AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680035178.01

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MsG0680035178.01.T01 AT5G18610 43.689 309 158 7 171 469 52 354 3.81e-71 234
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MsG0680035178.01.T01 AT1G24030 42.361 288 155 4 185 463 59 344 3.88e-69 225
MsG0680035178.01.T01 AT3G45860 39.175 291 166 5 186 469 335 621 5.92e-69 233
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MsG0680035178.01.T01 AT2G48010 42.561 289 154 3 189 469 270 554 8.23e-69 231
MsG0680035178.01.T01 AT1G07870 43.357 286 150 6 192 469 93 374 1.44e-68 225
MsG0680035178.01.T01 AT1G01540 49.528 212 102 2 193 399 145 356 1.91e-68 224
MsG0680035178.01.T01 AT1G53420 42.908 282 152 3 193 469 615 892 2.03e-68 235
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MsG0680035178.01.T01 AT3G05140 41.637 281 150 5 194 469 183 454 1.69e-63 214
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MsG0680035178.01.T01 AT4G23230 37.413 286 170 4 189 469 324 605 9.18e-62 212
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MsG0680035178.01.T01 AT5G02290 37.202 336 191 6 150 469 16 347 9.66e-62 206
MsG0680035178.01.T01 AT1G07650 40.268 298 160 5 182 469 664 953 9.73e-62 217
MsG0680035178.01.T01 AT5G57670 40.702 285 152 7 192 469 257 531 1.04e-61 211
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MsG0680035178.01.T01 AT1G52540 37.778 315 175 7 161 469 8 307 1.53e-61 204
MsG0680035178.01.T01 AT1G51810 40.278 288 155 8 189 469 439 716 1.83e-61 213
MsG0680035178.01.T01 AT2G18890 39.100 289 157 8 190 469 56 334 1.93e-61 205
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MsG0680035178.01.T01 AT4G23290 38.832 291 170 5 184 469 345 632 2.85e-61 212
MsG0680035178.01.T01 AT4G04570 41.516 277 146 8 199 469 345 611 2.87e-61 211
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MsG0680035178.01.T01 AT4G04510 40.136 294 155 8 186 469 323 605 3.40e-61 211
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MsG0680035178.01.T01 AT5G01950 39.865 296 159 4 183 469 607 892 1.06e-60 214
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MsG0680035178.01.T01 AT4G35030 37.979 287 167 4 190 469 92 374 2.04e-60 204
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MsG0680035178.01.T01 AT1G11330 41.404 285 158 5 190 469 510 790 3.27e-59 209
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MsG0680035178.01.T01 AT4G04540 40.580 276 150 7 199 469 350 616 1.08e-58 204
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MsG0680035178.01.T01 AT4G03230 39.286 280 157 5 197 469 528 801 1.82e-58 207
MsG0680035178.01.T01 AT4G00970 43.836 219 110 5 189 397 331 546 1.83e-58 202
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MsG0680035178.01.T01 AT2G28990 40.000 290 157 8 187 469 564 843 1.90e-58 207
MsG0680035178.01.T01 AT4G04500 37.838 296 167 8 186 469 327 617 2.49e-58 203
MsG0680035178.01.T01 AT4G03230 39.286 280 157 5 197 469 585 858 2.68e-58 207
MsG0680035178.01.T01 AT4G03230 39.286 280 157 5 197 469 585 858 2.68e-58 207
MsG0680035178.01.T01 AT4G03230 39.286 280 157 5 197 469 613 886 2.99e-58 207
MsG0680035178.01.T01 AT2G19210 38.889 288 164 6 187 469 563 843 3.05e-58 206
MsG0680035178.01.T01 AT1G24650 38.989 277 157 4 199 466 544 817 3.20e-58 206
MsG0680035178.01.T01 AT1G70740 38.434 281 165 3 192 468 52 328 3.35e-58 198
MsG0680035178.01.T01 AT1G65790 40.000 280 155 5 199 469 516 791 5.09e-58 205
MsG0680035178.01.T01 AT2G19190 39.175 291 165 6 183 469 557 839 5.47e-58 206
MsG0680035178.01.T01 AT5G06740 38.014 292 165 7 189 469 317 603 5.88e-58 202
