AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0580026046.01

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MsG0580026046.01.T01 AT3G17420 35.932 295 124 5 48 288 142 425 2.60e-48 170
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MsG0580026046.01.T01 AT5G18500 36.824 296 120 7 48 288 154 437 3.76e-48 169
MsG0580026046.01.T01 AT2G30730 33.557 298 140 4 48 291 35 328 5.93e-48 166
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MsG0580026046.01.T01 AT1G56120 36.308 325 141 6 33 304 665 976 1.46e-47 173
MsG0580026046.01.T01 AT3G24550 36.601 306 127 6 48 297 268 562 1.73e-47 171
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MsG0580026046.01.T01 AT4G34440 33.903 351 159 8 48 342 300 633 3.41e-47 170
MsG0580026046.01.T01 AT1G29740 37.162 296 118 8 48 288 665 947 9.46e-47 171
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MsG0580026046.01.T01 AT2G18470 36.364 297 121 7 48 288 272 556 2.59e-46 167
MsG0580026046.01.T01 AT5G11020 34.471 293 135 7 48 291 91 375 2.89e-46 162
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MsG0580026046.01.T01 AT1G53430 36.011 361 152 11 48 346 657 1000 2.58e-45 166
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MsG0580026046.01.T01 AT1G48210 34.007 297 136 5 51 293 59 349 3.56e-45 159
MsG0580026046.01.T01 AT1G48210 34.007 297 136 5 51 293 59 349 3.56e-45 159
MsG0580026046.01.T01 AT3G09010 34.740 308 133 6 36 288 22 316 7.47e-45 159
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MsG0580026046.01.T01 AT1G21590 32.013 303 141 5 40 288 389 680 2.33e-44 163
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MsG0580026046.01.T01 AT2G28250 35.331 317 145 8 29 288 179 492 4.69e-44 160
MsG0580026046.01.T01 AT2G28250 35.331 317 145 8 29 288 179 492 4.69e-44 160
MsG0580026046.01.T01 AT2G28250 35.331 317 145 8 29 288 179 492 4.69e-44 160
MsG0580026046.01.T01 AT2G28250 35.331 317 145 8 29 288 179 492 4.69e-44 160
MsG0580026046.01.T01 AT2G28250 35.331 317 145 8 29 288 179 492 4.69e-44 160
MsG0580026046.01.T01 AT3G18810 34.603 315 138 7 48 306 325 627 5.57e-44 161
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MsG0580026046.01.T01 AT1G56145 36.735 294 120 7 48 288 675 955 7.56e-44 162
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MsG0580026046.01.T01 AT5G45780 33.444 302 129 9 45 288 285 572 1.69e-41 154
MsG0580026046.01.T01 AT2G28970 35.410 305 128 8 38 288 424 713 1.99e-41 154
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MsG0580026046.01.T01 AT2G28970 35.410 305 128 8 38 288 459 748 3.43e-41 154
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MsG0580026046.01.T01 AT1G52290 36.471 255 97 6 48 248 131 374 1.17e-40 147
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MsG0580026046.01.T01 AT1G51805 32.628 331 154 8 12 288 507 822 1.41e-40 152
MsG0580026046.01.T01 AT5G54380 34.268 321 153 6 18 288 468 780 2.73e-40 152
MsG0580026046.01.T01 AT5G11410 30.547 311 157 6 41 296 30 336 2.97e-40 145
MsG0580026046.01.T01 AT5G16900 33.555 301 137 7 39 288 368 656 3.23e-40 150
MsG0580026046.01.T01 AT3G46400 33.226 310 138 7 33 288 551 845 5.03e-40 151
MsG0580026046.01.T01 AT4G00330 31.849 292 148 5 47 288 106 396 7.21e-40 146
MsG0580026046.01.T01 AT4G00330 31.849 292 148 5 47 288 106 396 7.21e-40 146
