AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0480020883.01

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MsG0480020883.01.T08 AT1G06840 46.102 295 146 4 21 309 613 900 1.86e-72 243
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MsG0480020883.01.T08 AT5G02800 42.907 289 161 3 21 305 61 349 4.83e-72 229
MsG0480020883.01.T08 AT5G02070 43.144 299 158 4 26 312 356 654 8.72e-72 236
MsG0480020883.01.T08 AT1G29730 41.121 321 180 4 6 325 651 963 1.04e-71 241
MsG0480020883.01.T08 AT3G26940 43.878 294 158 3 21 307 62 355 2.66e-71 229
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MsG0480020883.01.T08 AT5G37450 42.907 289 153 4 21 304 595 876 1.68e-66 226
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MsG0480020883.01.T08 AT3G20530 47.234 235 120 2 21 251 70 304 2.11e-66 213
MsG0480020883.01.T08 AT5G37450 42.907 289 153 4 21 304 619 900 2.52e-66 226
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MsG0480020883.01.T08 AT5G49780 41.100 309 172 4 6 308 605 909 5.14e-62 214
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MsG0480020883.01.T08 AT2G18470 46.491 228 120 2 21 248 272 497 5.36e-62 207
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MsG0480020883.01.T08 AT5G56790 41.404 285 165 2 21 304 378 661 7.33e-62 210
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MsG0480020883.01.T08 AT1G29730 46.460 226 115 2 6 231 651 870 9.71e-61 211
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MsG0480020883.01.T08 AT4G35030 37.456 283 174 2 21 300 92 374 6.05e-60 200
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MsG0480020883.01.T08 AT2G43230 38.488 291 171 3 26 308 138 428 8.04e-59 197
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MsG0480020883.01.T08 AT1G31420 40.659 273 158 4 33 304 306 575 1.88e-58 199
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MsG0480020883.01.T08 AT1G51620 39.932 293 165 6 21 310 37 321 2.00e-58 193
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MsG0480020883.01.T08 AT2G16750 37.857 280 172 1 21 300 265 542 2.67e-58 199
MsG0480020883.01.T08 AT5G60320 34.364 291 189 2 19 309 334 622 3.06e-58 201
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MsG0480020883.01.T08 AT1G16160 39.933 298 177 2 8 304 407 703 4.90e-58 201
MsG0480020883.01.T08 AT4G23190 38.754 289 169 6 21 303 260 546 6.76e-58 198
MsG0480020883.01.T08 AT4G23190 38.754 289 169 6 21 303 260 546 6.76e-58 198
MsG0480020883.01.T08 AT2G37710 38.127 299 174 5 20 312 334 627 7.33e-58 199
MsG0480020883.01.T08 AT5G11020 37.456 283 172 3 23 303 70 349 9.72e-58 192
MsG0480020883.01.T08 AT2G28940 42.088 297 153 8 21 300 90 384 1.21e-57 194
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MsG0480020883.01.T08 AT5G11020 37.456 283 172 3 23 303 97 376 1.41e-57 192
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MsG0480020883.01.T08 AT3G26700 36.364 319 185 6 20 334 66 370 3.39e-56 188
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MsG0480020883.01.T01 AT1G51860 39.949 393 222 6 234 624 344 724 4.41e-80 270
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MsG0480020883.01.T01 AT1G51860 39.949 393 222 6 234 624 488 868 5.12e-79 270
MsG0480020883.01.T01 AT1G51890 41.734 369 198 7 249 615 220 573 6.73e-79 263
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MsG0480020883.01.T01 AT1G51850 40.779 385 212 6 227 608 476 847 1.02e-78 269
MsG0480020883.01.T01 AT1G76370 47.222 288 149 2 326 610 63 350 1.70e-78 255
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MsG0480020883.01.T01 AT2G28960 46.918 292 150 3 325 615 430 717 8.64e-78 264
MsG0480020883.01.T01 AT1G51880 37.915 422 225 7 212 631 471 857 1.40e-77 266
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MsG0480020883.01.T01 AT1G51880 37.915 422 225 7 212 631 489 875 1.58e-77 266
MsG0480020883.01.T01 AT1G51890 41.734 369 198 7 249 615 428 781 1.78e-77 264
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MsG0480020883.01.T01 AT5G02070 43.144 299 158 4 331 617 356 654 5.67e-68 235
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MsG0480020883.01.T01 AT4G00330 44.595 296 152 7 325 609 106 400 1.28e-67 228
MsG0480020883.01.T01 AT4G00330 44.595 296 152 7 325 609 106 400 1.28e-67 228
MsG0480020883.01.T01 AT1G29730 41.368 307 175 4 326 630 628 931 2.56e-67 238
MsG0480020883.01.T01 AT1G25390 37.594 399 209 11 222 609 196 565 2.93e-67 233
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MsG0480020883.01.T01 AT4G02630 38.033 305 179 4 322 622 146 444 4.24e-63 218
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MsG0480020883.01.T01 AT2G28590 46.753 231 120 2 326 553 86 316 2.75e-59 202
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MsG0480020883.01.T01 AT1G24030 45.259 232 121 3 331 557 55 285 3.39e-59 201
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MsG0480020883.01.T01 AT2G47060 40.728 302 165 5 326 617 61 358 3.40e-59 204
MsG0480020883.01.T01 AT2G18470 46.491 228 120 2 326 553 272 497 3.47e-59 208
MsG0480020883.01.T01 AT1G21210 39.088 307 180 4 331 632 403 707 4.38e-59 212
MsG0480020883.01.T01 AT1G21240 41.379 290 163 5 347 632 163 449 4.93e-59 206
MsG0480020883.01.T01 AT3G59350 40.550 291 165 3 331 613 64 354 4.95e-59 203
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MsG0480020883.01.T01 AT5G10290 41.034 290 165 4 325 609 277 565 5.63e-59 209
MsG0480020883.01.T01 AT1G11050 40.129 309 165 8 326 617 283 588 5.75e-59 210
MsG0480020883.01.T01 AT5G59260 37.716 289 171 4 325 609 342 625 6.48e-59 211
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MsG0480020883.01.T01 AT1G55200 39.590 293 175 2 326 617 367 658 1.05e-58 210
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MsG0480020883.01.T01 AT5G59270 32.778 360 212 5 251 609 292 622 2.07e-58 209
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MsG0480020883.01.T01 AT2G35620 34.127 378 220 9 237 609 219 572 7.29e-57 203
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MsG0480020883.01.T01 AT4G35030 37.456 283 174 2 326 605 92 374 2.67e-56 198
MsG0480020883.01.T01 AT4G35030 37.456 283 174 2 326 605 92 374 2.67e-56 198
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MsG0480020883.01.T01 AT2G43230 38.488 291 171 3 331 613 104 394 9.58e-56 196
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MsG0480020883.01.T01 AT3G17410 39.394 297 166 5 326 612 57 349 3.28e-55 193
MsG0480020883.01.T01 AT1G65790 27.749 573 380 12 55 605 231 791 3.73e-55 202
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MsG0480020883.01.T01 AT2G16750 37.857 280 172 1 326 605 265 542 3.79e-55 199
MsG0480020883.01.T01 AT1G11330 33.903 351 214 4 265 608 454 793 3.93e-55 202
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MsG0480020883.01.T01 AT1G79620 45.946 259 123 7 248 503 559 803 4.91e-55 202
MsG0480020883.01.T01 AT2G28940 42.088 297 153 8 326 605 90 384 6.56e-55 195
MsG0480020883.01.T01 AT1G29750 40.206 291 161 5 326 609 669 953 6.87e-55 203
MsG0480020883.01.T01 AT5G11020 33.521 355 219 6 261 608 5 349 7.38e-55 192
MsG0480020883.01.T01 AT4G23240 32.311 424 229 11 258 665 278 659 7.79e-55 199
MsG0480020883.01.T01 AT1G16150 35.833 360 222 5 253 609 342 695 7.90e-55 201
MsG0480020883.01.T01 AT4G23130 38.144 291 168 5 325 608 327 612 9.17e-55 199
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MsG0480020883.01.T01 AT4G23130 38.144 291 168 5 325 608 331 616 1.05e-54 199
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MsG0480020883.01.T01 AT1G16260 36.232 345 195 7 275 609 332 661 1.84e-54 199
MsG0480020883.01.T01 AT1G61420 34.247 365 219 7 246 605 266 614 1.98e-54 198
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MsG0480020883.01.T01 AT4G23190 37.075 294 159 5 246 536 279 549 3.81e-54 196
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MsG0480020883.01.T07 AT3G46370 44.737 304 162 4 54 355 476 775 1.58e-76 253
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MsG0480020883.01.T07 AT3G07070 44.828 290 154 4 55 339 67 355 3.06e-75 240
MsG0480020883.01.T07 AT4G29990 47.735 287 146 3 55 341 564 846 3.08e-75 251
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MsG0480020883.01.T07 AT3G28690 41.060 302 166 3 55 345 14 314 6.41e-68 220
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MsG0480020883.01.T07 AT5G18610 43.299 291 157 4 55 339 71 359 6.41e-68 224
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MsG0480020883.01.T07 AT1G68690 38.483 356 196 7 4 338 297 650 7.35e-68 228
MsG0480020883.01.T07 AT1G68690 39.031 351 191 7 4 333 297 645 8.69e-68 227
