AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0480022450.01


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MsG0480022450.01.T01 AT1G67000 46.897 290 134 6 253 525 566 852 3.12e-83 277
MsG0480022450.01.T01 AT1G66920 45.918 294 143 6 242 525 297 584 2.36e-82 269
MsG0480022450.01.T01 AT1G66920 45.918 294 143 6 242 525 305 592 2.50e-82 269
MsG0480022450.01.T01 AT5G39030 48.936 282 132 5 253 526 508 785 1.47e-81 271
MsG0480022450.01.T01 AT5G39030 49.110 281 131 5 253 525 502 778 1.70e-81 271
MsG0480022450.01.T01 AT4G18250 46.853 286 135 7 253 525 365 646 1.32e-80 266
MsG0480022450.01.T01 AT1G66980 45.552 281 142 3 253 525 798 1075 2.54e-80 272
MsG0480022450.01.T01 AT1G66980 45.552 281 142 3 253 525 815 1092 3.97e-80 272
MsG0480022450.01.T01 AT1G66930 45.804 286 136 6 253 525 356 635 4.06e-80 265
MsG0480022450.01.T01 AT1G66980 45.552 281 142 3 253 525 842 1119 4.10e-80 272
MsG0480022450.01.T01 AT1G66980 45.552 281 142 3 253 525 844 1121 5.13e-80 272
MsG0480022450.01.T01 AT1G70250 45.936 283 139 6 253 525 469 747 6.56e-80 266
MsG0480022450.01.T01 AT5G39020 47.670 279 138 4 253 526 506 781 1.26e-79 266
MsG0480022450.01.T01 AT1G66930 45.804 286 136 6 253 525 565 844 1.92e-78 264
MsG0480022450.01.T01 AT1G66920 41.638 293 131 6 242 525 305 566 9.86e-68 229
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MsG0480022450.01.T01 AT5G24080 41.156 294 161 7 253 539 413 701 2.82e-62 218
MsG0480022450.01.T01 AT1G66930 40.351 285 122 6 253 525 356 604 5.74e-62 215
MsG0480022450.01.T01 AT5G24080 41.156 294 161 7 253 539 540 828 9.43e-62 218
MsG0480022450.01.T01 AT1G34300 41.577 279 151 6 253 523 494 768 5.29e-61 216
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MsG0480022450.01.T01 AT5G35370 42.509 287 134 7 253 514 525 805 6.94e-59 210
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MsG0480022450.01.T01 AT4G11480 39.860 286 157 4 253 525 331 614 9.63e-58 204
MsG0480022450.01.T01 AT2G19130 41.343 283 155 4 253 528 503 781 1.27e-57 206
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MsG0480022450.01.T01 AT4G23320 38.929 280 160 4 253 525 193 468 1.97e-56 197
MsG0480022450.01.T01 AT4G04490 41.199 267 150 5 251 515 348 609 2.01e-56 200
MsG0480022450.01.T01 AT4G23320 38.929 280 160 4 253 525 214 489 2.35e-56 197
MsG0480022450.01.T01 AT4G23240 38.929 280 160 4 253 525 38 313 9.01e-56 191
MsG0480022450.01.T01 AT4G23200 39.929 283 157 5 251 525 344 621 1.04e-55 198
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MsG0480022450.01.T01 AT4G11480 39.643 280 158 4 253 525 334 609 1.55e-55 198
MsG0480022450.01.T01 AT4G11530 38.851 296 168 5 253 540 362 652 1.95e-55 198
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MsG0480022450.01.T01 AT4G11470 38.652 282 162 4 251 525 352 629 4.41e-55 197
MsG0480022450.01.T01 AT4G23280 37.710 297 172 5 251 539 350 641 6.54e-55 196
MsG0480022450.01.T01 AT4G23280 37.710 297 172 5 251 539 352 643 7.07e-55 196
MsG0480022450.01.T01 AT4G04510 40.364 275 156 5 251 522 347 616 2.06e-54 195
MsG0480022450.01.T01 AT4G04510 40.364 275 156 5 251 522 349 618 2.08e-54 195
MsG0480022450.01.T01 AT4G00960 37.762 286 155 7 253 523 66 343 2.30e-54 188
MsG0480022450.01.T01 AT4G11490 37.234 282 166 4 251 525 329 606 4.19e-54 194
MsG0480022450.01.T01 AT4G38830 37.838 296 168 6 239 525 343 631 4.80e-54 194
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MsG0480022450.01.T01 AT4G23270 38.298 282 163 4 251 525 334 611 8.94e-54 193
MsG0480022450.01.T01 AT4G23270 38.298 282 163 4 251 525 334 611 9.38e-54 193
MsG0480022450.01.T01 AT1G65800 36.275 306 177 7 232 523 510 811 1.79e-53 194
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MsG0480022450.01.T01 AT4G23290 38.929 280 160 4 253 525 330 605 4.11e-53 191
MsG0480022450.01.T01 AT4G00340 41.367 278 139 8 253 514 492 761 4.45e-53 193
MsG0480022450.01.T01 AT4G23260 35.906 298 172 6 241 523 320 613 4.52e-53 191
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MsG0480022450.01.T01 AT4G23290 38.929 280 160 4 253 525 373 648 6.78e-53 191
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MsG0480022450.01.T01 AT4G23260 35.906 298 172 6 241 523 331 624 7.77e-53 191
MsG0480022450.01.T01 AT4G21230 40.071 282 154 6 253 526 343 617 1.06e-52 190
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MsG0480022450.01.T01 AT4G23130 37.234 282 166 4 251 525 352 629 1.25e-52 190
MsG0480022450.01.T01 AT3G45860 37.809 283 164 4 251 525 359 637 1.34e-52 190
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MsG0480022450.01.T01 AT5G06740 34.680 297 174 8 251 534 350 639 1.56e-52 190
MsG0480022450.01.T01 AT4G23250 36.429 280 167 4 253 525 369 644 3.02e-52 189
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MsG0480022450.01.T01 AT4G23250 36.429 280 167 4 253 525 364 639 5.11e-52 189
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MsG0480022450.01.T01 AT5G18500 38.235 272 158 5 253 518 176 443 5.33e-52 185
MsG0480022450.01.T01 AT5G18500 38.235 272 158 5 253 518 176 443 5.33e-52 185
MsG0480022450.01.T01 AT5G18500 38.235 272 158 5 253 518 176 443 5.33e-52 185
MsG0480022450.01.T01 AT5G18500 38.235 272 158 5 253 518 176 443 5.33e-52 185
MsG0480022450.01.T01 AT1G01540 36.531 271 162 5 253 517 164 430 7.33e-52 184
MsG0480022450.01.T01 AT4G21380 38.380 284 160 6 251 523 534 813 7.96e-52 190
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MsG0480022450.01.T01 AT1G56120 37.107 318 165 8 227 515 670 981 8.84e-52 191
MsG0480022450.01.T01 AT4G23190 38.298 282 161 4 253 525 282 559 9.17e-52 186
MsG0480022450.01.T01 AT4G23190 38.298 282 161 4 253 525 282 559 9.17e-52 186
MsG0480022450.01.T01 AT4G11460 36.879 282 167 4 251 525 279 556 9.64e-52 187
