AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780036632.01

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MsG0780036632.01.T01 AT3G26940 33.871 310 182 8 10 303 45 347 3.39e-41 149
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MsG0780036632.01.T01 AT2G37050 33.119 311 181 10 22 317 588 886 1.44e-39 149
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MsG0780036632.01.T01 AT1G07570 34.839 310 170 10 27 313 67 367 2.81e-37 138
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MsG0780036632.01.T01 AT2G02800 31.579 304 178 8 27 309 71 365 4.03e-37 138
MsG0780036632.01.T01 AT5G16900 32.862 283 175 6 36 311 386 660 4.37e-37 140
MsG0780036632.01.T01 AT2G04300 30.312 320 207 7 10 322 514 824 4.86e-37 141
MsG0780036632.01.T01 AT3G55450 32.198 323 180 11 6 303 32 340 4.97e-37 137
MsG0780036632.01.T01 AT2G28590 32.450 302 178 9 24 309 83 374 5.15e-37 137
MsG0780036632.01.T01 AT3G09010 39.091 220 119 5 27 241 34 243 6.15e-37 134
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MsG0780036632.01.T01 AT1G56720 30.068 296 186 6 25 308 165 451 6.90e-37 138
MsG0780036632.01.T01 AT1G56720 30.068 296 186 6 25 308 165 451 6.90e-37 138
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MsG0780036632.01.T01 AT4G01330 30.662 287 182 5 27 303 150 429 7.36e-36 135
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MsG0780036632.01.T01 AT5G65600 38.636 220 121 6 26 241 337 546 9.25e-35 134
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MsG0780036632.01.T01 AT2G01820 32.573 307 178 12 27 314 573 869 1.07e-34 134
MsG0780036632.01.T01 AT4G35600 31.210 314 191 9 27 322 75 381 1.14e-34 131
MsG0780036632.01.T01 AT5G10530 33.103 290 170 8 25 300 321 600 1.20e-34 134
MsG0780036632.01.T01 AT1G49270 30.263 304 193 6 27 318 324 620 1.23e-34 134
MsG0780036632.01.T01 AT1G29730 33.770 305 175 8 26 315 627 919 1.28e-34 134
MsG0780036632.01.T01 AT2G16750 30.872 298 190 6 14 303 252 541 1.37e-34 133
MsG0780036632.01.T01 AT2G16750 30.872 298 190 6 14 303 252 541 1.37e-34 133
MsG0780036632.01.T01 AT5G49780 33.054 239 147 4 82 311 575 809 1.50e-34 134
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MsG0780036632.01.T01 AT1G61420 38.117 223 127 5 27 246 334 548 3.54e-34 132
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MsG0780036632.01.T01 AT1G61420 38.117 223 127 5 27 246 484 698 6.65e-34 132
MsG0780036632.01.T01 AT1G26970 30.921 304 177 9 27 308 71 363 7.25e-34 129
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MsG0780036632.01.T01 AT2G35620 33.333 288 171 9 31 308 296 572 1.29e-33 130
MsG0780036632.01.T01 AT2G35620 33.333 288 171 9 31 308 296 572 1.29e-33 130
