AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0580029428.01

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MsG0580029428.01.T01 AT1G07650 35.389 373 180 12 209 569 624 947 1.54e-55 203
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MsG0580029428.01.T01 AT1G53440 37.353 340 173 12 275 598 655 970 4.57e-53 196
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MsG0580029428.01.T01 AT3G19300 39.016 305 149 9 274 569 315 591 5.73e-53 192
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MsG0580029428.01.T01 AT5G03320 35.000 360 193 9 241 582 38 374 9.66e-53 186
MsG0580029428.01.T01 AT1G26150 40.397 302 148 9 210 482 332 630 9.91e-53 191
MsG0580029428.01.T01 AT1G66150 39.062 320 149 10 275 575 576 868 1.10e-52 194
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MsG0580029428.01.T01 AT3G13690 36.228 334 179 11 275 596 399 710 6.08e-51 188
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MsG0580029428.01.T01 AT3G26700 33.516 364 202 10 218 575 22 351 3.07e-50 178
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MsG0580029428.01.T01 AT3G21340 36.102 313 164 10 269 572 576 861 3.91e-50 187
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MsG0580029428.01.T01 AT1G77280 35.922 309 167 9 275 574 392 678 6.03e-50 185
MsG0580029428.01.T01 AT4G23310 35.514 321 176 8 259 572 444 740 6.73e-50 185
MsG0580029428.01.T01 AT1G51790 34.539 304 169 7 274 572 618 896 6.80e-50 186
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MsG0580029428.01.T01 AT5G03140 37.821 312 165 12 271 573 357 648 1.33e-45 172
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MsG0580029428.01.T01 AT4G02410 35.548 301 164 9 277 569 345 623 1.48e-45 171
MsG0580029428.01.T01 AT5G35370 33.784 370 207 13 217 569 452 800 1.51e-45 173
MsG0580029428.01.T01 AT5G65240 34.242 330 187 10 252 572 250 558 1.54e-45 171
MsG0580029428.01.T01 AT1G61420 34.426 305 172 9 275 572 484 767 1.64e-45 172
MsG0580029428.01.T01 AT1G61420 34.426 305 172 9 275 572 484 767 1.64e-45 172
MsG0580029428.01.T01 AT5G59700 36.334 311 164 10 283 582 478 765 1.76e-45 172
MsG0580029428.01.T01 AT4G03230 36.156 307 168 7 273 572 676 961 1.80e-45 173
MsG0580029428.01.T01 AT4G03230 36.156 307 168 7 273 572 676 961 1.80e-45 173
MsG0580029428.01.T01 AT4G03230 36.156 307 168 7 273 572 518 803 1.84e-45 173
MsG0580029428.01.T01 AT3G45410 34.911 338 188 11 268 595 320 635 2.15e-45 171
MsG0580029428.01.T01 AT1G66880 37.864 309 149 13 275 569 336 615 2.32e-45 171
MsG0580029428.01.T01 AT5G38210 33.416 404 200 19 198 569 261 627 2.41e-45 171
MsG0580029428.01.T01 AT1G07570 34.579 321 171 8 275 577 56 355 2.57e-45 166
MsG0580029428.01.T01 AT1G07570 34.579 321 171 8 275 577 56 355 2.57e-45 166
MsG0580029428.01.T01 AT1G07570 34.579 321 171 8 275 577 56 355 2.57e-45 166
MsG0580029428.01.T01 AT2G23450 36.977 311 169 10 275 578 336 626 2.90e-45 171