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MsG0480020883.01.T07 AT3G01300 41.118 304 167 3 54 346 123 425 1.18e-67 223
MsG0480020883.01.T07 AT1G53440 41.060 302 173 3 55 352 655 955 1.66e-67 231
MsG0480020883.01.T07 AT1G05700 42.434 304 170 4 43 345 548 847 1.67e-67 229
MsG0480020883.01.T07 AT3G17420 40.345 290 170 2 51 338 138 426 1.75e-67 221
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MsG0480020883.01.T07 AT5G59660 37.278 338 164 7 5 341 468 758 1.08e-55 197
MsG0480020883.01.T07 AT5G59660 37.278 338 164 7 5 341 465 755 1.09e-55 197
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MsG0480020883.01.T06 AT5G59700 68.333 120 34 2 11 130 460 575 3.71e-43 157
MsG0480020883.01.T06 AT5G54380 61.828 186 58 4 102 278 674 855 1.85e-66 222
MsG0480020883.01.T06 AT5G54380 71.910 89 25 0 13 101 490 578 1.71e-37 140
MsG0480020883.01.T06 AT4G39110 57.216 194 62 4 102 278 689 878 1.35e-65 220
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MsG0480020883.01.T06 AT1G51890 42.857 112 62 1 104 215 736 845 2.44e-20 91.3
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MsG0480020883.01.T06 AT4G00330 27.273 209 120 5 20 196 106 314 3.32e-12 66.6
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MsG0480020883.01.T06 AT2G30740 41.964 112 65 0 102 213 243 354 6.61e-17 80.1
MsG0480020883.01.T06 AT2G30740 41.964 112 65 0 102 213 243 354 6.61e-17 80.1
MsG0480020883.01.T06 AT2G30740 41.964 112 65 0 102 213 243 354 6.61e-17 80.1
MsG0480020883.01.T06 AT2G30740 41.964 112 65 0 102 213 243 354 6.61e-17 80.1
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MsG0480020883.01.T06 AT1G68690 47.368 76 40 0 21 96 365 440 9.86e-15 74.3
MsG0480020883.01.T06 AT1G68690 37.500 112 66 1 102 209 539 650 2.02e-16 79.3
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MsG0480020883.01.T06 AT1G70450 39.286 112 64 1 102 209 213 324 2.50e-15 75.9
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MsG0480020883.01.T06 AT1G52290 29.008 131 88 2 102 227 306 436 2.42e-11 64.3
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MsG0480020883.01.T06 AT1G61430 41.818 110 58 2 21 130 486 589 2.88e-16 79.0
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MsG0480020883.01.T04 AT1G51810 45.675 289 152 3 33 320 439 723 1.87e-78 256
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MsG0480020883.01.T04 AT1G51805 47.405 289 147 3 33 320 566 850 3.32e-78 258
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MsG0480020883.01.T04 AT5G59650 43.234 303 161 4 33 334 576 868 4.34e-69 234
MsG0480020883.01.T04 AT1G18390 44.755 286 146 6 34 312 332 612 5.08e-69 229
MsG0480020883.01.T04 AT1G69790 42.373 295 156 3 34 317 72 363 5.80e-69 222
MsG0480020883.01.T04 AT5G56460 40.785 331 184 4 26 345 56 385 5.87e-69 223
MsG0480020883.01.T04 AT5G15080 41.118 304 167 3 33 325 129 431 5.90e-69 225
MsG0480020883.01.T04 AT2G48010 43.793 290 157 2 33 317 270 558 6.05e-69 228
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MsG0480020883.01.T04 AT5G54590 42.718 309 162 7 16 323 89 383 6.08e-69 224
MsG0480020883.01.T04 AT1G18390 44.755 286 146 6 34 312 326 606 6.09e-69 229
MsG0480020883.01.T04 AT1G66150 43.003 293 158 5 38 322 580 871 6.77e-69 234
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MsG0480020883.01.T04 AT1G52290 38.762 307 182 3 34 335 131 436 8.98e-69 225
MsG0480020883.01.T04 AT1G24650 45.196 281 142 6 38 309 539 816 1.18e-68 232
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MsG0480020883.01.T04 AT2G05940 42.014 288 158 3 34 313 75 361 1.26e-64 213
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MsG0480020883.01.T04 AT4G01330 39.655 290 172 2 30 317 146 434 1.93e-64 213
MsG0480020883.01.T04 AT1G21230 42.500 280 159 2 39 317 401 679 2.51e-64 218
MsG0480020883.01.T04 AT4G01330 39.655 290 172 2 30 317 146 434 2.51e-64 213
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MsG0480020883.01.T04 AT1G55200 39.590 293 175 2 34 325 367 658 4.73e-61 209
MsG0480020883.01.T04 AT1G55200 39.590 293 175 2 34 325 367 658 4.73e-61 209
MsG0480020883.01.T04 AT4G23220 35.121 373 214 10 4 369 300 651 5.02e-61 208
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MsG0480020883.01.T04 AT1G71830 41.096 292 162 5 33 317 289 577 7.41e-61 207
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MsG0480020883.01.T04 AT5G59260 37.716 289 171 4 33 317 342 625 1.56e-60 207
MsG0480020883.01.T04 AT1G55610 41.343 283 159 4 33 309 846 1127 1.83e-60 211
MsG0480020883.01.T04 AT1G55610 41.343 283 159 4 33 309 846 1127 1.83e-60 211
MsG0480020883.01.T04 AT1G29730 46.460 226 115 2 19 244 651 870 1.92e-60 210
MsG0480020883.01.T04 AT3G02810 38.832 291 172 4 34 318 52 342 1.95e-60 204
MsG0480020883.01.T04 AT1G21270 39.344 305 182 3 39 342 397 699 2.03e-60 208
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MsG0480020883.01.T04 AT4G23270 37.801 291 177 4 33 320 313 602 4.79e-57 197
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MsG0480020883.01.T04 AT5G59660 38.080 323 161 6 5 320 465 755 1.10e-56 199
MsG0480020883.01.T04 AT4G23290 37.188 320 187 6 3 313 318 632 1.13e-56 197
MsG0480020883.01.T04 AT1G21590 36.170 282 177 2 34 313 397 677 1.18e-56 198
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MsG0480020883.01.T04 AT2G25220 38.436 307 184 4 12 316 118 421 1.67e-56 191
MsG0480020883.01.T04 AT5G57670 35.816 282 174 3 34 313 255 531 1.74e-56 194
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MsG0480020883.01.T05 AT3G46290 79.683 379 54 4 1 356 452 830 0.0 617
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MsG0480020883.01.T05 AT3G04690 55.372 363 138 3 11 356 495 850 2.51e-134 404
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MsG0480020883.01.T05 AT2G28970 45.804 286 133 4 20 287 468 749 1.06e-70 235
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MsG0480020883.01.T05 AT2G28990 43.046 302 150 4 7 290 553 850 1.17e-66 226
MsG0480020883.01.T05 AT3G21340 42.808 292 145 4 20 293 581 868 1.27e-66 226
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MsG0480020883.01.T05 AT4G20450 41.987 312 152 6 4 297 565 865 3.46e-66 224
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MsG0480020883.01.T05 AT3G46370 41.118 304 156 5 20 304 476 775 3.75e-64 218
MsG0480020883.01.T05 AT1G51870 40.645 310 158 6 20 308 520 824 3.79e-64 218
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MsG0480020883.01.T05 AT1G51870 40.864 301 155 5 20 302 572 867 6.88e-64 218
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MsG0480020883.01.T05 AT1G07570 39.672 305 155 4 21 296 56 360 3.25e-63 207
MsG0480020883.01.T05 AT3G24790 41.077 297 153 6 14 288 27 323 4.05e-63 205
MsG0480020883.01.T05 AT3G20530 41.034 290 149 5 21 288 70 359 4.98e-63 206
MsG0480020883.01.T05 AT1G07570 39.672 305 155 4 21 296 67 371 6.92e-63 206
MsG0480020883.01.T05 AT3G24790 41.077 297 153 6 14 288 45 341 7.21e-63 205
MsG0480020883.01.T05 AT2G11520 41.549 284 142 6 26 286 218 500 9.38e-63 208
MsG0480020883.01.T05 AT5G01020 39.590 293 151 4 21 287 55 347 9.64e-63 206
MsG0480020883.01.T05 AT5G38560 38.835 309 166 5 2 287 307 615 1.21e-62 212
MsG0480020883.01.T05 AT1G76360 38.870 301 157 3 21 294 151 451 1.64e-62 207
MsG0480020883.01.T05 AT3G46340 41.581 291 147 5 20 291 574 860 1.77e-62 214
MsG0480020883.01.T05 AT1G70460 40.717 307 156 5 2 287 326 627 2.15e-62 212
MsG0480020883.01.T05 AT3G55450 38.636 308 156 6 21 298 49 353 2.91e-62 204
MsG0480020883.01.T05 AT3G46400 40.830 289 149 4 20 290 565 849 3.65e-62 213
MsG0480020883.01.T05 AT1G51820 42.561 289 144 4 20 290 567 851 4.36e-62 213
MsG0480020883.01.T05 AT4G02010 41.118 304 154 6 26 307 373 673 4.43e-62 211
MsG0480020883.01.T05 AT5G56890 44.170 283 137 4 26 287 716 998 5.29e-62 214
MsG0480020883.01.T05 AT2G19230 42.509 287 145 3 21 290 559 842 6.09e-62 213
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MsG0480020883.01.T05 AT5G54590 38.835 309 157 8 3 293 89 383 9.36e-56 188
MsG0480020883.01.T05 AT5G54590 38.835 309 157 8 3 293 89 383 9.36e-56 188
MsG0480020883.01.T05 AT5G54590 38.835 309 157 8 3 293 89 383 9.36e-56 188
MsG0480020883.01.T05 AT1G24030 36.678 289 159 4 26 290 1 289 9.38e-56 184
MsG0480020883.01.T05 AT1G07650 38.111 307 167 4 21 307 672 975 9.44e-56 196
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MsG0480020883.01.T05 AT3G13690 37.895 285 158 3 21 287 399 682 3.05e-52 185
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MsG0480020883.01.T05 AT1G56120 38.652 282 154 3 19 283 530 809 1.02e-51 184
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MsG0480020883.01.T05 AT1G56120 38.652 282 154 3 19 283 696 975 1.82e-51 184
