AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680035564.01

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MsG0680035564.01.T01 AT1G56145 42.808 292 131 4 50 316 572 852 4.29e-65 223
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MsG0680035564.01.T01 AT1G56145 42.808 292 131 4 50 316 675 955 8.09e-65 224
MsG0680035564.01.T01 AT1G24030 43.496 246 109 2 109 324 11 256 9.00e-65 208
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MsG0680035564.01.T01 AT1G55200 41.695 295 134 6 50 317 367 650 4.74e-64 217
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MsG0680035564.01.T01 AT5G01950 40.196 306 148 5 45 325 609 904 4.03e-60 210
MsG0680035564.01.T01 AT5G01950 40.196 306 148 5 45 325 609 904 4.03e-60 210
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MsG0680035564.01.T01 AT4G02630 44.033 243 116 5 50 286 150 378 9.87e-60 202
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MsG0680035564.01.T01 AT1G56145 39.185 319 131 5 50 316 675 982 1.26e-59 209
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MsG0680035564.01.T01 AT1G07560 40.625 320 152 7 30 325 540 845 1.63e-59 207
MsG0680035564.01.T01 AT2G30730 36.859 312 153 6 50 327 45 346 1.65e-59 197
MsG0680035564.01.T01 AT3G59700 44.167 240 123 3 48 286 324 553 2.15e-59 204
MsG0680035564.01.T01 AT2G04300 39.867 301 144 5 49 324 571 859 2.27e-59 207
MsG0680035564.01.T01 AT4G23270 38.333 300 143 4 49 318 313 600 2.51e-59 204
MsG0680035564.01.T01 AT4G23270 38.333 300 143 4 49 318 313 600 2.51e-59 204
MsG0680035564.01.T01 AT5G49770 43.478 253 117 2 94 320 656 908 3.60e-59 207
MsG0680035564.01.T01 AT4G23270 38.333 300 143 4 49 318 313 600 3.79e-59 203
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MsG0680035564.01.T01 AT1G48210 41.841 239 121 3 54 285 60 287 1.55e-56 188
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MsG0680035564.01.T01 AT1G61610 44.141 256 116 4 19 273 498 727 2.78e-56 197
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MsG0680035564.01.T01 AT1G61610 39.145 304 149 6 19 321 498 766 3.26e-56 198
MsG0680035564.01.T01 AT4G23180 42.857 224 117 2 49 271 335 548 3.50e-56 194
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MsG0680035564.01.T01 AT1G61420 42.276 246 131 2 47 291 329 564 3.65e-56 196
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MsG0680035564.01.T01 AT3G59350 39.615 260 137 4 50 299 101 350 4.54e-56 189
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MsG0680035564.01.T01 AT1G11300 38.750 320 163 5 50 349 497 803 9.32e-56 197
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MsG0680035564.01.T01 AT3G46400 37.954 303 151 5 49 326 565 855 2.09e-55 196
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MsG0680035564.01.T01 AT5G11020 38.188 309 139 7 52 331 97 382 1.59e-54 186
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MsG0680035564.01.T01 AT5G59650 41.045 268 133 2 97 339 604 871 2.65e-54 193
