AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780040037.01

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MsG0780040037.01.T01 AT2G37050 41.053 285 159 7 48 327 593 873 5.25e-62 215
MsG0780040037.01.T01 AT1G56120 43.617 282 151 7 53 331 536 812 5.49e-62 214
MsG0780040037.01.T01 AT5G11020 40.214 281 161 5 54 331 134 410 5.59e-62 206
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MsG0780040037.01.T01 AT4G03230 41.637 281 153 6 57 331 529 804 6.24e-60 209
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MsG0780040037.01.T01 AT4G23140 36.443 343 194 10 6 342 309 633 9.38e-60 206
MsG0780040037.01.T01 AT5G24010 37.353 340 194 7 6 334 431 762 9.64e-60 207
MsG0780040037.01.T01 AT1G67720 39.571 326 185 9 11 331 558 876 1.01e-59 209
MsG0780040037.01.T01 AT5G63710 41.333 300 161 9 40 331 271 563 1.04e-59 204
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MsG0780040037.01.T01 AT1G53440 41.135 282 161 5 53 331 659 938 1.09e-59 209
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MsG0780040037.01.T01 AT5G35960 37.770 278 162 5 53 327 126 395 1.65e-56 191
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MsG0780040037.01.T01 AT2G14440 39.502 281 164 5 53 332 558 833 1.83e-56 199
MsG0780040037.01.T01 AT4G32300 41.404 285 156 9 53 332 487 765 2.04e-56 198
MsG0780040037.01.T01 AT1G61360 44.043 277 143 7 4 276 447 715 2.04e-56 198
MsG0780040037.01.T01 AT4G04540 38.621 290 168 7 57 343 320 602 2.30e-56 196
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MsG0780040037.01.T01 AT4G23250 39.322 295 169 8 54 342 347 637 2.62e-56 197
MsG0780040037.01.T01 AT1G80640 37.589 282 161 5 54 331 142 412 2.85e-56 191
MsG0780040037.01.T01 AT4G23180 45.701 221 114 4 54 269 341 560 2.88e-56 194
MsG0780040037.01.T01 AT3G21630 40.753 292 155 9 53 336 314 595 3.51e-56 195
MsG0780040037.01.T01 AT2G02220 41.343 283 161 5 53 332 726 1006 3.58e-56 199
MsG0780040037.01.T01 AT1G74360 40.000 295 158 8 53 337 806 1091 3.71e-56 199
MsG0780040037.01.T01 AT4G23150 38.790 281 167 5 54 331 329 607 3.79e-56 196
MsG0780040037.01.T01 AT4G04540 38.621 290 168 7 57 343 349 631 4.42e-56 195
MsG0780040037.01.T01 AT2G23950 44.538 238 122 6 53 285 291 523 4.46e-56 193
MsG0780040037.01.T01 AT1G61370 36.810 326 196 7 54 376 343 661 5.68e-56 195
MsG0780040037.01.T01 AT4G04490 38.567 293 160 7 45 331 328 606 5.81e-56 195
MsG0780040037.01.T01 AT5G24080 38.926 298 175 6 53 347 524 817 6.08e-56 197
MsG0780040037.01.T01 AT1G61610 37.113 291 179 4 54 342 518 806 6.95e-56 197
MsG0780040037.01.T01 AT1G34300 36.686 338 196 12 53 381 478 806 7.29e-56 197
MsG0780040037.01.T01 AT1G69730 36.420 324 198 4 53 374 439 756 7.66e-56 197
MsG0780040037.01.T01 AT1G65790 38.811 286 162 7 55 331 513 794 7.97e-56 197