MsG0580029428.01.T01 AT2G23450 36.977 311 169 10 275 578 336 626 2.90e-45 171
MsG0580029428.01.T01 AT5G49760 37.771 323 168 8 275 585 619 920 3.15e-45 172
MsG0580029428.01.T01 AT1G65800 38.567 293 157 10 204 479 436 722 3.17e-45 172
MsG0580029428.01.T01 AT1G11303 31.892 370 209 9 210 572 440 773 3.19e-45 172
MsG0580029428.01.T01 AT4G04540 37.374 297 153 9 283 572 320 590 3.24e-45 170
MsG0580029428.01.T01 AT4G33430 35.390 308 170 8 274 572 276 563 3.32e-45 169
MsG0580029428.01.T01 AT3G59350 40.179 224 120 6 273 482 99 322 3.58e-45 164
MsG0580029428.01.T01 AT1G07560 32.603 365 184 11 216 572 526 836 3.76e-45 172
MsG0580029428.01.T01 AT4G33430 35.144 313 174 8 269 572 318 610 4.03e-45 170
MsG0580029428.01.T01 AT4G11470 34.591 318 175 10 271 579 328 621 4.34e-45 170
MsG0580029428.01.T01 AT4G04540 37.374 297 153 9 283 572 349 619 4.43e-45 170
MsG0580029428.01.T01 AT4G04510 34.844 353 197 11 254 598 305 632 4.56e-45 170
MsG0580029428.01.T01 AT1G07570 34.579 321 171 8 275 577 67 366 4.56e-45 165
MsG0580029428.01.T01 AT4G11470 34.591 318 175 10 271 579 323 616 4.72e-45 170
MsG0580029428.01.T01 AT4G04510 34.844 353 197 11 254 598 307 634 4.89e-45 170
MsG0580029428.01.T01 AT1G74490 36.977 311 164 8 275 575 79 367 5.08e-45 165
MsG0580029428.01.T01 AT1G71830 35.390 308 170 8 274 572 289 576 5.75e-45 169
MsG0580029428.01.T01 AT5G38210 33.416 404 200 19 198 569 255 621 5.87e-45 170
MsG0580029428.01.T01 AT5G38210 33.416 404 200 19 198 569 273 639 6.36e-45 170
MsG0580029428.01.T01 AT4G23190 35.069 288 158 8 210 488 293 560 6.92e-45 168
MsG0580029428.01.T01 AT1G70740 34.727 311 166 9 275 574 50 334 7.41e-45 165
MsG0580029428.01.T01 AT1G61490 33.876 307 171 9 275 572 328 611 7.67e-45 169
MsG0580029428.01.T01 AT2G48010 35.121 373 197 15 216 576 221 560 8.03e-45 169
MsG0580029428.01.T01 AT4G00960 34.839 310 169 10 274 572 43 330 8.33e-45 164
MsG0580029428.01.T01 AT1G61440 34.528 307 169 9 275 572 466 749 8.46e-45 171
MsG0580029428.01.T01 AT1G11300 32.275 378 207 12 202 572 438 773 8.51e-45 171
MsG0580029428.01.T01 AT1G61440 34.528 307 169 9 275 572 471 754 8.78e-45 171
MsG0580029428.01.T01 AT1G05700 32.673 303 176 6 275 572 560 839 9.44e-45 171
MsG0580029428.01.T01 AT3G45430 35.526 304 169 7 274 572 331 612 9.50e-45 169
MsG0580029428.01.T01 AT3G45430 35.526 304 169 7 274 572 331 612 9.50e-45 169
MsG0580029428.01.T01 AT3G45430 35.526 304 169 7 274 572 331 612 9.50e-45 169
MsG0580029428.01.T01 AT1G11300 32.615 371 201 12 209 572 430 758 9.61e-45 170
MsG0580029428.01.T01 AT1G05700 32.673 303 176 6 275 572 591 870 9.63e-45 171
MsG0580029428.01.T01 AT1G66460 34.675 323 175 11 274 580 116 418 1.08e-44 166
MsG0580029428.01.T01 AT4G04490 37.333 300 153 10 283 574 336 608 1.14e-44 169
MsG0580029428.01.T01 AT5G65530 32.209 326 187 7 275 592 132 431 1.15e-44 165