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MsG0480022450.01.T01 AT1G53420 39.286 280 160 5 244 517 625 900 1.19e-51 190
MsG0480022450.01.T01 AT4G05200 37.282 287 162 5 253 529 357 635 1.25e-51 187
MsG0480022450.01.T01 AT4G05200 37.282 287 162 5 253 529 375 653 1.73e-51 187
MsG0480022450.01.T01 AT4G11460 37.102 283 168 4 251 525 354 634 1.91e-51 187
MsG0480022450.01.T01 AT1G11340 39.785 279 157 6 253 525 525 798 2.39e-51 188
MsG0480022450.01.T01 AT4G23190 38.298 282 161 4 253 525 360 637 2.63e-51 186
MsG0480022450.01.T01 AT4G11460 36.879 282 167 4 251 525 354 631 2.80e-51 187
MsG0480022450.01.T01 AT1G53430 40.672 268 149 5 253 514 638 901 2.94e-51 189
MsG0480022450.01.T01 AT5G10290 37.539 317 182 9 235 540 280 591 2.99e-51 185
MsG0480022450.01.T01 AT5G10290 37.539 317 182 9 235 540 280 591 2.99e-51 185
MsG0480022450.01.T01 AT1G53430 40.672 268 149 5 253 514 679 942 3.11e-51 189
MsG0480022450.01.T01 AT1G07650 36.111 288 175 4 244 525 466 750 3.14e-51 188
MsG0480022450.01.T01 AT4G23250 36.429 280 167 4 253 525 364 639 3.43e-51 189
MsG0480022450.01.T01 AT4G23310 36.577 298 178 4 251 541 516 809 3.55e-51 188
MsG0480022450.01.T01 AT4G23310 37.589 282 165 4 251 525 476 753 3.63e-51 187
MsG0480022450.01.T01 AT1G29720 37.124 299 174 6 235 525 663 955 4.01e-51 189
MsG0480022450.01.T01 AT3G14840 38.267 277 161 5 244 514 673 945 4.01e-51 189
MsG0480022450.01.T01 AT1G70530 37.201 293 169 8 251 534 331 617 5.53e-51 185
MsG0480022450.01.T01 AT4G04570 46.269 201 103 3 251 450 192 388 6.20e-51 180
MsG0480022450.01.T01 AT1G07650 36.111 288 175 4 244 525 653 937 7.35e-51 188
MsG0480022450.01.T01 AT4G02630 36.264 273 165 4 251 517 170 439 7.49e-51 182
MsG0480022450.01.T01 AT1G07650 36.111 288 175 4 244 525 685 969 7.92e-51 188
MsG0480022450.01.T01 AT1G56130 37.544 285 167 5 253 532 505 783 8.25e-51 187
MsG0480022450.01.T01 AT1G07650 36.111 288 175 4 244 525 679 963 9.72e-51 187
MsG0480022450.01.T01 AT4G00970 38.062 289 152 8 253 525 354 631 1.07e-50 185
MsG0480022450.01.T01 AT1G56130 37.193 285 168 5 253 532 556 834 1.14e-50 187
MsG0480022450.01.T01 AT5G20050 38.488 291 156 8 253 524 113 399 1.27e-50 180
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MsG0480022450.01.T01 AT4G21390 37.943 282 158 5 253 525 539 812 2.74e-50 186
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MsG0480022450.01.T01 AT1G29750 37.906 277 161 6 253 522 691 963 9.75e-50 185
MsG0480022450.01.T01 AT1G61610 38.462 286 155 7 251 526 533 807 9.75e-50 184
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MsG0480022450.01.T01 AT1G09440 37.500 272 156 6 253 516 167 432 1.16e-49 178
MsG0480022450.01.T01 AT5G40380 36.897 290 163 7 251 528 323 604 1.31e-49 181
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MsG0480022450.01.T01 AT4G01330 35.793 271 164 5 253 517 172 438 1.44e-49 178
MsG0480022450.01.T01 AT4G23140 37.276 279 165 5 253 525 361 635 1.50e-49 182
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MsG0480022450.01.T01 AT1G61440 36.972 284 158 7 253 525 493 766 2.96e-49 182
MsG0480022450.01.T01 AT4G21400 37.979 287 163 6 253 529 359 640 3.83e-49 180
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MsG0480022450.01.T01 AT1G61420 36.054 294 165 7 251 533 352 633 4.11e-49 180
MsG0480022450.01.T01 AT1G61420 36.054 294 165 7 251 533 354 635 4.17e-49 180
MsG0480022450.01.T01 AT4G21400 37.979 287 163 6 253 529 371 652 5.19e-49 180
MsG0480022450.01.T01 AT4G11900 37.906 277 159 5 253 520 478 750 7.37e-49 181
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MsG0480022450.01.T01 AT4G11900 37.906 277 159 5 253 520 547 819 1.16e-48 181
MsG0480022450.01.T01 AT1G29740 34.043 376 218 10 169 525 596 960 1.27e-48 181
MsG0480022450.01.T01 AT1G11300 37.545 277 162 6 251 523 517 786 1.51e-48 180
MsG0480022450.01.T01 AT1G61400 36.972 284 158 7 253 525 510 783 1.52e-48 180
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MsG0480022450.01.T01 AT1G61430 36.786 280 164 6 253 525 476 749 1.82e-48 180
MsG0480022450.01.T01 AT1G61430 36.786 280 164 6 253 525 476 749 1.82e-48 180
MsG0480022450.01.T01 AT1G61430 36.786 280 164 6 253 525 499 772 1.86e-48 180
MsG0480022450.01.T01 AT1G61420 36.054 294 165 7 251 533 504 785 1.92e-48 180
MsG0480022450.01.T01 AT1G61420 36.054 294 165 7 251 533 504 785 1.92e-48 180
MsG0480022450.01.T01 AT4G27290 34.944 269 158 5 251 509 473 734 2.10e-48 179
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MsG0480022450.01.T01 AT3G59110 35.662 272 165 5 253 518 200 467 2.19e-48 176
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MsG0480022450.01.T01 AT1G56720 36.496 274 160 6 253 518 189 456 2.35e-48 175
MsG0480022450.01.T01 AT1G56720 36.496 274 160 6 253 518 189 456 2.35e-48 175
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MsG0480022450.01.T01 AT4G03230 35.640 289 175 5 251 533 598 881 3.16e-48 180
MsG0480022450.01.T01 AT4G03230 35.640 289 175 5 251 533 698 981 3.54e-48 180
MsG0480022450.01.T01 AT4G03230 35.640 289 175 5 251 533 698 981 3.54e-48 180
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MsG0480022450.01.T01 AT1G55200 37.407 270 156 6 253 515 389 652 1.44e-47 176
MsG0480022450.01.T01 AT1G55200 37.407 270 156 6 253 515 389 652 1.44e-47 176
MsG0480022450.01.T01 AT5G65600 36.897 290 156 8 251 522 358 638 1.70e-47 176
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MsG0480022450.01.T01 AT3G16030 36.713 286 160 8 253 525 558 835 1.93e-47 177
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MsG0480022450.01.T01 AT4G23140 36.491 285 165 6 253 525 361 641 2.76e-47 175
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MsG0480022450.01.T01 AT1G61480 36.996 273 152 7 251 512 504 767 2.92e-47 176
MsG0480022450.01.T01 AT5G01550 36.331 278 157 9 253 519 389 657 2.94e-47 176