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MsG0680035564.01.T01 AT4G23230 34.810 316 169 3 30 318 305 610 3.80e-54 189
MsG0680035564.01.T01 AT1G61490 41.870 246 132 2 47 291 325 560 3.93e-54 190
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MsG0680035564.01.T01 AT5G59270 40.000 255 134 5 49 302 339 575 4.36e-54 190
MsG0680035564.01.T01 AT4G38830 43.320 247 128 3 49 293 331 567 4.89e-54 190
MsG0680035564.01.T01 AT1G70110 43.515 239 125 2 48 286 330 558 5.01e-54 190
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MsG0680035564.01.T01 AT1G55610 41.418 268 133 5 47 309 844 1092 5.17e-54 193
MsG0680035564.01.T01 AT5G59270 40.000 255 134 5 49 302 355 591 5.51e-54 190
MsG0680035564.01.T01 AT2G19230 37.075 294 146 3 50 317 559 839 6.93e-54 192
MsG0680035564.01.T01 AT3G45410 37.363 273 157 5 48 320 328 586 8.45e-54 189
MsG0680035564.01.T01 AT1G79680 37.705 305 151 5 50 326 421 714 8.45e-54 191
MsG0680035564.01.T01 AT3G13380 37.500 312 151 6 47 325 843 1143 1.10e-53 192
MsG0680035564.01.T01 AT2G19230 37.075 294 146 3 50 317 560 840 1.13e-53 192
MsG0680035564.01.T01 AT1G16120 38.047 297 146 5 50 319 417 702 1.30e-53 190
MsG0680035564.01.T01 AT4G23200 34.943 352 180 8 46 366 320 653 1.50e-53 189
MsG0680035564.01.T01 AT1G61490 41.870 246 132 2 47 291 475 710 1.73e-53 190
MsG0680035564.01.T01 AT1G61490 41.870 246 132 2 47 291 475 710 1.73e-53 190
MsG0680035564.01.T01 AT1G61490 41.870 246 132 2 47 291 475 710 1.73e-53 190
MsG0680035564.01.T01 AT1G61490 41.870 246 132 2 47 291 475 710 1.73e-53 190
MsG0680035564.01.T01 AT2G23200 38.514 296 144 5 52 320 478 762 1.78e-53 191
MsG0680035564.01.T01 AT1G61490 41.870 246 132 2 47 291 449 684 1.83e-53 190
MsG0680035564.01.T01 AT1G61490 41.870 246 132 2 47 291 449 684 1.83e-53 190
MsG0680035564.01.T01 AT1G60800 37.624 303 146 7 46 317 218 508 1.96e-53 186
MsG0680035564.01.T01 AT4G27300 42.798 243 126 4 50 290 488 719 2.00e-53 190
MsG0680035564.01.T01 AT5G60320 40.392 255 133 5 48 302 334 569 2.07e-53 188
MsG0680035564.01.T01 AT4G23190 40.323 248 130 3 25 271 320 550 2.60e-53 186
MsG0680035564.01.T01 AT1G66150 35.294 306 153 6 50 321 576 870 2.93e-53 191
MsG0680035564.01.T01 AT4G03390 36.129 310 150 8 45 320 468 763 2.99e-53 189
MsG0680035564.01.T01 AT4G03390 36.129 310 150 8 45 320 468 763 2.99e-53 189
MsG0680035564.01.T01 AT2G02220 36.808 307 155 5 41 319 713 1008 3.24e-53 191
MsG0680035564.01.T01 AT5G49780 39.453 256 128 2 94 322 556 811 3.66e-53 190
MsG0680035564.01.T01 AT1G61360 40.323 248 137 2 45 291 400 637 3.69e-53 189
MsG0680035564.01.T01 AT1G61360 40.323 248 137 2 45 291 400 637 3.69e-53 189
MsG0680035564.01.T01 AT1G61360 40.323 248 137 2 45 291 400 637 3.69e-53 189
MsG0680035564.01.T01 AT4G23290 37.458 299 149 6 49 319 307 595 4.05e-53 187
MsG0680035564.01.T01 AT4G23240 38.176 296 145 6 49 316 322 607 4.46e-53 187
