AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880044561.01

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MsG0880044561.01.T01 AT1G31420 31.224 474 288 8 316 766 76 534 4.64e-59 212
MsG0880044561.01.T01 AT1G31420 37.273 110 69 0 271 380 79 188 4.75e-14 76.3
MsG0880044561.01.T01 AT1G31420 32.692 156 95 6 7 155 54 206 1.38e-12 71.6
MsG0880044561.01.T01 AT2G23950 34.597 422 264 7 323 740 83 496 1.25e-58 211
MsG0880044561.01.T01 AT2G23950 38.318 107 66 0 201 307 81 187 1.40e-11 68.6
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MsG0880044561.01.T01 AT3G25560 31.667 120 78 2 29 145 86 204 9.29e-11 65.9
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MsG0880044561.01.T01 AT2G13800 38.053 113 69 1 291 403 71 182 2.84e-11 67.4
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MsG0880044561.01.T01 AT5G63710 32.195 410 266 5 338 743 92 493 2.54e-51 190
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MsG0880044561.01.T01 AT2G35620 29.622 476 294 8 316 767 75 533 2.83e-50 187
MsG0880044561.01.T01 AT2G35620 29.622 476 294 8 316 767 75 533 2.83e-50 187
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MsG0880044561.01.T01 AT1G56130 34.495 287 185 2 459 744 464 748 1.68e-47 182
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MsG0880044561.01.T01 AT1G56130 28.019 207 147 1 221 427 4 208 2.69e-16 84.0
MsG0880044561.01.T01 AT3G45420 36.042 283 173 5 496 775 307 584 3.09e-47 179
MsG0880044561.01.T01 AT1G56130 34.495 287 185 2 459 744 612 896 3.26e-47 182
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MsG0880044561.01.T01 AT2G18470 37.553 237 147 1 531 766 272 508 2.12e-45 173
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MsG0880044561.01.T01 AT2G04300 32.308 390 237 6 358 739 411 781 4.35e-45 175
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MsG0880044561.01.T01 AT1G68690 37.021 235 147 1 531 764 365 599 4.68e-45 173
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MsG0880044561.01.T01 AT3G45430 34.936 312 193 6 467 775 274 578 7.26e-45 172
MsG0880044561.01.T01 AT2G01820 36.131 274 167 4 531 797 573 845 7.59e-45 174
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MsG0880044561.01.T01 AT1G51820 32.115 383 228 9 388 743 142 519 8.18e-45 171
MsG0880044561.01.T01 AT1G24030 41.667 216 119 4 535 743 54 269 9.10e-45 163
MsG0880044561.01.T01 AT5G55830 33.427 356 215 10 454 798 278 622 1.01e-44 172
MsG0880044561.01.T01 AT5G60320 35.082 305 184 7 499 800 308 601 1.18e-44 172
MsG0880044561.01.T01 AT1G49100 31.630 411 229 11 348 740 405 781 1.25e-44 174
MsG0880044561.01.T01 AT3G23750 41.870 246 134 5 536 772 571 816 1.66e-44 173
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MsG0880044561.01.T01 AT3G23750 31.092 238 158 5 192 427 61 294 1.63e-17 88.2
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MsG0880044561.01.T01 AT1G70130 33.439 314 195 6 467 772 260 567 2.00e-43 168
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MsG0880044561.01.T01 AT5G18500 39.111 225 134 1 522 743 145 369 2.68e-43 164
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MsG0880044561.01.T01 AT5G18500 39.111 225 134 1 522 743 145 369 2.68e-43 164
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MsG0880044561.01.T01 AT1G16130 32.660 297 190 4 513 805 386 676 3.31e-42 165
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MsG0880044561.01.T01 AT1G07560 31.455 426 251 13 356 772 406 799 3.59e-42 166
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MsG0880044561.01.T01 AT5G15730 35.688 269 143 7 516 773 90 339 3.73e-42 160
MsG0880044561.01.T01 AT4G04570 38.136 236 140 4 536 766 341 575 4.04e-42 164
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MsG0880044561.01.T01 AT4G23130 33.019 318 186 9 499 799 293 600 5.22e-42 164
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MsG0880044561.01.T01 AT2G14510 32.836 402 237 13 388 774 421 804 2.35e-41 163
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MsG0880044561.01.T01 AT4G21230 31.563 339 203 9 474 799 265 587 4.14e-41 160
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MsG0880044561.01.T01 AT2G43690 33.333 303 188 6 464 755 257 556 8.84e-41 160
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MsG0880044561.01.T01 AT1G21240 35.102 245 155 2 536 776 408 652 9.23e-41 160
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MsG0880044561.01.T01 AT1G70740 32.847 274 179 3 495 765 4 275 1.18e-40 155
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MsG0880044561.01.T01 AT5G06740 32.209 326 196 9 490 797 270 588 1.42e-40 159
MsG0880044561.01.T01 AT4G29180 32.099 405 226 8 359 744 409 783 1.44e-40 161
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MsG0880044561.01.T01 AT4G23190 34.749 259 159 5 492 740 292 550 1.58e-40 159
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MsG0880044561.01.T01 AT4G21380 37.559 213 130 2 531 740 514 726 6.00e-40 159
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MsG0880044561.01.T01 AT4G21400 33.333 309 177 7 497 787 302 599 8.42e-40 157
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MsG0880044561.01.T01 AT3G13690 38.532 218 132 2 528 743 396 613 1.81e-39 157
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MsG0880044561.01.T01 AT2G30740 33.858 254 156 5 531 772 59 312 2.14e-39 150
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MsG0880044561.01.T01 AT1G61440 40.488 205 119 2 539 740 474 678 3.35e-39 156
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MsG0880044561.01.T01 AT1G29730 33.813 278 155 5 518 784 611 870 4.44e-39 157
MsG0880044561.01.T01 AT1G29730 32.035 231 154 2 198 427 102 330 1.13e-20 98.2
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MsG0880044561.01.T01 AT1G29730 29.153 295 171 8 35 327 112 370 9.87e-14 75.9
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MsG0880044561.01.T01 AT1G79620 27.988 343 186 10 18 352 94 383 2.56e-20 97.1
