AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680035822.01

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MsG0680035822.01.T01 AT1G21250 31.752 274 133 6 25 248 410 679 1.08e-26 112
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MsG0680035822.01.T01 AT4G27290 28.723 282 145 7 16 245 503 780 1.23e-26 112
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MsG0680035822.01.T01 AT1G61430 29.110 292 151 8 23 262 465 752 1.29e-26 111
MsG0680035822.01.T01 AT1G61430 29.110 292 151 8 23 262 465 752 1.29e-26 111
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MsG0680035822.01.T01 AT1G24030 38.182 165 84 4 21 169 59 221 3.61e-26 106
MsG0680035822.01.T01 AT5G59270 28.472 288 152 7 11 248 354 637 3.66e-26 110
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MsG0680035822.01.T01 AT1G24030 37.805 164 84 4 22 169 6 167 4.48e-26 106
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MsG0680035822.01.T01 AT1G61420 28.622 283 145 9 23 253 495 772 6.37e-26 109
MsG0680035822.01.T01 AT1G65790 27.491 291 140 6 21 250 516 796 6.38e-26 109
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MsG0680035822.01.T01 AT3G08870 28.523 298 152 7 5 249 369 658 8.27e-26 109
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MsG0680035822.01.T01 AT3G45430 28.966 290 151 10 11 250 330 614 1.76e-25 108
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MsG0680035822.01.T01 AT5G60320 28.571 308 165 10 1 258 323 625 3.18e-25 107
MsG0680035822.01.T01 AT2G32800 40.373 161 74 3 23 164 116 273 3.19e-25 107
MsG0680035822.01.T01 AT2G28960 29.630 297 149 9 7 251 557 845 3.23e-25 107
MsG0680035822.01.T01 AT2G28960 29.630 297 149 9 7 251 425 713 3.27e-25 107
MsG0680035822.01.T01 AT3G02130 27.305 282 150 6 23 254 856 1132 3.39e-25 107
MsG0680035822.01.T01 AT1G61430 28.814 295 151 9 23 262 488 778 3.41e-25 107
MsG0680035822.01.T01 AT1G61360 39.474 152 72 5 28 164 502 648 3.47e-25 107
MsG0680035822.01.T01 AT1G51860 31.618 272 132 10 29 251 589 855 3.53e-25 107
MsG0680035822.01.T01 AT1G61360 39.474 152 72 5 28 164 421 567 3.74e-25 107
MsG0680035822.01.T01 AT1G61360 39.474 152 72 5 28 164 421 567 3.74e-25 107
MsG0680035822.01.T01 AT1G61360 39.474 152 72 5 28 164 421 567 3.74e-25 107
MsG0680035822.01.T01 AT5G35370 41.216 148 70 3 30 164 521 664 3.74e-25 107
MsG0680035822.01.T01 AT1G51860 31.618 272 132 10 29 251 445 711 3.75e-25 107
MsG0680035822.01.T01 AT1G11330 40.385 156 75 4 23 164 523 674 3.89e-25 107
MsG0680035822.01.T01 AT1G11330 40.385 156 75 4 23 164 523 674 4.13e-25 107
MsG0680035822.01.T01 AT1G11330 40.385 156 75 4 23 164 521 672 4.15e-25 107
MsG0680035822.01.T01 AT2G18890 34.831 178 94 6 2 164 50 220 4.46e-25 103
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MsG0680035822.01.T01 AT1G11300 30.345 290 146 10 7 250 481 760 9.05e-25 106
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MsG0680035822.01.T01 AT1G12460 28.276 290 144 7 24 253 593 878 1.33e-24 105
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MsG0680035822.01.T01 AT5G24080 28.571 294 152 9 13 253 391 679 2.75e-24 104
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MsG0680035822.01.T01 AT5G54380 40.667 150 72 3 26 162 512 657 3.83e-24 104
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MsG0680035822.01.T01 AT2G13800 28.428 299 151 8 7 248 140 432 4.17e-24 103
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MsG0680035822.01.T01 AT1G61430 36.538 156 81 3 23 164 488 639 4.39e-24 104
MsG0680035822.01.T01 AT1G61430 36.538 156 81 3 23 164 465 616 4.42e-24 104
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MsG0680035822.01.T01 AT5G16900 28.966 290 152 8 11 251 561 845 4.56e-24 104
MsG0680035822.01.T01 AT1G67720 42.857 147 66 3 30 162 612 754 4.57e-24 104
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MsG0680035822.01.T01 AT5G59260 28.472 288 152 8 11 248 341 624 4.72e-24 103
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MsG0680035822.01.T01 AT2G13800 28.428 299 151 8 7 248 257 549 9.67e-24 102
MsG0680035822.01.T01 AT4G23250 27.857 280 144 7 23 249 358 632 1.04e-23 103
MsG0680035822.01.T01 AT4G23250 27.857 280 144 7 23 249 353 627 1.06e-23 103
MsG0680035822.01.T01 AT4G11530 27.063 303 156 9 6 250 331 626 1.10e-23 102
MsG0680035822.01.T01 AT1G51830 28.267 329 173 9 15 293 376 691 1.19e-23 102
MsG0680035822.01.T01 AT1G35710 28.322 286 150 10 15 249 839 1120 1.22e-23 103
MsG0680035822.01.T01 AT1G51890 28.231 294 135 7 29 251 575 863 1.24e-23 102
MsG0680035822.01.T01 AT1G16120 37.278 169 87 3 29 182 434 598 1.27e-23 102
