AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0580029178.01

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MsG0580029178.01.T01 AT3G19700 28.883 367 226 6 1 367 244 575 1.33e-26 117
MsG0580029178.01.T01 AT5G06940 31.818 660 411 19 7 662 80 704 9.95e-67 237
MsG0580029178.01.T01 AT5G06940 33.475 236 154 3 203 436 76 310 2.53e-20 97.1
MsG0580029178.01.T01 AT3G28040 30.026 766 413 17 1 662 100 846 6.36e-66 237
MsG0580029178.01.T01 AT3G28040 35.751 193 117 5 248 436 75 264 1.60e-14 78.2
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MsG0580029178.01.T01 AT1G09970 28.553 767 421 23 1 685 96 817 2.98e-65 234
MsG0580029178.01.T01 AT1G73080 30.819 769 399 20 3 659 196 943 6.56e-65 234
MsG0580029178.01.T01 AT1G73080 35.165 455 283 8 7 460 104 547 1.15e-53 201
MsG0580029178.01.T01 AT1G73080 33.740 492 287 9 12 477 157 635 1.67e-50 192
MsG0580029178.01.T01 AT1G73080 34.943 352 221 4 109 460 85 428 4.34e-36 147
MsG0580029178.01.T01 AT1G73080 33.003 303 152 4 207 460 80 380 2.17e-27 119
MsG0580029178.01.T01 AT1G73080 33.191 235 130 4 251 460 76 308 1.04e-19 95.1
MsG0580029178.01.T01 AT1G73080 35.000 140 89 2 323 461 75 213 1.43e-12 72.0
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MsG0580029178.01.T01 AT3G02130 26.110 766 455 21 3 681 263 1004 2.04e-40 160
MsG0580029178.01.T01 AT3G02130 28.125 416 225 7 14 419 132 483 7.40e-29 124
MsG0580029178.01.T01 AT3G02130 27.660 517 285 15 1 460 167 651 2.01e-25 113
MsG0580029178.01.T01 AT3G02130 35.231 281 144 10 189 461 132 382 7.16e-24 108
MsG0580029178.01.T01 AT2G15080 34.884 387 215 9 44 427 106 458 2.48e-40 160
MsG0580029178.01.T01 AT2G15080 33.550 462 263 12 4 433 114 563 3.80e-40 159
MsG0580029178.01.T01 AT2G15080 32.508 323 206 6 117 435 103 417 1.75e-34 142
MsG0580029178.01.T01 AT2G15080 37.398 246 148 2 203 448 113 352 1.02e-33 139
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MsG0580029178.01.T01 AT1G07390 28.381 451 280 13 28 449 311 747 1.16e-19 95.1
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MsG0580029178.01.T01 AT2G27060 29.533 535 286 20 28 508 95 592 5.61e-37 149
MsG0580029178.01.T01 AT5G10020 30.268 522 294 15 1 499 98 572 5.99e-37 149
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MsG0580029178.01.T01 AT3G20820 28.750 240 138 3 4 243 129 335 3.52e-15 78.6
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MsG0580029178.01.T01 AT3G25020 30.204 490 286 20 7 461 78 546 2.63e-23 106
MsG0580029178.01.T01 AT3G25020 26.066 610 288 18 1 461 195 790 8.04e-21 98.6
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MsG0580029178.01.T01 AT1G74180 26.527 622 277 15 3 457 285 893 1.20e-30 130
MsG0580029178.01.T01 AT1G74180 31.086 267 167 10 204 460 140 399 2.25e-12 71.2
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MsG0580029178.01.T01 AT3G11010 29.185 466 267 12 1 414 231 685 7.58e-29 124
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MsG0580029178.01.T01 AT1G47890 29.114 474 282 15 24 462 225 679 2.39e-24 110
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MsG0580029178.01.T01 AT2G42800 36.723 177 105 3 266 441 137 307 1.08e-16 84.0
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MsG0580029178.01.T01 AT5G10290 29.356 419 253 13 287 683 30 427 4.24e-27 117
MsG0580029178.01.T01 AT1G58190 28.228 457 300 11 6 457 423 856 5.85e-27 118
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MsG0580029178.01.T01 AT1G58190 29.070 258 172 6 204 453 103 357 2.39e-15 80.9
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MsG0580029178.01.T01 AT1G56140 33.840 263 163 4 213 470 109 365 1.10e-26 117
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MsG0580029178.01.T01 AT1G56140 30.627 271 170 6 4 270 124 380 2.68e-24 109
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MsG0580029178.01.T01 AT1G56130 29.747 316 188 6 1 316 98 379 1.75e-22 103
MsG0580029178.01.T01 AT1G56130 30.736 231 135 8 435 661 600 809 4.01e-20 96.3
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MsG0580029178.01.T01 AT5G65240 29.280 403 236 12 297 683 52 421 1.22e-24 109
MsG0580029178.01.T01 AT5G65240 47.619 84 44 0 11 94 97 180 1.21e-12 71.6
MsG0580029178.01.T01 AT5G65240 46.988 83 41 1 4 86 114 193 6.53e-11 66.2
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MsG0580029178.01.T01 AT2G28990 32.059 340 180 12 372 688 406 717 1.29e-24 110
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MsG0580029178.01.T01 AT1G74200 33.758 157 101 2 1 157 92 245 5.20e-14 73.9
MsG0580029178.01.T01 AT1G74200 27.612 268 153 9 7 246 1 255 3.35e-12 68.6
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MsG0580029178.01.T01 AT2G15320 27.500 320 172 6 3 320 77 338 2.97e-18 88.2
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MsG0580029178.01.T01 AT1G51790 25.670 448 213 16 345 721 409 807 3.77e-20 96.3