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MsG0880044561.01.T01 AT4G00960 38.049 205 122 2 539 738 52 256 4.63e-39 146
MsG0880044561.01.T01 AT1G66910 35.135 259 153 6 493 739 289 544 4.80e-39 155
MsG0880044561.01.T01 AT4G11890 40.488 205 117 3 539 740 36 238 5.10e-39 149
MsG0880044561.01.T01 AT5G11020 34.799 273 163 4 516 775 76 346 5.20e-39 150
MsG0880044561.01.T01 AT1G79620 38.009 221 135 2 525 743 646 866 5.23e-39 156
MsG0880044561.01.T01 AT1G79620 32.308 260 153 6 173 428 99 339 4.05e-22 103
MsG0880044561.01.T01 AT1G79620 27.988 343 186 10 18 352 94 383 2.48e-20 97.4
MsG0880044561.01.T01 AT1G79620 29.508 183 121 3 263 437 70 252 4.29e-11 67.4
MsG0880044561.01.T01 AT1G51890 28.169 426 253 11 366 772 138 529 5.39e-39 154
MsG0880044561.01.T01 AT5G11020 34.799 273 163 4 516 775 114 384 5.64e-39 150
MsG0880044561.01.T01 AT5G02800 40.367 218 125 3 531 743 61 278 5.78e-39 149
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MsG0880044561.01.T01 AT1G66910 35.135 259 153 6 493 739 292 547 6.07e-39 154
MsG0880044561.01.T01 AT5G58940 38.991 218 128 3 531 743 135 352 6.25e-39 151
MsG0880044561.01.T01 AT5G58940 38.991 218 128 3 531 743 135 352 6.25e-39 151
MsG0880044561.01.T01 AT5G58940 38.991 218 128 3 531 743 135 352 6.25e-39 151
MsG0880044561.01.T01 AT5G58940 38.991 218 128 3 531 743 135 352 6.25e-39 151
MsG0880044561.01.T01 AT1G61610 38.028 213 129 2 531 740 513 725 6.41e-39 155
MsG0880044561.01.T01 AT1G66930 35.341 249 155 4 496 740 510 756 6.43e-39 156
MsG0880044561.01.T01 AT5G11020 34.799 273 163 4 516 775 80 350 7.02e-39 149
MsG0880044561.01.T01 AT5G54590 40.758 211 120 3 532 741 104 310 7.74e-39 150
MsG0880044561.01.T01 AT5G54590 40.758 211 120 3 532 741 104 310 7.74e-39 150
MsG0880044561.01.T01 AT5G54590 40.758 211 120 3 532 741 104 310 7.74e-39 150
MsG0880044561.01.T01 AT4G23180 33.884 242 157 2 502 740 307 548 7.89e-39 154
MsG0880044561.01.T01 AT1G11300 34.247 292 171 8 494 766 429 718 7.94e-39 155
MsG0880044561.01.T01 AT1G29730 35.458 251 148 5 518 757 611 858 8.33e-39 155
MsG0880044561.01.T01 AT1G29730 32.035 231 154 2 198 427 102 330 1.37e-20 98.2
MsG0880044561.01.T01 AT1G29730 28.803 309 181 8 115 420 95 367 2.84e-19 93.6
MsG0880044561.01.T01 AT1G29730 31.844 179 117 1 255 428 82 260 5.57e-17 86.3
MsG0880044561.01.T01 AT1G29730 29.153 295 171 8 35 327 112 370 1.02e-13 75.9
MsG0880044561.01.T01 AT1G29730 28.270 237 158 7 34 266 135 363 3.09e-12 70.9
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MsG0880044561.01.T01 AT1G61490 40.488 205 119 2 539 740 486 690 8.73e-39 155
MsG0880044561.01.T01 AT1G61490 40.488 205 119 2 539 740 486 690 8.73e-39 155
MsG0880044561.01.T01 AT1G61490 40.488 205 119 2 539 740 486 690 8.73e-39 155
MsG0880044561.01.T01 AT1G61490 40.488 205 119 2 539 740 486 690 8.73e-39 155
MsG0880044561.01.T01 AT1G61490 40.488 205 119 2 539 740 460 664 8.87e-39 155
MsG0880044561.01.T01 AT1G61490 40.488 205 119 2 539 740 460 664 8.87e-39 155
MsG0880044561.01.T01 AT1G51860 28.972 428 258 11 366 773 271 672 9.05e-39 155
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MsG0880044561.01.T01 AT1G61420 34.221 263 161 4 490 740 284 546 1.01e-38 154
MsG0880044561.01.T01 AT3G25490 38.278 209 127 1 535 741 100 308 1.11e-38 150
MsG0880044561.01.T01 AT1G51860 28.972 428 258 11 366 773 415 816 1.20e-38 155
MsG0880044561.01.T01 AT1G29730 34.615 260 146 3 531 784 661 902 1.26e-38 155
MsG0880044561.01.T01 AT1G29730 32.035 231 154 2 198 427 102 330 9.75e-21 98.6
MsG0880044561.01.T01 AT1G29730 28.803 309 181 8 115 420 95 367 2.16e-19 94.4
MsG0880044561.01.T01 AT1G29730 31.844 179 117 1 255 428 82 260 8.42e-17 85.9
MsG0880044561.01.T01 AT1G29730 29.153 295 171 8 35 327 112 370 7.96e-14 76.3
MsG0880044561.01.T01 AT1G29730 28.270 237 158 7 34 266 135 363 1.60e-12 72.0

Find 162 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 423 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TAACACCAGTTATCATATTT+TGG 0.095463 8:-44420263 None:intergenic
AAAAGCGATGCTAAGGATTT+TGG 0.151328 8:-44420288 None:intergenic
GTTGCACATGTTAGCGATTT+TGG 0.157375 8:+44422013 MsG0880044561.01.T01:CDS
GAAGCATTGAATATGCTATT+TGG 0.213386 8:-44419412 None:intergenic
GGTGAATCTTTGCACAATTC+AGG 0.215982 8:-44423894 None:intergenic
TATATAATGCCTGAAGGTTT+TGG 0.216147 8:+44417747 None:intergenic
TCTAAGTTAGTCCAACAAAA+TGG 0.229803 8:+44423820 MsG0880044561.01.T01:CDS
GCTTTGTCAAATTGACAATT+TGG 0.244484 8:+44419864 MsG0880044561.01.T01:CDS
TTAAATATTCTAGACTTATC+AGG 0.252490 8:+44419598 MsG0880044561.01.T01:CDS
ATGCTAATGGAAATCTTTAC+AGG 0.253669 8:+44423703 MsG0880044561.01.T01:CDS
GTGAATGGGAATAATATAAA+TGG 0.261051 8:+44419754 MsG0880044561.01.T01:CDS
AAAACTTAATAAAAGGAAAA+TGG 0.263957 8:+44421496 MsG0880044561.01.T01:CDS
ACTCTACCCAACACCGCTTT+TGG 0.265677 8:+44419478 MsG0880044561.01.T01:CDS
AATGGTTAGCTTGTTCTCTT+TGG 0.283566 8:+44420233 MsG0880044561.01.T01:CDS
CTACGATACCTTCCTCTCTT+TGG 0.286132 8:+44419992 MsG0880044561.01.T01:CDS
TTGCTTGGAAGGGGAGGATT+TGG 0.294029 8:+44421620 MsG0880044561.01.T01:CDS
TAAAGATTTACATAAACTTC+AGG 0.298971 8:+44419795 MsG0880044561.01.T01:CDS
TGTGACGTCAAGTCTCTTAA+TGG 0.299194 8:+44417777 MsG0880044561.01.T01:CDS
TACTTGTAAAACTTAATAAA+AGG 0.303057 8:+44421489 MsG0880044561.01.T01:CDS
TCATAATAAGAAATTCTTCT+TGG 0.307547 8:-44421560 None:intergenic
ACCTGAAGAAAGAATTAATA+TGG 0.308075 8:+44423914 MsG0880044561.01.T01:CDS
TCCATATTAATTCTTTCTTC+AGG 0.310146 8:-44423915 None:intergenic
GTCAAGTCTCTTAATGGTTC+TGG 0.314464 8:+44417783 MsG0880044561.01.T01:CDS
AAAGGAGATGTATACAACTA+TGG 0.319773 8:+44423676 MsG0880044561.01.T01:CDS
TGATGACATGTTCATGAGTT+TGG 0.328751 8:-44419269 None:intergenic
TTCAATGCTTCTAATCTCAT+TGG 0.329341 8:+44419424 MsG0880044561.01.T01:CDS
CAACTATGGGATTATGCTAA+TGG 0.337329 8:+44423690 MsG0880044561.01.T01:CDS
TTTACATAAACTTCAGGGTT+TGG 0.338448 8:+44419801 MsG0880044561.01.T01:CDS
TGATCCATGTCTTTAAAGTT+AGG 0.340559 8:-44423759 None:intergenic
