AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680035352.01

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MsG0680035352.01.T01 AT2G11520 35.359 362 206 9 54 404 166 510 1.06e-55 192
MsG0680035352.01.T01 AT5G59700 40.339 295 151 7 107 392 475 753 1.07e-55 197
MsG0680035352.01.T01 AT1G52290 39.498 319 157 10 90 392 120 418 1.11e-55 192
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MsG0680035352.01.T01 AT1G07570 37.304 319 157 11 102 396 56 355 3.98e-52 180
MsG0680035352.01.T01 AT2G14440 36.721 305 160 9 98 391 550 832 4.03e-52 188
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MsG0680035352.01.T01 AT3G59420 37.294 303 162 7 102 392 500 786 9.46e-52 187
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MsG0680035352.01.T01 AT5G15080 34.465 383 208 14 35 394 63 425 2.02e-51 181
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MsG0680035352.01.T01 AT5G02290 36.677 319 159 12 100 394 54 353 2.50e-51 177
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MsG0680035352.01.T01 AT1G11050 33.548 310 175 6 102 392 283 580 6.96e-48 173
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MsG0680035352.01.T01 AT2G05940 36.250 320 152 13 102 395 75 368 1.22e-45 164
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MsG0680035352.01.T01 AT1G06700 35.294 306 165 8 106 394 60 349 1.39e-45 162
MsG0680035352.01.T01 AT2G23950 41.322 242 124 7 85 321 270 498 1.40e-45 165
MsG0680035352.01.T01 AT5G11020 34.043 329 183 11 97 410 124 433 1.59e-45 163
MsG0680035352.01.T01 AT1G51790 33.555 301 174 8 99 392 564 845 1.94e-45 169
MsG0680035352.01.T01 AT1G51790 33.555 301 174 8 99 392 564 845 1.94e-45 169
MsG0680035352.01.T01 AT5G47070 35.103 339 184 11 73 394 49 368 2.07e-45 162
MsG0680035352.01.T01 AT1G74490 36.275 306 165 11 102 394 79 367 2.13e-45 162
MsG0680035352.01.T01 AT4G04490 35.127 316 177 9 85 391 310 606 2.15e-45 167
MsG0680035352.01.T01 AT3G02130 35.333 300 170 6 104 395 864 1147 2.16e-45 169
MsG0680035352.01.T01 AT5G13160 34.060 367 203 13 47 391 11 360 2.26e-45 163
MsG0680035352.01.T01 AT3G28690 35.238 315 163 12 102 394 14 309 2.35e-45 161
MsG0680035352.01.T01 AT2G02220 34.884 344 176 11 71 394 693 1008 2.39e-45 169
MsG0680035352.01.T01 AT1G51790 33.555 301 174 8 99 392 616 897 2.49e-45 169
MsG0680035352.01.T01 AT3G02130 35.333 300 170 6 104 395 847 1130 2.49e-45 169
MsG0680035352.01.T01 AT1G70740 34.295 312 166 8 98 387 34 328 3.13e-45 162
MsG0680035352.01.T01 AT5G60300 34.884 301 167 8 98 388 328 609 3.36e-45 167
MsG0680035352.01.T01 AT5G60300 34.884 301 167 8 98 388 328 609 3.36e-45 167
MsG0680035352.01.T01 AT1G61440 34.754 305 171 8 100 393 464 751 3.38e-45 167
MsG0680035352.01.T01 AT1G61440 34.754 305 171 8 100 393 469 756 3.75e-45 167