MsG0680035564.01.T01 AT3G45430 40.784 255 132 4 48 302 330 565 4.46e-53 187
MsG0680035564.01.T01 AT3G45430 40.784 255 132 4 48 302 330 565 4.46e-53 187
MsG0680035564.01.T01 AT3G45430 40.784 255 132 4 48 302 330 565 4.46e-53 187
MsG0680035564.01.T01 AT5G49780 39.453 256 128 2 94 322 677 932 5.01e-53 190
MsG0680035564.01.T01 AT1G61360 40.323 248 137 2 45 291 481 718 5.01e-53 189
MsG0680035564.01.T01 AT5G49780 39.453 256 128 2 94 322 655 910 5.30e-53 190
MsG0680035564.01.T01 AT4G23190 40.323 248 130 3 25 271 242 472 5.50e-53 186
MsG0680035564.01.T01 AT4G23190 40.323 248 130 3 25 271 242 472 5.50e-53 186
MsG0680035564.01.T01 AT4G11480 43.304 224 116 3 49 271 308 521 7.04e-53 186
MsG0680035564.01.T01 AT1G61400 35.843 332 168 5 47 350 485 799 7.29e-53 189
MsG0680035564.01.T01 AT3G25490 37.710 297 147 4 50 319 96 381 7.42e-53 182
MsG0680035564.01.T01 AT4G23290 37.458 299 149 6 49 319 350 638 7.63e-53 187
MsG0680035564.01.T01 AT4G11480 43.304 224 116 3 49 271 311 524 7.78e-53 186
MsG0680035564.01.T01 AT1G61380 42.982 228 119 2 45 271 324 541 7.95e-53 186
MsG0680035564.01.T01 AT5G40380 36.416 346 171 9 21 336 274 600 8.11e-53 186
MsG0680035564.01.T01 AT1G61550 41.221 262 143 2 45 305 472 723 8.80e-53 188

Find 100 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 195 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GCCATCGCCATTATCGTTTA+AGG 0.161766 6:+108529744 MsG0680035564.01.T01:CDS
TTGACAACTTCACTCATTAA+AGG 0.205712 6:-108529670 None:intergenic
TAGCTTTGGCGTGGTTCTTC+TGG 0.233626 6:+108529442 MsG0680035564.01.T01:CDS
CAAAACTTCTAATATCCTAT+TGG 0.291140 6:+108528417 MsG0680035564.01.T01:CDS
AAAGGCTGGATAGGTCTAAA+TGG 0.299316 6:+108527223 MsG0680035564.01.T01:CDS
CCAAATCTGGTTAGACTTGT+TGG 0.305490 6:+108527818 MsG0680035564.01.T01:CDS
CTGTTGCTGACTTAAGTTCT+TGG 0.315255 6:-108527147 None:intergenic
ACTGCATTGAAGATGAAAAT+AGG 0.331152 6:+108527843 MsG0680035564.01.T01:CDS
AACTATCTTCATTGCTTTGT+AGG 0.331226 6:-108529614 None:intergenic
CCGATCAATGGCTTTCCTTC+CGG 0.332919 6:-108529474 None:intergenic
CCAACAAGTCTAACCAGATT+TGG 0.337234 6:-108527818 None:intergenic
GTTCATGCCAAAAGGAAGTT+TGG 0.338813 6:+108527880 MsG0680035564.01.T01:CDS
TGCTCTTCAGCATCCAAATC+TGG 0.349587 6:+108527805 MsG0680035564.01.T01:CDS
TAAGTTCTTGGTACGTGAAT+TGG 0.355233 6:-108527135 None:intergenic
TACAATTGGTTCATCATCTT+CGG 0.357415 6:+108529843 MsG0680035564.01.T01:CDS
AATGCAAAACTTTCTGACTT+TGG 0.359113 6:+108528531 MsG0680035564.01.T01:CDS
TAACCTGTCATGACATATTC+AGG 0.366960 6:-108528630 None:intergenic
GTACGTGAATTGGTTAAGAT+TGG 0.367926 6:-108527125 None:intergenic
TTGAAATCTCTATATATGAT+TGG 0.371787 6:-108528397 None:intergenic
TTTCTTGGTGAGGGTGGATT+TGG 0.378688 6:+108527190 MsG0680035564.01.T01:CDS
TTCTAATATCCTATTGGATT+CGG 0.379762 6:+108528423 MsG0680035564.01.T01:CDS
TCAGTCTCTTAGCCCATGTA+AGG 0.388148 6:-108528318 None:intergenic