TTGCATTCCAATGCATTTAG+TGG 0.343102 8:+44419454 MsG0880044561.01.T01:CDS
TCCCACATCACTTGGTGAAA+TGG 0.347544 8:+44420215 MsG0880044561.01.T01:CDS
GAAAGAAGTTTATCAACTCT+TGG 0.349466 8:+44421533 MsG0880044561.01.T01:CDS
TTGATATATGATTTCTAGAT+AGG 0.352485 8:-44420113 None:intergenic
TCCGATTGACTTAGGAAGAT+TGG 0.359121 8:-44419635 None:intergenic
TGCTCTAAAATTTCCAATCT+CGG 0.362355 8:-44420076 None:intergenic
CATTCAAGTGTAGATATTGT+AGG 0.374175 8:-44419366 None:intergenic
CTAAGTTAGTCCAACAAAAT+GGG 0.382999 8:+44423821 MsG0880044561.01.T01:CDS
CTGGCACCGCCCCTGCCATC+AGG 0.390766 8:-44420360 None:intergenic
AAGACATCCATGATTGAATT+AGG 0.392852 8:-44423793 None:intergenic
TTGTCCCAAAATATGATAAC+TGG 0.393541 8:+44420258 MsG0880044561.01.T01:CDS
GGGAACGTTGGGAGCGGCAA+TGG 0.396987 8:-44417815 None:intergenic
CTGATGGCAGGGGCGGTGCC+AGG 0.399686 8:+44420361 MsG0880044561.01.T01:CDS
GGGCTCTAATACCATATGTT+GGG 0.407682 8:-44417845 None:intergenic
GCAGATTCATGTGGAATTGA+TGG 0.408069 8:+44419682 MsG0880044561.01.T01:CDS
AACCTCCTGACCCAGGGTCC+TGG 0.411410 8:+44421265 MsG0880044561.01.T01:intron
GGTAATCTTCCACCCGAGAT+TGG 0.415032 8:+44420063 MsG0880044561.01.T01:CDS
AGGATTTGGCTCTGTGTATG+AGG 0.415813 8:+44421634 MsG0880044561.01.T01:CDS
TAATTCAATCATGGATGTCT+TGG 0.419332 8:+44423795 MsG0880044561.01.T01:CDS
ATTACCAGTGAAAGCATTAG+AGG 0.422435 8:-44420046 None:intergenic
TTCAAGATAGCCAATCTCCT+TGG 0.422697 8:-44419194 None:intergenic
CATGTCATCATTGAAACAAA+TGG 0.428174 8:+44419282 MsG0880044561.01.T01:CDS
TGCAATGCATTGAGAAATCT+AGG 0.429804 8:+44421740 MsG0880044561.01.T01:CDS
CATCTCCACCCAAAACCTTC+AGG 0.429815 8:-44417756 None:intergenic
TATCACAGAGAGGGACTTGT+AGG 0.430390 8:-44421373 None:intergenic
AAATATTGATTTCAAAGCAT+TGG 0.431846 8:+44421799 MsG0880044561.01.T01:CDS
TGTCTTGTTAGACGAAGATA+TGG 0.432156 8:+44421991 MsG0880044561.01.T01:CDS
CAAATTTCTTAAGGAACTGA+TGG 0.433269 8:-44420151 None:intergenic
GGTTCGATACCCAAGGAGAT+TGG 0.441295 8:+44419184 MsG0880044561.01.T01:intron
GCTCTAAAATTTCCAATCTC+GGG 0.442749 8:-44420075 None:intergenic
TGTAAATCTTTAAATGTGCC+AGG 0.443140 8:-44419784 None:intergenic
AAATCTAGGACATCGAAATC+TGG 0.444366 8:+44421754 MsG0880044561.01.T01:CDS
GTTAAGTTTCCGATTGACTT+AGG 0.444763 8:-44419643 None:intergenic
TTAGCTCATAACAAATTGTA+TGG 0.446142 8:+44420186 MsG0880044561.01.T01:CDS
TCCAATCTTCCTAAGTCAAT+CGG 0.446597 8:+44419634 MsG0880044561.01.T01:CDS
TCAAGATAGCCAATCTCCTT+GGG 0.448636 8:-44419193 None:intergenic
TAAAACTCATACAGAGACTT+TGG 0.451638 8:+44422066 MsG0880044561.01.T01:CDS
AAAGATTTACATAAACTTCA+GGG 0.456902 8:+44419796 MsG0880044561.01.T01:CDS
GAGCTTGTGCAAGCAACAAA+TGG 0.459996 8:+44421581 MsG0880044561.01.T01:CDS
ATGAGAGTAATTTGCTTGGA+AGG 0.460524 8:+44421609 MsG0880044561.01.T01:CDS
AAAGGAATTGTTTCTATCAA+AGG 0.464798 8:+44423658 MsG0880044561.01.T01:CDS
GTTCATGAGTTTGGAAGGAA+TGG 0.465002 8:-44419260 None:intergenic
CATGTAGAGTATGGAGCTAA+AGG 0.466838 8:+44423640 MsG0880044561.01.T01:intron
GTAGATATTGTAGGCTAGGA+AGG 0.469802 8:-44419357 None:intergenic
TCCCTAGACTCCCCAACATA+TGG 0.470364 8:+44417834 MsG0880044561.01.T01:CDS
CTTAAGGAACTGATGGATGT+AGG 0.473421 8:-44420144 None:intergenic
GGAACGTTGGGAGCGGCAAT+GGG 0.474224 8:-44417814 None:intergenic
TACCATATGTTGGGGAGTCT+AGG 0.476258 8:-44417836 None:intergenic
CATCAGGCAGTGGCGTCTCC+AGG 0.476834 8:-44421283 None:intergenic
AGTAATTTGCTTGGAAGGGG+AGG 0.477318 8:+44421614 MsG0880044561.01.T01:CDS
ACCATATGTTGGGGAGTCTA+GGG 0.477768 8:-44417835 None:intergenic
GAGAGTAATTTGCTTGGAAG+GGG 0.480336 8:+44421611 MsG0880044561.01.T01:CDS
TCGTCTAACAAGACAATACT+AGG 0.483462 8:-44421983 None:intergenic
AAGGAGAGATTCCTGATGGC+AGG 0.484077 8:+44420349 MsG0880044561.01.T01:CDS
ACAGAGACTTTGGCTACTGT+TGG 0.484218 8:+44422076 MsG0880044561.01.T01:CDS
GTGAATCTTTGCACAATTCA+GGG 0.486078 8:-44423893 None:intergenic
AAACCTCCAAAAGCGGTGTT+GGG 0.490306 8:-44419484 None:intergenic
ACTACAAGGATCATTTGTTA+AGG 0.491182 8:+44419840 MsG0880044561.01.T01:CDS
AACATTGCCTAATTCAATCA+TGG 0.492393 8:+44423786 MsG0880044561.01.T01:CDS
GTTGTTTAAATTTCTTGCAA+AGG 0.494410 8:+44421876 MsG0880044561.01.T01:CDS
GAAACCTCCAAAAGCGGTGT+TGG 0.494489 8:-44419485 None:intergenic
TTGTCCTCTAATGCTTTCAC+TGG 0.495434 8:+44420042 MsG0880044561.01.T01:CDS
TGAGAGTAATTTGCTTGGAA+GGG 0.501534 8:+44421610 MsG0880044561.01.T01:CDS
GTGATGGAGTTCATGTCAAA+TGG 0.504721 8:+44421821 MsG0880044561.01.T01:CDS
GGTAATATTCCTCTAGAGGT+TGG 0.505186 8:+44419703 MsG0880044561.01.T01:CDS
AAGTGTAGATATTGTAGGCT+AGG 0.505669 8:-44419361 None:intergenic
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TGGGGAGTCTAGGGAACGTT+GGG 0.509490 8:-44417826 None:intergenic
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AACCATTTCACCAAGTGATG+TGG 0.543286 8:-44420217 None:intergenic
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GCTACAAACATATCATCTGT+TGG 0.546447 8:-44423733 None:intergenic
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CRISPR-GE

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! TTAACGAGGAAAAAAAAACA+TGG - Chr8:44422899-44422918 None:intergenic 25.0%
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! TTCAAATGGGAACAATATTA+AGG + Chr8:44423116-44423135 MsG0880044561.01.T01:intron 25.0%
! TTTAATTGGAAAACTTGAAG+GGG - Chr8:44417902-44417921 None:intergenic 25.0%
! TTTCCCTGATTAAAAAAATG+GGG + Chr8:44423016-44423035 MsG0880044561.01.T01:intron 25.0%
!! AACACCAGTTATCATATTTT+GGG - Chr8:44420265-44420284 None:intergenic 25.0%
!! AAGGAAGTATAATATGAGTT+GGG - Chr8:44422251-44422270 None:intergenic 25.0%
!! CAGATTTTGCAAATTTCTTA+AGG - Chr8:44420163-44420182 None:intergenic 25.0%
!! CATTTTAGATGGATGAAATT+CGG - Chr8:44422800-44422819 None:intergenic 25.0%
!! CTTAACTTTAGTACACTTTT+TGG + Chr8:44419660-44419679 MsG0880044561.01.T01:CDS 25.0%
!! TAACACCAGTTATCATATTT+TGG - Chr8:44420266-44420285 None:intergenic 25.0%
!! TACACCTTAATGATTTTAAG+TGG + Chr8:44423327-44423346 MsG0880044561.01.T01:intron 25.0%