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MsG0480020883.01.T05 AT4G35030 33.569 283 168 3 21 283 92 374 2.21e-47 166
MsG0480020883.01.T05 AT4G23220 32.945 343 192 10 20 339 324 651 2.46e-47 170
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MsG0480020883.01.T05 AT1G16120 38.214 280 154 3 26 287 422 700 6.13e-47 170
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MsG0480020883.01.T05 AT2G28250 35.034 294 162 6 19 283 196 489 7.05e-47 167
MsG0480020883.01.T05 AT2G28250 35.034 294 162 6 19 283 196 489 7.05e-47 167
MsG0480020883.01.T05 AT2G28250 35.034 294 162 6 19 283 196 489 7.05e-47 167
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MsG0480020883.01.T05 AT2G13800 36.301 292 159 6 20 287 262 550 8.57e-47 168
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MsG0480020883.01.T05 AT4G23270 34.364 291 170 5 20 290 313 602 2.20e-45 164
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MsG0480020883.01.T05 AT1G61420 34.397 282 165 4 21 283 484 764 9.66e-45 164
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MsG0480020883.01.T02 AT3G04690 55.190 395 170 2 11 405 463 850 9.68e-150 445
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MsG0480020883.01.T02 AT5G39000 54.985 331 143 4 34 358 486 816 1.88e-120 370
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MsG0480020883.01.T02 AT2G28970 49.301 286 140 3 52 336 468 749 8.44e-84 272
MsG0480020883.01.T02 AT1G76370 44.620 316 168 3 25 337 39 350 9.33e-83 258
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MsG0480020883.01.T02 AT1G51830 47.405 289 147 3 52 339 382 666 1.39e-81 264
MsG0480020883.01.T02 AT1G07560 47.222 288 146 3 52 339 559 840 2.08e-81 267
MsG0480020883.01.T02 AT1G67720 46.441 295 152 5 50 342 593 883 5.54e-81 267
MsG0480020883.01.T02 AT2G28960 46.918 292 150 3 52 342 430 717 7.18e-81 263
MsG0480020883.01.T02 AT1G49100 46.575 292 151 3 52 342 570 857 6.69e-80 263
MsG0480020883.01.T02 AT5G16900 46.897 290 149 3 52 340 376 661 1.21e-79 259
MsG0480020883.01.T02 AT2G28960 46.918 292 150 3 52 342 562 849 1.59e-79 262
MsG0480020883.01.T02 AT2G04300 45.675 289 152 3 52 339 530 814 1.65e-79 262
MsG0480020883.01.T02 AT1G20650 41.246 337 191 3 4 337 21 353 2.34e-79 249
MsG0480020883.01.T02 AT1G51860 45.183 301 159 4 52 351 429 724 3.09e-79 259
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MsG0480020883.01.T02 AT1G51890 43.344 323 176 5 22 342 256 573 4.78e-79 255
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MsG0480020883.01.T02 AT5G01950 45.364 302 147 5 48 340 608 900 1.14e-72 245
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MsG0480020883.01.T02 AT5G13160 42.662 293 160 4 51 337 72 362 1.53e-71 232
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MsG0480020883.01.T02 AT4G00330 42.733 344 180 8 4 336 63 400 1.60e-71 230
MsG0480020883.01.T02 AT5G15080 38.873 355 199 4 1 344 84 431 2.72e-71 232
MsG0480020883.01.T02 AT3G01300 38.315 368 201 4 2 344 59 425 6.24e-71 231
MsG0480020883.01.T02 AT3G53590 45.918 294 148 4 52 340 608 895 7.42e-71 240
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MsG0480020883.01.T02 AT1G70450 43.599 289 157 3 53 336 37 324 2.05e-70 227
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MsG0480020883.01.T02 AT1G68690 39.181 342 192 5 9 336 311 650 3.86e-70 234
MsG0480020883.01.T02 AT5G54590 41.056 341 185 8 4 342 57 383 4.37e-70 228
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MsG0480020883.01.T02 AT5G54590 41.056 341 185 8 4 342 57 383 4.37e-70 228
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MsG0480020883.01.T02 AT5G49770 44.407 295 152 4 53 341 622 910 6.53e-66 226
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MsG0480020883.01.T02 AT5G55830 40.000 285 165 4 53 332 353 636 6.29e-62 212
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MsG0480020883.01.T02 AT1G55610 41.343 283 159 4 52 328 846 1127 2.45e-61 214
MsG0480020883.01.T02 AT3G02810 38.832 291 172 4 53 337 52 342 3.06e-61 207
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MsG0480020883.01.T02 AT3G13690 39.649 285 170 2 53 336 399 682 2.21e-60 209
MsG0480020883.01.T02 AT2G28250 39.116 294 167 5 51 332 196 489 2.34e-60 205
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MsG0480020883.01.T02 AT4G13190 45.259 232 124 2 53 281 59 290 5.78e-60 197
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MsG0480020883.01.T02 AT1G48210 37.415 294 176 2 53 339 56 348 1.18e-59 198
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MsG0480020883.01.T02 AT1G06700 39.041 292 168 4 58 340 61 351 1.33e-59 198
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MsG0480020883.01.T02 AT4G35030 37.456 283 174 2 53 332 92 374 1.38e-59 200
MsG0480020883.01.T02 AT4G35030 37.456 283 174 2 53 332 92 374 1.38e-59 200
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MsG0480020883.01.T02 AT2G35620 39.721 287 166 6 53 336 290 572 1.88e-58 201
MsG0480020883.01.T02 AT2G35620 39.721 287 166 6 53 336 290 572 1.88e-58 201
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MsG0480020883.01.T02 AT4G23190 38.754 289 169 6 53 335 260 546 2.34e-58 200
MsG0480020883.01.T02 AT4G23130 38.144 291 168 5 52 335 331 616 3.61e-58 201
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MsG0480020883.01.T02 AT1G78530 39.929 283 165 3 57 337 67 346 4.17e-58 194
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MsG0480020883.01.T02 AT5G16000 40.830 289 164 5 52 336 299 584 5.98e-58 200
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MsG0480020883.01.T02 AT4G11470 37.153 288 169 7 52 332 331 613 9.91e-58 200
MsG0480020883.01.T02 AT4G04510 40.283 283 162 5 52 332 326 603 1.03e-57 200
MsG0480020883.01.T02 AT4G02420 37.809 283 173 3 52 332 337 618 1.06e-57 200
MsG0480020883.01.T02 AT4G04510 40.283 283 162 5 52 332 328 605 1.07e-57 200
MsG0480020883.01.T02 AT2G16750 37.857 280 172 1 53 332 265 542 1.09e-57 199
MsG0480020883.01.T02 AT2G16750 37.857 280 172 1 53 332 265 542 1.09e-57 199
MsG0480020883.01.T02 AT1G16150 39.643 280 167 2 58 336 417 695 1.12e-57 201
MsG0480020883.01.T02 AT1G11330 37.676 284 176 1 53 335 512 795 1.24e-57 202
MsG0480020883.01.T02 AT1G11330 37.676 284 176 1 53 335 510 793 1.31e-57 202
MsG0480020883.01.T02 AT4G23270 37.801 291 177 4 52 339 313 602 1.83e-57 199
MsG0480020883.01.T02 AT4G23270 37.801 291 177 4 52 339 313 602 1.83e-57 199
MsG0480020883.01.T02 AT5G57670 35.816 282 174 3 53 332 255 531 2.08e-57 197
MsG0480020883.01.T02 AT4G11460 37.377 305 175 6 42 335 322 621 2.11e-57 200
MsG0480020883.01.T02 AT4G23270 37.801 291 177 4 52 339 313 602 2.24e-57 199
MsG0480020883.01.T02 AT5G60300 35.065 308 198 2 36 343 315 620 2.26e-57 201
MsG0480020883.01.T02 AT1G16260 40.351 285 158 6 58 336 374 652 2.56e-57 199
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MsG0480020883.01.T02 AT1G29750 40.206 291 161 5 53 336 654 938 3.79e-57 202
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MsG0480020883.01.T03 AT1G51890 45.205 292 154 4 49 339 495 781 6.34e-77 254
MsG0480020883.01.T03 AT4G29450 44.667 300 152 2 49 336 555 852 1.28e-76 254
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MsG0480020883.01.T03 AT1G61860 45.033 302 162 3 45 342 68 369 3.64e-76 241
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MsG0480020883.01.T03 AT2G14440 45.574 305 160 4 49 352 553 852 7.45e-76 252
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MsG0480020883.01.T03 AT1G51870 43.522 301 164 4 49 348 572 867 2.35e-75 251
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MsG0480020883.01.T03 AT5G54590 41.018 334 182 7 7 339 64 383 4.95e-69 224
MsG0480020883.01.T03 AT1G14370 41.694 307 164 4 50 345 74 376 5.28e-69 224
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MsG0480020883.01.T03 AT4G35600 36.236 356 208 6 2 341 22 374 8.33e-69 223
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MsG0480020883.01.T03 AT3G17420 40.345 290 170 2 46 333 138 426 2.06e-68 224
MsG0480020883.01.T03 AT1G26970 42.230 296 156 4 50 333 71 363 3.05e-68 222
MsG0480020883.01.T03 AT3G28690 41.060 302 166 3 50 340 63 363 4.34e-68 222
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MsG0480020883.01.T03 AT1G56120 42.553 282 160 2 48 329 696 975 1.46e-63 220
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MsG0480020883.01.T03 AT5G66790 39.310 290 170 3 50 333 302 591 2.10e-63 214
MsG0480020883.01.T03 AT3G59110 38.621 290 175 2 46 333 174 462 2.36e-63 212
MsG0480020883.01.T03 AT5G07280 42.086 278 157 3 55 329 910 1186 2.78e-63 220