MsG0580029428.01.T01 AT4G23130 37.736 265 144 7 222 479 293 543 1.16e-44 167
MsG0580029428.01.T01 AT2G23200 36.964 303 162 9 277 572 478 758 1.19e-44 170
MsG0580029428.01.T01 AT5G49780 33.787 367 207 11 210 569 564 901 1.21e-44 171
MsG0580029428.01.T01 AT1G66880 37.864 309 149 13 275 569 578 857 1.25e-44 171
MsG0580029428.01.T01 AT5G10520 33.742 326 183 6 275 592 141 441 1.26e-44 165
MsG0580029428.01.T01 AT4G35600 33.735 332 180 10 275 588 74 383 1.38e-44 164
MsG0580029428.01.T01 AT4G21230 35.535 318 165 9 272 577 318 607 1.55e-44 168
MsG0580029428.01.T01 AT4G35600 33.735 332 180 10 275 588 75 384 1.59e-44 164
MsG0580029428.01.T01 AT1G66880 37.864 309 149 13 275 569 957 1236 1.68e-44 171
MsG0580029428.01.T01 AT1G35710 33.538 325 175 9 256 568 820 1115 1.79e-44 171
MsG0580029428.01.T01 AT4G11490 34.713 314 174 10 270 572 300 593 1.80e-44 168
MsG0580029428.01.T01 AT3G16030 35.974 303 166 8 275 569 392 674 1.81e-44 169
MsG0580029428.01.T01 AT1G70530 35.312 320 174 10 263 574 298 592 1.91e-44 168
MsG0580029428.01.T01 AT5G39000 35.556 315 169 10 270 572 501 793 1.91e-44 170
MsG0580029428.01.T01 AT5G10290 34.242 330 187 11 252 572 256 564 1.91e-44 167
MsG0580029428.01.T01 AT5G10290 34.242 330 187 11 252 572 256 564 1.91e-44 167

Find 117 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 228 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CCATTACAGGTTGCAGATTT+TGG 0.089790 5:-96880181 MsG0580029428.01.T01:intron
CTTTAGCTTCCTATTATATA+TGG 0.188230 5:-96882885 MsG0580029428.01.T01:CDS
CTCATTGTTGGGCGTTGTTT+TGG 0.214598 5:+96879442 None:intergenic
CTCAATTCTTCTATTGATAA+TGG 0.234381 5:-96879394 MsG0580029428.01.T01:CDS
GAGAGAGTCAACATTTATTC+TGG 0.273837 5:-96882598 MsG0580029428.01.T01:CDS
AAAATTGGTCAAGGTGGTTT+TGG 0.278276 5:-96881194 MsG0580029428.01.T01:CDS
AGAGAGGTTTCTAAGGATTA+TGG 0.281236 5:-96882517 MsG0580029428.01.T01:CDS
TGTAGCTTCCCATATATAAT+AGG 0.288184 5:+96882876 None:intergenic
AAGATAGATGTGTATGCTTT+TGG 0.288788 5:-96879961 MsG0580029428.01.T01:CDS
ATACTGGATCCAGATATATT+TGG 0.300921 5:-96881286 MsG0580029428.01.T01:CDS
ACATTAACCGTCGCAGATTC+AGG 0.302148 5:+96882565 None:intergenic
GGTACAGCTGGAATATCTAT+TGG 0.348130 5:-96881562 MsG0580029428.01.T01:CDS
AAAGATACCAATGGTGATAC+TGG 0.349170 5:-96881302 MsG0580029428.01.T01:CDS
ATAAATAAATACCTTGCTAA+TGG 0.351176 5:+96879573 None:intergenic
TGCATCAATGATGAGTTTCT+TGG 0.356218 5:-96882712 MsG0580029428.01.T01:CDS
TGGGAACAGAGAGGTTTCTA+AGG 0.364693 5:-96882524 MsG0580029428.01.T01:CDS
GTACTCATCAATAGATTCAT+TGG 0.369053 5:+96879849 None:intergenic
AGCCAACATCTACATAATTC+AGG 0.381393 5:-96880490 MsG0580029428.01.T01:intron
GTACAAGAGCCTTGTAGCTT+TGG 0.384702 5:-96879830 MsG0580029428.01.T01:intron
GATCATGTGGCTGGCACATT+TGG 0.390701 5:-96880115 MsG0580029428.01.T01:CDS
CCTTTGTGTAGAAATGCATA+TGG 0.407095 5:-96879997 MsG0580029428.01.T01:intron
GAAGGTGTCATAGAATCTTC+TGG 0.417514 5:+96881454 None:intergenic