MsG0480022450.01.T01 AT1G61370 35.294 272 158 6 251 512 358 621 3.09e-47 175
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MsG0480022450.01.T01 AT3G24540 35.943 281 160 8 253 521 193 465 3.14e-47 172
MsG0480022450.01.T01 AT1G60800 36.242 298 166 7 253 530 311 604 3.58e-47 174
MsG0480022450.01.T01 AT1G61490 36.567 268 160 4 251 512 472 735 4.10e-47 176
MsG0480022450.01.T01 AT1G61490 36.567 268 160 4 251 512 472 735 4.10e-47 176
MsG0480022450.01.T01 AT1G70520 36.395 294 170 8 244 525 326 614 4.22e-47 174
MsG0480022450.01.T01 AT1G61500 37.091 275 149 7 251 512 481 744 4.29e-47 176
MsG0480022450.01.T01 AT1G61490 36.567 268 160 4 251 512 498 761 4.85e-47 176
MsG0480022450.01.T01 AT1G61490 36.567 268 160 4 251 512 498 761 4.85e-47 176
MsG0480022450.01.T01 AT1G61490 36.567 268 160 4 251 512 498 761 4.85e-47 176
MsG0480022450.01.T01 AT1G61490 36.567 268 160 4 251 512 498 761 4.85e-47 176
MsG0480022450.01.T01 AT1G61500 37.091 275 149 7 251 512 504 767 5.14e-47 176
MsG0480022450.01.T01 AT1G61500 37.091 275 149 7 251 512 499 762 5.34e-47 176
MsG0480022450.01.T01 AT1G11410 39.568 278 159 5 253 525 418 691 6.35e-47 175
MsG0480022450.01.T01 AT3G24550 34.909 275 163 7 251 515 288 556 7.30e-47 174
MsG0480022450.01.T01 AT2G42960 35.294 272 166 5 253 518 193 460 7.60e-47 171
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MsG0480022450.01.T01 AT2G42960 35.294 272 166 5 253 518 193 460 7.60e-47 171
MsG0480022450.01.T01 AT2G42960 35.294 272 166 5 253 518 193 460 7.60e-47 171
MsG0480022450.01.T01 AT4G00960 43.750 192 101 4 253 441 66 253 8.61e-47 165
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MsG0480022450.01.T01 AT1G29730 36.678 289 171 6 244 525 641 924 9.89e-47 176
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MsG0480022450.01.T01 AT1G11410 39.568 278 159 5 253 525 509 782 1.08e-46 175
MsG0480022450.01.T01 AT3G09010 37.132 272 158 7 253 517 56 321 1.11e-46 168
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MsG0480022450.01.T01 AT1G61360 34.043 282 173 5 251 523 425 702 1.17e-46 174
MsG0480022450.01.T01 AT1G70740 36.691 278 153 6 253 512 60 332 1.18e-46 169
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MsG0480022450.01.T01 AT3G13690 36.765 272 159 6 253 517 421 686 5.98e-46 172
MsG0480022450.01.T01 AT1G61440 35.842 279 158 7 258 525 523 791 8.25e-46 172
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MsG0480022450.01.T01 AT1G67520 34.965 286 165 8 253 525 298 575 2.09e-45 169
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MsG0480022450.01.T01 AT1G11350 33.438 317 189 6 227 525 484 796 2.87e-45 171
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MsG0480022450.01.T01 AT5G63710 35.897 273 161 7 251 514 262 529 1.03e-44 167
MsG0480022450.01.T01 AT1G67520 34.965 286 165 8 253 525 513 790 1.07e-44 169
MsG0480022450.01.T01 AT1G67520 34.965 286 165 8 253 525 506 783 1.34e-44 169
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MsG0480022450.01.T01 AT5G63710 35.897 273 161 7 251 514 298 565 1.81e-44 166
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MsG0480022450.01.T01 AT2G18470 37.091 275 156 9 251 515 292 559 4.69e-44 166
MsG0480022450.01.T01 AT1G61610 43.069 202 108 4 251 450 533 729 4.81e-44 167
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MsG0480022450.01.T01 AT2G28960 35.206 267 161 6 253 513 583 843 5.50e-44 167
MsG0480022450.01.T01 AT5G59270 34.201 269 165 6 253 515 359 621 6.32e-44 166
MsG0480022450.01.T01 AT1G01540 43.684 190 102 4 253 441 164 349 6.70e-44 160
MsG0480022450.01.T01 AT5G59270 34.201 269 165 6 253 515 362 624 6.76e-44 166
MsG0480022450.01.T01 AT1G24650 36.604 265 153 6 253 506 557 817 7.28e-44 167
MsG0480022450.01.T01 AT1G09970 36.392 316 161 10 232 516 649 955 8.02e-44 167
MsG0480022450.01.T01 AT1G21590 30.640 297 187 5 246 536 411 694 8.20e-44 166
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MsG0480022450.01.T01 AT5G62710 35.688 269 158 7 253 513 322 583 1.19e-43 164
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MsG0480022450.01.T01 AT1G61430 42.714 199 109 3 253 450 499 693 3.52e-43 164
MsG0480022450.01.T01 AT1G21210 35.256 312 174 9 251 543 418 720 4.09e-43 164
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MsG0480022450.01.T01 AT1G48210 33.457 269 168 4 254 513 79 345 1.80e-42 156
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MsG0480022450.01.T01 AT1G48210 33.457 269 168 4 254 513 79 345 1.80e-42 156
MsG0480022450.01.T01 AT1G48210 33.457 269 168 4 254 513 79 345 1.80e-42 156
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MsG0480022450.01.T01 AT2G35620 35.231 281 161 10 253 524 314 582 5.31e-42 159
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MsG0480022450.01.T01 AT5G54590 34.091 264 164 5 251 512 121 376 7.64e-42 156
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MsG0480022450.01.T01 AT3G45430 34.050 279 164 8 247 515 347 615 1.64e-41 159
MsG0480022450.01.T01 AT1G26150 34.799 273 150 6 253 509 440 700 1.69e-41 159
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MsG0480022450.01.T01 AT5G16900 35.075 268 160 7 253 513 583 843 2.84e-41 159
MsG0480022450.01.T01 AT1G26970 36.614 254 145 8 268 513 3 248 3.02e-41 150
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MsG0480022450.01.T01 AT1G68690 34.317 271 161 5 253 513 387 650 7.23e-41 157
MsG0480022450.01.T01 AT2G01820 31.310 313 185 9 247 532 588 897 7.84e-41 158
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MsG0480022450.01.T01 AT3G09010 39.720 214 120 6 253 463 56 263 8.16e-41 150
MsG0480022450.01.T01 AT2G18470 40.741 216 118 6 251 464 292 499 8.25e-41 155
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MsG0480022450.01.T01 AT1G30570 36.330 267 159 4 253 513 530 791 9.23e-41 158