MsG0780040037.01.T01 AT1G51910 40.636 283 154 8 53 331 567 839 8.65e-56 197
MsG0780040037.01.T01 AT2G11520 39.789 284 153 6 49 322 213 488 9.91e-56 191
MsG0780040037.01.T01 AT5G01950 40.484 289 157 7 53 334 533 813 1.17e-55 197
MsG0780040037.01.T01 AT1G11330 48.804 209 104 3 54 260 517 724 1.67e-55 195
MsG0780040037.01.T01 AT4G29450 37.415 294 164 5 53 331 560 848 2.05e-55 196
MsG0780040037.01.T01 AT4G02410 38.255 298 174 7 53 346 347 638 2.09e-55 194
MsG0780040037.01.T01 AT3G55550 39.103 312 172 8 53 357 338 638 2.22e-55 194
MsG0780040037.01.T01 AT5G01950 40.484 289 157 7 53 334 618 898 2.64e-55 196
MsG0780040037.01.T01 AT5G01950 40.484 289 157 7 53 334 618 898 2.64e-55 196
MsG0780040037.01.T01 AT5G01950 40.484 289 157 7 53 334 618 898 2.64e-55 196
MsG0780040037.01.T01 AT5G01950 40.484 289 157 7 53 334 618 898 2.64e-55 196
MsG0780040037.01.T01 AT5G18910 36.879 282 167 5 53 331 184 457 2.90e-55 190
MsG0780040037.01.T01 AT4G38830 39.161 286 164 7 54 332 337 619 2.93e-55 193
MsG0780040037.01.T01 AT1G05700 38.194 288 173 3 46 332 557 840 2.94e-55 196
MsG0780040037.01.T01 AT1G61370 36.810 326 196 7 54 376 494 812 3.41e-55 195
MsG0780040037.01.T01 AT4G04570 37.543 293 173 7 54 343 341 626 3.99e-55 193
MsG0780040037.01.T01 AT3G53810 39.604 303 164 9 53 346 339 631 4.14e-55 193
MsG0780040037.01.T01 AT1G78530 45.946 222 112 5 58 276 72 288 4.55e-55 184
MsG0780040037.01.T01 AT4G23250 39.322 295 169 8 54 342 347 637 4.66e-55 196
MsG0780040037.01.T01 AT1G72300 39.590 293 172 5 49 338 791 1081 4.84e-55 196
MsG0780040037.01.T01 AT1G61430 37.421 318 191 6 54 368 459 771 4.88e-55 194
MsG0780040037.01.T01 AT1G61430 37.421 318 191 6 54 368 459 771 4.88e-55 194
MsG0780040037.01.T01 AT1G61430 37.421 318 191 6 54 368 459 771 4.88e-55 194
MsG0780040037.01.T01 AT1G05700 38.194 288 173 3 46 332 588 871 5.18e-55 195
MsG0780040037.01.T01 AT5G37450 40.210 286 157 6 53 332 420 697 6.07e-55 194
MsG0780040037.01.T01 AT4G21400 35.849 318 164 9 54 335 215 528 6.20e-55 191
MsG0780040037.01.T01 AT1G11050 40.968 310 156 10 51 341 285 586 6.38e-55 192
MsG0780040037.01.T01 AT1G61430 37.421 318 191 6 54 368 482 794 6.97e-55 194
MsG0780040037.01.T01 AT1G61420 40.000 285 166 5 54 335 339 621 7.90e-55 192
MsG0780040037.01.T01 AT1G65800 38.328 287 164 7 54 331 516 798 7.95e-55 194
MsG0780040037.01.T01 AT4G11460 36.877 301 177 6 51 342 336 632 7.99e-55 192
MsG0780040037.01.T01 AT4G23290 37.543 293 177 5 54 342 313 603 8.45e-55 192
MsG0780040037.01.T01 AT5G42440 35.780 327 191 9 14 334 42 355 9.30e-55 185
MsG0780040037.01.T01 AT1G61420 40.000 285 166 5 54 335 337 619 9.81e-55 192
MsG0780040037.01.T01 AT4G00970 36.525 282 171 7 57 332 340 619 1.08e-54 192
MsG0780040037.01.T01 AT4G04510 48.585 212 98 4 54 259 332 538 1.23e-54 191