MsG0580029178.01.T01 AT1G51870 27.273 352 190 11 348 681 412 715 3.83e-20 96.3
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MsG0580029178.01.T01 AT2G45340 36.723 177 109 3 288 463 82 256 1.00e-17 88.2
MsG0580029178.01.T01 AT2G45340 43.750 128 71 1 310 437 80 206 1.00e-16 85.1
MsG0580029178.01.T01 AT2G45340 38.217 157 96 1 3 159 69 224 2.40e-16 84.0
MsG0580029178.01.T01 AT2G45340 35.484 155 73 3 4 158 118 245 7.47e-13 72.8
MsG0580029178.01.T01 AT2G45340 30.675 163 106 2 137 299 82 237 2.21e-12 71.2
MsG0580029178.01.T01 AT3G46330 30.921 304 183 8 387 688 428 706 5.64e-20 95.9
MsG0580029178.01.T01 AT2G39180 28.349 321 142 13 444 692 396 700 5.68e-20 95.5
MsG0580029178.01.T01 AT3G45420 29.268 287 139 7 459 690 271 548 5.87e-20 95.1
MsG0580029178.01.T01 AT1G49100 31.307 329 193 12 372 688 414 721 5.89e-20 95.9
MsG0580029178.01.T01 AT4G02420 35.802 162 93 3 527 688 340 490 9.26e-20 94.7
MsG0580029178.01.T01 AT2G31880 27.229 415 217 13 318 662 82 481 1.32e-19 94.0
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MsG0580029178.01.T01 AT1G05700 26.944 360 181 12 325 659 411 713 2.81e-18 90.5
MsG0580029178.01.T01 AT3G22800 33.191 235 147 6 177 409 123 349 3.02e-18 89.0
MsG0580029178.01.T01 AT3G22800 25.455 330 180 8 25 351 98 364 8.95e-17 84.3
MsG0580029178.01.T01 AT3G22800 29.237 236 158 5 207 438 104 334 1.29e-15 80.9
MsG0580029178.01.T01 AT2G13800 31.034 319 186 10 373 683 3 295 3.16e-18 89.0
MsG0580029178.01.T01 AT2G13800 31.034 319 186 10 373 683 3 295 3.16e-18 89.0
MsG0580029178.01.T01 AT1G80640 27.333 300 135 11 465 692 56 344 3.28e-18 87.4
MsG0580029178.01.T01 AT1G51820 28.035 346 204 10 365 688 134 456 3.44e-18 89.7
MsG0580029178.01.T01 AT3G59510 28.571 224 128 4 250 453 95 306 3.73e-18 88.2
MsG0580029178.01.T01 AT3G59510 30.392 306 197 9 128 431 100 391 1.34e-17 86.7
MsG0580029178.01.T01 AT3G59510 36.601 153 90 3 314 466 90 235 8.35e-16 80.9
MsG0580029178.01.T01 AT3G59510 24.852 338 213 8 3 338 96 394 1.09e-15 80.5
MsG0580029178.01.T01 AT3G59510 27.969 261 163 5 197 436 90 346 3.16e-15 79.0
MsG0580029178.01.T01 AT3G59510 25.987 304 205 8 1 301 118 404 3.88e-12 69.3
MsG0580029178.01.T01 AT1G51820 28.035 346 204 11 365 688 396 718 3.73e-18 90.1
MsG0580029178.01.T01 AT1G26970 28.916 249 104 7 506 692 56 293 3.89e-18 88.2
MsG0580029178.01.T01 AT5G10530 30.288 208 125 6 470 666 257 455 3.92e-18 89.4
MsG0580029178.01.T01 AT4G35470 29.179 329 184 14 18 338 238 525 3.95e-18 89.0
MsG0580029178.01.T01 AT4G35470 33.610 241 149 11 193 432 261 491 8.86e-18 87.8
MsG0580029178.01.T01 AT4G23160 27.519 258 115 7 496 689 310 559 5.20e-18 89.0
MsG0580029178.01.T01 AT5G59700 38.125 160 87 6 529 688 474 621 5.33e-18 89.4
MsG0580029178.01.T01 AT1G52540 29.876 241 104 8 508 694 15 244 5.52e-18 86.7
MsG0580029178.01.T01 AT5G11020 37.017 181 99 6 504 681 45 213 5.72e-18 87.0
MsG0580029178.01.T01 AT5G59260 38.037 163 88 6 527 688 345 495 5.89e-18 89.0
MsG0580029178.01.T01 AT5G11020 37.017 181 99 6 504 681 68 236 6.25e-18 87.0
MsG0580029178.01.T01 AT1G71830 41.176 136 80 0 324 459 70 205 6.59e-18 88.6
MsG0580029178.01.T01 AT1G71830 49.425 87 44 0 7 93 98 184 4.04e-14 76.6
MsG0580029178.01.T01 AT1G71830 36.090 133 83 2 250 382 69 199 2.27e-12 70.9
MsG0580029178.01.T01 AT1G71830 38.182 110 68 0 207 316 74 183 3.49e-12 70.5
MsG0580029178.01.T01 AT1G71830 30.435 184 113 5 501 683 270 439 5.33e-12 69.7
MsG0580029178.01.T01 AT5G11020 37.017 181 99 6 504 681 72 240 6.60e-18 87.0
MsG0580029178.01.T01 AT1G65800 34.101 217 105 8 475 661 431 639 6.72e-18 89.0
MsG0580029178.01.T01 AT1G65790 28.239 301 122 10 475 689 427 719 7.43e-18 89.0
MsG0580029178.01.T01 AT2G25220 38.621 145 78 5 517 659 125 260 7.71e-18 86.7
MsG0580029178.01.T01 AT3G45390 29.885 261 132 9 503 721 315 566 8.12e-18 88.6
MsG0580029178.01.T01 AT4G35470 33.610 241 149 11 193 432 261 491 8.81e-18 87.8
MsG0580029178.01.T01 AT4G35470 30.693 303 166 14 18 319 238 497 2.96e-17 86.3
MsG0580029178.01.T01 AT2G26730 41.096 146 81 3 7 151 71 212 8.84e-18 88.2
MsG0580029178.01.T01 AT2G26730 30.288 208 90 5 538 697 352 552 4.21e-17 86.3
MsG0580029178.01.T01 AT2G26730 36.257 171 98 4 298 467 66 226 1.55e-16 84.3
MsG0580029178.01.T01 AT2G26730 32.903 155 92 2 1 155 90 232 3.22e-11 67.4
MsG0580029178.01.T01 AT5G59270 35.802 162 93 5 527 688 342 492 8.97e-18 88.2
MsG0580029178.01.T01 AT1G27170 26.852 432 260 13 1 427 764 1144 9.25e-18 89.0
MsG0580029178.01.T01 AT5G59270 35.802 162 93 5 527 688 339 489 9.56e-18 88.2
MsG0580029178.01.T01 AT5G59270 35.802 162 93 5 527 688 358 508 9.71e-18 88.2
MsG0580029178.01.T01 AT5G37450 31.930 285 145 10 179 455 79 322 9.73e-18 88.6
MsG0580029178.01.T01 AT5G37450 26.557 305 184 7 15 314 66 335 1.92e-16 84.3
MsG0580029178.01.T01 AT5G37450 38.129 139 69 5 527 661 597 722 9.61e-14 75.9
MsG0580029178.01.T01 AT5G11020 37.017 181 99 6 504 681 106 274 1.08e-17 87.0