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MsG0480022450.01.T01 AT1G21270 36.000 275 161 6 251 517 412 679 9.85e-41 157
MsG0480022450.01.T01 AT2G02800 36.759 253 147 7 268 513 118 364 1.04e-40 152
MsG0480022450.01.T01 AT2G02800 36.759 253 147 7 268 513 118 364 1.04e-40 152
MsG0480022450.01.T01 AT1G29730 41.827 208 114 4 244 450 674 875 1.12e-40 158
MsG0480022450.01.T01 AT1G29730 41.827 208 115 4 244 450 641 843 1.15e-40 157
MsG0480022450.01.T01 AT1G11050 35.974 303 168 12 247 528 298 595 1.23e-40 155
MsG0480022450.01.T01 AT1G70530 41.176 204 114 4 251 453 331 529 1.27e-40 154
MsG0480022450.01.T01 AT2G14440 35.741 263 154 6 253 508 574 828 1.36e-40 157
MsG0480022450.01.T01 AT2G07180 34.982 283 160 9 248 513 93 368 1.40e-40 152
MsG0480022450.01.T01 AT2G07180 34.982 283 160 9 248 513 93 368 1.40e-40 152
MsG0480022450.01.T01 AT1G77280 31.429 280 181 6 245 516 405 681 1.49e-40 157
MsG0480022450.01.T01 AT1G77280 31.429 280 181 6 245 516 405 681 1.49e-40 157
MsG0480022450.01.T01 AT5G37450 36.466 266 158 5 253 513 438 697 1.65e-40 156
MsG0480022450.01.T01 AT5G40380 41.089 202 113 4 251 451 323 519 1.80e-40 154
MsG0480022450.01.T01 AT1G21250 34.416 308 180 8 251 543 417 717 2.02e-40 156
MsG0480022450.01.T01 AT2G17220 34.386 285 168 6 253 522 97 377 2.05e-40 151
MsG0480022450.01.T01 AT2G37050 37.367 281 156 10 242 508 598 872 2.10e-40 157
MsG0480022450.01.T01 AT2G37050 37.367 281 156 10 242 508 599 873 2.15e-40 157
MsG0480022450.01.T01 AT4G20270 35.664 286 150 10 253 519 720 990 2.15e-40 157
MsG0480022450.01.T01 AT1G70130 35.556 270 159 7 253 514 344 606 2.19e-40 155
MsG0480022450.01.T01 AT3G20530 41.327 196 110 4 253 445 92 285 2.19e-40 149
MsG0480022450.01.T01 AT2G17220 34.386 285 168 6 253 522 96 376 2.30e-40 151
MsG0480022450.01.T01 AT2G39110 35.018 277 159 8 263 522 101 373 2.52e-40 151
MsG0480022450.01.T01 AT5G49660 36.332 289 153 9 253 522 666 942 2.64e-40 157
MsG0480022450.01.T01 AT5G37450 36.466 266 158 5 253 513 617 876 2.76e-40 156
MsG0480022450.01.T01 AT5G37450 36.466 266 158 5 253 513 641 900 2.92e-40 156
MsG0480022450.01.T01 AT2G39110 35.018 277 159 8 263 522 116 388 2.98e-40 151
MsG0480022450.01.T01 AT1G68690 34.962 266 156 5 253 508 387 645 3.04e-40 155
MsG0480022450.01.T01 AT3G09830 33.673 294 166 9 253 522 94 382 3.24e-40 151
MsG0480022450.01.T01 AT3G09830 33.673 294 166 9 253 522 94 382 3.24e-40 151
MsG0480022450.01.T01 AT3G09830 33.673 294 166 9 253 522 94 382 3.24e-40 151
MsG0480022450.01.T01 AT5G37450 36.466 266 158 5 253 513 665 924 3.35e-40 156
MsG0480022450.01.T01 AT5G48740 34.386 285 173 8 239 513 598 878 3.55e-40 156
MsG0480022450.01.T01 AT3G46330 33.904 292 169 10 234 509 550 833 3.88e-40 156
MsG0480022450.01.T01 AT4G28650 35.088 285 154 11 255 520 711 983 4.22e-40 156
MsG0480022450.01.T01 AT4G29990 35.878 262 157 7 253 509 584 839 4.32e-40 156
MsG0480022450.01.T01 AT3G46330 33.904 292 169 10 234 509 526 809 4.56e-40 155
MsG0480022450.01.T01 AT4G28350 36.000 275 152 11 253 513 356 620 4.81e-40 154
MsG0480022450.01.T01 AT1G17230 36.029 272 150 8 255 512 811 1072 5.07e-40 156
MsG0480022450.01.T01 AT2G28590 33.457 269 168 5 253 513 108 373 5.31e-40 150
MsG0480022450.01.T01 AT1G17230 36.029 272 150 8 255 512 811 1072 5.61e-40 156
MsG0480022450.01.T01 AT3G46370 34.572 269 161 8 253 513 497 758 5.68e-40 155
MsG0480022450.01.T01 AT3G46370 34.572 269 161 8 253 513 497 758 5.68e-40 155
MsG0480022450.01.T01 AT1G31420 34.559 272 159 10 253 515 316 577 5.93e-40 153
MsG0480022450.01.T01 AT1G31420 34.559 272 159 10 253 515 316 577 5.93e-40 153
MsG0480022450.01.T01 AT1G31420 34.926 272 157 10 253 515 316 576 6.92e-40 153
MsG0480022450.01.T01 AT1G14370 35.971 278 155 10 253 513 96 367 7.37e-40 150
MsG0480022450.01.T01 AT3G59740 35.211 284 160 13 253 521 343 617 7.44e-40 154
MsG0480022450.01.T01 AT5G02290 35.573 253 152 7 268 513 103 351 7.80e-40 149
MsG0480022450.01.T01 AT5G02290 35.573 253 152 7 268 513 103 351 7.80e-40 149
MsG0480022450.01.T01 AT1G52540 33.216 283 170 9 254 525 51 325 7.88e-40 148
MsG0480022450.01.T01 AT3G59420 33.333 291 177 7 247 527 515 798 8.73e-40 155
MsG0480022450.01.T01 AT5G42120 34.237 295 170 10 251 529 374 660 8.96e-40 154
MsG0480022450.01.T01 AT1G52540 33.216 283 170 9 254 525 48 322 9.30e-40 148
MsG0480022450.01.T01 AT5G15730 33.835 266 158 7 251 512 122 373 1.00e-39 150
MsG0480022450.01.T01 AT5G63930 34.602 289 162 9 241 512 736 1014 1.22e-39 155
MsG0480022450.01.T01 AT5G15730 33.835 266 160 7 251 512 122 375 1.24e-39 150
MsG0480022450.01.T01 AT5G15730 33.835 266 160 7 251 512 122 375 1.24e-39 150
MsG0480022450.01.T01 AT2G23200 35.316 269 159 8 253 513 498 759 1.24e-39 154
MsG0480022450.01.T01 AT5G63930 34.602 289 162 9 241 512 800 1078 1.29e-39 155
MsG0480022450.01.T01 AT5G60320 33.935 277 163 9 253 522 358 621 1.34e-39 153
MsG0480022450.01.T01 AT4G29050 35.484 279 164 9 253 521 354 626 1.44e-39 153
MsG0480022450.01.T01 AT3G18810 34.420 276 162 7 251 515 345 612 1.46e-39 153
MsG0480022450.01.T01 AT2G18890 33.948 271 162 8 247 508 71 333 1.48e-39 147
MsG0480022450.01.T01 AT4G29050 35.484 279 164 9 253 521 368 640 1.69e-39 153
MsG0480022450.01.T01 AT3G17410 33.829 269 167 4 254 513 80 346 1.70e-39 147
MsG0480022450.01.T01 AT3G17410 33.829 269 167 4 254 513 80 346 1.70e-39 147
MsG0480022450.01.T01 AT3G59700 35.915 284 155 14 253 521 348 619 1.77e-39 153
MsG0480022450.01.T01 AT4G13190 31.834 289 184 6 234 512 60 345 1.81e-39 148
MsG0480022450.01.T01 AT2G19230 33.456 272 163 6 251 513 578 840 2.03e-39 154
MsG0480022450.01.T01 AT2G29000 32.542 295 181 7 230 513 548 835 2.30e-39 154
MsG0480022450.01.T01 AT2G28930 34.532 278 161 9 253 513 79 352 2.37e-39 148
MsG0480022450.01.T01 AT2G28930 34.532 278 161 9 253 513 82 355 2.38e-39 149