MsG0680035178.01.T01 AT4G03230 39.286 280 157 5 197 469 527 800 6.32e-58 205
MsG0680035178.01.T01 AT1G31420 38.298 282 162 5 193 469 297 571 6.35e-58 201
MsG0680035178.01.T01 AT1G31420 38.298 282 162 5 193 469 297 571 6.35e-58 201
MsG0680035178.01.T01 AT4G03230 39.286 280 157 5 197 469 685 958 6.97e-58 206
MsG0680035178.01.T01 AT4G03230 39.286 280 157 5 197 469 685 958 6.97e-58 206
MsG0680035178.01.T01 AT5G06740 38.014 292 165 7 189 469 329 615 7.65e-58 202
MsG0680035178.01.T01 AT4G29990 38.658 313 171 7 167 469 538 839 8.04e-58 205
MsG0680035178.01.T01 AT1G78530 46.818 220 110 4 199 414 72 288 8.74e-58 192
MsG0680035178.01.T01 AT1G56145 38.217 314 151 7 190 469 675 979 8.94e-58 206
MsG0680035178.01.T01 AT1G48220 37.979 287 163 6 194 469 60 342 9.74e-58 195
MsG0680035178.01.T01 AT1G51860 41.667 288 150 10 189 469 573 849 1.25e-57 204
MsG0680035178.01.T01 AT4G22130 38.596 285 159 4 195 469 388 666 1.33e-57 202
MsG0680035178.01.T01 AT5G61350 37.847 288 164 5 192 469 515 797 1.68e-57 204
MsG0680035178.01.T01 AT2G28250 40.000 295 161 7 189 469 197 489 1.74e-57 199
MsG0680035178.01.T01 AT2G28250 40.000 295 161 7 189 469 197 489 1.74e-57 199
MsG0680035178.01.T01 AT2G28250 40.000 295 161 7 189 469 197 489 1.74e-57 199
MsG0680035178.01.T01 AT2G28250 40.000 295 161 7 189 469 197 489 1.74e-57 199
MsG0680035178.01.T01 AT2G28250 40.000 295 161 7 189 469 197 489 1.74e-57 199
MsG0680035178.01.T01 AT2G28250 40.000 295 161 7 189 469 197 489 1.74e-57 199
MsG0680035178.01.T01 AT4G21230 37.374 297 152 5 190 469 321 600 1.88e-57 201
MsG0680035178.01.T01 AT1G51870 42.014 288 149 10 189 469 520 796 1.96e-57 204
MsG0680035178.01.T01 AT1G29750 39.373 287 155 6 193 469 672 949 2.28e-57 205
MsG0680035178.01.T01 AT1G29750 39.373 287 155 6 193 469 657 934 2.72e-57 204
MsG0680035178.01.T01 AT3G46420 40.288 278 151 7 198 469 529 797 3.00e-57 203
MsG0680035178.01.T01 AT1G51870 42.014 288 149 10 189 469 572 848 3.06e-57 204
MsG0680035178.01.T01 AT1G61390 38.488 291 164 7 186 469 336 618 3.18e-57 201
MsG0680035178.01.T01 AT1G11350 42.657 286 153 5 190 469 500 780 3.31e-57 203
MsG0680035178.01.T01 AT1G11050 39.933 298 157 8 186 465 279 572 4.52e-57 199
MsG0680035178.01.T01 AT4G38830 36.770 291 168 6 189 469 331 615 5.84e-57 200
MsG0680035178.01.T01 AT2G29000 38.966 290 160 8 187 469 552 831 5.91e-57 202
MsG0680035178.01.T01 AT5G38990 39.643 280 156 5 199 469 522 797 6.08e-57 202
MsG0680035178.01.T01 AT4G21390 38.406 276 160 6 199 469 526 796 6.14e-57 202
MsG0680035178.01.T01 AT1G26970 42.339 248 132 5 227 469 3 244 6.50e-57 191
MsG0680035178.01.T01 AT2G25220 41.328 271 145 7 193 456 137 400 6.86e-57 194
MsG0680035178.01.T01 AT4G35600 33.427 356 202 8 136 469 21 363 7.07e-57 194
MsG0680035178.01.T01 AT2G16750 38.298 282 164 4 192 469 267 542 7.20e-57 199
MsG0680035178.01.T01 AT2G16750 38.298 282 164 4 192 469 267 542 7.20e-57 199
MsG0680035178.01.T01 AT2G25220 41.328 271 145 7 193 456 88 351 7.72e-57 193
MsG0680035178.01.T01 AT4G21400 34.891 321 157 8 190 468 210 520 8.92e-57 197
MsG0680035178.01.T01 AT5G24080 41.053 285 153 6 192 469 395 671 9.81e-57 201
MsG0680035178.01.T01 AT5G24080 41.053 285 153 6 192 469 395 671 9.81e-57 201
MsG0680035178.01.T01 AT1G51880 40.345 290 155 9 187 469 553 831 1.21e-56 202
MsG0680035178.01.T01 AT1G61420 39.338 272 152 6 199 463 343 608 1.29e-56 199
MsG0680035178.01.T01 AT2G25220 40.959 271 146 7 193 456 142 405 1.40e-56 194
MsG0680035178.01.T01 AT4G35600 35.577 312 174 7 172 469 64 362 1.44e-56 193
MsG0680035178.01.T01 AT1G51880 40.625 288 153 9 189 469 573 849 1.44e-56 202
MsG0680035178.01.T01 AT1G51880 40.625 288 153 9 189 469 581 857 1.45e-56 202