MsG0580029178.01.T01 AT1G15530 26.383 235 109 6 527 706 351 576 1.10e-17 88.2
MsG0580029178.01.T01 AT2G25220 38.621 145 78 5 517 659 76 211 1.13e-17 86.3
MsG0580029178.01.T01 AT1G80640 27.333 300 135 10 465 692 56 344 1.16e-17 86.7
MsG0580029178.01.T01 AT3G02810 28.070 228 100 4 524 693 51 272 1.18e-17 87.4
MsG0580029178.01.T01 AT1G10620 34.395 157 92 4 506 661 339 485 1.19e-17 88.2
MsG0580029178.01.T01 AT4G05200 32.692 208 117 9 465 661 268 463 1.20e-17 87.8
MsG0580029178.01.T01 AT4G05200 32.692 208 117 9 465 661 286 481 1.26e-17 87.8
MsG0580029178.01.T01 AT1G27170 26.852 432 260 13 1 427 764 1144 1.32e-17 88.6

Find 153 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 216 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TTTAACTTTCCAATTGAATT+TGG 0.147350 5:-93304763 None:intergenic
CTTATCCTTATCAGTGTAAT+TGG 0.200155 5:+93305483 MsG0580029178.01.T01:CDS
CTATCTTAATTGGCTTGATA+TGG 0.208964 5:+93304642 MsG0580029178.01.T01:CDS
GAATTGCGATGGTTTGATTT+AGG 0.239910 5:+93304406 MsG0580029178.01.T01:CDS
TCTTCACCATCTTTGCAAAA+AGG 0.242340 5:+93305576 MsG0580029178.01.T01:CDS
TCCCAATCTTGTAGATTTCT+TGG 0.246910 5:+93304330 MsG0580029178.01.T01:CDS
AGGAAGCATACCTTATTCTT+TGG 0.253698 5:+93304153 MsG0580029178.01.T01:CDS
TTGTTCAAGCGTTGATTATA+AGG 0.259143 5:+93305836 MsG0580029178.01.T01:CDS
TGGAGGTATACCTTCGTTCT+TGG 0.277531 5:+93305188 MsG0580029178.01.T01:CDS
GCAAGTTGGTACAATATCTA+AGG 0.287573 5:-93304915 None:intergenic
CTTCTTCATGAAAATAGATT+TGG 0.287867 5:+93304583 MsG0580029178.01.T01:CDS
CAGGGAGATGTTTACAGCTT+TGG 0.292688 5:+93306412 MsG0580029178.01.T01:CDS
ATAAGTTGTCCGATTCCTTT+AGG 0.302983 5:-93304691 None:intergenic
GAAACTTCCTCCATGTTCTA+AGG 0.309833 5:+93305422 MsG0580029178.01.T01:CDS
TTAGGATCTTTACAAGATTT+CGG 0.311877 5:-93305809 None:intergenic
ATTTACCTAACGAAACAATT+AGG 0.317010 5:+93304974 MsG0580029178.01.T01:CDS
CAAAAGATTGCATATTTGAT+AGG 0.322373 5:-93304252 None:intergenic
TGGGTCAATACCTCTTACTT+TGG 0.324353 5:+93304444 MsG0580029178.01.T01:CDS
GACCGACAGATAGCATGTTT+TGG 0.326058 5:+93306467 MsG0580029178.01.T01:CDS
AAACAAGCACCGAGGTCATT+TGG 0.330024 5:-93305126 None:intergenic
AGGGAGATGTTTACAGCTTT+GGG 0.337755 5:+93306413 MsG0580029178.01.T01:CDS
TTGGGAGAAAACAAATTATA+TGG 0.341061 5:+93304805 MsG0580029178.01.T01:CDS
TTCAATACCTTTACAACAAT+GGG 0.343616 5:-93305720 None:intergenic
GTCAACTTACCCAAAGAATA+AGG 0.343698 5:-93304163 None:intergenic
GTAAGATTGCCAATACTATT+AGG 0.344924 5:-93304835 None:intergenic
TATAGAAATTCTTGAGATAG+TGG 0.352559 5:+93306531 MsG0580029178.01.T01:CDS
GGAAGCATACCTTATTCTTT+GGG 0.352866 5:+93304154 MsG0580029178.01.T01:CDS
TTCCAAGAAATCTACAAGAT+TGG 0.354951 5:-93304332 None:intergenic
ATGGGGATGAATCAAATATA+TGG 0.356672 5:+93304661 MsG0580029178.01.T01:CDS
CATATTTGATAGGTTGTAAA+GGG 0.356964 5:-93304242 None:intergenic
GTTTCGGCAATTTCATTAAC+CGG 0.357539 5:+93305366 MsG0580029178.01.T01:CDS
AAAACAAGATTCATATTTGA+TGG 0.358635 5:-93304307 None:intergenic
ACGGAAAATTCCCGGTCATT+TGG 0.366182 5:-93304363 None:intergenic
TATCTTAATTGGCTTGATAT+GGG 0.368138 5:+93304643 MsG0580029178.01.T01:CDS
GAAACAATTCCAAATTCAAT+TGG 0.372825 5:+93304754 MsG0580029178.01.T01:CDS
ACATCTCCCTGTGGAGATAC+TGG 0.372980 5:-93306400 None:intergenic
TGGTGAAGATGGTAGCATTT+TGG 0.373202 5:-93305562 None:intergenic
AAAGGAATCGGACAACTTAT+CGG 0.379444 5:+93304694 MsG0580029178.01.T01:CDS
GGAGGTATACCTTCGTTCTT+GGG 0.382003 5:+93305189 MsG0580029178.01.T01:CDS
AACAAGCACCGAGGTCATTT+GGG 0.383848 5:-93305125 None:intergenic
CTTGGGGTAAACAATTTATT+CGG 0.387312 5:+93304277 MsG0580029178.01.T01:CDS
TCATCTAATTTGGTTGGAAC+AGG 0.404817 5:+93305651 MsG0580029178.01.T01:CDS
AGGTGACTTTAGCAATGTTT+CGG 0.405368 5:+93305350 MsG0580029178.01.T01:CDS
TTGGTTGGAACAGGAAGTTT+TGG 0.405919 5:+93305660 MsG0580029178.01.T01:CDS
TTTAATCTACCCAAAGTAAG+AGG 0.407788 5:-93304454 None:intergenic
TCCAAGAAATCTACAAGATT+GGG 0.410138 5:-93304331 None:intergenic
TTGTATAGAAATAAATTTCA+AGG 0.412307 5:+93304877 MsG0580029178.01.T01:CDS
GGGTCAATACCTCTTACTTT+GGG 0.419403 5:+93304445 MsG0580029178.01.T01:CDS
CAACGCTTGAACAACAAGTT+AGG 0.428624 5:-93305827 None:intergenic
ATTCAGTGCAGTTGGTTAGC+AGG 0.437762 5:-93304549 None:intergenic
CATATCAAGCCAATTAAGAT+AGG 0.438313 5:-93304641 None:intergenic
ACTATCTCAAGAATTTCTAT+AGG 0.440519 5:-93306529 None:intergenic
CTAAATGAAAACAAGTTGTC+TGG 0.442244 5:+93305096 MsG0580029178.01.T01:CDS
AGATACCTAATTGTTTCGTT+AGG 0.443887 5:-93304979 None:intergenic
GAAACATTTCCTAGGGAAGA+TGG 0.448809 5:-93304091 None:intergenic
GAAATGTTTCATCACTTCAA+TGG 0.449274 5:+93304104 MsG0580029178.01.T01:CDS
CTGTCAAAATCCCTGGCAAA+TGG 0.451782 5:-93306586 None:intergenic
CCGTTTGTGAGGGGTATCCT+TGG 0.458928 5:-93306646 None:intergenic
TATGGTGATGTTCCCGTAGC+AGG 0.461938 5:+93305330 MsG0580029178.01.T01:CDS
GAAGTGATGAAACATTTCCT+AGG 0.462101 5:-93304099 None:intergenic
TGTTCAAGCGTTGATTATAA+GGG 0.462581 5:+93305837 MsG0580029178.01.T01:CDS