TGCAAGACCTTAAACGATAA+TGG 0.388647 6:-108529751 None:intergenic
TCAACTCCAGCTCGATTTCA+AGG 0.393058 6:+108529877 MsG0680035564.01.T01:CDS
GGATTTGGTTCTGTGTATAA+AGG 0.396835 6:+108527205 MsG0680035564.01.T01:CDS
TTGTAAATTTATAGATGATA+AGG 0.403161 6:+108527027 MsG0680035564.01.T01:CDS
TGAAATCGAGCTGGAGTTGA+TGG 0.409238 6:-108529874 None:intergenic
TGGTGATCTTGTGTTACTGC+TGG 0.411415 6:-108527077 None:intergenic
AATAAATACGGTCCTACAAT+TGG 0.419049 6:+108529829 MsG0680035564.01.T01:CDS
CATGTGTCAACACAAGTAAT+AGG 0.426089 6:+108528588 MsG0680035564.01.T01:CDS
TTTCACTTACCGAATCCAAT+AGG 0.426781 6:-108528432 None:intergenic
AAGAGTGATGTCTATAGCTT+TGG 0.427331 6:+108529428 MsG0680035564.01.T01:CDS
GATTTCTTCAAGACCTGGAA+TGG 0.441035 6:+108527249 MsG0680035564.01.T01:CDS
ATAGATGATAAGGTCGTTGT+TGG 0.444761 6:+108527037 MsG0680035564.01.T01:CDS
GTTCTTCTGGAGATGTTAAC+CGG 0.445577 6:+108529455 MsG0680035564.01.T01:CDS
GAAGATGATGAACCAATTGT+AGG 0.448410 6:-108529841 None:intergenic
GAAATCAAGGGCACAAAGAA+TGG 0.452177 6:+108527308 MsG0680035564.01.T01:CDS
GACGATCTGTACCCCTTACA+TGG 0.454223 6:+108528305 MsG0680035564.01.T01:CDS
AACGATAATGGCGATGGCAT+TGG 0.460179 6:-108529739 None:intergenic
CAGGCTGAAATTAACCATCT+TGG 0.462288 6:+108527782 MsG0680035564.01.T01:intron
TTCTGACTTTGGACTTGCTA+AGG 0.463345 6:+108528542 MsG0680035564.01.T01:CDS
AGACATGTTGGTGGCGGCAG+CGG 0.464356 6:+108529802 MsG0680035564.01.T01:CDS
ATTATGCTTGGTGCTGCAAA+AGG 0.468732 6:+108528343 MsG0680035564.01.T01:CDS
TTAAACAAAGAAGGAAATCA+AGG 0.470264 6:+108527295 MsG0680035564.01.T01:CDS
CAAGAACTTAAGTCAGCAAC+AGG 0.472629 6:+108527148 MsG0680035564.01.T01:CDS
ATTTCTTCAAGACCTGGAAT+GGG 0.475957 6:+108527250 MsG0680035564.01.T01:CDS
TTGGTTCTGTGTATAAAGGC+TGG 0.478951 6:+108527209 MsG0680035564.01.T01:CDS
AGACATCACTCTTGGAACTA+AGG 0.479836 6:-108529418 None:intergenic
GACTTTGGACTTGCTAAGGA+TGG 0.485237 6:+108528546 MsG0680035564.01.T01:CDS
GAATAATAATGTACACCATC+GGG 0.485291 6:-108527103 None:intergenic
CTTGCTAAGGATGGTCCAAC+GGG 0.486943 6:+108528555 MsG0680035564.01.T01:CDS
TTTCCACCACGAGGAGGAAT+CGG 0.489821 6:-108529934 None:intergenic
TCGTTTAAGGTCTTGCATGA+TGG 0.497756 6:+108529757 MsG0680035564.01.T01:CDS
CCCTCACCAAGAAAACATTC+TGG 0.498251 6:-108527181 None:intergenic
GGAAAGCCATTGATCGGAAA+AGG 0.501394 6:+108529480 MsG0680035564.01.T01:CDS
AAGGCTGGATAGGTCTAAAT+GGG 0.501974 6:+108527224 MsG0680035564.01.T01:CDS
AAAGGAGGAGTAAAGTTCAA+TGG 0.508200 6:-108529904 None:intergenic
GTTTATGAGTTCATGCCAAA+AGG 0.508359 6:+108527872 MsG0680035564.01.T01:CDS
AAAGCTATAGACATCACTCT+TGG 0.527295 6:-108529426 None:intergenic
ATCAAGGTTTGTTCATTCTG+CGG 0.529278 6:-108529503 None:intergenic
TCAAGGGCACAAAGAATGGC+TGG 0.531220 6:+108527312 MsG0680035564.01.T01:CDS
ACACAAGTAATAGGAACTCA+AGG 0.535380 6:+108528597 MsG0680035564.01.T01:CDS
GGCGATGGCATTGGTGAGCA+AGG 0.536882 6:-108529730 None:intergenic
TCAAATTCCTCTAGACATGT+TGG 0.540055 6:+108529790 MsG0680035564.01.T01:CDS