MsG0580026046.01.T01 AT4G35030 30.938 320 152 7 29 290 71 379 7.32e-40 145
MsG0580026046.01.T01 AT1G49270 34.528 307 132 7 48 297 324 618 7.61e-40 150
MsG0580026046.01.T01 AT2G11520 32.595 316 140 7 48 308 213 510 8.17e-40 147
MsG0580026046.01.T01 AT1G29750 33.237 346 154 8 36 320 646 975 8.39e-40 150
MsG0580026046.01.T01 AT1G29750 34.603 315 132 7 36 292 661 959 9.84e-40 150
MsG0580026046.01.T01 AT4G23240 32.903 310 134 10 47 294 15 312 1.00e-39 144
MsG0580026046.01.T01 AT1G51850 34.426 305 131 8 38 288 558 847 1.09e-39 150
MsG0580026046.01.T01 AT3G46340 32.865 356 164 11 23 319 550 889 1.17e-39 150
MsG0580026046.01.T01 AT1G51850 34.426 305 131 8 38 288 538 827 1.42e-39 150
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MsG0580026046.01.T01 AT5G16900 33.555 301 137 7 39 288 554 842 1.65e-39 149
MsG0580026046.01.T01 AT5G10530 32.931 331 145 10 26 294 301 616 1.85e-39 148
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MsG0580026046.01.T01 AT2G47060 33.663 303 141 5 50 298 63 359 2.26e-39 144
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MsG0580026046.01.T01 AT1G51830 33.033 333 149 9 10 288 343 655 2.31e-38 145
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MsG0580026046.01.T01 AT5G58940 31.741 293 148 6 48 291 135 424 1.11e-36 138
MsG0580026046.01.T01 AT5G58940 31.741 293 148 6 48 291 135 424 1.11e-36 138
MsG0580026046.01.T01 AT5G58940 31.741 293 148 6 48 291 135 424 1.11e-36 138
MsG0580026046.01.T01 AT4G00960 29.429 333 158 10 18 288 13 330 1.13e-36 137
MsG0580026046.01.T01 AT1G70740 31.366 322 143 8 30 284 18 328 1.30e-36 137
MsG0580026046.01.T01 AT5G65600 32.051 312 139 7 46 294 336 637 1.34e-36 140
MsG0580026046.01.T01 AT4G02420 31.935 310 143 8 43 298 336 631 1.47e-36 140
MsG0580026046.01.T01 AT2G18470 37.860 243 86 7 48 237 272 502 1.54e-36 139
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MsG0580026046.01.T01 AT3G25560 30.065 306 148 8 36 288 289 581 4.33e-36 139
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MsG0580026046.01.T01 AT1G51890 31.596 307 126 6 43 288 283 566 5.58e-36 138
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MsG0580026046.01.T01 AT4G23130 32.686 309 139 10 36 288 317 612 1.65e-35 137
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MsG0580026046.01.T01 AT1G11330 32.399 321 143 6 23 288 492 793 3.46e-35 137
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MsG0580026046.01.T01 AT4G03230 32.542 295 134 6 48 288 678 961 3.97e-35 137
MsG0580026046.01.T01 AT4G23160 28.923 325 155 8 30 292 330 640 4.19e-35 136
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MsG0580026046.01.T01 AT4G29180 31.333 300 145 5 46 288 555 850 4.34e-35 137
MsG0580026046.01.T01 AT4G23260 29.688 320 153 8 34 292 313 621 5.37e-35 135
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MsG0580026046.01.T01 AT3G62220 32.441 299 142 5 51 295 60 352 5.53e-35 132
MsG0580026046.01.T01 AT2G25220 33.205 259 119 4 48 258 85 337 5.71e-35 132
MsG0580026046.01.T01 AT3G59750 31.529 314 150 7 37 296 280 582 5.76e-35 135
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MsG0580026046.01.T01 AT1G06700 32.886 298 142 5 48 291 56 349 5.76e-35 132
MsG0580026046.01.T01 AT1G06700 32.886 298 142 5 48 291 56 349 5.76e-35 132
MsG0580026046.01.T01 AT4G29180 31.104 299 147 5 46 288 553 848 5.86e-35 136