Find 107 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 215 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TATCCAAAGCTTTCTGATTT+TGG 0.101772 7:-72285527 MsG0780040037.01.T01:CDS
GCGAGTACTGTTTCTGTTTC+TGG 0.134143 7:-72287885 MsG0780040037.01.T01:CDS
CAATGAAACAACATTGATTT+TGG 0.150009 7:-72284822 MsG0780040037.01.T01:CDS
TTATTTCCTCAGGACTATTT+TGG 0.162102 7:+72284717 None:intergenic
CAGTACTCGCAACAGATTTA+AGG 0.170103 7:+72287898 None:intergenic
TTTAGGGATGAAAACTTTAT+TGG 0.190273 7:-72286238 MsG0780040037.01.T01:CDS
GAAGTCATCCAACATATTAT+TGG 0.204061 7:-72285561 MsG0780040037.01.T01:CDS
CTAACTATTTCGGATGCTTT+TGG 0.240646 7:+72284875 None:intergenic
CAATCAAGTGGTTCATTATC+TGG 0.247459 7:+72285674 None:intergenic
ATGGGTCGTTGCCCATGTTT+TGG 0.265678 7:-72287975 MsG0780040037.01.T01:CDS
CCCAACCTTGTTAGTATGAT+TGG 0.271119 7:-72285959 MsG0780040037.01.T01:CDS
TTTATTGGCCAAGGTGGATT+TGG 0.272836 7:-72286223 MsG0780040037.01.T01:CDS
TCTGTTTCTGGAAGATCTTT+AGG 0.282576 7:-72287873 MsG0780040037.01.T01:CDS
AAATGTGGGTCTACTAATTT+CGG 0.293978 7:+72285037 None:intergenic
CAAAATCAATGTTGTTTCAT+TGG 0.313350 7:+72284823 None:intergenic
AAAATCAATGTTGTTTCATT+GGG 0.316618 7:+72284824 None:intergenic
GTGTTATTGGAGCTAATTAC+TGG 0.330204 7:-72285368 MsG0780040037.01.T01:CDS
AGATCTGACATCTATAGTTT+TGG 0.333404 7:-72285395 MsG0780040037.01.T01:CDS
TCGTCGTGCTCCATCTCTCC+TGG 0.336227 7:+72284851 None:intergenic
CTCTCCTGGGCTAACTATTT+CGG 0.337673 7:+72284865 None:intergenic
ACCATGGAGATGAGATTCTA+AGG 0.373242 7:+72285880 None:intergenic
TAACAGAAGGCTCCGCTTCA+TGG 0.384864 7:+72285597 None:intergenic
ATGACAAGCATCTTGTTGAT+TGG 0.386220 7:-72285316 MsG0780040037.01.T01:CDS
TCTTGGATGACAAGTAATCT+AGG 0.398816 7:+72284906 None:intergenic
ACTACCCTATATCAGGTCTA+AGG 0.406978 7:-72285006 MsG0780040037.01.T01:CDS
CAGATAATGAACCACTTGAT+TGG 0.413636 7:-72285673 MsG0780040037.01.T01:CDS
TACCTCCTTATTATTTCCTC+AGG 0.415849 7:+72284707 None:intergenic
GGGTCTAGAAAGAAGGGAAA+AGG 0.422240 7:-72287954 MsG0780040037.01.T01:CDS
TGACAAGCATCTTGTTGATT+GGG 0.422306 7:-72285315 MsG0780040037.01.T01:intron
TGTCTATGAATACATGCCTA+TGG 0.424126 7:-72285906 MsG0780040037.01.T01:CDS
ATAGTCCTGAGGAAATAATA+AGG 0.425388 7:-72284712 MsG0780040037.01.T01:CDS
GCCATCCTTAGACCTGATAT+AGG 0.432843 7:+72285001 None:intergenic
CAAGGTCACTACCCTATATC+AGG 0.445567 7:-72285013 MsG0780040037.01.T01:CDS
TCTAAGGATGGCCCTTGAAA+TGG 0.448720 7:-72284990 MsG0780040037.01.T01:CDS
CACTAAAATTCTTCTCACCT+TGG 0.452594 7:+72286011 None:intergenic
GACACATGCGTGCCATTTCA+AGG 0.452935 7:+72284978 None:intergenic
CCATCCTTAGACCTGATATA+GGG 0.455171 7:+72285002 None:intergenic
CCACGTCTCCGGCCTTCTGC+AGG 0.460375 7:-72284944 MsG0780040037.01.T01:CDS
AGGCCAAAATCAGAAAGCTT+TGG 0.461926 7:+72285524 None:intergenic