TCCATACAGGTACACTTGAT+TGG 0.419417 5:-96880571 MsG0580029428.01.T01:intron
ATTCCTTGTGTTTGAATACA+TGG 0.420670 5:-96880527 MsG0580029428.01.T01:CDS
TTTAGCTTCCTATTATATAT+GGG 0.423140 5:-96882884 MsG0580029428.01.T01:CDS
TGCTACAGATAACTTCAGTT+TGG 0.424534 5:-96881222 MsG0580029428.01.T01:CDS
ACTATACCATCTTTAGTTGA+AGG 0.424752 5:+96881436 None:intergenic
AGGGAACATTCACTCTTGTA+TGG 0.426759 5:+96882746 None:intergenic
ATGTCGCGATGGATATATAC+AGG 0.427869 5:+96880310 None:intergenic
GACTCTCTCCATCCACTCCT+TGG 0.436583 5:+96882612 None:intergenic
CCACAACATCTCTCATTGTT+GGG 0.437553 5:+96879431 None:intergenic
CATTCACTCTTGTATGGGAT+TGG 0.437664 5:+96882752 None:intergenic
ATCCTTGTAGACAACGTCAT+TGG 0.441095 5:+96880388 None:intergenic
ATGGCAGTTTGATGAAGTTA+TGG 0.445802 5:-96879671 MsG0580029428.01.T01:intron
AGCTTTCTTAGACCTTCTAT+AGG 0.453151 5:+96879634 None:intergenic
TGATGAAGTTATGGATCAAA+CGG 0.454435 5:-96879662 MsG0580029428.01.T01:CDS
ACCACAACATCTCTCATTGT+TGG 0.464363 5:+96879430 None:intergenic
TTTGTCCAACCAAATATATC+TGG 0.464866 5:+96881277 None:intergenic
AATAAAATGTAACCTTTCCC+TGG 0.466879 5:+96882358 None:intergenic
CGATACTTTCGAAAGAAGAA+TGG 0.467599 5:-96881496 MsG0580029428.01.T01:CDS
ATCTCGGTTTATGCAAGCCT+TGG 0.471747 5:+96879465 None:intergenic
CAAGGCCTCTCGCAACATCC+AGG 0.475427 5:+96880356 None:intergenic
CAAACGGGAGATCCTATAGA+AGG 0.477813 5:-96879646 MsG0580029428.01.T01:CDS
CCTTGGCTGAAATTCACACC+AGG 0.481537 5:+96882400 None:intergenic
ATTGATAATGGAAGTAGTAC+AGG 0.482947 5:-96879382 MsG0580029428.01.T01:CDS
CTGTTAAATGAAAACTTCAC+TGG 0.484414 5:-96880271 MsG0580029428.01.T01:CDS
CACCTGAATTATGTAGATGT+TGG 0.488610 5:+96880488 None:intergenic
GAATAGTTATCTCCTAGCCT+TGG 0.492422 5:+96879604 None:intergenic
CCAGTGATGAACACTTGTTA+AGG 0.492560 5:+96880754 None:intergenic
AACCAATGACGTTGTCTACA+AGG 0.497945 5:-96880390 MsG0580029428.01.T01:CDS
TTGATTGGATATTGTGTTGA+GGG 0.498759 5:-96880556 MsG0580029428.01.T01:CDS
TTCAATTGATTCCATTAGCA+AGG 0.503054 5:-96879584 MsG0580029428.01.T01:intron
AAGGATACCAAGCTTGAGGC+TGG 0.505191 5:-96882442 MsG0580029428.01.T01:CDS
GATGAAGTTATGGATCAAAC+GGG 0.509366 5:-96879661 MsG0580029428.01.T01:CDS
TACAAGGATGAAAATTGCCC+TGG 0.515480 5:-96880374 MsG0580029428.01.T01:CDS
TGCAGCATTGAGTCTTGCTA+TGG 0.516135 5:-96879356 MsG0580029428.01.T01:CDS
CCTTAACAAGTGTTCATCAC+TGG 0.519054 5:-96880754 MsG0580029428.01.T01:CDS
CAGCTTAGCAATGGAAGGAT+AGG 0.520021 5:+96882654 None:intergenic
TTGAGGCTGGTTTGTTGCAG+AGG 0.521039 5:-96882429 MsG0580029428.01.T01:CDS
GTTACTGTTAATTGTTCTTG+TGG 0.522673 5:-96882544 MsG0580029428.01.T01:CDS
GTGAATTTCAGCCAAGGAAG+TGG 0.527765 5:-96882394 MsG0580029428.01.T01:CDS
TTACTGTTAATTGTTCTTGT+GGG 0.527889 5:-96882543 MsG0580029428.01.T01:CDS
ACTGAAGTTATCTGTAGCAT+TGG 0.528362 5:+96881226 None:intergenic
ACTTGCAGCATCAGTAAGCT+TGG 0.528409 5:+96880153 None:intergenic
