AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780036525.01

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MsG0780036525.01.T01 AT1G16150 28.669 293 122 7 66 349 448 662 9.63e-26 109
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MsG0780036525.01.T01 AT1G61360 29.528 254 99 5 67 318 442 617 1.44e-25 108
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MsG0780036525.01.T01 AT1G77280 29.961 257 98 6 66 319 428 605 3.56e-25 107
MsG0780036525.01.T01 AT5G07280 38.065 155 67 4 167 319 991 1118 4.07e-25 107
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MsG0780036525.01.T01 AT1G61420 27.273 286 120 5 67 342 519 726 6.53e-25 107
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MsG0780036525.01.T01 AT5G18500 28.627 255 102 5 67 319 191 367 1.23e-24 105
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MsG0780036525.01.T01 AT1G07650 29.020 255 100 6 66 317 702 878 5.21e-24 104
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MsG0780036525.01.T01 AT1G56720 27.843 255 104 5 67 319 204 380 8.47e-24 102
MsG0780036525.01.T01 AT1G56720 27.843 255 104 5 67 319 204 380 8.47e-24 102
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MsG0780036525.01.T01 AT4G03230 28.621 290 122 7 84 363 629 843 8.56e-24 103
MsG0780036525.01.T01 AT1G70520 28.205 234 92 4 86 318 366 524 8.62e-24 103
MsG0780036525.01.T01 AT4G03230 28.621 290 122 7 84 363 571 785 1.08e-23 103
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MsG0780036525.01.T01 AT4G11490 29.008 262 106 5 58 317 337 520 1.19e-23 102
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MsG0780036525.01.T01 AT4G23210 27.376 263 111 5 67 327 383 567 1.25e-23 102
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MsG0780036525.01.T01 AT1G68690 30.196 255 97 5 66 319 401 575 1.37e-23 102
MsG0780036525.01.T01 AT1G68690 30.196 255 97 5 66 319 401 575 1.37e-23 102
MsG0780036525.01.T01 AT1G65790 27.481 262 108 5 67 325 544 726 1.44e-23 102
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MsG0780036525.01.T01 AT1G29730 29.020 255 97 6 66 317 697 870 1.50e-23 102
MsG0780036525.01.T01 AT4G11460 29.020 255 97 6 67 317 296 470 1.54e-23 102
MsG0780036525.01.T01 AT4G11460 29.020 255 97 6 67 317 371 545 1.55e-23 102
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MsG0780036525.01.T01 AT4G23190 26.877 253 105 7 67 317 297 471 4.51e-22 98.2
MsG0780036525.01.T01 AT4G23190 25.969 258 111 7 67 322 375 554 4.57e-22 98.2
MsG0780036525.01.T01 AT1G56130 31.915 235 79 5 86 317 735 891 4.64e-22 98.6
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MsG0780036525.01.T01 AT1G52540 26.603 312 129 10 67 364 65 290 5.12e-22 96.3
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MsG0780036525.01.T01 AT4G23310 27.308 260 103 7 63 316 527 706 2.44e-21 96.3
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MsG0780036525.01.T01 AT2G28250 28.763 299 116 10 66 344 234 455 6.97e-21 94.4
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MsG0780036525.01.T01 AT5G15730 25.090 279 130 7 67 344 138 338 3.14e-20 92.0
MsG0780036525.01.T01 AT1G24030 27.458 295 120 8 78 354 2 220 3.43e-20 89.7
