AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680035401.01

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MsG0680035401.01.T01 AT1G56145 37.160 331 166 6 24 314 663 991 8.73e-68 229
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MsG0680035401.01.T01 AT1G29740 44.211 285 144 3 34 305 665 947 4.61e-67 227
MsG0680035401.01.T01 AT1G29750 41.115 287 157 2 33 307 653 939 4.99e-67 226
MsG0680035401.01.T01 AT1G29750 41.115 287 157 2 33 307 668 954 6.05e-67 226
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MsG0680035401.01.T01 AT5G24080 39.446 289 161 4 34 310 393 679 2.53e-61 208
MsG0680035401.01.T01 AT3G26940 35.625 320 188 3 9 310 37 356 2.90e-61 201
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MsG0680035401.01.T01 AT1G60800 37.662 308 174 4 15 308 274 577 4.97e-60 202
MsG0680035401.01.T01 AT4G33430 36.280 328 182 6 1 308 293 613 1.13e-59 202
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MsG0680035401.01.T01 AT5G10290 36.735 294 171 3 30 308 274 567 2.32e-58 197
MsG0680035401.01.T01 AT4G23320 35.669 314 181 4 10 306 147 456 2.37e-58 196
MsG0680035401.01.T01 AT4G23320 35.669 314 181 4 10 306 147 456 2.37e-58 196
MsG0680035401.01.T01 AT4G23320 36.156 307 175 4 17 306 175 477 2.92e-58 196
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MsG0680035401.01.T01 AT4G23270 37.241 290 167 3 34 309 314 602 1.01e-57 196
MsG0680035401.01.T01 AT1G67520 35.667 300 177 4 24 308 237 535 1.16e-57 195
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MsG0680035401.01.T01 AT5G18500 36.585 287 170 2 34 308 154 440 1.27e-57 193
MsG0680035401.01.T01 AT5G18500 36.585 287 170 2 34 308 154 440 1.27e-57 193
MsG0680035401.01.T01 AT5G18500 36.585 287 170 2 34 308 154 440 1.27e-57 193
MsG0680035401.01.T01 AT5G18500 36.585 287 170 2 34 308 154 440 1.27e-57 193
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MsG0680035401.01.T01 AT1G67520 35.667 300 177 4 24 308 266 564 1.84e-57 195
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MsG0680035401.01.T01 AT1G09440 36.066 305 178 4 20 308 128 431 2.48e-57 192
MsG0680035401.01.T01 AT3G24550 36.076 316 176 8 20 315 257 566 4.08e-57 195
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MsG0680035401.01.T01 AT1G56720 35.197 304 182 3 20 308 150 453 8.58e-56 188
MsG0680035401.01.T01 AT1G56720 35.197 304 182 3 20 308 150 453 8.58e-56 188
MsG0680035401.01.T01 AT1G11303 37.413 286 172 3 30 309 493 777 9.45e-56 194
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MsG0680035401.01.T01 AT4G11490 34.247 292 169 5 34 307 309 595 2.63e-55 190
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MsG0680035401.01.T01 AT4G21400 38.276 290 160 4 33 305 348 635 4.46e-55 190
MsG0680035401.01.T01 AT4G23190 34.564 298 178 3 26 307 330 626 5.05e-55 190
MsG0680035401.01.T01 AT4G11470 35.017 297 178 3 24 306 322 617 5.77e-55 189
MsG0680035401.01.T01 AT4G11470 35.017 297 178 3 24 306 317 612 6.05e-55 189
MsG0680035401.01.T01 AT1G07870 35.690 297 176 4 24 305 81 377 6.23e-55 184
MsG0680035401.01.T01 AT4G23310 35.404 322 185 5 7 306 461 781 6.62e-55 191
MsG0680035401.01.T01 AT5G38560 36.120 299 171 5 25 305 318 614 8.72e-55 189
MsG0680035401.01.T01 AT4G23220 35.906 298 170 5 27 305 313 608 9.49e-55 189
MsG0680035401.01.T01 AT4G11530 34.237 295 179 3 26 306 332 625 1.02e-54 189
MsG0680035401.01.T01 AT4G23200 35.135 296 177 3 25 306 315 609 1.89e-54 188
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MsG0680035401.01.T01 AT1G11340 37.847 288 166 4 30 305 499 785 2.68e-54 189