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MsG0480020883.01.T03 AT5G59260 37.716 289 171 4 49 333 342 625 1.10e-61 211
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MsG0480020883.01.T03 AT1G71830 41.096 292 162 5 49 333 289 577 1.40e-61 209
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MsG0480020883.01.T03 AT2G02220 42.593 270 152 2 57 324 729 997 1.58e-61 214
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MsG0480020883.01.T03 AT5G59270 36.364 286 179 3 49 333 355 638 9.67e-61 208
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MsG0480020883.01.T03 AT1G79670 41.786 280 161 2 55 333 414 692 2.40e-60 208
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MsG0480020883.01.T03 AT4G23150 38.710 279 168 3 52 328 326 603 2.84e-60 207
MsG0480020883.01.T03 AT1G49730 46.330 218 113 2 49 264 316 531 4.98e-60 205
MsG0480020883.01.T03 AT4G13190 45.259 232 124 2 50 278 59 290 5.80e-60 197
MsG0480020883.01.T03 AT2G13800 40.068 292 165 5 49 333 145 433 5.88e-60 202
MsG0480020883.01.T03 AT2G13800 40.068 292 165 5 49 333 145 433 5.88e-60 202
MsG0480020883.01.T03 AT4G23240 35.028 354 201 8 49 389 15 352 7.04e-60 198
MsG0480020883.01.T03 AT3G45420 36.364 286 178 3 48 332 336 618 7.10e-60 206
MsG0480020883.01.T03 AT5G65240 39.935 308 179 4 31 333 253 559 7.98e-60 204
MsG0480020883.01.T03 AT4G35030 37.456 283 174 2 50 329 92 374 1.07e-59 200
MsG0480020883.01.T03 AT4G35030 37.456 283 174 2 50 329 92 374 1.07e-59 200
MsG0480020883.01.T03 AT4G35030 37.456 283 174 2 50 329 92 374 1.07e-59 200
MsG0480020883.01.T03 AT4G35030 37.456 283 174 2 50 329 92 374 1.07e-59 200
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MsG0480020883.01.T03 AT1G48210 37.415 294 176 2 50 336 56 348 1.11e-59 198
MsG0480020883.01.T03 AT1G06700 39.041 292 168 4 55 337 61 351 1.24e-59 198
MsG0480020883.01.T03 AT1G06700 39.041 292 168 4 55 337 61 351 1.24e-59 198
MsG0480020883.01.T03 AT1G06700 39.041 292 168 4 55 337 61 351 1.24e-59 198
MsG0480020883.01.T03 AT5G65240 39.935 308 179 4 31 333 253 559 1.60e-59 204
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MsG0480020883.01.T03 AT4G35030 37.589 282 173 2 50 328 92 373 2.09e-59 197
MsG0480020883.01.T03 AT4G30520 39.510 286 168 4 50 333 291 573 2.75e-59 204
MsG0480020883.01.T03 AT2G28940 39.385 358 184 10 3 329 29 384 3.05e-59 199
MsG0480020883.01.T03 AT1G29730 47.170 212 110 2 50 260 628 838 3.85e-59 207
MsG0480020883.01.T03 AT4G23220 35.277 343 201 8 49 385 324 651 4.24e-59 203
MsG0480020883.01.T03 AT2G13800 40.068 292 165 5 49 333 262 550 4.55e-59 202
MsG0480020883.01.T03 AT2G13800 40.068 292 165 5 49 333 262 550 4.55e-59 202
MsG0480020883.01.T03 AT3G55950 41.083 314 159 7 50 338 484 796 4.99e-59 206
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MsG0480020883.01.T03 AT2G43230 38.488 291 171 3 55 337 138 428 1.26e-58 197
MsG0480020883.01.T03 AT5G60320 34.364 291 189 2 48 338 334 622 1.41e-58 202
MsG0480020883.01.T03 AT2G23950 48.804 209 103 3 50 257 287 492 1.43e-58 199
MsG0480020883.01.T03 AT1G31420 40.659 273 158 4 62 333 306 575 1.51e-58 201
MsG0480020883.01.T03 AT1G31420 40.659 273 158 4 62 333 306 575 1.51e-58 201
MsG0480020883.01.T03 AT2G37710 38.127 299 174 5 49 341 334 627 1.56e-58 202
MsG0480020883.01.T03 AT1G01540 40.000 275 148 5 3 272 103 365 1.73e-58 196
MsG0480020883.01.T03 AT1G51620 39.932 293 165 6 50 339 37 321 1.79e-58 194
MsG0480020883.01.T03 AT2G35620 39.721 287 166 6 50 333 290 572 1.98e-58 200
MsG0480020883.01.T03 AT2G35620 39.721 287 166 6 50 333 290 572 1.98e-58 200
MsG0480020883.01.T03 AT2G35620 39.721 287 166 6 50 333 290 572 1.98e-58 200
MsG0480020883.01.T03 AT2G35620 39.721 287 166 6 50 333 290 572 1.98e-58 200
MsG0480020883.01.T03 AT1G16120 41.429 280 162 2 55 333 422 700 2.35e-58 202
MsG0480020883.01.T03 AT4G23190 38.754 289 169 6 50 332 260 546 2.36e-58 200
MsG0480020883.01.T03 AT4G23190 38.754 289 169 6 50 332 260 546 2.36e-58 200
MsG0480020883.01.T03 AT5G16000 40.830 289 164 5 49 333 299 584 4.04e-58 201
MsG0480020883.01.T03 AT1G78530 39.929 283 165 3 54 334 67 346 4.18e-58 194
MsG0480020883.01.T03 AT1G16160 41.429 280 162 2 55 333 425 703 4.29e-58 202
MsG0480020883.01.T03 AT4G23130 38.408 289 170 5 49 332 327 612 4.58e-58 201
MsG0480020883.01.T03 AT4G23130 38.408 289 170 5 49 332 331 616 5.07e-58 201
MsG0480020883.01.T03 AT3G17410 39.394 297 166 5 50 336 57 349 5.24e-58 194
MsG0480020883.01.T03 AT3G17410 39.394 297 166 5 50 336 57 349 5.24e-58 194
MsG0480020883.01.T03 AT4G32300 39.236 288 168 5 49 333 482 765 5.26e-58 203
MsG0480020883.01.T03 AT4G23190 38.754 289 169 6 50 332 338 624 5.26e-58 201
MsG0480020883.01.T03 AT2G47060 43.460 237 126 3 50 279 61 296 7.21e-58 192
MsG0480020883.01.T03 AT4G23200 37.063 286 172 5 52 332 326 608 8.06e-58 200
MsG0480020883.01.T03 AT4G02420 37.809 283 173 3 49 329 337 618 9.43e-58 200
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MsG0480020883.01.T03 AT4G11470 37.153 288 169 7 49 329 326 608 1.07e-57 200
MsG0480020883.01.T03 AT1G11330 37.676 284 176 1 50 332 510 793 1.13e-57 202
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MsG0480020883.01.T03 AT5G60300 35.714 294 187 2 47 340 329 620 1.16e-57 201
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MsG0480020883.01.T03 AT1G11330 37.676 284 176 1 50 332 512 795 1.26e-57 202
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MsG0480020883.01.T03 AT4G04510 40.283 283 162 5 49 329 328 605 1.60e-57 199
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MsG0480020883.01.T03 AT4G23270 37.801 291 177 4 49 336 313 602 2.46e-57 199
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MsG0480020883.01.T03 AT4G11480 37.457 291 170 5 49 332 308 593 3.16e-57 198
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MsG0480020883.01.T03 AT4G11480 37.457 291 170 5 49 332 311 596 3.37e-57 198
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MsG0480020883.01.T03 AT1G16260 39.223 283 164 3 55 333 383 661 3.73e-57 199
MsG0480020883.01.T03 AT1G29750 40.206 291 161 5 50 333 669 953 3.88e-57 202
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MsG0480020883.01.T03 AT1G61420 38.298 282 171 3 50 329 332 612 8.82e-57 197
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MsG0480020883.01.T03 AT5G26150 38.033 305 160 9 33 326 400 686 1.24e-56 197
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MsG0480020883.01.T03 AT5G53890 41.219 279 161 2 57 333 749 1026 1.53e-56 200
MsG0480020883.01.T03 AT5G35370 34.347 329 182 5 49 355 504 820 1.68e-56 199
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MsG0480020883.01.T03 AT5G01560 38.112 286 168 4 48 329 349 629 3.25e-56 196
MsG0480020883.01.T03 AT4G39400 40.830 289 157 9 49 329 870 1152 3.57e-56 199
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MsG0480020883.01.T03 AT1G61420 38.298 282 171 3 50 329 484 764 3.83e-56 197

Find 144 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 320 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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GCCAGTGCTGCTTCAAATTT+CGG 0.209492 4:-50059701 MsG0480020883.01.T01:CDS
GTTATTGGTGTAGGTGGTTT+TGG 0.221477 4:-50059620 MsG0480020883.01.T01:CDS
CCAGTGCTGCTTCAAATTTC+GGG 0.238910 4:-50059700 MsG0480020883.01.T01:CDS
TCCAGTTTAGATGATCTTTC+AGG 0.248622 4:-50058684 MsG0480020883.01.T01:CDS
GGGCGATGTATTGTGGAATT+TGG 0.259611 4:-50058844 MsG0480020883.01.T01:CDS
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TGGCAAAAGTAGCCGATTTC+GGG 0.274244 4:-50059223 MsG0480020883.01.T01:CDS
AAAGACATGGGTTCCTTTAT+CGG 0.276923 4:-50059771 MsG0480020883.01.T01:CDS
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CGACATCTAGTATCATTAAT+TGG 0.283189 4:-50059473 MsG0480020883.01.T01:CDS
GGGGAACCCTCGGTCGCATC+AGG 0.303582 4:-50059546 MsG0480020883.01.T01:CDS
AATCGGACGTGTATTCATTT+GGG 0.310514 4:-50059091 MsG0480020883.01.T01:CDS
ATGGCAAAAGTAGCCGATTT+CGG 0.314362 4:-50059224 MsG0480020883.01.T01:CDS
ACCAAGTACTCCTTCATAAC+AGG 0.321860 4:+50060684 None:intergenic
AAATCGGACGTGTATTCATT+TGG 0.334002 4:-50059092 MsG0480020883.01.T01:CDS
TGTTGCCTTCTGAAATATTC+CGG 0.338708 4:+50059125 None:intergenic
ATCGTGGATCCAACACTTGC+TGG 0.348985 4:-50058951 MsG0480020883.01.T01:CDS
ACAGCTGTCAAAGGGAGTTT+TGG 0.354882 4:-50059158 MsG0480020883.01.T01:CDS
GTCCATTCAAAATTGCATTA+GGG 0.362532 4:+50059999 None:intergenic
TGCTCGAAATTGTTGATTTG+CGG 0.371249 4:+50058741 None:intergenic
GTACTCTCTTCGCGGATTCA+AGG 0.392186 4:+50060542 None:intergenic
GCCTGAAAGATCATCTAAAC+TGG 0.392770 4:+50058683 None:intergenic
GGTGATGACAAGTGTGTCTA+AGG 0.392918 4:+50060653 None:intergenic