MsG0680035178.01.T01 AT1G61420 39.338 272 152 6 199 463 341 606 1.50e-56 199
MsG0680035178.01.T01 AT3G21630 39.437 284 164 6 189 469 309 587 1.81e-56 197
MsG0680035178.01.T01 AT5G24080 40.767 287 155 6 190 469 520 798 1.89e-56 201

Find 122 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 149 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TGTTGACAGGTTGCTAATTT+TGG 0.178036 6:+100129536 MsG0680035178.01.T01:intron
CTCGAGTGATGGGCACTTTC+GGG 0.193376 6:+100129600 MsG0680035178.01.T01:CDS
AATTGCTGCTTACAGGTATT+TGG 0.222931 6:+100129811 MsG0680035178.01.T01:intron
TCTCCACTTAAGCCATATTC+TGG 0.262791 6:-100129836 None:intergenic
AGGTATTTGGCTCCAGAATA+TGG 0.276107 6:+100129824 MsG0680035178.01.T01:intron
CCTCGAGTGATGGGCACTTT+CGG 0.279009 6:+100129599 MsG0680035178.01.T01:CDS
ATTGGAGCATGAGGCGGCTT+TGG 0.326529 6:-100128668 None:intergenic
CTCCTCGGAAAAGGTGGATT+TGG 0.327975 6:+100128893 MsG0680035178.01.T01:CDS
CACATTACCAGGCTCATCTT+TGG 0.336629 6:-100130528 None:intergenic
CTAGGCATTGGATTAAGCTT+TGG 0.337649 6:+100128809 MsG0680035178.01.T01:CDS
CAAGATGAAATACAAGGATT+TGG 0.341323 6:+100128838 MsG0680035178.01.T01:CDS
ATGCGAATTGCTGTAGGATC+TGG 0.343734 6:+100129254 MsG0680035178.01.T01:CDS
TAGGCATTGGATTAAGCTTT+GGG 0.368387 6:+100128810 MsG0680035178.01.T01:CDS
ATTGAAGCATGAGGCGGCTT+TGG 0.369170 6:-100128344 None:intergenic
CACAAAGGTATTTATCCTAA+TGG 0.374045 6:+100128923 MsG0680035178.01.T01:CDS
GGAGCATGAGGCGGCTTTGG+CGG 0.375403 6:-100128665 None:intergenic
ATCCTCCTTGAGTTAATAAC+TGG 0.376666 6:+100129896 MsG0680035178.01.T01:CDS
ACCATACGAGTCATCTCATT+AGG 0.378111 6:-100130462 None:intergenic
TGATACTCCAATGTATTGTT+AGG 0.388190 6:-100129100 None:intergenic
GGCTCAGGATCAAAACATTC+AGG 0.395877 6:+100128761 MsG0680035178.01.T01:CDS
CCACCTCCTTCTCTAGGCAT+TGG 0.395937 6:+100128797 MsG0680035178.01.T01:CDS
GTTGAAGCATTAGGCTGCTT+TGG 0.398440 6:-100128398 None:intergenic
GTTGAAGCATTAGGCTGCTT+TGG 0.398440 6:-100128560 None:intergenic
CCTGATTGAGTTGAAGCATT+AGG 0.401237 6:-100128407 None:intergenic
CCTGATTGAGTTGAAGCATT+AGG 0.401237 6:-100128569 None:intergenic
GACTTACATGAACGGTAGTT+TGG 0.401263 6:+100129943 MsG0680035178.01.T01:CDS
GGCTGCTTTGGCGGTGCTAC+AGG 0.404514 6:-100128386 None:intergenic
AAATAATAATGTAGATTCTC+TGG 0.406997 6:+100130410 MsG0680035178.01.T01:CDS
ACAGCAATCTTGTCACCATT+AGG 0.409730 6:-100128938 None:intergenic
GTTAGCCTCGGAAAAGTTAT+CGG 0.422577 6:-100128870 None:intergenic
GACGGAGGTCCTGATGGAAT+TGG 0.428621 6:-100128470 None:intergenic
CTGGTTGGATACTGCAGCAC+TGG 0.434510 6:+100129046 MsG0680035178.01.T01:CDS
TCAAATTTATTCTGAAGCCT+TGG 0.437334 6:-100130438 None:intergenic
GACGGAGGTCCTGATGGAAT+TGG 0.437645 6:-100128632 None:intergenic
GTAAGCAGCTGTGGCGGCTC+AGG 0.440115 6:+100128746 MsG0680035178.01.T01:CDS
CCTAATGCTTCAACTCAATC+AGG 0.441467 6:+100128407 MsG0680035178.01.T01:CDS
CCTAATGCTTCAACTCAATC+AGG 0.441467 6:+100128569 MsG0680035178.01.T01:CDS
ATTGGAGCATCATGCTGCTT+TGG 0.442339 6:-100128452 None:intergenic
ATTGGAGCATCATGCTGCTT+TGG 0.442339 6:-100128614 None:intergenic
GCTCCAGAATATGGCTTAAG+TGG 0.446313 6:+100129833 MsG0680035178.01.T01:CDS
GATACTGCAGCACTGGTTCT+CGG 0.447933 6:+100129053 MsG0680035178.01.T01:CDS
TCATAAACATCTTGTTTCCC+TGG 0.451586 6:+100129027 MsG0680035178.01.T01:CDS
AAACATCTTGTTTCCCTGGT+TGG 0.453021 6:+100129031 MsG0680035178.01.T01:CDS
TAAGTCTGATCTTTAACAAT+CGG 0.467670 6:-100129926 None:intergenic
GAGGCTAACCTCCTCGGAAA+AGG 0.475303 6:+100128884 MsG0680035178.01.T01:CDS
GAAGCATGAGGCGGCTTTGG+CGG 0.476354 6:-100128341 None:intergenic
ATTGAAGCATCAGGCGGCGT+TGG 0.482217 6:-100128506 None:intergenic