CCACACCAATTACACTGATA+AGG 0.463564 5:-93305488 None:intergenic
AGTTTGAATTTATTGTATCT+AGG 0.464060 5:+93304187 MsG0580029178.01.T01:CDS
AATCTTGTAGATTTCTTGGA+AGG 0.464534 5:+93304334 MsG0580029178.01.T01:CDS
AAACCCCTGGCAAATTTGCC+AGG 0.464758 5:+93306616 MsG0580029178.01.T01:CDS
GGTAATATTCCTAATAGTAT+TGG 0.466452 5:+93304826 MsG0580029178.01.T01:CDS
TATTGAAGACGGAAAATTCC+CGG 0.474347 5:-93304371 None:intergenic
CTTCATGAAAATAGATTTGG+TGG 0.478184 5:+93304586 MsG0580029178.01.T01:CDS
CTAGGTGGAAATAATTTGTC+AGG 0.478396 5:+93304205 MsG0580029178.01.T01:CDS
CTCTGTCAATTCAGTGCAGT+TGG 0.479090 5:-93304557 None:intergenic
GTACAATATCTAAGGGTGAA+TGG 0.479707 5:-93304907 None:intergenic
GGTTTAACATACTTAGACAT+AGG 0.481223 5:+93304715 MsG0580029178.01.T01:CDS
AATTTGATGATTATTTATAG+AGG 0.481546 5:+93305600 MsG0580029178.01.T01:CDS
ATTGCTAAAGTCACCTGCTA+CGG 0.485807 5:-93305343 None:intergenic
CATAGAGATTGTTAAAAGAC+AGG 0.487684 5:-93305311 None:intergenic
TTGTCCGATTCCTTTAGGTA+TGG 0.499787 5:-93304686 None:intergenic
GCATATTTGATAGGTTGTAA+AGG 0.500629 5:-93304243 None:intergenic
CTGCACGATAACGAAGGGTC+TGG 0.502039 5:+93305918 MsG0580029178.01.T01:CDS
CTCCGTGGCAATAATCTAGT+TGG 0.502535 5:+93304061 MsG0580029178.01.T01:CDS
GGCTACATGAAGCAACCAAT+GGG 0.503618 5:+93305622 MsG0580029178.01.T01:CDS
GATAGGTTGTAAAGGGAATG+AGG 0.504995 5:-93304235 None:intergenic
ATAATCTCAGCCTCAGACAA+AGG 0.508743 5:+93305946 MsG0580029178.01.T01:CDS
CCTTATCAGTGTAATTGGTG+TGG 0.509782 5:+93305488 MsG0580029178.01.T01:CDS
ATTCAATACCTTTACAACAA+TGG 0.511457 5:-93305721 None:intergenic
GAAGGAGCCAACCAAATGAC+CGG 0.519223 5:+93304352 MsG0580029178.01.T01:CDS
TTCTTAAAATCCGTTTGTGA+GGG 0.520958 5:-93306656 None:intergenic
TATGTCCCTGTCAAAATCCC+TGG 0.521348 5:-93306593 None:intergenic
TAATCTAGTAAAATTGCACT+TGG 0.531439 5:+93304786 MsG0580029178.01.T01:CDS
GCCTAAGGGGAGTCTAGAAA+AGG 0.533707 5:+93305893 MsG0580029178.01.T01:CDS
TTTCTTAAAATCCGTTTGTG+AGG 0.537423 5:-93306657 None:intergenic
AAAATTCCCGGTCATTTGGT+TGG 0.538123 5:-93304359 None:intergenic
AAAGCAGAATGTGAAGCTCT+AGG 0.538380 5:+93305774 MsG0580029178.01.T01:CDS
TTCAAGTTACCAAACCCTAA+AGG 0.539118 5:-93305054 None:intergenic
GGAGCCATACCTAAAGGAAT+CGG 0.539274 5:+93304682 MsG0580029178.01.T01:CDS
TTGCTAAAGTCACCTGCTAC+GGG 0.541891 5:-93305342 None:intergenic
TAATCTCAGCCTCAGACAAA+GGG 0.542048 5:+93305947 MsG0580029178.01.T01:CDS
ATCTTAATTGGCTTGATATG+GGG 0.544010 5:+93304644 MsG0580029178.01.T01:CDS
AGGTGTTCCAGTATCTCCAC+AGG 0.545284 5:+93306393 MsG0580029178.01.T01:CDS
ATATATGGAGCCATACCTAA+AGG 0.545794 5:+93304676 MsG0580029178.01.T01:CDS
TCATGAAAATAGATTTGGTG+GGG 0.546621 5:+93304588 MsG0580029178.01.T01:CDS
ATTTGATGATTATTTATAGA+GGG 0.548114 5:+93305601 MsG0580029178.01.T01:CDS
GAAAAGTTTCCTAGAAAATG+TGG 0.548403 5:-93304616 None:intergenic
GTATTGAATCTTAAAACACT+TGG 0.548616 5:+93305735 MsG0580029178.01.T01:CDS
AAACATTTCCTAGGGAAGAT+GGG 0.549755 5:-93304090 None:intergenic
AATTTGGAATTGTTTCCTCA+AGG 0.550109 5:-93304747 None:intergenic
CCAAGGATACCCCTCACAAA+CGG 0.558966 5:+93306646 MsG0580029178.01.T01:CDS
CTTCTGTTAGAGATGCTCAC+TGG 0.559627 5:+93306439 MsG0580029178.01.T01:CDS
AAGTGATGAAACATTTCCTA+GGG 0.559954 5:-93304098 None:intergenic
CATGGAGGAAGTTTCAATTG+AGG 0.561181 5:-93305414 None:intergenic
ATCACTTACACAAAATCACT+TGG 0.561679 5:+93304129 MsG0580029178.01.T01:CDS
TTCCCTGGCAAATTTGCCAG+GGG 0.561739 5:-93306619 None:intergenic
ATTAGATGAAGAAAACCCAT+TGG 0.562570 5:-93305637 None:intergenic
TTTCCCTGGCAAATTTGCCA+GGG 0.563580 5:-93306620 None:intergenic
TTCATGAAAATAGATTTGGT+GGG 0.570604 5:+93304587 MsG0580029178.01.T01:CDS
AGTTACCAAACCCTAAAGGA+AGG 0.573594 5:-93305050 None:intergenic
GGTACTATCCCATCTTCCCT+AGG 0.576193 5:+93304082 MsG0580029178.01.T01:CDS
ATTTGATTAGAATATGGAGA+AGG 0.577273 5:+93306373 MsG0580029178.01.T01:intron
TTGAATTTATTGTATCTAGG+TGG 0.579004 5:+93304190 MsG0580029178.01.T01:CDS
GGGCTACATGAAGCAACCAA+TGG 0.579356 5:+93305621 MsG0580029178.01.T01:CDS
TGACAGGGACATAAAACCCC+TGG 0.579444 5:+93306603 MsG0580029178.01.T01:CDS
CAATGTCAACCCTTTGTCTG+AGG 0.579609 5:-93305956 None:intergenic
TTAGTGGGTACCTTAGAACA+TGG 0.583358 5:-93305432 None:intergenic
GTTACCAAACCCTAAAGGAA+GGG 0.585763 5:-93305049 None:intergenic
TTACCAAACCCTAAAGGAAG+GGG 0.590013 5:-93305048 None:intergenic
CAAGTTGGTACAATATCTAA+GGG 0.592664 5:-93304914 None:intergenic
AATACGAAATGACTGCAAGT+TGG 0.596033 5:-93304929 None:intergenic
CTTACACAAAATCACTTGGA+AGG 0.602596 5:+93304133 MsG0580029178.01.T01:CDS
TCAACCTCACAGAATTGCGA+TGG 0.603756 5:+93304395 MsG0580029178.01.T01:CDS
GTGAGGTTGAATATTGAAGA+CGG 0.605399 5:-93304382 None:intergenic
TCCCAAAACATGCTATCTGT+CGG 0.605500 5:-93306469 None:intergenic
AGAACGAAGGTATACCTCCA+TGG 0.609350 5:-93305185 None:intergenic
CATAGGAAACAATTTCCTTG+AGG 0.611741 5:+93304732 MsG0580029178.01.T01:CDS
TCATCTTACAGAATTTGTGA+AGG 0.614422 5:-93306501 None:intergenic