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MsG0580026046.01.T01 AT1G16150 32.353 306 145 7 46 302 410 702 6.13e-35 136
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MsG0580026046.01.T01 AT4G23190 30.183 328 150 9 33 294 322 636 7.09e-35 135
MsG0580026046.01.T01 AT4G23140 28.793 323 158 7 30 292 322 632 7.24e-35 135
MsG0580026046.01.T01 AT3G45410 33.775 302 131 9 47 292 329 617 7.94e-35 135
MsG0580026046.01.T01 AT4G23250 30.000 320 152 8 34 292 328 636 8.75e-35 136
MsG0580026046.01.T01 AT3G14350 31.164 292 146 4 41 283 400 685 1.01e-34 135
MsG0580026046.01.T01 AT1G52540 30.063 316 153 8 29 289 6 308 1.21e-34 130
MsG0580026046.01.T01 AT4G11460 29.293 297 144 7 47 288 258 543 1.49e-34 134
MsG0580026046.01.T01 AT4G23230 30.128 312 147 7 41 292 318 618 1.59e-34 134
MsG0580026046.01.T01 AT1G78530 36.071 280 124 8 57 288 72 344 1.63e-34 130
MsG0580026046.01.T01 AT2G13800 30.743 296 149 6 44 288 142 432 1.71e-34 132
MsG0580026046.01.T01 AT2G13800 30.743 296 149 6 44 288 142 432 1.71e-34 132
MsG0580026046.01.T01 AT5G66790 30.864 324 156 6 23 288 277 590 1.76e-34 134
MsG0580026046.01.T01 AT3G59700 29.674 337 165 7 37 318 315 634 1.85e-34 134
MsG0580026046.01.T01 AT2G20850 30.565 301 141 6 45 288 463 752 2.14e-34 134
MsG0580026046.01.T01 AT2G37710 32.177 317 145 9 47 304 334 639 2.16e-34 134
MsG0580026046.01.T01 AT5G65530 31.142 289 147 6 46 288 130 412 2.19e-34 132
MsG0580026046.01.T01 AT4G02410 30.744 309 148 6 43 298 341 636 2.26e-34 134
MsG0580026046.01.T01 AT1G53730 31.293 294 144 6 41 283 397 683 2.33e-34 134
MsG0580026046.01.T01 AT1G51870 30.838 334 141 7 16 288 495 799 2.34e-34 134
MsG0580026046.01.T01 AT4G11460 29.293 297 144 7 47 288 333 618 2.36e-34 134
MsG0580026046.01.T01 AT1G51870 30.838 334 141 7 16 288 547 851 2.41e-34 134
MsG0580026046.01.T01 AT1G25390 34.754 305 126 10 48 293 279 569 2.83e-34 134
MsG0580026046.01.T01 AT1G25390 34.754 305 126 10 48 293 279 569 2.83e-34 134
MsG0580026046.01.T01 AT5G59670 30.640 297 137 7 46 288 552 833 2.87e-34 134
MsG0580026046.01.T01 AT5G59670 30.640 297 137 7 46 288 552 833 2.87e-34 134
MsG0580026046.01.T01 AT1G29730 36.250 240 86 6 48 232 661 888 2.97e-34 134
MsG0580026046.01.T01 AT1G52540 30.421 309 147 8 36 289 16 311 3.00e-34 129
MsG0580026046.01.T01 AT2G01950 32.754 345 137 11 29 291 798 1129 3.28e-34 134
MsG0580026046.01.T01 AT4G23200 30.435 299 142 7 45 288 321 608 3.47e-34 133
MsG0580026046.01.T01 AT5G59260 31.987 297 135 7 46 288 341 624 3.62e-34 133
MsG0580026046.01.T01 AT4G11460 28.667 300 145 6 47 288 333 621 3.73e-34 134
MsG0580026046.01.T01 AT1G61610 31.864 295 135 6 48 288 513 795 4.10e-34 134
MsG0580026046.01.T01 AT2G13800 30.743 296 149 6 44 288 259 549 4.52e-34 133
MsG0580026046.01.T01 AT2G13800 30.743 296 149 6 44 288 259 549 4.52e-34 133
MsG0580026046.01.T01 AT1G11303 34.014 294 124 7 48 288 497 773 4.72e-34 134
MsG0580026046.01.T01 AT4G23290 30.408 319 146 9 37 292 297 602 4.98e-34 133
MsG0580026046.01.T01 AT1G79670 33.108 296 126 7 46 284 370 650 4.98e-34 133
MsG0580026046.01.T01 AT1G79670 33.108 296 126 7 46 284 407 687 5.27e-34 133
MsG0580026046.01.T01 AT1G16130 32.026 306 147 6 46 303 402 694 5.39e-34 133
MsG0580026046.01.T01 AT5G35370 31.988 322 132 10 46 293 503 811 6.18e-34 133
MsG0580026046.01.T01 AT4G11490 29.316 307 145 7 47 292 308 603 6.19e-34 132