AGGGAAGAACCTCAATGATC+AGG 0.464515 7:-72287934 MsG0780040037.01.T01:CDS
AAAACTAGATAGAACTAGTC+AGG 0.464803 7:-72286185 MsG0780040037.01.T01:intron
TTTCATCTTCCTGATCATTG+AGG 0.469180 7:+72287925 None:intergenic
TCCAACATATTATTGGATGA+AGG 0.469505 7:-72285554 MsG0780040037.01.T01:CDS
GGTCTAGAAAGAAGGGAAAA+GGG 0.470058 7:-72287953 MsG0780040037.01.T01:CDS
CTTGCGAAATTCGGTCCAAC+TGG 0.479810 7:-72285503 MsG0780040037.01.T01:CDS
CCAATCATACTAACAAGGTT+GGG 0.485576 7:+72285959 None:intergenic
TTCTTTCTAGACCCAAAACA+TGG 0.487772 7:+72287963 None:intergenic
ACCAATCATACTAACAAGGT+TGG 0.491646 7:+72285958 None:intergenic
AATAGTTAGCCCAGGAGAGA+TGG 0.494331 7:-72284861 MsG0780040037.01.T01:CDS
TTAAAAGACTTGATAAACAC+TGG 0.524121 7:-72286037 MsG0780040037.01.T01:CDS
CGTCGTGCTCCATCTCTCCT+GGG 0.525478 7:+72284852 None:intergenic
GGGTAGTGACCTTGCAAATG+TGG 0.528481 7:+72285022 None:intergenic
CAAGAATGAGGATAGCTGTA+GGG 0.529830 7:-72285646 MsG0780040037.01.T01:CDS
CTTGGATGACAAGTAATCTA+GGG 0.529953 7:+72284907 None:intergenic
TCCTTCATCCAATAATATGT+TGG 0.535433 7:+72285553 None:intergenic
TTCGAGAAGATCCACGTCTC+CGG 0.536776 7:-72284955 MsG0780040037.01.T01:CDS
CCTGCAGAAGGCCGGAGACG+TGG 0.537660 7:+72284944 None:intergenic
TCTTGCAGAGGCCAAACAGT+GGG 0.538191 7:-72284774 MsG0780040037.01.T01:CDS
TTTCCAGTAGTTGCATACTC+AGG 0.538586 7:+72285428 None:intergenic
TTGATAAACACTGGTTTCCA+AGG 0.539450 7:-72286028 MsG0780040037.01.T01:CDS
GTCTATGAATACATGCCTAT+GGG 0.540285 7:-72285905 MsG0780040037.01.T01:CDS
ATTCTTGTATTCCAATCAAG+TGG 0.546631 7:+72285662 None:intergenic
GATGAAAACTTTATTGGCCA+AGG 0.556480 7:-72286232 MsG0780040037.01.T01:CDS
ATCAACAAGATGCTTGTCAT+GGG 0.558221 7:+72285319 None:intergenic
AATCAACAAGATGCTTGTCA+TGG 0.561712 7:+72285318 None:intergenic
ATACGTTGCTACTAGAGTCA+TGG 0.563003 7:-72285471 MsG0780040037.01.T01:CDS
GCACCTGAGTATGCAACTAC+TGG 0.564739 7:-72285431 MsG0780040037.01.T01:CDS
TACGTTGCTACTAGAGTCAT+GGG 0.565478 7:-72285470 MsG0780040037.01.T01:CDS
AAATCAATGTTGTTTCATTG+GGG 0.567037 7:+72284825 None:intergenic
TCCTTAGAATCTCATCTCCA+TGG 0.569780 7:-72285881 MsG0780040037.01.T01:intron
GCCCATTGTTCAGAGACAAA+AGG 0.570214 7:-72285066 MsG0780040037.01.T01:CDS
ATGATTGGTTACTGCGCGGA+AGG 0.572439 7:-72285944 MsG0780040037.01.T01:CDS
CTATATCGCCTGCAGAAGGC+CGG 0.572493 7:+72284936 None:intergenic
ACAAGAATGAGGATAGCTGT+AGG 0.582324 7:-72285647 MsG0780040037.01.T01:CDS
TTGATTGGAATACAAGAATG+AGG 0.584561 7:-72285658 MsG0780040037.01.T01:CDS
AAGATAATTTAGTCCTCTTG+CGG 0.585738 7:+72285622 None:intergenic
AATCAATGTTGTTTCATTGG+GGG 0.592811 7:+72284826 None:intergenic
TTGCAGAGGCCAAACAGTGG+GGG 0.593718 7:-72284772 MsG0780040037.01.T01:CDS
TCATACTAACAAGGTTGGGA+TGG 0.597031 7:+72285963 None:intergenic
CCCTATATCAGGTCTAAGGA+TGG 0.603423 7:-72285002 MsG0780040037.01.T01:CDS