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MsG0680035401.01.T01 AT5G65240 35.374 294 175 3 30 308 268 561 4.06e-54 187
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MsG0680035401.01.T01 AT1G34210 35.410 305 178 4 19 308 282 582 4.26e-54 186
MsG0680035401.01.T01 AT1G29730 45.581 215 113 2 34 245 628 841 4.37e-54 189
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MsG0680035401.01.T01 AT2G13800 35.390 308 180 4 16 308 132 435 6.74e-54 183
MsG0680035401.01.T01 AT4G23280 36.897 290 162 4 34 306 332 617 7.62e-54 186
MsG0680035401.01.T01 AT4G23280 36.897 290 162 4 34 306 330 615 8.32e-54 186
MsG0680035401.01.T01 AT4G11900 37.857 280 160 3 42 308 533 811 9.14e-54 188
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MsG0680035401.01.T01 AT2G02800 35.294 306 171 6 24 305 61 363 3.29e-53 180
MsG0680035401.01.T01 AT2G13800 35.390 308 180 4 16 308 249 552 4.43e-53 183
MsG0680035401.01.T01 AT2G13800 35.390 308 180 4 16 308 249 552 4.43e-53 183
MsG0680035401.01.T01 AT5G40380 37.847 288 163 5 34 306 303 589 4.69e-53 184
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MsG0680035401.01.T01 AT4G04540 37.050 278 166 4 42 311 320 596 1.35e-52 182
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MsG0680035401.01.T01 AT1G55610 37.113 291 167 5 31 305 844 1134 6.15e-52 184
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MsG0680035401.01.T01 AT1G68690 35.862 290 165 5 33 305 364 649 7.16e-52 182
MsG0680035401.01.T01 AT4G00970 36.864 236 142 2 26 255 324 558 7.21e-52 179
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MsG0680035401.01.T01 AT5G02290 34.591 318 174 7 24 313 46 357 1.32e-51 175
MsG0680035401.01.T01 AT1G23540 35.640 289 166 5 34 305 359 644 1.36e-51 181
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MsG0680035401.01.T01 AT4G23210 34.014 294 180 4 25 307 339 629 3.32e-51 179
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MsG0680035401.01.T01 AT4G34440 34.797 296 174 5 33 312 299 591 3.77e-51 179
MsG0680035401.01.T01 AT2G28930 35.621 306 172 6 24 305 47 351 3.99e-51 174
MsG0680035401.01.T01 AT1G11330 35.780 327 183 6 8 308 471 796 4.29e-51 181
MsG0680035401.01.T01 AT1G61390 35.690 297 179 3 21 306 495 790 4.47e-51 181
MsG0680035401.01.T01 AT1G11330 37.000 300 170 4 27 308 500 798 4.51e-51 181
MsG0680035401.01.T01 AT1G07570 33.728 338 189 6 8 315 28 360 4.62e-51 174
MsG0680035401.01.T01 AT1G07570 33.728 338 189 6 8 315 28 360 4.62e-51 174
MsG0680035401.01.T01 AT1G07570 33.728 338 189 6 8 315 28 360 4.62e-51 174
MsG0680035401.01.T01 AT2G28930 35.621 306 172 6 24 305 58 362 4.92e-51 174
MsG0680035401.01.T01 AT2G28930 35.621 306 172 6 24 305 50 354 5.00e-51 174
MsG0680035401.01.T01 AT1G11410 37.299 311 176 6 12 305 461 769 5.04e-51 181
MsG0680035401.01.T01 AT1G07570 33.728 338 189 6 8 315 39 371 5.46e-51 174
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MsG0680035401.01.T01 AT3G59350 35.238 315 183 5 10 305 94 406 1.03e-48 168
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MsG0680035401.01.T01 AT5G54590 34.247 292 182 4 26 311 95 382 3.28e-48 167
MsG0680035401.01.T01 AT2G04300 31.596 307 190 6 10 302 507 807 3.85e-48 172
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MsG0680035401.01.T01 AT2G04300 31.596 307 190 6 10 302 548 848 5.81e-48 172
MsG0680035401.01.T01 AT2G28970 32.867 286 172 5 34 305 469 748 6.15e-48 171
MsG0680035401.01.T01 AT4G23300 32.441 299 183 4 26 307 333 629 6.26e-48 170
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MsG0680035401.01.T01 AT2G30740 33.016 315 190 5 10 305 37 349 4.79e-47 162