GGGAGGATTTCTTCAAGACC+TGG 0.543556 6:+108527244 MsG0680035564.01.T01:CDS
CAGTCTCTTAGCCCATGTAA+GGG 0.545816 6:-108528317 None:intergenic
TCCTCTAGACATGTTGGTGG+CGG 0.555438 6:+108529796 MsG0680035564.01.T01:CDS
GGAATAATAATGTACACCAT+CGG 0.557101 6:-108527104 None:intergenic
AAGAGACTGAAAATTATGCT+TGG 0.559894 6:+108528331 MsG0680035564.01.T01:CDS
TCTGTGTATAAAGGCTGGAT+AGG 0.567910 6:+108527214 MsG0680035564.01.T01:CDS
GGAATCGGTGAAAGTAAAGG+AGG 0.572455 6:-108529919 None:intergenic
GGAGGAATCGGTGAAAGTAA+AGG 0.573077 6:-108529922 None:intergenic
GATGCTGAAGAGCACCAAGA+TGG 0.573381 6:-108527796 None:intergenic
TTTAATGAGTGAAGTTGTCA+AGG 0.573819 6:+108529672 MsG0680035564.01.T01:CDS
TTCTGGAGATGTTAACCGGA+AGG 0.578067 6:+108529459 MsG0680035564.01.T01:CDS
CCGGAAGGAAAGCCATTGAT+CGG 0.581358 6:+108529474 MsG0680035564.01.T01:CDS
GGTGAACCTTGAAATCGAGC+TGG 0.583004 6:-108529883 None:intergenic
AATTCCTCTAGACATGTTGG+TGG 0.585870 6:+108529793 MsG0680035564.01.T01:CDS
GGCAGCGGTGCTAATAAATA+CGG 0.587822 6:+108529817 MsG0680035564.01.T01:CDS
ACCTTAAACGATAATGGCGA+TGG 0.594438 6:-108529745 None:intergenic
TTTCTTCAAGACCTGGAATG+GGG 0.595246 6:+108527251 MsG0680035564.01.T01:CDS
TAATGTACACCATCGGGAGT+TGG 0.596411 6:-108527097 None:intergenic
GATCCTGAATATGTCATGAC+AGG 0.597034 6:+108528627 MsG0680035564.01.T01:CDS
AGGTCTTGCATTTCTGCATG+AGG 0.604362 6:+108528363 MsG0680035564.01.T01:CDS
ACTTGCTAAGGATGGTCCAA+CGG 0.607514 6:+108528554 MsG0680035564.01.T01:CDS
TTCTTCAAGACCTGGAATGG+GGG 0.619813 6:+108527252 MsG0680035564.01.T01:CDS
ATGTCTAGAGGAATTTGAAG+AGG 0.625634 6:-108529785 None:intergenic
TCACCGATTCCTCCTCGTGG+TGG 0.626097 6:+108529931 MsG0680035564.01.T01:CDS
AGTCTCTTAGCCCATGTAAG+GGG 0.629519 6:-108528316 None:intergenic
TAAACAAAGAAGGAAATCAA+GGG 0.631043 6:+108527296 MsG0680035564.01.T01:CDS
TGATGTCTATAGCTTTGGCG+TGG 0.638045 6:+108529433 MsG0680035564.01.T01:CDS
GCCGCCACCAACATGTCTAG+AGG 0.644641 6:-108529797 None:intergenic
CACAAGTAATAGGAACTCAA+GGG 0.647200 6:+108528598 MsG0680035564.01.T01:CDS
CTTTCACCGATTCCTCCTCG+TGG 0.654967 6:+108529928 MsG0680035564.01.T01:CDS
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AATTCCTCTAGACATGTTGG+TGG + Chr6:108529793-108529812 MsG0680035564.01.T01:CDS 40.0%
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CAAGAACTTAAGTCAGCAAC+AGG + Chr6:108527148-108527167 MsG0680035564.01.T01:CDS 40.0%
CAGGCTGAAATTAACCATCT+TGG + Chr6:108527782-108527801 MsG0680035564.01.T01:intron 40.0%
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TAGACCTAGAACAAGGACTT+AGG + Chr6:108528864-108528883 MsG0680035564.01.T01:intron 40.0%
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TCTGTGTATAAAGGCTGGAT+AGG + Chr6:108527214-108527233 MsG0680035564.01.T01:CDS 40.0%
TGTGAGAAACAAGTCAGATC+AGG - Chr6:108528911-108528930 None:intergenic 40.0%
TTTCTTCAAGACCTGGAATG+GGG + Chr6:108527251-108527270 MsG0680035564.01.T01:CDS 40.0%
