGGAATTAGCACAGGAAACAATAACAGTAATCAAGGAAGTGAACAATTTTGGAATAGTGCTGTTGTTACTGGTAATTCTGCAGCTAATTGGACTGATCATGTTTCTGGTTTTAGCTCTTCTTCTAATACTACTAGTAACCAGATGTAG

Protein sequence

>MsG0480019031.01.T04

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>MsG0480019031.01.T03

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>MsG0480019031.01.T02

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>MsG0480019031.01.T01

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>MsG0480019031.01.T05

MPEAALKCPRCESTNTKFCYFNNYSLSQPRHFCKTCRRYWTRGGALRNVPVGGGFRRNKRSSKSSNNGNSTKSPASSDRQTGSASSTNSITSNNNIHSSADILGLTPQMSSLRFMTPLHHNFSNPNDFVVGGGGDLGLNYGFSYMGGVGDLGSALGGNSILSSSGLEQWRMPMSMTHQQHQFPFLANLEGSNSNLYPFEGNVQNHEMITSGGYVRPKVISTSGIMTQLASVKMEDSINRGFLGISTGNNNSNQGSEQFWNSAVVTGNSAANWTDHVSGFSSSSNTTSNQM*