TTAGTAGACCCACATTTGCA+AGG 0.603437 7:-72285031 MsG0780040037.01.T01:CDS
GCATCCGAAATAGTTAGCCC+AGG 0.604554 7:-72284869 MsG0780040037.01.T01:CDS
TGCAGAGGCCAAACAGTGGG+GGG 0.605050 7:-72284771 MsG0780040037.01.T01:CDS
GGATTTGGAACTGTTTACAA+AGG 0.607551 7:-72286208 MsG0780040037.01.T01:CDS
AAATCTCTATATATAACAGA+AGG 0.609478 7:+72285584 None:intergenic
GAAAACTTTATTGGCCAAGG+TGG 0.611290 7:-72286229 MsG0780040037.01.T01:CDS
ACACATGCGTGCCATTTCAA+GGG 0.613330 7:+72284979 None:intergenic
CAGTTGGACCGAATTTCGCA+AGG 0.616957 7:+72285504 None:intergenic
GGTAGTGACCTTGCAAATGT+GGG 0.619415 7:+72285023 None:intergenic
AGTACTATATCGCCTGCAGA+AGG 0.620346 7:+72284932 None:intergenic
AAATTATCTTCACCATGAAG+CGG 0.622353 7:-72285609 MsG0780040037.01.T01:CDS
TGAGATTCTAAGGATCCCAT+AGG 0.625412 7:+72285890 None:intergenic
CTTGCAGAGGCCAAACAGTG+GGG 0.626226 7:-72284773 MsG0780040037.01.T01:CDS
AAGAATGAGGATAGCTGTAG+GGG 0.628284 7:-72285645 MsG0780040037.01.T01:CDS
TCTTTCTAGACCCAAAACAT+GGG 0.635878 7:+72287964 None:intergenic
AAACAGTTCCAAATCCACCT+TGG 0.635901 7:+72286215 None:intergenic
ATAGCTGTAGGGGCCGCAAG+AGG 0.647829 7:-72285635 MsG0780040037.01.T01:CDS
ACTAGAGTCATGGGAACACA+TGG 0.648215 7:-72285461 MsG0780040037.01.T01:CDS
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CRISPR-GE

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!! CTTAATAATACAAATTGATT+AGG - Chr7:72285992-72286011 MsG0780040037.01.T01:CDS 15.0%
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!! AGGTGAGAAGAATTTTAGTG+AGG - Chr7:72286673-72286692 MsG0780040037.01.T01:intron 35.0%
!! ATGTTTTGGGTCTAGAAAGA+AGG - Chr7:72284720-72284739 MsG0780040037.01.T01:CDS 35.0%
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!! TGGAGCCTTATTAGAAATGT+CGG + Chr7:72286385-72286404 None:intergenic 35.0%
!! TGTTTTGGGTCTAGAAAGAA+GGG - Chr7:72284721-72284740 MsG0780040037.01.T01:CDS 35.0%
!! TTCAATGGCTCTAAAGTCAT+AGG - Chr7:72285585-72285604 MsG0780040037.01.T01:CDS 35.0%
!! TTGATAAACACTGGTTTCCA+AGG - Chr7:72286653-72286672 MsG0780040037.01.T01:intron 35.0%
AAACAGTTCCAAATCCACCT+TGG + Chr7:72286469-72286488 None:intergenic 40.0%
AAGAATGAGGATAGCTGTAG+GGG - Chr7:72287036-72287055 MsG0780040037.01.T01:intron 40.0%
ACAAGAATGAGGATAGCTGT+AGG - Chr7:72287034-72287053 MsG0780040037.01.T01:intron 40.0%
ACCATGGAGATGAGATTCTA+AGG + Chr7:72286804-72286823 None:intergenic 40.0%
ACGTATGATTGATCTCCAGT+TGG + Chr7:72287196-72287215 None:intergenic 40.0%
ACTACCCTATATCAGGTCTA+AGG - Chr7:72287675-72287694 MsG0780040037.01.T01:intron 40.0%
AGGCCAAAATCAGAAAGCTT+TGG + Chr7:72287160-72287179 None:intergenic 40.0%
AGTCGAGGAGCTATAAAAGA+AGG + Chr7:72285684-72285703 None:intergenic 40.0%
ATACGTTGCTACTAGAGTCA+TGG - Chr7:72287210-72287229 MsG0780040037.01.T01:intron 40.0%
ATATGTGCTCAATCACTAGG+AGG + Chr7:72285637-72285656 None:intergenic 40.0%