MsG0680035822.01.T01 AT2G48010 34.673 199 93 8 8 181 266 452 1.33e-23 102
MsG0680035822.01.T01 AT1G20650 34.118 170 89 3 9 163 67 228 1.61e-23 100
MsG0680035822.01.T01 AT2G19130 28.986 276 131 6 30 248 499 766 1.69e-23 102
MsG0680035822.01.T01 AT4G03230 28.521 284 142 9 21 250 529 805 1.87e-23 102
MsG0680035822.01.T01 AT4G23220 30.108 279 138 9 24 250 337 610 1.96e-23 102
MsG0680035822.01.T01 AT4G11480 27.667 300 156 10 7 250 301 595 2.10e-23 102
MsG0680035822.01.T01 AT4G11480 27.667 300 156 10 7 250 304 598 2.17e-23 102
MsG0680035822.01.T01 AT4G04510 39.181 171 81 5 12 164 326 491 2.23e-23 102
MsG0680035822.01.T01 AT5G56460 37.349 166 78 5 19 162 71 232 2.33e-23 100
MsG0680035822.01.T01 AT4G04510 39.181 171 81 5 12 164 324 489 2.33e-23 102
MsG0680035822.01.T01 AT1G61860 39.073 151 72 4 29 163 90 236 2.38e-23 100
MsG0680035822.01.T01 AT4G23260 27.083 288 152 7 16 250 320 602 2.42e-23 102
MsG0680035822.01.T01 AT2G43700 26.642 274 144 6 29 250 339 607 2.54e-23 101
MsG0680035822.01.T01 AT1G18390 41.722 151 65 4 30 164 350 493 2.55e-23 101
MsG0680035822.01.T01 AT2G43700 26.642 274 144 6 29 250 315 583 2.56e-23 101
MsG0680035822.01.T01 AT2G43700 26.642 274 144 6 29 250 315 583 2.56e-23 101
MsG0680035822.01.T01 AT2G43700 26.642 274 144 6 29 250 315 583 2.56e-23 101
MsG0680035822.01.T01 AT2G43700 26.642 274 144 6 29 250 315 583 2.56e-23 101
MsG0680035822.01.T01 AT4G23260 27.208 283 148 7 21 250 336 613 2.57e-23 101
MsG0680035822.01.T01 AT5G02800 36.257 171 82 4 14 163 60 224 2.59e-23 100
MsG0680035822.01.T01 AT1G16110 36.723 177 91 3 23 182 431 603 2.61e-23 101
MsG0680035822.01.T01 AT4G27300 35.570 149 78 3 28 162 504 648 2.69e-23 102
MsG0680035822.01.T01 AT4G23250 27.857 280 144 7 23 249 353 627 2.69e-23 102
MsG0680035822.01.T01 AT1G34300 29.433 282 138 8 30 255 490 766 2.89e-23 102
MsG0680035822.01.T01 AT4G00330 29.596 223 122 4 30 239 125 325 2.97e-23 100
MsG0680035822.01.T01 AT4G00330 29.596 223 122 4 30 239 125 325 2.97e-23 100
MsG0680035822.01.T01 AT3G47110 38.372 172 72 6 23 166 718 883 3.01e-23 102
MsG0680035822.01.T01 AT1G51890 40.541 148 69 4 29 162 575 717 3.11e-23 101
MsG0680035822.01.T01 AT4G03230 28.521 284 142 9 21 250 587 863 3.27e-23 101
MsG0680035822.01.T01 AT4G03230 28.521 284 142 9 21 250 587 863 3.27e-23 101
MsG0680035822.01.T01 AT4G29180 33.505 194 99 4 1 164 533 726 3.34e-23 101
MsG0680035822.01.T01 AT1G79620 37.500 160 79 4 20 164 634 787 3.39e-23 101
MsG0680035822.01.T01 AT5G01560 28.094 299 161 9 5 253 343 637 3.52e-23 101
MsG0680035822.01.T01 AT4G03230 28.521 284 142 9 21 250 687 963 3.54e-23 101
MsG0680035822.01.T01 AT4G03230 28.521 284 142 9 21 250 687 963 3.54e-23 101
MsG0680035822.01.T01 AT1G18390 41.722 151 65 4 30 164 344 487 3.64e-23 101
MsG0680035822.01.T01 AT4G03230 28.521 284 142 9 21 250 615 891 3.67e-23 101
MsG0680035822.01.T01 AT4G35030 36.129 155 80 2 22 161 102 252 3.86e-23 99.0
MsG0680035822.01.T01 AT1G11340 36.306 157 80 4 23 164 582 733 3.91e-23 101
MsG0680035822.01.T01 AT1G11340 35.849 159 82 4 21 164 512 665 4.08e-23 101
MsG0680035822.01.T01 AT1G79620 37.500 160 79 4 20 164 660 813 4.12e-23 101
MsG0680035822.01.T01 AT4G03230 28.521 284 142 9 21 250 522 798 4.15e-23 101
MsG0680035822.01.T01 AT4G03230 28.521 284 142 9 21 250 530 806 4.17e-23 101
MsG0680035822.01.T01 AT4G23320 26.882 279 144 6 27 250 184 457 4.52e-23 100
MsG0680035822.01.T01 AT4G23320 26.882 279 144 6 27 250 184 457 4.52e-23 100
MsG0680035822.01.T01 AT3G46400 29.151 271 139 5 30 251 582 848 4.64e-23 101
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MsG0680035822.01.T01 AT4G35030 36.129 155 80 2 22 161 102 252 5.30e-23 99.4
MsG0680035822.01.T01 AT1G79620 37.500 160 79 4 20 164 634 787 5.36e-23 100
MsG0680035822.01.T01 AT4G22130 38.462 156 79 2 23 163 253 406 5.48e-23 100
MsG0680035822.01.T01 AT3G24790 34.682 173 91 3 6 163 33 198 5.80e-23 99.0
MsG0680035822.01.T01 AT4G29990 38.776 147 72 3 29 162 579 720 5.91e-23 100
MsG0680035822.01.T01 AT1G61380 26.623 308 159 11 23 272 340 638 6.09e-23 100

Find 64 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 257 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ATTTCAGTTGTCTACATATT+TGG 0.162649 6:-112809946 MsG0680035822.01.T01:CDS
GAAAACAAGTAACATTCTTT+TGG 0.254565 6:-112811162 MsG0680035822.01.T01:CDS
ATCATTGGAAGTGGTGGATT+TGG 0.289721 6:-112811571 MsG0680035822.01.T01:CDS
AGTTGGAACAGAACCATTCT+AGG 0.301545 6:-112809897 MsG0680035822.01.T01:CDS
TTCACAACTTCCTTCATTGA+TGG 0.307827 6:+112810576 None:intergenic
TACTTTGCTGCTCGATGTTT+GGG 0.307890 6:+112806839 None:intergenic