TACCAACTAGATTATTGCCA+CGG 0.617807 5:-93304063 None:intergenic
AACCCCTGGCAAATTTGCCA+GGG 0.621734 5:+93306617 MsG0580029178.01.T01:CDS
TCTTAAAATCCGTTTGTGAG+GGG 0.621885 5:-93306655 None:intergenic
ATTTATGATAACAAGTTGAG+TGG 0.627707 5:+93304949 MsG0580029178.01.T01:CDS
ATTGAGGTATTCCTCCACAA+AGG 0.631908 5:-93305398 None:intergenic
AAGGAGCCAACCAAATGACC+GGG 0.633199 5:+93304353 MsG0580029178.01.T01:CDS
AATCTAGTAAAATTGCACTT+GGG 0.635030 5:+93304787 MsG0580029178.01.T01:CDS
ATTTGCCAGGGAAAATGCCA+AGG 0.641347 5:+93306629 MsG0580029178.01.T01:CDS
AAGGTTCTGCACGATAACGA+AGG 0.644438 5:+93305912 MsG0580029178.01.T01:CDS
AGGTTCTGCACGATAACGAA+GGG 0.648440 5:+93305913 MsG0580029178.01.T01:CDS
GCACTTGATTATCTTCACAA+TGG 0.649418 5:+93305996 MsG0580029178.01.T01:CDS
CTTAAAGAACCCAAGAACGA+AGG 0.654064 5:-93305198 None:intergenic
CTTATTGAATTGAAACTCCG+TGG 0.656228 5:+93304046 MsG0580029178.01.T01:CDS
GGTGAAATCCCAAATGACCT+CGG 0.672308 5:+93305117 MsG0580029178.01.T01:CDS
TACCAAACCCTAAAGGAAGG+GGG 0.679419 5:-93305047 None:intergenic
GTGGGTACCTTAGAACATGG+AGG 0.720386 5:-93305429 None:intergenic
CAAACCATCGCAATTCTGTG+AGG 0.721314 5:-93304399 None:intergenic
GGTGTTCCAGTATCTCCACA+GGG 0.730827 5:+93306394 MsG0580029178.01.T01:CDS
AAGCTGTAAACATCTCCCTG+TGG 0.743560 5:-93306409 None:intergenic
TTAATGTAAAACAAGCACCG+AGG 0.776440 5:-93305134 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATTCTTTAGCAAAATAATTA+AGG - Chr5:93306346-93306365 None:intergenic 15.0%
!! TTCTTTAGCAAAATAATTAA+GGG - Chr5:93306345-93306364 None:intergenic 15.0%
!! TTGTATAGAAATAAATTTCA+AGG + Chr5:93304877-93304896 MsG0580029178.01.T01:CDS 15.0%
!!! AAATTGCCAAAAATAATTTT+GGG + Chr5:93304494-93304513 MsG0580029178.01.T01:CDS 15.0%
!!! AATTTGATGATTATTTATAG+AGG + Chr5:93305600-93305619 MsG0580029178.01.T01:CDS 15.0%
!!! ACTAAAATTTTGTTAAAGAT+AGG - Chr5:93306253-93306272 None:intergenic 15.0%
!!! ATTTGATGATTATTTATAGA+GGG + Chr5:93305601-93305620 MsG0580029178.01.T01:CDS 15.0%
!!! TAGGAGATAATTTTTTTAAT+GGG + Chr5:93304425-93304444 MsG0580029178.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTAGGAGATAATTTTTTTAA+TGG + Chr5:93304424-93304443 MsG0580029178.01.T01:CDS 15.0%
!! AAAACAAGATTCATATTTGA+TGG - Chr5:93304310-93304329 None:intergenic 20.0%
!! AGTTTGAATTTATTGTATCT+AGG + Chr5:93304187-93304206 MsG0580029178.01.T01:CDS 20.0%
!!! CAAATTGCCAAAAATAATTT+TGG + Chr5:93304493-93304512 MsG0580029178.01.T01:CDS 20.0%
!!! GTTGTTATTTGATTAGAATA+TGG + Chr5:93306367-93306386 MsG0580029178.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTAACTTTCCAATTGAATT+TGG - Chr5:93304766-93304785 None:intergenic 20.0%
! AATCTAGTAAAATTGCACTT+GGG + Chr5:93304787-93304806 MsG0580029178.01.T01:CDS 25.0%
! AATTAATTCTTCCACAATCA+AGG + Chr5:93306154-93306173 MsG0580029178.01.T01:intron 25.0%
! ACTATCTCAAGAATTTCTAT+AGG - Chr5:93306532-93306551 None:intergenic 25.0%
! ATTAATTCTTCCACAATCAA+GGG + Chr5:93306155-93306174 MsG0580029178.01.T01:intron 25.0%
! ATTCAATACCTTTACAACAA+TGG - Chr5:93305724-93305743 None:intergenic 25.0%
! ATTTACCTAACGAAACAATT+AGG + Chr5:93304974-93304993 MsG0580029178.01.T01:CDS 25.0%
! ATTTGATTAGAATATGGAGA+AGG + Chr5:93306373-93306392 MsG0580029178.01.T01:intron 25.0%
! CAAAAGATTGCATATTTGAT+AGG - Chr5:93304255-93304274 None:intergenic 25.0%
! CATATTTGATAGGTTGTAAA+GGG - Chr5:93304245-93304264 None:intergenic 25.0%
! CTTCTTCATGAAAATAGATT+TGG + Chr5:93304583-93304602 MsG0580029178.01.T01:CDS 25.0%
! GAAACAATTCCAAATTCAAT+TGG + Chr5:93304754-93304773 MsG0580029178.01.T01:CDS 25.0%
! GGTAATATTCCTAATAGTAT+TGG + Chr5:93304826-93304845 MsG0580029178.01.T01:CDS 25.0%
! GTATTGAATCTTAAAACACT+TGG + Chr5:93305735-93305754 MsG0580029178.01.T01:CDS 25.0%
! TAATCTAGTAAAATTGCACT+TGG + Chr5:93304786-93304805 MsG0580029178.01.T01:CDS 25.0%
! TATAGAAATTCTTGAGATAG+TGG + Chr5:93306531-93306550 MsG0580029178.01.T01:CDS 25.0%
! TTAGCAAAATAATTAAGGGT+TGG - Chr5:93306341-93306360 None:intergenic 25.0%
! TTAGGATCTTTACAAGATTT+CGG - Chr5:93305812-93305831 None:intergenic 25.0%
! TTCAATACCTTTACAACAAT+GGG - Chr5:93305723-93305742 None:intergenic 25.0%
! TTGAATTTATTGTATCTAGG+TGG + Chr5:93304190-93304209 MsG0580029178.01.T01:CDS 25.0%
! TTGGGAGAAAACAAATTATA+TGG + Chr5:93304805-93304824 MsG0580029178.01.T01:CDS 25.0%
!! AATATGCAATCTTTTGATCT+TGG + Chr5:93304259-93304278 MsG0580029178.01.T01:CDS 25.0%
!! ACTTTTCAACCTATCTTAAT+TGG + Chr5:93304632-93304651 MsG0580029178.01.T01:CDS 25.0%
!! ATATGCAATCTTTTGATCTT+GGG + Chr5:93304260-93304279 MsG0580029178.01.T01:CDS 25.0%
!! ATTTATGATAACAAGTTGAG+TGG + Chr5:93304949-93304968 MsG0580029178.01.T01:CDS 25.0%
!! CAAATCTATTTTCATGAAGA+AGG - Chr5:93304585-93304604 None:intergenic 25.0%
!! TTCATGAAAATAGATTTGGT+GGG + Chr5:93304587-93304606 MsG0580029178.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTTCTTCATCTAATTTGGT+TGG + Chr5:93305645-93305664 MsG0580029178.01.T01:CDS 25.0%