ATTCATTGGTCTTAATCTCA+AGG 0.531834 5:+96879863 None:intergenic
GATATTGTCAGCTACAACAC+AGG 0.531914 5:-96882799 MsG0580029428.01.T01:CDS
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TGGAAGGATAGGTATCACTG+TGG 0.799452 5:+96882665 None:intergenic

CRISPR-GE

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AAAGATACCAATGGTGATAC+TGG - Chr5:96880983-96881002 MsG0580029428.01.T01:intron 35.0%
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AGTCATACCATAAACAGGAA+AGG - Chr5:96881294-96881313 MsG0580029428.01.T01:CDS 35.0%
ATCTATTGGAGGATTATGCA+TGG - Chr5:96880737-96880756 MsG0580029428.01.T01:intron 35.0%
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ATGACACCTTCAACTAAAGA+TGG - Chr5:96880843-96880862 MsG0580029428.01.T01:intron 35.0%
ATGGCAGTTTGATGAAGTTA+TGG - Chr5:96882614-96882633 MsG0580029428.01.T01:CDS 35.0%
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CCGTAATTTCTCACTTTCAT+TGG - Chr5:96881262-96881281 MsG0580029428.01.T01:CDS 35.0%
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CGATACTTTCGAAAGAAGAA+TGG - Chr5:96880789-96880808 MsG0580029428.01.T01:CDS 35.0%
CTTCAAACTTATCAGAGAGT+TGG - Chr5:96880592-96880611 MsG0580029428.01.T01:intron 35.0%
CTTGATTGGATATTGTGTTG+AGG - Chr5:96881728-96881747 MsG0580029428.01.T01:intron 35.0%
GAGAGAGTCAACATTTATTC+TGG - Chr5:96879687-96879706 MsG0580029428.01.T01:intron 35.0%
GATGAAGTTATGGATCAAAC+GGG - Chr5:96882624-96882643 MsG0580029428.01.T01:CDS 35.0%
GCTAAAAAAATTGGTCAAGG+TGG - Chr5:96881085-96881104 MsG0580029428.01.T01:intron 35.0%
GTAGAGTTTAACTAAGGAAG+TGG + Chr5:96882262-96882281 None:intergenic 35.0%
GTGTTTGAATACATGGACAA+CGG - Chr5:96881765-96881784 MsG0580029428.01.T01:intron 35.0%
TAAAAACAAGACCACTTCCT+TGG + Chr5:96879905-96879924 None:intergenic 35.0%
TATAGAAGGTCTAAGAAAGC+TGG - Chr5:96882653-96882672 MsG0580029428.01.T01:CDS 35.0%
TCATCATTGATGCAATCACA+AGG + Chr5:96879567-96879586 None:intergenic 35.0%
TGCATCAATGATGAGTTTCT+TGG - Chr5:96879573-96879592 MsG0580029428.01.T01:intron 35.0%
TGCTACAGATAACTTCAGTT+TGG - Chr5:96881063-96881082 MsG0580029428.01.T01:intron 35.0%
TGGATCCAGATATATTTGGT+TGG - Chr5:96881003-96881022 MsG0580029428.01.T01:intron 35.0%
TGTCCATGTATTCAAACACA+AGG + Chr5:96881764-96881783 None:intergenic 35.0%
TTCTGATTTCAGTATCTGAC+AGG - Chr5:96882760-96882779 MsG0580029428.01.T01:CDS 35.0%
TTTCATACTCCTCCCAAATA+CGG - Chr5:96880883-96880902 MsG0580029428.01.T01:intron 35.0%
! AAAATTGGTCAAGGTGGTTT+TGG - Chr5:96881091-96881110 MsG0580029428.01.T01:intron 35.0%
! AGAGAGGTTTCTAAGGATTA+TGG - Chr5:96879768-96879787 MsG0580029428.01.T01:intron 35.0%
! ATTGGTTCTTTCTCTGCAAA+TGG + Chr5:96881882-96881901 None:intergenic 35.0%
! TATCTGATTTTATGTCGCGA+TGG + Chr5:96881989-96882008 None:intergenic 35.0%
!! CACTTTGAAGTCTATTGCAA+AGG - Chr5:96879824-96879843 MsG0580029428.01.T01:intron 35.0%