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MsG0780036632.01.T01 AT1G31420 32.877 292 176 7 27 308 294 575 7.67e-33 128
MsG0780036632.01.T01 AT1G31420 32.877 292 176 7 27 308 294 575 7.67e-33 128
MsG0780036632.01.T01 AT5G47850 32.188 320 189 7 26 322 430 744 7.73e-33 129
MsG0780036632.01.T01 AT4G00960 35.211 213 127 6 32 240 49 254 7.78e-33 123
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MsG0780036632.01.T01 AT4G21380 33.684 285 163 8 35 303 522 796 7.96e-33 129
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MsG0780036632.01.T01 AT4G11890 35.931 231 138 7 13 241 15 237 8.43e-33 125
MsG0780036632.01.T01 AT1G61500 37.668 223 128 5 27 246 484 698 9.08e-33 129
MsG0780036632.01.T01 AT1G61500 37.668 223 128 5 27 246 479 693 9.66e-33 129
MsG0780036632.01.T01 AT4G11890 36.087 230 136 7 13 241 15 234 9.81e-33 124
MsG0780036632.01.T01 AT4G22130 29.180 305 180 7 24 307 239 528 1.05e-32 127
MsG0780036632.01.T01 AT1G61500 37.668 223 128 5 27 246 461 675 1.07e-32 128
MsG0780036632.01.T01 AT1G18390 31.544 298 178 7 25 307 324 610 1.11e-32 128
MsG0780036632.01.T01 AT1G52290 30.000 330 182 12 27 327 131 440 1.16e-32 127
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MsG0780036632.01.T01 AT4G00970 30.847 295 172 8 32 307 337 618 1.20e-32 128
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MsG0780036632.01.T01 AT4G04540 39.367 221 117 7 27 241 341 550 2.27e-31 124
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MsG0780036632.01.T01 AT2G18470 29.167 312 200 6 27 324 272 576 2.34e-31 124
MsG0780036632.01.T01 AT2G18470 29.167 312 200 6 27 324 272 576 2.34e-31 124
MsG0780036632.01.T01 AT3G46410 30.182 275 158 8 36 303 2 249 2.46e-31 119
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MsG0780036632.01.T01 AT1G11340 36.161 224 127 7 25 241 566 780 2.66e-31 124
MsG0780036632.01.T01 AT4G31110 30.464 302 192 6 27 317 419 713 2.97e-31 124
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MsG0780036632.01.T01 AT3G09830 29.936 314 163 8 25 303 70 361 3.11e-31 122
MsG0780036632.01.T01 AT2G19130 32.441 299 177 8 27 311 483 770 3.13e-31 124
MsG0780036632.01.T01 AT1G70110 37.387 222 126 6 25 243 330 541 3.21e-31 124
MsG0780036632.01.T01 AT4G13190 35.371 229 129 7 92 307 34 256 3.29e-31 119
MsG0780036632.01.T01 AT5G59270 35.455 220 128 6 25 240 338 547 3.38e-31 124
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MsG0780036632.01.T01 AT2G30740 31.849 292 173 9 27 300 59 342 5.73e-31 120
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MsG0780036632.01.T01 AT4G04510 32.872 289 171 9 26 303 328 604 5.94e-31 123