GACGGCTGTCCTGATGGAAT+TGG 0.482554 6:-100128686 None:intergenic
CCTGATGGAATTGAAGCATC+AGG 0.485684 6:-100128515 None:intergenic
CCTCATGCTTCAATTCCATC+AGG 0.486270 6:+100128353 MsG0680035178.01.T01:CDS
CTGGATGCTTCAATTCCATC+AGG 0.488253 6:+100128300 MsG0680035178.01.T01:CDS
CCTGATGCTTCAATTCCATC+AGG 0.492284 6:+100128515 MsG0680035178.01.T01:CDS
CCATACGAGTCATCTCATTA+GGG 0.495082 6:-100130461 None:intergenic
TGATGTTTCTCCTCGAGTGA+TGG 0.496864 6:+100129589 MsG0680035178.01.T01:CDS
GGAGCATCATGCTGCTTTGG+CGG 0.500146 6:-100128449 None:intergenic
GGAGCATCATGCTGCTTTGG+CGG 0.500146 6:-100128611 None:intergenic
GCATGAGACGGCTGTCCTGA+TGG 0.513638 6:-100128692 None:intergenic
GATGTTTCTCCTCGAGTGAT+GGG 0.514635 6:+100129590 MsG0680035178.01.T01:CDS
TCAAATTTATTCACATTACC+AGG 0.515596 6:-100130539 None:intergenic
GAAGCATTAGGCTGCTTTGG+CGG 0.518011 6:-100128395 None:intergenic
TGCGAATTGCTGTAGGATCT+GGG 0.524112 6:+100129255 MsG0680035178.01.T01:CDS
CCGCCACAGCTGCTTACTAA+AGG 0.524677 6:-100128740 None:intergenic
CCTCATGCTCCAATTCCATC+AGG 0.528485 6:+100128677 MsG0680035178.01.T01:CDS
ACATTGGAGTATCATTTACA+TGG 0.529677 6:+100129109 MsG0680035178.01.T01:CDS
CATGATGCTCCAATTCCATC+AGG 0.532323 6:+100128461 MsG0680035178.01.T01:CDS
CATGATGCTCCAATTCCATC+AGG 0.532323 6:+100128623 MsG0680035178.01.T01:CDS
CTGCTTCCACCTCCTTCTCT+AGG 0.536118 6:+100128791 MsG0680035178.01.T01:CDS
ACGCGAGACGGAGGTCCTGA+TGG 0.540120 6:-100128476 None:intergenic
GCTGTTAAGCAACTAAAAGC+TGG 0.541740 6:+100128956 MsG0680035178.01.T01:CDS
GAAGCATTAGGCTGCTTTGG+CGG 0.546516 6:-100128557 None:intergenic
GTTTGTTCCTAACAATACAT+TGG 0.550382 6:+100129093 MsG0680035178.01.T01:CDS
ACAGGAGAACGAGGTCCTGA+TGG 0.550386 6:-100128368 None:intergenic
AAGGACTACCAACATTGGAT+TGG 0.552337 6:+100129222 MsG0680035178.01.T01:CDS
ACACGAGACGGAGGTCCTGA+TGG 0.554632 6:-100128638 None:intergenic
TGAACGGTAGTTTGGTTGAG+TGG 0.558564 6:+100129951 MsG0680035178.01.T01:CDS
CAGTGCTGCAGTATCCAACC+AGG 0.558575 6:-100129045 None:intergenic
GCCACCGTCTCATGTAGCGC+TGG 0.562553 6:+100128281 MsG0680035178.01.T01:CDS
TAGATTCTCTGGTTGATCCA+AGG 0.563467 6:+100130421 MsG0680035178.01.T01:CDS
AGATCGACCAAAGATGAGCC+TGG 0.565075 6:+100130521 MsG0680035178.01.T01:CDS
TGCAGAACTGTCAACGCCAT+CGG 0.568329 6:+100128712 MsG0680035178.01.T01:CDS
TTTACAGCACGGTCGAGCAA+AGG 0.568395 6:-100130387 None:intergenic
GCTAACCTCCTCGGAAAAGG+TGG 0.571509 6:+100128887 MsG0680035178.01.T01:CDS
CTTACTAAAGGAGGCACCGA+TGG 0.578106 6:-100128728 None:intergenic
GTCGTCCAGTTATTAACTCA+AGG 0.583246 6:-100129901 None:intergenic
AAAAGAATGCGAATTGCTGT+AGG 0.589299 6:+100129248 MsG0680035178.01.T01:CDS
GAACGGTAGTTTGGTTGAGT+GGG 0.593143 6:+100129952 MsG0680035178.01.T01:CDS
CTTAATCCAATGCCTAGAGA+AGG 0.597419 6:-100128803 None:intergenic
TAACGACAATGAGAACCTGA+TGG 0.602703 6:-100128315 None:intergenic
ACACGAGAATCAGAACCTGA+TGG 0.611545 6:-100128530 None:intergenic
CCTCCTTTAGTAAGCAGCTG+TGG 0.612362 6:+100128737 MsG0680035178.01.T01:CDS
CCACAGCTGCTTACTAAAGG+AGG 0.614715 6:-100128737 None:intergenic
AATCCAATGCCTAGAGAAGG+AGG 0.615468 6:-100128800 None:intergenic
GCATCCAGCGCTACATGAGA+CGG 0.616128 6:-100128285 None:intergenic
GGCGATGCTACGCGAGACGG+AGG 0.621051 6:-100128485 None:intergenic
GTTGGCGATGCTACGCGAGA+CGG 0.633986 6:-100128488 None:intergenic
CCTTTAGTAAGCAGCTGTGG+CGG 0.640191 6:+100128740 MsG0680035178.01.T01:CDS
TTTGGCGGTGCTACACGAGA+CGG 0.640811 6:-100128650 None:intergenic
CCGAAAGTGCCCATCACTCG+AGG 0.644139 6:-100129599 None:intergenic
CAAGATGTTTATGATGAACA+CGG 0.644711 6:-100129018 None:intergenic
GATGGAATTGGAGCATGAGG+CGG 0.646784 6:-100128674 None:intergenic