!! TCAGTTGAATTAGGTTGAGT+TGG - Chr5:96879984-96880003 MsG0580029428.01.T01:CDS 35.0%
!!! ACATTTTGATTCTGCAGTGA+TGG + Chr5:96879361-96879380 None:intergenic 35.0%
!!! AGTGGTCTTGTTTTTATTCC+AGG - Chr5:96879909-96879928 MsG0580029428.01.T01:CDS 35.0%
!!! CTTGTTTTTATTCCAGGGAA+AGG - Chr5:96879915-96879934 MsG0580029428.01.T01:CDS 35.0%
!!! GTGGTCTTGTTTTTATTCCA+GGG - Chr5:96879910-96879929 MsG0580029428.01.T01:CDS 35.0%
AAAACTTACCTAGGGGGTAA+GGG + Chr5:96880467-96880486 None:intergenic 40.0%
AACCAATGACGTTGTCTACA+AGG - Chr5:96881895-96881914 MsG0580029428.01.T01:intron 40.0%
AAGTGTCCTCAGAAGTAAGA+GGG + Chr5:96879809-96879828 None:intergenic 40.0%
AATAGTCTGACATGCCTCAA+GGG - Chr5:96881189-96881208 MsG0580029428.01.T01:CDS 40.0%
ACAGCTGGAATATCTATTGG+AGG - Chr5:96880726-96880745 MsG0580029428.01.T01:intron 40.0%
ACCACAACATCTCTCATTGT+TGG + Chr5:96882858-96882877 None:intergenic 40.0%
AGCACTTCATTCACCGTATT+TGG + Chr5:96880899-96880918 None:intergenic 40.0%
AGCAGATAACACTGATCATG+TGG - Chr5:96882157-96882176 MsG0580029428.01.T01:intron 40.0%
AGGGAACATTCACTCTTGTA+TGG + Chr5:96879542-96879561 None:intergenic 40.0%
AGTTCTTCGTACGAAAACTC+TGG + Chr5:96881037-96881056 None:intergenic 40.0%
ATCCTTGTAGACAACGTCAT+TGG + Chr5:96881900-96881919 None:intergenic 40.0%
ATGTCGCGATGGATATATAC+AGG + Chr5:96881978-96881997 None:intergenic 40.0%
ATTATGAACTTCGTCCCTTG+AGG + Chr5:96881206-96881225 None:intergenic 40.0%
ATTGATGCAATCACAAGGGA+AGG + Chr5:96879562-96879581 None:intergenic 40.0%
CAATGCTACGATTACAAACC+TGG + Chr5:96881144-96881163 None:intergenic 40.0%
CATAATTCATCATACTCGGG+TGG + Chr5:96882203-96882222 None:intergenic 40.0%
CATAGCACCTTTCCTGTTTA+TGG + Chr5:96881304-96881323 None:intergenic 40.0%
CATTCACTCTTGTATGGGAT+TGG + Chr5:96879536-96879555 None:intergenic 40.0%
CCAAAATCTGCAACCTGTAA+TGG + Chr5:96882107-96882126 None:intergenic 40.0%
CCACAACATCTCTCATTGTT+GGG + Chr5:96882857-96882876 None:intergenic 40.0%
CCTTAACAAGTGTTCATCAC+TGG - Chr5:96881531-96881550 MsG0580029428.01.T01:CDS 40.0%
GAATAGTTATCTCCTAGCCT+TGG + Chr5:96882684-96882703 None:intergenic 40.0%
GATATTGTCAGCTACAACAC+AGG - Chr5:96879486-96879505 MsG0580029428.01.T01:intron 40.0%
GCAAAAAGTTTAGGTACAGC+TGG - Chr5:96880711-96880730 MsG0580029428.01.T01:intron 40.0%
GCACTTCATTCACCGTATTT+GGG + Chr5:96880898-96880917 None:intergenic 40.0%
GGGAACATTCACTCTTGTAT+GGG + Chr5:96879541-96879560 None:intergenic 40.0%
GGTACAGCTGGAATATCTAT+TGG - Chr5:96880723-96880742 MsG0580029428.01.T01:intron 40.0%
TAAAACTTACCTAGGGGGTA+AGG + Chr5:96880468-96880487 None:intergenic 40.0%
TAAGTCAGCTTAGCAATGGA+AGG + Chr5:96879639-96879658 None:intergenic 40.0%
TAATAGTCTGACATGCCTCA+AGG - Chr5:96881188-96881207 MsG0580029428.01.T01:CDS 40.0%
TACAAGGATGAAAATTGCCC+TGG - Chr5:96881911-96881930 MsG0580029428.01.T01:intron 40.0%
TCCAATCAAGTGTACCTGTA+TGG + Chr5:96881718-96881737 None:intergenic 40.0%