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MsG0780036632.01.T01 AT4G23270 30.225 311 190 9 26 320 313 612 6.89e-31 123
MsG0780036632.01.T01 AT2G28940 32.895 304 167 12 27 303 90 383 7.09e-31 121
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MsG0780036632.01.T01 AT1G61440 37.220 223 129 5 27 246 471 685 1.01e-30 123
MsG0780036632.01.T01 AT4G23180 36.916 214 122 6 32 241 341 545 1.01e-30 122
MsG0780036632.01.T01 AT1G61440 37.220 223 129 5 27 246 466 680 1.15e-30 122

Find 68 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 117 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CCTATCAAAGATATCAAATT+TGG 0.115721 7:-10961375 None:intergenic
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AAATGTTGAACATTGTTTCT+TGG 0.277907 7:-10961127 None:intergenic
CCAAATTTGATATCTTTGAT+AGG 0.312556 7:+10961375 MsG0780036632.01.T01:CDS
AATCCAAGTTGCCATAGTTT+TGG 0.329709 7:-10961633 None:intergenic
TTTATGTCACGGTGGTAAAT+CGG 0.346168 7:-10961576 None:intergenic
AAATGTGACGTTTACTCCTT+TGG 0.360066 7:+10962365 MsG0780036632.01.T01:CDS
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CGCTATCAATCTCATGAGAA+TGG 0.418530 7:-10962492 None:intergenic
ACATTTATCTGTGCAAGTTC+CGG 0.422573 7:-10962348 None:intergenic
TTATGTCACGGTGGTAAATC+GGG 0.423171 7:-10961575 None:intergenic
CACCACCGTCATTGATAAGA+TGG 0.427512 7:+10962427 MsG0780036632.01.T01:CDS
CTATCAAAGATATCAAATTT+GGG 0.429750 7:-10961374 None:intergenic
TGAGCATGCTCTGGCACTGC+AGG 0.438038 7:+10962610 MsG0780036632.01.T01:CDS
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AAAGGATATGTCAAACATAA+TGG 0.447539 7:+10961255 MsG0780036632.01.T01:CDS
ACCAGCTATGGGTGAGGTTG+AGG 0.453206 7:+10962580 MsG0780036632.01.T01:CDS
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TATTGAAAGCTTCCCTTGTA+GGG 0.457190 7:-10961658 None:intergenic
TCAAATTTGGGTGACAAAGC+TGG 0.464132 7:-10961362 None:intergenic
GCACCAGAGTATAGTCTAAC+CGG 0.475202 7:+10962329 MsG0780036632.01.T01:CDS
AATCACTCTCGTGGAAGAAA+AGG 0.484705 7:+10961493 MsG0780036632.01.T01:CDS
CAACTTGGATTATCCCTACA+AGG 0.486141 7:+10961645 MsG0780036632.01.T01:CDS
GTTATCCGCAACAATGCTAC+TGG 0.492511 7:-10961291 None:intergenic
GAACCAAAACTATGGCAACT+TGG 0.503513 7:+10961630 MsG0780036632.01.T01:CDS
CATCTTATCAATGACGGTGG+TGG 0.511513 7:-10962426 None:intergenic
GGTTGAACTTGAGCATGCTC+TGG 0.512369 7:+10962601 MsG0780036632.01.T01:CDS
ATATGCGTTGGAGCTGCAAA+AGG 0.514478 7:+10961522 MsG0780036632.01.T01:CDS
TTATCTAAAAGAATGCTGTC+AGG 0.527708 7:-10961600 None:intergenic
GCTATCAATCTCATGAGAAT+GGG 0.528960 7:-10962491 None:intergenic
TTGGGTGACAAAGCTGGCAG+TGG 0.538707 7:-10961356 None:intergenic
GATGGATATGTTGTTTCAGA+GGG 0.543645 7:+10962445 MsG0780036632.01.T01:CDS