!! TCTAAAACATGTAGATAAGT+TGG - Chr8:44422303-44422322 None:intergenic 25.0%
!! TGCATATAACACATTTTAGA+TGG - Chr8:44422811-44422830 None:intergenic 25.0%
!! TTGAATGACAACAATTTTGT+TGG + Chr8:44419382-44419401 MsG0880044561.01.T01:CDS 25.0%
!!! AAAGGAATTGTTTCTATCAA+AGG + Chr8:44423658-44423677 MsG0880044561.01.T01:CDS 25.0%
!!! ACACCTTAATGATTTTAAGT+GGG + Chr8:44423328-44423347 MsG0880044561.01.T01:intron 25.0%
!!! ACTTAGTGTTTTTTAGTACA+AGG + Chr8:44423173-44423192 MsG0880044561.01.T01:intron 25.0%
!!! ATACAATTTGTTATGAGCTA+AGG - Chr8:44420187-44420206 None:intergenic 25.0%
!!! CTTTTTAGGAAACATTGTTT+TGG + Chr8:44423205-44423224 MsG0880044561.01.T01:intron 25.0%
!!! GAGAGAAGTTTTTTTTTTAG+AGG - Chr8:44420538-44420557 None:intergenic 25.0%
!!! TAAAGTGATTGATTTGAACT+CGG + Chr8:44421688-44421707 MsG0880044561.01.T01:CDS 25.0%
!!! TCTGACCTTTTTTTAAAATC+TGG + Chr8:44418642-44418661 MsG0880044561.01.T01:intron 25.0%
!!! TCTGTATGAAAATTGTTTTG+AGG - Chr8:44419516-44419535 None:intergenic 25.0%
!!! TGTTGGTTTGTTTTCTTTTT+GGG + Chr8:44420964-44420983 MsG0880044561.01.T01:intron 25.0%
!!! TTTAATGAGAGTAATTTGCT+TGG + Chr8:44421605-44421624 MsG0880044561.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTCTGTTATTTTGTTGTCT+AGG + Chr8:44420880-44420899 MsG0880044561.01.T01:intron 25.0%
AAAAAGCTTCATGTGGTTTA+TGG - Chr8:44422950-44422969 None:intergenic 30.0%
AAAAATGATTGACACGAGTA+TGG - Chr8:44421453-44421472 None:intergenic 30.0%
AAAAGCTTCATGTGGTTTAT+GGG - Chr8:44422949-44422968 None:intergenic 30.0%
AAAATGATTGACACGAGTAT+GGG - Chr8:44421452-44421471 None:intergenic 30.0%
AAAGAGATAAAGAAACTACC+TGG - Chr8:44422112-44422131 None:intergenic 30.0%
AAAGGAGATGTATACAACTA+TGG + Chr8:44423676-44423695 MsG0880044561.01.T01:CDS 30.0%
AACATTGCCTAATTCAATCA+TGG + Chr8:44423786-44423805 MsG0880044561.01.T01:CDS 30.0%
AAGACATCCATGATTGAATT+AGG - Chr8:44423796-44423815 None:intergenic 30.0%
AAGGAGATGTATACAACTAT+GGG + Chr8:44423677-44423696 MsG0880044561.01.T01:CDS 30.0%
AATGTACTCAAAAAACTCCA+AGG - Chr8:44421141-44421160 None:intergenic 30.0%
AATTGCGAAAACGACTTAAA+AGG + Chr8:44422657-44422676 MsG0880044561.01.T01:intron 30.0%
ACACCCACTTAAAATCATTA+AGG - Chr8:44423334-44423353 None:intergenic 30.0%
AGTGAAGTGAAAATTGGAAA+AGG + Chr8:44423092-44423111 MsG0880044561.01.T01:intron 30.0%
ATGCTAATGGAAATCTTTAC+AGG + Chr8:44423703-44423722 MsG0880044561.01.T01:CDS 30.0%
ATTGCATGAGCATAACAATT+TGG + Chr8:44420772-44420791 MsG0880044561.01.T01:intron 30.0%
CAAATTTCTTAAGGAACTGA+TGG - Chr8:44420154-44420173 None:intergenic 30.0%
CACAATTGACAAAATATAGG+GGG + Chr8:44418789-44418808 MsG0880044561.01.T01:intron 30.0%
CATGTCATCATTGAAACAAA+TGG + Chr8:44419282-44419301 MsG0880044561.01.T01:CDS 30.0%
CATTCAAGTGTAGATATTGT+AGG - Chr8:44419369-44419388 None:intergenic 30.0%
CGCACAATTGACAAAATATA+GGG + Chr8:44418787-44418806 MsG0880044561.01.T01:intron 30.0%
CTAAACTAAAGGAAACAAGT+AGG - Chr8:44422528-44422547 None:intergenic 30.0%
CTAAGTTAGTCCAACAAAAT+GGG + Chr8:44423821-44423840 MsG0880044561.01.T01:CDS 30.0%
GAAAGAAGTTTATCAACTCT+TGG + Chr8:44421533-44421552 MsG0880044561.01.T01:CDS 30.0%
GCACAATTGACAAAATATAG+GGG + Chr8:44418788-44418807 MsG0880044561.01.T01:intron 30.0%
GCTTTGTCAAATTGACAATT+TGG + Chr8:44419864-44419883 MsG0880044561.01.T01:CDS 30.0%
GTTGGAAAAATCAAATCACT+TGG - Chr8:44422166-44422185 None:intergenic 30.0%
TAAAACTCATACAGAGACTT+TGG + Chr8:44422066-44422085 MsG0880044561.01.T01:CDS 30.0%
TAAGTTAGTCCAACAAAATG+GGG + Chr8:44423822-44423841 MsG0880044561.01.T01:CDS 30.0%
TAATTCAATCATGGATGTCT+TGG + Chr8:44423795-44423814 MsG0880044561.01.T01:CDS 30.0%
TCATGTAACGTTAAATAAGC+CGG - Chr8:44422693-44422712 None:intergenic 30.0%
TCGCACAATTGACAAAATAT+AGG + Chr8:44418786-44418805 MsG0880044561.01.T01:intron 30.0%
TCTAAGTTAGTCCAACAAAA+TGG + Chr8:44423820-44423839 MsG0880044561.01.T01:CDS 30.0%
TGATGTTCATAGTAAACTAG+TGG - Chr8:44419133-44419152 None:intergenic 30.0%
TGGTGGGAAAAAAAATACAA+GGG - Chr8:44421041-44421060 None:intergenic 30.0%
TGTAAATCTTTAAATGTGCC+AGG - Chr8:44419787-44419806 None:intergenic 30.0%
TTCAATGCTTCTAATCTCAT+TGG + Chr8:44419424-44419443 MsG0880044561.01.T01:CDS 30.0%
TTGTCCCAAAATATGATAAC+TGG + Chr8:44420258-44420277 MsG0880044561.01.T01:CDS 30.0%
TTTACATAAACTTCAGGGTT+TGG + Chr8:44419801-44419820 MsG0880044561.01.T01:CDS 30.0%
! ACTACAAGGATCATTTGTTA+AGG + Chr8:44419840-44419859 MsG0880044561.01.T01:CDS 30.0%
! AGTTGCATGTCATCTATTTT+TGG + Chr8:44423865-44423884 MsG0880044561.01.T01:CDS 30.0%
! ATGAAGGCCTTCTAAAAATT+TGG + Chr8:44423058-44423077 MsG0880044561.01.T01:intron 30.0%
! CAAGGAAGTATAATATGAGT+TGG - Chr8:44422252-44422271 None:intergenic 30.0%
! CTACTTGTTTCCTTTAGTTT+AGG + Chr8:44422526-44422545 MsG0880044561.01.T01:intron 30.0%
! GTTTAGCTCAGTATCTTTAT+TGG + Chr8:44420939-44420958 MsG0880044561.01.T01:intron 30.0%
! TACAACACCTTAGTGTTTTT+AGG + Chr8:44423391-44423410 MsG0880044561.01.T01:intron 30.0%
! TCAGCTGTGAAATTTTTGAA+AGG - Chr8:44421314-44421333 None:intergenic 30.0%
! TGCTATCTTTTTCTGTGAAT+GGG + Chr8:44419740-44419759 MsG0880044561.01.T01:CDS 30.0%
! TTCAAGATGCAAAAAGCATA+GGG - Chr8:44420442-44420461 None:intergenic 30.0%
! TTGCTATCTTTTTCTGTGAA+TGG + Chr8:44419739-44419758 MsG0880044561.01.T01:CDS 30.0%
!! CTTAAAAGGTCAATTTTAGC+CGG + Chr8:44422671-44422690 MsG0880044561.01.T01:intron 30.0%
!! GAAGCATTGAATATGCTATT+TGG - Chr8:44419415-44419434 None:intergenic 30.0%
!! TGATCCATGTCTTTAAAGTT+AGG - Chr8:44423762-44423781 None:intergenic 30.0%
!! TGCTCTAAAATTTCCAATCT+CGG - Chr8:44420079-44420098 None:intergenic 30.0%
!! TTGCATAATGAAGCACTTTT+TGG + Chr8:44421341-44421360 MsG0880044561.01.T01:CDS 30.0%
!!! AATAAATTTTTAGGGTTGGC+AGG - Chr8:44420405-44420424 None:intergenic 30.0%
!!! ACACATTAGTGTTTTTAGGT+GGG - Chr8:44422739-44422758 None:intergenic 30.0%
!!! AGGTTATATCCTGTTTTTGA+TGG - Chr8:44419340-44419359 None:intergenic 30.0%
!!! ATTCAAGCATTGTTTTAACG+AGG - Chr8:44422913-44422932 None:intergenic 30.0%