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MsG0780036525.01.T01 AT5G54380 30.085 236 83 7 86 317 551 708 4.25e-20 92.4
MsG0780036525.01.T01 AT3G26940 29.954 217 105 6 167 365 148 335 4.34e-20 91.7
MsG0780036525.01.T01 AT2G04300 35.065 154 71 3 167 318 615 741 4.53e-20 92.4
MsG0780036525.01.T01 AT5G49470 31.148 183 91 5 167 349 566 713 4.69e-20 92.4
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Find 67 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 440 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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AGATTCGGAGTTCGGATTTA+TGG 0.214302 7:+9335776 MsG0780036525.01.T01:three_prime_UTR
AGTGAAACCATCTCATTATT+TGG 0.217599 7:-9333123 None:intergenic
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CAGCCTAGTGTTTCTGACTT+TGG 0.391575 7:+9332456 MsG0780036525.01.T01:CDS
TCCAATCGAACAATAGTTGC+TGG 0.399978 7:+9332507 MsG0780036525.01.T01:CDS
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AGAGATATCACAAAGAGATT+GGG 0.415123 7:-9331681 None:intergenic
TAAAAGCCATGAAATTCAAT+TGG 0.420609 7:+9332310 MsG0780036525.01.T01:CDS
CTAAAAGTTTCATCAAAAGT+TGG 0.422885 7:-9331911 None:intergenic
AAAACATACAAAGGGGAAAT+CGG 0.423394 7:-9332169 None:intergenic
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TGCGGAGCTTGCATATACTA+TGG 0.435330 7:+9332948 MsG0780036525.01.T01:CDS
GTTGCTGTGTTTGTGAGATT+CGG 0.458823 7:+9335761 MsG0780036525.01.T01:three_prime_UTR
CATTGACATTGACATTGGCT+TGG 0.460894 7:+9337839 MsG0780036525.01.T01:three_prime_UTR
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GCGAGGAGCACTAATAAGCT+TGG 0.485964 7:-9332202 None:intergenic
GCTTATTAGTGCTCCTCGCA+CGG 0.489479 7:+9332206 MsG0780036525.01.T01:CDS
ATTGACATTGACATTGGCAT+TGG 0.493849 7:+9337906 MsG0780036525.01.T01:three_prime_UTR
CGTCGTTGTTCTTCGACAAA+CGG 0.497476 7:-9335799 None:intergenic
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AGATAAGTACAATGTGGAAT+GGG 0.499258 7:-9331737 None:intergenic
CGAGGAGCACTAATAAGCTT+GGG 0.504487 7:-9332201 None:intergenic
AGTGATGACAATATTTCCTC+AGG 0.508700 7:-9333039 None:intergenic
AAGATAAGTACAATGTGGAA+TGG 0.512983 7:-9331738 None:intergenic
CATTGTTAACGGAGTTGCAT+CGG 0.516308 7:+9332347 MsG0780036525.01.T01:CDS
CTTATTAGTGCTCCTCGCAC+GGG 0.521340 7:+9332207 MsG0780036525.01.T01:CDS
CCATCTCATTATTTGGACGT+TGG 0.535139 7:-9333116 None:intergenic
GATTGGATGAATCACATTGA+AGG 0.537576 7:-9332491 None:intergenic
ACTATTGGATATATAGCTCC+TGG 0.538272 7:+9332531 MsG0780036525.01.T01:CDS
TTTGACATTGACATTGACAT+TGG 0.550317 7:+9337834 MsG0780036525.01.T01:three_prime_UTR
ATTGACATTGACATTGACAT+TGG 0.550317 7:+9337870 MsG0780036525.01.T01:three_prime_UTR
ATTGACATTGACATTGACAT+TGG 0.550317 7:+9337900 MsG0780036525.01.T01:three_prime_UTR
GAGGTGGATGAGGTTGCAAT+TGG 0.552182 7:-9331811 None:intergenic
TCAGAATTGAAGCGTTGTTG+CGG 0.577609 7:+9335831 MsG0780036525.01.T01:three_prime_UTR
ATATCTTGCTAAACTCGGAA+TGG 0.582906 7:+9332433 MsG0780036525.01.T01:CDS
ATATATGTGAAAGAAGAGAT+GGG 0.588340 7:+9332859 MsG0780036525.01.T01:intron
ATATATCAGTATATGGAAAG+AGG 0.590132 7:+9332022 MsG0780036525.01.T01:CDS
CCAACGTCCAAATAATGAGA+TGG 0.591480 7:+9333116 MsG0780036525.01.T01:CDS