TCACATACAAATACTTCAAT+AGG 0.399583 4:-50061014 MsG0480020883.01.T01:CDS
TGAAGAAGAGGAGGAGGAGG+AGG 0.400231 4:+50063131 None:intergenic
ATTCTTGCAGTTTGATAAAG+AGG 0.406318 4:+50060879 None:intergenic
TGGTGTTGATAGACCTTCCA+TGG 0.412639 4:-50058865 MsG0480020883.01.T01:CDS
TCCTGTTATGAAGGAGTACT+TGG 0.419493 4:-50060685 MsG0480020883.01.T01:CDS
AAGACAGTTGGCACAACAAC+GGG 0.421287 4:-50059798 MsG0480020883.01.T01:CDS
TGGCAGAATGGGCGATGAAA+TGG 0.431128 4:-50058998 MsG0480020883.01.T01:CDS
GAACTAAAGTTGCTTGTAAG+AGG 0.431567 4:-50059568 MsG0480020883.01.T01:CDS
TCTATAAGGTAATTATCTAT+AGG 0.433787 4:+50061044 None:intergenic
GGTCTTTGATAGCCCGAAAT+CGG 0.435504 4:+50059211 None:intergenic
TGAGAAGTACCATCCGATAA+AGG 0.436996 4:+50059758 None:intergenic
GTGATAGTGGGTGTTAGTCT+TGG 0.437806 4:-50059878 MsG0480020883.01.T01:CDS
GATAATTACCTTATAGATTG+TGG 0.440862 4:-50061038 MsG0480020883.01.T01:CDS
ATAGGAAATGTGTACTTAGA+AGG 0.441676 4:+50060846 None:intergenic
TCATCGGCAATTAGATCATC+AGG 0.445152 4:+50060573 None:intergenic
TCCACGAGAAAGGGTGAACT+TGG 0.447727 4:-50059018 MsG0480020883.01.T01:CDS
ATCCATCCCTTCCACGAGAA+AGG 0.449238 4:-50059028 MsG0480020883.01.T01:CDS
TGTGGAATTGTAGAGAAGAT+TGG 0.450659 4:-50061130 MsG0480020883.01.T01:CDS
GGAAGGGATGGATCTATAAC+AGG 0.450674 4:+50059038 None:intergenic
TATGTGATCCACAATCTATA+AGG 0.454933 4:+50061030 None:intergenic
TGAAGATGAAGAAGAGGAGG+AGG 0.456658 4:+50063125 None:intergenic
CGTTCCTTCCAACTTAAGCT+AGG 0.460197 4:+50059362 None:intergenic
GCCTCCTGAACTACTGCAAA+AGG 0.460793 4:+50059668 None:intergenic
AAGGGTGAACTTGGCAGAAT+GGG 0.465938 4:-50059009 MsG0480020883.01.T01:CDS
AGATGAAGAAGAGGAGGAGG+AGG 0.467806 4:+50063128 None:intergenic
GGAATTGTTCGACGGGGAAA+AGG 0.474051 4:+50060632 None:intergenic
GGTTCAAATTCTAAGAAAGT+TGG 0.475325 4:-50059902 MsG0480020883.01.T01:CDS
TCCATCCCTTCCACGAGAAA+GGG 0.475422 4:-50059027 MsG0480020883.01.T01:CDS
AAGAGTCATCTGTATGGTTC+AGG 0.477423 4:-50059389 MsG0480020883.01.T01:CDS
AACCCTGTGTACTCTCTTCG+CGG 0.478213 4:+50060534 None:intergenic
ACAACATTTCAATTTCAGTT+CGG 0.482003 4:+50059510 None:intergenic
ACCCTTTCTCGTGGAAGGGA+TGG 0.484525 4:+50059026 None:intergenic
TCTCAGTGCAGCTGCAGCTG+TGG 0.487494 4:-50059942 MsG0480020883.01.T01:CDS
GCGCTGGTGGCCATGGTTGG+AGG 0.489510 4:-50059845 MsG0480020883.01.T01:CDS
AGTTCACCCTTTCTCGTGGA+AGG 0.492401 4:+50059021 None:intergenic
CTTCCATGGGCGATGTATTG+TGG 0.493352 4:-50058851 MsG0480020883.01.T01:CDS
AAAGGGTGAACTTGGCAGAA+TGG 0.494311 4:-50059010 MsG0480020883.01.T01:CDS
TTCTGAAATATTCCGGATCA+AGG 0.497216 4:+50059132 None:intergenic
TAAGAAAGTTGGTGTGATAG+TGG 0.497966 4:-50059891 MsG0480020883.01.T01:CDS
GAATATCTTCTTGTGTTGAA+AGG 0.499992 4:+50060949 None:intergenic
CAGGTCTCCCTAGCTTAAGT+TGG 0.500091 4:-50059370 MsG0480020883.01.T01:CDS
CATAGCCGGTATGAAGGTAA+TGG 0.502779 4:+50059306 None:intergenic
TACAAAGAAACCTCCAACCA+TGG 0.503180 4:+50059835 None:intergenic
CCCGAAATTTGAAGCAGCAC+TGG 0.506455 4:+50059700 None:intergenic
AAGCAGTGGAATTGTTCGAC+GGG 0.507192 4:+50060625 None:intergenic
AGTTGGGTTATTGGTGTAGG+TGG 0.508912 4:-50059626 MsG0480020883.01.T01:CDS
TGATAGTGGGTGTTAGTCTT+GGG 0.511633 4:-50059877 MsG0480020883.01.T01:CDS
GTGGCTTTGACGAGTAATCA+TGG 0.517128 4:-50059923 MsG0480020883.01.T01:CDS
TTTGCGCTGGTGGCCATGGT+TGG 0.518454 4:-50059848 MsG0480020883.01.T01:CDS
GATATGCATTGGAGCAGCTA+GGG 0.522239 4:-50059333 MsG0480020883.01.T01:CDS
CCATGAGGTTCTCATCAAGT+AGG 0.523616 4:+50059243 None:intergenic
ACATGTGTCTGATCAATCTC+CGG 0.524744 4:+50059185 None:intergenic
GCCAAGTTCACCCTTTCTCG+TGG 0.526190 4:+50059017 None:intergenic
GATGGTACTTCTCACACAAT+GGG 0.527287 4:-50059749 MsG0480020883.01.T01:CDS
AATAACTGCTTTAGCATAGC+CGG 0.527516 4:+50059292 None:intergenic
ATCGGACGTGTATTCATTTG+GGG 0.529574 4:-50059090 MsG0480020883.01.T01:CDS
TGTCTGATCAATCTCCGGTC+CGG 0.533467 4:+50059190 None:intergenic
CTTTAGCATAGCCGGTATGA+AGG 0.535704 4:+50059300 None:intergenic
GAACGACTTGAGATATGCAT+TGG 0.536042 4:-50059344 MsG0480020883.01.T01:CDS
AGATATGCATTGGAGCAGCT+AGG 0.537093 4:-50059334 MsG0480020883.01.T01:CDS
ATTTGGGGTAGTTCTGCTTG+AGG 0.538851 4:-50059075 MsG0480020883.01.T01:CDS
GCAAGTCCCTGATGCGACCG+AGG 0.539960 4:+50059539 None:intergenic
GAGAGTTGGGTTATTGGTGT+AGG 0.546140 4:-50059629 MsG0480020883.01.T01:CDS
TCGTGGATCCAACACTTGCT+GGG 0.547208 4:-50058950 MsG0480020883.01.T01:CDS
ATGTGAGCACAGCTGTCAAA+GGG 0.547917 4:-50059166 MsG0480020883.01.T01:CDS
AACTAAAGTTGCTTGTAAGA+GGG 0.551361 4:-50059567 MsG0480020883.01.T01:CDS
AACTATCTGATGTAAAATTG+AGG 0.555408 4:+50060985 None:intergenic
ACTAAAGTTGCTTGTAAGAG+GGG 0.555930 4:-50059566 MsG0480020883.01.T01:CDS
CACAATACATCGCCCATGGA+AGG 0.558428 4:+50058852 None:intergenic
TAATTGGATATTGTGACGAA+AGG 0.558544 4:-50059457 MsG0480020883.01.T01:CDS
AAATGAAGATGAAGAAGAGG+AGG 0.559938 4:+50063122 None:intergenic
CATGTGAGCACAGCTGTCAA+AGG 0.560187 4:-50059167 MsG0480020883.01.T01:CDS
GAAAACAGTACTAATATGAT+CGG 0.561136 4:-50058774 MsG0480020883.01.T01:CDS
GCACACTAAAGCTACTAAGA+AGG 0.561708 4:+50060718 None:intergenic
CTCACAGCTGGTGAAGTCTG+AGG 0.562552 4:-50058640 MsG0480020883.01.T01:CDS
GTTCCTTCCAACTTAAGCTA+GGG 0.563187 4:+50059363 None:intergenic
AATTGTTGATTTGCGGACAG+AGG 0.563241 4:+50058748 None:intergenic
TCACAGCTGGTGAAGTCTGA+GGG 0.566345 4:-50058639 MsG0480020883.01.T01:CDS
GAGTAAAGTATTCTCACAGC+TGG 0.566574 4:-50058652 MsG0480020883.01.T01:CDS
TAATCACTATTTACATCAGA+AGG 0.569566 4:+50060022 None:intergenic
AGGGGAACTTGCACGAATCG+TGG 0.571140 4:-50058967 MsG0480020883.01.T01:CDS
TGAAGCAGCACTGGCTGTTG+TGG 0.574675 4:+50059709 None:intergenic
GTATGCTCTTCAACTTCAAG+AGG 0.575963 4:-50058820 MsG0480020883.01.T01:CDS
GATCTTGATATATGAATACA+TGG 0.576536 4:-50059426 MsG0480020883.01.T01:CDS
ACATGGGTTCCTTTATCGGA+TGG 0.576985 4:-50059767 MsG0480020883.01.T01:CDS
CAGAAAGAGAAGAAGACAGT+TGG 0.577864 4:-50059810 MsG0480020883.01.T01:CDS
GGTGTTGATAGACCTTCCAT+GGG 0.580403 4:-50058864 MsG0480020883.01.T01:CDS
GTTCACCCTTTCTCGTGGAA+GGG 0.582174 4:+50059022 None:intergenic
ATTCAAGGCGATAGCATCAT+CGG 0.583016 4:+50060557 None:intergenic
ACTGTCAAGAGTCATCTGTA+TGG 0.584454 4:-50059395 MsG0480020883.01.T01:CDS
GCAAATCAACAATTTCGAGC+AGG 0.585500 4:-50058739 MsG0480020883.01.T01:CDS
CAAGTCCCTGATGCGACCGA+GGG 0.592584 4:+50059540 None:intergenic
TACAAAGGTGAATTAAGCGA+TGG 0.598134 4:-50059590 MsG0480020883.01.T01:CDS
AACAACGGGATTCAAAGACA+TGG 0.600624 4:-50059784 MsG0480020883.01.T01:CDS
TTGATCCGGAATATTTCAGA+AGG 0.601051 4:-50059130 MsG0480020883.01.T01:CDS
AGCTGGTGAAGTCTGAGGGA+AGG 0.601800 4:-50058635 MsG0480020883.01.T01:CDS
TCTCCCTAGCTTAAGTTGGA+AGG 0.603132 4:-50059366 MsG0480020883.01.T01:CDS
AATAGCATTCACAAAAGCAG+TGG 0.604665 4:+50060611 None:intergenic
GGACTCCATTACCTTCATAC+CGG 0.609892 4:-50059311 MsG0480020883.01.T01:CDS
GGGAACCCTCGGTCGCATCA+GGG 0.610354 4:-50059545 MsG0480020883.01.T01:CDS
CCTACTTGATGAGAACCTCA+TGG 0.611873 4:-50059243 MsG0480020883.01.T01:CDS
GGATGGTACTTCTCACACAA+TGG 0.619812 4:-50059750 MsG0480020883.01.T01:CDS
ATTCCACAATACATCGCCCA+TGG 0.620641 4:+50058848 None:intergenic
CGGGCTATCAAAGACCGGAC+CGG 0.621799 4:-50059204 MsG0480020883.01.T01:CDS
ATATATGAATACATGGAGAA+CGG 0.624837 4:-50059419 MsG0480020883.01.T01:CDS
AAAGCAGTGGAATTGTTCGA+CGG 0.630976 4:+50060624 None:intergenic
AAGAAAGTTGGTGTGATAGT+GGG 0.631245 4:-50059890 MsG0480020883.01.T01:CDS
GAAGACAGTTGGCACAACAA+CGG 0.636017 4:-50059799 MsG0480020883.01.T01:CDS
GATTTCGGGCTATCAAAGAC+CGG 0.637758 4:-50059209 MsG0480020883.01.T01:CDS
AAAATGGAAAGAAATAAAGA+CGG 0.640852 4:+50060799 None:intergenic
ATGATACTAGATGTCGATGA+CGG 0.647168 4:+50059480 None:intergenic
AATCCGCGAAGAGAGTACAC+AGG 0.658925 4:-50060537 MsG0480020883.01.T01:CDS
GATTGCTCAACAGAAACACT+CGG 0.666652 4:+50058714 None:intergenic
ATATGCATTGGAGCAGCTAG+GGG 0.667881 4:-50059332 MsG0480020883.01.T01:CDS
CTAAAGTTGCTTGTAAGAGG+GGG 0.668973 4:-50059565 MsG0480020883.01.T01:CDS
ACAACGGGATTCAAAGACAT+GGG 0.674897 4:-50059783 MsG0480020883.01.T01:CDS
ATCCGCGAAGAGAGTACACA+GGG 0.684954 4:-50060536 MsG0480020883.01.T01:intron
AGCAGTGGAATTGTTCGACG+GGG 0.728874 4:+50060626 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! TTATTTTTTTATTTTTTTAA+AGG + Chr4:50059599-50059618 None:intergenic 0.0%
!!! TTTTATATGACTAAAAAAAT+AGG - Chr4:50059556-50059575 MsG0480020883.01.T01:CDS 10.0%
!! AAAATAATCAATATTACAAG+AGG - Chr4:50059784-50059803 MsG0480020883.01.T01:CDS 15.0%
!! AATAAAATTCTTGTAAGTAT+TGG - Chr4:50061779-50061798 MsG0480020883.01.T02:intron 15.0%
!!! AATAAAATTTTAGAGTTTGA+CGG + Chr4:50059035-50059054 None:intergenic 15.0%
!!! ATTGTTGTTATTGTAATATT+AGG + Chr4:50060249-50060268 None:intergenic 15.0%