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MsG0680035401.01.T01 AT5G01550 32.119 302 194 5 21 311 354 655 6.48e-47 168
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MsG0680035401.01.T01 AT1G61430 39.352 216 126 2 31 242 451 665 6.03e-46 165
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MsG0680035401.01.T01 AT1G51860 33.876 307 177 7 13 305 414 708 8.02e-46 165
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MsG0680035401.01.T01 AT1G06700 33.559 295 177 4 30 305 52 346 8.89e-46 159
MsG0680035401.01.T01 AT1G61610 38.528 231 135 4 21 245 498 727 1.22e-45 165
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MsG0680035401.01.T01 AT1G77280 32.288 319 195 6 12 311 367 683 1.24e-45 165
MsG0680035401.01.T01 AT4G28670 31.773 299 183 5 27 307 312 607 1.31e-45 164
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MsG0680035401.01.T01 AT1G11050 35.974 303 169 7 34 311 283 585 1.54e-45 163
MsG0680035401.01.T01 AT5G15730 31.802 283 185 4 26 305 96 373 1.57e-45 160
MsG0680035401.01.T01 AT1G61550 34.021 291 178 3 34 311 477 766 1.59e-45 165
MsG0680035401.01.T01 AT1G61440 31.661 319 179 4 31 311 468 785 1.67e-45 165
MsG0680035401.01.T01 AT4G04570 40.097 207 119 2 42 244 344 549 1.77e-45 162
MsG0680035401.01.T01 AT1G11330 40.351 228 126 3 27 245 500 726 1.83e-45 164
MsG0680035401.01.T01 AT4G20450 34.516 310 177 7 10 305 563 860 2.19e-45 165
MsG0680035401.01.T01 AT4G02420 33.449 287 175 5 36 308 340 624 2.69e-45 163
MsG0680035401.01.T01 AT2G29000 32.803 314 191 5 6 305 527 834 2.71e-45 164
MsG0680035401.01.T01 AT4G04540 40.580 207 118 2 42 244 349 554 3.40e-45 162
MsG0680035401.01.T01 AT5G15730 31.802 283 187 4 26 305 96 375 3.77e-45 159
MsG0680035401.01.T01 AT5G15730 31.802 283 187 4 26 305 96 375 3.77e-45 159
MsG0680035401.01.T01 AT5G35960 34.028 288 176 5 32 309 120 403 4.10e-45 159
MsG0680035401.01.T01 AT1G72300 34.783 299 177 4 22 305 779 1074 5.99e-45 164
MsG0680035401.01.T01 AT1G51850 31.190 311 191 6 9 302 540 844 6.24e-45 164
MsG0680035401.01.T01 AT1G51850 31.190 311 191 6 9 302 520 824 6.51e-45 163
MsG0680035401.01.T01 AT4G32000 32.770 296 186 3 31 314 114 408 7.64e-45 158
MsG0680035401.01.T01 AT2G47060 30.612 343 186 6 13 305 41 381 7.75e-45 157
MsG0680035401.01.T01 AT4G32000 32.770 296 186 3 31 314 115 409 7.79e-45 158
MsG0680035401.01.T01 AT1G61590 34.130 293 169 5 38 309 91 380 9.44e-45 157
MsG0680035401.01.T01 AT2G28990 32.143 308 188 6 12 305 546 846 9.54e-45 163
MsG0680035401.01.T01 AT2G28990 32.143 308 188 6 12 305 546 846 9.54e-45 163
MsG0680035401.01.T01 AT4G02410 32.753 287 177 5 36 308 345 629 9.74e-45 162
MsG0680035401.01.T01 AT2G28590 35.385 260 162 3 17 271 69 327 1.15e-44 155
MsG0680035401.01.T01 AT2G47060 36.515 241 142 4 11 242 39 277 1.36e-44 155
MsG0680035401.01.T01 AT2G18890 34.194 310 176 8 21 308 37 340 1.43e-44 156
MsG0680035401.01.T01 AT1G34300 32.787 305 185 8 22 311 463 762 1.50e-44 162
MsG0680035401.01.T01 AT5G16900 32.248 307 194 4 10 305 353 656 1.51e-44 161
MsG0680035401.01.T01 AT2G19190 32.423 293 181 5 25 305 555 842 2.01e-44 162
MsG0680035401.01.T01 AT3G17410 33.445 299 178 5 26 305 49 345 2.05e-44 155
MsG0680035401.01.T01 AT3G17410 33.445 299 178 5 26 305 49 345 2.05e-44 155
MsG0680035401.01.T01 AT3G46400 31.849 292 185 5 22 302 554 842 2.08e-44 162
MsG0680035401.01.T01 AT3G46370 32.372 312 190 6 6 302 448 753 2.53e-44 161
MsG0680035401.01.T01 AT3G46370 32.372 312 190 6 6 302 448 753 2.53e-44 161
MsG0680035401.01.T01 AT4G32000 32.770 296 186 3 31 314 157 451 2.84e-44 157
MsG0680035401.01.T01 AT2G19230 33.449 287 173 6 32 305 558 839 2.94e-44 162