MsG0680035352.01.T01 AT3G20530 36.190 315 155 12 102 394 70 360 3.97e-45 161
MsG0680035352.01.T01 AT1G61370 33.333 303 174 8 102 393 489 774 3.98e-45 167
MsG0680035352.01.T01 AT4G22130 34.426 305 173 9 99 391 239 528 4.10e-45 165
MsG0680035352.01.T01 AT1G24030 41.704 223 109 6 80 292 28 239 4.15e-45 157
MsG0680035352.01.T01 AT2G28940 36.025 322 156 12 102 394 90 390 4.31e-45 163
MsG0680035352.01.T01 AT3G28690 35.238 315 163 12 102 394 63 358 4.73e-45 162
MsG0680035352.01.T01 AT5G60300 34.884 301 167 8 98 388 328 609 4.73e-45 167
MsG0680035352.01.T01 AT2G28590 39.200 250 125 8 85 321 67 302 4.92e-45 159
MsG0680035352.01.T01 AT3G55550 33.766 308 166 9 101 392 333 618 5.03e-45 166
MsG0680035352.01.T01 AT3G55950 37.695 321 165 11 98 392 480 791 6.03e-45 167
MsG0680035352.01.T01 AT3G45430 35.235 298 168 7 99 388 329 609 6.31e-45 166
MsG0680035352.01.T01 AT3G45430 35.235 298 168 7 99 388 329 609 6.31e-45 166
MsG0680035352.01.T01 AT3G45430 35.235 298 168 7 99 388 329 609 6.31e-45 166
MsG0680035352.01.T01 AT4G04500 35.577 312 174 8 94 392 324 621 6.75e-45 165
MsG0680035352.01.T01 AT4G04570 41.778 225 110 5 101 317 171 382 6.82e-45 161
MsG0680035352.01.T01 AT3G28690 35.238 315 163 12 102 394 114 409 7.70e-45 162
MsG0680035352.01.T01 AT4G00340 35.390 308 163 10 102 392 451 739 9.41e-45 166
MsG0680035352.01.T01 AT4G00340 35.390 308 163 10 102 392 472 760 1.00e-44 166
MsG0680035352.01.T01 AT1G72300 35.179 307 169 9 106 400 795 1083 1.04e-44 167
MsG0680035352.01.T01 AT5G42440 33.775 302 170 9 105 394 72 355 1.05e-44 159
MsG0680035352.01.T01 AT1G17540 32.822 326 165 11 84 388 376 668 1.33e-44 165
MsG0680035352.01.T01 AT1G69270 32.523 329 180 8 90 395 227 536 1.42e-44 163
MsG0680035352.01.T01 AT2G37710 34.653 303 172 9 101 393 334 620 1.97e-44 164
MsG0680035352.01.T01 AT5G60270 35.197 304 164 9 101 391 328 611 2.34e-44 164
MsG0680035352.01.T01 AT2G25220 34.528 307 170 10 97 391 80 367 2.36e-44 159
MsG0680035352.01.T01 AT4G22130 34.426 305 173 9 99 391 380 669 2.39e-44 164
MsG0680035352.01.T01 AT1G78530 38.306 248 125 7 75 317 45 269 2.62e-44 156
MsG0680035352.01.T01 AT4G11530 34.853 307 171 8 99 393 337 626 2.64e-44 164
MsG0680035352.01.T01 AT1G61360 35.197 304 169 9 102 393 405 692 2.65e-44 165
MsG0680035352.01.T01 AT1G61360 35.197 304 169 9 102 393 405 692 2.65e-44 165
MsG0680035352.01.T01 AT1G61360 35.197 304 169 9 102 393 405 692 2.65e-44 165
MsG0680035352.01.T01 AT2G45910 35.294 306 162 11 102 398 469 747 2.79e-44 165
MsG0680035352.01.T01 AT2G45910 35.294 306 162 11 102 398 469 747 2.79e-44 165
MsG0680035352.01.T01 AT3G59350 33.968 315 175 8 106 403 63 361 2.83e-44 158
MsG0680035352.01.T01 AT5G63710 32.951 349 203 10 95 430 235 565 2.94e-44 162