!!! CTTGTAATATTGATTATTTT+CGG + Chr4:50059784-50059803 None:intergenic 15.0%
!!! TTGTAATTTTGATATGAAAA+TGG + Chr4:50061044-50061063 None:intergenic 15.0%
!!! TTTACTTTCTATGAAATTTT+CGG + Chr4:50059761-50059780 None:intergenic 15.0%
!! AAAAATAATTACAAAGGAAG+GGG - Chr4:50059066-50059085 MsG0480020883.01.T01:CDS 20.0%
!! AAAATGGAAAGAAATAAAGA+CGG + Chr4:50061028-50061047 None:intergenic 20.0%
!! ACATTTCCTATTAACAAAAA+GGG - Chr4:50060990-50061009 MsG0480020883.01.T01:CDS 20.0%
!! AGAAAAAATGAGTTTAATTG+TGG + Chr4:50059335-50059354 None:intergenic 20.0%
!! AGTACTATATCAAATTGTTA+AGG - Chr4:50060480-50060499 MsG0480020883.01.T01:intron 20.0%
!! ATGCTAGTAGTATTATAATA+TGG + Chr4:50060078-50060097 None:intergenic 20.0%
!! GAAAAATAATTACAAAGGAA+GGG - Chr4:50059065-50059084 MsG0480020883.01.T01:CDS 20.0%
!! GATTATGGAAATCTATAATT+TGG - Chr4:50059173-50059192 MsG0480020883.01.T01:CDS 20.0%
!! GTAACAAAATCCATAAAATA+CGG + Chr4:50061743-50061762 None:intergenic 20.0%
!! GTTTATTGTTTATACCATTA+AGG + Chr4:50060187-50060206 None:intergenic 20.0%
!! TCTATAAGGTAATTATCTAT+AGG + Chr4:50060783-50060802 None:intergenic 20.0%
!! TGAAGAGAGAATAAAATAAA+AGG + Chr4:50060335-50060354 None:intergenic 20.0%
!!! AATGAATGTTGATTTCTTTA+GGG + Chr4:50059213-50059232 None:intergenic 20.0%
!!! ACTCTTGATTTTAATTTTTC+AGG + Chr4:50058819-50058838 None:intergenic 20.0%
!!! GTAACTTTTTTTTATAAGCA+AGG - Chr4:50058936-50058955 MsG0480020883.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTACTTTCTGTTTTTTTCTT+TGG + Chr4:50059109-50059128 None:intergenic 20.0%
!!! TTCATAACAGGATTTTTTTT+CGG + Chr4:50061131-50061150 None:intergenic 20.0%
! AAAAAATGAAGATGAAGAAG+AGG + Chr4:50058708-50058727 None:intergenic 25.0%
! AAAATAATTACAAAGGAAGG+GGG - Chr4:50059067-50059086 MsG0480020883.01.T01:CDS 25.0%
! AACACATGTTAATACCTTAA+TGG - Chr4:50060170-50060189 MsG0480020883.01.T01:intron 25.0%
! AACTATCTGATGTAAAATTG+AGG + Chr4:50060842-50060861 None:intergenic 25.0%
! AAGGGGAAAAATAATTACAA+AGG - Chr4:50059060-50059079 MsG0480020883.01.T01:CDS 25.0%
! ACAACATTTCAATTTCAGTT+CGG + Chr4:50062317-50062336 None:intergenic 25.0%
! ATAACAGAGTGAACAAAATA+AGG + Chr4:50060573-50060592 None:intergenic 25.0%
! ATATATGAATACATGGAGAA+CGG - Chr4:50062405-50062424 MsG0480020883.01.T02:intron 25.0%
! ATCCTCGTAAAAAAAAATTC+CGG + Chr4:50059728-50059747 None:intergenic 25.0%
! ATTAATACATCACTATCATG+TGG - Chr4:50060676-50060695 MsG0480020883.01.T01:CDS 25.0%
! ATTGAATTTGAAAGAAGAGA+AGG - Chr4:50060647-50060666 MsG0480020883.01.T01:CDS 25.0%
! CACATTTCCTATTAACAAAA+AGG - Chr4:50060989-50061008 MsG0480020883.01.T01:CDS 25.0%
! GAAAAAAAATCCTGTTATGA+AGG - Chr4:50061130-50061149 MsG0480020883.01.T01:CDS 25.0%
! GAAAACAGTACTAATATGAT+CGG - Chr4:50063050-50063069 MsG0480020883.01.T02:intron 25.0%
! GATAATTACCTTATAGATTG+TGG - Chr4:50060786-50060805 MsG0480020883.01.T01:CDS 25.0%
! GATCTTGATATATGAATACA+TGG - Chr4:50062398-50062417 MsG0480020883.01.T02:intron 25.0%
! GCAACAATTAACAGAAAAAT+CGG - Chr4:50062716-50062735 MsG0480020883.01.T02:intron 25.0%
! GGAAAAATAATTACAAAGGA+AGG - Chr4:50059064-50059083 MsG0480020883.01.T01:CDS 25.0%
! TAATCACTATTTACATCAGA+AGG + Chr4:50061805-50061824 None:intergenic 25.0%
! TCACATACAAATACTTCAAT+AGG - Chr4:50060810-50060829 MsG0480020883.01.T01:CDS 25.0%
! TCATCAAAGTTGTCTAATTT+GGG + Chr4:50059919-50059938 None:intergenic 25.0%
! TGAAAAGACTCATAATACTT+TGG - Chr4:50061712-50061731 MsG0480020883.01.T02:intron 25.0%
! TGTTAATCATAATACCAAAG+AGG + Chr4:50060603-50060622 None:intergenic 25.0%
! TTTAAAGAGTTGTCAAAAAG+TGG - Chr4:50060033-50060052 MsG0480020883.01.T01:intron 25.0%
!! AGATTTCCATAATCTGTTTT+TGG + Chr4:50059167-50059186 None:intergenic 25.0%
!! ATATTAGTACTGTTTTCTTC+AGG + Chr4:50063047-50063066 None:intergenic 25.0%
!!! AAACAATTTTGATGAGAGTT+GGG - Chr4:50062182-50062201 MsG0480020883.01.T02:intron 25.0%
!!! CTGTTATTTTTTTACCTCTT+TGG - Chr4:50060586-50060605 MsG0480020883.01.T01:CDS 25.0%
!!! GAATGAATGTTGATTTCTTT+AGG + Chr4:50059214-50059233 None:intergenic 25.0%
!!! GATTTCCATAATCTGTTTTT+GGG + Chr4:50059166-50059185 None:intergenic 25.0%
!!! GTCATGTCAAGAATTTTTTA+TGG + Chr4:50059862-50059881 None:intergenic 25.0%
!!! TATTTTTTTAAAGGTACACG+TGG + Chr4:50059590-50059609 None:intergenic 25.0%
!!! TTAATTTTTCAGGTGAGAAA+AGG + Chr4:50058809-50058828 None:intergenic 25.0%
!!! TTTCTGTTTTTTTCTTTGGA+GGG + Chr4:50059105-50059124 None:intergenic 25.0%
!!! TTTTTTTATAAGCAAGGAGA+GGG - Chr4:50058942-50058961 MsG0480020883.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTTTTTTATAAGCAAGGAG+AGG - Chr4:50058941-50058960 MsG0480020883.01.T01:CDS 25.0%
AAACACCCAAAAACAGATTA+TGG - Chr4:50059158-50059177 MsG0480020883.01.T01:CDS 30.0%
AAATAACCAGCTTAATGTTC+AGG + Chr4:50060407-50060426 None:intergenic 30.0%
AAATATGCACAGTCATATGA+GGG - Chr4:50059691-50059710 MsG0480020883.01.T01:CDS 30.0%
AACTAAAGTTGCTTGTAAGA+GGG - Chr4:50062257-50062276 MsG0480020883.01.T02:intron 30.0%
AATCAATGAACCGAAAATAG+TGG + Chr4:50060109-50060128 None:intergenic 30.0%
ACATATGAGTATGAGAGATA+GGG - Chr4:50060007-50060026 MsG0480020883.01.T01:CDS 30.0%
ACTGTGCATATATGTTTATG+TGG + Chr4:50059642-50059661 None:intergenic 30.0%
AGAAACTGCTGAAAAATGTT+TGG - Chr4:50062929-50062948 MsG0480020883.01.T02:intron 30.0%
AGTCCATTCAAAATTGCATT+AGG + Chr4:50061829-50061848 None:intergenic 30.0%
ATAAAGAGAGATAGATGAGT+TGG + Chr4:50060310-50060329 None:intergenic 30.0%
ATAAAGAGGTGAAAAATCAG+TGG + Chr4:50060934-50060953 None:intergenic 30.0%
ATAGGAAATGTGTACTTAGA+AGG + Chr4:50060981-50061000 None:intergenic 30.0%
ATCAATGAACCGAAAATAGT+GGG + Chr4:50060108-50060127 None:intergenic 30.0%
ATGACAGTAGCATATTATAG+AGG - Chr4:50059877-50059896 MsG0480020883.01.T01:CDS 30.0%
ATTCTTGCAGTTTGATAAAG+AGG + Chr4:50060948-50060967 None:intergenic 30.0%
CAATCACAAGAAGAGAAAAT+TGG + Chr4:50059945-50059964 None:intergenic 30.0%
CGACATCTAGTATCATTAAT+TGG - Chr4:50062351-50062370 MsG0480020883.01.T02:intron 30.0%
CTTCAAGAGGTTATTGTTAA+AGG - Chr4:50063017-50063036 MsG0480020883.01.T02:intron 30.0%
GAATATCTTCTTGTGTTGAA+AGG + Chr4:50060878-50060897 None:intergenic 30.0%
GTAGTAATTTCAATGTGACA+TGG - Chr4:50061555-50061574 MsG0480020883.01.T02:intron 30.0%
GTCATCAAAGTTGTCTAATT+TGG + Chr4:50059920-50059939 None:intergenic 30.0%
GTCCATTCAAAATTGCATTA+GGG + Chr4:50061828-50061847 None:intergenic 30.0%
TAATTGGATATTGTGACGAA+AGG - Chr4:50062367-50062386 MsG0480020883.01.T02:intron 30.0%
TACTTGAAAAGTTAGTAGCA+AGG + Chr4:50061436-50061455 None:intergenic 30.0%
TACTTTAACTGAGATGAACT+CGG - Chr4:50061520-50061539 MsG0480020883.01.T02:intron 30.0%
TAGTAAGTAACAGATGGATA+TGG + Chr4:50060219-50060238 None:intergenic 30.0%
TATGTGATCCACAATCTATA+AGG + Chr4:50060797-50060816 None:intergenic 30.0%
TGCTGTTAAATATGCAAAAG+GGG - Chr4:50061460-50061479 MsG0480020883.01.T02:intron 30.0%
TTCCTATTAACAAAAAGGGT+AGG - Chr4:50060994-50061013 MsG0480020883.01.T01:CDS 30.0%
TTGTGATTGGACAAAAACAA+TGG - Chr4:50059956-50059975 MsG0480020883.01.T01:CDS 30.0%
TTTGCAGAAAAACATACCAA+AGG + Chr4:50060753-50060772 None:intergenic 30.0%
! AGAATTTTATTGTCAACCGA+CGG + Chr4:50061770-50061789 None:intergenic 30.0%
! ATGACTTTACCCACTATTTT+CGG - Chr4:50060096-50060115 MsG0480020883.01.T01:intron 30.0%
! CAATTTTCTCTTCTTGTGAT+TGG - Chr4:50059943-50059962 MsG0480020883.01.T01:CDS 30.0%
! GGTTCAAATTCTAAGAAAGT+TGG - Chr4:50061922-50061941 MsG0480020883.01.T02:intron 30.0%
! GTGCTGTTAAATATGCAAAA+GGG - Chr4:50061459-50061478 MsG0480020883.01.T02:intron 30.0%
! TACCCTAATGCAATTTTGAA+TGG - Chr4:50061823-50061842 MsG0480020883.01.T02:intron 30.0%
! TGTCTTATCAGTTTTTCCTT+TGG - Chr4:50060734-50060753 MsG0480020883.01.T01:CDS 30.0%
!! AAGAAGGATATTGTTTTGTG+TGG + Chr4:50061093-50061112 None:intergenic 30.0%
!! CAAACAATTTTGATGAGAGT+TGG - Chr4:50062181-50062200 MsG0480020883.01.T02:intron 30.0%
!! GAAAAATGTTTGGCTGATTT+TGG - Chr4:50062939-50062958 MsG0480020883.01.T02:intron 30.0%
!! GGAATTGATTGATTTTAAGG+TGG + Chr4:50060910-50060929 None:intergenic 30.0%
!! GGTGGAATTGATTGATTTTA+AGG + Chr4:50060913-50060932 None:intergenic 30.0%
!!! CTTTCTGTTTTTTTCTTTGG+AGG + Chr4:50059106-50059125 None:intergenic 30.0%
!!! GCTACTAACTTTTCAAGTAT+AGG - Chr4:50061437-50061456 MsG0480020883.01.T02:intron 30.0%
!!! TTCCGGAATTTTTTTTTACG+AGG - Chr4:50059723-50059742 MsG0480020883.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTTTTTATAAGCAAGGAGAG+GGG - Chr4:50058943-50058962 MsG0480020883.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTTTTTTCTTTGGAGGGTTT+TGG + Chr4:50059099-50059118 None:intergenic 30.0%
AAAGACATGGGTTCCTTTAT+CGG - Chr4:50062053-50062072 MsG0480020883.01.T02:intron 35.0%