MsG0480022450.01.T01 AT5G35960 32.740 281 166 10 245 515 135 402 2.71e-39 149

Find 115 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 148 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AAAGCTGATGTTTATAGTTT+TGG 0.204782 4:+72689478 MsG0480022450.01.T01:CDS
TCTTTACCTTCTCATCTTTC+CGG 0.205636 4:+72688044 MsG0480022450.01.T01:CDS
AAAGTTACATAGAGAATTAT+TGG 0.218840 4:+72689539 MsG0480022450.01.T01:CDS
AAAGCAATACTATTCCTATT+TGG 0.244305 4:+72688159 MsG0480022450.01.T01:CDS
TTCACATAATACTTGGAAAC+TGG 0.247835 4:-72687855 None:intergenic
ATCATTTAAAAGGCATATAT+TGG 0.258752 4:+72688101 MsG0480022450.01.T01:CDS
GATTGTTGTAAATTTGTGTT+TGG 0.307033 4:+72688760 MsG0480022450.01.T01:CDS
AAACCGGTAGATCATTTAAA+AGG 0.317420 4:+72688091 MsG0480022450.01.T01:CDS
TGTATACTGTATATCGAATA+GGG 0.334245 4:-72688395 None:intergenic
ATGTATACTGTATATCGAAT+AGG 0.356849 4:-72688396 None:intergenic
TCGGTAGTGTACTTCAACTA+TGG 0.357525 4:+72687887 MsG0480022450.01.T01:CDS
TTCATTGAGGGACGATCATC+TGG 0.376766 4:-72689691 None:intergenic
AAAATTTACGACATTTCTCT+TGG 0.384173 4:+72689220 MsG0480022450.01.T01:CDS
AAAGAAGAGGAGGAGGAATC+TGG 0.386856 4:-72687938 None:intergenic
TTAAAATACTTTGATCTGTT+CGG 0.390638 4:-72689378 None:intergenic
GCAAGACTACTTTGCTCAAT+GGG 0.391460 4:+72689561 MsG0480022450.01.T01:CDS
GTTAAGAGAGATTGAGGATC+AGG 0.392613 4:-72689763 None:intergenic
TTGCGATCTTGATACGTAAA+TGG 0.393626 4:+72688797 MsG0480022450.01.T01:CDS
ACTATTCCTATTTGGTTGAC+GGG 0.404290 4:+72688167 MsG0480022450.01.T01:CDS
GGCAAGACTACTTTGCTCAA+TGG 0.410696 4:+72689560 MsG0480022450.01.T01:CDS
GAAGATATCTGACTTTGGTT+TGG 0.411308 4:+72689345 MsG0480022450.01.T01:CDS
TTGACCAAGTCTCAAACTAA+TGG 0.413681 4:+72689013 MsG0480022450.01.T01:CDS
TCATTTAAAAGGCATATATT+GGG 0.414268 4:+72688102 MsG0480022450.01.T01:CDS
ATCAATGAAGTTGCAACCAT+TGG 0.416133 4:+72689046 MsG0480022450.01.T01:CDS
AGAGATAGGGAATTGATGAT+AGG 0.416278 4:-72688001 None:intergenic
TGCTGCTGTTCACAGCGTAT+TGG 0.423555 4:-72688346 None:intergenic
CAGCAGCAAGGCAGAGACAG+TGG 0.433762 4:+72688367 MsG0480022450.01.T01:CDS
TGGAATGATGCTAATGGAAA+TGG 0.438319 4:+72689498 MsG0480022450.01.T01:CDS
TACTATTCCTATTTGGTTGA+CGG 0.439044 4:+72688166 MsG0480022450.01.T01:CDS
GTTTACGAGTTCATGCCTAA+TGG 0.441900 4:+72689136 MsG0480022450.01.T01:CDS
GAGATAGGGAATTGATGATA+GGG 0.460944 4:-72688000 None:intergenic
TGCCAAGTTAAGAGAGATTG+AGG 0.463562 4:-72689769 None:intergenic
TTCGTCCCCGTCAACCAAAT+AGG 0.467532 4:-72688173 None:intergenic
ATCTATCACTTCATTCATTG+AGG 0.467537 4:-72689704 None:intergenic
ATGATAGGGCAGTTATTATG+AGG 0.469403 4:-72687986 None:intergenic
CAAACGCAAAGTAGCTGTTA+AGG 0.469620 4:+72688988 MsG0480022450.01.T01:CDS
ATGGGTTTATGATCAATTTG+AGG 0.472908 4:+72689579 MsG0480022450.01.T01:CDS
CCTTGAATACATCGTTCCGC+TGG 0.473492 4:-72687796 None:intergenic
CGAAGGTAACGATGAGTGGA+TGG 0.476328 4:+72688233 MsG0480022450.01.T01:CDS
TCATGTGAATGTGGTGCAAC+TGG 0.476817 4:+72689078 MsG0480022450.01.T01:CDS
ACATACTCACTGTGAACCTC+TGG 0.478343 4:-72688298 None:intergenic
ATCCTCAATCTCTCTTAACT+TGG 0.485154 4:+72689767 MsG0480022450.01.T01:CDS
CCAGCGGAACGATGTATTCA+AGG 0.489637 4:+72687796 MsG0480022450.01.T01:CDS
AAGAGAGATTGAGGATCAGG+TGG 0.492792 4:-72689760 None:intergenic
GAAGTGATAGATATGCTTGA+AGG 0.495281 4:+72689715 MsG0480022450.01.T01:CDS
TCATCAAGAAGAATATTATG+AGG 0.497447 4:-72689310 None:intergenic
ATTGTTGTAAATTTGTGTTT+GGG 0.497807 4:+72688761 MsG0480022450.01.T01:CDS
GATCCGAAGATATCTGACTT+TGG 0.499074 4:+72689340 MsG0480022450.01.T01:CDS
TCACATAATACTTGGAAACT+GGG 0.504316 4:-72687854 None:intergenic
TAAGTTGGGTGAGGAGGCTA+TGG 0.505463 4:+72688938 MsG0480022450.01.T01:intron
ATCAAGATCGCAACCACGAA+TGG 0.507789 4:-72688787 None:intergenic
TCTATCACTTCATTCATTGA+GGG 0.510757 4:-72689703 None:intergenic
ATTATGTGAAAACAACAAAT+CGG 0.514178 4:+72687868 MsG0480022450.01.T01:CDS
TAACATTAGTTTCACTCACT+TGG 0.516619 4:-72689820 None:intergenic
ATATTTGCACAGTTCCCTCA+TGG 0.516883 4:+72688738 MsG0480022450.01.T01:intron
AAACCAAAGTCAGATATCTT+CGG 0.520407 4:-72689343 None:intergenic
GAAAGATGAGAAGGTAAAGA+AGG 0.523138 4:-72688041 None:intergenic
GGCTATGGTTCGGTCTATGA+AGG 0.525270 4:+72688953 MsG0480022450.01.T01:CDS
TGTGTTTGGGTCACCATTCG+TGG 0.531387 4:+72688774 MsG0480022450.01.T01:CDS
CTTGAATACATCGTTCCGCT+GGG 0.531440 4:-72687795 None:intergenic
TGAAAGAACTAAGCAAGCTC+TGG 0.531580 4:+72689114 MsG0480022450.01.T01:CDS
GTAACGATGAGTGGATGGGA+TGG 0.532684 4:+72688238 MsG0480022450.01.T01:CDS
ACAGCGGCAAGAGGAACAAT+GGG 0.533489 4:+72689406 MsG0480022450.01.T01:CDS
CACATGACGAATTCTTCCAA+TGG 0.534482 4:-72689062 None:intergenic
AAGAGGAACAATGGGATACA+TGG 0.540244 4:+72689414 MsG0480022450.01.T01:CDS
TTGTCCATTAGTTTGAGACT+TGG 0.543877 4:-72689017 None:intergenic
TCAACGGAATTGAGGTTCGT+TGG 0.545743 4:+72688320 MsG0480022450.01.T01:CDS
TAACGATGAGTGGATGGGAT+GGG 0.548896 4:+72688239 MsG0480022450.01.T01:CDS
GTGTAAGTATTGAATTCCAC+GGG 0.549904 4:-72689248 None:intergenic
ATCTCACAACAGCTAACGAC+CGG 0.554280 4:-72688063 None:intergenic
TGTTTATCAAGAGAACCATT+AGG 0.556636 4:-72689151 None:intergenic
ATCTGGAGCTATAATAGCCT+CGG 0.559095 4:-72687921 None:intergenic
AACAGCGGCAAGAGGAACAA+TGG 0.560124 4:+72689405 MsG0480022450.01.T01:CDS
TCTTCAGAGAGGTGTGGCGG+TGG 0.560624 4:+72688130 MsG0480022450.01.T01:CDS
GCAAAGGATGTCAGTCGAGA+AGG 0.569956 4:+72689789 MsG0480022450.01.T01:CDS
GAGACGAAGGTAACGATGAG+TGG 0.573789 4:+72688229 MsG0480022450.01.T01:CDS
GGATCAGGTGGAAGTTGTTG+AGG 0.574353 4:-72689748 None:intergenic
AGAGAGGTGTGGCGGTGGTG+AGG 0.575331 4:+72688135 MsG0480022450.01.T01:CDS
AGATGAGAAGGTAAAGAAGG+AGG 0.576617 4:-72688038 None:intergenic
GTAACGAAAAGAAGAGGAGG+AGG 0.579707 4:-72687945 None:intergenic
AATCTCTCTTAACTTGGCAA+AGG 0.584094 4:+72689773 MsG0480022450.01.T01:CDS
GTGAATGTGGTGCAACTGGT+TGG 0.593503 4:+72689082 MsG0480022450.01.T01:CDS