CCTGATGGAATTGGAGCATG+AGG 0.652164 6:-100128677 None:intergenic
GAAGAACAAGATGAAATACA+AGG 0.652731 6:+100128832 MsG0680035178.01.T01:CDS
ATTGCTGTAGGATCTGGGAA+AGG 0.655606 6:+100129260 MsG0680035178.01.T01:CDS
CCTGATGGAATTGAAGCATG+AGG 0.655786 6:-100128353 None:intergenic
CCCTAATGAGATGACTCGTA+TGG 0.659406 6:+100130461 MsG0680035178.01.T01:CDS
TAATGAGATGACTCGTATGG+TGG 0.661091 6:+100130464 MsG0680035178.01.T01:CDS
GGCGGTGCTACACGAGACGG+AGG 0.662614 6:-100128647 None:intergenic
GGCGGTGCTACACGAGAACG+AGG 0.666935 6:-100128431 None:intergenic
GGCGGTGCTACACGAGAACG+AGG 0.666935 6:-100128593 None:intergenic
GTTAAGCAACTAAAAGCTGG+AGG 0.671386 6:+100128959 MsG0680035178.01.T01:CDS
CCAATGCCTAGAGAAGGAGG+TGG 0.672845 6:-100128797 None:intergenic
GTTGACAGTTCTGCATGAGA+CGG 0.677389 6:-100128704 None:intergenic
GATGGAATTGAAGCATGAGG+CGG 0.686254 6:-100128350 None:intergenic
AAAGATCAGACTTACATGAA+CGG 0.686562 6:+100129935 MsG0680035178.01.T01:CDS
GGATTTGGAGACGTGCACAA+AGG 0.692503 6:+100128908 MsG0680035178.01.T01:CDS
TCCAGCGCTACATGAGACGG+TGG 0.695326 6:-100128282 None:intergenic
GAGGAGAAACATCAGTGTCG+AGG 0.698245 6:-100129580 None:intergenic
GATGGAATTGAAGCATCAGG+CGG 0.698807 6:-100128512 None:intergenic
GGCGGTGCTACAGGAGAACG+AGG 0.706043 6:-100128377 None:intergenic
ACTGCAGCACTGGTTCTCGG+AGG 0.724297 6:+100129056 MsG0680035178.01.T01:CDS
AGTGCTGCAGTATCCAACCA+GGG 0.733255 6:-100129044 None:intergenic
GTCCAGTTATTAACTCAAGG+AGG 0.735777 6:-100129898 None:intergenic

CRISPR-GE

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!!! ACTTACACATTTTTTTTAAT+AGG + Chr6:100130219-100130238 MsG0680035178.01.T01:intron 15.0%
!! AAATAATAATGTAGATTCTC+TGG + Chr6:100130410-100130429 MsG0680035178.01.T01:CDS 20.0%
!! AATGTATCAATTATTGACAA+TGG + Chr6:100130172-100130191 MsG0680035178.01.T01:intron 20.0%
!! ATTCTATCATTATGAAAAGA+TGG - Chr6:100130014-100130033 None:intergenic 20.0%
!! TGTAATATATAAACTCTCTA+TGG - Chr6:100129987-100130006 None:intergenic 20.0%
!!! CATTATTATTTTTTACAGCA+CGG - Chr6:100130401-100130420 None:intergenic 20.0%
! AATCAAATGATTAAGTGAGA+CGG + Chr6:100130250-100130269 MsG0680035178.01.T01:intron 25.0%
! TAAGTCTGATCTTTAACAAT+CGG - Chr6:100129929-100129948 None:intergenic 25.0%
! TATCATTATGAAAAGATGGA+GGG - Chr6:100130010-100130029 None:intergenic 25.0%
! TTGTAAATTTCTGTTTGTTC+AGG + Chr6:100129376-100129395 MsG0680035178.01.T01:intron 25.0%
!! AAATCAGATGTTTTCTCTTA+TGG + Chr6:100129869-100129888 MsG0680035178.01.T01:CDS 25.0%
!! TCTTTTATTGGATGATAACA+AGG + Chr6:100130309-100130328 MsG0680035178.01.T01:intron 25.0%
!!! ACATGGTACATATTTGTTTT+TGG + Chr6:100129126-100129145 MsG0680035178.01.T01:intron 25.0%
!!! AGATTTTAATTTTGAAGCGA+AGG + Chr6:100129447-100129466 MsG0680035178.01.T01:CDS 25.0%
AAAAGTCAAATGAATGAGCT+AGG - Chr6:100130057-100130076 None:intergenic 30.0%
AAAGATCAGACTTACATGAA+CGG + Chr6:100129935-100129954 MsG0680035178.01.T01:CDS 30.0%
ATCAGTTTGACATAAACTAG+CGG - Chr6:100129350-100129369 None:intergenic 30.0%
ATTTCCTTCCTCTCAAAATT+TGG + Chr6:100129637-100129656 MsG0680035178.01.T01:intron 30.0%
CAAGATGAAATACAAGGATT+TGG + Chr6:100128838-100128857 MsG0680035178.01.T01:CDS 30.0%
CAAGATGTTTATGATGAACA+CGG - Chr6:100129021-100129040 None:intergenic 30.0%
CTATCATTATGAAAAGATGG+AGG - Chr6:100130011-100130030 None:intergenic 30.0%
GAAGAACAAGATGAAATACA+AGG + Chr6:100128832-100128851 MsG0680035178.01.T01:CDS 30.0%
GATGTGTTCTTTAATTCTAG+TGG + Chr6:100129181-100129200 MsG0680035178.01.T01:intron 30.0%
GTTATTTGAACTGCAGAAAA+AGG + Chr6:100129203-100129222 MsG0680035178.01.T01:intron 30.0%
GTTTGTTCCTAACAATACAT+TGG + Chr6:100129093-100129112 MsG0680035178.01.T01:CDS 30.0%