!!! TATCTTAATTGGCTTGATAT+GGG + Chr5:93304643-93304662 MsG0580029178.01.T01:CDS 25.0%
AAGTGATGAAACATTTCCTA+GGG - Chr5:93304101-93304120 None:intergenic 30.0%
AATCTTGTAGATTTCTTGGA+AGG + Chr5:93304334-93304353 MsG0580029178.01.T01:CDS 30.0%
AGATACCTAATTGTTTCGTT+AGG - Chr5:93304982-93305001 None:intergenic 30.0%
ATCACTTACACAAAATCACT+TGG + Chr5:93304129-93304148 MsG0580029178.01.T01:CDS 30.0%
ATCTTTACTTGAATGCTATC+TGG - Chr5:93306132-93306151 None:intergenic 30.0%
ATGGGGATGAATCAAATATA+TGG + Chr5:93304661-93304680 MsG0580029178.01.T01:CDS 30.0%
ATTAGATGAAGAAAACCCAT+TGG - Chr5:93305640-93305659 None:intergenic 30.0%
CATAGAGATTGTTAAAAGAC+AGG - Chr5:93305314-93305333 None:intergenic 30.0%
CATATCAAGCCAATTAAGAT+AGG - Chr5:93304644-93304663 None:intergenic 30.0%
CTAAATGAAAACAAGTTGTC+TGG + Chr5:93305096-93305115 MsG0580029178.01.T01:CDS 30.0%
CTTAATATCACAGTGAACTA+TGG - Chr5:93306033-93306052 None:intergenic 30.0%
CTTATCCTTATCAGTGTAAT+TGG + Chr5:93305483-93305502 MsG0580029178.01.T01:CDS 30.0%
CTTCATGAAAATAGATTTGG+TGG + Chr5:93304586-93304605 MsG0580029178.01.T01:CDS 30.0%
CTTGGGGTAAACAATTTATT+CGG + Chr5:93304277-93304296 MsG0580029178.01.T01:CDS 30.0%
GAAAAGTTTCCTAGAAAATG+TGG - Chr5:93304619-93304638 None:intergenic 30.0%
GAAATGTTTCATCACTTCAA+TGG + Chr5:93304104-93304123 MsG0580029178.01.T01:CDS 30.0%
GCATATTTGATAGGTTGTAA+AGG - Chr5:93304246-93304265 None:intergenic 30.0%
GGTTTAACATACTTAGACAT+AGG + Chr5:93304715-93304734 MsG0580029178.01.T01:CDS 30.0%
GTAAGATTGCCAATACTATT+AGG - Chr5:93304838-93304857 None:intergenic 30.0%
TCATCTTACAGAATTTGTGA+AGG - Chr5:93306504-93306523 None:intergenic 30.0%
TCCAAGAAATCTACAAGATT+GGG - Chr5:93304334-93304353 None:intergenic 30.0%
TGAAAAACCCATTGTTGTAA+AGG + Chr5:93305713-93305732 MsG0580029178.01.T01:CDS 30.0%
TTCCAAGAAATCTACAAGAT+TGG - Chr5:93304335-93304354 None:intergenic 30.0%
TTGTCTAAAAATTCACTGAC+CGG + Chr5:93305024-93305043 MsG0580029178.01.T01:CDS 30.0%
TTTAATCTACCCAAAGTAAG+AGG - Chr5:93304457-93304476 None:intergenic 30.0%
! AAATTCCCTTTTTGCAAAGA+TGG - Chr5:93305585-93305604 None:intergenic 30.0%
! AATTTGGAATTGTTTCCTCA+AGG - Chr5:93304750-93304769 None:intergenic 30.0%
! CTGTCTTTTAACAATCTCTA+TGG + Chr5:93305312-93305331 MsG0580029178.01.T01:CDS 30.0%
! GATCTTTTGTGTTTCTTAGT+GGG - Chr5:93305450-93305469 None:intergenic 30.0%
! TATGCAATCTTTTGATCTTG+GGG + Chr5:93304261-93304280 MsG0580029178.01.T01:CDS 30.0%
! TCCACTCCCAAAATTATTTT+TGG - Chr5:93304503-93304522 None:intergenic 30.0%
! TGATCTTTTGTGTTTCTTAG+TGG - Chr5:93305451-93305470 None:intergenic 30.0%
! TGGGTTTTCTTCATCTAATT+TGG + Chr5:93305641-93305660 MsG0580029178.01.T01:CDS 30.0%
!! ATCTTAATTGGCTTGATATG+GGG + Chr5:93304644-93304663 MsG0580029178.01.T01:CDS 30.0%
!! CAAGTTGGTACAATATCTAA+GGG - Chr5:93304917-93304936 None:intergenic 30.0%
!! CTATCTTAATTGGCTTGATA+TGG + Chr5:93304642-93304661 MsG0580029178.01.T01:CDS 30.0%
!! GTGAATTTTTAGACAAGTCA+AGG - Chr5:93305020-93305039 None:intergenic 30.0%
!! TCATGAAAATAGATTTGGTG+GGG + Chr5:93304588-93304607 MsG0580029178.01.T01:CDS 30.0%
!! TGTTCAAGCGTTGATTATAA+GGG + Chr5:93305837-93305856 MsG0580029178.01.T01:CDS 30.0%
!! TTGAAGAACAACTTTTTCCA+TGG + Chr5:93305168-93305187 MsG0580029178.01.T01:CDS 30.0%
!! TTGTTCAAGCGTTGATTATA+AGG + Chr5:93305836-93305855 MsG0580029178.01.T01:CDS 30.0%
!!! AGTTTTGGTTCTGTTTACAA+AGG + Chr5:93305675-93305694 MsG0580029178.01.T01:CDS 30.0%
!!! GTGAGATTTTCTAGTTCAAA+GGG - Chr5:93305273-93305292 None:intergenic 30.0%
!!! TGTGAGATTTTCTAGTTCAA+AGG - Chr5:93305274-93305293 None:intergenic 30.0%
AAACATTTCCTAGGGAAGAT+GGG - Chr5:93304093-93304112 None:intergenic 35.0%
AAAGGAATCGGACAACTTAT+CGG + Chr5:93304694-93304713 MsG0580029178.01.T01:CDS 35.0%
AAGAAAAATGTCCATTTGCC+AGG + Chr5:93306575-93306594 MsG0580029178.01.T01:CDS 35.0%
AATACGAAATGACTGCAAGT+TGG - Chr5:93304932-93304951 None:intergenic 35.0%
AGAAAAATGTCCATTTGCCA+GGG + Chr5:93306576-93306595 MsG0580029178.01.T01:CDS 35.0%
AGGTGACTTTAGCAATGTTT+CGG + Chr5:93305350-93305369 MsG0580029178.01.T01:CDS 35.0%
ATAAGTTGTCCGATTCCTTT+AGG - Chr5:93304694-93304713 None:intergenic 35.0%
ATAGAAAGAACTTTACCAGG+AGG - Chr5:93306197-93306216 None:intergenic 35.0%
ATATATGGAGCCATACCTAA+AGG + Chr5:93304676-93304695 MsG0580029178.01.T01:CDS 35.0%
CATAGGAAACAATTTCCTTG+AGG + Chr5:93304732-93304751 MsG0580029178.01.T01:CDS 35.0%
CTTACACAAAATCACTTGGA+AGG + Chr5:93304133-93304152 MsG0580029178.01.T01:CDS 35.0%
CTTATTGAATTGAAACTCCG+TGG + Chr5:93304046-93304065 MsG0580029178.01.T01:CDS 35.0%
CTTCACCATCTTTGCAAAAA+GGG + Chr5:93305577-93305596 MsG0580029178.01.T01:CDS 35.0%
GAAGTGATGAAACATTTCCT+AGG - Chr5:93304102-93304121 None:intergenic 35.0%
GCACTTGATTATCTTCACAA+TGG + Chr5:93305996-93306015 MsG0580029178.01.T01:CDS 35.0%
GTACAATATCTAAGGGTGAA+TGG - Chr5:93304910-93304929 None:intergenic 35.0%
GTCAACTTACCCAAAGAATA+AGG - Chr5:93304166-93304185 None:intergenic 35.0%