MsG0680035352.01.T01 AT5G63710 32.951 349 203 10 95 430 235 565 2.94e-44 162
MsG0680035352.01.T01 AT4G11490 35.179 307 170 9 99 393 306 595 3.37e-44 163
MsG0680035352.01.T01 AT1G61360 35.197 304 169 9 102 393 486 773 3.69e-44 165
MsG0680035352.01.T01 AT1G52540 32.686 309 163 10 102 391 28 310 3.71e-44 157
MsG0680035352.01.T01 AT5G63710 32.951 349 203 10 95 430 271 601 3.97e-44 163
MsG0680035352.01.T01 AT1G55610 33.642 324 159 11 100 396 845 1139 4.45e-44 165
MsG0680035352.01.T01 AT1G55610 33.642 324 159 11 100 396 845 1139 4.45e-44 165
MsG0680035352.01.T01 AT5G63710 32.951 349 203 10 95 430 270 600 4.56e-44 162

Find 77 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 114 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AATGCTAAAGTTGCAGATTT+TGG 0.129832 6:-103054853 MsG0680035352.01.T01:CDS
GCTCTCAGAAAGCACTTAAA+TGG 0.238484 6:-103054432 MsG0680035352.01.T01:CDS
TCTACTATTGTCAAAGTTAC+TGG 0.274063 6:+103056081 None:intergenic
CAATGTTGGATTGGTTGTTC+TGG 0.276877 6:+103056146 None:intergenic
CGCTATGGATAAAATCCTTA+AGG 0.299726 6:-103054626 MsG0680035352.01.T01:CDS
AATGGTGTCTGTAGATTCTA+AGG 0.327468 6:-103056263 MsG0680035352.01.T01:CDS
CACTCTCACCAATGTTGGAT+TGG 0.330111 6:+103056137 None:intergenic
AAGCTTGTCGACCCGACTCT+TGG 0.357967 6:-103054592 MsG0680035352.01.T01:CDS
TTACAGCTTCGGAGTAATAT+TGG 0.372058 6:-103054713 MsG0680035352.01.T01:CDS
CTCTCAGAAAGCACTTAAAT+GGG 0.384507 6:-103054431 MsG0680035352.01.T01:CDS
TCAAAACCCTTTGTTAATGA+AGG 0.394643 6:+103056343 None:intergenic
GCTATGGATAAAATCCTTAA+GGG 0.399024 6:-103054625 MsG0680035352.01.T01:CDS
TGCAATAAAGCGCTTACATA+AGG 0.399489 6:-103055208 MsG0680035352.01.T01:CDS
TTACGAACATTGTCACCTTT+CGG 0.406415 6:-103054749 MsG0680035352.01.T01:CDS
GAAGGTCTCATGTCTCTTTG+AGG 0.411273 6:+103054499 None:intergenic
AAAAGTGATGTTTACAGCTT+CGG 0.418183 6:-103054724 MsG0680035352.01.T01:CDS
AGGACAAGTTCAAGATGTTA+AGG 0.421159 6:-103055188 MsG0680035352.01.T01:CDS
TTCTTCTCAAAATAATCATC+AGG 0.421834 6:+103054358 None:intergenic
GAAAATCTTGTTCAACTGTA+TGG 0.431424 6:-103055087 MsG0680035352.01.T01:CDS
CAAATGTAATGAATCAGTTC+CGG 0.436025 6:-103056233 MsG0680035352.01.T01:CDS
GCGGTGGCAGAGTTAGCATT+TGG 0.443763 6:-103054532 MsG0680035352.01.T01:CDS
GGTAATCGACAATGATCAAA+TGG 0.462008 6:-103056281 MsG0680035352.01.T01:CDS
TTTCTCACTCTCACCAATGT+TGG 0.464474 6:+103056132 None:intergenic
CGTGGCTGTGAGTTCTGAAA+AGG 0.469136 6:-103056302 MsG0680035352.01.T01:CDS
TTTGACAATAGTAGAATACT+TGG 0.476531 6:-103056073 MsG0680035352.01.T01:CDS
TTGGATTTCAATCAGACAGT+TGG 0.481885 6:-103054573 MsG0680035352.01.T01:CDS
ATACTTGGGAAGGGAGGCTA+TGG 0.486745 6:-103056058 MsG0680035352.01.T01:CDS
ACCGATCCTGCTGGAACTCC+AGG 0.487616 6:-103054790 MsG0680035352.01.T01:CDS
AACAGCCCTTCATTAACAAA+GGG 0.501459 6:-103056349 MsG0680035352.01.T01:CDS