TGATACTCCAATGTATTGTT+AGG - Chr6:100129103-100129122 None:intergenic 30.0%
! ACATTGGAGTATCATTTACA+TGG + Chr6:100129109-100129128 MsG0680035178.01.T01:CDS 30.0%
! CGTTTGCATCTTTCTTTTAT+TGG + Chr6:100130297-100130316 MsG0680035178.01.T01:intron 30.0%
! TGCAATATCCAAATTTTGAG+AGG - Chr6:100129648-100129667 None:intergenic 30.0%
!! ATATCCAAATTTTGAGAGGA+AGG - Chr6:100129644-100129663 None:intergenic 30.0%
!! CACAAAGGTATTTATCCTAA+TGG + Chr6:100128923-100128942 MsG0680035178.01.T01:CDS 30.0%
!! TCAAATTTATTCTGAAGCCT+TGG - Chr6:100130441-100130460 None:intergenic 30.0%
AAAAGAATGCGAATTGCTGT+AGG + Chr6:100129248-100129267 MsG0680035178.01.T01:CDS 35.0%
AGAAAAAGGACTACCAACAT+TGG + Chr6:100129217-100129236 MsG0680035178.01.T01:intron 35.0%
AGTGAGAGAGAGAAAAAAGT+TGG - Chr6:100130202-100130221 None:intergenic 35.0%
ATCCTCCTTGAGTTAATAAC+TGG + Chr6:100129896-100129915 MsG0680035178.01.T01:CDS 35.0%
TATCCATGTTTCATCATCAC+AGG + Chr6:100130359-100130378 MsG0680035178.01.T01:intron 35.0%
! AATTGCTGCTTACAGGTATT+TGG + Chr6:100129811-100129830 MsG0680035178.01.T01:intron 35.0%
! AGTATCGAATTTCTGTTGAC+AGG + Chr6:100129523-100129542 MsG0680035178.01.T01:intron 35.0%
! CTTTTTGACCAATCCAATGT+TGG - Chr6:100129233-100129252 None:intergenic 35.0%
! TCATAAACATCTTGTTTCCC+TGG + Chr6:100129027-100129046 MsG0680035178.01.T01:CDS 35.0%
! TGTTGACAGGTTGCTAATTT+TGG + Chr6:100129536-100129555 MsG0680035178.01.T01:intron 35.0%
! TTTAACCGATAACTTTTCCG+AGG + Chr6:100128865-100128884 MsG0680035178.01.T01:CDS 35.0%
!! TAGGCATTGGATTAAGCTTT+GGG + Chr6:100128810-100128829 MsG0680035178.01.T01:CDS 35.0%
AAATGATTAAGTGAGACGGC+GGG + Chr6:100130254-100130273 MsG0680035178.01.T01:intron 40.0%
AAGGACTACCAACATTGGAT+TGG + Chr6:100129222-100129241 MsG0680035178.01.T01:CDS 40.0%
ACAGCAATCTTGTCACCATT+AGG - Chr6:100128941-100128960 None:intergenic 40.0%
ACCATACGAGTCATCTCATT+AGG - Chr6:100130465-100130484 None:intergenic 40.0%
ATGTTTCATCATCACAGGCT+AGG + Chr6:100130364-100130383 MsG0680035178.01.T01:intron 40.0%
CAAATGATTAAGTGAGACGG+CGG + Chr6:100130253-100130272 MsG0680035178.01.T01:intron 40.0%
CCATACGAGTCATCTCATTA+GGG - Chr6:100130464-100130483 None:intergenic 40.0%
CCTAATGCTTCAACTCAATC+AGG + Chr6:100128407-100128426 MsG0680035178.01.T01:CDS 40.0%
CTTAATCCAATGCCTAGAGA+AGG - Chr6:100128806-100128825 None:intergenic 40.0%
GACTTACATGAACGGTAGTT+TGG + Chr6:100129943-100129962 MsG0680035178.01.T01:CDS 40.0%
GCTGTTAAGCAACTAAAAGC+TGG + Chr6:100128956-100128975 MsG0680035178.01.T01:CDS 40.0%
GTCCAGTTATTAACTCAAGG+AGG - Chr6:100129901-100129920 None:intergenic 40.0%
GTCGTCCAGTTATTAACTCA+AGG - Chr6:100129904-100129923 None:intergenic 40.0%
GTTAAGCAACTAAAAGCTGG+AGG + Chr6:100128959-100128978 MsG0680035178.01.T01:CDS 40.0%
TAACGACAATGAGAACCTGA+TGG - Chr6:100128318-100128337 None:intergenic 40.0%
TAATGAGATGACTCGTATGG+TGG + Chr6:100130464-100130483 MsG0680035178.01.T01:CDS 40.0%
TAGATTCTCTGGTTGATCCA+AGG + Chr6:100130421-100130440 MsG0680035178.01.T01:CDS 40.0%
TCTCCACTTAAGCCATATTC+TGG - Chr6:100129839-100129858 None:intergenic 40.0%
! AAACATCTTGTTTCCCTGGT+TGG + Chr6:100129031-100129050 MsG0680035178.01.T01:CDS 40.0%
! AGGTATTTGGCTCCAGAATA+TGG + Chr6:100129824-100129843 MsG0680035178.01.T01:intron 40.0%
! AGTTGTCAATTGCTGCTTAC+AGG + Chr6:100129804-100129823 MsG0680035178.01.T01:intron 40.0%
! GTTAGCCTCGGAAAAGTTAT+CGG - Chr6:100128873-100128892 None:intergenic 40.0%
! TAGCCTGTGATGATGAAACA+TGG - Chr6:100130365-100130384 None:intergenic 40.0%
!! ACAGGTTGCTAATTTTGGTC+TGG + Chr6:100129541-100129560 MsG0680035178.01.T01:intron 40.0%