GTGAGGTTGAATATTGAAGA+CGG - Chr5:93304385-93304404 None:intergenic 35.0%
GTGATAGAAAGAACTTTACC+AGG - Chr5:93306200-93306219 None:intergenic 35.0%
GTTTCGGCAATTTCATTAAC+CGG + Chr5:93305366-93305385 MsG0580029178.01.T01:CDS 35.0%
TACCAACTAGATTATTGCCA+CGG - Chr5:93304066-93304085 None:intergenic 35.0%
TATTGAAGACGGAAAATTCC+CGG - Chr5:93304374-93304393 None:intergenic 35.0%
TCATCTAATTTGGTTGGAAC+AGG + Chr5:93305651-93305670 MsG0580029178.01.T01:CDS 35.0%
TCCCAATCTTGTAGATTTCT+TGG + Chr5:93304330-93304349 MsG0580029178.01.T01:CDS 35.0%
TCTTCACCATCTTTGCAAAA+AGG + Chr5:93305576-93305595 MsG0580029178.01.T01:CDS 35.0%
! AGGAAGCATACCTTATTCTT+TGG + Chr5:93304153-93304172 MsG0580029178.01.T01:CDS 35.0%
! CTAGGTGGAAATAATTTGTC+AGG + Chr5:93304205-93304224 MsG0580029178.01.T01:CDS 35.0%
! GAATTGCGATGGTTTGATTT+AGG + Chr5:93304406-93304425 MsG0580029178.01.T01:CDS 35.0%
! GGAAGCATACCTTATTCTTT+GGG + Chr5:93304154-93304173 MsG0580029178.01.T01:CDS 35.0%
! TTAATGTAAAACAAGCACCG+AGG - Chr5:93305137-93305156 None:intergenic 35.0%
! TTCAAGTTACCAAACCCTAA+AGG - Chr5:93305057-93305076 None:intergenic 35.0%
! TTTTGCAAAGATGGTGAAGA+TGG - Chr5:93305576-93305595 None:intergenic 35.0%
!! AAGAACAACTTTTTCCATGG+AGG + Chr5:93305171-93305190 MsG0580029178.01.T01:CDS 35.0%
!! GCAAGTTGGTACAATATCTA+AGG - Chr5:93304918-93304937 None:intergenic 35.0%
!! GCCAAAAATAATTTTGGGAG+TGG + Chr5:93304499-93304518 MsG0580029178.01.T01:CDS 35.0%
!! TCCACAAAGGTTTTTGTTTC+CGG - Chr5:93305388-93305407 None:intergenic 35.0%
!!! GTTTTTGAGTTCATGCCTAA+GGG + Chr5:93305879-93305898 MsG0580029178.01.T01:CDS 35.0%
!!! TGTTTTTGAGTTCATGCCTA+AGG + Chr5:93305878-93305897 MsG0580029178.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTTTTGAGTTCATGCCTAAG+GGG + Chr5:93305880-93305899 MsG0580029178.01.T01:CDS 35.0%
AAAATTCCCGGTCATTTGGT+TGG - Chr5:93304362-93304381 None:intergenic 40.0%
AAAGCAGAATGTGAAGCTCT+AGG + Chr5:93305774-93305793 MsG0580029178.01.T01:CDS 40.0%
ACCGGAAACAAAAACCTTTG+TGG + Chr5:93305384-93305403 MsG0580029178.01.T01:CDS 40.0%
ACTATAGCATATGTTCCTCC+TGG + Chr5:93306179-93306198 MsG0580029178.01.T01:intron 40.0%
AGGGAGATGTTTACAGCTTT+GGG + Chr5:93306413-93306432 MsG0580029178.01.T01:CDS 40.0%
AGTTACCAAACCCTAAAGGA+AGG - Chr5:93305053-93305072 None:intergenic 40.0%
ATAATCTCAGCCTCAGACAA+AGG + Chr5:93305946-93305965 MsG0580029178.01.T01:CDS 40.0%
ATTGCTAAAGTCACCTGCTA+CGG - Chr5:93305346-93305365 None:intergenic 40.0%
CAACGCTTGAACAACAAGTT+AGG - Chr5:93305830-93305849 None:intergenic 40.0%
CATGGAGGAAGTTTCAATTG+AGG - Chr5:93305417-93305436 None:intergenic 40.0%
CCACACCAATTACACTGATA+AGG - Chr5:93305491-93305510 None:intergenic 40.0%
CCTTATCAGTGTAATTGGTG+TGG + Chr5:93305488-93305507 MsG0580029178.01.T01:CDS 40.0%
CTTAAAGAACCCAAGAACGA+AGG - Chr5:93305201-93305220 None:intergenic 40.0%
GAAACATTTCCTAGGGAAGA+TGG - Chr5:93304094-93304113 None:intergenic 40.0%
GAAACTTCCTCCATGTTCTA+AGG + Chr5:93305422-93305441 MsG0580029178.01.T01:CDS 40.0%
GATAGGTTGTAAAGGGAATG+AGG - Chr5:93304238-93304257 None:intergenic 40.0%
GGAAACAAAAACCTTTGTGG+AGG + Chr5:93305387-93305406 MsG0580029178.01.T01:CDS 40.0%
GGGTCAATACCTCTTACTTT+GGG + Chr5:93304445-93304464 MsG0580029178.01.T01:CDS 40.0%
GTTACCAAACCCTAAAGGAA+GGG - Chr5:93305052-93305071 None:intergenic 40.0%
TAATCTCAGCCTCAGACAAA+GGG + Chr5:93305947-93305966 MsG0580029178.01.T01:CDS 40.0%
TCCCAAAACATGCTATCTGT+CGG - Chr5:93306472-93306491 None:intergenic 40.0%
TGCTATAGTTCCCTTGATTG+TGG - Chr5:93306168-93306187 None:intergenic 40.0%
TGGGTCAATACCTCTTACTT+TGG + Chr5:93304444-93304463 MsG0580029178.01.T01:CDS 40.0%
TTACCAAACCCTAAAGGAAG+GGG - Chr5:93305051-93305070 None:intergenic 40.0%
TTGTCCGATTCCTTTAGGTA+TGG - Chr5:93304689-93304708 None:intergenic 40.0%
! ACCGACAGATAGCATGTTTT+GGG + Chr5:93306468-93306487 MsG0580029178.01.T01:CDS 40.0%
! ATTGAGGTATTCCTCCACAA+AGG - Chr5:93305401-93305420 None:intergenic 40.0%
! TGGTGAAGATGGTAGCATTT+TGG - Chr5:93305565-93305584 None:intergenic 40.0%
! TTAGTGGGTACCTTAGAACA+TGG - Chr5:93305435-93305454 None:intergenic 40.0%
! TTGGTTGGAACAGGAAGTTT+TGG + Chr5:93305660-93305679 MsG0580029178.01.T01:CDS 40.0%
!! ATTTGCCAGGGATTTTGACA+GGG + Chr5:93306588-93306607 MsG0580029178.01.T01:CDS 40.0%
!! GGTAGCATTTTGGTCTTTCT+TGG - Chr5:93305555-93305574 None:intergenic 40.0%
AAGCTGTAAACATCTCCCTG+TGG - Chr5:93306412-93306431 None:intergenic 45.0%
AAGGTTCTGCACGATAACGA+AGG + Chr5:93305912-93305931 MsG0580029178.01.T01:CDS 45.0%
ACGGAAAATTCCCGGTCATT+TGG - Chr5:93304366-93304385 None:intergenic 45.0%
AGGTTCTGCACGATAACGAA+GGG + Chr5:93305913-93305932 MsG0580029178.01.T01:CDS 45.0%
ATTCAGTGCAGTTGGTTAGC+AGG - Chr5:93304552-93304571 None:intergenic 45.0%
ATTTGCCAGGGAAAATGCCA+AGG + Chr5:93306629-93306648 MsG0580029178.01.T01:CDS 45.0%
CAAACCATCGCAATTCTGTG+AGG - Chr5:93304402-93304421 None:intergenic 45.0%
CAATGTCAACCCTTTGTCTG+AGG - Chr5:93305959-93305978 None:intergenic 45.0%