TGCAGGAGGAAGCAGATCGT+GGG 0.545846 7:+10962627 MsG0780036632.01.T01:CDS
AAAAGGCTTGAAATATGCGT+TGG 0.546831 7:+10961510 MsG0780036632.01.T01:CDS
ACCTCAACCTCACCCATAGC+TGG 0.548466 7:-10962581 None:intergenic
AGATGGATATGTTGTTTCAG+AGG 0.562142 7:+10962444 MsG0780036632.01.T01:CDS
CTGCAGGAGGAAGCAGATCG+TGG 0.567770 7:+10962626 MsG0780036632.01.T01:CDS
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TGCTGTCAGGATTTATGTCA+CGG 0.574974 7:-10961587 None:intergenic
CCCTTGAACATAAGTGATCA+CGG 0.585087 7:-10961464 None:intergenic
ATTATCCAGTAGCATTGTTG+CGG 0.585219 7:+10961286 MsG0780036632.01.T01:CDS
GCATGCTCTGGCACTGCAGG+AGG 0.586226 7:+10962613 MsG0780036632.01.T01:CDS
GATCGTACAGAGAAAACTCA+TGG 0.601455 7:-10961164 None:intergenic
ACACATATACACATAAAACA+AGG 0.608159 7:+10961312 MsG0780036632.01.T01:CDS
CATATCCATCTTATCAATGA+CGG 0.608194 7:-10962432 None:intergenic
AAGAAATAGAACCACACCAA+AGG 0.612630 7:-10962381 None:intergenic
GCAAATGAAAGACCAGCTAT+GGG 0.619089 7:+10962569 MsG0780036632.01.T01:CDS
GGGATATGGAATCACTCTCG+TGG 0.628454 7:+10961484 MsG0780036632.01.T01:CDS
TGAAAGACCAGCTATGGGTG+AGG 0.638015 7:+10962574 MsG0780036632.01.T01:CDS
AACGGCAATATAGTGTACAA+AGG 0.646833 7:+10961237 MsG0780036632.01.T01:CDS
CACATATACACATAAAACAA+GGG 0.660362 7:+10961313 MsG0780036632.01.T01:CDS
TGACGTTTACTCCTTTGGTG+TGG 0.661748 7:+10962370 MsG0780036632.01.T01:CDS
AACTTGGATTATCCCTACAA+GGG 0.670949 7:+10961646 MsG0780036632.01.T01:CDS
GTTCCGGTTAGACTATACTC+TGG 0.672548 7:-10962332 None:intergenic
GCAGGAGGAAGCAGATCGTG+GGG 0.678700 7:+10962628 MsG0780036632.01.T01:CDS
GGACTACACTATCTTCACAC+AGG 0.679485 7:+10961543 MsG0780036632.01.T01:CDS
ATCCATCTTATCAATGACGG+TGG 0.681438 7:-10962429 None:intergenic
ATGAACACTTCTAAACATTG+CGG 0.706193 7:-10962515 None:intergenic
TGTCAGGATTTATGTCACGG+TGG 0.785488 7:-10961584 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAAAATCTTAAGAACTAAAA+TGG + Chr7:10962186-10962205 MsG0780036632.01.T01:intron 15.0%
!! AGTTATTAAAATATGTGAAA+AGG - Chr7:10962245-10962264 None:intergenic 15.0%
!!! TTTCACATATTTTAATAACT+TGG + Chr7:10962245-10962264 MsG0780036632.01.T01:intron 15.0%
!! CTATCAAAGATATCAAATTT+GGG - Chr7:10961377-10961396 None:intergenic 20.0%
!!! CATTCTTTTAGATAACAATA+TGG + Chr7:10961608-10961627 MsG0780036632.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTTTGTCATGATCTAATTT+TGG + Chr7:10962219-10962238 MsG0780036632.01.T01:intron 20.0%
! AAAATGGTCTATAATGTCTT+AGG + Chr7:10962090-10962109 MsG0780036632.01.T01:intron 25.0%
! AAACTCAACTCCTAATAAAA+AGG - Chr7:10961985-10962004 None:intergenic 25.0%
! AAAGAAGATGAAATGGTAAA+TGG + Chr7:10961435-10961454 MsG0780036632.01.T01:CDS 25.0%