CAAGAATGAGGATAGCTGTA+GGG - Chr7:72287035-72287054 MsG0780040037.01.T01:intron 40.0%
CAGTACTCGCAACAGATTTA+AGG + Chr7:72284786-72284805 None:intergenic 40.0%
CCATCCTTAGACCTGATATA+GGG + Chr7:72287682-72287701 None:intergenic 40.0%
CCCAACCTTGTTAGTATGAT+TGG - Chr7:72286722-72286741 MsG0780040037.01.T01:intron 40.0%
GAAAACTTTATTGGCCAAGG+TGG - Chr7:72286452-72286471 MsG0780040037.01.T01:intron 40.0%
GCAATATGTGCTCAATCACT+AGG + Chr7:72285640-72285659 None:intergenic 40.0%
GGTCTAGAAAGAAGGGAAAA+GGG - Chr7:72284728-72284747 MsG0780040037.01.T01:CDS 40.0%
GTCCTGAGGAAATAATAAGG+AGG - Chr7:72287972-72287991 MsG0780040037.01.T01:CDS 40.0%
TACATTCAGAGAACTTGCGA+CGG - Chr7:72286409-72286428 MsG0780040037.01.T01:intron 40.0%
TACGTTGCTACTAGAGTCAT+GGG - Chr7:72287211-72287230 MsG0780040037.01.T01:intron 40.0%
TAGAACCAGATATAGCTGCA+GGG + Chr7:72285948-72285967 None:intergenic 40.0%
TCATACTAACAAGGTTGGGA+TGG + Chr7:72286721-72286740 None:intergenic 40.0%
TCCTTAGAATCTCATCTCCA+TGG - Chr7:72286800-72286819 MsG0780040037.01.T01:intron 40.0%
TTAGTAGACCCACATTTGCA+AGG - Chr7:72287650-72287669 MsG0780040037.01.T01:intron 40.0%
TTGATAAGGCATGAAAGTCG+AGG + Chr7:72285699-72285718 None:intergenic 40.0%
TTTCCAGTAGTTGCATACTC+AGG + Chr7:72287256-72287275 None:intergenic 40.0%
TTTGTCCAGTTGCAGAATAG+TGG - Chr7:72286093-72286112 MsG0780040037.01.T01:intron 40.0%
! CACATATCTCGTGACACTTT+TGG + Chr7:72286057-72286076 None:intergenic 40.0%
! CCAAAAGGAAGCCTTTTAAG+TGG + Chr7:72285184-72285203 None:intergenic 40.0%
! CCACTTAAAAGGCTTCCTTT+TGG - Chr7:72285181-72285200 MsG0780040037.01.T01:intron 40.0%
! CGACGGCAACAAAGAATTTT+AGG - Chr7:72286426-72286445 MsG0780040037.01.T01:intron 40.0%
! TAGTATGATTGGTTACTGCG+CGG - Chr7:72286733-72286752 MsG0780040037.01.T01:intron 40.0%
! TGAGATTCTAAGGATCCCAT+AGG + Chr7:72286794-72286813 None:intergenic 40.0%
! TTTATTGGCCAAGGTGGATT+TGG - Chr7:72286458-72286477 MsG0780040037.01.T01:intron 40.0%
!! CAAAAGTGTCACGAGATATG+TGG - Chr7:72286055-72286074 MsG0780040037.01.T01:intron 40.0%
!!! GATTTTGGCCTTGCGAAATT+CGG - Chr7:72287169-72287188 MsG0780040037.01.T01:intron 40.0%
AAGCGGTAGTAGTGTTCTGA+TGG - Chr7:72285263-72285282 MsG0780040037.01.T01:intron 45.0%
AAGTGGCCAAAATAGTCCTG+AGG - Chr7:72287958-72287977 MsG0780040037.01.T01:CDS 45.0%
AATAGTTAGCCCAGGAGAGA+TGG - Chr7:72287820-72287839 MsG0780040037.01.T01:intron 45.0%
ACTAGAGTCATGGGAACACA+TGG - Chr7:72287220-72287239 MsG0780040037.01.T01:intron 45.0%
AGCAATGATAACTCGGTCAG+AGG + Chr7:72285799-72285818 None:intergenic 45.0%
AGGGAAGAACCTCAATGATC+AGG - Chr7:72284747-72284766 MsG0780040037.01.T01:CDS 45.0%
AGTACTATATCGCCTGCAGA+AGG + Chr7:72287752-72287771 None:intergenic 45.0%
CAAGGTCACTACCCTATATC+AGG - Chr7:72287668-72287687 MsG0780040037.01.T01:intron 45.0%