CAGGGAGATGTTTACAGCTT+TGG + Chr5:93306412-93306431 MsG0580029178.01.T01:CDS 45.0%
CTCCGTGGCAATAATCTAGT+TGG + Chr5:93304061-93304080 MsG0580029178.01.T01:CDS 45.0%
CTCTGTCAATTCAGTGCAGT+TGG - Chr5:93304560-93304579 None:intergenic 45.0%
CTGTCAAAATCCCTGGCAAA+TGG - Chr5:93306589-93306608 None:intergenic 45.0%
CTTCTGTTAGAGATGCTCAC+TGG + Chr5:93306439-93306458 MsG0580029178.01.T01:CDS 45.0%
GGAGCCATACCTAAAGGAAT+CGG + Chr5:93304682-93304701 MsG0580029178.01.T01:CDS 45.0%
GGCTACATGAAGCAACCAAT+GGG + Chr5:93305622-93305641 MsG0580029178.01.T01:CDS 45.0%
GGTGAAATCCCAAATGACCT+CGG + Chr5:93305117-93305136 MsG0580029178.01.T01:CDS 45.0%
TAAGCCAAAGTCTCCCAAGT+GGG - Chr5:93306090-93306109 None:intergenic 45.0%
TACCAAACCCTAAAGGAAGG+GGG - Chr5:93305050-93305069 None:intergenic 45.0%
TATGTCCCTGTCAAAATCCC+TGG - Chr5:93306596-93306615 None:intergenic 45.0%
TCAACCTCACAGAATTGCGA+TGG + Chr5:93304395-93304414 MsG0580029178.01.T01:CDS 45.0%
TTGCTAAAGTCACCTGCTAC+GGG - Chr5:93305345-93305364 None:intergenic 45.0%
TTTCCCTGGCAAATTTGCCA+GGG - Chr5:93306623-93306642 None:intergenic 45.0%
! ACCTTTTCTAGACTCCCCTT+AGG - Chr5:93305897-93305916 None:intergenic 45.0%
! AGAACGAAGGTATACCTCCA+TGG - Chr5:93305188-93305207 None:intergenic 45.0%
! GACCGACAGATAGCATGTTT+TGG + Chr5:93306467-93306486 MsG0580029178.01.T01:CDS 45.0%
! GGAGGTATACCTTCGTTCTT+GGG + Chr5:93305189-93305208 MsG0580029178.01.T01:CDS 45.0%
! GGGGAATTGCCACATTTTCT+AGG + Chr5:93304607-93304626 MsG0580029178.01.T01:CDS 45.0%
! TGGAGGTATACCTTCGTTCT+TGG + Chr5:93305188-93305207 MsG0580029178.01.T01:CDS 45.0%
! TTTTCCCTGGCAAATTTGCC+AGG - Chr5:93306624-93306643 None:intergenic 45.0%
!! AAACAAGCACCGAGGTCATT+TGG - Chr5:93305129-93305148 None:intergenic 45.0%
!! AACAAGCACCGAGGTCATTT+GGG - Chr5:93305128-93305147 None:intergenic 45.0%
!! CATTTGCCAGGGATTTTGAC+AGG + Chr5:93306587-93306606 MsG0580029178.01.T01:CDS 45.0%
AAACCCCTGGCAAATTTGCC+AGG + Chr5:93306616-93306635 MsG0580029178.01.T01:CDS 50.0%
AACCCCTGGCAAATTTGCCA+GGG + Chr5:93306617-93306636 MsG0580029178.01.T01:CDS 50.0%
AAGGAGCCAACCAAATGACC+GGG + Chr5:93304353-93304372 MsG0580029178.01.T01:CDS 50.0%
ACATCTCCCTGTGGAGATAC+TGG - Chr5:93306403-93306422 None:intergenic 50.0%
AGGTGTTCCAGTATCTCCAC+AGG + Chr5:93306393-93306412 MsG0580029178.01.T01:CDS 50.0%
CCAAGGATACCCCTCACAAA+CGG + Chr5:93306646-93306665 MsG0580029178.01.T01:CDS 50.0%
CTAAGCCAAAGTCTCCCAAG+TGG - Chr5:93306091-93306110 None:intergenic 50.0%
GAAGGAGCCAACCAAATGAC+CGG + Chr5:93304352-93304371 MsG0580029178.01.T01:CDS 50.0%
GATGACACTGTAGCCCACTT+GGG + Chr5:93306074-93306093 MsG0580029178.01.T01:intron 50.0%
GCCTAAGGGGAGTCTAGAAA+AGG + Chr5:93305893-93305912 MsG0580029178.01.T01:CDS 50.0%
GGGCTACATGAAGCAACCAA+TGG + Chr5:93305621-93305640 MsG0580029178.01.T01:CDS 50.0%
GGTACTATCCCATCTTCCCT+AGG + Chr5:93304082-93304101 MsG0580029178.01.T01:CDS 50.0%
GGTGTTCCAGTATCTCCACA+GGG + Chr5:93306394-93306413 MsG0580029178.01.T01:CDS 50.0%
GTGGGTACCTTAGAACATGG+AGG - Chr5:93305432-93305451 None:intergenic 50.0%
TGACAGGGACATAAAACCCC+TGG + Chr5:93306603-93306622 MsG0580029178.01.T01:CDS 50.0%
TTCCCTGGCAAATTTGCCAG+GGG - Chr5:93306622-93306641 None:intergenic 50.0%
! GGTATCCTTGGCATTTTCCC+TGG - Chr5:93306637-93306656 None:intergenic 50.0%
! TATGGTGATGTTCCCGTAGC+AGG + Chr5:93305330-93305349 MsG0580029178.01.T01:CDS 50.0%
! TGGGAGACTTTGGCTTAGCT+AGG + Chr5:93306093-93306112 MsG0580029178.01.T01:intron 50.0%
AAACCCTAAAGGAAGGGGGC+CGG - Chr5:93305046-93305065 None:intergenic 55.0%
CGATGACACTGTAGCCCACT+TGG + Chr5:93306073-93306092 MsG0580029178.01.T01:intron 55.0%
CTGCACGATAACGAAGGGTC+TGG + Chr5:93305918-93305937 MsG0580029178.01.T01:CDS 55.0%
GTAGCCCACTTGGGAGACTT+TGG + Chr5:93306083-93306102 MsG0580029178.01.T01:intron 55.0%
!! CCGTTTGTGAGGGGTATCCT+TGG - Chr5:93306649-93306668 None:intergenic 55.0%
TGACCGGCCCCCTTCCTTTA+GGG + Chr5:93305040-93305059 MsG0580029178.01.T01:CDS 60.0%
!! GGCCCCCTTCCTTTAGGGTT+TGG + Chr5:93305045-93305064 MsG0580029178.01.T01:CDS 60.0%
CTGACCGGCCCCCTTCCTTT+AGG + Chr5:93305039-93305058 MsG0580029178.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr5 gene 93304037 93306675 93304037 ID=MsG0580029178.01;Name=MsG0580029178.01
Chr5 mRNA 93304037 93306675 93304037 ID=MsG0580029178.01.T01;Parent=MsG0580029178.01;Name=MsG0580029178.01.T01;_AED=0.28;_eAED=0.28;_QI=0|0|0|1|1|1|2|0|757
Chr5 exon 93304037 93306017 93304037 ID=MsG0580029178.01.T01:exon:49642;Parent=MsG0580029178.01.T01
Chr5 exon 93306383 93306675 93306383 ID=MsG0580029178.01.T01:exon:49643;Parent=MsG0580029178.01.T01
Chr5 CDS 93304037 93306017 93304037 ID=MsG0580029178.01.T01:cds;Parent=MsG0580029178.01.T01
Chr5 CDS 93306383 93306675 93306383 ID=MsG0580029178.01.T01:cds;Parent=MsG0580029178.01.T01
Gene Sequence

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Protein sequence

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