! AAAGGATATGTCAAACATAA+TGG + Chr7:10961255-10961274 MsG0780036632.01.T01:CDS 25.0%
! AACTCAACTCCTAATAAAAA+GGG - Chr7:10961984-10962003 None:intergenic 25.0%
! ACACATATACACATAAAACA+AGG + Chr7:10961312-10961331 MsG0780036632.01.T01:CDS 25.0%
! ACATAATTTACCAAAAAAGC+TGG - Chr7:10961706-10961725 None:intergenic 25.0%
! CACATATACACATAAAACAA+GGG + Chr7:10961313-10961332 MsG0780036632.01.T01:CDS 25.0%
! CCAAATTTGATATCTTTGAT+AGG + Chr7:10961375-10961394 MsG0780036632.01.T01:CDS 25.0%
! CCTATCAAAGATATCAAATT+TGG - Chr7:10961378-10961397 None:intergenic 25.0%
! TAAATTATACTTTATGCACC+AGG - Chr7:10962047-10962066 None:intergenic 25.0%
! TTTAATTCATCCTTCCAAAA+TGG + Chr7:10962074-10962093 MsG0780036632.01.T01:intron 25.0%
! TTTGATGAAAATCGAGAAAT+TGG + Chr7:10961207-10961226 MsG0780036632.01.T01:CDS 25.0%
!! AAATGTTGAACATTGTTTCT+TGG - Chr7:10961130-10961149 None:intergenic 25.0%
!! GATCAATAATTTTATCAGCT+GGG - Chr7:10962472-10962491 None:intergenic 25.0%
!! TAAGACATTATAGACCATTT+TGG - Chr7:10962091-10962110 None:intergenic 25.0%
!! TCGATTTTCATCAAAGTTAT+TGG - Chr7:10961202-10961221 None:intergenic 25.0%
!! TGTTCTAGTATTTTCATTCT+CGG + Chr7:10962146-10962165 MsG0780036632.01.T01:intron 25.0%
!!! CGAGAATTTTCTCATTTTTT+TGG - Chr7:10961410-10961429 None:intergenic 25.0%
ACAATATGGAACCAAAACTA+TGG + Chr7:10961622-10961641 MsG0780036632.01.T01:CDS 30.0%
ACTCAACTCCTAATAAAAAG+GGG - Chr7:10961983-10962002 None:intergenic 30.0%
ATGAACACTTCTAAACATTG+CGG - Chr7:10962518-10962537 None:intergenic 30.0%
ATTACCCATCAACAAAAGAT+GGG - Chr7:10961927-10961946 None:intergenic 30.0%
CATATCCATCTTATCAATGA+CGG - Chr7:10962435-10962454 None:intergenic 30.0%
CGTGTATAAAGAAGATGAAA+TGG + Chr7:10961428-10961447 MsG0780036632.01.T01:CDS 30.0%
TATTACCCATCAACAAAAGA+TGG - Chr7:10961928-10961947 None:intergenic 30.0%
TTATCTAAAAGAATGCTGTC+AGG - Chr7:10961603-10961622 None:intergenic 30.0%
! ACATTATAGACCATTTTGGA+AGG - Chr7:10962087-10962106 None:intergenic 30.0%
! GGATCAATAATTTTATCAGC+TGG - Chr7:10962473-10962492 None:intergenic 30.0%
! GTTCTAGTATTTTCATTCTC+GGG + Chr7:10962147-10962166 MsG0780036632.01.T01:intron 30.0%
! GTTTAATCCCCCTTTTTATT+AGG + Chr7:10961972-10961991 MsG0780036632.01.T01:intron 30.0%
!! TGATTAGTCTATGCTCATAT+GGG - Chr7:10961808-10961827 None:intergenic 30.0%
!! TTGATTAGTCTATGCTCATA+TGG - Chr7:10961809-10961828 None:intergenic 30.0%
!!! AAGCTGGTTTTAATTGGTAT+TGG - Chr7:10961690-10961709 None:intergenic 30.0%
!!! CCAAAAAAGCTGGTTTTAAT+TGG - Chr7:10961696-10961715 None:intergenic 30.0%
!!! CCAATTAAAACCAGCTTTTT+TGG + Chr7:10961693-10961712 MsG0780036632.01.T01:CDS 30.0%
AAAAGGCTTGAAATATGCGT+TGG + Chr7:10961510-10961529 MsG0780036632.01.T01:CDS 35.0%