MsG0680035401.01.T01 AT5G59270 32.867 286 178 5 34 307 340 623 3.22e-44 160
MsG0680035401.01.T01 AT4G26540 34.014 294 165 8 45 313 759 1048 3.65e-44 161
MsG0680035401.01.T01 AT4G28350 34.028 288 165 8 36 305 339 619 3.67e-44 160
MsG0680035401.01.T01 AT2G18470 39.720 214 122 3 33 242 271 481 4.02e-44 158
MsG0680035401.01.T01 AT5G59270 32.867 286 178 5 34 307 337 620 4.08e-44 160
MsG0680035401.01.T01 AT2G19230 33.449 287 173 6 32 305 557 838 4.09e-44 161
MsG0680035401.01.T01 AT3G05140 32.934 334 194 9 1 311 89 415 4.15e-44 157
MsG0680035401.01.T01 AT1G51880 32.573 307 187 6 10 305 537 834 4.29e-44 161
MsG0680035401.01.T01 AT1G51880 32.573 307 187 6 10 305 555 852 4.36e-44 161
MsG0680035401.01.T01 AT5G38990 32.609 322 189 6 11 305 480 800 4.62e-44 161
MsG0680035401.01.T01 AT5G16900 32.248 307 194 4 10 305 539 842 4.71e-44 161
MsG0680035401.01.T01 AT5G16900 32.248 307 194 4 10 305 539 842 4.71e-44 161
MsG0680035401.01.T01 AT1G61430 38.813 219 126 3 31 242 474 691 4.94e-44 160
MsG0680035401.01.T01 AT2G23950 39.070 215 123 3 31 241 284 494 5.01e-44 158
MsG0680035401.01.T01 AT1G51880 32.573 307 187 6 10 305 563 860 5.20e-44 161
MsG0680035401.01.T01 AT5G59270 32.867 286 178 5 34 307 356 639 5.45e-44 160
MsG0680035401.01.T01 AT1G48210 31.494 308 189 5 19 305 38 344 6.61e-44 154
MsG0680035401.01.T01 AT1G48210 31.494 308 189 5 19 305 38 344 6.61e-44 154
MsG0680035401.01.T01 AT1G48210 31.494 308 189 5 19 305 38 344 6.61e-44 154
MsG0680035401.01.T01 AT1G48210 31.494 308 189 5 19 305 38 344 6.61e-44 154
MsG0680035401.01.T01 AT3G59700 31.579 323 196 7 2 307 297 611 1.13e-43 159

Find 61 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 114 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TCTTGGTTTAATTTCTTATT+TGG 0.125356 6:+104721449 MsG0680035401.01.T01:CDS
CAAAATAAAACATGAAAATT+TGG 0.144592 6:+104721965 MsG0680035401.01.T01:CDS
AAAACAGATGTTTACAGTTT+TGG 0.218688 6:+104722777 MsG0680035401.01.T01:CDS
GTTACATACCTGATGTAATA+AGG 0.231867 6:-104722636 None:intergenic
TTGGTAGATTTGTCTCTAAA+TGG 0.252571 6:+104723008 MsG0680035401.01.T01:CDS
GAAAATTTGGTTGAACTATA+TGG 0.275763 6:+104721978 MsG0680035401.01.T01:CDS
TTCAGTTCTGCTAATCATAT+CGG 0.284708 6:+104721678 MsG0680035401.01.T01:CDS
AGAAGGAGATCACCGAATTT+TGG 0.317268 6:+104722010 MsG0680035401.01.T01:CDS
ACGGGAACTTTATAAGAAAA+AGG 0.325369 6:+104722974 MsG0680035401.01.T01:CDS
ACTAAAAGGTGGGAACTTAA+TGG 0.335829 6:+104721872 MsG0680035401.01.T01:CDS
TCATTCAACCCCTCTCTTGT+TGG 0.347037 6:-104721915 None:intergenic
TCCCTCCGACTATTTCTATA+AGG 0.349225 6:-104722806 None:intergenic
TATGAATAGGGAGTACTAAA+AGG 0.352222 6:+104721858 MsG0680035401.01.T01:intron
AATGTAATATCTACTTTGAT+TGG 0.353910 6:+104722439 MsG0680035401.01.T01:CDS
CTATAGTGCATTTACCTAGA+AGG 0.357227 6:-104722070 None:intergenic
GTGATTTCAAATTTCGGTCT+TGG 0.359035 6:+104722591 MsG0680035401.01.T01:CDS
ACACCCGTGATTTCAAATTT+CGG 0.389135 6:+104722585 MsG0680035401.01.T01:CDS
CGTGATCCTAAAATTCTTGA+AGG 0.405796 6:+104721497 MsG0680035401.01.T01:CDS
AGCTCGCTGTGAATATTGTT+TGG 0.420355 6:-104722528 None:intergenic
TCAGTTCTGCTAATCATATC+GGG 0.422639 6:+104721679 MsG0680035401.01.T01:CDS
TGGTAGATTTGTCTCTAAAT+GGG 0.434196 6:+104723009 MsG0680035401.01.T01:CDS
ATTAGCAGAACTGAAATTGT+TGG 0.439090 6:-104721670 None:intergenic
TTGCAAGGCTCTTGTTCTCA+AGG 0.452464 6:-104722043 None:intergenic
GGTATCTGTAGACCAAAATT+CGG 0.460320 6:-104722022 None:intergenic
TCTTTCTTGCTCATGAAGAA+AGG 0.464146 6:-104722505 None:intergenic
TTTGTTAACATCAATTTCTC+CGG 0.470172 6:-104723138 None:intergenic
TTACATACCTGATGTAATAA+GGG 0.480251 6:-104722635 None:intergenic