MsG0580026046.01.T01 AT4G00960 31.179 263 114 6 18 223 13 265 6.44e-34 127
MsG0580026046.01.T01 AT1G18390 32.070 343 161 10 8 293 294 621 6.48e-34 132
MsG0580026046.01.T01 AT4G23290 30.408 319 146 9 37 292 340 645 6.61e-34 133
MsG0580026046.01.T01 AT1G34110 30.745 322 148 8 50 307 758 1068 7.02e-34 133
MsG0580026046.01.T01 AT1G29730 36.735 245 87 8 44 232 624 856 7.37e-34 133
MsG0580026046.01.T01 AT5G47850 32.188 320 151 8 34 288 411 729 7.49e-34 133
MsG0580026046.01.T01 AT1G18390 32.070 343 161 10 8 293 288 615 7.58e-34 132
MsG0580026046.01.T01 AT1G11350 32.776 299 128 8 48 288 500 783 9.14e-34 132
MsG0580026046.01.T01 AT4G23260 30.293 307 142 8 47 292 315 610 9.19e-34 132
MsG0580026046.01.T01 AT4G23250 30.619 307 141 8 47 292 346 641 1.01e-33 132
MsG0580026046.01.T01 AT3G46370 31.803 305 139 8 38 288 467 756 1.05e-33 132
MsG0580026046.01.T01 AT3G46370 31.803 305 139 8 38 288 467 756 1.05e-33 132
MsG0580026046.01.T01 AT1G11300 34.007 297 120 8 48 288 482 758 1.11e-33 132
MsG0580026046.01.T01 AT3G16030 31.803 305 135 9 43 288 510 800 1.11e-33 132
MsG0580026046.01.T01 AT1G11300 34.007 297 120 8 48 288 497 773 1.13e-33 132
MsG0580026046.01.T01 AT5G59680 32.787 305 136 8 38 288 560 849 1.14e-33 132
MsG0580026046.01.T01 AT2G48010 32.673 303 138 6 42 288 265 557 1.41e-33 131
MsG0580026046.01.T01 AT5G24080 33.446 296 128 8 48 288 393 674 1.50e-33 132
MsG0580026046.01.T01 AT5G24080 33.446 296 128 8 48 288 393 674 1.50e-33 132
MsG0580026046.01.T01 AT2G37050 31.594 345 145 12 15 284 545 873 1.54e-33 132
MsG0580026046.01.T01 AT1G17910 32.313 294 144 6 44 288 438 725 1.55e-33 132
MsG0580026046.01.T01 AT1G69730 31.561 301 147 6 48 295 435 729 1.62e-33 132
MsG0580026046.01.T01 AT4G04500 31.746 315 135 9 45 292 330 631 1.84e-33 131
MsG0580026046.01.T01 AT1G34110 31.579 304 133 8 50 289 758 1050 1.96e-33 132
MsG0580026046.01.T01 AT3G16030 31.803 305 135 9 43 288 387 677 2.01e-33 131
MsG0580026046.01.T01 AT5G24080 33.446 296 128 8 48 288 520 801 2.09e-33 132
MsG0580026046.01.T01 AT1G79620 32.203 295 138 5 46 288 624 908 2.33e-33 132
MsG0580026046.01.T01 AT1G79620 32.203 295 138 5 46 288 650 934 2.37e-33 132

Find 108 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 193 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AAAAGCTTGTGATTAATTTA+AGG 0.130377 5:-29800127 None:intergenic
GCATGCATGCTTCTAGAATT+TGG 0.175435 5:-29799829 None:intergenic
CTCATTAAGGGTCTAGCTTT+TGG 0.195492 5:-29799706 None:intergenic
TTCGACAACTTCACTCATTA+AGG 0.207068 5:-29799719 None:intergenic
TCATCTCTTTATGTTTCTTC+TGG 0.240148 5:+29799995 MsG0580026046.01.T01:three_prime_UTR
CAGCTCTATGCTTTGACATT+AGG 0.247282 5:-29799961 None:intergenic
AGTTGGCAACAAGAAATTTC+CGG 0.274978 5:+29797580 MsG0580026046.01.T01:CDS
ATCACCTTCTGGACCATCTT+TGG 0.285017 5:-29798650 None:intergenic
TTAGCCATATTTAAACTATA+AGG 0.287903 5:+29800249 MsG0580026046.01.T01:three_prime_UTR
ATTTATGTTGCTTAAGATCT+AGG 0.289789 5:+29800190 MsG0580026046.01.T01:three_prime_UTR
AGCCTGGAAATCACTTATTT+AGG 0.294793 5:+29797959 MsG0580026046.01.T01:CDS
AGCACCTTATAGTTTAAATA+TGG 0.295974 5:-29800253 None:intergenic
AAAGGTTGGATCGAAGAAAA+TGG 0.302715 5:+29797645 MsG0580026046.01.T01:CDS
AAAAGTGACGTGTACAGTTT+TGG 0.305705 5:+29799475 MsG0580026046.01.T01:CDS
ACCGCTCGGCTTGCATTGAT+TGG 0.310131 5:-29799795 None:intergenic