CATGTTACAACCGATCCTGC+TGG 0.509845 6:-103054799 MsG0680035352.01.T01:CDS
GTGACAATGTTCGTAATACT+CGG 0.510938 6:+103054756 None:intergenic
TAACATGAGTGGCGCCGTGC+GGG 0.516060 6:+103054815 None:intergenic
CGAGAAGACACAGTTCCATT+CGG 0.520432 6:+103055015 None:intergenic
CTGATTGAAATCCAAGAGTC+GGG 0.520964 6:+103054581 None:intergenic
GGAGAAGGGTAGCAATTTCG+TGG 0.526317 6:-103056320 MsG0680035352.01.T01:CDS
CAAAACCCTTTGTTAATGAA+GGG 0.528201 6:+103056344 None:intergenic
AGTATTCAAAACCTCACTCA+TGG 0.531505 6:+103054477 None:intergenic
ACCTGGAGTTCCAGCAGGAT+CGG 0.534483 6:+103054789 None:intergenic
ATAGCGAAATCAGAAAGAAA+AGG 0.537134 6:+103054643 None:intergenic
GAGTGGCGCCGTGCGGGACA+AGG 0.539218 6:+103054821 None:intergenic
GTCTCAGAAATCACATTCAC+CGG 0.540757 6:+103056214 None:intergenic
AAACAGCCCTTCATTAACAA+AGG 0.545377 6:-103056350 MsG0680035352.01.T01:CDS
CTTATAGGAACACTTAAAGA+TGG 0.546035 6:-103055240 MsG0680035352.01.T01:intron
ATTACAAACTGCAAGTGCAC+TGG 0.551922 6:-103054947 MsG0680035352.01.T01:CDS
CACATCACGGTGGATAACAT+TGG 0.554711 6:+103054909 None:intergenic
GGCTATGGAACAGTTTACTC+TGG 0.558499 6:-103056043 MsG0680035352.01.T01:intron
GCTTCAGCACCATGACTACT+CGG 0.568005 6:+103056190 None:intergenic
AGCATCGATGATTGATTCGA+AGG 0.568434 6:-103056170 MsG0680035352.01.T01:CDS
AGACAGTTGGATAAGTGAAA+CGG 0.568548 6:-103054560 MsG0680035352.01.T01:CDS
ATATAACCTGGAGTTCCAGC+AGG 0.573126 6:+103054784 None:intergenic
TACTCGGGATCAATATAACC+TGG 0.573133 6:+103054772 None:intergenic
CAATAGTAGAATACTTGGGA+AGG 0.579176 6:-103056068 MsG0680035352.01.T01:CDS
TCTGATTGAAATCCAAGAGT+CGG 0.581484 6:+103054580 None:intergenic
TCTGAGACACCGAGTAGTCA+TGG 0.583164 6:-103056199 MsG0680035352.01.T01:CDS
GTAACATGAGTGGCGCCGTG+CGG 0.587745 6:+103054814 None:intergenic
TTCAAAACCTCACTCATGGA+AGG 0.595089 6:+103054481 None:intergenic
TTGTCACGCCTTGTCCCGCA+CGG 0.599694 6:-103054829 MsG0680035352.01.T01:CDS
AAGTGAAACGGTAGGTGCGG+TGG 0.606023 6:-103054548 MsG0680035352.01.T01:CDS
GTGCAAGAATATGTTCCGAA+TGG 0.607188 6:-103055030 MsG0680035352.01.T01:CDS
CATGAGACCTTCCATGAGTG+AGG 0.610487 6:-103054488 MsG0680035352.01.T01:CDS
TTGACAATAGTAGAATACTT+GGG 0.611917 6:-103056072 MsG0680035352.01.T01:CDS
CAGAACAACCAATCCAACAT+TGG 0.618453 6:-103056145 MsG0680035352.01.T01:CDS
AGTAGAATACTTGGGAAGGG+AGG 0.618948 6:-103056064 MsG0680035352.01.T01:CDS
TGACAATGTTCGTAATACTC+GGG 0.620060 6:+103054757 None:intergenic
GTTGCATGATAATAAGCTTG+AGG 0.620862 6:-103055166 MsG0680035352.01.T01:CDS
AGAAGTAGTTCACGTGTCTG+AGG 0.621480 6:+103055054 None:intergenic
AATAGTAGAATACTTGGGAA+GGG 0.626455 6:-103056067 MsG0680035352.01.T01:CDS
CGTTTAGTCGAGTAGACCAC+GGG 0.628393 6:+103054974 None:intergenic
GCGTGACACAATGTGAACTT+CGG 0.641215 6:+103054384 None:intergenic