ATCGGTTGCCATATAAAGCA+TGG 0.594757 7:-9332151 None:intergenic
TTCAAGGAACACAAGGAACA+AGG 0.600575 7:+9331763 MsG0780036525.01.T01:CDS
TAGCAATATCTTGCTAAACT+CGG 0.602827 7:+9332428 MsG0780036525.01.T01:CDS
ATCTCTATGCACTATTGGAG+AGG 0.608781 7:-9332397 None:intergenic
GAGATATCACAAAGAGATTG+GGG 0.610251 7:-9331680 None:intergenic
ATCTTAGTTCAAGGAACACA+AGG 0.611350 7:+9331756 MsG0780036525.01.T01:CDS
TTTATTGGGAAGACATCCTG+AGG 0.612589 7:+9333023 MsG0780036525.01.T01:CDS
TTAACCGGCAAGCCCGTGCG+AGG 0.621081 7:-9332219 None:intergenic
ATACCAAAGTCAGAAACACT+AGG 0.629246 7:-9332459 None:intergenic
GGAGCACTAATAAGCTTGGG+TGG 0.637121 7:-9332198 None:intergenic
GAACTAAGATAAGTACAATG+TGG 0.688470 7:-9331743 None:intergenic
CGTTTGTCGAAGAACAACGA+CGG 0.724955 7:+9335800 MsG0780036525.01.T01:three_prime_UTR
TCGTTGTGATTTGGTCAATG+CGG 0.726039 7:+9332930 MsG0780036525.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
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!!! AAGAAAATATTGTTTTAATT+AGG - Chr7:9332787-9332806 None:intergenic 10.0%
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TGTGACATACATTTCATTGT+TGG - Chr7:9333210-9333229 None:intergenic 30.0%
TGTTATAATGTGAGGGTTAT+AGG - Chr7:9334494-9334513 None:intergenic 30.0%
TTAGAAGCTGTTAGAAATGA+AGG + Chr7:9335961-9335980 MsG0780036525.01.T01:intron 30.0%
TTCTTCACTTAGAAACTCTT+AGG - Chr7:9333615-9333634 None:intergenic 30.0%
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TTTCTAAGTGAAGAATTGGA+GGG + Chr7:9333620-9333639 MsG0780036525.01.T01:intron 30.0%
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!!! AAGGATTTTTTGAACATGCA+GGG + Chr7:9335073-9335092 MsG0780036525.01.T01:intron 30.0%
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AAGAGACCATATATTTAGGG+GGG - Chr7:9332705-9332724 None:intergenic 35.0%
AAGGTAATGACGAATTCGTA+AGG + Chr7:9335886-9335905 MsG0780036525.01.T01:intron 35.0%
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ACCTTGATGTATAAATCCCT+TGG - Chr7:9337188-9337207 None:intergenic 35.0%
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AGTGATGACAATATTTCCTC+AGG - Chr7:9333042-9333061 None:intergenic 35.0%
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ATAGTAAAACAGGCAGGAAA+GGG + Chr7:9335113-9335132 MsG0780036525.01.T01:intron 35.0%
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CCTAAGAGCAATTTCGAAAT+GGG + Chr7:9335182-9335201 MsG0780036525.01.T01:intron 35.0%
CGGAAACAAAACATAAGCAA+AGG + Chr7:9337568-9337587 MsG0780036525.01.T01:intron 35.0%
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TACATCAAGGTAGAAAGAAC+GGG + Chr7:9337197-9337216 MsG0780036525.01.T01:intron 35.0%
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TAGAAAATTGGTTATGGTGG+AGG + Chr7:9336097-9336116 MsG0780036525.01.T01:intron 35.0%
TCACTCAAAGGAATGCTTAA+TGG - Chr7:9333255-9333274 None:intergenic 35.0%
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TGCACTGAAATTTCACTCAA+AGG - Chr7:9333267-9333286 None:intergenic 35.0%
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TTGATGTATAAATCCCTTGG+TGG - Chr7:9337185-9337204 None:intergenic 35.0%
TTTGCTCCGATTTAAACAAG+AGG - Chr7:9335594-9335613 None:intergenic 35.0%