CCTTAACCATGATGGGCTTC+AGG 0.310353 5:+29797715 MsG0580026046.01.T01:CDS
TGTTATCTCTTGATTTCTTT+AGG 0.310550 5:+29800070 MsG0580026046.01.T01:three_prime_UTR
AAGAGCTTGCCATGTCCTTT+AGG 0.311576 5:-29799762 None:intergenic
TAACCTGTCATGACATATTC+TGG 0.334425 5:-29798721 None:intergenic
TATGCTTTGACATTAGGTTT+AGG 0.334892 5:-29799955 None:intergenic
CAAAACCTTGTTAAACTCAT+AGG 0.335121 5:+29797881 MsG0580026046.01.T01:CDS
CTCCTAAATAAGTGATTTCC+AGG 0.354463 5:-29797961 None:intergenic
GGTTGCTTTGTTTAACCATA+AGG 0.361673 5:+29800221 MsG0580026046.01.T01:three_prime_UTR
CTCTTTCAATGAACTTAAGT+TGG 0.364810 5:+29797563 MsG0580026046.01.T01:CDS
GACTTTGGTCTTGCCAAAGA+TGG 0.370510 5:+29798637 MsG0580026046.01.T01:CDS
GATATCCGGCAGAAGATCTA+TGG 0.373741 5:+29799516 MsG0580026046.01.T01:CDS
TTTCTTGGTGAAGGTGGCTT+TGG 0.389893 5:+29797612 MsG0580026046.01.T01:CDS
CCTGAAGCCCATCATGGTTA+AGG 0.390030 5:-29797715 None:intergenic
CTTAAGATCTAGGAAATGAT+TGG 0.391022 5:+29800200 MsG0580026046.01.T01:three_prime_UTR
GTGATTGTTGAGGATACTTA+TGG 0.391802 5:-29799933 None:intergenic
CTTGCCATGTCCTTTAGGTT+TGG 0.399035 5:-29799757 None:intergenic
TTGATAGACCCTCGTCTTGA+AGG 0.419472 5:+29799619 MsG0580026046.01.T01:CDS
CTGAAGCCCATCATGGTTAA+GGG 0.424009 5:-29797714 None:intergenic
AATGCCAAGCTCTCAGACTT+TGG 0.424969 5:+29798622 MsG0580026046.01.T01:CDS
TGAACATAACCTTGTGGAAT+GGG 0.430938 5:+29799558 MsG0580026046.01.T01:CDS
AGCCCTGTGCCAGGTTTCAC+TGG 0.435370 5:-29797675 None:intergenic
GTTCATGCCTCGGGGAAGCC+TGG 0.437375 5:+29797943 MsG0580026046.01.T01:CDS
AGGAGCTTAAAATTGCTTCC+AGG 0.439508 5:+29797529 MsG0580026046.01.T01:CDS
TCGACAACTTCACTCATTAA+GGG 0.439998 5:-29799718 None:intergenic
TGAGGATACTTATGGTGATA+AGG 0.440978 5:-29799925 None:intergenic
CTCTTCAAGTTTAGTAGTTG+AGG 0.449214 5:-29797508 None:intergenic
GTGGTTGTAGAAGAGATTAC+TGG 0.455301 5:-29797465 None:intergenic
CACATCTAGGAGAGCGAAGA+AGG 0.468252 5:+29799587 MsG0580026046.01.T01:CDS
CTTAACCATGATGGGCTTCA+GGG 0.469895 5:+29797716 MsG0580026046.01.T01:CDS
TCAATGCAAGCCGAGCGGTT+TGG 0.477204 5:+29799799 MsG0580026046.01.T01:CDS
AGTGTACGAGTTCATGCCTC+GGG 0.486147 5:+29797934 MsG0580026046.01.T01:CDS
ATGTCCTTTAGGTTTGGTAG+AGG 0.486206 5:-29799751 None:intergenic
ACCTTCACCAAGAAAACTCT+CGG 0.487217 5:-29797604 None:intergenic
CACAAGGTTATGTTCACCGT+TGG 0.487877 5:-29799551 None:intergenic
ATCAAGAGATAACATTTCCA+TGG 0.492414 5:-29800061 None:intergenic
ATAAAACCCACGTGTCTACT+CGG 0.492666 5:+29798671 MsG0580026046.01.T01:CDS
CCACGTGTCTACTCGGGTGA+TGG 0.494513 5:+29798678 MsG0580026046.01.T01:CDS
ACTCGGGTGATGGGAACATA+TGG 0.497289 5:+29798688 MsG0580026046.01.T01:CDS
TGTTTATAGAAAGATGAGAA+AGG 0.505310 5:+29800149 MsG0580026046.01.T01:three_prime_UTR
GAATGGGCTCGACCACATCT+AGG 0.506060 5:+29799574 MsG0580026046.01.T01:CDS
CTCAACTACTAAACTTGAAG+AGG 0.506553 5:+29797509 MsG0580026046.01.T01:CDS
AAGACCAAAGTCTGAGAGCT+TGG 0.506606 5:-29798626 None:intergenic
TGTAAAACCCTTAACCATGA+TGG 0.508253 5:+29797707 MsG0580026046.01.T01:CDS
ACAAGGTTATGTTCACCGTT+GGG 0.508853 5:-29799550 None:intergenic
CAAGACGAGGGTCTATCAAC+CGG 0.515912 5:-29799615 None:intergenic
GTACTACTTGAGATGATATC+CGG 0.519858 5:+29799502 MsG0580026046.01.T01:CDS
CACCAAGAAAACTCTCGGGC+CGG 0.520809 5:-29797599 None:intergenic
GGAGATACATGTGCACCGTT+CGG 0.525728 5:-29799904 None:intergenic