AAATGTGACGTTTACTCCTT+TGG + Chr7:10962365-10962384 MsG0780036632.01.T01:CDS 35.0%
AACACATTAGTCCCACATAA+GGG - Chr7:10962130-10962149 None:intergenic 35.0%
AACGGCAATATAGTGTACAA+AGG + Chr7:10961237-10961256 MsG0780036632.01.T01:CDS 35.0%
AACTTGGATTATCCCTACAA+GGG + Chr7:10961646-10961665 MsG0780036632.01.T01:CDS 35.0%
AAGAAATAGAACCACACCAA+AGG - Chr7:10962384-10962403 None:intergenic 35.0%
ACAAGGGAAGCTTTCAATAT+CGG + Chr7:10961662-10961681 MsG0780036632.01.T01:CDS 35.0%
ACATTTATCTGTGCAAGTTC+CGG - Chr7:10962351-10962370 None:intergenic 35.0%
ATATTGAAAGCTTCCCTTGT+AGG - Chr7:10961662-10961681 None:intergenic 35.0%
ATTATCCAGTAGCATTGTTG+CGG + Chr7:10961286-10961305 MsG0780036632.01.T01:CDS 35.0%
CATGAAAAGATGCATGAGTA+TGG + Chr7:10962544-10962563 MsG0780036632.01.T01:CDS 35.0%
CGAGAAATTGGAGTAGTAAA+CGG + Chr7:10961219-10961238 MsG0780036632.01.T01:CDS 35.0%
CTCAACTCCTAATAAAAAGG+GGG - Chr7:10961982-10962001 None:intergenic 35.0%
GCTATCAATCTCATGAGAAT+GGG - Chr7:10962494-10962513 None:intergenic 35.0%
TATTGAAAGCTTCCCTTGTA+GGG - Chr7:10961661-10961680 None:intergenic 35.0%
TCACTTATGTTCAAGGGATA+TGG + Chr7:10961470-10961489 MsG0780036632.01.T01:CDS 35.0%
TTTATGTCACGGTGGTAAAT+CGG - Chr7:10961579-10961598 None:intergenic 35.0%
! AATCCAAGTTGCCATAGTTT+TGG - Chr7:10961636-10961655 None:intergenic 35.0%
! ATCTACCCATCTTTTGTTGA+TGG + Chr7:10961919-10961938 MsG0780036632.01.T01:intron 35.0%
! TCTACCCATCTTTTGTTGAT+GGG + Chr7:10961920-10961939 MsG0780036632.01.T01:intron 35.0%
! TGGCTGCAGATAATTTTAGA+AGG + Chr7:10962265-10962284 MsG0780036632.01.T01:intron 35.0%
!! AGATGGATATGTTGTTTCAG+AGG + Chr7:10962444-10962463 MsG0780036632.01.T01:CDS 35.0%
!! GATGGATATGTTGTTTCAGA+GGG + Chr7:10962445-10962464 MsG0780036632.01.T01:CDS 35.0%
!! GCAATGTTTAGAAGTGTTCA+TGG + Chr7:10962517-10962536 MsG0780036632.01.T01:CDS 35.0%
AATCACTCTCGTGGAAGAAA+AGG + Chr7:10961493-10961512 MsG0780036632.01.T01:CDS 40.0%
AGCAAATGAAAGACCAGCTA+TGG + Chr7:10962568-10962587 MsG0780036632.01.T01:CDS 40.0%
ATCCATCTTATCAATGACGG+TGG - Chr7:10962432-10962451 None:intergenic 40.0%
CAACTTGGATTATCCCTACA+AGG + Chr7:10961645-10961664 MsG0780036632.01.T01:CDS 40.0%
CACATGTTAGACCCTTATGT+GGG + Chr7:10962116-10962135 MsG0780036632.01.T01:intron 40.0%
CCCTTGAACATAAGTGATCA+CGG - Chr7:10961467-10961486 None:intergenic 40.0%
CCGTGATCACTTATGTTCAA+GGG + Chr7:10961464-10961483 MsG0780036632.01.T01:CDS 40.0%
CGCTATCAATCTCATGAGAA+TGG - Chr7:10962495-10962514 None:intergenic 40.0%
CTCATCAATAAAAGCTGCGT+AGG + Chr7:10961777-10961796 MsG0780036632.01.T01:intron 40.0%
GAACACATTAGTCCCACATA+AGG - Chr7:10962131-10962150 None:intergenic 40.0%
GAACCAAAACTATGGCAACT+TGG + Chr7:10961630-10961649 MsG0780036632.01.T01:CDS 40.0%