ACACGATGTAGGATATGTAT+TGG 0.482662 6:+104722465 MsG0680035401.01.T01:CDS
TTTATTTCAGCTGTCATGAT+GGG 0.493060 6:+104722712 MsG0680035401.01.T01:intron
ATTGCCCTTCTCTGTACTGA+TGG 0.499146 6:+104723068 MsG0680035401.01.T01:CDS
TTGACCACAGAAGACATAGT+TGG 0.500267 6:-104723107 None:intergenic
AATTTGAAATCACGGGTGTA+AGG 0.500761 6:-104722581 None:intergenic
TCACGGCTTACATTAGAAGA+TGG 0.501777 6:-104721479 None:intergenic
GCACCAGAGTACGCCACAAT+GGG 0.505905 6:+104722741 MsG0680035401.01.T01:CDS
CTCATCATACAGTCATGTCT+TGG 0.507107 6:+104721432 None:intergenic
TGTCCCATTGTGGCGTACTC+TGG 0.516914 6:-104722744 None:intergenic
TATAGTGCATTTACCTAGAA+GGG 0.523005 6:-104722069 None:intergenic
AGCAGAACTGAAATTGTTGG+AGG 0.530413 6:-104721667 None:intergenic
CTATATGGTTACTGTGCAGA+AGG 0.539133 6:+104721993 MsG0680035401.01.T01:CDS
AAGACCGAAATTTGAAATCA+CGG 0.541130 6:-104722589 None:intergenic
ATTTCCATCAGTACAGAGAA+GGG 0.541652 6:-104723072 None:intergenic
ACATGTCATTTGTCCCATTG+TGG 0.548326 6:-104722754 None:intergenic
TTGATTGGCGAACACGATGT+AGG 0.549114 6:+104722454 MsG0680035401.01.T01:CDS
GGTCTTGGAAGACTTATTCG+AGG 0.551190 6:+104722606 MsG0680035401.01.T01:CDS
GAATAGGGAGTACTAAAAGG+TGG 0.551330 6:+104721861 MsG0680035401.01.T01:intron
AATTTCCATCAGTACAGAGA+AGG 0.556745 6:-104723073 None:intergenic
GAGACCGCCCTTATTACATC+AGG 0.566407 6:+104722628 MsG0680035401.01.T01:CDS
AGACCGAAATTTGAAATCAC+GGG 0.580599 6:-104722588 None:intergenic
AATAGGGAGTACTAAAAGGT+GGG 0.590822 6:+104721862 MsG0680035401.01.T01:intron
TTTGAAAATAGCATTAACAT+CGG 0.607036 6:-104721946 None:intergenic
TCTGTGGTCAAAATGCTCAC+CGG 0.613698 6:+104723119 MsG0680035401.01.T01:CDS
CAGTTCTGCTAATCATATCG+GGG 0.614107 6:+104721680 MsG0680035401.01.T01:CDS
TCCTTATAGAAATAGTCGGA+GGG 0.617479 6:+104722805 MsG0680035401.01.T01:CDS
TGCACCAGAGTACGCCACAA+TGG 0.623109 6:+104722740 MsG0680035401.01.T01:CDS
GTCATCCTTATAGAAATAGT+CGG 0.623265 6:+104722801 MsG0680035401.01.T01:CDS
ATCCTTATAGAAATAGTCGG+AGG 0.635678 6:+104722804 MsG0680035401.01.T01:CDS
GGAGAAATTGATGTTAACAA+AGG 0.637973 6:+104723140 MsG0680035401.01.T01:CDS
AGTTCTGCTAATCATATCGG+GGG 0.643261 6:+104721681 MsG0680035401.01.T01:CDS
GAGGCCAACTATGTCTTCTG+TGG 0.646950 6:+104723103 MsG0680035401.01.T01:CDS
ATATGTATTGGAGTTGCACG+TGG 0.650244 6:+104722477 MsG0680035401.01.T01:CDS
CATACCTGATGTAATAAGGG+CGG 0.712683 6:-104722632 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TGGTATTAAAAATAATAATT+CGG + Chr6:104722332-104722351 MsG0680035401.01.T01:intron 10.0%
!!! GAGTTTTATTTTATATTTAT+TGG + Chr6:104722103-104722122 MsG0680035401.01.T01:intron 10.0%
!! AAGCATAATTAATATTGTTA+AGG - Chr6:104721839-104721858 None:intergenic 15.0%
!! AAGTACTATGTAATAATATT+AGG + Chr6:104722290-104722309 MsG0680035401.01.T01:intron 15.0%
!! AGAAATAGATATAAATTGTT+TGG - Chr6:104721740-104721759 None:intergenic 15.0%
!! ATTAATTATGCTTATGAATA+GGG + Chr6:104721846-104721865 MsG0680035401.01.T01:intron 15.0%
!! CAAAATAAAACATGAAAATT+TGG + Chr6:104721965-104721984 MsG0680035401.01.T01:CDS 15.0%
!! GAAATAAACTAAATTACTAT+TGG + Chr6:104722312-104722331 MsG0680035401.01.T01:intron 15.0%
!! GGTATTAAAAATAATAATTC+GGG + Chr6:104722333-104722352 MsG0680035401.01.T01:intron 15.0%
!! TATTAATTATGCTTATGAAT+AGG + Chr6:104721845-104721864 MsG0680035401.01.T01:intron 15.0%
!! TCAATTCAAGTATTAAATTA+AGG - Chr6:104722271-104722290 None:intergenic 15.0%
!!! TTATTTTATATTTATTGGCA+TGG + Chr6:104722108-104722127 MsG0680035401.01.T01:intron 15.0%
!! AATGTAATATCTACTTTGAT+TGG + Chr6:104722439-104722458 MsG0680035401.01.T01:CDS 20.0%