TCCATACAGGTACACTTGAT+TGG - Chr5:96881714-96881733 MsG0580029428.01.T01:intron 40.0%
TTACAGCAGTTTGACTACCA+AGG - Chr5:96879656-96879675 MsG0580029428.01.T01:CDS 40.0%
TTGATGCAATCACAAGGGAA+GGG + Chr5:96879561-96879580 None:intergenic 40.0%
! AAAGTGTCCTCAGAAGTAAG+AGG + Chr5:96879810-96879829 None:intergenic 40.0%
! AAATTTAGAACCGCCTCTGA+GGG + Chr5:96881229-96881248 None:intergenic 40.0%
! AGAGTTTTCGTACGAAGAAC+TGG - Chr5:96881036-96881055 MsG0580029428.01.T01:intron 40.0%
! CCAGTGATGAACACTTGTTA+AGG + Chr5:96881534-96881553 None:intergenic 40.0%
! CCATTACAGGTTGCAGATTT+TGG - Chr5:96882104-96882123 MsG0580029428.01.T01:intron 40.0%
! GTGAAACCTTTTCTGCAAGA+GGG + Chr5:96880572-96880591 None:intergenic 40.0%
! TAAATTTAGAACCGCCTCTG+AGG + Chr5:96881230-96881249 None:intergenic 40.0%
!! GAAGGTGTCATAGAATCTTC+TGG + Chr5:96880834-96880853 None:intergenic 40.0%
AAGTGTTCATCACTGGAACC+TGG - Chr5:96881538-96881557 MsG0580029428.01.T01:CDS 45.0%
ACATTAACCGTCGCAGATTC+AGG + Chr5:96879723-96879742 None:intergenic 45.0%
ACTTGCAGCATCAGTAAGCT+TGG + Chr5:96882135-96882154 None:intergenic 45.0%
AGAAGGTCTAAGAAAGCTGG+TGG - Chr5:96882656-96882675 MsG0580029428.01.T01:CDS 45.0%
AGTTCATAATCCCTCAGAGG+CGG - Chr5:96881216-96881235 MsG0580029428.01.T01:CDS 45.0%
ATCTCGGTTTATGCAAGCCT+TGG + Chr5:96882823-96882842 None:intergenic 45.0%
CAAACGGGAGATCCTATAGA+AGG - Chr5:96882639-96882658 MsG0580029428.01.T01:CDS 45.0%
CACATACCCTCTTACTTCTG+AGG - Chr5:96879800-96879819 MsG0580029428.01.T01:intron 45.0%
CAGCTTAGCAATGGAAGGAT+AGG + Chr5:96879634-96879653 None:intergenic 45.0%
CCCAACAATGAGAGATGTTG+TGG - Chr5:96882854-96882873 MsG0580029428.01.T01:CDS 45.0%
CGAAGTTCATAATCCCTCAG+AGG - Chr5:96881213-96881232 MsG0580029428.01.T01:CDS 45.0%
CTTCATTCACCGTATTTGGG+AGG + Chr5:96880895-96880914 None:intergenic 45.0%
CTTGGCTGAAATTCACACCA+GGG + Chr5:96879887-96879906 None:intergenic 45.0%
GATAACACTGATCATGTGGC+TGG - Chr5:96882161-96882180 MsG0580029428.01.T01:intron 45.0%
GCTGTAAGTCAGCTTAGCAA+TGG + Chr5:96879643-96879662 None:intergenic 45.0%
GTGAATTTCAGCCAAGGAAG+TGG - Chr5:96879891-96879910 MsG0580029428.01.T01:CDS 45.0%
TCTGGATCCAGTATCACCAT+TGG + Chr5:96880993-96881012 None:intergenic 45.0%
TGCAAAGGATACCAAGCTTG+AGG - Chr5:96879839-96879858 MsG0580029428.01.T01:CDS 45.0%
TGGAAGGATAGGTATCACTG+TGG + Chr5:96879623-96879642 None:intergenic 45.0%
TGGGAACAGAGAGGTTTCTA+AGG - Chr5:96879761-96879780 MsG0580029428.01.T01:intron 45.0%
TTGTTCTTGTGGGAACAGAG+AGG - Chr5:96879752-96879771 MsG0580029428.01.T01:intron 45.0%
TTTATGTTCCCTTACCCCCT+AGG - Chr5:96880456-96880475 MsG0580029428.01.T01:intron 45.0%
TTTGACTACCAAGGAGTGGA+TGG - Chr5:96879665-96879684 MsG0580029428.01.T01:CDS 45.0%
! CCTTTTCCCTCTTGCAGAAA+AGG - Chr5:96880563-96880582 MsG0580029428.01.T01:CDS 45.0%
! CCTTTTCTGCAAGAGGGAAA+AGG + Chr5:96880566-96880585 None:intergenic 45.0%
! GGTGAAACCTTTTCTGCAAG+AGG + Chr5:96880573-96880592 None:intergenic 45.0%