TTCATAAACACAAGTTCCCG+TGG 0.644958 6:-103054990 MsG0680035352.01.T01:CDS
GCATGATAATAAGCTTGAGG+AGG 0.652584 6:-103055163 MsG0680035352.01.T01:CDS
TTTCAATGTTAACTCGCATG+AGG 0.653667 6:-103055113 MsG0680035352.01.T01:CDS
GATAAGTGAAACGGTAGGTG+CGG 0.660372 6:-103054551 MsG0680035352.01.T01:CDS
TCTCAGAAAGCACTTAAATG+GGG 0.684044 6:-103054430 MsG0680035352.01.T01:CDS
AGGATCGGTTGTAACATGAG+TGG 0.685779 6:+103054804 None:intergenic
ACGTTTAGTCGAGTAGACCA+CGG 0.689913 6:+103054973 None:intergenic
AGTTGGATAAGTGAAACGGT+AGG 0.713888 6:-103054556 MsG0680035352.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! CAATTTTGTTAATATCTTAT+AGG - Chr6:103055511-103055530 MsG0680035352.01.T01:intron 15.0%
!! TTACACAAAAAAGAGAAAAT+CGG + Chr6:103054366-103054385 None:intergenic 20.0%
!!! TTGCAGTTATTTTTAAATTG+CGG - Chr6:103055195-103055214 MsG0680035352.01.T01:CDS 20.0%
! ACTTGAAAGTTGAAATAAAG+TGG + Chr6:103054758-103054777 None:intergenic 25.0%
! AGAATTCGTTTAGAGAAAAA+AGG - Chr6:103055112-103055131 MsG0680035352.01.T01:CDS 25.0%
! AGTATCATATTCAATATAGG+AGG + Chr6:103055459-103055478 None:intergenic 25.0%
! ATAAAAACGAACGAGTTTAA+AGG + Chr6:103055302-103055321 None:intergenic 25.0%
! ATACATGACAGAAAAATTTG+AGG + Chr6:103055371-103055390 None:intergenic 25.0%
! CTATATTGAATATGATACTG+AGG - Chr6:103055460-103055479 MsG0680035352.01.T01:intron 25.0%
! CTCAGTATCATATTCAATAT+AGG + Chr6:103055462-103055481 None:intergenic 25.0%
! TTAAATTGCGGTTACAAAAT+GGG - Chr6:103055207-103055226 MsG0680035352.01.T01:CDS 25.0%
! TTCTTCTCAAAATAATCATC+AGG + Chr6:103056411-103056430 None:intergenic 25.0%
! TTGACAATAGTAGAATACTT+GGG - Chr6:103054694-103054713 MsG0680035352.01.T01:CDS 25.0%
! TTTAAATTGCGGTTACAAAA+TGG - Chr6:103055206-103055225 MsG0680035352.01.T01:CDS 25.0%
! TTTGACAATAGTAGAATACT+TGG - Chr6:103054693-103054712 MsG0680035352.01.T01:CDS 25.0%
!!! TATTACTAGTTTTCACATCA+CGG + Chr6:103055873-103055892 None:intergenic 25.0%
!!! TGTTTTTTATAGTTGAAGAG+AGG - Chr6:103054873-103054892 MsG0680035352.01.T01:CDS 25.0%
AAAAGTGATGTTTACAGCTT+CGG - Chr6:103056042-103056061 MsG0680035352.01.T01:intron 30.0%
AATAGTAGAATACTTGGGAA+GGG - Chr6:103054699-103054718 MsG0680035352.01.T01:CDS 30.0%
ACATAATATTGAAGTTTCCG+TGG + Chr6:103055073-103055092 None:intergenic 30.0%
ATAGCGAAATCAGAAAGAAA+AGG + Chr6:103056126-103056145 None:intergenic 30.0%
CAAAACCCTTTGTTAATGAA+GGG + Chr6:103054425-103054444 None:intergenic 30.0%
CAAATGTAATGAATCAGTTC+CGG - Chr6:103054533-103054552 MsG0680035352.01.T01:CDS 30.0%
CAGTTCATAAAGCAGTTTAT+CGG + Chr6:103054825-103054844 None:intergenic 30.0%
CTTATAGGAACACTTAAAGA+TGG - Chr6:103055526-103055545 MsG0680035352.01.T01:intron 30.0%
CTTCTCAGCTATTAATTGAA+AGG + Chr6:103055343-103055362 None:intergenic 30.0%