!!! GAAACATTGTTTTGGAAAGA+TGG + Chr8:44423213-44423232 MsG0880044561.01.T01:intron 30.0%
!!! GTGTTGGTTTGTTTTCTTTT+TGG + Chr8:44420963-44420982 MsG0880044561.01.T01:intron 30.0%
!!! TACACATTAGTGTTTTTAGG+TGG - Chr8:44422740-44422759 None:intergenic 30.0%
!!! TAGTGTTTTTTAGTACAAGG+CGG + Chr8:44423176-44423195 MsG0880044561.01.T01:intron 30.0%
AAGATACAAAAGCGATGCTA+AGG - Chr8:44420298-44420317 None:intergenic 35.0%
AAGTGTAGATATTGTAGGCT+AGG - Chr8:44419364-44419383 None:intergenic 35.0%
AAGTTAGTCCAACAAAATGG+GGG + Chr8:44423823-44423842 MsG0880044561.01.T01:CDS 35.0%
ACAATTGGCAAAATATAGGG+TGG - Chr8:44418032-44418051 None:intergenic 35.0%
ATCGAACCTGAAAATGCATA+AGG - Chr8:44419172-44419191 None:intergenic 35.0%
ATGGAAGAAAAAGCTTCATG+TGG - Chr8:44422957-44422976 None:intergenic 35.0%
CAACTATGGGATTATGCTAA+TGG + Chr8:44423690-44423709 MsG0880044561.01.T01:CDS 35.0%
CACAATTGGCAAAATATAGG+GGG - Chr8:44418033-44418052 None:intergenic 35.0%
CAGTATCTTTATTGGTGTGT+TGG + Chr8:44420947-44420966 MsG0880044561.01.T01:intron 35.0%
CGCACAATTGGCAAAATATA+GGG - Chr8:44418035-44418054 None:intergenic 35.0%
CTGGTGGGAAAAAAAATACA+AGG - Chr8:44421042-44421061 None:intergenic 35.0%
GAGTTTACTTCTTATGTCCT+TGG + Chr8:44420813-44420832 MsG0880044561.01.T01:intron 35.0%
GCACAATTGGCAAAATATAG+GGG - Chr8:44418034-44418053 None:intergenic 35.0%
GCTACAAACATATCATCTGT+TGG - Chr8:44423736-44423755 None:intergenic 35.0%
GGCATTATTCCATCAAAAAC+AGG + Chr8:44419328-44419347 MsG0880044561.01.T01:CDS 35.0%
GGGAACAATATTAAGGGAAT+GGG + Chr8:44423123-44423142 MsG0880044561.01.T01:intron 35.0%
GGTGGGAAAAAAAATACAAG+GGG - Chr8:44421040-44421059 None:intergenic 35.0%
GGTTTGGATCTTAGAAACAA+TGG + Chr8:44419817-44419836 MsG0880044561.01.T01:CDS 35.0%
GTAAATAATCAAGTGGGTGT+AGG + Chr8:44423295-44423314 MsG0880044561.01.T01:intron 35.0%
GTGAATCTTTGCACAATTCA+GGG - Chr8:44423896-44423915 None:intergenic 35.0%
GTTTGAGCAAAATAACCTCT+CGG + Chr8:44419306-44419325 MsG0880044561.01.T01:CDS 35.0%
TAGAGTTCCACTAAATGCAT+TGG - Chr8:44419464-44419483 None:intergenic 35.0%
TCCAATCTTCCTAAGTCAAT+CGG + Chr8:44419634-44419653 MsG0880044561.01.T01:CDS 35.0%
TCGCACAATTGGCAAAATAT+AGG - Chr8:44418036-44418055 None:intergenic 35.0%
TCGTCTAACAAGACAATACT+AGG - Chr8:44421986-44422005 None:intergenic 35.0%
TGATGACATGTTCATGAGTT+TGG - Chr8:44419272-44419291 None:intergenic 35.0%
TGATGGTAATATTCCTCTAG+AGG + Chr8:44419699-44419718 MsG0880044561.01.T01:CDS 35.0%
TGGGAACAATATTAAGGGAA+TGG + Chr8:44423122-44423141 MsG0880044561.01.T01:intron 35.0%
TTAGCAGAAAATAGCTTCAG+TGG + Chr8:44419235-44419254 MsG0880044561.01.T01:CDS 35.0%
TTGCATTCCAATGCATTTAG+TGG + Chr8:44419454-44419473 MsG0880044561.01.T01:CDS 35.0%
TTTGAGCAAAATAACCTCTC+GGG + Chr8:44419307-44419326 MsG0880044561.01.T01:CDS 35.0%
TTTGGGTGCAAAATCAGAAA+GGG - Chr8:44418140-44418159 None:intergenic 35.0%
! AAAAGCGATGCTAAGGATTT+TGG - Chr8:44420291-44420310 None:intergenic 35.0%
! AAATCGCTCGTTTGAAACAA+TGG + Chr8:44418754-44418773 MsG0880044561.01.T01:intron 35.0%
! AAATCGCTCGTTTGAAACAA+TGG - Chr8:44418773-44418754 None:intergenic 35.0%
! AAATCTAGGACATCGAAATC+TGG + Chr8:44421754-44421773 MsG0880044561.01.T01:CDS 35.0%
! AATCGCTCGTTTGAAACAAT+GGG + Chr8:44418755-44418774 MsG0880044561.01.T01:intron 35.0%
! AATCGCTCGTTTGAAACAAT+GGG - Chr8:44418774-44418755 None:intergenic 35.0%
! CAAATGGAAGTGTGGAAAAA+TGG + Chr8:44421837-44421856 MsG0880044561.01.T01:CDS 35.0%
! CAGACCTAACTTTAAAGACA+TGG + Chr8:44423755-44423774 MsG0880044561.01.T01:CDS 35.0%
! GAAAAATCACTGAGCTTTGA+TGG + Chr8:44421713-44421732 MsG0880044561.01.T01:CDS 35.0%
! GGCTTTTAGTGAAAAACAAG+TGG - Chr8:44422779-44422798 None:intergenic 35.0%
! GGTGTTTTACCAACATGTTT+GGG + Chr8:44419919-44419938 MsG0880044561.01.T01:CDS 35.0%
! GTTAAGTTTCCGATTGACTT+AGG - Chr8:44419646-44419665 None:intergenic 35.0%
! GTTCAAGATGCAAAAAGCAT+AGG - Chr8:44420443-44420462 None:intergenic 35.0%
! TCAAGATGCAAAAAGCATAG+GGG - Chr8:44420441-44420460 None:intergenic 35.0%
! TGGTGTTTTACCAACATGTT+TGG + Chr8:44419918-44419937 MsG0880044561.01.T01:CDS 35.0%
! TGTCTTGTTAGACGAAGATA+TGG + Chr8:44421991-44422010 MsG0880044561.01.T01:CDS 35.0%
!! AATGGTTAGCTTGTTCTCTT+TGG + Chr8:44420233-44420252 MsG0880044561.01.T01:CDS 35.0%
!! ATGAGAGTAATTTGCTTGGA+AGG + Chr8:44421609-44421628 MsG0880044561.01.T01:CDS 35.0%
!! ATTACCAGTGAAAGCATTAG+AGG - Chr8:44420049-44420068 None:intergenic 35.0%
!! CATGTAGATAAGTTGGTTTG+AGG - Chr8:44422296-44422315 None:intergenic 35.0%
!! CTTAGAAACAATGGACTACA+AGG + Chr8:44419826-44419845 MsG0880044561.01.T01:CDS 35.0%
!! GCTCTAAAATTTCCAATCTC+GGG - Chr8:44420078-44420097 None:intergenic 35.0%
!! TACTAGGCTTTAGATCACAA+TGG - Chr8:44421970-44421989 None:intergenic 35.0%
!! TAGATAAGTTGGTTTGAGGT+CGG - Chr8:44422292-44422311 None:intergenic 35.0%
!! TAGCTTGTTTATCACAGAGA+GGG - Chr8:44421385-44421404 None:intergenic 35.0%
!! TGAGAGTAATTTGCTTGGAA+GGG + Chr8:44421610-44421629 MsG0880044561.01.T01:CDS 35.0%
!! TGATTTCAAAGCATTGGTGA+TGG + Chr8:44421805-44421824 MsG0880044561.01.T01:CDS 35.0%
!! TTAGCTTGTTTATCACAGAG+AGG - Chr8:44421386-44421405 None:intergenic 35.0%
!! TTTTGGGTGCAAAATCAGAA+AGG - Chr8:44418141-44418160 None:intergenic 35.0%
!!! AACACCTTAGTGTTTTTAGG+TGG + Chr8:44423394-44423413 MsG0880044561.01.T01:intron 35.0%
!!! AATTTGGTGCTGCTTTTCAT+TGG + Chr8:44420788-44420807 MsG0880044561.01.T01:intron 35.0%
!!! ACACCTTAGTGTTTTTAGGT+GGG + Chr8:44423395-44423414 MsG0880044561.01.T01:intron 35.0%
!!! AGTGTTTTTTAGTACAAGGC+GGG + Chr8:44423177-44423196 MsG0880044561.01.T01:intron 35.0%
!!! CGACCCCATTTTTTTAATCA+GGG - Chr8:44423022-44423041 None:intergenic 35.0%
!!! TGGTTTGTTTTCTTTTTGGG+TGG + Chr8:44420967-44420986 MsG0880044561.01.T01:intron 35.0%
!!! TGTTTTGGAAAGATGGAAGT+GGG + Chr8:44423220-44423239 MsG0880044561.01.T01:intron 35.0%
!!! TTCTTTTTGGGTGGTTTTGA+GGG + Chr8:44420976-44420995 MsG0880044561.01.T01:intron 35.0%