! AAGGCCTTGCTCTTTTATCA+CGG - Chr6:108529654-108529673 None:intergenic 40.0%
! ACCAGAATGTTTTCTTGGTG+AGG + Chr6:108527180-108527199 MsG0680035564.01.T01:CDS 40.0%
! ACCTTAAACGATAATGGCGA+TGG - Chr6:108529748-108529767 None:intergenic 40.0%
! CCAGAATGTTTTCTTGGTGA+GGG + Chr6:108527181-108527200 MsG0680035564.01.T01:CDS 40.0%
! GAAATCAAGGGCACAAAGAA+TGG + Chr6:108527308-108527327 MsG0680035564.01.T01:CDS 40.0%
! GTTCTTCTGGAGATGTTAAC+CGG + Chr6:108529455-108529474 MsG0680035564.01.T01:CDS 40.0%
! TCGTTTAAGGTCTTGCATGA+TGG + Chr6:108529757-108529776 MsG0680035564.01.T01:CDS 40.0%
! TTCGCACCAGAATGTTTTCT+TGG + Chr6:108527175-108527194 MsG0680035564.01.T01:CDS 40.0%
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!! CTGTTGCTGACTTAAGTTCT+TGG - Chr6:108527150-108527169 None:intergenic 40.0%
!! TTCTGACTTTGGACTTGCTA+AGG + Chr6:108528542-108528561 MsG0680035564.01.T01:CDS 40.0%
!! TTGGTTCTGTGTATAAAGGC+TGG + Chr6:108527209-108527228 MsG0680035564.01.T01:CDS 40.0%
ACGATCTGTACCCCTTACAT+GGG + Chr6:108528306-108528325 MsG0680035564.01.T01:CDS 45.0%
AGGTCTTGCATTTCTGCATG+AGG + Chr6:108528363-108528382 MsG0680035564.01.T01:CDS 45.0%
AGTCTCTTAGCCCATGTAAG+GGG - Chr6:108528319-108528338 None:intergenic 45.0%
CAGTCTCTTAGCCCATGTAA+GGG - Chr6:108528320-108528339 None:intergenic 45.0%
CCCTCACCAAGAAAACATTC+TGG - Chr6:108527184-108527203 None:intergenic 45.0%
GCCATCGCCATTATCGTTTA+AGG + Chr6:108529744-108529763 MsG0680035564.01.T01:CDS 45.0%
GCTACCTAAGTCCTTGTTCT+AGG - Chr6:108528871-108528890 None:intergenic 45.0%
GGAAAGCCATTGATCGGAAA+AGG + Chr6:108529480-108529499 MsG0680035564.01.T01:CDS 45.0%
GGAATCGGTGAAAGTAAAGG+AGG - Chr6:108529922-108529941 None:intergenic 45.0%
GGAGGAATCGGTGAAAGTAA+AGG - Chr6:108529925-108529944 None:intergenic 45.0%
TAATGTACACCATCGGGAGT+TGG - Chr6:108527100-108527119 None:intergenic 45.0%
TCAACTCCAGCTCGATTTCA+AGG + Chr6:108529877-108529896 MsG0680035564.01.T01:CDS 45.0%
TCAGTCTCTTAGCCCATGTA+AGG - Chr6:108528321-108528340 None:intergenic 45.0%
TCTTGAGTCTAACTAAGGGC+CGG + Chr6:108528720-108528739 MsG0680035564.01.T01:intron 45.0%
TGAAATCGAGCTGGAGTTGA+TGG - Chr6:108529877-108529896 None:intergenic 45.0%
TGCTCTTCAGCATCCAAATC+TGG + Chr6:108527805-108527824 MsG0680035564.01.T01:CDS 45.0%
TGTCGATGCAACTGCAATTG+TGG + Chr6:108529033-108529052 MsG0680035564.01.T01:intron 45.0%
TTCTTCAAGACCTGGAATGG+GGG + Chr6:108527252-108527271 MsG0680035564.01.T01:CDS 45.0%
! AACGATAATGGCGATGGCAT+TGG - Chr6:108529742-108529761 None:intergenic 45.0%
! ACATGTGTTTTGTCTCCCGT+TGG - Chr6:108528573-108528592 None:intergenic 45.0%
! ACTTGCTAAGGATGGTCCAA+CGG + Chr6:108528554-108528573 MsG0680035564.01.T01:CDS 45.0%
! GAATGTTTTCTTGGTGAGGG+TGG + Chr6:108527184-108527203 MsG0680035564.01.T01:CDS 45.0%
! GGCAGCGGTGCTAATAAATA+CGG + Chr6:108529817-108529836 MsG0680035564.01.T01:CDS 45.0%
! GGGTTTTACCCACTCAATCA+AGG - Chr6:108529522-108529541 None:intergenic 45.0%