GGAACTGCTCCAGTGAAACC+TGG 0.528126 5:+29797666 MsG0580026046.01.T01:CDS
AGATTACTGGAGCAGTTCGT+TGG 0.534468 5:-29797452 None:intergenic
GCTCCAGTGAAACCTGGCAC+AGG 0.535117 5:+29797672 MsG0580026046.01.T01:CDS
GTAAAACCCTTAACCATGAT+GGG 0.535902 5:+29797708 MsG0580026046.01.T01:CDS
CTCGCAACGGACAGCAGAGA+AGG 0.540774 5:+29799869 MsG0580026046.01.T01:CDS
CACGTGTCTACTCGGGTGAT+GGG 0.543139 5:+29798679 MsG0580026046.01.T01:CDS
TATGACCCTGAAGCCCATCA+TGG 0.544011 5:-29797721 None:intergenic
GTGAACATAACCTTGTGGAA+TGG 0.554907 5:+29799557 MsG0580026046.01.T01:CDS
CTAATGTCAAAGCATAGAGC+TGG 0.556325 5:+29799962 MsG0580026046.01.T01:exon
GCAACTGTAAGCCCTGTGCC+AGG 0.565611 5:-29797684 None:intergenic
GCACCAGAATATGTCATGAC+AGG 0.567394 5:+29798718 MsG0580026046.01.T01:CDS
ATTGCTTTCTGCGTTACTAG+TGG 0.570790 5:-29797484 None:intergenic
GAGAGCGAAGAAGGTTCTAC+CGG 0.571211 5:+29799596 MsG0580026046.01.T01:CDS
AATGCCTCTACCAAACCTAA+AGG 0.575940 5:+29799747 MsG0580026046.01.T01:CDS
TAGTGTACGAGTTCATGCCT+CGG 0.580734 5:+29797933 MsG0580026046.01.T01:CDS
TTTGTCCATAGATCTTCTGC+CGG 0.583035 5:-29799521 None:intergenic
CTCCAGTGAAACCTGGCACA+GGG 0.590855 5:+29797673 MsG0580026046.01.T01:CDS
TCAAGAGATAACATTTCCAT+GGG 0.592331 5:-29800060 None:intergenic
GGTTATGTTCACCGTTGGGT+CGG 0.599139 5:-29799546 None:intergenic
CCTTCACCAAGAAAACTCTC+GGG 0.599348 5:-29797603 None:intergenic
TTAGGTTTAGGTGATTGTTG+AGG 0.605285 5:-29799943 None:intergenic
TAAAACCCACGTGTCTACTC+GGG 0.605524 5:+29798672 MsG0580026046.01.T01:CDS
GGAGCGTCGCTTGCTCGCAA+CGG 0.616247 5:+29799856 MsG0580026046.01.T01:CDS
CTTGCCAAAGATGGTCCAGA+AGG 0.620848 5:+29798646 MsG0580026046.01.T01:CDS
CTTCTTCGCTCTCCTAGATG+TGG 0.621454 5:-29799586 None:intergenic
TCTAGAAGCATGCATGCACA+AGG 0.622807 5:+29799835 MsG0580026046.01.T01:CDS
CCATCACCCGAGTAGACACG+TGG 0.623575 5:-29798678 None:intergenic
GTGCACCGTTCGGTATCGAA+AGG 0.632359 5:-29799894 None:intergenic
ATGGACAAACACCGACCCAA+CGG 0.632711 5:+29799535 MsG0580026046.01.T01:CDS
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TGGACTCGCTCCAAACCGCT+CGG 0.640762 5:-29799809 None:intergenic
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CRISPR-GE

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AATGCCAAGCTCTCAGACTT+TGG + Chr5:29798622-29798641 MsG0580026046.01.T01:CDS 45.0%
AGATTACTGGAGCAGTTCGT+TGG - Chr5:29797455-29797474 None:intergenic 45.0%
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CAACGGTGAACATAACCTTG+TGG + Chr5:29799552-29799571 MsG0580026046.01.T01:CDS 45.0%
CACAAGGTTATGTTCACCGT+TGG - Chr5:29799554-29799573 None:intergenic 45.0%
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GATATCCGGCAGAAGATCTA+TGG + Chr5:29799516-29799535 MsG0580026046.01.T01:CDS 45.0%
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TGGATGTCTCTTGTGAAACC+TGG + Chr5:29798086-29798105 MsG0580026046.01.T01:intron 45.0%
TTGATAGACCCTCGTCTTGA+AGG + Chr5:29799619-29799638 MsG0580026046.01.T01:CDS 45.0%
TTGGAACATGTTACAGGCAG+AGG + Chr5:29797832-29797851 MsG0580026046.01.T01:intron 45.0%
TTTCTTGGTGAAGGTGGCTT+TGG + Chr5:29797612-29797631 MsG0580026046.01.T01:CDS 45.0%
! ATCCTAATGGACCATGGAAG+AGG - Chr5:29798417-29798436 None:intergenic 45.0%
! CTTGCCATGTCCTTTAGGTT+TGG - Chr5:29799760-29799779 None:intergenic 45.0%
! GAAAGAGAATTTTCGCAGCC+TGG - Chr5:29797550-29797569 None:intergenic 45.0%