AATGCAAAAGTTGCTGATTT+CGG 0.317169 6:-112811128 MsG0680035822.01.T01:CDS
GACATGGTAGCAAGTTCTTT+TGG 0.317773 6:+112811083 None:intergenic
GTACTTTGCTGCTCGATGTT+TGG 0.318070 6:+112806838 None:intergenic
GAACTGAATCCACAAGCTTC+TGG 0.336494 6:+112811470 None:intergenic
CACATTTCTTTCACATTACT+AGG 0.339704 6:+112810651 None:intergenic
TCTTGCAGAATGGGCGTGGC+TGG 0.365909 6:-112810731 MsG0680035822.01.T01:CDS
TTGAAATACTGAGCAATATT+CGG 0.378000 6:-112811438 MsG0680035822.01.T01:CDS
ATGAAAATCAAAGCCTTGAT+AGG 0.381132 6:-112811345 MsG0680035822.01.T01:CDS
TTTCGGTCTCGCCAGAATAT+TGG 0.389940 6:-112811111 MsG0680035822.01.T01:CDS
CGTGTTGCTGTTGAAGATTT+AGG 0.415116 6:-112811538 MsG0680035822.01.T01:CDS
AAATGTTAAGATTGAAGAAA+TGG 0.419833 6:-112806805 MsG0680035822.01.T01:CDS
TCTTGTGCAGCCACCTATCA+AGG 0.430941 6:+112811332 None:intergenic
TTCATTGATGGTCGTCTAGC+TGG 0.435884 6:+112810588 None:intergenic
TTTGAGTTTCCAACCTAGAA+TGG 0.438223 6:+112809884 None:intergenic
GTTCTCGTCTCTTGCAGAAT+GGG 0.439981 6:-112810740 MsG0680035822.01.T01:CDS
TAGGTTGGAAACTCAAAAGT+TGG 0.440479 6:-112809878 MsG0680035822.01.T01:CDS
TTCACGTCTCGATGAACAAT+AGG 0.445943 6:+112811182 None:intergenic
GAATTTGAAAGGGGAAAAGC+AGG 0.460866 6:-112810475 MsG0680035822.01.T01:intron
GTCTAGAAGTTCTTCTATCT+CGG 0.464594 6:+112810689 None:intergenic
CACTTCTTAAGAATTTGAAA+GGG 0.468874 6:-112810485 MsG0680035822.01.T01:CDS
CCACTTCTTAAGAATTTGAA+AGG 0.477550 6:-112810486 MsG0680035822.01.T01:CDS
CCTTTCAAATTCTTAAGAAG+TGG 0.477997 6:+112810486 None:intergenic
CAATTACAGCTCTCTTTCCA+AGG 0.481738 6:+112806898 None:intergenic
AGTTCTCGTCTCTTGCAGAA+TGG 0.482998 6:-112810741 MsG0680035822.01.T01:CDS
ATGTCAGAACATAATATCAT+TGG 0.483836 6:-112811586 MsG0680035822.01.T01:CDS
CGTCTCTTGCAGAATGGGCG+TGG 0.497079 6:-112810735 MsG0680035822.01.T01:CDS
CATAATATCATTGGAAGTGG+TGG 0.500301 6:-112811577 MsG0680035822.01.T01:CDS
ACTTCTAGACGACGATGCTA+TGG 0.525128 6:-112810676 MsG0680035822.01.T01:CDS
CAAACCTTGTGCAGCTCCGA+TGG 0.534053 6:+112811232 None:intergenic
ATGTGCAGCATCTTCAAACT+TGG 0.534536 6:-112810633 MsG0680035822.01.T01:CDS
ACAGGAAAAGAAGCAAATCA+TGG 0.535112 6:-112810769 MsG0680035822.01.T01:intron
GAACATAATATCATTGGAAG+TGG 0.537824 6:-112811580 MsG0680035822.01.T01:CDS
AAAGAAAGCGATTAATGAGA+AGG 0.538460 6:-112811669 None:intergenic
ATATGTGCAGGCAAATCCCT+TGG 0.540736 6:-112806915 MsG0680035822.01.T01:intron
TGTGAAACTCAGCCTCTGAA+AGG 0.549355 6:+112811630 None:intergenic
GGAACAGAACCATTCTAGGT+TGG 0.549924 6:-112809893 MsG0680035822.01.T01:CDS
GGCTGGCGCCACATTCAGAT+AGG 0.552132 6:-112810714 MsG0680035822.01.T01:CDS
AATTACAGCTCTCTTTCCAA+GGG 0.554221 6:+112806899 None:intergenic
ATCGACATCAATGAAAGGAA+TGG 0.560182 6:+112806866 None:intergenic
TTCAACAGCAACACGGTACA+CGG 0.567015 6:+112811546 None:intergenic
TGTTCCAGCCACAGCTGACA+TGG 0.568226 6:+112811067 None:intergenic
ATCTTCTCCACGTTGGCGAG+TGG 0.568800 6:+112810531 None:intergenic
AACCATGTTGTTAGAGAAGA+CGG 0.574110 6:-112809850 MsG0680035822.01.T01:intron
AGCTAGACGACCATCAATGA+AGG 0.589337 6:-112810586 MsG0680035822.01.T01:CDS
ACTTCTTAAGAATTTGAAAG+GGG 0.594990 6:-112810484 MsG0680035822.01.T01:CDS
GAATCATCGACATCAATGAA+AGG 0.600917 6:+112806861 None:intergenic
GGAAGCTAACTTCCTTTCAG+AGG 0.613378 6:-112811642 MsG0680035822.01.T01:CDS
TCTCGGTTCCTATCTGAATG+TGG 0.618954 6:+112810706 None:intergenic
AAAATCAAAGCCTTGATAGG+TGG 0.624199 6:-112811342 MsG0680035822.01.T01:CDS
AAAGTTAGACCAGAAGCTTG+TGG 0.629762 6:-112811479 MsG0680035822.01.T01:CDS
GAAGATATTGAGCAACTGCA+AGG 0.635116 6:-112810556 MsG0680035822.01.T01:CDS
ATAGCCATCGGAGCTGCACA+AGG 0.642108 6:-112811236 MsG0680035822.01.T01:intron
AGCGATTAATGAGAAGGACA+TGG 0.642245 6:-112811663 None:intergenic
ATCAACAATCTTCTCCACGT+TGG 0.662875 6:+112810524 None:intergenic
TACCGTCTTCTCTAACAACA+TGG 0.663192 6:+112809848 None:intergenic
CAAGGATCCACTCGCCAACG+TGG 0.678973 6:-112810538 MsG0680035822.01.T01:CDS
ACGTCTCGATGAACAATAGG+CGG 0.680413 6:+112811185 None:intergenic
CTAAATCTTCAACAGCAACA+CGG 0.689582 6:+112811539 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAACTAATATATTTATATCT+TGG + Chr6:112809887-112809906 None:intergenic 10.0%
!! AACTAATATATTTATATCTT+GGG + Chr6:112809886-112809905 None:intergenic 10.0%
!! ATAAGAATAAACAAAAATAT+TGG - Chr6:112809924-112809943 MsG0680035822.01.T01:CDS 10.0%
!! ATATCAAATTTATATATACA+CGG + Chr6:112811306-112811325 None:intergenic 10.0%
!!! TATATTTCACTATTTTATTA+CGG + Chr6:112810270-112810289 None:intergenic 10.0%
!!! TTTTTTTATAATAGTGTAAT+TGG - Chr6:112808473-112808492 MsG0680035822.01.T01:intron 10.0%