AAATCGGACGTGTATTCATT+TGG - Chr4:50062732-50062751 MsG0480020883.01.T02:intron 35.0%
AAATGAAGATGAAGAAGAGG+AGG + Chr4:50058705-50058724 None:intergenic 35.0%
AATAACTGCTTTAGCATAGC+CGG + Chr4:50062535-50062554 None:intergenic 35.0%
AATAGCATTCACAAAAGCAG+TGG + Chr4:50061216-50061235 None:intergenic 35.0%
AATCGGACGTGTATTCATTT+GGG - Chr4:50062733-50062752 MsG0480020883.01.T02:intron 35.0%
ACAAGAACTAGGAAGATCTA+AGG + Chr4:50060517-50060536 None:intergenic 35.0%
ACCTTAAGAACACAAGAACT+AGG + Chr4:50060528-50060547 None:intergenic 35.0%
ACTAAAGTTGCTTGTAAGAG+GGG - Chr4:50062258-50062277 MsG0480020883.01.T02:intron 35.0%
AGGATGCTCTTATCTTTACA+AGG + Chr4:50059825-50059844 None:intergenic 35.0%
AGGTGAGAAAAGGAAATAAG+AGG + Chr4:50058799-50058818 None:intergenic 35.0%
ATGATACTAGATGTCGATGA+CGG + Chr4:50062347-50062366 None:intergenic 35.0%
CAAATATGCACAGTCATATG+AGG - Chr4:50059690-50059709 MsG0480020883.01.T01:CDS 35.0%
CACATATGAGTATGAGAGAT+AGG - Chr4:50060006-50060025 MsG0480020883.01.T01:CDS 35.0%
CAGAGTGAACAAAATAAGGA+TGG + Chr4:50060569-50060588 None:intergenic 35.0%
CGATGAAATGGCAGAAAAAA+GGG - Chr4:50062838-50062857 MsG0480020883.01.T02:intron 35.0%
GAAAAGTTAGTAGCAAGGTT+AGG + Chr4:50061431-50061450 None:intergenic 35.0%
GAACTAAAGTTGCTTGTAAG+AGG - Chr4:50062256-50062275 MsG0480020883.01.T02:intron 35.0%
GATGAAATGGCAGAAAAAAG+GGG - Chr4:50062839-50062858 MsG0480020883.01.T02:intron 35.0%
GCAAACTTTCTTAGAGAATC+TGG + Chr4:50062909-50062928 None:intergenic 35.0%
GCTGTTAAATATGCAAAAGG+GGG - Chr4:50061461-50061480 MsG0480020883.01.T02:intron 35.0%
GGATGCTCTTATCTTTACAA+GGG + Chr4:50059824-50059843 None:intergenic 35.0%
GTCACATTGAAATTACTACG+CGG + Chr4:50061554-50061573 None:intergenic 35.0%
GTGAACAAAATAAGGATGGA+AGG + Chr4:50060565-50060584 None:intergenic 35.0%
TACAAAGGTGAATTAAGCGA+TGG - Chr4:50062234-50062253 MsG0480020883.01.T02:intron 35.0%
TCCAGTTTAGATGATCTTTC+AGG - Chr4:50063140-50063159 MsG0480020883.01.T02:CDS 35.0%
TGTGGAATTGTAGAGAAGAT+TGG - Chr4:50060694-50060713 MsG0480020883.01.T01:CDS 35.0%
TGTTTACATCACTTCCTTGT+TGG - Chr4:50061667-50061686 MsG0480020883.01.T02:intron 35.0%
TTATGGTCACATGTGATAGA+AGG + Chr4:50059845-50059864 None:intergenic 35.0%
TTCTGTGACATTGTCAGTAA+AGG - Chr4:50061623-50061642 MsG0480020883.01.T02:intron 35.0%
TTGATCCGGAATATTTCAGA+AGG - Chr4:50062694-50062713 MsG0480020883.01.T02:intron 35.0%
TTTGATGAGAGTTGGGTTAT+TGG - Chr4:50062189-50062208 MsG0480020883.01.T02:intron 35.0%
! GATTTCTTTAGGGATAGATG+TGG + Chr4:50059203-50059222 None:intergenic 35.0%
! GTTAAAGTACCATAGACACT+AGG + Chr4:50061509-50061528 None:intergenic 35.0%
! TCCTAGTTCTTGTGTTCTTA+AGG - Chr4:50060524-50060543 MsG0480020883.01.T01:intron 35.0%
! TTTGGCTACTCCGTATTTTA+TGG - Chr4:50061730-50061749 MsG0480020883.01.T02:intron 35.0%
!! AAGAAAGTTGGTGTGATAGT+GGG - Chr4:50061934-50061953 MsG0480020883.01.T02:intron 35.0%
!! ACGGTTTTTAGGCTTAACAT+GGG - Chr4:50061332-50061351 MsG0480020883.01.T02:intron 35.0%
!! ATGCATTTGAGACGGTTTTT+AGG - Chr4:50061321-50061340 MsG0480020883.01.T02:intron 35.0%
!! CGAACAAGGTATTGAAATTC+TGG + Chr4:50061596-50061615 None:intergenic 35.0%
!! GGTGCTGTTAAATATGCAAA+AGG - Chr4:50061458-50061477 MsG0480020883.01.T02:intron 35.0%
!! GGTTTTGGTAAGGTATACAA+AGG - Chr4:50062219-50062238 MsG0480020883.01.T02:intron 35.0%
!! TAAGAAAGTTGGTGTGATAG+TGG - Chr4:50061933-50061952 MsG0480020883.01.T02:intron 35.0%
!! TGCTCGAAATTGTTGATTTG+CGG + Chr4:50063086-50063105 None:intergenic 35.0%
!! TGTTGCCTTCTGAAATATTC+CGG + Chr4:50062702-50062721 None:intergenic 35.0%
!! TTAACATGTGTTAGCTTGTG+AGG + Chr4:50060162-50060181 None:intergenic 35.0%
!! TTCTGAAATATTCCGGATCA+AGG + Chr4:50062695-50062714 None:intergenic 35.0%
!!! ATTTTAGAGTTTGACGGCAT+AGG + Chr4:50059029-50059048 None:intergenic 35.0%
!!! GACCACTTTTTGTTGATCAT+GGG - Chr4:50058739-50058758 MsG0480020883.01.T01:CDS 35.0%
!!! GTAGTTTTATTGCATGTAGC+AGG - Chr4:50060624-50060643 MsG0480020883.01.T01:CDS 35.0%
AAAGCAGTGGAATTGTTCGA+CGG + Chr4:50061203-50061222 None:intergenic 40.0%
AACAACGGGATTCAAAGACA+TGG - Chr4:50062040-50062059 MsG0480020883.01.T02:intron 40.0%
AAGAGGTGAAAAATCAGTGG+TGG + Chr4:50060931-50060950 None:intergenic 40.0%
AAGAGTCATCTGTATGGTTC+AGG - Chr4:50062435-50062454 MsG0480020883.01.T02:intron 40.0%
ACAACGGGATTCAAAGACAT+GGG - Chr4:50062041-50062060 MsG0480020883.01.T02:intron 40.0%
ACATGTGTCTGATCAATCTC+CGG + Chr4:50062642-50062661 None:intergenic 40.0%
ACCAAGTACTCCTTCATAAC+AGG + Chr4:50061143-50061162 None:intergenic 40.0%
ACTGTCAAGAGTCATCTGTA+TGG - Chr4:50062429-50062448 MsG0480020883.01.T02:intron 40.0%
AGCACGTAGTAAGTAACAGA+TGG + Chr4:50060225-50060244 None:intergenic 40.0%
ATCGGACGTGTATTCATTTG+GGG - Chr4:50062734-50062753 MsG0480020883.01.T02:intron 40.0%
ATTCAAGGCGATAGCATCAT+CGG + Chr4:50061270-50061289 None:intergenic 40.0%
CACAGAAATGAAGTCGAACA+AGG + Chr4:50061610-50061629 None:intergenic 40.0%
CAGAAAGAGAAGAAGACAGT+TGG - Chr4:50062014-50062033 MsG0480020883.01.T02:intron 40.0%
CTAAAGTTGCTTGTAAGAGG+GGG - Chr4:50062259-50062278 MsG0480020883.01.T02:intron 40.0%
GAACGACTTGAGATATGCAT+TGG - Chr4:50062480-50062499 MsG0480020883.01.T02:intron 40.0%
GATGGTACTTCTCACACAAT+GGG - Chr4:50062075-50062094 MsG0480020883.01.T02:intron 40.0%
GATTGCTCAACAGAAACACT+CGG + Chr4:50063113-50063132 None:intergenic 40.0%
GCAAATCAACAATTTCGAGC+AGG - Chr4:50063085-50063104 MsG0480020883.01.T02:intron 40.0%
GCACACTAAAGCTACTAAGA+AGG + Chr4:50061109-50061128 None:intergenic 40.0%
GCCTGAAAGATCATCTAAAC+TGG + Chr4:50063144-50063163 None:intergenic 40.0%
GCGATGAAATGGCAGAAAAA+AGG - Chr4:50062837-50062856 MsG0480020883.01.T02:intron 40.0%
GTATGCTCTTCAACTTCAAG+AGG - Chr4:50063004-50063023 MsG0480020883.01.T02:intron 40.0%
GTCCCATGATCAACAAAAAG+TGG + Chr4:50058744-50058763 None:intergenic 40.0%
GTTCCTTCCAACTTAAGCTA+GGG + Chr4:50062464-50062483 None:intergenic 40.0%
GTTGACAGATGCATTTGAGA+CGG - Chr4:50061313-50061332 MsG0480020883.01.T02:intron 40.0%
TAACCAGCTTAATGTTCAGG+TGG + Chr4:50060404-50060423 None:intergenic 40.0%
TACAAAGAAACCTCCAACCA+TGG + Chr4:50061992-50062011 None:intergenic 40.0%
TCAACACTAGAGGAAACACT+TGG + Chr4:50061362-50061381 None:intergenic 40.0%
TCATCGGCAATTAGATCATC+AGG + Chr4:50061254-50061273 None:intergenic 40.0%
TCTCTTCACAGACACAAGAT+AGG - Chr4:50060347-50060366 MsG0480020883.01.T01:intron 40.0%
TGTATCAGGAAGCTTGTATC+CGG + Chr4:50061407-50061426 None:intergenic 40.0%
TTAACAAAAAGGGTAGGCGT+TGG - Chr4:50061000-50061019 MsG0480020883.01.T01:CDS 40.0%
! AAAGTACCATAGACACTAGG+TGG + Chr4:50061506-50061525 None:intergenic 40.0%
! ATGGCAAAAGTAGCCGATTT+CGG - Chr4:50062600-50062619 MsG0480020883.01.T02:intron 40.0%
! CGCCTACCCTTTTTGTTAAT+AGG + Chr4:50060999-50061018 None:intergenic 40.0%
! CTTTCCTTTTGCAGTAGTTC+AGG - Chr4:50062152-50062171 MsG0480020883.01.T02:intron 40.0%
! GAGTAAAGTATTCTCACAGC+TGG - Chr4:50063172-50063191 MsG0480020883.01.T02:CDS 40.0%
! GTTATTGGTGTAGGTGGTTT+TGG - Chr4:50062204-50062223 MsG0480020883.01.T02:intron 40.0%
! TAGCAAGGTTAGGTTGTATC+AGG + Chr4:50061421-50061440 None:intergenic 40.0%
!! AATTGTTGATTTGCGGACAG+AGG + Chr4:50063079-50063098 None:intergenic 40.0%
!! CTTATTTTCCCAGCAAGTGT+TGG + Chr4:50062885-50062904 None:intergenic 40.0%
!! GACGGTTTTTAGGCTTAACA+TGG - Chr4:50061331-50061350 MsG0480020883.01.T02:intron 40.0%
!! GTTTTTAGGCTTAACATGGG+AGG - Chr4:50061335-50061354 MsG0480020883.01.T02:intron 40.0%
!! TCCTGTTATGAAGGAGTACT+TGG - Chr4:50061139-50061158 MsG0480020883.01.T02:intron 40.0%
!! TGAGAAGTACCATCCGATAA+AGG + Chr4:50062069-50062088 None:intergenic 40.0%
!! TGATAGTGGGTGTTAGTCTT+GGG - Chr4:50061947-50061966 MsG0480020883.01.T02:intron 40.0%
!!! CGACCACTTTTTGTTGATCA+TGG - Chr4:50058738-50058757 MsG0480020883.01.T01:CDS 40.0%
!!! TCTTGGGATATTTTTTGCGC+TGG - Chr4:50061963-50061982 MsG0480020883.01.T02:intron 40.0%
AAAGGGTGAACTTGGCAGAA+TGG - Chr4:50062814-50062833 MsG0480020883.01.T02:intron 45.0%
AAGACAGTTGGCACAACAAC+GGG - Chr4:50062026-50062045 MsG0480020883.01.T02:intron 45.0%
AAGATCCTTGACAGCCAACA+AGG + Chr4:50061684-50061703 None:intergenic 45.0%
AAGCAGTGGAATTGTTCGAC+GGG + Chr4:50061202-50061221 None:intergenic 45.0%
AAGGGTGAACTTGGCAGAAT+GGG - Chr4:50062815-50062834 MsG0480020883.01.T02:intron 45.0%
ACATGGGTTCCTTTATCGGA+TGG - Chr4:50062057-50062076 MsG0480020883.01.T02:intron 45.0%
AGATATGCATTGGAGCAGCT+AGG - Chr4:50062490-50062509 MsG0480020883.01.T02:intron 45.0%
AGTTGGGTTATTGGTGTAGG+TGG - Chr4:50062198-50062217 MsG0480020883.01.T02:intron 45.0%
ATATGCATTGGAGCAGCTAG+GGG - Chr4:50062492-50062511 MsG0480020883.01.T02:intron 45.0%
ATGTGAGCACAGCTGTCAAA+GGG - Chr4:50062658-50062677 MsG0480020883.01.T02:intron 45.0%