GGTGTAAGTATTGAATTCCA+CGG 0.606092 4:-72689249 None:intergenic
ATTTCTCTTGGAATTTCCCG+TGG 0.606227 4:+72689232 MsG0480022450.01.T01:CDS
TGAGTATGTCAACGGAATTG+AGG 0.608075 4:+72688312 MsG0480022450.01.T01:CDS
CTATTCCTATTTGGTTGACG+GGG 0.608809 4:+72688168 MsG0480022450.01.T01:CDS
TGGGTGAGGAGGCTATGGTT+CGG 0.609605 4:+72688943 MsG0480022450.01.T01:intron
TTAACTTTAACAGCGGCAAG+AGG 0.609663 4:+72689397 MsG0480022450.01.T01:CDS
ATGTTCTTGTATAACAACTC+AGG 0.614495 4:-72689439 None:intergenic
GAAGGTAACGATGAGTGGAT+GGG 0.615668 4:+72688234 MsG0480022450.01.T01:CDS
TAACGACCGGAAAGATGAGA+AGG 0.621211 4:-72688050 None:intergenic
GATATTTCTTCAGAGAGGTG+TGG 0.621329 4:+72688124 MsG0480022450.01.T01:CDS
TGTGAACAGCAGCAGCAGCA+AGG 0.624941 4:+72688355 MsG0480022450.01.T01:CDS
TACAAACAATGGCACAGAGG+AGG 0.626803 4:+72689612 MsG0480022450.01.T01:CDS
GACGATGTAACGAAAAGAAG+AGG 0.632215 4:-72687951 None:intergenic
TAATTTGCATGTCACAACCT+TGG 0.641223 4:-72689270 None:intergenic
GTATACTGTATATCGAATAG+GGG 0.642214 4:-72688394 None:intergenic
GTCATGCAGAGTAGAGACGA+AGG 0.645318 4:+72688216 MsG0480022450.01.T01:CDS
ATTTCTTCAGAGAGGTGTGG+CGG 0.649356 4:+72688127 MsG0480022450.01.T01:CDS
GTTCACAGTGAGTATGTCAA+CGG 0.651966 4:+72688304 MsG0480022450.01.T01:CDS
CAAATTTACAACAATCCATG+AGG 0.652146 4:-72688753 None:intergenic
ATTGGGATATTTCTTCAGAG+AGG 0.652532 4:+72688119 MsG0480022450.01.T01:CDS
GCATTTATCTATAGATGACA+CGG 0.659573 4:+72688828 MsG0480022450.01.T01:CDS
TTGAATACATCGTTCCGCTG+GGG 0.666302 4:-72687794 None:intergenic
CAGCAAGTGTGTGTATCCAG+AGG 0.666622 4:+72688282 MsG0480022450.01.T01:CDS
AAATTTACAACAATCCATGA+GGG 0.667298 4:-72688752 None:intergenic
AAGAATTCGTCATGTGAATG+TGG 0.677775 4:+72689069 MsG0480022450.01.T01:CDS
GAAACAATAGATACAAACAA+TGG 0.679529 4:+72689601 MsG0480022450.01.T01:CDS
GGAATTCAATACTTACACCA+AGG 0.686537 4:+72689253 MsG0480022450.01.T01:CDS
GAGTTGTTATACAAGAACAT+CGG 0.690147 4:+72689442 MsG0480022450.01.T01:CDS
GATGTAACGAAAAGAAGAGG+AGG 0.693925 4:-72687948 None:intergenic
ATGATGCTAATGGAAATGGC+AGG 0.715222 4:+72689502 MsG0480022450.01.T01:CDS
CTATGGCGAACATCAAACCG+AGG 0.733269 4:+72687904 MsG0480022450.01.T01:CDS
AGATACAAACAATGGCACAG+AGG 0.741873 4:+72689609 MsG0480022450.01.T01:CDS
AAGCTTCATTCAATCCCCAG+CGG 0.778452 4:+72687780 MsG0480022450.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATTATATTTATATCGTATTG+TGG + Chr4:72688681-72688700 MsG0480022450.01.T01:intron 15.0%
!! AAAGTTACATAGAGAATTAT+TGG + Chr4:72689539-72689558 MsG0480022450.01.T01:CDS 20.0%
!! ATTATGTGAAAACAACAAAT+CGG + Chr4:72687868-72687887 MsG0480022450.01.T01:CDS 20.0%
!! ATTGTTGTAAATTTGTGTTT+GGG + Chr4:72688761-72688780 MsG0480022450.01.T01:CDS 20.0%
!! TGAGTAAGTAAAAATAAACT+GGG + Chr4:72688445-72688464 MsG0480022450.01.T01:intron 20.0%
!! TTAAAATACTTTGATCTGTT+CGG - Chr4:72689381-72689400 None:intergenic 20.0%
!! TTGAGTAAGTAAAAATAAAC+TGG + Chr4:72688444-72688463 MsG0480022450.01.T01:intron 20.0%
!!! AAATTCAAGGAAATTTTTAG+AGG + Chr4:72688472-72688491 MsG0480022450.01.T01:intron 20.0%
!!! AAGTATTTTAACTTTAACAG+CGG + Chr4:72689390-72689409 MsG0480022450.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATCATTTAAAAGGCATATAT+TGG + Chr4:72688101-72688120 MsG0480022450.01.T01:CDS 20.0%
!!! CAAACATTTTAACATAAGTT+GGG + Chr4:72688924-72688943 MsG0480022450.01.T01:intron 20.0%
!!! TCATTTAAAAGGCATATATT+GGG + Chr4:72688102-72688121 MsG0480022450.01.T01:CDS 20.0%
! AAAATTTACGACATTTCTCT+TGG + Chr4:72689220-72689239 MsG0480022450.01.T01:CDS 25.0%
! AAAGCAATACTATTCCTATT+TGG + Chr4:72688159-72688178 MsG0480022450.01.T01:CDS 25.0%
! AAATTTACAACAATCCATGA+GGG - Chr4:72688755-72688774 None:intergenic 25.0%
! ACGTGTTTAACGAAAATAAA+AGG - Chr4:72688545-72688564 None:intergenic 25.0%
! ATGTATACTGTATATCGAAT+AGG - Chr4:72688399-72688418 None:intergenic 25.0%
! CCAACTTATGTTAAAATGTT+TGG - Chr4:72688926-72688945 None:intergenic 25.0%
! GAAACAATAGATACAAACAA+TGG + Chr4:72689601-72689620 MsG0480022450.01.T01:CDS 25.0%
! GATTGTTGTAAATTTGTGTT+TGG + Chr4:72688760-72688779 MsG0480022450.01.T01:CDS 25.0%
! TCATCAAGAAGAATATTATG+AGG - Chr4:72689313-72689332 None:intergenic 25.0%
! TGTATACTGTATATCGAATA+GGG - Chr4:72688398-72688417 None:intergenic 25.0%
!! AAAGCTGATGTTTATAGTTT+TGG + Chr4:72689478-72689497 MsG0480022450.01.T01:CDS 25.0%
!!! CCAAACATTTTAACATAAGT+TGG + Chr4:72688923-72688942 MsG0480022450.01.T01:intron 25.0%
!!! GTATTCAAGGATGTTTTATT+TGG + Chr4:72687809-72687828 MsG0480022450.01.T01:CDS 25.0%
!!! TGTTGTTTTCACATAATACT+TGG - Chr4:72687865-72687884 None:intergenic 25.0%
AAACCAAAGTCAGATATCTT+CGG - Chr4:72689346-72689365 None:intergenic 30.0%
AAACCGGTAGATCATTTAAA+AGG + Chr4:72688091-72688110 MsG0480022450.01.T01:CDS 30.0%
ATCTATCACTTCATTCATTG+AGG - Chr4:72689707-72689726 None:intergenic 30.0%
ATGGGTTTATGATCAATTTG+AGG + Chr4:72689579-72689598 MsG0480022450.01.T01:CDS 30.0%
ATGTTCTTGTATAACAACTC+AGG - Chr4:72689442-72689461 None:intergenic 30.0%
CAAATTTACAACAATCCATG+AGG - Chr4:72688756-72688775 None:intergenic 30.0%
GAGTTGTTATACAAGAACAT+CGG + Chr4:72689442-72689461 MsG0480022450.01.T01:CDS 30.0%
GCATTTATCTATAGATGACA+CGG + Chr4:72688828-72688847 MsG0480022450.01.T01:CDS 30.0%
GTATACTGTATATCGAATAG+GGG - Chr4:72688397-72688416 None:intergenic 30.0%
GTTGAATATCCTATTGAACA+CGG - Chr4:72688633-72688652 None:intergenic 30.0%
TAAACTGGGACTAAAATTCA+AGG + Chr4:72688459-72688478 MsG0480022450.01.T01:intron 30.0%
TACTATTCCTATTTGGTTGA+CGG + Chr4:72688166-72688185 MsG0480022450.01.T01:CDS 30.0%
TCACATAATACTTGGAAACT+GGG - Chr4:72687857-72687876 None:intergenic 30.0%
TCTATCACTTCATTCATTGA+GGG - Chr4:72689706-72689725 None:intergenic 30.0%
TGTTTATCAAGAGAACCATT+AGG - Chr4:72689154-72689173 None:intergenic 30.0%
TTCACATAATACTTGGAAAC+TGG - Chr4:72687858-72687877 None:intergenic 30.0%