!! ATAGATATAAATTGTTTGGT+TGG - Chr6:104721736-104721755 None:intergenic 20.0%
!! ATTAAAAATAATAATTCGGG+TGG + Chr6:104722336-104722355 MsG0680035401.01.T01:intron 20.0%
!! TATATTAAATCCTGATGAAA+TGG - Chr6:104722384-104722403 None:intergenic 20.0%
!! TTTGAAAATAGCATTAACAT+CGG - Chr6:104721949-104721968 None:intergenic 20.0%
!!! CTACATCATTTAATTTGTTT+TGG + Chr6:104721767-104721786 MsG0680035401.01.T01:intron 20.0%
!!! TCTTGGTTTAATTTCTTATT+TGG + Chr6:104721449-104721468 MsG0680035401.01.T01:CDS 20.0%
! ATTGGCATGGTATATATTAT+TGG + Chr6:104722121-104722140 MsG0680035401.01.T01:intron 25.0%
! GAAAATTTGGTTGAACTATA+TGG + Chr6:104721978-104721997 MsG0680035401.01.T01:CDS 25.0%
! TTACATACCTGATGTAATAA+GGG - Chr6:104722638-104722657 None:intergenic 25.0%
! TTATACTACATGCATATTAC+AGG + Chr6:104722408-104722427 MsG0680035401.01.T01:intron 25.0%
! TTATGTTCTTATTACAGACA+CGG + Chr6:104722955-104722974 MsG0680035401.01.T01:intron 25.0%
! TTTGTTAACATCAATTTCTC+CGG - Chr6:104723141-104723160 None:intergenic 25.0%
!! AAAACAGATGTTTACAGTTT+TGG + Chr6:104722777-104722796 MsG0680035401.01.T01:CDS 25.0%
!! AAACAGATGTTTACAGTTTT+GGG + Chr6:104722778-104722797 MsG0680035401.01.T01:CDS 25.0%
!!! TAATTTTGGTTCTGTCTATA+AGG + Chr6:104721707-104721726 MsG0680035401.01.T01:CDS 25.0%
ACGGGAACTTTATAAGAAAA+AGG + Chr6:104722974-104722993 MsG0680035401.01.T01:CDS 30.0%
ATAAGCAATACGATGAACTA+TGG - Chr6:104722929-104722948 None:intergenic 30.0%
ATTAGCAGAACTGAAATTGT+TGG - Chr6:104721673-104721692 None:intergenic 30.0%
GGAGAAATTGATGTTAACAA+AGG + Chr6:104723140-104723159 MsG0680035401.01.T01:CDS 30.0%
GTCATCCTTATAGAAATAGT+CGG + Chr6:104722801-104722820 MsG0680035401.01.T01:CDS 30.0%
GTTACATACCTGATGTAATA+AGG - Chr6:104722639-104722658 None:intergenic 30.0%
TATAGTGCATTTACCTAGAA+GGG - Chr6:104722072-104722091 None:intergenic 30.0%
TATGTTCTTATTACAGACAC+GGG + Chr6:104722956-104722975 MsG0680035401.01.T01:intron 30.0%
TCGTCATATCTAATGTAGAT+AGG - Chr6:104721526-104721545 None:intergenic 30.0%
TGGTAGATTTGTCTCTAAAT+GGG + Chr6:104723009-104723028 MsG0680035401.01.T01:CDS 30.0%
TGTTAAGGTTCCATTAATAC+AGG - Chr6:104721824-104721843 None:intergenic 30.0%
TTCAGTTCTGCTAATCATAT+CGG + Chr6:104721678-104721697 MsG0680035401.01.T01:CDS 30.0%
TTGGTAGATTTGTCTCTAAA+TGG + Chr6:104723008-104723027 MsG0680035401.01.T01:CDS 30.0%
TTTATTTCAGCTGTCATGAT+GGG + Chr6:104722712-104722731 MsG0680035401.01.T01:intron 30.0%
! AACAGATGTTTACAGTTTTG+GGG + Chr6:104722779-104722798 MsG0680035401.01.T01:CDS 30.0%
! AAGACCGAAATTTGAAATCA+CGG - Chr6:104722592-104722611 None:intergenic 30.0%
! AGGTTACCTTCAAGAATTTT+AGG - Chr6:104721506-104721525 None:intergenic 30.0%
! GTAAATGCACTATAGTGTTT+TGG + Chr6:104722078-104722097 MsG0680035401.01.T01:intron 30.0%
!! GTACTGATGGAAATTTTAAG+AGG + Chr6:104723081-104723100 MsG0680035401.01.T01:CDS 30.0%
!! TATGAATAGGGAGTACTAAA+AGG + Chr6:104721858-104721877 MsG0680035401.01.T01:intron 30.0%
!! TTTTATTTCAGCTGTCATGA+TGG + Chr6:104722711-104722730 MsG0680035401.01.T01:intron 30.0%
!!! CTTCAAGAATTTTAGGATCA+CGG - Chr6:104721499-104721518 None:intergenic 30.0%
!!! TTTTTAGTTCCAACAAGAGA+GGG + Chr6:104721906-104721925 MsG0680035401.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTTTTTAGTTCCAACAAGAG+AGG + Chr6:104721905-104721924 MsG0680035401.01.T01:CDS 30.0%
AAGGTTCCATTAATACAGGA+AGG - Chr6:104721820-104721839 None:intergenic 35.0%
AATTTCCATCAGTACAGAGA+AGG - Chr6:104723076-104723095 None:intergenic 35.0%
ACACCCGTGATTTCAAATTT+CGG + Chr6:104722585-104722604 MsG0680035401.01.T01:CDS 35.0%
ACACGATGTAGGATATGTAT+TGG + Chr6:104722465-104722484 MsG0680035401.01.T01:CDS 35.0%