! GAGAGTTTTCTTGGTGAAGG+TGG + Chr5:29797606-29797625 MsG0580026046.01.T01:CDS 45.0%
! GGCTTTCTGAGCTCCTTTTA+CGG - Chr5:29799653-29799672 None:intergenic 45.0%
! TAGCTTTTGGATCTCTGCTC+AGG - Chr5:29799696-29799715 None:intergenic 45.0%
! TCTAGAAGCATGCATGCACA+AGG + Chr5:29799835-29799854 MsG0580026046.01.T01:CDS 45.0%
!! ACGTGGGTTTTATCACCTTC+TGG - Chr5:29798664-29798683 None:intergenic 45.0%
!! CTTAACCATGATGGGCTTCA+GGG + Chr5:29797716-29797735 MsG0580026046.01.T01:CDS 45.0%
!! GACTTTGGTCTTGCCAAAGA+TGG + Chr5:29798637-29798656 MsG0580026046.01.T01:CDS 45.0%
AATGGACCATGGAAGAGGCA+TGG - Chr5:29798412-29798431 None:intergenic 50.0%
AGGAGCCTTTCGATACCGAA+CGG + Chr5:29799889-29799908 MsG0580026046.01.T01:CDS 50.0%
AGTGTACGAGTTCATGCCTC+GGG + Chr5:29797934-29797953 MsG0580026046.01.T01:CDS 50.0%
ATGGACAAACACCGACCCAA+CGG + Chr5:29799535-29799554 MsG0580026046.01.T01:CDS 50.0%
CAAGACGAGGGTCTATCAAC+CGG - Chr5:29799618-29799637 None:intergenic 50.0%
CACATCTAGGAGAGCGAAGA+AGG + Chr5:29799587-29799606 MsG0580026046.01.T01:CDS 50.0%
CATGCTAAAACAGTCCCGCA+AGG - Chr5:29798831-29798850 None:intergenic 50.0%
CCTGAAGCCCATCATGGTTA+AGG - Chr5:29797718-29797737 None:intergenic 50.0%
CTTCTTCGCTCTCCTAGATG+TGG - Chr5:29799589-29799608 None:intergenic 50.0%
CTTGCCAAAGATGGTCCAGA+AGG + Chr5:29798646-29798665 MsG0580026046.01.T01:CDS 50.0%
GAGAGCGAAGAAGGTTCTAC+CGG + Chr5:29799596-29799615 MsG0580026046.01.T01:CDS 50.0%
GGAGATACATGTGCACCGTT+CGG - Chr5:29799907-29799926 None:intergenic 50.0%
GGTTATGTTCACCGTTGGGT+CGG - Chr5:29799549-29799568 None:intergenic 50.0%
TAGGATCCATGCCTCTTCCA+TGG + Chr5:29798403-29798422 MsG0580026046.01.T01:intron 50.0%
TATGACCCTGAAGCCCATCA+TGG - Chr5:29797724-29797743 None:intergenic 50.0%
TCCAATCAATGCAAGCCGAG+CGG + Chr5:29799794-29799813 MsG0580026046.01.T01:CDS 50.0%
TGCCTCTTCCATGGTCCATT+AGG + Chr5:29798412-29798431 MsG0580026046.01.T01:intron 50.0%
! CCCGAGAGTTTTCTTGGTGA+AGG + Chr5:29797603-29797622 MsG0580026046.01.T01:CDS 50.0%
!! ACTCGGGTGATGGGAACATA+TGG + Chr5:29798688-29798707 MsG0580026046.01.T01:CDS 50.0%
!! CCTTAACCATGATGGGCTTC+AGG + Chr5:29797715-29797734 MsG0580026046.01.T01:CDS 50.0%
CACCAAGAAAACTCTCGGGC+CGG - Chr5:29797602-29797621 None:intergenic 55.0%
CACGTGTCTACTCGGGTGAT+GGG + Chr5:29798679-29798698 MsG0580026046.01.T01:CDS 55.0%
CATCACCCGAGTAGACACGT+GGG - Chr5:29798680-29798699 None:intergenic 55.0%
CTCCAGTGAAACCTGGCACA+GGG + Chr5:29797673-29797692 MsG0580026046.01.T01:CDS 55.0%
GCAGTGATGAGCTAGCTGAG+CGG - Chr5:29799674-29799693 None:intergenic 55.0%
GGAACTGCTCCAGTGAAACC+TGG + Chr5:29797666-29797685 MsG0580026046.01.T01:CDS 55.0%
GTGTACGAGTTCATGCCTCG+GGG + Chr5:29797935-29797954 MsG0580026046.01.T01:CDS 55.0%
TCAATGCAAGCCGAGCGGTT+TGG + Chr5:29799799-29799818 MsG0580026046.01.T01:CDS 55.0%
! ACCGCTCGGCTTGCATTGAT+TGG - Chr5:29799798-29799817 None:intergenic 55.0%
! GAATGGGCTCGACCACATCT+AGG + Chr5:29799574-29799593 MsG0580026046.01.T01:CDS 55.0%
! GTGCACCGTTCGGTATCGAA+AGG - Chr5:29799897-29799916 None:intergenic 55.0%
! TTCCGGCCCGAGAGTTTTCT+TGG + Chr5:29797597-29797616 MsG0580026046.01.T01:CDS 55.0%
!! CAAACTTGTGTGGCACTGGC+AGG + Chr5:29799439-29799458 MsG0580026046.01.T01:intron 55.0%
AGCCCTGTGCCAGGTTTCAC+TGG - Chr5:29797678-29797697 None:intergenic 60.0%
CCACGTGTCTACTCGGGTGA+TGG + Chr5:29798678-29798697 MsG0580026046.01.T01:CDS 60.0%