CCCTATATCAGGTCTAAGGA+TGG - Chr7:72287679-72287698 MsG0780040037.01.T01:intron 45.0%
CTAGAACCAGATATAGCTGC+AGG + Chr7:72285949-72285968 None:intergenic 45.0%
CTCGGTTTCCTAATGCGTAT+AGG - Chr7:72287589-72287608 MsG0780040037.01.T01:intron 45.0%
CTCTCCTGGGCTAACTATTT+CGG + Chr7:72287819-72287838 None:intergenic 45.0%
GCCATCCTTAGACCTGATAT+AGG + Chr7:72287683-72287702 None:intergenic 45.0%
GCCCATTGTTCAGAGACAAA+AGG - Chr7:72287615-72287634 MsG0780040037.01.T01:intron 45.0%
GGGTCTAGAAAGAAGGGAAA+AGG - Chr7:72284727-72284746 MsG0780040037.01.T01:CDS 45.0%
GGTAGTGACCTTGCAAATGT+GGG + Chr7:72287661-72287680 None:intergenic 45.0%
TCTAAGGATGGCCCTTGAAA+TGG - Chr7:72287691-72287710 MsG0780040037.01.T01:intron 45.0%
!! ACACATGCGTGCCATTTCAA+GGG + Chr7:72287705-72287724 None:intergenic 45.0%
!! GCGAGTACTGTTTCTGTTTC+TGG - Chr7:72284796-72284815 MsG0780040037.01.T01:CDS 45.0%
AAGAGAGCAAGCTCTTGCAG+AGG - Chr7:72287895-72287914 MsG0780040037.01.T01:CDS 50.0%
CAGTTGGACCGAATTTCGCA+AGG + Chr7:72287180-72287199 None:intergenic 50.0%
CTTGCGAAATTCGGTCCAAC+TGG - Chr7:72287178-72287197 MsG0780040037.01.T01:intron 50.0%
GCACCTGAGTATGCAACTAC+TGG - Chr7:72287250-72287269 MsG0780040037.01.T01:intron 50.0%
GCATCCGAAATAGTTAGCCC+AGG - Chr7:72287812-72287831 MsG0780040037.01.T01:intron 50.0%
GGGTAGTGACCTTGCAAATG+TGG + Chr7:72287662-72287681 None:intergenic 50.0%
TAACAGAAGGCTCCGCTTCA+TGG + Chr7:72287087-72287106 None:intergenic 50.0%
TCTTGCAGAGGCCAAACAGT+GGG - Chr7:72287907-72287926 MsG0780040037.01.T01:CDS 50.0%
TTCGAGAAGATCCACGTCTC+CGG - Chr7:72287726-72287745 MsG0780040037.01.T01:intron 50.0%
! ATGATTGGTTACTGCGCGGA+AGG - Chr7:72286737-72286756 MsG0780040037.01.T01:intron 50.0%
! ATGGGTCGTTGCCCATGTTT+TGG - Chr7:72284706-72284725 MsG0780040037.01.T01:CDS 50.0%
! TGGGTCGTTGCCCATGTTTT+GGG - Chr7:72284707-72284726 MsG0780040037.01.T01:CDS 50.0%
!! GACACATGCGTGCCATTTCA+AGG + Chr7:72287706-72287725 None:intergenic 50.0%
AGATATAGCTGCAGGGCGAG+GGG + Chr7:72285941-72285960 None:intergenic 55.0%
CAGATATAGCTGCAGGGCGA+GGG + Chr7:72285942-72285961 None:intergenic 55.0%
CTATATCGCCTGCAGAAGGC+CGG + Chr7:72287748-72287767 None:intergenic 55.0%
CTCTTGCAGAGGCCAAACAG+TGG - Chr7:72287906-72287925 MsG0780040037.01.T01:CDS 55.0%
CTTGCAGAGGCCAAACAGTG+GGG - Chr7:72287908-72287927 MsG0780040037.01.T01:CDS 55.0%
TGGGCGTGCCTATACGCATT+AGG + Chr7:72287600-72287619 None:intergenic 55.0%
TTGCAGAGGCCAAACAGTGG+GGG - Chr7:72287909-72287928 MsG0780040037.01.T01:CDS 55.0%
ATAGCTGTAGGGGCCGCAAG+AGG - Chr7:72287046-72287065 MsG0780040037.01.T01:intron 60.0%
CCAAACAGTGGGGGGAGACA+TGG - Chr7:72287918-72287937 MsG0780040037.01.T01:CDS 60.0%
CCAGATATAGCTGCAGGGCG+AGG + Chr7:72285943-72285962 None:intergenic 60.0%
CCATGTCTCCCCCCACTGTT+TGG + Chr7:72287921-72287940 None:intergenic 60.0%