! TGGTGATCTTGTGTTACTGC+TGG - Chr6:108527080-108527099 None:intergenic 45.0%
! TTCTGGAGATGTTAACCGGA+AGG + Chr6:108529459-108529478 MsG0680035564.01.T01:CDS 45.0%
! TTTCTTGGTGAGGGTGGATT+TGG + Chr6:108527190-108527209 MsG0680035564.01.T01:CDS 45.0%
!! GACTTAGGTAGCCTTATCGT+TGG + Chr6:108528879-108528898 MsG0680035564.01.T01:intron 45.0%
!! GACTTTGGACTTGCTAAGGA+TGG + Chr6:108528546-108528565 MsG0680035564.01.T01:CDS 45.0%
!! TGATGTCTATAGCTTTGGCG+TGG + Chr6:108529433-108529452 MsG0680035564.01.T01:CDS 45.0%
!! TTGGCTTGTGTGTGAAGAGA+AGG - Chr6:108529112-108529131 None:intergenic 45.0%
ACAAGATCACCAACTCCCGA+TGG + Chr6:108527088-108527107 MsG0680035564.01.T01:CDS 50.0%
AGGAGGGTTCTGTGAAGTGA+TGG + Chr6:108529559-108529578 MsG0680035564.01.T01:intron 50.0%
CATAGATTTCCACCACGAGG+AGG - Chr6:108529943-108529962 None:intergenic 50.0%
CCGATCAATGGCTTTCCTTC+CGG - Chr6:108529477-108529496 None:intergenic 50.0%
CCGGAAGGAAAGCCATTGAT+CGG + Chr6:108529474-108529493 MsG0680035564.01.T01:CDS 50.0%
CTTGCTAAGGATGGTCCAAC+GGG + Chr6:108528555-108528574 MsG0680035564.01.T01:CDS 50.0%
GACGATCTGTACCCCTTACA+TGG + Chr6:108528305-108528324 MsG0680035564.01.T01:CDS 50.0%
GCTGGATAGGTCTAAATGGG+AGG + Chr6:108527227-108527246 MsG0680035564.01.T01:CDS 50.0%
GGGAGGATTTCTTCAAGACC+TGG + Chr6:108527244-108527263 MsG0680035564.01.T01:CDS 50.0%
GGTGAACCTTGAAATCGAGC+TGG - Chr6:108529886-108529905 None:intergenic 50.0%
TTTCCACCACGAGGAGGAAT+CGG - Chr6:108529937-108529956 None:intergenic 50.0%
! TCAAGGGCACAAAGAATGGC+TGG + Chr6:108527312-108527331 MsG0680035564.01.T01:CDS 50.0%
! TCCTCTAGACATGTTGGTGG+CGG + Chr6:108529796-108529815 MsG0680035564.01.T01:CDS 50.0%
!! GATGCTGAAGAGCACCAAGA+TGG - Chr6:108527799-108527818 None:intergenic 50.0%
!! TAGCTTTGGCGTGGTTCTTC+TGG + Chr6:108529442-108529461 MsG0680035564.01.T01:CDS 50.0%
ACTTCACAGAACCCTCCTCC+AGG - Chr6:108529557-108529576 None:intergenic 55.0%
TCAGGATCGGCCCAACGATA+AGG - Chr6:108528893-108528912 None:intergenic 55.0%
! CTGCGGCCTTTTCCGATCAA+TGG - Chr6:108529489-108529508 None:intergenic 55.0%
!! CTTTCACCGATTCCTCCTCG+TGG + Chr6:108529928-108529947 MsG0680035564.01.T01:CDS 55.0%
GCAACAGGTACCCCCATTCC+AGG - Chr6:108527265-108527284 None:intergenic 60.0%
GCCGCCACCAACATGTCTAG+AGG - Chr6:108529800-108529819 None:intergenic 60.0%
!! AGACATGTTGGTGGCGGCAG+CGG + Chr6:108529802-108529821 MsG0680035564.01.T01:CDS 60.0%
!! GGCGATGGCATTGGTGAGCA+AGG - Chr6:108529733-108529752 None:intergenic 60.0%
!! TCACCGATTCCTCCTCGTGG+TGG + Chr6:108529931-108529950 MsG0680035564.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 108526992 108529963 108526992 ID=MsG0680035564.01;Name=MsG0680035564.01
Chr6 mRNA 108526992 108529963 108526992 ID=MsG0680035564.01.T01;Parent=MsG0680035564.01;Name=MsG0680035564.01.T01;_AED=0.15;_eAED=0.15;_QI=0|0|0|1|1|1|6|0|403