GATCGTACAGAGAAAACTCA+TGG - Chr7:10961167-10961186 None:intergenic 40.0%
GCAAATGAAAGACCAGCTAT+GGG + Chr7:10962569-10962588 MsG0780036632.01.T01:CDS 40.0%
TCAAATTTGGGTGACAAAGC+TGG - Chr7:10961365-10961384 None:intergenic 40.0%
TCATTCTCGGGCACTAATTA+TGG + Chr7:10962159-10962178 MsG0780036632.01.T01:intron 40.0%
TCCGTGATCACTTATGTTCA+AGG + Chr7:10961463-10961482 MsG0780036632.01.T01:CDS 40.0%
TGCTGTCAGGATTTATGTCA+CGG - Chr7:10961590-10961609 None:intergenic 40.0%
TTATGTCACGGTGGTAAATC+GGG - Chr7:10961578-10961597 None:intergenic 40.0%
! GTCTAAATGCTTTTGCTGAC+AGG + Chr7:10962290-10962309 MsG0780036632.01.T01:intron 40.0%
ACCAGGTCAGACCAATAGTA+CGG - Chr7:10962030-10962049 None:intergenic 45.0%
ATATGCGTTGGAGCTGCAAA+AGG + Chr7:10961522-10961541 MsG0780036632.01.T01:CDS 45.0%
ATTCCTCACCACCGTACTAT+TGG + Chr7:10962016-10962035 MsG0780036632.01.T01:intron 45.0%
CACCACCGTCATTGATAAGA+TGG + Chr7:10962427-10962446 MsG0780036632.01.T01:CDS 45.0%
CATCTTATCAATGACGGTGG+TGG - Chr7:10962429-10962448 None:intergenic 45.0%
CCACATAAGGGTCTAACATG+TGG - Chr7:10962118-10962137 None:intergenic 45.0%
CCACATGTTAGACCCTTATG+TGG + Chr7:10962115-10962134 MsG0780036632.01.T01:intron 45.0%
CGGTGGTGAGGAATTGTATT+TGG - Chr7:10962010-10962029 None:intergenic 45.0%
GCACCAGAGTATAGTCTAAC+CGG + Chr7:10962329-10962348 MsG0780036632.01.T01:CDS 45.0%
GGACTACACTATCTTCACAC+AGG + Chr7:10961543-10961562 MsG0780036632.01.T01:CDS 45.0%
GTTATCCGCAACAATGCTAC+TGG - Chr7:10961294-10961313 None:intergenic 45.0%
GTTCCGGTTAGACTATACTC+TGG - Chr7:10962335-10962354 None:intergenic 45.0%
TGACGTTTACTCCTTTGGTG+TGG + Chr7:10962370-10962389 MsG0780036632.01.T01:CDS 45.0%
TGTCAGGATTTATGTCACGG+TGG - Chr7:10961587-10961606 None:intergenic 45.0%
! CTTTTGCTGACAGGTACATG+GGG + Chr7:10962299-10962318 MsG0780036632.01.T01:intron 45.0%
! GCTTTTGCTGACAGGTACAT+GGG + Chr7:10962298-10962317 MsG0780036632.01.T01:intron 45.0%
! TGCTTTTGCTGACAGGTACA+TGG + Chr7:10962297-10962316 MsG0780036632.01.T01:intron 45.0%
AGACCAATAGTACGGTGGTG+AGG - Chr7:10962022-10962041 None:intergenic 50.0%
AGGTCAGACCAATAGTACGG+TGG - Chr7:10962027-10962046 None:intergenic 50.0%
GACAGGTACATGGGGTTTCA+TGG + Chr7:10962307-10962326 MsG0780036632.01.T01:intron 50.0%
GGGATATGGAATCACTCTCG+TGG + Chr7:10961484-10961503 MsG0780036632.01.T01:CDS 50.0%
GGTTGAACTTGAGCATGCTC+TGG + Chr7:10962601-10962620 MsG0780036632.01.T01:CDS 50.0%
TGAAAGACCAGCTATGGGTG+AGG + Chr7:10962574-10962593 MsG0780036632.01.T01:CDS 50.0%
! ACCGTACTATTGGTCTGACC+TGG + Chr7:10962026-10962045 MsG0780036632.01.T01:intron 50.0%
ACCAGCTATGGGTGAGGTTG+AGG + Chr7:10962580-10962599 MsG0780036632.01.T01:CDS 55.0%