TTTGTATTTCCTTGGTCAAG+TGG - Chr7:9337384-9337403 None:intergenic 35.0%
! AAAGGGTACAAACTGTTCTT+TGG + Chr7:9337586-9337605 MsG0780036525.01.T01:intron 35.0%
! ACGTAAATAACAAAAGTGCG+CGG + Chr7:9336372-9336391 MsG0780036525.01.T01:intron 35.0%
! ATTTGTTGCGAATCTGTTTG+TGG - Chr7:9335541-9335560 None:intergenic 35.0%
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! GTACTTGATGGATGATCTTA+GGG - Chr7:9334708-9334727 None:intergenic 35.0%
! GTGGAAGTTGGTTAGAAAAT+TGG + Chr7:9336085-9336104 MsG0780036525.01.T01:intron 35.0%
! GTTATGGTGGAGGAATAAAA+TGG + Chr7:9336107-9336126 MsG0780036525.01.T01:intron 35.0%
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! TACTTTTGGGCCAACAAAAA+TGG - Chr7:9337779-9337798 None:intergenic 35.0%
! TTCGTTTGAGTTATGAAGAG+AGG - Chr7:9335273-9335292 None:intergenic 35.0%
!! ATGTTGTGGTATTGATCAAG+TGG - Chr7:9337503-9337522 None:intergenic 35.0%
!! CTTTTGTTTGCTTGGGATTT+TGG - Chr7:9334470-9334489 None:intergenic 35.0%
!! GTTGTTATGGAGGTTTGTTA+GGG + Chr7:9336019-9336038 MsG0780036525.01.T01:intron 35.0%
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!! TTTTACGGGTGGTTTTTAAG+GGG + Chr7:9332116-9332135 MsG0780036525.01.T01:intron 35.0%
!!! AGGATTTTTTGAACATGCAG+GGG + Chr7:9335074-9335093 MsG0780036525.01.T01:intron 35.0%
!!! ATGTTTTGTTTCCGGTCAAA+CGG - Chr7:9337562-9337581 None:intergenic 35.0%
AAAGACTAAAATGCCCCTAG+GGG + Chr7:9336667-9336686 MsG0780036525.01.T01:intron 40.0%
ACAACCCAAAAGAATTGACG+CGG - Chr7:9332091-9332110 None:intergenic 40.0%
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AGAGGCCATAGAATGTATCT+AGG - Chr7:9334170-9334189 None:intergenic 40.0%
AGATTCGGAGTTCGGATTTA+TGG + Chr7:9335776-9335795 MsG0780036525.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
AGTAGGTGCAAACTGTTCTT+TGG + Chr7:9337526-9337545 MsG0780036525.01.T01:intron 40.0%
AGTTTCGAATCTGTGAGGAA+AGG + Chr7:9335867-9335886 MsG0780036525.01.T01:intron 40.0%
ATCGGTTGCCATATAAAGCA+TGG - Chr7:9332154-9332173 None:intergenic 40.0%
ATCTCTATGCACTATTGGAG+AGG - Chr7:9332400-9332419 None:intergenic 40.0%
CATTCTCCATCCTATATCCT+TGG - Chr7:9334298-9334317 None:intergenic 40.0%
CATTGTTAACGGAGTTGCAT+CGG + Chr7:9332347-9332366 MsG0780036525.01.T01:CDS 40.0%
CCAACGTCCAAATAATGAGA+TGG + Chr7:9333116-9333135 MsG0780036525.01.T01:CDS 40.0%
CCATCTCATTATTTGGACGT+TGG - Chr7:9333119-9333138 None:intergenic 40.0%
CCCATTTCGAAATTGCTCTT+AGG - Chr7:9335185-9335204 None:intergenic 40.0%
CGAAAGATGCTCATGAAACA+TGG + Chr7:9334330-9334349 MsG0780036525.01.T01:intron 40.0%
CTATCAGTTTCGAATCTGTG+AGG + Chr7:9335862-9335881 MsG0780036525.01.T01:intron 40.0%
CTCACAGATTCGAAACTGAT+AGG - Chr7:9335864-9335883 None:intergenic 40.0%
CTTGATCGGAGATACAACAA+AGG + Chr7:9337445-9337464 MsG0780036525.01.T01:intron 40.0%
GAAAAGACTAAAATGCCCCT+AGG + Chr7:9336665-9336684 MsG0780036525.01.T01:intron 40.0%
GAAATGAAGGTGGAAGTTTG+TGG + Chr7:9335974-9335993 MsG0780036525.01.T01:intron 40.0%
GAAGCTGTTAGAAATGAAGG+TGG + Chr7:9335964-9335983 MsG0780036525.01.T01:intron 40.0%
GACGAAGTCTTAGAATTGAC+GGG + Chr7:9337019-9337038 MsG0780036525.01.T01:intron 40.0%
GAGGCCATAGAATGTATCTA+GGG - Chr7:9334169-9334188 None:intergenic 40.0%