ACTAAAAGGTGGGAACTTAA+TGG + Chr6:104721872-104721891 MsG0680035401.01.T01:CDS 35.0%
ATAGGACTTTCCATTTCATC+AGG + Chr6:104722371-104722390 MsG0680035401.01.T01:intron 35.0%
ATCCTTATAGAAATAGTCGG+AGG + Chr6:104722804-104722823 MsG0680035401.01.T01:CDS 35.0%
ATTTCCATCAGTACAGAGAA+GGG - Chr6:104723075-104723094 None:intergenic 35.0%
CAATACGATGAACTATGGTT+TGG - Chr6:104722924-104722943 None:intergenic 35.0%
CGTGATCCTAAAATTCTTGA+AGG + Chr6:104721497-104721516 MsG0680035401.01.T01:CDS 35.0%
CTATAGTGCATTTACCTAGA+AGG - Chr6:104722073-104722092 None:intergenic 35.0%
GAAAAAGGAGCTATTCAAGT+TGG + Chr6:104722989-104723008 MsG0680035401.01.T01:CDS 35.0%
GGTATCTGTAGACCAAAATT+CGG - Chr6:104722025-104722044 None:intergenic 35.0%
GTGATTTCAAATTTCGGTCT+TGG + Chr6:104722591-104722610 MsG0680035401.01.T01:CDS 35.0%
TACTACATGCATATTACAGG+TGG + Chr6:104722411-104722430 MsG0680035401.01.T01:intron 35.0%
TCAGTTCTGCTAATCATATC+GGG + Chr6:104721679-104721698 MsG0680035401.01.T01:CDS 35.0%
TCCATTAATACAGGAAGGAA+CGG - Chr6:104721815-104721834 None:intergenic 35.0%
TCCTTATAGAAATAGTCGGA+GGG + Chr6:104722805-104722824 MsG0680035401.01.T01:CDS 35.0%
TCTTTCTTGCTCATGAAGAA+AGG - Chr6:104722508-104722527 None:intergenic 35.0%
! AATTTGAAATCACGGGTGTA+AGG - Chr6:104722584-104722603 None:intergenic 35.0%
! AGACCGAAATTTGAAATCAC+GGG - Chr6:104722591-104722610 None:intergenic 35.0%
! GAACATACGTACTTGTTAAC+AGG + Chr6:104721594-104721613 MsG0680035401.01.T01:intron 35.0%
!! AATAGGGAGTACTAAAAGGT+GGG + Chr6:104721862-104721881 MsG0680035401.01.T01:intron 35.0%
!! CTGATGGAAATTTTAAGAGG+AGG + Chr6:104723084-104723103 MsG0680035401.01.T01:CDS 35.0%
!! TCTCTAAATGGGTTTTTCGA+TGG + Chr6:104723020-104723039 MsG0680035401.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTTTAGTTCCAACAAGAGAG+GGG + Chr6:104721907-104721926 MsG0680035401.01.T01:CDS 35.0%
AGCAGAACTGAAATTGTTGG+AGG - Chr6:104721670-104721689 None:intergenic 40.0%
AGCTCGCTGTGAATATTGTT+TGG - Chr6:104722531-104722550 None:intergenic 40.0%
AGTTCTGCTAATCATATCGG+GGG + Chr6:104721681-104721700 MsG0680035401.01.T01:CDS 40.0%
ATATGTATTGGAGTTGCACG+TGG + Chr6:104722477-104722496 MsG0680035401.01.T01:CDS 40.0%
CAGTTCTGCTAATCATATCG+GGG + Chr6:104721680-104721699 MsG0680035401.01.T01:CDS 40.0%
CATACCTGATGTAATAAGGG+CGG - Chr6:104722635-104722654 None:intergenic 40.0%
CTATATGGTTACTGTGCAGA+AGG + Chr6:104721993-104722012 MsG0680035401.01.T01:CDS 40.0%
GGGTGGAATTTGAGAACAAT+AGG + Chr6:104722353-104722372 MsG0680035401.01.T01:intron 40.0%
TACATGCATATTACAGGTGG+AGG + Chr6:104722414-104722433 MsG0680035401.01.T01:intron 40.0%
TCACGGCTTACATTAGAAGA+TGG - Chr6:104721482-104721501 None:intergenic 40.0%
TCACTTTGATTGTGAACCAG+TGG + Chr6:104722889-104722908 MsG0680035401.01.T01:intron 40.0%
TCCGTTCCTTCCTGTATTAA+TGG + Chr6:104721811-104721830 MsG0680035401.01.T01:intron 40.0%
TTGACCACAGAAGACATAGT+TGG - Chr6:104723110-104723129 None:intergenic 40.0%
! ACATGTCATTTGTCCCATTG+TGG - Chr6:104722757-104722776 None:intergenic 40.0%
! AGAAGGAGATCACCGAATTT+TGG + Chr6:104722010-104722029 MsG0680035401.01.T01:CDS 40.0%
! TACCTAGAAGGGTTTTTGCA+AGG - Chr6:104722061-104722080 None:intergenic 40.0%
!! AAATGGGTTTTTCGATGGTG+AGG + Chr6:104723025-104723044 MsG0680035401.01.T01:CDS 40.0%
!! GAATAGGGAGTACTAAAAGG+TGG + Chr6:104721861-104721880 MsG0680035401.01.T01:intron 40.0%
!! TCCCTCCGACTATTTCTATA+AGG - Chr6:104722809-104722828 None:intergenic 40.0%
!!! GGCTCTTTTTAGTTCTTCGT+AGG - Chr6:104721649-104721668 None:intergenic 40.0%
AGCCTTGCAAAAACCCTTCT+AGG + Chr6:104722056-104722075 MsG0680035401.01.T01:CDS 45.0%