TTGAATATCCTATTGAACAC+GGG - Chr4:72688632-72688651 None:intergenic 30.0%
! ATGCCTTTTAAATGATCTAC+CGG - Chr4:72688097-72688116 None:intergenic 30.0%
! GTTTTTATACGGAAGAGATA+GGG - Chr4:72688017-72688036 None:intergenic 30.0%
!! ATTTTAACATAAGTTGGGTG+AGG + Chr4:72688929-72688948 MsG0480022450.01.T01:intron 30.0%
!!! AAGGATGTTTTATTTGGAGA+TGG + Chr4:72687815-72687834 MsG0480022450.01.T01:CDS 30.0%
!!! AGGATGTTTTATTTGGAGAT+GGG + Chr4:72687816-72687835 MsG0480022450.01.T01:CDS 30.0%
!!! TAGTTTTGGAATGATGCTAA+TGG + Chr4:72689492-72689511 MsG0480022450.01.T01:CDS 30.0%
AAGAATTCGTCATGTGAATG+TGG + Chr4:72689069-72689088 MsG0480022450.01.T01:CDS 35.0%
ACAACAATTTCATGCCCATA+AGG + Chr4:72688872-72688891 MsG0480022450.01.T01:intron 35.0%
ACTATTCCTATTTGGTTGAC+GGG + Chr4:72688167-72688186 MsG0480022450.01.T01:CDS 35.0%
ATCAATGAAGTTGCAACCAT+TGG + Chr4:72689046-72689065 MsG0480022450.01.T01:CDS 35.0%
ATCCTCAATCTCTCTTAACT+TGG + Chr4:72689767-72689786 MsG0480022450.01.T01:CDS 35.0%
ATGATAGGGCAGTTATTATG+AGG - Chr4:72687989-72688008 None:intergenic 35.0%
ATTGGGATATTTCTTCAGAG+AGG + Chr4:72688119-72688138 MsG0480022450.01.T01:CDS 35.0%
CTTACTCAAGAGAGAGTAAA+TGG - Chr4:72688433-72688452 None:intergenic 35.0%
GAAAGATGAGAAGGTAAAGA+AGG - Chr4:72688044-72688063 None:intergenic 35.0%
GAAGATATCTGACTTTGGTT+TGG + Chr4:72689345-72689364 MsG0480022450.01.T01:CDS 35.0%
GAAGTGATAGATATGCTTGA+AGG + Chr4:72689715-72689734 MsG0480022450.01.T01:CDS 35.0%
GGAATTCAATACTTACACCA+AGG + Chr4:72689253-72689272 MsG0480022450.01.T01:CDS 35.0%
TCTTTACCTTCTCATCTTTC+CGG + Chr4:72688044-72688063 MsG0480022450.01.T01:CDS 35.0%
TGGAATGATGCTAATGGAAA+TGG + Chr4:72689498-72689517 MsG0480022450.01.T01:CDS 35.0%
TGTTGTGAGATGTGAAAAAC+CGG + Chr4:72688075-72688094 MsG0480022450.01.T01:CDS 35.0%
TTGACCAAGTCTCAAACTAA+TGG + Chr4:72689013-72689032 MsG0480022450.01.T01:CDS 35.0%
TTGCGATCTTGATACGTAAA+TGG + Chr4:72688797-72688816 MsG0480022450.01.T01:CDS 35.0%
! AATCTCTCTTAACTTGGCAA+AGG + Chr4:72689773-72689792 MsG0480022450.01.T01:CDS 35.0%
! AGAGATAGGGAATTGATGAT+AGG - Chr4:72688004-72688023 None:intergenic 35.0%
! CGTTTTTATACGGAAGAGAT+AGG - Chr4:72688018-72688037 None:intergenic 35.0%
! GAGATAGGGAATTGATGATA+GGG - Chr4:72688003-72688022 None:intergenic 35.0%
! TAATTTGCATGTCACAACCT+TGG - Chr4:72689273-72689292 None:intergenic 35.0%
! TTGTCCATTAGTTTGAGACT+TGG - Chr4:72689020-72689039 None:intergenic 35.0%
!! GGTGTAAGTATTGAATTCCA+CGG - Chr4:72689252-72689271 None:intergenic 35.0%
!! GTGTAAGTATTGAATTCCAC+GGG - Chr4:72689251-72689270 None:intergenic 35.0%
!! TGAGAGTAAGAGTACCTTAT+GGG - Chr4:72688889-72688908 None:intergenic 35.0%
!! TTGAGAGTAAGAGTACCTTA+TGG - Chr4:72688890-72688909 None:intergenic 35.0%
!!! AAGAAGGAGGCGTTTTTATA+CGG - Chr4:72688028-72688047 None:intergenic 35.0%
!!! TGTTTTATTTGGAGATGGGA+TGG + Chr4:72687820-72687839 MsG0480022450.01.T01:CDS 35.0%
AAGAGGAACAATGGGATACA+TGG + Chr4:72689414-72689433 MsG0480022450.01.T01:CDS 40.0%
AGAGAGAGTAAATGGAGAGA+TGG - Chr4:72688425-72688444 None:intergenic 40.0%
AGATACAAACAATGGCACAG+AGG + Chr4:72689609-72689628 MsG0480022450.01.T01:CDS 40.0%
AGATGAGAAGGTAAAGAAGG+AGG - Chr4:72688041-72688060 None:intergenic 40.0%
ATATTTGCACAGTTCCCTCA+TGG + Chr4:72688738-72688757 MsG0480022450.01.T01:intron 40.0%
ATGATGCTAATGGAAATGGC+AGG + Chr4:72689502-72689521 MsG0480022450.01.T01:CDS 40.0%
ATTTCTCTTGGAATTTCCCG+TGG + Chr4:72689232-72689251 MsG0480022450.01.T01:CDS 40.0%
CAAACGCAAAGTAGCTGTTA+AGG + Chr4:72688988-72689007 MsG0480022450.01.T01:CDS 40.0%
CACATGACGAATTCTTCCAA+TGG - Chr4:72689065-72689084 None:intergenic 40.0%
CTATTCCTATTTGGTTGACG+GGG + Chr4:72688168-72688187 MsG0480022450.01.T01:CDS 40.0%
GACGATGTAACGAAAAGAAG+AGG - Chr4:72687954-72687973 None:intergenic 40.0%
GATATTTCTTCAGAGAGGTG+TGG + Chr4:72688124-72688143 MsG0480022450.01.T01:CDS 40.0%
GATCCGAAGATATCTGACTT+TGG + Chr4:72689340-72689359 MsG0480022450.01.T01:CDS 40.0%
GATGTAACGAAAAGAAGAGG+AGG - Chr4:72687951-72687970 None:intergenic 40.0%
GCAAGACTACTTTGCTCAAT+GGG + Chr4:72689561-72689580 MsG0480022450.01.T01:CDS 40.0%
GTTAAGAGAGATTGAGGATC+AGG - Chr4:72689766-72689785 None:intergenic 40.0%
GTTCACAGTGAGTATGTCAA+CGG + Chr4:72688304-72688323 MsG0480022450.01.T01:CDS 40.0%
GTTTACGAGTTCATGCCTAA+TGG + Chr4:72689136-72689155 MsG0480022450.01.T01:CDS 40.0%
TCGGTAGTGTACTTCAACTA+TGG + Chr4:72687887-72687906 MsG0480022450.01.T01:CDS 40.0%
TGAAAGAACTAAGCAAGCTC+TGG + Chr4:72689114-72689133 MsG0480022450.01.T01:CDS 40.0%
TGAGTATGTCAACGGAATTG+AGG + Chr4:72688312-72688331 MsG0480022450.01.T01:CDS 40.0%
TGCCAAGTTAAGAGAGATTG+AGG - Chr4:72689772-72689791 None:intergenic 40.0%
TTAACTTTAACAGCGGCAAG+AGG + Chr4:72689397-72689416 MsG0480022450.01.T01:CDS 40.0%
! ATCTGGAGCTATAATAGCCT+CGG - Chr4:72687924-72687943 None:intergenic 40.0%
! TCTTTTCGTTACATCGTCAC+TGG + Chr4:72687956-72687975 MsG0480022450.01.T01:CDS 40.0%
! TTAACATAAGTTGGGTGAGG+AGG + Chr4:72688932-72688951 MsG0480022450.01.T01:intron 40.0%
AAAGAAGAGGAGGAGGAATC+TGG - Chr4:72687941-72687960 None:intergenic 45.0%
AAGAGAGATTGAGGATCAGG+TGG - Chr4:72689763-72689782 None:intergenic 45.0%
AAGCTTCATTCAATCCCCAG+CGG + Chr4:72687780-72687799 MsG0480022450.01.T01:CDS 45.0%
ACATACTCACTGTGAACCTC+TGG - Chr4:72688301-72688320 None:intergenic 45.0%
ATCAAGATCGCAACCACGAA+TGG - Chr4:72688790-72688809 None:intergenic 45.0%
ATCTCACAACAGCTAACGAC+CGG - Chr4:72688066-72688085 None:intergenic 45.0%
CTTGAATACATCGTTCCGCT+GGG - Chr4:72687798-72687817 None:intergenic 45.0%
GAAGGTAACGATGAGTGGAT+GGG + Chr4:72688234-72688253 MsG0480022450.01.T01:CDS 45.0%
GGCAAGACTACTTTGCTCAA+TGG + Chr4:72689560-72689579 MsG0480022450.01.T01:CDS 45.0%
GTAACGAAAAGAAGAGGAGG+AGG - Chr4:72687948-72687967 None:intergenic 45.0%