ACCTCAACCTCACCCATAGC+TGG - Chr7:10962584-10962603 None:intergenic 55.0%
TGCAGGAGGAAGCAGATCGT+GGG + Chr7:10962627-10962646 MsG0780036632.01.T01:CDS 55.0%
TTGGGTGACAAAGCTGGCAG+TGG - Chr7:10961359-10961378 None:intergenic 55.0%
CTGCAGGAGGAAGCAGATCG+TGG + Chr7:10962626-10962645 MsG0780036632.01.T01:CDS 60.0%
GCAGGAGGAAGCAGATCGTG+GGG + Chr7:10962628-10962647 MsG0780036632.01.T01:CDS 60.0%
TGAGCATGCTCTGGCACTGC+AGG + Chr7:10962610-10962629 MsG0780036632.01.T01:CDS 60.0%
GCATGCTCTGGCACTGCAGG+AGG + Chr7:10962613-10962632 MsG0780036632.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 10961093 10962679 10961093 ID=MsG0780036632.01;Name=MsG0780036632.01
Chr7 mRNA 10961093 10962679 10961093 ID=MsG0780036632.01.T01;Parent=MsG0780036632.01;Name=MsG0780036632.01.T01;_AED=0.31;_eAED=0.31;_QI=0|0|0|1|1|1|2|0|329
Chr7 exon 10961093 10961714 10961093 ID=MsG0780036632.01.T01:exon:1667;Parent=MsG0780036632.01.T01
Chr7 exon 10962312 10962679 10962312 ID=MsG0780036632.01.T01:exon:1668;Parent=MsG0780036632.01.T01
Chr7 CDS 10961093 10961714 10961093 ID=MsG0780036632.01.T01:cds;Parent=MsG0780036632.01.T01
Chr7 CDS 10962312 10962679 10962312 ID=MsG0780036632.01.T01:cds;Parent=MsG0780036632.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780036632.01.T01

ATGCTTGCAAAATACTCAAAGCATAAAAGTTCGTCCAAGAAACAATGTTCAACATTTATAAAAGAGCTATGCCATGAGTTTTCTCTGTACGATCTTAAGAAAGCTACCAATAACTTTGATGAAAATCGAGAAATTGGAGTAGTAAACGGCAATATAGTGTACAAAGGATATGTCAAACATAATGGTGAAAATGATTATCCAGTAGCATTGTTGCGGATAACACATATACACATAAAACAAGGGTTCAAGAATGAAATTAAACTCCACTGCCAGCTTTGTCACCCAAATTTGATATCTTTGATAGGATTTTGTGACCAAAAAAATGAGAAAATTCTCGTGTATAAAGAAGATGAAATGGTAAATGGCTCTCTCCGTGATCACTTATGTTCAAGGGATATGGAATCACTCTCGTGGAAGAAAAGGCTTGAAATATGCGTTGGAGCTGCAAAAGGACTACACTATCTTCACACAGGAACAAAGCGCCCGATTTACCACCGTGACATAAATCCTGACAGCATTCTTTTAGATAACAATATGGAACCAAAACTATGGCAACTTGGATTATCCCTACAAGGGAAGCTTTCAATATCGGAGCCAATACCAATTAAAACCAGCTTTTTTGGTACATGGGGTTTCATGGCACCAGAGTATAGTCTAACCGGAACTTGCACAGATAAATGTGACGTTTACTCCTTTGGTGTGGTTCTATTTCTTGTAATTTCATGCGCATACATTTCCACCACCGTCATTGATAAGATGGATATGTTGTTTCAGAGGGTCCCAGCTGATAAAATTATTGATCCCATTCTCATGAGATTGATAGCGCCGCAATGTTTAGAAGTGTTCATGGATATCATGAAAAGATGCATGAGTATGGAAGCAAATGAAAGACCAGCTATGGGTGAGGTTGAGGTTGAACTTGAGCATGCTCTGGCACTGCAGGAGGAAGCAGATCGTGGGGAAAGTAACATTTTAACTTTTTATGAATGA
Protein sequence

>MsG0780036632.01.T01

MLAKYSKHKSSSKKQCSTFIKELCHEFSLYDLKKATNNFDENREIGVVNGNIVYKGYVKHNGENDYPVALLRITHIHIKQGFKNEIKLHCQLCHPNLISLIGFCDQKNEKILVYKEDEMVNGSLRDHLCSRDMESLSWKKRLEICVGAAKGLHYLHTGTKRPIYHRDINPDSILLDNNMEPKLWQLGLSLQGKLSISEPIPIKTSFFGTWGFMAPEYSLTGTCTDKCDVYSFGVVLFLVISCAYISTTVIDKMDMLFQRVPADKIIDPILMRLIAPQCLEVFMDIMKRCMSMEANERPAMGEVEVELEHALALQEEADRGESNILTFYE*