!! AAAAGAAATAAAGAAAGAAA+AGG + Chr6:112809244-112809263 None:intergenic 15.0%
!! AATATAATCTTAAATTCACA+TGG + Chr6:112810480-112810499 None:intergenic 15.0%
!! ATATATTATAAACTGAACAT+AGG + Chr6:112807501-112807520 None:intergenic 15.0%
!! ATCAATAAATATGCAATAAT+AGG - Chr6:112809274-112809293 MsG0680035822.01.T01:intron 15.0%
!! ATTACTCTTTCTAAATTAAA+GGG - Chr6:112809307-112809326 MsG0680035822.01.T01:intron 15.0%
!! ATTATGTATTATTATCAGAT+AGG + Chr6:112808233-112808252 None:intergenic 15.0%
!! CATTATTCTTCTTTATATAT+TGG - Chr6:112811267-112811286 MsG0680035822.01.T01:intron 15.0%
!! TATCTGATAATAATACATAA+TGG - Chr6:112808232-112808251 MsG0680035822.01.T01:intron 15.0%
!! TGGAAGAAAAAAAAATTAAA+AGG - Chr6:112810390-112810409 MsG0680035822.01.T01:intron 15.0%
!! TGTATATCATAATAATCAAA+AGG - Chr6:112809079-112809098 MsG0680035822.01.T01:intron 15.0%
!!! TGAGAATATGTATTATTTTT+TGG + Chr6:112809746-112809765 None:intergenic 15.0%
!!! TTAATTTTTTTTTCTTCCAA+TGG + Chr6:112810389-112810408 None:intergenic 15.0%
!!! TTCACATTATTCATTTTAAT+TGG + Chr6:112809357-112809376 None:intergenic 15.0%
!! AAAAAAAAACAATTGAGATG+AGG + Chr6:112809506-112809525 None:intergenic 20.0%
!! AAATACACATTAATTGAATG+TGG + Chr6:112809445-112809464 None:intergenic 20.0%
!! AAATGTTAAGATTGAAGAAA+TGG - Chr6:112811650-112811669 MsG0680035822.01.T01:CDS 20.0%
!! AAATTCACTTTAAACTTCAA+AGG - Chr6:112808183-112808202 MsG0680035822.01.T01:intron 20.0%
!! AAATTCACTTTGAACTTATA+AGG + Chr6:112808854-112808873 None:intergenic 20.0%
!! AATACACATTAATTGAATGT+GGG + Chr6:112809444-112809463 None:intergenic 20.0%
!! AATGAATAAAGACTTGAAAA+CGG + Chr6:112810808-112810827 None:intergenic 20.0%
!! AGGATAGTAAATATTACAAA+AGG - Chr6:112809042-112809061 MsG0680035822.01.T01:intron 20.0%
!! ATACATTTGACAATTGTAAT+AGG - Chr6:112810520-112810539 MsG0680035822.01.T01:CDS 20.0%
!! ATGCATATTTGTAACAAAAT+AGG - Chr6:112808106-112808125 MsG0680035822.01.T01:intron 20.0%
!! ATGGAAGAAATATTACTATA+AGG + Chr6:112811474-112811493 None:intergenic 20.0%
!! ATTGAAAAAACACTAAGATA+TGG + Chr6:112809579-112809598 None:intergenic 20.0%
!! CATGTTTACAAGAATAAATT+AGG + Chr6:112809173-112809192 None:intergenic 20.0%
!! GATTACTCTTTCTAAATTAA+AGG - Chr6:112809306-112809325 MsG0680035822.01.T01:intron 20.0%
!! TATTATAGCTTGAATACTTA+AGG - Chr6:112810987-112811006 MsG0680035822.01.T01:intron 20.0%
!! TCATAGAAGAGAAAATAAAT+GGG - Chr6:112808346-112808365 MsG0680035822.01.T01:intron 20.0%
!! TTAGGATTAACTTAACTTAT+TGG + Chr6:112809155-112809174 None:intergenic 20.0%
!! TTATGATATACATTCCTAAT+TGG + Chr6:112809071-112809090 None:intergenic 20.0%
!!! AATTCAAGTATTGTACTTAA+TGG + Chr6:112811493-112811512 None:intergenic 20.0%
!!! ATGTATTATTTTTTGGTACA+AGG + Chr6:112809739-112809758 None:intergenic 20.0%
!!! CATTATTTTTATACCTTAGA+AGG - Chr6:112809655-112809674 MsG0680035822.01.T01:intron 20.0%
!!! CTTCTAAGGTATAAAAATAA+TGG + Chr6:112809657-112809676 None:intergenic 20.0%
!!! TAATTTCTGAAACACAATTT+AGG - Chr6:112808682-112808701 MsG0680035822.01.T01:intron 20.0%
!!! TCTTAGTGTTTTTTCAATTT+TGG - Chr6:112809581-112809600 MsG0680035822.01.T01:intron 20.0%
!!! TGTATTATTTTTTGGTACAA+GGG + Chr6:112809738-112809757 None:intergenic 20.0%
!!! TTATTTTATCACATGTTCAA+AGG + Chr6:112808086-112808105 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTGTAATATTTACTATCC+TGG + Chr6:112809043-112809062 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTTTTTTAGATCCTTCTA+AGG + Chr6:112809671-112809690 None:intergenic 20.0%
! AAAAAAACTAGTGACAAGTT+TGG + Chr6:112810933-112810952 None:intergenic 25.0%
! AAGATAGATGTTTACAACTT+TGG - Chr6:112807641-112807660 MsG0680035822.01.T01:intron 25.0%
! ACCATTAATGTATAGAGTAT+AGG + Chr6:112811398-112811417 None:intergenic 25.0%
! ACCTATACTCTATACATTAA+TGG - Chr6:112811394-112811413 MsG0680035822.01.T01:CDS 25.0%
! ACTTCTTAAGAATTTGAAAG+GGG - Chr6:112807971-112807990 MsG0680035822.01.T01:intron 25.0%
! AGTAAGCTTCTTGTATAAAA+TGG + Chr6:112810841-112810860 None:intergenic 25.0%
! ATACACATTAATTGAATGTG+GGG + Chr6:112809443-112809462 None:intergenic 25.0%
! ATGTCAGAACATAATATCAT+TGG - Chr6:112806869-112806888 MsG0680035822.01.T01:CDS 25.0%
! ATTGTCATAGTTATGATTCA+GGG - Chr6:112811048-112811067 MsG0680035822.01.T01:intron 25.0%
! ATTTCAGTTGTCTACATATT+TGG - Chr6:112808509-112808528 MsG0680035822.01.T01:intron 25.0%
! CACTTCTTAAGAATTTGAAA+GGG - Chr6:112807970-112807989 MsG0680035822.01.T01:intron 25.0%
! GAAGAAATATTACTATAAGG+CGG + Chr6:112811471-112811490 None:intergenic 25.0%
! GTCATAGAAGAGAAAATAAA+TGG - Chr6:112808345-112808364 MsG0680035822.01.T01:intron 25.0%