ATTGCCCTTCTCTGTACTGA+TGG + Chr6:104723068-104723087 MsG0680035401.01.T01:CDS 45.0%
GGTCTTGGAAGACTTATTCG+AGG + Chr6:104722606-104722625 MsG0680035401.01.T01:CDS 45.0%
TCATTCAACCCCTCTCTTGT+TGG - Chr6:104721918-104721937 None:intergenic 45.0%
TCTGTGGTCAAAATGCTCAC+CGG + Chr6:104723119-104723138 MsG0680035401.01.T01:CDS 45.0%
TTGATTGGCGAACACGATGT+AGG + Chr6:104722454-104722473 MsG0680035401.01.T01:CDS 45.0%
TTGCAAGGCTCTTGTTCTCA+AGG - Chr6:104722046-104722065 None:intergenic 45.0%
! CATATCGGGGGTGGTAATTT+TGG + Chr6:104721693-104721712 MsG0680035401.01.T01:CDS 45.0%
GAGACCGCCCTTATTACATC+AGG + Chr6:104722628-104722647 MsG0680035401.01.T01:CDS 50.0%
GAGGCCAACTATGTCTTCTG+TGG + Chr6:104723103-104723122 MsG0680035401.01.T01:CDS 50.0%
TCTGCTAATCATATCGGGGG+TGG + Chr6:104721684-104721703 MsG0680035401.01.T01:CDS 50.0%
! GGTTTGGTATTGCAGTCCAC+TGG - Chr6:104722908-104722927 None:intergenic 50.0%
!! TGGGTTTTTCGATGGTGAGG+AGG + Chr6:104723028-104723047 MsG0680035401.01.T01:CDS 50.0%
GCACCAGAGTACGCCACAAT+GGG + Chr6:104722741-104722760 MsG0680035401.01.T01:CDS 55.0%
TGCACCAGAGTACGCCACAA+TGG + Chr6:104722740-104722759 MsG0680035401.01.T01:CDS 55.0%
TGTCCCATTGTGGCGTACTC+TGG - Chr6:104722747-104722766 None:intergenic 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 104721446 104723169 104721446 ID=MsG0680035401.01;Name=MsG0680035401.01
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Chr6 exon 104721446 104721518 104721446 ID=MsG0680035401.01.T01:exon:16950;Parent=MsG0680035401.01.T01
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Chr6 exon 104721867 104722077 104721867 ID=MsG0680035401.01.T01:exon:16952;Parent=MsG0680035401.01.T01
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Chr6 exon 104722722 104722854 104722722 ID=MsG0680035401.01.T01:exon:16954;Parent=MsG0680035401.01.T01
Chr6 exon 104722972 104723169 104722972 ID=MsG0680035401.01.T01:exon:16955;Parent=MsG0680035401.01.T01
Chr6 CDS 104721446 104721518 104721446 ID=MsG0680035401.01.T01:cds;Parent=MsG0680035401.01.T01
Chr6 CDS 104721616 104721728 104721616 ID=MsG0680035401.01.T01:cds;Parent=MsG0680035401.01.T01
Chr6 CDS 104721867 104722077 104721867 ID=MsG0680035401.01.T01:cds;Parent=MsG0680035401.01.T01
Chr6 CDS 104722430 104722649 104722430 ID=MsG0680035401.01.T01:cds;Parent=MsG0680035401.01.T01
Chr6 CDS 104722722 104722854 104722722 ID=MsG0680035401.01.T01:cds;Parent=MsG0680035401.01.T01
Chr6 CDS 104722972 104723169 104722972 ID=MsG0680035401.01.T01:cds;Parent=MsG0680035401.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680035401.01.T01

ATGTCTTGGTTTAATTTCTTATTTGGTAAGAAACCATCTTCTAATGTAAGCCGTGATCCTAAAATTCTTGAAGGACTTTCAAGCACTCAGATAAAAGTTTATACCTACGAAGAACTAAAAAGAGCCTCCAACAATTTCAGTTCTGCTAATCATATCGGGGGTGGTAATTTTGGTTCTGTCTATAAGGGAGTACTAAAAGGTGGGAACTTAATGGCTCTAAAAGCTTTTTTAGTTCCAACAAGAGAGGGGTTGAATGAATTCTTGACCGATGTTAATGCTATTTTCAAAATAAAACATGAAAATTTGGTTGAACTATATGGTTACTGTGCAGAAGGAGATCACCGAATTTTGGTCTACAGATACCTTGAGAACAAGAGCCTTGCAAAAACCCTTCTAGGTGGAGGTCAATGTAATATCTACTTTGATTGGCGAACACGATGTAGGATATGTATTGGAGTTGCACGTGGACTTGCCTTTCTTCATGAGCAAGAAAGACCAAACAATATTCACAGCGAGCTAACATGCAACAATATTCTACTTGACAAAGACCTTACACCCGTGATTTCAAATTTCGGTCTTGGAAGACTTATTCGAGGAGACCGCCCTTATTACATCAGCTGTCATGATGGGCATGTTGCACCAGAGTACGCCACAATGGGACAAATGACATGTAAAACAGATGTTTACAGTTTTGGGGTCATCCTTATAGAAATAGTCGGAGGGAGATCTAACACATATCTTATACGACAAACACGGGAACTTTATAAGAAAAAGGAGCTATTCAAGTTGGTAGATTTGTCTCTAAATGGGTTTTTCGATGGTGAGGAGGCTTATAAGATTCTTAAGATTGCCCTTCTCTGTACTGATGGAAATTTTAAGAGGAGGCCAACTATGTCTTCTGTGGTCAAAATGCTCACCGGAGAAATTGATGTTAACAAAGGTATATGA
Protein sequence

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