GATAGGTACAAGCTGTTCTT+TGG + Chr7:9337348-9337367 MsG0780036525.01.T01:intron 40.0%
GCACGCGTAGAAATTAAAGA+CGG - Chr7:9333554-9333573 None:intergenic 40.0%
GCCATGTGTCCAAATGTTAT+TGG - Chr7:9336319-9336338 None:intergenic 40.0%
GCCTAAGAGCAATTTCGAAA+TGG + Chr7:9335181-9335200 MsG0780036525.01.T01:intron 40.0%
GGAAACATAGACATATACGC+AGG + Chr7:9337629-9337648 MsG0780036525.01.T01:intron 40.0%
GGAGAAATTGATCGGTGAAT+TGG + Chr7:9335922-9335941 MsG0780036525.01.T01:intron 40.0%
GGGACCCTTCAAACAATTAT+TGG - Chr7:9331720-9331739 None:intergenic 40.0%
GGTAGATACAAGCTGTTCTT+TGG + Chr7:9337467-9337486 MsG0780036525.01.T01:intron 40.0%
GTGGATTTGATCCCTTAATC+GGG - Chr7:9333709-9333728 None:intergenic 40.0%
GTTGCTGTGTTTGTGAGATT+CGG + Chr7:9335761-9335780 MsG0780036525.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
TAGTAAAACAGGCAGGAAAG+GGG + Chr7:9335114-9335133 MsG0780036525.01.T01:intron 40.0%
TCCAATCGAACAATAGTTGC+TGG + Chr7:9332507-9332526 MsG0780036525.01.T01:CDS 40.0%
TCCAGCAACTATTGTTCGAT+TGG - Chr7:9332511-9332530 None:intergenic 40.0%
TCGAAGTTCTTTCCATCTTG+AGG - Chr7:9335619-9335638 None:intergenic 40.0%
TGAAGATTGAGAGGCCTTAA+AGG + Chr7:9333801-9333820 MsG0780036525.01.T01:intron 40.0%
TGAATGCAAGACAATCGAAC+CGG + Chr7:9337139-9337158 MsG0780036525.01.T01:intron 40.0%
TGTCTATGTTTCCGGTCAAA+CGG - Chr7:9337622-9337641 None:intergenic 40.0%
TGTTCGAGCCATGCTTTATA+TGG + Chr7:9332143-9332162 MsG0780036525.01.T01:CDS 40.0%
TGTTTGTGAGATTCGGAGTT+CGG + Chr7:9335768-9335787 MsG0780036525.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
TTCAAGGAACACAAGGAACA+AGG + Chr7:9331763-9331782 MsG0780036525.01.T01:CDS 40.0%
TTCATTGTTGGTCAAGACGA+CGG - Chr7:9333198-9333217 None:intergenic 40.0%
TTGCACCTACTTACATGTTG+TGG - Chr7:9337517-9337536 None:intergenic 40.0%
TTGTTGTATCTCCGATCAAG+TGG - Chr7:9337445-9337464 None:intergenic 40.0%
TTTATTGGGAAGACATCCTG+AGG + Chr7:9333023-9333042 MsG0780036525.01.T01:CDS 40.0%
TTTGTATTCTCTCGGTCAAG+TGG - Chr7:9337323-9337342 None:intergenic 40.0%
! AGTTCCGCGTCAATTCTTTT+GGG + Chr7:9332084-9332103 MsG0780036525.01.T01:intron 40.0%
! CATTGACATTGACATTGGCT+TGG + Chr7:9337839-9337858 MsG0780036525.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
! GACATTGGCATTGGATATTG+AGG + Chr7:9337915-9337934 MsG0780036525.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
! GGTACTTGATGGATGATCTT+AGG - Chr7:9334709-9334728 None:intergenic 40.0%
! GGTGGATTTGATCCCTTAAT+CGG - Chr7:9333710-9333729 None:intergenic 40.0%
! GGTTGTTATGGAGGTTTGTT+AGG + Chr7:9336018-9336037 MsG0780036525.01.T01:intron 40.0%
! TAGTTCCGCGTCAATTCTTT+TGG + Chr7:9332083-9332102 MsG0780036525.01.T01:intron 40.0%
! TCAACTTGCTCGTTGTGATT+TGG + Chr7:9332921-9332940 MsG0780036525.01.T01:CDS 40.0%
! TGGAGGGAGAAGAATGTTTT+TGG + Chr7:9333636-9333655 MsG0780036525.01.T01:intron 40.0%
! TTTTGTATCTCTCGGTCAAG+TGG - Chr7:9337265-9337284 None:intergenic 40.0%
! TTTTTCTTGTGAGGTGGATG+AGG - Chr7:9331824-9331843 None:intergenic 40.0%
!! AAGTTTGTGGTGGTTGATGA+TGG + Chr7:9335987-9336006 MsG0780036525.01.T01:intron 40.0%
!! TCAGAATTGAAGCGTTGTTG+CGG + Chr7:9335831-9335850 MsG0780036525.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