Chr6 exon 108526992 108527333 108526992 ID=MsG0680035564.01.T01:exon:7546;Parent=MsG0680035564.01.T01
Chr6 exon 108527785 108527920 108527785 ID=MsG0680035564.01.T01:exon:7545;Parent=MsG0680035564.01.T01
Chr6 exon 108528305 108528444 108528305 ID=MsG0680035564.01.T01:exon:7544;Parent=MsG0680035564.01.T01
Chr6 exon 108528525 108528648 108528525 ID=MsG0680035564.01.T01:exon:7543;Parent=MsG0680035564.01.T01
Chr6 exon 108529414 108529528 108529414 ID=MsG0680035564.01.T01:exon:7542;Parent=MsG0680035564.01.T01
Chr6 exon 108529609 108529963 108529609 ID=MsG0680035564.01.T01:exon:7541;Parent=MsG0680035564.01.T01
Chr6 CDS 108526992 108527333 108526992 ID=MsG0680035564.01.T01:cds;Parent=MsG0680035564.01.T01
Chr6 CDS 108527785 108527920 108527785 ID=MsG0680035564.01.T01:cds;Parent=MsG0680035564.01.T01
Chr6 CDS 108528305 108528444 108528305 ID=MsG0680035564.01.T01:cds;Parent=MsG0680035564.01.T01
Chr6 CDS 108528525 108528648 108528525 ID=MsG0680035564.01.T01:cds;Parent=MsG0680035564.01.T01
Chr6 CDS 108529414 108529528 108529414 ID=MsG0680035564.01.T01:cds;Parent=MsG0680035564.01.T01
Chr6 CDS 108529609 108529963 108529609 ID=MsG0680035564.01.T01:cds;Parent=MsG0680035564.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680035564.01.T01

ATGTTGCTTATTAAGTTTGACCTAATATTTTTTTCTTGTAAATTTATAGATGATAAGGTCGTTGTTGGTACTCAAAATTCTTCAACCAGCAGTAACACAAGATCACCAACTCCCGATGGTGTACATTATTATTCCAATCTTAACCAATTCACGTACCAAGAACTTAAGTCAGCAACAGGACATTTCGCACCAGAATGTTTTCTTGGTGAGGGTGGATTTGGTTCTGTGTATAAAGGCTGGATAGGTCTAAATGGGAGGATTTCTTCAAGACCTGGAATGGGGGTACCTGTTGCTGTAAAAACTTTAAACAAAGAAGGAAATCAAGGGCACAAAGAATGGCTGGCTGAAATTAACCATCTTGGTGCTCTTCAGCATCCAAATCTGGTTAGACTTGTTGGTTACTGCATTGAAGATGAAAATAGGCTGCTTGTTTATGAGTTCATGCCAAAAGGAAGTTTGGAAAATCATCTATTTAAGAGACGATCTGTACCCCTTACATGGGCTAAGAGACTGAAAATTATGCTTGGTGCTGCAAAAGGTCTTGCATTTCTGCATGAGGAAGCTGAGAAGCCAATCATATATAGAGATTTCAAAACTTCTAATATCCTATTGGATTCGGAATATAATGCAAAACTTTCTGACTTTGGACTTGCTAAGGATGGTCCAACGGGAGACAAAACACATGTGTCAACACAAGTAATAGGAACTCAAGGGTATGCTGATCCTGAATATGTCATGACAGGGCACCTTAGTTCCAAGAGTGATGTCTATAGCTTTGGCGTGGTTCTTCTGGAGATGTTAACCGGAAGGAAAGCCATTGATCGGAAAAGGCCGCAGAATGAACAAACCTTGATTGAGGGAGCCTACAAAGCAATGAAGATAGTTGCGCAATGTGTTTACCGTGATAAAAGAGCAAGGCCTTTAATGAGTGAAGTTGTCAAGGAGCTCAAAACTATCATTGATTACAACAATGATATTCCTTGCTCACCAATGCCATCGCCATTATCGTTTAAGGTCTTGCATGATGGCGCTTCCTCTTCAAATTCCTCTAGACATGTTGGTGGCGGCAGCGGTGCTAATAAATACGGTCCTACAATTGGTTCATCATCTTCGGCTTCAACTCCATCAACTCCAGCTCGATTTCAAGGTTCACCATTGAACTTTACTCCTCCTTTACTTTCACCGATTCCTCCTCGTGGTGGAAATCTATGA
Protein sequence

>MsG0680035564.01.T01

MLLIKFDLIFFSCKFIDDKVVVGTQNSSTSSNTRSPTPDGVHYYSNLNQFTYQELKSATGHFAPECFLGEGGFGSVYKGWIGLNGRISSRPGMGVPVAVKTLNKEGNQGHKEWLAEINHLGALQHPNLVRLVGYCIEDENRLLVYEFMPKGSLENHLFKRRSVPLTWAKRLKIMLGAAKGLAFLHEEAEKPIIYRDFKTSNILLDSEYNAKLSDFGLAKDGPTGDKTHVSTQVIGTQGYADPEYVMTGHLSSKSDVYSFGVVLLEMLTGRKAIDRKRPQNEQTLIEGAYKAMKIVAQCVYRDKRARPLMSEVVKELKTIIDYNNDIPCSPMPSPLSFKVLHDGASSSNSSRHVGGGSGANKYGPTIGSSSSASTPSTPARFQGSPLNFTPPLLSPIPPRGGNL*