! GGTGTCATAGAATCTTCTGG+TGG + Chr5:96880831-96880850 None:intergenic 45.0%
! GTACAAGAGCCTTGTAGCTT+TGG - Chr5:96882455-96882474 MsG0580029428.01.T01:CDS 45.0%
! TAAGAAAGCTGGTGGATCCA+AGG - Chr5:96882664-96882683 MsG0580029428.01.T01:CDS 45.0%
! TGCAGCATTGAGTCTTGCTA+TGG - Chr5:96882929-96882948 MsG0580029428.01.T01:CDS 45.0%
!! CTCATTGTTGGGCGTTGTTT+TGG + Chr5:96882846-96882865 None:intergenic 45.0%
!! GGCTTTACCTGTTTTTCCAC+TGG - Chr5:96882781-96882800 MsG0580029428.01.T01:CDS 45.0%
!! GGTTTTGGTGAGGTCTACTA+TGG - Chr5:96881106-96881125 MsG0580029428.01.T01:intron 45.0%
!!! TTGGGCGTTGTTTTGGATCT+CGG + Chr5:96882839-96882858 None:intergenic 45.0%
AAGGATACCAAGCTTGAGGC+TGG - Chr5:96879843-96879862 MsG0580029428.01.T01:CDS 50.0%
CAACAAACCAGCCTCAAGCT+TGG + Chr5:96879853-96879872 None:intergenic 50.0%
CCATCTGCCAGTGGAAAAAC+AGG + Chr5:96882791-96882810 None:intergenic 50.0%
CCTGGTGTGAATTTCAGCCA+AGG - Chr5:96879885-96879904 MsG0580029428.01.T01:CDS 50.0%
CCTTGGCTGAAATTCACACC+AGG + Chr5:96879888-96879907 None:intergenic 50.0%
CGATCTTCCTGAATCTGCGA+CGG - Chr5:96879713-96879732 MsG0580029428.01.T01:intron 50.0%
CGTCGCAGATTCAGGAAGAT+CGG + Chr5:96879715-96879734 None:intergenic 50.0%
GATCATGTGGCTGGCACATT+TGG - Chr5:96882170-96882189 MsG0580029428.01.T01:intron 50.0%
GCAGTTTGACTACCAAGGAG+TGG - Chr5:96879661-96879680 MsG0580029428.01.T01:CDS 50.0%
GTCTACTATGGAGAGCTGAG+AGG - Chr5:96881118-96881137 MsG0580029428.01.T01:intron 50.0%
! GTGAACGGACTCAACTCAAG+TGG + Chr5:96880104-96880123 None:intergenic 50.0%
! TTGTTGCAGAGGTACAACCC+TGG - Chr5:96879867-96879886 MsG0580029428.01.T01:CDS 50.0%
!! CCTGTTTTTCCACTGGCAGA+TGG - Chr5:96882788-96882807 MsG0580029428.01.T01:CDS 50.0%
!! TTGAGGCTGGTTTGTTGCAG+AGG - Chr5:96879856-96879875 MsG0580029428.01.T01:CDS 50.0%
!!! TGGTCAAGGTGGTTTTGGTG+AGG - Chr5:96881096-96881115 MsG0580029428.01.T01:intron 50.0%
AAGGCCTCTCGCAACATCCA+GGG + Chr5:96881931-96881950 None:intergenic 55.0%
ATTGCCCTGGATGTTGCGAG+AGG - Chr5:96881924-96881943 MsG0580029428.01.T01:intron 55.0%
CAAGCTTTGCCATCTGCCAG+TGG + Chr5:96882800-96882819 None:intergenic 55.0%
GACTCTCTCCATCCACTCCT+TGG + Chr5:96879676-96879695 None:intergenic 55.0%
GCAGATGGCAAAGCTTGCCA+AGG - Chr5:96882803-96882822 MsG0580029428.01.T01:CDS 55.0%
! AAGCTGGTGGATCCAAGGCT+AGG - Chr5:96882669-96882688 MsG0580029428.01.T01:CDS 55.0%
CAAGGCCTCTCGCAACATCC+AGG + Chr5:96881932-96881951 None:intergenic 60.0%
CTATGGAGAGCTGAGAGGCC+AGG - Chr5:96881123-96881142 MsG0580029428.01.T01:intron 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr5 gene 96879339 96882968 96879339 ID=MsG0580029428.01;Name=MsG0580029428.01
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Chr5 exon 96879339 96879500 96879339 ID=MsG0580029428.01.T01:exon:24713;Parent=MsG0580029428.01.T01
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