!! TCGTTGTGATTTGGTCAATG+CGG + Chr7:9332930-9332949 MsG0780036525.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTTTGGAAGAGAACTACGG+TGG - Chr7:9333728-9333747 None:intergenic 40.0%
!!! GGTTGTTTTGTTTTTACGGG+TGG + Chr7:9332105-9332124 MsG0780036525.01.T01:intron 40.0%
!!! GTGTTTGGTGCTGTTTTGAA+TGG - Chr7:9334662-9334681 None:intergenic 40.0%
AAATGACCAAAACGCCCCTA+GGG + Chr7:9336509-9336528 MsG0780036525.01.T01:intron 45.0%
AAGGAATGCTTGGACCAATG+AGG + Chr7:9336253-9336272 MsG0780036525.01.T01:intron 45.0%
ACAATCGAACCGGAATCTAC+GGG + Chr7:9337149-9337168 MsG0780036525.01.T01:intron 45.0%
ACCAATGAGGAAATGCCACA+TGG + Chr7:9336266-9336285 MsG0780036525.01.T01:intron 45.0%
AGCAAAACCCTTGAGAATCG+AGG + Chr7:9333462-9333481 MsG0780036525.01.T01:intron 45.0%
AGTAAAACAGGCAGGAAAGG+GGG + Chr7:9335115-9335134 MsG0780036525.01.T01:intron 45.0%
ATGAAGGTGGAAGTTTGTGG+TGG + Chr7:9335977-9335996 MsG0780036525.01.T01:intron 45.0%
CACGTGATTGAAGAGAGAAG+AGG + Chr7:9336131-9336150 MsG0780036525.01.T01:intron 45.0%
CCGAGAGATACAAAAGAGAC+GGG + Chr7:9337270-9337289 MsG0780036525.01.T01:intron 45.0%
CGTCGTTGTTCTTCGACAAA+CGG - Chr7:9335802-9335821 None:intergenic 45.0%
CGTTTGTCGAAGAACAACGA+CGG + Chr7:9335800-9335819 MsG0780036525.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
CTCTTCTCTCTTCAATCACG+TGG - Chr7:9336133-9336152 None:intergenic 45.0%
GACAATCGAACCGGAATCTA+CGG + Chr7:9337148-9337167 MsG0780036525.01.T01:intron 45.0%
GACAGGTACAAGCTGTTCTT+TGG + Chr7:9337229-9337248 MsG0780036525.01.T01:intron 45.0%
GCTTAATGGTGTAAGCTGAG+TGG - Chr7:9333241-9333260 None:intergenic 45.0%
TAGGGGATGAAAGGAATGCT+TGG + Chr7:9336243-9336262 MsG0780036525.01.T01:intron 45.0%
TCATTGTTGGTCAAGACGAC+GGG - Chr7:9333197-9333216 None:intergenic 45.0%
TCCATGTGGCATTTCCTCAT+TGG - Chr7:9336270-9336289 None:intergenic 45.0%
TGCGGAGCTTGCATATACTA+TGG + Chr7:9332948-9332967 MsG0780036525.01.T01:CDS 45.0%
TGGTTAGAGGTTGTGGAAGT+TGG + Chr7:9336073-9336092 MsG0780036525.01.T01:intron 45.0%
TGTTAGAGTCCAAGTCCATG+TGG - Chr7:9336284-9336303 None:intergenic 45.0%
TTGCCTACGTACCCGATTAA+GGG + Chr7:9333695-9333714 MsG0780036525.01.T01:intron 45.0%
TTTGTTAGGGTGGAGAGAGT+TGG + Chr7:9336032-9336051 MsG0780036525.01.T01:intron 45.0%
! ATGAGTTTTCCGGCGAGAAT+AGG - Chr7:9335311-9335330 None:intergenic 45.0%
! ATGGTGGAGGAAGGTTGTTA+TGG + Chr7:9336006-9336025 MsG0780036525.01.T01:intron 45.0%
! CAGCCTAGTGTTTCTGACTT+TGG + Chr7:9332456-9332475 MsG0780036525.01.T01:CDS 45.0%
! CCCGTCTCTTTTGTATCTCT+CGG - Chr7:9337273-9337292 None:intergenic 45.0%
! GATCGAACTTGCCACTTGAT+CGG + Chr7:9337431-9337450 MsG0780036525.01.T01:intron 45.0%
! TTGAGTCAGTTTTGCCCCTA+GGG - Chr7:9336684-9336703 None:intergenic 45.0%
! TTTGAGTCAGTTTTGCCCCT+AGG - Chr7:9336685-9336704 None:intergenic 45.0%
!! CGAGGAGCACTAATAAGCTT+GGG - Chr7:9332204-9332223 None:intergenic 45.0%
!! GTTATGGAGGTTTGTTAGGG+TGG + Chr7:9336022-9336041 MsG0780036525.01.T01:intron 45.0%
!! TCGAGTCATTTTAGCCCCTA+GGG - Chr7:9336527-9336546 None:intergenic 45.0%
!! TTCGAGTCATTTTAGCCCCT+AGG - Chr7:9336528-9336547 None:intergenic 45.0%