!!! TTGTTTTGGAAAGATGGAAG+TGG + Chr8:44423219-44423238 MsG0880044561.01.T01:intron 35.0%
!!! TTTCTTTTTGGGTGGTTTTG+AGG + Chr8:44420975-44420994 MsG0880044561.01.T01:intron 35.0%
AAAAAATGGGGTCGCTAGTT+CGG + Chr8:44423028-44423047 MsG0880044561.01.T01:intron 40.0%
AACCATTTCACCAAGTGATG+TGG - Chr8:44420220-44420239 None:intergenic 40.0%
ACACCCACCTAAAAACACTA+AGG - Chr8:44422752-44422733 None:intergenic 40.0%
ACCATTTCACCAAGTGATGT+GGG - Chr8:44420219-44420238 None:intergenic 40.0%
AGTTAGTCCAACAAAATGGG+GGG + Chr8:44423824-44423843 MsG0880044561.01.T01:CDS 40.0%
AGTTGAGTGAAGTGAGAGTT+TGG - Chr8:44420503-44420522 None:intergenic 40.0%
ATCAGAAAGGGGGAAAACTA+TGG - Chr8:44418128-44418147 None:intergenic 40.0%
CAGGGAAAAATACTCTTCAG+TGG - Chr8:44423004-44423023 None:intergenic 40.0%
CATGTAGAGTATGGAGCTAA+AGG + Chr8:44423640-44423659 MsG0880044561.01.T01:intron 40.0%
CTAAAATTTCCAATCTCGGG+TGG - Chr8:44420075-44420094 None:intergenic 40.0%
CTTTAGATCACAATGGACCA+CGG - Chr8:44421963-44421982 None:intergenic 40.0%
GAACCTGAAAATGCATAAGG+AGG - Chr8:44419169-44419188 None:intergenic 40.0%
GAAGTGGGTGTAAATTAGTG+AGG + Chr8:44423235-44423254 MsG0880044561.01.T01:intron 40.0%
GACATGTTCATGAGTTTGGA+AGG - Chr8:44419268-44419287 None:intergenic 40.0%
GCAGATTCATGTGGAATTGA+TGG + Chr8:44419682-44419701 MsG0880044561.01.T01:CDS 40.0%
GGTGAATCTTTGCACAATTC+AGG - Chr8:44423897-44423916 None:intergenic 40.0%
GTAGATATTGTAGGCTAGGA+AGG - Chr8:44419360-44419379 None:intergenic 40.0%
GTCAAGTCTCTTAATGGTTC+TGG + Chr8:44417783-44417802 MsG0880044561.01.T01:CDS 40.0%
GTCATGTTTCCCAAACATGT+TGG - Chr8:44419931-44419950 None:intergenic 40.0%
GTTCATGAGTTTGGAAGGAA+TGG - Chr8:44419263-44419282 None:intergenic 40.0%
GTTCATGTCAAATGGAAGTG+TGG + Chr8:44421829-44421848 MsG0880044561.01.T01:CDS 40.0%
GTTGAGTGAAGTGAGAGTTT+GGG - Chr8:44420502-44420521 None:intergenic 40.0%
TCAAGATAGCCAATCTCCTT+GGG - Chr8:44419196-44419215 None:intergenic 40.0%
TCAGAAAGGGGGAAAACTAT+GGG - Chr8:44418127-44418146 None:intergenic 40.0%
TGGGTGTAAATTAGTGAGGT+GGG + Chr8:44423239-44423258 MsG0880044561.01.T01:intron 40.0%
TGTGACGTCAAGTCTCTTAA+TGG + Chr8:44417777-44417796 MsG0880044561.01.T01:CDS 40.0%
TTCAAGATAGCCAATCTCCT+TGG - Chr8:44419197-44419216 None:intergenic 40.0%
TTGGGTGCAAAATCAGAAAG+GGG - Chr8:44418139-44418158 None:intergenic 40.0%
TTGTCCTCTAATGCTTTCAC+TGG + Chr8:44420042-44420061 MsG0880044561.01.T01:CDS 40.0%
TTTAGATCACAATGGACCAC+GGG - Chr8:44421962-44421981 None:intergenic 40.0%
! AAGCAGTAATAAGCTCTGGT+GGG - Chr8:44421057-44421076 None:intergenic 40.0%
! ACTCCTCCTTATGCATTTTC+AGG + Chr8:44419163-44419182 MsG0880044561.01.T01:intron 40.0%
! AGGGCTCTAATACCATATGT+TGG - Chr8:44417849-44417868 None:intergenic 40.0%
! AGGGTTTTCTAAGTGAAGAG+AGG - Chr8:44420569-44420588 None:intergenic 40.0%
! ATCGCTCGTTTGAAACAATG+GGG + Chr8:44418756-44418775 MsG0880044561.01.T01:intron 40.0%
! ATCGCTCGTTTGAAACAATG+GGG - Chr8:44418775-44418756 None:intergenic 40.0%
! CAATTTTCCCCCCATTTTGT+TGG - Chr8:44423834-44423853 None:intergenic 40.0%
! CCACTCTCATCAACTTTTTG+TGG + Chr8:44420623-44420642 MsG0880044561.01.T01:intron 40.0%
! CTTAAGGAACTGATGGATGT+AGG - Chr8:44420147-44420166 None:intergenic 40.0%
! GGCTCTAATACCATATGTTG+GGG - Chr8:44417847-44417866 None:intergenic 40.0%
! GGGCTCTAATACCATATGTT+GGG - Chr8:44417848-44417867 None:intergenic 40.0%
! GGTAATATTCCTCTAGAGGT+TGG + Chr8:44419703-44419722 MsG0880044561.01.T01:CDS 40.0%
! GTGATGGAGTTCATGTCAAA+TGG + Chr8:44421821-44421840 MsG0880044561.01.T01:CDS 40.0%
! GTTGCACATGTTAGCGATTT+TGG + Chr8:44422013-44422032 MsG0880044561.01.T01:CDS 40.0%
! TCCGATTGACTTAGGAAGAT+TGG - Chr8:44419638-44419657 None:intergenic 40.0%
! TGTTTTGTACTTCTGTGCTG+CGG + Chr8:44420655-44420674 MsG0880044561.01.T01:intron 40.0%
! TTTTGGTATTGCCAAGCTCA+TGG + Chr8:44422030-44422049 MsG0880044561.01.T01:CDS 40.0%
!! AGATAAGTTGGTTTGAGGTC+GGG - Chr8:44422291-44422310 None:intergenic 40.0%
!! AGTGATTGATTTGAACTCGG+AGG + Chr8:44421691-44421710 MsG0880044561.01.T01:CDS 40.0%
!! CACTTTTTGGCAGATTCATG+TGG + Chr8:44419673-44419692 MsG0880044561.01.T01:CDS 40.0%
!! CCACAAAAAGTTGATGAGAG+TGG - Chr8:44420626-44420645 None:intergenic 40.0%
!! GAGAGTAATTTGCTTGGAAG+GGG + Chr8:44421611-44421630 MsG0880044561.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTTTGAAAGGTCCACCATC+AGG - Chr8:44421302-44421321 None:intergenic 40.0%
!!! ATTTTCAGGTTCGATACCCA+AGG + Chr8:44419177-44419196 MsG0880044561.01.T01:intron 40.0%
!!! GCGACCCCATTTTTTTAATC+AGG - Chr8:44423023-44423042 None:intergenic 40.0%
!!! TCTTTTTGGGTGGTTTTGAG+GGG + Chr8:44420977-44420996 MsG0880044561.01.T01:intron 40.0%
AAAAATGGGGTCGCTAGTTC+GGG + Chr8:44423029-44423048 MsG0880044561.01.T01:intron 45.0%
AAACCGAAAAAGCTGCCAAG+TGG - Chr8:44420845-44420864 None:intergenic 45.0%
AAACCTCCAAAAGCGGTGTT+GGG - Chr8:44419487-44419506 None:intergenic 45.0%
ACAGAGACTTTGGCTACTGT+TGG + Chr8:44422076-44422095 MsG0880044561.01.T01:CDS 45.0%
ACCATATGTTGGGGAGTCTA+GGG - Chr8:44417838-44417857 None:intergenic 45.0%
ACTGTTGGATATCTTGCACC+AGG + Chr8:44422091-44422110 MsG0880044561.01.T01:CDS 45.0%
ATCTGTGAGACTCCAAAGAG+AGG - Chr8:44420007-44420026 None:intergenic 45.0%
ATGAGTCTGTGGTCTGAATG+TGG + Chr8:44420905-44420924 MsG0880044561.01.T01:intron 45.0%
ATGGTATTAGAGCCCTTGCT+AGG + Chr8:44417853-44417872 MsG0880044561.01.T01:intron 45.0%
ATTGCCAAGCTCATGGATGA+AGG + Chr8:44422037-44422056 MsG0880044561.01.T01:CDS 45.0%
CAGAAAGGGGGAAAACTATG+GGG - Chr8:44418126-44418145 None:intergenic 45.0%
CGAGAAGCAGTAATAAGCTC+TGG - Chr8:44421061-44421080 None:intergenic 45.0%
CTACAAGGAGAGATTCCTGA+TGG + Chr8:44420345-44420364 MsG0880044561.01.T01:CDS 45.0%
CTACGATACCTTCCTCTCTT+TGG + Chr8:44419992-44420011 MsG0880044561.01.T01:CDS 45.0%
CTAGTTCGGGAAGACAATGA+AGG + Chr8:44423042-44423061 MsG0880044561.01.T01:intron 45.0%
CTCATGTTTCCAACCTCTAG+AGG - Chr8:44419715-44419734 None:intergenic 45.0%
CTTATTACTGCTTCTCGCAC+GGG + Chr8:44421064-44421083 MsG0880044561.01.T01:intron 45.0%