CCATCACCCGAGTAGACACG+TGG - Chr5:29798681-29798700 None:intergenic 60.0%
CTCGCAACGGACAGCAGAGA+AGG + Chr5:29799869-29799888 MsG0580026046.01.T01:CDS 60.0%
GCAACTGTAAGCCCTGTGCC+AGG - Chr5:29797687-29797706 None:intergenic 60.0%
GCTCCAGTGAAACCTGGCAC+AGG + Chr5:29797672-29797691 MsG0580026046.01.T01:CDS 60.0%
GTGATTTCCAGGCTTCCCCG+AGG - Chr5:29797953-29797972 None:intergenic 60.0%
GTGGTCGAGCCCATTCCACA+AGG - Chr5:29799570-29799589 None:intergenic 60.0%
TGGACTCGCTCCAAACCGCT+CGG - Chr5:29799812-29799831 None:intergenic 60.0%
GTTCATGCCTCGGGGAAGCC+TGG + Chr5:29797943-29797962 MsG0580026046.01.T01:CDS 65.0%
!! GGAGCGTCGCTTGCTCGCAA+CGG + Chr5:29799856-29799875 MsG0580026046.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr5 gene 29797420 29800429 29797420 ID=MsG0580026046.01;Name=MsG0580026046.01
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Chr5 exon 29797420 29797737 29797420 ID=MsG0580026046.01.T01:exon:7202;Parent=MsG0580026046.01.T01
Chr5 exon 29797848 29797982 29797848 ID=MsG0580026046.01.T01:exon:7203;Parent=MsG0580026046.01.T01
Chr5 exon 29798616 29798739 29798616 ID=MsG0580026046.01.T01:exon:7204;Parent=MsG0580026046.01.T01
Chr5 exon 29799461 29800429 29799461 ID=MsG0580026046.01.T01:exon:7205;Parent=MsG0580026046.01.T01
Chr5 CDS 29797420 29797737 29797420 ID=MsG0580026046.01.T01:cds;Parent=MsG0580026046.01.T01
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Chr5 CDS 29798616 29798739 29798616 ID=MsG0580026046.01.T01:cds;Parent=MsG0580026046.01.T01
Chr5 CDS 29799461 29799978 29799461 ID=MsG0580026046.01.T01:cds;Parent=MsG0580026046.01.T01
Chr5 three_prime_UTR 29799979 29800429 29799979 ID=MsG0580026046.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0580026046.01.T01
Gene Sequence

>MsG0580026046.01.T01

GAAAGTAAATCAACTAATGATACAAGTAGAGGCCAACGAACTGCTCCAGTAATCTCTTCTACAACCACTAGTAACGCAGAAAGCAATTCCTCAACTACTAAACTTGAAGAGGAGCTTAAAATTGCTTCCAGGCTGCGAAAATTCTCTTTCAATGAACTTAAGTTGGCAACAAGAAATTTCCGGCCCGAGAGTTTTCTTGGTGAAGGTGGCTTTGGTTGTGTTTTCAAAGGTTGGATCGAAGAAAATGGAACTGCTCCAGTGAAACCTGGCACAGGGCTTACAGTTGCTGTAAAACCCTTAACCATGATGGGCTTCAGGGCAGAGGTTAATTTTCTTGGTGATCTAGTTCATCAAAACCTTGTTAAACTCATAGGTTACTGCATTGAAGATGATCAAAGGCTGCTAGTGTACGAGTTCATGCCTCGGGGAAGCCTGGAAATCACTTATTTAGGAGACTACAATGCCAAGCTCTCAGACTTTGGTCTTGCCAAAGATGGTCCAGAAGGTGATAAAACCCACGTGTCTACTCGGGTGATGGGAACATATGGTTATGCAGCACCAGAATATGTCATGACAGGTCATCTTACGTCAAAAAGTGACGTGTACAGTTTTGGAGTCGTACTACTTGAGATGATATCCGGCAGAAGATCTATGGACAAACACCGACCCAACGGTGAACATAACCTTGTGGAATGGGCTCGACCACATCTAGGAGAGCGAAGAAGGTTCTACCGGTTGATAGACCCTCGTCTTGAAGGTCACTTTTCCGTAAAAGGAGCTCAGAAAGCCGCTCAGCTAGCTCATCACTGCCTGAGCAGAGATCCAAAAGCTAGACCCTTAATGAGTGAAGTTGTCGAAGCTTTAATGCCTCTACCAAACCTAAAGGACATGGCAAGCTCTTCGTACTATTTCCAATCAATGCAAGCCGAGCGGTTTGGAGCGAGTCCAAATTCTAGAAGCATGCATGCACAAGGAGCGTCGCTTGCTCGCAACGGACAGCAGAGAAGGAGCCTTTCGATACCGAACGGTGCACATGTATCTCCTTATCACCATAAGTATCCTCAACAATCACCTAAACCTAATGTCAAAGCATAG
Protein sequence

>MsG0580026046.01.T01

ESKSTNDTSRGQRTAPVISSTTTSNAESNSSTTKLEEELKIASRLRKFSFNELKLATRNFRPESFLGEGGFGCVFKGWIEENGTAPVKPGTGLTVAVKPLTMMGFRAEVNFLGDLVHQNLVKLIGYCIEDDQRLLVYEFMPRGSLEITYLGDYNAKLSDFGLAKDGPEGDKTHVSTRVMGTYGYAAPEYVMTGHLTSKSDVYSFGVVLLEMISGRRSMDKHRPNGEHNLVEWARPHLGERRRFYRLIDPRLEGHFSVKGAQKAAQLAHHCLSRDPKARPLMSEVVEALMPLPNLKDMASSSYYFQSMQAERFGASPNSRSMHAQGASLARNGQQRRSLSIPNGAHVSPYHHKYPQQSPKPNVKA*