! TCTTGTAAACATGTTACATT+TGG - Chr6:112809180-112809199 MsG0680035822.01.T01:intron 25.0%
! TTAACTTAACTTATTGGCAA+AGG + Chr6:112809149-112809168 None:intergenic 25.0%
! TTCTACGATTTAAGAAATTC+AGG + Chr6:112810014-112810033 None:intergenic 25.0%
! TTGAAATACTGAGCAATATT+CGG - Chr6:112807017-112807036 MsG0680035822.01.T01:intron 25.0%
! TTTATACAAGAAGCTTACTT+TGG - Chr6:112810842-112810861 MsG0680035822.01.T01:intron 25.0%
!! AAGGAAAGAAATCTAAAGTT+TGG - Chr6:112808202-112808221 MsG0680035822.01.T01:intron 25.0%
!! AATGTTCATTCTCAATTTTG+TGG + Chr6:112808765-112808784 None:intergenic 25.0%
!! ATTTGAAACACATTGCTTAT+TGG + Chr6:112808917-112808936 None:intergenic 25.0%
!! CAAAATAGGAAATTGAGTTT+TGG - Chr6:112808120-112808139 MsG0680035822.01.T01:intron 25.0%
!! GAAAACAAGTAACATTCTTT+TGG - Chr6:112807293-112807312 MsG0680035822.01.T01:intron 25.0%
!! TGACATATTTGCACTATTTT+CGG + Chr6:112811216-112811235 None:intergenic 25.0%
!!! AGATTTTAACTCATAGCTTT+TGG + Chr6:112809122-112809141 None:intergenic 25.0%
!!! GACTATTTTGATACAAAAGT+TGG - Chr6:112808541-112808560 MsG0680035822.01.T01:intron 25.0%
!!! GATTTTAACTCATAGCTTTT+GGG + Chr6:112809121-112809140 None:intergenic 25.0%
!!! TATCCTGGTTTATTTTTGTT+TGG + Chr6:112809028-112809047 None:intergenic 25.0%
AAAACCATTGAGTAATCCAA+GGG - Chr6:112811025-112811044 MsG0680035822.01.T01:intron 30.0%
AATTGAGTAGTTTGAAAACG+AGG - Chr6:112808651-112808670 MsG0680035822.01.T01:intron 30.0%
AGCTTAAATTAGTAATCTGC+AGG + Chr6:112811434-112811453 None:intergenic 30.0%
ATGAAAATCAAAGCCTTGAT+AGG - Chr6:112807110-112807129 MsG0680035822.01.T01:intron 30.0%
ATGGTGACAAATGAAACAAA+AGG - Chr6:112808251-112808270 MsG0680035822.01.T01:intron 30.0%
ATGTTGCAGTGAAAAAGATA+AGG - Chr6:112806942-112806961 MsG0680035822.01.T01:intron 30.0%
ATTACAAAAGGTTGCCAATT+AGG - Chr6:112809054-112809073 MsG0680035822.01.T01:intron 30.0%
ATTCACGCATGAAATTAACA+TGG + Chr6:112807587-112807606 None:intergenic 30.0%
CACATTTCTTTCACATTACT+AGG + Chr6:112807807-112807826 None:intergenic 30.0%
CATAACATCCTTGAATTGAT+TGG - Chr6:112807181-112807200 MsG0680035822.01.T01:intron 30.0%
CCACTTCTTAAGAATTTGAA+AGG - Chr6:112807969-112807988 MsG0680035822.01.T01:intron 30.0%
CCTTTCAAATTCTTAAGAAG+TGG + Chr6:112807972-112807991 None:intergenic 30.0%
GAACATAATATCATTGGAAG+TGG - Chr6:112806875-112806894 MsG0680035822.01.T01:CDS 30.0%
GAATCAAATAAGCTGTAGTT+AGG - Chr6:112808373-112808392 MsG0680035822.01.T01:intron 30.0%
GATTGTCATAGTTATGATTC+AGG - Chr6:112811047-112811066 MsG0680035822.01.T01:intron 30.0%
GCAAATATGTCAAAGAGAAA+AGG - Chr6:112811224-112811243 MsG0680035822.01.T01:CDS 30.0%
TAAAACCATTGAGTAATCCA+AGG - Chr6:112811024-112811043 MsG0680035822.01.T01:intron 30.0%
TAAACCATTGGGAAAACAAA+TGG + Chr6:112810446-112810465 None:intergenic 30.0%
TATGTCAAAGAGAAAAGGAT+CGG - Chr6:112811229-112811248 MsG0680035822.01.T01:CDS 30.0%
TCAATTCAAGGATGTTATGA+TGG + Chr6:112807180-112807199 None:intergenic 30.0%
TCATGCAAATCTAAACCATT+GGG + Chr6:112810457-112810476 None:intergenic 30.0%
TGACCAAACAAAAATAAACC+AGG - Chr6:112809022-112809041 MsG0680035822.01.T01:intron 30.0%
TGGGTTTCATGTATATTACT+TGG - Chr6:112810055-112810074 MsG0680035822.01.T01:intron 30.0%
TGGTGACAAATGAAACAAAA+GGG - Chr6:112808252-112808271 MsG0680035822.01.T01:intron 30.0%
TGTTGCAGTGAAAAAGATAA+GGG - Chr6:112806943-112806962 MsG0680035822.01.T01:intron 30.0%
TTGTCATAGTTATGATTCAG+GGG - Chr6:112811049-112811068 MsG0680035822.01.T01:intron 30.0%
TTTACAGTTTAGTGAGACTT+GGG + Chr6:112808877-112808896 None:intergenic 30.0%
! ACTTTAGAAGATTAAGTGCT+AGG - Chr6:112808050-112808069 MsG0680035822.01.T01:intron 30.0%
! CGTTTTCAAACTACTCAATT+TGG + Chr6:112808651-112808670 None:intergenic 30.0%
! GCACTTTAAAAGATGAAGTT+AGG + Chr6:112808162-112808181 None:intergenic 30.0%
!! AAGGTATTGTCCTCTATAAA+AGG + Chr6:112808964-112808983 None:intergenic 30.0%
!! AATGCAAAAGTTGCTGATTT+CGG - Chr6:112807327-112807346 MsG0680035822.01.T01:intron 30.0%
!!! ACATAGTTTTTGGTAAAAGC+AGG - Chr6:112811166-112811185 MsG0680035822.01.T01:CDS 30.0%
!!! ACTTGACATTGTTTTTTAGG+AGG - Chr6:112810746-112810765 MsG0680035822.01.T01:CDS 30.0%
!!! CATAGTTTTTGGTAAAAGCA+GGG - Chr6:112811167-112811186 MsG0680035822.01.T01:CDS 30.0%
!!! CTTGACATTGTTTTTTAGGA+GGG - Chr6:112810747-112810766 MsG0680035822.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTATGAGACATTTTTTCACC+TGG + Chr6:112807429-112807448 None:intergenic 30.0%
!!! TTGACATTGTTTTTTAGGAG+GGG - Chr6:112810748-112810767 MsG0680035822.01.T01:CDS 30.0%
AAAATCAAAGCCTTGATAGG+TGG - Chr6:112807113-112807132 MsG0680035822.01.T01:intron 35.0%