GAACCTGAAACCTCCAAAAG+CGG - Chr8:44419494-44419513 None:intergenic 45.0%
GAAGCTTCTGAATGGTGAGA+TGG + Chr8:44421658-44421677 MsG0880044561.01.T01:CDS 45.0%
GAAGTGAGAGTTTGGGTCTT+TGG - Chr8:44420495-44420514 None:intergenic 45.0%
GAGCTTGTGCAAGCAACAAA+TGG + Chr8:44421581-44421600 MsG0880044561.01.T01:CDS 45.0%
GATAGATGTTGCACATGCGT+TGG + Chr8:44421910-44421929 MsG0880044561.01.T01:CDS 45.0%
GCGTTGGAATATCTCCATCA+TGG + Chr8:44421926-44421945 MsG0880044561.01.T01:CDS 45.0%
GCTTATTACTGCTTCTCGCA+CGG + Chr8:44421063-44421082 MsG0880044561.01.T01:intron 45.0%
GGAGAAATTCCCACATCACT+TGG + Chr8:44420207-44420226 MsG0880044561.01.T01:CDS 45.0%
GGGGTGTAAAATCGCACAAT+TGG - Chr8:44418047-44418066 None:intergenic 45.0%
GTGGGTGTAAATTAGTGAGG+TGG + Chr8:44423238-44423257 MsG0880044561.01.T01:intron 45.0%
TACCATATGTTGGGGAGTCT+AGG - Chr8:44417839-44417858 None:intergenic 45.0%
TATCACAGAGAGGGACTTGT+AGG - Chr8:44421376-44421395 None:intergenic 45.0%
TATGAGGGGAAGCTTCTGAA+TGG + Chr8:44421650-44421669 MsG0880044561.01.T01:CDS 45.0%
TATTCGAGCCGGTATCCTTA+CGG + Chr8:44421004-44421023 MsG0880044561.01.T01:intron 45.0%
TCATGGTTCTTCAATACCCG+TGG + Chr8:44421943-44421962 MsG0880044561.01.T01:CDS 45.0%
TCTGAATGGTGAGATGGTTG+CGG + Chr8:44421664-44421683 MsG0880044561.01.T01:CDS 45.0%
TGGGTGCAAAATCAGAAAGG+GGG - Chr8:44418138-44418157 None:intergenic 45.0%
TTGATGGAATAATGCCCGAG+AGG - Chr8:44419324-44419343 None:intergenic 45.0%
TTGTCCTTCATCCATGAGCT+TGG - Chr8:44422044-44422063 None:intergenic 45.0%
TTGTCTAGGTGATGAGTCTG+TGG + Chr8:44420894-44420913 MsG0880044561.01.T01:intron 45.0%
! AATTTTGAACCTCCTGACCC+AGG + Chr8:44421258-44421277 MsG0880044561.01.T01:intron 45.0%
! ACTGTGGTTTGTGTTTCAGC+TGG + Chr8:44420712-44420731 MsG0880044561.01.T01:intron 45.0%
! ATTTTGAACCTCCTGACCCA+GGG + Chr8:44421259-44421278 MsG0880044561.01.T01:intron 45.0%
! CAAGGCGGGACAAACTTTTT+AGG + Chr8:44423191-44423210 MsG0880044561.01.T01:intron 45.0%
! GAAGCAGTAATAAGCTCTGG+TGG - Chr8:44421058-44421077 None:intergenic 45.0%
! GATCCACTTGGCAGCTTTTT+CGG + Chr8:44420839-44420858 MsG0880044561.01.T01:intron 45.0%
! GGACATAGGTTGGAGTAACA+AGG - Chr8:44422270-44422289 None:intergenic 45.0%
! GTTTTGTACTTCTGTGCTGC+GGG + Chr8:44420656-44420675 MsG0880044561.01.T01:intron 45.0%
! TCCCACATCACTTGGTGAAA+TGG + Chr8:44420215-44420234 MsG0880044561.01.T01:CDS 45.0%
! TGAGGGGTTTTTATTCGAGC+CGG + Chr8:44420993-44421012 MsG0880044561.01.T01:intron 45.0%
!! AGGATTTGGCTCTGTGTATG+AGG + Chr8:44421634-44421653 MsG0880044561.01.T01:CDS 45.0%
!! AGTAATTTGCTTGGAAGGGG+AGG + Chr8:44421614-44421633 MsG0880044561.01.T01:CDS 45.0%
!! AGTGGTGAAGTTGATGAGAG+TGG - Chr8:44420608-44420627 None:intergenic 45.0%
!! CGGGTATTGAAGAACCATGA+TGG - Chr8:44421943-44421962 None:intergenic 45.0%
!! GATTTGGCTCTGTGTATGAG+GGG + Chr8:44421636-44421655 MsG0880044561.01.T01:CDS 45.0%
!! GGATTTGGCTCTGTGTATGA+GGG + Chr8:44421635-44421654 MsG0880044561.01.T01:CDS 45.0%
!!! AAATTTAATTTTTAAAAATC+TGG + Chr8:44418334-44418353 MsG0880044561.01.T01:intron 5.0%
!!! AAATTTAATTTTTAAAAATC+TGG - Chr8:44418353-44418334 None:intergenic 5.0%
!!! AATATTTTTATGATTTTTTT+GGG - Chr8:44418157-44418176 None:intergenic 5.0%
!!! AGATTTTTTTAAAAAAAATT+TGG - Chr8:44418625-44418644 None:intergenic 5.0%
!!! GATTTTTTTTAAAAAAATTA+TGG + Chr8:44418307-44418326 MsG0880044561.01.T01:intron 5.0%
!!! TTCTAATTTTTTAAATTTTT+TGG + Chr8:44418717-44418736 MsG0880044561.01.T01:intron 5.0%
AAACAGCAGCAACCAGCAGA+AGG - Chr8:44420746-44420765 None:intergenic 50.0%
AAGGAGAGATTCCTGATGGC+AGG + Chr8:44420349-44420368 MsG0880044561.01.T01:CDS 50.0%
AGGAGAGATTCCTGATGGCA+GGG + Chr8:44420350-44420369 MsG0880044561.01.T01:CDS 50.0%
AGGCTCGTGGGAAAGAAGAA+TGG + Chr8:44417873-44417892 MsG0880044561.01.T01:intron 50.0%
ATCGGTTGCCGTAAGGATAC+CGG - Chr8:44421015-44421034 None:intergenic 50.0%
CATCTCCACCCAAAACCTTC+AGG - Chr8:44417759-44417778 None:intergenic 50.0%
GAAACCTCCAAAAGCGGTGT+TGG - Chr8:44419488-44419507 None:intergenic 50.0%
GGGGTGCAAAATCGCACAAT+TGG - Chr8:44418794-44418775 None:intergenic 50.0%
GGTAATCTTCCACCCGAGAT+TGG + Chr8:44420063-44420082 MsG0880044561.01.T01:CDS 50.0%
GGTTCGATACCCAAGGAGAT+TGG + Chr8:44419184-44419203 MsG0880044561.01.T01:intron 50.0%
GTGAGACTCCAAAGAGAGGA+AGG - Chr8:44420003-44420022 None:intergenic 50.0%
TCCCTAGACTCCCCAACATA+TGG + Chr8:44417834-44417853 MsG0880044561.01.T01:CDS 50.0%
TGTCCTTGGTGAGATCCACT+TGG + Chr8:44420827-44420846 MsG0880044561.01.T01:intron 50.0%
TTGCTTGGAAGGGGAGGATT+TGG + Chr8:44421620-44421639 MsG0880044561.01.T01:CDS 50.0%
! ACTCTACCCAACACCGCTTT+TGG + Chr8:44419478-44419497 MsG0880044561.01.T01:CDS 50.0%
! CTGGCAGTTTTACCTTCTGC+TGG + Chr8:44420731-44420750 MsG0880044561.01.T01:intron 50.0%
! GTTGATGAGAGTGGTGGTAG+TGG - Chr8:44420599-44420618 None:intergenic 50.0%
! TTGGTTTGAGGTCGGGACAT+AGG - Chr8:44422284-44422303 None:intergenic 50.0%
! TTTGAGGTCGGGACATAGGT+TGG - Chr8:44422280-44422299 None:intergenic 50.0%
!! ACACCGCTTTTGGAGGTTTC+AGG + Chr8:44419488-44419507 MsG0880044561.01.T01:CDS 50.0%
!! GGTGAAGTTGATGAGAGTGG+TGG - Chr8:44420605-44420624 None:intergenic 50.0%
!! TGGTGGTAGTGGAGGAAGAA+GGG - Chr8:44420588-44420607 None:intergenic 50.0%
AAAGGTCCACCATCAGGCAG+TGG - Chr8:44421296-44421315 None:intergenic 55.0%
AGGGGAAATCGGTTGCCGTA+AGG - Chr8:44421022-44421041 None:intergenic 55.0%
AGTCTAGGGAACGTTGGGAG+CGG - Chr8:44417824-44417843 None:intergenic 55.0%
CTGCCAAGTGGATCTCACCA+AGG - Chr8:44420833-44420852 None:intergenic 55.0%
CTTTCCCACGAGCCTAGCAA+GGG - Chr8:44417868-44417887 None:intergenic 55.0%
GAGTTTGGGTCTTTGGCAGC+TGG - Chr8:44420488-44420507 None:intergenic 55.0%
GCTTTGCTGCGCTTCTACTG+TGG + Chr8:44420696-44420715 MsG0880044561.01.T01:intron 55.0%
GGAGAGATTCCTGATGGCAG+GGG + Chr8:44420351-44420370 MsG0880044561.01.T01:CDS 55.0%
GTACTTCTGTGCTGCGGGAT+TGG + Chr8:44420661-44420680 MsG0880044561.01.T01:intron 55.0%
TCTTTCCCACGAGCCTAGCA+AGG - Chr8:44417869-44417888 None:intergenic 55.0%