GAAAATCTTGTTCAACTGTA+TGG - Chr6:103055679-103055698 MsG0680035352.01.T01:intron 30.0%
GCTATGGATAAAATCCTTAA+GGG - Chr6:103056141-103056160 MsG0680035352.01.T01:CDS 30.0%
TAAACATACCTTTAGTACCA+CGG - Chr6:103055053-103055072 MsG0680035352.01.T01:CDS 30.0%
TCAAAACCCTTTGTTAATGA+AGG + Chr6:103054426-103054445 None:intergenic 30.0%
TCTACTATTGTCAAAGTTAC+TGG + Chr6:103054688-103054707 None:intergenic 30.0%
TTGAATATGATACTGAGGAT+TGG - Chr6:103055465-103055484 MsG0680035352.01.T01:intron 30.0%
! AATGCTAAAGTTGCAGATTT+TGG - Chr6:103055913-103055932 MsG0680035352.01.T01:intron 30.0%
! TTCATTAACAAAGGGTTTTG+AGG - Chr6:103054425-103054444 MsG0680035352.01.T01:CDS 30.0%
! TTTTCTTTCTGATTTCGCTA+TGG - Chr6:103056125-103056144 MsG0680035352.01.T01:CDS 30.0%
!! AAACATCACTTTTATCCGAA+AGG + Chr6:103056035-103056054 None:intergenic 30.0%
AAACAGCCCTTCATTAACAA+AGG - Chr6:103054416-103054435 MsG0680035352.01.T01:CDS 35.0%
AACAGCCCTTCATTAACAAA+GGG - Chr6:103054417-103054436 MsG0680035352.01.T01:CDS 35.0%
AATGGTGTCTGTAGATTCTA+AGG - Chr6:103054503-103054522 MsG0680035352.01.T01:CDS 35.0%
AGACAGTTGGATAAGTGAAA+CGG - Chr6:103056206-103056225 MsG0680035352.01.T01:CDS 35.0%
AGGACAAGTTCAAGATGTTA+AGG - Chr6:103055578-103055597 MsG0680035352.01.T01:intron 35.0%
AGTATTCAAAACCTCACTCA+TGG + Chr6:103056292-103056311 None:intergenic 35.0%
CAATAGTAGAATACTTGGGA+AGG - Chr6:103054698-103054717 MsG0680035352.01.T01:CDS 35.0%
CGCTATGGATAAAATCCTTA+AGG - Chr6:103056140-103056159 MsG0680035352.01.T01:CDS 35.0%
GGTAATCGACAATGATCAAA+TGG - Chr6:103054485-103054504 MsG0680035352.01.T01:CDS 35.0%
GTGACAATGTTCGTAATACT+CGG + Chr6:103056013-103056032 None:intergenic 35.0%
GTTGCATGATAATAAGCTTG+AGG - Chr6:103055600-103055619 MsG0680035352.01.T01:intron 35.0%
GTTTAAAGGAGATGCATTGT+CGG + Chr6:103055288-103055307 None:intergenic 35.0%
TCTGATTGAAATCCAAGAGT+CGG + Chr6:103056189-103056208 None:intergenic 35.0%
TGACAATGTTCGTAATACTC+GGG + Chr6:103056012-103056031 None:intergenic 35.0%
TTACAGCTTCGGAGTAATAT+TGG - Chr6:103056053-103056072 MsG0680035352.01.T01:CDS 35.0%
TTACGAACATTGTCACCTTT+CGG - Chr6:103056017-103056036 MsG0680035352.01.T01:intron 35.0%
TTGGATTTCAATCAGACAGT+TGG - Chr6:103056193-103056212 MsG0680035352.01.T01:CDS 35.0%
TTTCAATGTTAACTCGCATG+AGG - Chr6:103055653-103055672 MsG0680035352.01.T01:intron 35.0%
TTTGTCACGTAGTCTATCAT+AGG + Chr6:103055430-103055449 None:intergenic 35.0%
! ACTCTTGAGAGCATAAAAAG+TGG - Chr6:103056309-103056328 MsG0680035352.01.T01:CDS 35.0%
! GAAGTATCATGAGTTCTCAT+TGG - Chr6:103055238-103055257 MsG0680035352.01.T01:intron 35.0%
! TGCAATAAAGCGCTTACATA+AGG - Chr6:103055558-103055577 MsG0680035352.01.T01:intron 35.0%
! TTTTCATCTTCGCTAAATGC+AGG + Chr6:103056099-103056118 None:intergenic 35.0%
! TTTTTCTTTCCAGTTCCATC+AGG + Chr6:103054399-103054418 None:intergenic 35.0%