AACCATGTTGTTAGAGAAGA+CGG - Chr6:112808605-112808624 MsG0680035822.01.T01:intron 35.0%
AATTACAGCTCTCTTTCCAA+GGG + Chr6:112811559-112811578 None:intergenic 35.0%
ACAGGAAAAGAAGCAAATCA+TGG - Chr6:112807686-112807705 MsG0680035822.01.T01:intron 35.0%
ATAAGGAATGTTGATCCTTG+TGG + Chr6:112808837-112808856 None:intergenic 35.0%
ATACCTTCAATGATATGTGC+AGG - Chr6:112811528-112811547 MsG0680035822.01.T01:CDS 35.0%
ATATGCTCAAACAATACGAG+TGG - Chr6:112807613-112807632 MsG0680035822.01.T01:intron 35.0%
ATCGACATCAATGAAAGGAA+TGG + Chr6:112811592-112811611 None:intergenic 35.0%
ATGTCAAAGAGAAAAGGATC+GGG - Chr6:112811230-112811249 MsG0680035822.01.T01:CDS 35.0%
ATTGAGAATGAACATTGAGC+AGG - Chr6:112808769-112808788 MsG0680035822.01.T01:intron 35.0%
CACAAGAAAAGTAAGATACC+GGG - Chr6:112807139-112807158 MsG0680035822.01.T01:intron 35.0%
CATAATATCATTGGAAGTGG+TGG - Chr6:112806878-112806897 MsG0680035822.01.T01:CDS 35.0%
CTAAATCTTCAACAGCAACA+CGG + Chr6:112806919-112806938 None:intergenic 35.0%
CTTTACAGTTTAGTGAGACT+TGG + Chr6:112808878-112808897 None:intergenic 35.0%
GAATCATCGACATCAATGAA+AGG + Chr6:112811597-112811616 None:intergenic 35.0%
GCACAAGAAAAGTAAGATAC+CGG - Chr6:112807138-112807157 MsG0680035822.01.T01:intron 35.0%
GTCATGCAAATCTAAACCAT+TGG + Chr6:112810458-112810477 None:intergenic 35.0%
GTCTAGAAGTTCTTCTATCT+CGG + Chr6:112807769-112807788 None:intergenic 35.0%
GTTGCAGTGAAAAAGATAAG+GGG - Chr6:112806944-112806963 MsG0680035822.01.T01:intron 35.0%
TCAGAAAAGCTGAACTTGTA+AGG + Chr6:112808983-112809002 None:intergenic 35.0%
TCATAACTATGACAATCCCT+TGG + Chr6:112811044-112811063 None:intergenic 35.0%
TCTGTAGCTTATATAGTGTG+TGG - Chr6:112810586-112810605 MsG0680035822.01.T01:CDS 35.0%
TTATATAGTGTGTGGTTGCT+AGG - Chr6:112810594-112810613 MsG0680035822.01.T01:CDS 35.0%
TTCACAACTTCCTTCATTGA+TGG + Chr6:112807882-112807901 None:intergenic 35.0%
TTCCTTATTCATGTTGGGAA+GGG - Chr6:112811143-112811162 MsG0680035822.01.T01:CDS 35.0%
! AGCATTCCAGTTTTCTAACA+TGG - Chr6:112810897-112810916 MsG0680035822.01.T01:intron 35.0%
! ATAGAAGAGTGCATAGAAGA+AGG + Chr6:112810656-112810675 None:intergenic 35.0%
! ATTTGCACTATTTTCGGATG+AGG + Chr6:112811210-112811229 None:intergenic 35.0%
! GCATTCCAGTTTTCTAACAT+GGG - Chr6:112810898-112810917 MsG0680035822.01.T01:intron 35.0%
! TAGGTTGGAAACTCAAAAGT+TGG - Chr6:112808577-112808596 MsG0680035822.01.T01:intron 35.0%
! TATGAGTGTGCCTTTTATAG+AGG - Chr6:112808951-112808970 MsG0680035822.01.T01:intron 35.0%
! TTTGAGTTTCCAACCTAGAA+TGG + Chr6:112808574-112808593 None:intergenic 35.0%
!! AAAAGGCACACTCATACTTT+TGG + Chr6:112808947-112808966 None:intergenic 35.0%
!! CAACTTTGGTGTAGTCTTAT+TGG - Chr6:112807655-112807674 MsG0680035822.01.T01:intron 35.0%
!! TCAACCATTTGTTTTCCCAA+TGG - Chr6:112810439-112810458 MsG0680035822.01.T01:intron 35.0%
!!! ACGACTTTAGATCGCTTTTT+TGG - Chr6:112810035-112810054 MsG0680035822.01.T01:intron 35.0%
!!! CGACTTTAGATCGCTTTTTT+GGG - Chr6:112810036-112810055 MsG0680035822.01.T01:intron 35.0%
!!! GGCACTTGACATTGTTTTTT+AGG - Chr6:112810743-112810762 MsG0680035822.01.T01:CDS 35.0%
!!! TGACATTGTTTTTTAGGAGG+GGG - Chr6:112810749-112810768 MsG0680035822.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTTTGGCTTGACCAATATTC+TGG + Chr6:112807358-112807377 None:intergenic 35.0%
AAACCAAGGATTGATAAGCC+CGG - Chr6:112808803-112808822 MsG0680035822.01.T01:intron 40.0%
AAAGTTAGACCAGAAGCTTG+TGG - Chr6:112806976-112806995 MsG0680035822.01.T01:intron 40.0%
AAGCTATGAGCGTATGACAA+CGG - Chr6:112808739-112808758 MsG0680035822.01.T01:intron 40.0%
ACTACCTCTGTACTTGTTCA+TGG + Chr6:112810712-112810731 None:intergenic 40.0%
AGGTGCTTCCTTATTCATGT+TGG - Chr6:112811137-112811156 MsG0680035822.01.T01:CDS 40.0%
AGTTGGAACAGAACCATTCT+AGG - Chr6:112808558-112808577 MsG0680035822.01.T01:intron 40.0%
ATCAACAATCTTCTCCACGT+TGG + Chr6:112807934-112807953 None:intergenic 40.0%
ATGTGCAGCATCTTCAAACT+TGG - Chr6:112807822-112807841 MsG0680035822.01.T01:intron 40.0%
CAATCCCTTGGATTACTCAA+TGG + Chr6:112811032-112811051 None:intergenic 40.0%
CAATTACAGCTCTCTTTCCA+AGG + Chr6:112811560-112811579 None:intergenic 40.0%
CATAGTTATGATTCAGGGGT+TGG - Chr6:112811053-112811072 MsG0680035822.01.T01:intron 40.0%
CTTCCTTATTCATGTTGGGA+AGG - Chr6:112811142-112811161 MsG0680035822.01.T01:CDS 40.0%
GAAACCATGAACAAGTACAG+AGG - Chr6:112810705-112810724 MsG0680035822.01.T01:CDS 40.0%
GAAGATATTGAGCAACTGCA+AGG - Chr6:112807899-112807918 MsG0680035822.01.T01:intron 40.0%
GAATGAATTCAGAGTCTCAC+CGG + Chr6:112810625-112810644 None:intergenic 40.0%
GAATTTGAAAGGGGAAAAGC+AGG - Chr6:112807980-112807999 MsG0680035822.01.T01:intron 40.0%