!! TTTAGCTACGGGAAGGTGTT+AGG + Chr7:9333497-9333516 MsG0780036525.01.T01:intron 45.0%
!! TTTGTGGTGGTTGATGATGG+TGG + Chr7:9335990-9336009 MsG0780036525.01.T01:intron 45.0%
!!! GAGTTGTTTTAGCTACGGGA+AGG + Chr7:9333490-9333509 MsG0780036525.01.T01:intron 45.0%
!!! TCCGGGAGTTGTTTTAGCTA+CGG + Chr7:9333485-9333504 MsG0780036525.01.T01:intron 45.0%
AACCCTTGAGAATCGAGGTC+CGG + Chr7:9333467-9333486 MsG0780036525.01.T01:intron 50.0%
AATGACCAAAACGCCCCTAG+GGG + Chr7:9336510-9336529 MsG0780036525.01.T01:intron 50.0%
AGGTCGACGAAAGAGAGAGT+GGG - Chr7:9335644-9335663 None:intergenic 50.0%
AGTGAGGTGTGTGCATGTGT+CGG + Chr7:9334093-9334112 MsG0780036525.01.T01:intron 50.0%
CCCGTAGCTAAAACAACTCC+CGG - Chr7:9333489-9333508 None:intergenic 50.0%
CGCAGGTACAAGCTGTTCTT+TGG + Chr7:9337646-9337665 MsG0780036525.01.T01:intron 50.0%
CGGAAAACTCATCAACTCGC+CGG + Chr7:9335338-9335357 MsG0780036525.01.T01:intron 50.0%
CTTAATCGGGTACGTAGGCA+AGG - Chr7:9333696-9333715 None:intergenic 50.0%
CTTATTAGTGCTCCTCGCAC+GGG + Chr7:9332207-9332226 MsG0780036525.01.T01:CDS 50.0%
CTTCTCTCACCTATTCTCGC+CGG + Chr7:9335299-9335318 MsG0780036525.01.T01:intron 50.0%
CTTGCCTACGTACCCGATTA+AGG + Chr7:9333694-9333713 MsG0780036525.01.T01:intron 50.0%
GAAATGACCAAAACGCCCCT+AGG + Chr7:9336508-9336527 MsG0780036525.01.T01:intron 50.0%
GAAGTGGTGGTTAGAGGTTG+TGG + Chr7:9336066-9336085 MsG0780036525.01.T01:intron 50.0%
GACGGGTACAAGCTGTTCTT+TGG + Chr7:9337287-9337306 MsG0780036525.01.T01:intron 50.0%
GAGGAAATGCCACATGGACT+TGG + Chr7:9336272-9336291 MsG0780036525.01.T01:intron 50.0%
GAGGTGGATGAGGTTGCAAT+TGG - Chr7:9331814-9331833 None:intergenic 50.0%
GATCCCTTAATCGGGTACGT+AGG - Chr7:9333701-9333720 None:intergenic 50.0%
GCCGGAAACTTCATCTTCTC+CGG + Chr7:9335356-9335375 MsG0780036525.01.T01:intron 50.0%
GCCGGAGAAGATGAAGTTTC+CGG - Chr7:9335360-9335379 None:intergenic 50.0%
GCTTATTAGTGCTCCTCGCA+CGG + Chr7:9332206-9332225 MsG0780036525.01.T01:CDS 50.0%
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GTGGAGGAAGGTTGTTATGG+AGG + Chr7:9336009-9336028 MsG0780036525.01.T01:intron 50.0%
TAAAACAGGCAGGAAAGGGG+GGG + Chr7:9335117-9335136 MsG0780036525.01.T01:intron 50.0%
TCGGAGCAAACACCTCAAGA+TGG + Chr7:9335604-9335623 MsG0780036525.01.T01:intron 50.0%
TCTCTTTCGTCGACCTGAAC+CGG + Chr7:9335648-9335667 MsG0780036525.01.T01:intron 50.0%
TGAATTGGGGCTGAATGTGG+CGG + Chr7:9335937-9335956 MsG0780036525.01.T01:intron 50.0%
TTGACGCTGGGGTATGCATA+TGG + Chr7:9332047-9332066 MsG0780036525.01.T01:intron 50.0%
! AGGGTGGAGAGAGTTGGTTA+TGG + Chr7:9336038-9336057 MsG0780036525.01.T01:intron 50.0%
! CAGAGTATTTCGAGACTCGC+CGG - Chr7:9335397-9335416 None:intergenic 50.0%
! GAGAGAGTTGGTTATGGTGG+AGG + Chr7:9336044-9336063 MsG0780036525.01.T01:intron 50.0%
! GATCGAACTTGCCGTTTGAC+CGG + Chr7:9337548-9337567 MsG0780036525.01.T01:intron 50.0%
! GGAGCACTAATAAGCTTGGG+TGG - Chr7:9332201-9332220 None:intergenic 50.0%
! GTGGAGAGAGTTGGTTATGG+TGG + Chr7:9336041-9336060 MsG0780036525.01.T01:intron 50.0%
! GTTGGTTATGGTGGAGGAAG+TGG + Chr7:9336050-9336069 MsG0780036525.01.T01:intron 50.0%
! TCGAACTTGCCACTTGACCA+AGG + Chr7:9337372-9337391 MsG0780036525.01.T01:intron 50.0%