!! CTCTCAGAAAGCACTTAAAT+GGG - Chr6:103056335-103056354 MsG0680035352.01.T01:CDS 35.0%
!! TCTCAGAAAGCACTTAAATG+GGG - Chr6:103056336-103056355 MsG0680035352.01.T01:CDS 35.0%
AGTTGGATAAGTGAAACGGT+AGG - Chr6:103056210-103056229 MsG0680035352.01.T01:CDS 40.0%
ATTACAAACTGCAAGTGCAC+TGG - Chr6:103055819-103055838 MsG0680035352.01.T01:intron 40.0%
CAGAACAACCAATCCAACAT+TGG - Chr6:103054621-103054640 MsG0680035352.01.T01:CDS 40.0%
CATGAGTTCTCATTGGATGT+CGG - Chr6:103055245-103055264 MsG0680035352.01.T01:intron 40.0%
CTGATTGAAATCCAAGAGTC+GGG + Chr6:103056188-103056207 None:intergenic 40.0%
GCATGATAATAAGCTTGAGG+AGG - Chr6:103055603-103055622 MsG0680035352.01.T01:intron 40.0%
GTCTCAGAAATCACATTCAC+CGG + Chr6:103054555-103054574 None:intergenic 40.0%
GTGCAAGAATATGTTCCGAA+TGG - Chr6:103055736-103055755 MsG0680035352.01.T01:intron 40.0%
TACTCGGGATCAATATAACC+TGG + Chr6:103055997-103056016 None:intergenic 40.0%
TGAAGTTTCCGTGGTACTAA+AGG + Chr6:103055064-103055083 None:intergenic 40.0%
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TTCATAAACACAAGTTCCCG+TGG - Chr6:103055776-103055795 MsG0680035352.01.T01:intron 40.0%
TTTCTCACTCTCACCAATGT+TGG + Chr6:103054637-103054656 None:intergenic 40.0%
! GGTTACAAAATGGGCTTACA+TGG - Chr6:103055216-103055235 MsG0680035352.01.T01:CDS 40.0%
!! AGCATCGATGATTGATTCGA+AGG - Chr6:103054596-103054615 MsG0680035352.01.T01:CDS 40.0%
!! CAATGTTGGATTGGTTGTTC+TGG + Chr6:103054623-103054642 None:intergenic 40.0%
!! GCTCTCAGAAAGCACTTAAA+TGG - Chr6:103056334-103056353 MsG0680035352.01.T01:CDS 40.0%
!! TGTAACTGTTTTTCGCCTGA+TGG - Chr6:103054381-103054400 MsG0680035352.01.T01:CDS 40.0%
!!! AACAAAGGGTTTTGAGGAGA+AGG - Chr6:103054431-103054450 MsG0680035352.01.T01:CDS 40.0%
!!! ACAAAGGGTTTTGAGGAGAA+GGG - Chr6:103054432-103054451 MsG0680035352.01.T01:CDS 40.0%
!!! TACTAGTTTTCACATCACGG+TGG + Chr6:103055870-103055889 None:intergenic 40.0%
ACGTTTAGTCGAGTAGACCA+CGG + Chr6:103055796-103055815 None:intergenic 45.0%
AGAAGTAGTTCACGTGTCTG+AGG + Chr6:103055715-103055734 None:intergenic 45.0%
AGGATCGGTTGTAACATGAG+TGG + Chr6:103055965-103055984 None:intergenic 45.0%
AGTAGAATACTTGGGAAGGG+AGG - Chr6:103054702-103054721 MsG0680035352.01.T01:CDS 45.0%
ATATAACCTGGAGTTCCAGC+AGG + Chr6:103055985-103056004 None:intergenic 45.0%
CACATCACGGTGGATAACAT+TGG + Chr6:103055860-103055879 None:intergenic 45.0%
CACTCTCACCAATGTTGGAT+TGG + Chr6:103054632-103054651 None:intergenic 45.0%
CGAGAAGACACAGTTCCATT+CGG + Chr6:103055754-103055773 None:intergenic 45.0%
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GATAAGTGAAACGGTAGGTG+CGG - Chr6:103056215-103056234 MsG0680035352.01.T01:CDS 45.0%
GCGTGACACAATGTGAACTT+CGG + Chr6:103056385-103056404 None:intergenic 45.0%