!! CCTGATTGAGTTGAAGCATT+AGG - Chr6:100128410-100128429 None:intergenic 40.0%
!! CTAGGCATTGGATTAAGCTT+TGG + Chr6:100128809-100128828 MsG0680035178.01.T01:CDS 40.0%
AATCCAATGCCTAGAGAAGG+AGG - Chr6:100128803-100128822 None:intergenic 45.0%
ACACGAGAATCAGAACCTGA+TGG - Chr6:100128533-100128552 None:intergenic 45.0%
ATGCGAATTGCTGTAGGATC+TGG + Chr6:100129254-100129273 MsG0680035178.01.T01:CDS 45.0%
ATTGCTGTAGGATCTGGGAA+AGG + Chr6:100129260-100129279 MsG0680035178.01.T01:CDS 45.0%
CACATTACCAGGCTCATCTT+TGG - Chr6:100130531-100130550 None:intergenic 45.0%
CATGATGCTCCAATTCCATC+AGG + Chr6:100128461-100128480 MsG0680035178.01.T01:CDS 45.0%
CCCTAATGAGATGACTCGTA+TGG + Chr6:100130461-100130480 MsG0680035178.01.T01:CDS 45.0%
CCTCATGCTTCAATTCCATC+AGG + Chr6:100128353-100128372 MsG0680035178.01.T01:CDS 45.0%
CCTGATGCTTCAATTCCATC+AGG + Chr6:100128515-100128534 MsG0680035178.01.T01:CDS 45.0%
CCTGATGGAATTGAAGCATG+AGG - Chr6:100128356-100128375 None:intergenic 45.0%
CTGGATGCTTCAATTCCATC+AGG + Chr6:100128300-100128319 MsG0680035178.01.T01:CDS 45.0%
GAACGGTAGTTTGGTTGAGT+GGG + Chr6:100129952-100129971 MsG0680035178.01.T01:CDS 45.0%
GATGGAATTGAAGCATGAGG+CGG - Chr6:100128353-100128372 None:intergenic 45.0%
GATGTTTCTCCTCGAGTGAT+GGG + Chr6:100129590-100129609 MsG0680035178.01.T01:CDS 45.0%
GCTCCAGAATATGGCTTAAG+TGG + Chr6:100129833-100129852 MsG0680035178.01.T01:CDS 45.0%
GGCTCAGGATCAAAACATTC+AGG + Chr6:100128761-100128780 MsG0680035178.01.T01:CDS 45.0%
GTTGACAGTTCTGCATGAGA+CGG - Chr6:100128707-100128726 None:intergenic 45.0%
TGAACGGTAGTTTGGTTGAG+TGG + Chr6:100129951-100129970 MsG0680035178.01.T01:CDS 45.0%
TGATGTTTCTCCTCGAGTGA+TGG + Chr6:100129589-100129608 MsG0680035178.01.T01:CDS 45.0%
TGCGAATTGCTGTAGGATCT+GGG + Chr6:100129255-100129274 MsG0680035178.01.T01:CDS 45.0%
! ATTGGAGCATCATGCTGCTT+TGG - Chr6:100128455-100128474 None:intergenic 45.0%
! CCTGATGGAATTGAAGCATC+AGG - Chr6:100128303-100128322 None:intergenic 45.0%
! GATGGAATTGAAGCATCAGG+CGG - Chr6:100128515-100128534 None:intergenic 45.0%
! GTTGAAGCATTAGGCTGCTT+TGG - Chr6:100128401-100128420 None:intergenic 45.0%
AGATCGACCAAAGATGAGCC+TGG + Chr6:100130521-100130540 MsG0680035178.01.T01:CDS 50.0%
AGTGCTGCAGTATCCAACCA+GGG - Chr6:100129047-100129066 None:intergenic 50.0%
ATTGAAGCATGAGGCGGCTT+TGG - Chr6:100128347-100128366 None:intergenic 50.0%
CCACAGCTGCTTACTAAAGG+AGG - Chr6:100128740-100128759 None:intergenic 50.0%
CCTCATGCTCCAATTCCATC+AGG + Chr6:100128677-100128696 MsG0680035178.01.T01:CDS 50.0%
CCTCCTTTAGTAAGCAGCTG+TGG + Chr6:100128737-100128756 MsG0680035178.01.T01:CDS 50.0%
CCTGATGGAATTGGAGCATG+AGG - Chr6:100128680-100128699 None:intergenic 50.0%
CCTTTAGTAAGCAGCTGTGG+CGG + Chr6:100128740-100128759 MsG0680035178.01.T01:CDS 50.0%
GAGGAGAAACATCAGTGTCG+AGG - Chr6:100129583-100129602 None:intergenic 50.0%
GATGGAATTGGAGCATGAGG+CGG - Chr6:100128677-100128696 None:intergenic 50.0%
GGATTTGGAGACGTGCACAA+AGG + Chr6:100128908-100128927 MsG0680035178.01.T01:CDS 50.0%
TGCAGAACTGTCAACGCCAT+CGG + Chr6:100128712-100128731 MsG0680035178.01.T01:CDS 50.0%
TTTACAGCACGGTCGAGCAA+AGG - Chr6:100130390-100130409 None:intergenic 50.0%
! CAAATCCACCTTTTCCGAGG+AGG - Chr6:100128895-100128914 None:intergenic 50.0%
! CTCCAAATCCACCTTTTCCG+AGG - Chr6:100128898-100128917 None:intergenic 50.0%
! CTCCTCGGAAAAGGTGGATT+TGG + Chr6:100128893-100128912 MsG0680035178.01.T01:CDS 50.0%
! GAAGCATTAGGCTGCTTTGG+CGG - Chr6:100128398-100128417 None:intergenic 50.0%
! TTTTCCGAGGCTAACCTCCT+CGG + Chr6:100128878-100128897 MsG0680035178.01.T01:CDS 50.0%
!! CTTACTAAAGGAGGCACCGA+TGG - Chr6:100128731-100128750 None:intergenic 50.0%