GGTGCTTCCTTATTCATGTT+GGG - Chr6:112811138-112811157 MsG0680035822.01.T01:CDS 40.0%
GTTGTCCCATGTTAGAAAAC+TGG + Chr6:112810906-112810925 None:intergenic 40.0%
TACCGTCTTCTCTAACAACA+TGG + Chr6:112808610-112808629 None:intergenic 40.0%
TACTTTGCTGCTCGATGTTT+GGG + Chr6:112811619-112811638 None:intergenic 40.0%
TGAACAAGTACAGAGGTAGT+AGG - Chr6:112810712-112810731 MsG0680035822.01.T01:CDS 40.0%
TGCATAGAAGAAGGTGAGTT+TGG + Chr6:112810647-112810666 None:intergenic 40.0%
TTCACGTCTCGATGAACAAT+AGG + Chr6:112807276-112807295 None:intergenic 40.0%
TTGCAAAGCACGCTATTACT+AGG + Chr6:112808402-112808421 None:intergenic 40.0%
TTGCCTGCACATATCATTGA+AGG + Chr6:112811534-112811553 None:intergenic 40.0%
! AAGAAGCTTACTTTGGAGAG+TGG - Chr6:112810849-112810868 MsG0680035822.01.T01:intron 40.0%
! ATCCTTGAATTGATTGGCTG+AGG - Chr6:112807187-112807206 MsG0680035822.01.T01:intron 40.0%
! CGTGTTGCTGTTGAAGATTT+AGG - Chr6:112806917-112806936 MsG0680035822.01.T01:intron 40.0%
! GACATGGTAGCAAGTTCTTT+TGG + Chr6:112807375-112807394 None:intergenic 40.0%
! GTCTTATTGGAACTGACAAC+AGG - Chr6:112807668-112807687 MsG0680035822.01.T01:intron 40.0%
! TTACTTTGGAGAGTGGAAGT+GGG - Chr6:112810856-112810875 MsG0680035822.01.T01:intron 40.0%
! TTGGGAAGGGACATAGTTTT+TGG - Chr6:112811156-112811175 MsG0680035822.01.T01:CDS 40.0%
!! ATAAGGAAGCACCTTCATTC+TGG + Chr6:112811131-112811150 None:intergenic 40.0%
!! ATCATTGGAAGTGGTGGATT+TGG - Chr6:112806884-112806903 MsG0680035822.01.T01:CDS 40.0%
!! GCTAGTCTTGAAGTTAGAGT+TGG - Chr6:112808274-112808293 MsG0680035822.01.T01:intron 40.0%
!! TAAGGAAGCACCTTCATTCT+GGG + Chr6:112811130-112811149 None:intergenic 40.0%
ACATTCGGCTATATTGCTCC+AGG - Chr6:112807408-112807427 MsG0680035822.01.T01:intron 45.0%
ACGTCTCGATGAACAATAGG+CGG + Chr6:112807273-112807292 None:intergenic 45.0%
ACTGTGCCATGCTCTCAAAA+GGG + Chr6:112810551-112810570 None:intergenic 45.0%
ACTTCTAGACGACGATGCTA+TGG - Chr6:112807779-112807798 MsG0680035822.01.T01:intron 45.0%
AGCTAGACGACCATCAATGA+AGG - Chr6:112807869-112807888 MsG0680035822.01.T01:intron 45.0%
AGGAGACTGCATATAGCCAT+CGG - Chr6:112807207-112807226 MsG0680035822.01.T01:intron 45.0%
AGTTCTCGTCTCTTGCAGAA+TGG - Chr6:112807714-112807733 MsG0680035822.01.T01:intron 45.0%
ATATGTGCAGGCAAATCCCT+TGG - Chr6:112811540-112811559 MsG0680035822.01.T01:CDS 45.0%
CAGAGGTAGTAGGAGAAAAG+AGG - Chr6:112810722-112810741 MsG0680035822.01.T01:CDS 45.0%
CCAATGGTTAAGATCACTCG+TGG + Chr6:112810373-112810392 None:intergenic 45.0%
CCACGAGTGATCTTAACCAT+TGG - Chr6:112810370-112810389 MsG0680035822.01.T01:intron 45.0%
CTCCTCAGCCAATCAATTCA+AGG + Chr6:112807192-112807211 None:intergenic 45.0%
GAACTGAATCCACAAGCTTC+TGG + Chr6:112806988-112807007 None:intergenic 45.0%
GGAACAGAACCATTCTAGGT+TGG - Chr6:112808562-112808581 MsG0680035822.01.T01:intron 45.0%
GGAAGCTAACTTCCTTTCAG+AGG - Chr6:112806813-112806832 MsG0680035822.01.T01:CDS 45.0%
GGATGAGGTAAGTCAGTGTA+GGG + Chr6:112811195-112811214 None:intergenic 45.0%
GGGCTTATCAATCCTTGGTT+TGG + Chr6:112808804-112808823 None:intergenic 45.0%
GTACTTTGCTGCTCGATGTT+TGG + Chr6:112811620-112811639 None:intergenic 45.0%
GTCCCTTCCCAACATGAATA+AGG + Chr6:112811148-112811167 None:intergenic 45.0%
GTTCTCGTCTCTTGCAGAAT+GGG - Chr6:112807715-112807734 MsG0680035822.01.T01:intron 45.0%
TCTCGGTTCCTATCTGAATG+TGG + Chr6:112807752-112807771 None:intergenic 45.0%
TGCACTCTTCTATAGAGCCT+TGG - Chr6:112810663-112810682 MsG0680035822.01.T01:CDS 45.0%
TGGCAAGTTAGTGTTGTCGT+TGG - Chr6:112810683-112810702 MsG0680035822.01.T01:CDS 45.0%
TGTGAAACTCAGCCTCTGAA+AGG + Chr6:112806828-112806847 None:intergenic 45.0%
TTAATTGGTCCACGTGAGCA+GGG + Chr6:112809342-112809361 None:intergenic 45.0%
TTCAACAGCAACACGGTACA+CGG + Chr6:112806912-112806931 None:intergenic 45.0%
TTTAATTGGTCCACGTGAGC+AGG + Chr6:112809343-112809362 None:intergenic 45.0%
TTTCGGTCTCGCCAGAATAT+TGG - Chr6:112807344-112807363 MsG0680035822.01.T01:intron 45.0%
! ACGACAACACTAACTTGCCA+AGG + Chr6:112810683-112810702 None:intergenic 45.0%
! CTTACTTTGGAGAGTGGAAG+TGG - Chr6:112810855-112810874 MsG0680035822.01.T01:intron 45.0%
! TTCATTGATGGTCGTCTAGC+TGG + Chr6:112807870-112807889 None:intergenic 45.0%
!! TTATGATTCAGGGGTTGGCT+TGG - Chr6:112811058-112811077 MsG0680035822.01.T01:intron 45.0%
!! TTTTAGGAGGGGGTAGTGAA+TGG - Chr6:112810759-112810778 MsG0680035822.01.T01:CDS 45.0%
!! ATATTTATTTCAATATATAA+AGG - Chr6:112810495-112810514 MsG0680035822.01.T01:CDS 5.0%
!! ATTATAAAAAAAAACTAAAA+AGG + Chr6:112808465-112808484 None:intergenic 5.0%
!! TATTTATTTCAATATATAAA+GGG - Chr6:112810496-112810515 MsG0680035822.01.T01:CDS 5.0%