CCTCGCCCTGCAGCTATATC+TGG - Chr7:72285940-72285959 MsG0780040037.01.T01:CDS 60.0%
CGTCGTGCTCCATCTCTCCT+GGG + Chr7:72287832-72287851 None:intergenic 60.0%
TCGTCGTGCTCCATCTCTCC+TGG + Chr7:72287833-72287852 None:intergenic 60.0%
TGCAGAGGCCAAACAGTGGG+GGG - Chr7:72287910-72287929 MsG0780040037.01.T01:CDS 60.0%
CCACGTCTCCGGCCTTCTGC+AGG - Chr7:72287737-72287756 MsG0780040037.01.T01:intron 70.0%
CCTGCAGAAGGCCGGAGACG+TGG + Chr7:72287740-72287759 None:intergenic 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 72284706 72287997 72284706 ID=MsG0780040037.01;Name=MsG0780040037.01
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Chr7 exon 72287843 72287997 72287843 ID=MsG0780040037.01.T01:exon:12774;Parent=MsG0780040037.01.T01
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Chr7 exon 72285882 72286062 72285882 ID=MsG0780040037.01.T01:exon:12772;Parent=MsG0780040037.01.T01
Chr7 exon 72285316 72285704 72285316 ID=MsG0780040037.01.T01:exon:12771;Parent=MsG0780040037.01.T01
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Gene Sequence

>MsG0780040037.01.T01

ATGGGTCGTTGCCCATGTTTTGGGTCTAGAAAGAAGGGAAAAGGGAAGAACCTCAATGATCAGGAAGATGAAAAGAACCTTAAATCTGTTGCGAGTACTGTTTCTGTTTCTGGAAGATCTTTAGGTACATTTTTCAGAATATGTTTAATTATTATAGAACTTGCGACGGCAACAAAGAATTTTAGGGATGAAAACTTTATTGGCCAAGGTGGATTTGGAACTGTTTACAAAGGAAAACTAGATAGAACTAGTCAGCTGTTAAAAGACTTGATAAACACTGGTTTCCAAGGTGAGAAGAATTTTAGTGAGGTGCTCATGCTCTCTCTTCTACACCATCCCAACCTTGTTAGTATGATTGGTTACTGCGCGGAAGGAGATCAACGACTTCTTGTCTATGAATACATGCCTATGGGATCCTTAGAATCTCATCTCCATGATCTTTTGCCAGATAATGAACCACTTGATTGGAATACAAGAATGAGGATAGCTGTAGGGGCCGCAAGAGGACTAAATTATCTTCACCATGAAGCGGAGCCTTCTGTTATATATAGAGATTTGAAGTCATCCAACATATTATTGGATGAAGGATTCTATCCAAAGCTTTCTGATTTTGGCCTTGCGAAATTCGGTCCAACTGGAGATCAATCATACGTTGCTACTAGAGTCATGGGAACACATGGTTATTGCGCACCTGAGTATGCAACTACTGGAAAATTAACAATGAGATCTGACATCTATAGTTTTGGAGTTGTGTTATTGGAGCTAATTACTGGACGTAGAGCGTATGATGAAACTCGTGCCCATGACAAGCATCTTGTTGATTGGGCACGCCCATTGTTCAGAGACAAAAGGAATTTTCCGAAATTAGTAGACCCACATTTGCAAGGTCACTACCCTATATCAGGTCTAAGGATGGCCCTTGAAATGGCACGCATGTGTCTTCGAGAAGATCCACGTCTCCGGCCTTCTGCAGGCGATATAGTACTCGCCCTAGATTACTTGTCATCCAAGAAATATGTTCCAAAAGCATCCGAAATAGTTAGCCCAGGAGAGATGGAGCACGACGAATCCCCCAATGAAACAACATTGATTTTGGCTAAAGACTCACTAAGAGAGCAAGCTCTTGCAGAGGCCAAACAGTGGGGGGAGACATGGAGAGAAAAGAGAAAACAAAGTGGCCAAAATAGTCCTGAGGAAATAATAAGGAGGTAA
Protein sequence

>MsG0780040037.01.T01

MGRCPCFGSRKKGKGKNLNDQEDEKNLKSVASTVSVSGRSLGTFFRICLIIIELATATKNFRDENFIGQGGFGTVYKGKLDRTSQLLKDLINTGFQGEKNFSEVLMLSLLHHPNLVSMIGYCAEGDQRLLVYEYMPMGSLESHLHDLLPDNEPLDWNTRMRIAVGAARGLNYLHHEAEPSVIYRDLKSSNILLDEGFYPKLSDFGLAKFGPTGDQSYVATRVMGTHGYCAPEYATTGKLTMRSDIYSFGVVLLELITGRRAYDETRAHDKHLVDWARPLFRDKRNFPKLVDPHLQGHYPISGLRMALEMARMCLREDPRLRPSAGDIVLALDYLSSKKYVPKASEIVSPGEMEHDESPNETTLILAKDSLREQALAEAKQWGETWREKRKQSGQNSPEEIIRR*