ATTACAAAGGAAGGGGGACT+AGG - Chr4:50059073-50059092 MsG0480020883.01.T01:CDS 45.0%
ATTCCACAATACATCGCCCA+TGG + Chr4:50062979-50062998 None:intergenic 45.0%
ATTGCTCCACCTAGTGTCTA+TGG - Chr4:50061497-50061516 MsG0480020883.01.T02:intron 45.0%
CATAGCCGGTATGAAGGTAA+TGG + Chr4:50062521-50062540 None:intergenic 45.0%
CATAGGATGGAGATTTCTCG+GGG + Chr4:50059012-50059031 None:intergenic 45.0%
CATCGACATCCCAACTATGT+TGG - Chr4:50058984-50059003 MsG0480020883.01.T01:CDS 45.0%
CCATGAGGTTCTCATCAAGT+AGG + Chr4:50062584-50062603 None:intergenic 45.0%
CCTACTTGATGAGAACCTCA+TGG - Chr4:50062581-50062600 MsG0480020883.01.T02:intron 45.0%
CGTTCCTTCCAACTTAAGCT+AGG + Chr4:50062465-50062484 None:intergenic 45.0%
CTTTAGCATAGCCGGTATGA+AGG + Chr4:50062527-50062546 None:intergenic 45.0%
GAAGACAGTTGGCACAACAA+CGG - Chr4:50062025-50062044 MsG0480020883.01.T02:intron 45.0%
GAGAGTTGGGTTATTGGTGT+AGG - Chr4:50062195-50062214 MsG0480020883.01.T02:intron 45.0%
GATATGCATTGGAGCAGCTA+GGG - Chr4:50062491-50062510 MsG0480020883.01.T02:intron 45.0%
GCATAGGATGGAGATTTCTC+GGG + Chr4:50059013-50059032 None:intergenic 45.0%
GCTGTCAAGGATCTTGATCT+TGG - Chr4:50061689-50061708 MsG0480020883.01.T02:intron 45.0%
GGAAGGGATGGATCTATAAC+AGG + Chr4:50062789-50062808 None:intergenic 45.0%
GGACTCCATTACCTTCATAC+CGG - Chr4:50062513-50062532 MsG0480020883.01.T02:intron 45.0%
GGATGGTACTTCTCACACAA+TGG - Chr4:50062074-50062093 MsG0480020883.01.T02:intron 45.0%
GGCATAGGATGGAGATTTCT+CGG + Chr4:50059014-50059033 None:intergenic 45.0%
GGGCGATGTATTGTGGAATT+TGG - Chr4:50062980-50062999 MsG0480020883.01.T02:intron 45.0%
GGTGATGACAAGTGTGTCTA+AGG + Chr4:50061174-50061193 None:intergenic 45.0%
TAATGTTCAGGTGGCTGCTT+TGG + Chr4:50060395-50060414 None:intergenic 45.0%
TAGAGTTTGACGGCATAGGA+TGG + Chr4:50059025-50059044 None:intergenic 45.0%
TGAAGATGAAGAAGAGGAGG+AGG + Chr4:50058702-50058721 None:intergenic 45.0%
! ACAGCTGTCAAAGGGAGTTT+TGG - Chr4:50062666-50062685 MsG0480020883.01.T02:intron 45.0%
! ACTGTGCATATTTGCTGACG+TGG + Chr4:50059684-50059703 None:intergenic 45.0%
! ATTTGGGGTAGTTCTGCTTG+AGG - Chr4:50062749-50062768 MsG0480020883.01.T02:intron 45.0%
! GGATTTTGTTACGACACCGT+CGG - Chr4:50061751-50061770 MsG0480020883.01.T02:intron 45.0%
! TCCTTTTGCAGTAGTTCAGG+AGG - Chr4:50062155-50062174 MsG0480020883.01.T02:intron 45.0%
! TGGCAAAAGTAGCCGATTTC+GGG - Chr4:50062601-50062620 MsG0480020883.01.T02:intron 45.0%
!! CCAGTGCTGCTTCAAATTTC+GGG - Chr4:50062124-50062143 MsG0480020883.01.T02:intron 45.0%
!! GCCAGTGCTGCTTCAAATTT+CGG - Chr4:50062123-50062142 MsG0480020883.01.T02:intron 45.0%
!! GGTGTTGATAGACCTTCCAT+GGG - Chr4:50062960-50062979 MsG0480020883.01.T02:intron 45.0%
!! GTGATAGTGGGTGTTAGTCT+TGG - Chr4:50061946-50061965 MsG0480020883.01.T02:intron 45.0%
!! GTGGCTTTGACGAGTAATCA+TGG - Chr4:50061901-50061920 MsG0480020883.01.T02:intron 45.0%
!! TCTCCCTAGCTTAAGTTGGA+AGG - Chr4:50062458-50062477 MsG0480020883.01.T02:intron 45.0%
!! TGGTGTTGATAGACCTTCCA+TGG - Chr4:50062959-50062978 MsG0480020883.01.T02:intron 45.0%
!!! AATCGGCTACTTTTGCCATG+AGG + Chr4:50062599-50062618 None:intergenic 45.0%
!!! GAGTTTTGGCTACCTTGATC+CGG - Chr4:50062680-50062699 MsG0480020883.01.T02:intron 45.0%
!!! TGGGATATTTTTTGCGCTGG+TGG - Chr4:50061966-50061985 MsG0480020883.01.T02:intron 45.0%
!!! TGGTGTAGGTGGTTTTGGTA+AGG - Chr4:50062209-50062228 MsG0480020883.01.T02:intron 45.0%
!!! CTAAAATTTTATTAAAAAAA+GGG - Chr4:50059042-50059061 MsG0480020883.01.T01:CDS 5.0%
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AACCCTGTGTACTCTCTTCG+CGG + Chr4:50061293-50061312 None:intergenic 50.0%
AGATGAAGAAGAGGAGGAGG+AGG + Chr4:50058699-50058718 None:intergenic 50.0%
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ATCCATCCCTTCCACGAGAA+AGG - Chr4:50062796-50062815 MsG0480020883.01.T02:intron 50.0%
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CACAATACATCGCCCATGGA+AGG + Chr4:50062975-50062994 None:intergenic 50.0%
CACAGTCATATGAGGGAGAG+GGG - Chr4:50059698-50059717 MsG0480020883.01.T01:CDS 50.0%
CAGCCACCTGAACATTAAGC+TGG - Chr4:50060398-50060417 MsG0480020883.01.T01:intron 50.0%
CAGGTCTCCCTAGCTTAAGT+TGG - Chr4:50062454-50062473 MsG0480020883.01.T02:intron 50.0%
CATGTGAGCACAGCTGTCAA+AGG - Chr4:50062657-50062676 MsG0480020883.01.T02:intron 50.0%
CTTCCATGGGCGATGTATTG+TGG - Chr4:50062973-50062992 MsG0480020883.01.T02:intron 50.0%
GAACCCAAGTTCGATGAAGC+GGG + Chr4:50061385-50061404 None:intergenic 50.0%
GCACAGTCATATGAGGGAGA+GGG - Chr4:50059697-50059716 MsG0480020883.01.T01:CDS 50.0%
GCCTCCTGAACTACTGCAAA+AGG + Chr4:50062159-50062178 None:intergenic 50.0%
GCTTCATCGAACTTGGGTTC+CGG - Chr4:50061385-50061404 MsG0480020883.01.T02:intron 50.0%
GGAACCCAAGTTCGATGAAG+CGG + Chr4:50061386-50061405 None:intergenic 50.0%
GGAATTGTTCGACGGGGAAA+AGG + Chr4:50061195-50061214 None:intergenic 50.0%
GTACTCTCTTCGCGGATTCA+AGG + Chr4:50061285-50061304 None:intergenic 50.0%
GTTCACCCTTTCTCGTGGAA+GGG + Chr4:50062805-50062824 None:intergenic 50.0%
TCACAGCTGGTGAAGTCTGA+GGG - Chr4:50063185-50063204 MsG0480020883.01.T02:CDS 50.0%
TCCACGAGAAAGGGTGAACT+TGG - Chr4:50062806-50062825 MsG0480020883.01.T02:intron 50.0%
TCCATCCCTTCCACGAGAAA+GGG - Chr4:50062797-50062816 MsG0480020883.01.T02:intron 50.0%
TCGTGGATCCAACACTTGCT+GGG - Chr4:50062874-50062893 MsG0480020883.01.T02:intron 50.0%
TGACCCGCTTCATCGAACTT+GGG - Chr4:50061379-50061398 MsG0480020883.01.T02:intron 50.0%
TGCACAGTCATATGAGGGAG+AGG - Chr4:50059696-50059715 MsG0480020883.01.T01:CDS 50.0%
TGGCAGAATGGGCGATGAAA+TGG - Chr4:50062826-50062845 MsG0480020883.01.T02:intron 50.0%
TGTCTGATCAATCTCCGGTC+CGG + Chr4:50062637-50062656 None:intergenic 50.0%
TTGACCCGCTTCATCGAACT+TGG - Chr4:50061378-50061397 MsG0480020883.01.T02:intron 50.0%
! AATCCGCGAAGAGAGTACAC+AGG - Chr4:50061287-50061306 MsG0480020883.01.T02:intron 50.0%
! ATCCGCGAAGAGAGTACACA+GGG - Chr4:50061288-50061307 MsG0480020883.01.T02:intron 50.0%
! CACTTCCTTGTTGGCTGTCA+AGG - Chr4:50061676-50061695 MsG0480020883.01.T02:intron 50.0%
! CCCGAAATTTGAAGCAGCAC+TGG + Chr4:50062127-50062146 None:intergenic 50.0%
!! GTGAGGTTCACTTTTGCTGC+TGG + Chr4:50060145-50060164 None:intergenic 50.0%
!!! ATTTTTTGCGCTGGTGGCCA+TGG - Chr4:50061972-50061991 MsG0480020883.01.T02:intron 50.0%
ACCCTTTCTCGTGGAAGGGA+TGG + Chr4:50062801-50062820 None:intergenic 55.0%
AGCTGGTGAAGTCTGAGGGA+AGG - Chr4:50063189-50063208 MsG0480020883.01.T02:CDS 55.0%
AGGGGAACTTGCACGAATCG+TGG - Chr4:50062857-50062876 MsG0480020883.01.T02:intron 55.0%
CTCACAGCTGGTGAAGTCTG+AGG - Chr4:50063184-50063203 MsG0480020883.01.T02:CDS 55.0%
CTTGTAAGAGGGGGAACCCT+CGG - Chr4:50062268-50062287 MsG0480020883.01.T02:intron 55.0%
GAGAGGGGACAGACATCAAG+AGG - Chr4:50058958-50058977 MsG0480020883.01.T01:CDS 55.0%
GCCAAGTTCACCCTTTCTCG+TGG + Chr4:50062810-50062829 None:intergenic 55.0%
TATGAGGGAGAGGGGTCTTC+CGG - Chr4:50059706-50059725 MsG0480020883.01.T01:CDS 55.0%
TGAAGAAGAGGAGGAGGAGG+AGG + Chr4:50058696-50058715 None:intergenic 55.0%
! CTCGGGGTGCCAACATAGTT+GGG + Chr4:50058996-50059015 None:intergenic 55.0%
! TCTCGGGGTGCCAACATAGT+TGG + Chr4:50058997-50059016 None:intergenic 55.0%
!! TGAAGCAGCACTGGCTGTTG+TGG + Chr4:50062118-50062137 None:intergenic 55.0%
AGAAGAGGAGGAGGAGGAGG+AGG + Chr4:50058693-50058712 None:intergenic 60.0%
CAAGTCCCTGATGCGACCGA+GGG + Chr4:50062287-50062306 None:intergenic 60.0%
TCTCAGTGCAGCTGCAGCTG+TGG - Chr4:50061882-50061901 MsG0480020883.01.T02:intron 60.0%
! TTTGCGCTGGTGGCCATGGT+TGG - Chr4:50061976-50061995 MsG0480020883.01.T02:intron 60.0%
GCAAGTCCCTGATGCGACCG+AGG + Chr4:50062288-50062307 None:intergenic 65.0%
GGAGGAGGAGGAGGAAGAGG+CGG + Chr4:50058684-50058703 None:intergenic 65.0%
GGAGGAGGAGGAGGAGGAAG+AGG + Chr4:50058687-50058706 None:intergenic 65.0%
GGGAACCCTCGGTCGCATCA+GGG - Chr4:50062279-50062298 MsG0480020883.01.T02:intron 65.0%
GGGGAACCCTCGGTCGCATC+AGG - Chr4:50062278-50062297 MsG0480020883.01.T02:intron 70.0%
! GCGCTGGTGGCCATGGTTGG+AGG - Chr4:50061979-50061998 MsG0480020883.01.T02:intron 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr4 gene 50058632 50063214 50058632 ID=MsG0480020883.01;Name=MsG0480020883.01
Chr4 mRNA 50058632 50061153 50058632 ID=MsG0480020883.01.T01;Parent=MsG0480020883.01;Name=MsG0480020883.01.T01;_AED=0.23;_eAED=0.23;_QI=0|0|0|1|0|0|2|0|678
Chr4 exon 50058632 50060051 50058632 ID=MsG0480020883.01.T01:exon:902;Parent=MsG0480020883.01.T01
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Chr4 mRNA 50058632 50063214 50058632 ID=MsG0480020883.01.T02;Parent=MsG0480020883.01;Name=MsG0480020883.01.T02;_AED=0.34;_eAED=0.34;_QI=0|0|0|1|0|0|2|0|405
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