GGCTATGGAACAGTTTACTC+TGG - Chr6:103054723-103054742 MsG0680035352.01.T01:CDS 45.0%
! TGTTTTTCGCCTGATGGAAC+TGG - Chr6:103054387-103054406 MsG0680035352.01.T01:CDS 45.0%
!!! GCTTTTCGAGTTGTCCCTTA+AGG + Chr6:103056158-103056177 None:intergenic 45.0%
ATACTTGGGAAGGGAGGCTA+TGG - Chr6:103054708-103054727 MsG0680035352.01.T01:CDS 50.0%
CATGAGACCTTCCATGAGTG+AGG - Chr6:103056278-103056297 MsG0680035352.01.T01:CDS 50.0%
CATGTTACAACCGATCCTGC+TGG - Chr6:103055967-103055986 MsG0680035352.01.T01:intron 50.0%
CGTTTAGTCGAGTAGACCAC+GGG + Chr6:103055795-103055814 None:intergenic 50.0%
GCTTCAGCACCATGACTACT+CGG + Chr6:103054579-103054598 None:intergenic 50.0%
GGAGAAGGGTAGCAATTTCG+TGG - Chr6:103054446-103054465 MsG0680035352.01.T01:CDS 50.0%
! TCTGAGACACCGAGTAGTCA+TGG - Chr6:103054567-103054586 MsG0680035352.01.T01:CDS 50.0%
!! CGTGGCTGTGAGTTCTGAAA+AGG - Chr6:103054464-103054483 MsG0680035352.01.T01:CDS 50.0%
AAGCTTGTCGACCCGACTCT+TGG - Chr6:103056174-103056193 MsG0680035352.01.T01:CDS 55.0%
AAGTGAAACGGTAGGTGCGG+TGG - Chr6:103056218-103056237 MsG0680035352.01.T01:CDS 55.0%
ACCTGGAGTTCCAGCAGGAT+CGG + Chr6:103055980-103055999 None:intergenic 55.0%
GCGGTGGCAGAGTTAGCATT+TGG - Chr6:103056234-103056253 MsG0680035352.01.T01:CDS 55.0%
ACCGATCCTGCTGGAACTCC+AGG - Chr6:103055976-103055995 MsG0680035352.01.T01:intron 60.0%
GTAACATGAGTGGCGCCGTG+CGG + Chr6:103055955-103055974 None:intergenic 60.0%
TAACATGAGTGGCGCCGTGC+GGG + Chr6:103055954-103055973 None:intergenic 60.0%
TTGTCACGCCTTGTCCCGCA+CGG - Chr6:103055937-103055956 MsG0680035352.01.T01:intron 60.0%
GAGTGGCGCCGTGCGGGACA+AGG + Chr6:103055948-103055967 None:intergenic 75.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 103054354 103056434 103054354 ID=MsG0680035352.01;Name=MsG0680035352.01
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Chr6 exon 103056044 103056434 103056044 ID=MsG0680035352.01.T01:exon:21039;Parent=MsG0680035352.01.T01
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Chr6 CDS 103056044 103056434 103056044 ID=MsG0680035352.01.T01:cds;Parent=MsG0680035352.01.T01
Chr6 CDS 103054354 103055255 103054354 ID=MsG0680035352.01.T01:cds;Parent=MsG0680035352.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680035352.01.T01

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Protein sequence

>MsG0680035352.01.T01

LVIPIFSFLCNCFSPDGTGKKNSPSLTKGFEEKGSNFVAVSSEKVIDNDQMVSVDSKVTSKCNESVPVNVISETPSSHGAEASMIDSKVQNNQSNIGESEKFKYSELEEATSNFDNSRILGKGGYGTVYSGTLKDGRLVAIKRLHKDKFKMLRLHDNKLEEETLRKFINEVSMLTRMRHENLVQLYGCTSPQTRELLLVQEYVPNGTVSSRLHKHKFPWSTRLNVALQTASALAYLHASNVIHRDVKTSNILLDKSLNAKVADFGLSRLVPHGATHVTTDPAGTPGYIDPEYYEHCHLSDKSDVYSFGVILVELISSLPAFSEDEKQPFLSDFAMDKILKGQLEKLVDPTLGFQSDSWISETVGAVAELAFGCLQPQRDMRPSMSEVLNTLESIKSGSSQKALKWGSNHCYNATEVHIVSRLPDDYFEKK*