CACTGTGCCATGCTCTCAAA+AGG + Chr6:112810552-112810571 None:intergenic 50.0%
CGGATGAGGTAAGTCAGTGT+AGG + Chr6:112811196-112811215 None:intergenic 50.0%
TAATTGGTCCACGTGAGCAG+GGG + Chr6:112809341-112809360 None:intergenic 50.0%
TCAGCTGTGGCTGGAACATT+CGG - Chr6:112807393-112807412 MsG0680035822.01.T01:intron 50.0%
TCTTGTGCAGCCACCTATCA+AGG + Chr6:112807126-112807145 None:intergenic 50.0%
TTGACACCGACCCAGAATGA+AGG - Chr6:112811117-112811136 MsG0680035822.01.T01:CDS 50.0%
! ACTTGCTACCATGTCAGCTG+TGG - Chr6:112807380-112807399 MsG0680035822.01.T01:intron 50.0%
! AGGCGTCGTAATCCAAACCA+AGG - Chr6:112808789-112808808 MsG0680035822.01.T01:intron 50.0%
! GAAGCACCTTCATTCTGGGT+CGG + Chr6:112811126-112811145 None:intergenic 50.0%
!! GATGCACCCTTTTGAGAGCA+TGG - Chr6:112810542-112810561 MsG0680035822.01.T01:CDS 50.0%
!! TAAGCTACAGAGCACTGCAG+AGG + Chr6:112810577-112810596 None:intergenic 50.0%
AATTGGTCCACGTGAGCAGG+GGG + Chr6:112809340-112809359 None:intergenic 55.0%
AGTAAGATACCGGGCGTGTC+AGG - Chr6:112807148-112807167 MsG0680035822.01.T01:intron 55.0%
ATAGCCATCGGAGCTGCACA+AGG - Chr6:112807219-112807238 MsG0680035822.01.T01:intron 55.0%
ATCTTCTCCACGTTGGCGAG+TGG + Chr6:112807927-112807946 None:intergenic 55.0%
CAAACCTTGTGCAGCTCCGA+TGG + Chr6:112807226-112807245 None:intergenic 55.0%
CCAAGGATTGATAAGCCCGG+AGG - Chr6:112808806-112808825 MsG0680035822.01.T01:intron 55.0%
CCTCCGGGCTTATCAATCCT+TGG + Chr6:112808809-112808828 None:intergenic 55.0%
GTGTGGTTGCTAGGATACGC+CGG - Chr6:112810603-112810622 MsG0680035822.01.T01:CDS 55.0%
TAGATTACCCCCTGCTCACG+TGG - Chr6:112809330-112809349 MsG0680035822.01.T01:intron 55.0%
TGTTCCAGCCACAGCTGACA+TGG + Chr6:112807391-112807410 None:intergenic 55.0%
!! ATCCTTGTGGTGTTGCCTCC+GGG + Chr6:112808824-112808843 None:intergenic 55.0%
!! GATCCTTGTGGTGTTGCCTC+CGG + Chr6:112808825-112808844 None:intergenic 55.0%
!! GATTCAGGGGTTGGCTTGGT+TGG - Chr6:112811062-112811081 MsG0680035822.01.T01:intron 55.0%
CAAGGATCCACTCGCCAACG+TGG - Chr6:112807917-112807936 MsG0680035822.01.T01:intron 60.0%
CGTCTCTTGCAGAATGGGCG+TGG - Chr6:112807720-112807739 MsG0680035822.01.T01:intron 60.0%
GATACCGGGCGTGTCAGGTA+CGG - Chr6:112807153-112807172 MsG0680035822.01.T01:intron 60.0%
GCTACCATGTCAGCTGTGGC+TGG - Chr6:112807384-112807403 MsG0680035822.01.T01:intron 60.0%
GGCTGGCGCCACATTCAGAT+AGG - Chr6:112807741-112807760 MsG0680035822.01.T01:intron 60.0%
TCTTGCAGAATGGGCGTGGC+TGG - Chr6:112807724-112807743 MsG0680035822.01.T01:intron 60.0%
AGCCCGGAGGCAACACCACA+AGG - Chr6:112808819-112808838 MsG0680035822.01.T01:intron 65.0%
TGGACCGTACCTGACACGCC+CGG + Chr6:112807160-112807179 None:intergenic 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 112806800 112811677 112806800 ID=MsG0680035822.01;Name=MsG0680035822.01
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Chr6 exon 112810476 112810787 112810476 ID=MsG0680035822.01.T01:exon:9711;Parent=MsG0680035822.01.T01
Chr6 exon 112809851 112809968 112809851 ID=MsG0680035822.01.T01:exon:9710;Parent=MsG0680035822.01.T01
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Chr6 CDS 112810476 112810787 112810476 ID=MsG0680035822.01.T01:cds;Parent=MsG0680035822.01.T01
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Chr6 CDS 112806800 112806927 112806800 ID=MsG0680035822.01.T01:cds;Parent=MsG0680035822.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680035822.01.T01

ATGAGAAGGACATGGAAGCTAACTTCCTTTCAGAGGCTGAGTTTCACAAAATCAAACATTGTGACGTCGATGTCAGAACATAATATCATTGGAAGTGGTGGATTTGGTTCCGTGTACCGTGTTGCTGTTGAAGATTTAGGCTATGTTGCAGTGAAAAAGATAAGGGGAAGTAACAGAAAGTTAGACCAGAAGCTTGTGGATTCAGTTCTTGCAGAAGTTGAAATACTGAGCAATATTCGGCATAGCAACATTGTGAAGTTGATGTGTTGTATCTCAAGTGATGATTCTCTACTACTTGTATACGAGTATCATGAAAATCAAAGCCTTGATAGGTGGCTGCACAAGAAAACCATCGGAGCTGCACAAGGTTTGTGCTACATGCATAATGATTGCTCGCCGCCTATTGTTCATCGAGACGTGAAAACAAGTAACATTCTTTTGGATTCGAAATTCAATGCAAAAGTTGCTGATTTCGGTCTCGCCAGAATATTGGTCAAGCCAAAAGAACTTGCTACCATGTCAGCTGAAAAGAAGCAAATCATGGAGACGAGTTCTCGTCTCTTGCAGAATGGGCGTGGCTGGCGCCACATTCAGATAGGAACCGAGATAGAAGAACTTCTAGACGACGATGCTATGGAACCTAGTAATGTGAAAGAAATGTGCAGCATCTTCAAACTTGGAGTTATGTGCACTTCAACACTACCAGCTAGACGACCATCAATGAAGGAAGTTGTGAAGATATTGAGCAACTGCAAGGATCCACTCGCCAACGTGGAGAAGATTGTTGATATCTATGATGCTGCTCCACTTCTTAAGAATTTGAAAGGGGAAAAGCAGATTTCAGTTGTCTACATATTTGGAACAAACTCGACTATTTTGATACAAAAGTTGGAACAGAACCATTCTAGGTTGGAAACTCAAAAGTTGGAACAGAACCATGTTGTTAGAGAAGACGGCAAATCCCTTGGAAAGAGAGCTGTAATTGATGTTGATGCCATTCCTTTCATTGATGTCGATGATTCCCAAACATCGAGCAGCAAAGTACAAAAGCTTGCAAATGTTAAGATTGAAGAAATGGAGTGA
Protein sequence

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