TAACGACCGGAAAGATGAGA+AGG - Chr4:72688053-72688072 None:intergenic 45.0%
TAACGATGAGTGGATGGGAT+GGG + Chr4:72688239-72688258 MsG0480022450.01.T01:CDS 45.0%
TACAAACAATGGCACAGAGG+AGG + Chr4:72689612-72689631 MsG0480022450.01.T01:CDS 45.0%
TACTGTCTCCCGTGTTCAAT+AGG + Chr4:72688621-72688640 MsG0480022450.01.T01:intron 45.0%
TCAACGGAATTGAGGTTCGT+TGG + Chr4:72688320-72688339 MsG0480022450.01.T01:CDS 45.0%
TCATGTGAATGTGGTGCAAC+TGG + Chr4:72689078-72689097 MsG0480022450.01.T01:CDS 45.0%
TTCATTGAGGGACGATCATC+TGG - Chr4:72689694-72689713 None:intergenic 45.0%
TTGAACACGGGAGACAGTAA+TGG - Chr4:72688620-72688639 None:intergenic 45.0%
TTGAATACATCGTTCCGCTG+GGG - Chr4:72687797-72687816 None:intergenic 45.0%
! ATTTCTTCAGAGAGGTGTGG+CGG + Chr4:72688127-72688146 MsG0480022450.01.T01:CDS 45.0%
! CACACGTTTTCACAAGAGCA+AGG + Chr4:72689172-72689191 MsG0480022450.01.T01:CDS 45.0%
AACAGCGGCAAGAGGAACAA+TGG + Chr4:72689405-72689424 MsG0480022450.01.T01:CDS 50.0%
ACAGCGGCAAGAGGAACAAT+GGG + Chr4:72689406-72689425 MsG0480022450.01.T01:CDS 50.0%
CAGCAAGTGTGTGTATCCAG+AGG + Chr4:72688282-72688301 MsG0480022450.01.T01:CDS 50.0%
CCAGCGGAACGATGTATTCA+AGG + Chr4:72687796-72687815 MsG0480022450.01.T01:CDS 50.0%
CCTTGAATACATCGTTCCGC+TGG - Chr4:72687799-72687818 None:intergenic 50.0%
CGAAGGTAACGATGAGTGGA+TGG + Chr4:72688233-72688252 MsG0480022450.01.T01:CDS 50.0%
CTATGGCGAACATCAAACCG+AGG + Chr4:72687904-72687923 MsG0480022450.01.T01:CDS 50.0%
GAGACGAAGGTAACGATGAG+TGG + Chr4:72688229-72688248 MsG0480022450.01.T01:CDS 50.0%
GCAAAGGATGTCAGTCGAGA+AGG + Chr4:72689789-72689808 MsG0480022450.01.T01:CDS 50.0%
GGATCAGGTGGAAGTTGTTG+AGG - Chr4:72689751-72689770 None:intergenic 50.0%
GTAACGATGAGTGGATGGGA+TGG + Chr4:72688238-72688257 MsG0480022450.01.T01:CDS 50.0%
GTCATGCAGAGTAGAGACGA+AGG + Chr4:72688216-72688235 MsG0480022450.01.T01:CDS 50.0%
GTGAATGTGGTGCAACTGGT+TGG + Chr4:72689082-72689101 MsG0480022450.01.T01:CDS 50.0%
TGCTGCTGTTCACAGCGTAT+TGG - Chr4:72688349-72688368 None:intergenic 50.0%
TGTGTTTGGGTCACCATTCG+TGG + Chr4:72688774-72688793 MsG0480022450.01.T01:CDS 50.0%
TTCGTCCCCGTCAACCAAAT+AGG - Chr4:72688176-72688195 None:intergenic 50.0%
! TAAGTTGGGTGAGGAGGCTA+TGG + Chr4:72688938-72688957 MsG0480022450.01.T01:intron 50.0%
!! GGCTATGGTTCGGTCTATGA+AGG + Chr4:72688953-72688972 MsG0480022450.01.T01:CDS 50.0%
TGGGTGAGGAGGCTATGGTT+CGG + Chr4:72688943-72688962 MsG0480022450.01.T01:intron 55.0%
TGTGAACAGCAGCAGCAGCA+AGG + Chr4:72688355-72688374 MsG0480022450.01.T01:CDS 55.0%
CAGCAGCAAGGCAGAGACAG+TGG + Chr4:72688367-72688386 MsG0480022450.01.T01:CDS 60.0%
! TCTTCAGAGAGGTGTGGCGG+TGG + Chr4:72688130-72688149 MsG0480022450.01.T01:CDS 60.0%
! AGAGAGGTGTGGCGGTGGTG+AGG + Chr4:72688135-72688154 MsG0480022450.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr4 gene 72687776 72689831 72687776 ID=MsG0480022450.01;Name=MsG0480022450.01
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Chr4 exon 72687776 72688410 72687776 ID=MsG0480022450.01.T01:exon:10991;Parent=MsG0480022450.01.T01
Chr4 exon 72688750 72688868 72688750 ID=MsG0480022450.01.T01:exon:10992;Parent=MsG0480022450.01.T01
Chr4 exon 72688951 72689831 72688951 ID=MsG0480022450.01.T01:exon:10993;Parent=MsG0480022450.01.T01
Chr4 CDS 72687776 72688410 72687776 ID=MsG0480022450.01.T01:cds;Parent=MsG0480022450.01.T01
Chr4 CDS 72688750 72688868 72688750 ID=MsG0480022450.01.T01:cds;Parent=MsG0480022450.01.T01
Chr4 CDS 72688951 72689831 72688951 ID=MsG0480022450.01.T01:cds;Parent=MsG0480022450.01.T01
Gene Sequence

>MsG0480022450.01.T01

ATGCAAGCTTCATTCAATCCCCAGCGGAACGATGTATTCAAGGATGTTTTATTTGGAGATGGGATGGAGTGTGCGAATCCCAGTTTCCAAGTATTATGTGAAAACAACAAATCGGTAGTGTACTTCAACTATGGCGAACATCAAACCGAGGCTATTATAGCTCCAGATTCCTCCTCCTCTTCTTTTCGTTACATCGTCACTGGAGTTAGTCCTCATAATAACTGCCCTATCATCAATTCCCTATCTCTTCCGTATAAAAACGCCTCCTTCTTTACCTTCTCATCTTTCCGGTCGTTAGCTGTTGTGAGATGTGAAAAACCGGTAGATCATTTAAAAGGCATATATTGGGATATTTCTTCAGAGAGGTGTGGCGGTGGTGAGGAAAAGCAATACTATTCCTATTTGGTTGACGGGGACGAAGATGTGAGTTACATAGCAGAGTCATGCAGAGTAGAGACGAAGGTAACGATGAGTGGATGGGATGGGAGAGTGATATGTAATAGCAGCAGCAAGTGTGTGTATCCAGAGGTTCACAGTGAGTATGTCAACGGAATTGAGGTTCGTTGGCAACCAATACGCTGTGAACAGCAGCAGCAGCAAGGCAGAGACAGTGGCACACCCCTATTCGATATACATTCCCTCATGGATTGTTGTAAATTTGTGTTTGGGTCACCATTCGTGGTTGCGATCTTGATACGTAAATGGAGAAAAAAGCATTTATCTATAGATGACACGGTTGAAGATTTTATTCAGAGAGGCTATGGTTCGGTCTATGAAGGAGTGCTGCGAAGCAAACGCAAAGTAGCTGTTAAGGTATTGACCAAGTCTCAAACTAATGGACAAGACTTCATCAATGAAGTTGCAACCATTGGAAGAATTCGTCATGTGAATGTGGTGCAACTGGTTGGATTTTGTGCTGAAAGAACTAAGCAAGCTCTGGTTTACGAGTTCATGCCTAATGGTTCTCTTGATAAACACACGTTTTCACAAGAGCAAGGACACTTGTCGTCGTTAAGCTATGAGAAAATTTACGACATTTCTCTTGGAATTTCCCGTGGAATTCAATACTTACACCAAGGTTGTGACATGCAAATTATACACTTTGATATAAAACCTCATAATATTCTTCTTGATGAGAATTTTGATCCGAAGATATCTGACTTTGGTTTGGCGAAGTTGTACCGAACAGATCAAAGTATTTTAACTTTAACAGCGGCAAGAGGAACAATGGGATACATGGCTCCTGAGTTGTTATACAAGAACATCGGAAGCATCTCTCATAAAGCTGATGTTTATAGTTTTGGAATGATGCTAATGGAAATGGCAGGTAGAAAAAAGAACAAAAGTTACATAGAGAATTATTGGCAAGACTACTTTGCTCAATGGGTTTATGATCAATTTGAGGAAACAATAGATACAAACAATGGCACAGAGGAGGAAAAGAAAATTGCAATGAAGATGATTGTGATTGCGTTGAAATGCATTCAAATGAAACCAGATGATCGTCCCTCAATGAATGAAGTGATAGATATGCTTGAAGGAGACGAAGTTCCTCAACAACTTCCACCTGATCCTCAATCTCTCTTAACTTGGCAAAGGATGTCAGTCGAGAAGGTGCAATCACCAAGTGAGTGA

Protein sequence

>MsG0480022450.01.T01

MQASFNPQRNDVFKDVLFGDGMECANPSFQVLCENNKSVVYFNYGEHQTEAIIAPDSSSSSFRYIVTGVSPHNNCPIINSLSLPYKNASFFTFSSFRSLAVVRCEKPVDHLKGIYWDISSERCGGGEEKQYYSYLVDGDEDVSYIAESCRVETKVTMSGWDGRVICNSSSKCVYPEVHSEYVNGIEVRWQPIRCEQQQQQGRDSGTPLFDIHSLMDCCKFVFGSPFVVAILIRKWRKKHLSIDDTVEDFIQRGYGSVYEGVLRSKRKVAVKVLTKSQTNGQDFINEVATIGRIRHVNVVQLVGFCAERTKQALVYEFMPNGSLDKHTFSQEQGHLSSLSYEKIYDISLGISRGIQYLHQGCDMQIIHFDIKPHNILLDENFDPKISDFGLAKLYRTDQSILTLTAARGTMGYMAPELLYKNIGSISHKADVYSFGMMLMEMAGRKKNKSYIENYWQDYFAQWVYDQFEETIDTNNGTEEEKKIAMKMIVIALKCIQMKPDDRPSMNEVIDMLEGDEVPQQLPPDPQSLLTWQRMSVEKVQSPSE*