! TGAGTCAGTTTTGCCCCTAG+GGG - Chr7:9336683-9336702 None:intergenic 50.0%
! TTGGTCAAGACGACGGGTTT+AGG - Chr7:9333191-9333210 None:intergenic 50.0%
!! ATGGAAAGAGGTGTTGACGC+TGG + Chr7:9332034-9332053 MsG0780036525.01.T01:intron 50.0%
!! CGAGTCATTTTAGCCCCTAG+GGG - Chr7:9336526-9336545 None:intergenic 50.0%
!! GCGAGGAGCACTAATAAGCT+TGG - Chr7:9332205-9332224 None:intergenic 50.0%
!! TCAATGGGGTTTTGACCCCA+AGG + Chr7:9333928-9333947 MsG0780036525.01.T01:intron 50.0%
!! TGGAAAGAGGTGTTGACGCT+GGG + Chr7:9332035-9332054 MsG0780036525.01.T01:intron 50.0%
!! TGGTTGATGATGGTGGAGGA+AGG + Chr7:9335997-9336016 MsG0780036525.01.T01:intron 50.0%
!!! AGTTGATGAGTTTTCCGGCC+AGG - Chr7:9335335-9335354 None:intergenic 50.0%
!!! CCGGGAGTTGTTTTAGCTAC+GGG + Chr7:9333486-9333505 MsG0780036525.01.T01:intron 50.0%
!!! CGGCGAGTTGATGAGTTTTC+CGG - Chr7:9335340-9335359 None:intergenic 50.0%
ACCCTTGAGAATCGAGGTCC+GGG + Chr7:9333468-9333487 MsG0780036525.01.T01:intron 55.0%
ACGCTGGGGTATGCATATGG+CGG + Chr7:9332050-9332069 MsG0780036525.01.T01:intron 55.0%
CAGGTCGACGAAAGAGAGAG+TGG - Chr7:9335645-9335664 None:intergenic 55.0%
CGGTGAATTGGGGCTGAATG+TGG + Chr7:9335934-9335953 MsG0780036525.01.T01:intron 55.0%
GACTTCGTCTCTTGACTCCC+CGG - Chr7:9337008-9337027 None:intergenic 55.0%
GTGACACAGCCCGTAGATTC+CGG - Chr7:9337161-9337180 None:intergenic 55.0%
GTGGAGGAAGTGGTGGTTAG+AGG + Chr7:9336060-9336079 MsG0780036525.01.T01:intron 55.0%
TCCCGGACCTCGATTCTCAA+GGG - Chr7:9333472-9333491 None:intergenic 55.0%
! GCATGTGTCGGTGCTTGTGT+CGG + Chr7:9334105-9334124 MsG0780036525.01.T01:intron 55.0%
! GGTTATGGTGGAGGAAGTGG+TGG + Chr7:9336053-9336072 MsG0780036525.01.T01:intron 55.0%
!! GGAAAGAGGTGTTGACGCTG+GGG + Chr7:9332036-9332055 MsG0780036525.01.T01:intron 55.0%
!! GTGGTGGTTGATGATGGTGG+AGG + Chr7:9335993-9336012 MsG0780036525.01.T01:intron 55.0%
!!! TTTAGCCCCTAGGGGCGTTT+TGG - Chr7:9336518-9336537 None:intergenic 55.0%
CCGGAAAACTCATGCCTGGC+CGG + Chr7:9335318-9335337 MsG0780036525.01.T01:intron 60.0%
CCGGAATCTGCACTTCTCGC+CGG - Chr7:9335378-9335397 None:intergenic 60.0%
CGCTGGGGTATGCATATGGC+GGG + Chr7:9332051-9332070 MsG0780036525.01.T01:intron 60.0%
CTCCCGGACCTCGATTCTCA+AGG - Chr7:9333473-9333492 None:intergenic 60.0%
CTCGCCGGAAAACTCATGCC+TGG + Chr7:9335314-9335333 MsG0780036525.01.T01:intron 60.0%
GGGCTGTGTCACACCACCAA+GGG + Chr7:9337169-9337188 MsG0780036525.01.T01:intron 60.0%
! CCGGCCAGGCATGAGTTTTC+CGG - Chr7:9335321-9335340 None:intergenic 60.0%
! CCGGCGAGAAGTGCAGATTC+CGG + Chr7:9335375-9335394 MsG0780036525.01.T01:intron 60.0%
! GGGGGGTGTACGTAGCAATC+TGG + Chr7:9335134-9335153 MsG0780036525.01.T01:intron 60.0%
CGGGCTGTGTCACACCACCA+AGG + Chr7:9337168-9337187 MsG0780036525.01.T01:intron 65.0%
TTAACCGGCAAGCCCGTGCG+AGG - Chr7:9332222-9332241 None:intergenic 65.0%
TGCTCCTCGCACGGGCTTGC+CGG + Chr7:9332215-9332234 MsG0780036525.01.T01:CDS 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 9331674 9337935 9331674 ID=MsG0780036525.01;Name=MsG0780036525.01
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Chr7 exon 9331674 9332043 9331674 ID=MsG0780036525.01.T01:exon:10270;Parent=MsG0780036525.01.T01
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