!! GATACTGCAGCACTGGTTCT+CGG + Chr6:100129053-100129072 MsG0680035178.01.T01:CDS 50.0%
!!! TTTTCCGAGGAGGTTAGCCT+CGG - Chr6:100128885-100128904 None:intergenic 50.0%
ACAGGAGAACGAGGTCCTGA+TGG - Chr6:100128371-100128390 None:intergenic 55.0%
ATTGGAGCATGAGGCGGCTT+TGG - Chr6:100128671-100128690 None:intergenic 55.0%
CAGTGCTGCAGTATCCAACC+AGG - Chr6:100129048-100129067 None:intergenic 55.0%
CCAATGCCTAGAGAAGGAGG+TGG - Chr6:100128800-100128819 None:intergenic 55.0%
CCACCTCCTTCTCTAGGCAT+TGG + Chr6:100128797-100128816 MsG0680035178.01.T01:CDS 55.0%
CCGCCACAGCTGCTTACTAA+AGG - Chr6:100128743-100128762 None:intergenic 55.0%
CTGCTTCCACCTCCTTCTCT+AGG + Chr6:100128791-100128810 MsG0680035178.01.T01:CDS 55.0%
CTGGTTGGATACTGCAGCAC+TGG + Chr6:100129046-100129065 MsG0680035178.01.T01:CDS 55.0%
GACGGAGGTCCTGATGGAAT+TGG - Chr6:100128473-100128492 None:intergenic 55.0%
GACGGCTGTCCTGATGGAAT+TGG - Chr6:100128689-100128708 None:intergenic 55.0%
GAGGCTAACCTCCTCGGAAA+AGG + Chr6:100128884-100128903 MsG0680035178.01.T01:CDS 55.0%
GCATCCAGCGCTACATGAGA+CGG - Chr6:100128288-100128307 None:intergenic 55.0%
GCTAACCTCCTCGGAAAAGG+TGG + Chr6:100128887-100128906 MsG0680035178.01.T01:CDS 55.0%
! ATTGAAGCATCAGGCGGCGT+TGG - Chr6:100128509-100128528 None:intergenic 55.0%
!! CCTCGAGTGATGGGCACTTT+CGG + Chr6:100129599-100129618 MsG0680035178.01.T01:CDS 55.0%
!! CTCGAGTGATGGGCACTTTC+GGG + Chr6:100129600-100129619 MsG0680035178.01.T01:CDS 55.0%
!! GGAGCATCATGCTGCTTTGG+CGG - Chr6:100128452-100128471 None:intergenic 55.0%
!! TTTGGCGGTGCTACACGAGA+CGG - Chr6:100128437-100128456 None:intergenic 55.0%
ACACGAGACGGAGGTCCTGA+TGG - Chr6:100128641-100128660 None:intergenic 60.0%
GCATGAGACGGCTGTCCTGA+TGG - Chr6:100128695-100128714 None:intergenic 60.0%
GTTGGCGATGCTACGCGAGA+CGG - Chr6:100128491-100128510 None:intergenic 60.0%
TCCAGCGCTACATGAGACGG+TGG - Chr6:100128285-100128304 None:intergenic 60.0%
! GAAGCATGAGGCGGCTTTGG+CGG - Chr6:100128344-100128363 None:intergenic 60.0%
!! ACTGCAGCACTGGTTCTCGG+AGG + Chr6:100129056-100129075 MsG0680035178.01.T01:CDS 60.0%
!! CCGAAAGTGCCCATCACTCG+AGG - Chr6:100129602-100129621 None:intergenic 60.0%
ACGCGAGACGGAGGTCCTGA+TGG - Chr6:100128479-100128498 None:intergenic 65.0%
GCCACCGTCTCATGTAGCGC+TGG + Chr6:100128281-100128300 MsG0680035178.01.T01:CDS 65.0%
GTAAGCAGCTGTGGCGGCTC+AGG + Chr6:100128746-100128765 MsG0680035178.01.T01:CDS 65.0%
! GGAGCATGAGGCGGCTTTGG+CGG - Chr6:100128668-100128687 None:intergenic 65.0%
!! GGCGGTGCTACACGAGAACG+AGG - Chr6:100128434-100128453 None:intergenic 65.0%
!! GGCGGTGCTACAGGAGAACG+AGG - Chr6:100128380-100128399 None:intergenic 65.0%
!! GGCTGCTTTGGCGGTGCTAC+AGG - Chr6:100128389-100128408 None:intergenic 65.0%
GGCGATGCTACGCGAGACGG+AGG - Chr6:100128488-100128507 None:intergenic 70.0%
!! GGCGGTGCTACACGAGACGG+AGG - Chr6:100128650-100128669 None:intergenic 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 100128275 100130551 100128275 ID=MsG0680035178.01;Name=MsG0680035178.01
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Gene Sequence

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Protein sequence

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FKATVSCSAGCFNSIRFSLSLEPPKPPHASIPSGPRSPVAPPKQPNASTQSGPRSRVAPPKQHDAPIPSGPPSRVASPTPPDASIPSGSDSRVEPPKQPNASTQSGPRSRVAPPKQHDAPIPSGPPSRVAPPKPPHAPIPSGQPSHAELSTPSVPPLVSSCGGSGSKHSGRKLLPPPSLGIGLSFGKNKMKYKDLEYLTDNFSEANLLGKGGFGDVHKGIYPNGDKIAVKQLKAGGESEFQAEVEIISRVHHKHLVSLVGYCSTGSRRLLAYEFVPNNTLEYHLHEKGLPTLDWSKRMRIAVGSGKGLAYLHEDCHDKIIHRDIKSANILLDFNFEAKVANFGLAKITSYLDTDVSPRVMGTFGYLAPEYGLSGELTDKSDVFSYGVILLELITGRQPIVKDQTYMNGSLVEWARPLLDRAVKNNNVDSLVDPRLQNKFDPNEMTRMVACAVACTHYSAIDRPKMSLVM*