TGGGGAGTCTAGGGAACGTT+GGG - Chr8:44417829-44417848 None:intergenic 55.0%
TTGGGGAGTCTAGGGAACGT+TGG - Chr8:44417830-44417849 None:intergenic 55.0%
!! CTACCCAACACCGCTTTTGG+AGG + Chr8:44419481-44419500 MsG0880044561.01.T01:CDS 55.0%
!! GATGAGAGTGGTGGTAGTGG+AGG - Chr8:44420596-44420615 None:intergenic 55.0%
!! GTGGTGGTAGTGGAGGAAGA+AGG - Chr8:44420589-44420608 None:intergenic 55.0%
AGAGCCCTTGCTAGGCTCGT+GGG + Chr8:44417861-44417880 MsG0880044561.01.T01:intron 60.0%
CAGAGAGGGACTTGTAGGCG+AGG - Chr8:44421371-44421390 None:intergenic 60.0%
GAGATTCCTGATGGCAGGGG+CGG + Chr8:44420354-44420373 MsG0880044561.01.T01:CDS 60.0%
GGAACGTTGGGAGCGGCAAT+GGG - Chr8:44417817-44417836 None:intergenic 60.0%
TAGAGCCCTTGCTAGGCTCG+TGG + Chr8:44417860-44417879 MsG0880044561.01.T01:intron 60.0%
TGCATCCCCTCAGCTCTACC+TGG - Chr8:44420382-44420401 None:intergenic 60.0%
TGCTTCTCGCACGGGCTTGT+TGG + Chr8:44421072-44421091 MsG0880044561.01.T01:intron 60.0%
AACCTCCTGACCCAGGGTCC+TGG + Chr8:44421265-44421284 MsG0880044561.01.T01:intron 65.0%
AGTGGCGTCTCCAGGACCCT+GGG - Chr8:44421278-44421297 None:intergenic 65.0%
CATCAGGCAGTGGCGTCTCC+AGG - Chr8:44421286-44421305 None:intergenic 65.0%
CTGGAGACGCCACTGCCTGA+TGG + Chr8:44421284-44421303 MsG0880044561.01.T01:CDS 65.0%
GAGACGCCACTGCCTGATGG+TGG + Chr8:44421287-44421306 MsG0880044561.01.T01:CDS 65.0%
GGGAACGTTGGGAGCGGCAA+TGG - Chr8:44417818-44417837 None:intergenic 65.0%
! CGGTGCCAGGTAGAGCTGAG+GGG + Chr8:44420374-44420393 MsG0880044561.01.T01:intron 65.0%
! GCGGTGCCAGGTAGAGCTGA+GGG + Chr8:44420373-44420392 MsG0880044561.01.T01:intron 65.0%
CAGTGGCGTCTCCAGGACCC+TGG - Chr8:44421279-44421298 None:intergenic 70.0%
CGTCTCCAGGACCCTGGGTC+AGG - Chr8:44421273-44421292 None:intergenic 70.0%
CTCCAGGACCCTGGGTCAGG+AGG - Chr8:44421270-44421289 None:intergenic 70.0%
! GGCGGTGCCAGGTAGAGCTG+AGG + Chr8:44420372-44420391 MsG0880044561.01.T01:intron 70.0%
CTGATGGCAGGGGCGGTGCC+AGG + Chr8:44420361-44420380 MsG0880044561.01.T01:CDS 75.0%
CTGGCACCGCCCCTGCCATC+AGG - Chr8:44420363-44420382 None:intergenic 75.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 44417753 44423957 44417753 ID=MsG0880044561.01;Name=MsG0880044561.01
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Chr8 exon 44417753 44417855 44417753 ID=MsG0880044561.01.T01:exon:17932;Parent=MsG0880044561.01.T01
Chr8 exon 44419185 44420382 44419185 ID=MsG0880044561.01.T01:exon:17933;Parent=MsG0880044561.01.T01
Chr8 exon 44421280 44422112 44421280 ID=MsG0880044561.01.T01:exon:17934;Parent=MsG0880044561.01.T01
Chr8 exon 44423647 44423957 44423647 ID=MsG0880044561.01.T01:exon:17935;Parent=MsG0880044561.01.T01
Chr8 CDS 44417753 44417855 44417753 ID=MsG0880044561.01.T01:cds;Parent=MsG0880044561.01.T01
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Chr8 CDS 44421280 44422112 44421280 ID=MsG0880044561.01.T01:cds;Parent=MsG0880044561.01.T01
Chr8 CDS 44423647 44423957 44423647 ID=MsG0880044561.01.T01:cds;Parent=MsG0880044561.01.T01
Gene Sequence

>MsG0880044561.01.T01

ATGCCTGAAGGTTTTGGGTGGAGATGTGACGTCAAGTCTCTTAATGGTTCTGGAAGTTTAGCCCATTGCCGCTCCCAACGTTCCCTAGACTCCCCAACATATGGTTCGATACCCAAGGAGATTGGCTATCTTGAAAAACTTGAAATTCTTATATTAGCAGAAAATAGCTTCAGTGGATCCATTCCTTCCAAACTCATGAACATGTCATCATTGAAACAAATGGAGTTTGAGCAAAATAACCTCTCGGGCATTATTCCATCAAAAACAGGATATAACCTTCCTAGCCTACAATATCTACACTTGAATGACAACAATTTTGTTGGAAATATTCCAAATAGCATATTCAATGCTTCTAATCTCATTGGATTTCAATTGCATTCCAATGCATTTAGTGGAACTCTACCCAACACCGCTTTTGGAGGTTTCAGGTTCCTCAAAACAATTTTCATACAGAACAACAACTTGATAATAGAAGATTCTCTTCAATTCTTTACTTCCTTGACAAATTGTAGATATTTAAATATTCTAGACTTATCAGGAAATCATATACTATCCAATCTTCCTAAGTCAATCGGAAACTTAACTTTAGTACACTTTTTGGCAGATTCATGTGGAATTGATGGTAATATTCCTCTAGAGGTTGGAAACATGAGTAACTTGCTATCTTTTTCTGTGAATGGGAATAATATAAATGGATCAATACCTGGCACATTTAAAGATTTACATAAACTTCAGGGTTTGGATCTTAGAAACAATGGACTACAAGGATCATTTGTTAAGGAGCTTTGTCAAATTGACAATTTGGATGAGTTGTATTTAGAAAGTAATAAGCTTTTTGGTGTTTTACCAACATGTTTGGGAAACATGACTTCTCTAAGAAAATTATACATAGGATATAACAATTTGAACTCTACGATACCTTCCTCTCTTTGGAGTCTCACAGATATCTTACAAGTAGATTTGTCCTCTAATGCTTTCACTGGTAATCTTCCACCCGAGATTGGAAATTTTAGAGCAATTATACTATTAGACCTATCTAGAAATCATATATCAAGCAACATACCTACATCCATCAGTTCCTTAAGAAATTTGCAAAATCTGTCCTTAGCTCATAACAAATTGTATGGAGAAATTCCCACATCACTTGGTGAAATGGTTAGCTTGTTCTCTTTGGACTTGTCCCAAAATATGATAACTGGTGTTATTCCAAAATCCTTAGCATCGCTTTTGTATCTTCAAAACATCAATTTATCATATAATAGACTACAAGGAGAGATTCCTGATGGCAGGGGCGGTGCCAGGGTCCTGGAGACGCCACTGCCTGATGGTGGACCTTTCAAAAATTTCACAGCTGAATCGTATTTGCATAATGAAGCACTTTTTGGTGATCCTCGCCTACAAGTCCCTCTCTGTGATAAACAAGCTAAAAAAATGTCAATGAAAAAGAATCTATTACTCAAATGCATACTTCCCATACTCGTGTCAATCATTTTTGTTGTTGCGTGCATAATACTTGTAAAACTTAATAAAAGGAAAATGGTTGAAAATACTCTTGAAAGAAGTTTATCAACTCTTGGATCTCCAAGAAGAATTTCTTATTATGAGCTTGTGCAAGCAACAAATGGATTTAATGAGAGTAATTTGCTTGGAAGGGGAGGATTTGGCTCTGTGTATGAGGGGAAGCTTCTGAATGGTGAGATGGTTGCGGTTAAAGTGATTGATTTGAACTCGGAGGAAAAATCACTGAGCTTTGATGGAGAATGCAATGCATTGAGAAATCTAGGACATCGAAATCTGGTTAAGACTATCAGCAGTTGTTCAAATATTGATTTCAAAGCATTGGTGATGGAGTTCATGTCAAATGGAAGTGTGGAAAAATGGTTATATTCAAATAATTGTTGTTTAAATTTCTTGCAAAGGTTAAATATAATGATAGATGTTGCACATGCGTTGGAATATCTCCATCATGGTTCTTCAATACCCGTGGTCCATTGTGATCTAAAGCCTAGTATTGTCTTGTTAGACGAAGATATGGTTGCACATGTTAGCGATTTTGGTATTGCCAAGCTCATGGATGAAGGACAATCTAAAACTCATACAGAGACTTTGGCTACTGTTGGATATCTTGCACCAGAGTATGGAGCTAAAGGAATTGTTTCTATCAAAGGAGATGTATACAACTATGGGATTATGCTAATGGAAATCTTTACAGGAAGAAAGCCAACAGATGATATGTTTGTAGCAGACCTAACTTTAAAGACATGGATCAGTGAAACATTGCCTAATTCAATCATGGATGTCTTGGATTCTAAGTTAGTCCAACAAAATGGGGGGAAAATTGATGACATATTGAGTTGCATGTCATCTATTTTTGGTTTAGCCCTGAATTGTGCAAAGATTCACCTGAAGAAAGAATTAATATGGAAGATGTTATTAAGATGCTAA
Protein sequence

>MsG0880044561.01.T01

MPEGFGWRCDVKSLNGSGSLAHCRSQRSLDSPTYGSIPKEIGYLEKLEILILAENSFSGSIPSKLMNMSSLKQMEFEQNNLSGIIPSKTGYNLPSLQYLHLNDNNFVGNIPNSIFNASNLIGFQLHSNAFSGTLPNTAFGGFRFLKTIFIQNNNLIIEDSLQFFTSLTNCRYLNILDLSGNHILSNLPKSIGNLTLVHFLADSCGIDGNIPLEVGNMSNLLSFSVNGNNINGSIPGTFKDLHKLQGLDLRNNGLQGSFVKELCQIDNLDELYLESNKLFGVLPTCLGNMTSLRKLYIGYNNLNSTIPSSLWSLTDILQVDLSSNAFTGNLPPEIGNFRAIILLDLSRNHISSNIPTSISSLRNLQNLSLAHNKLYGEIPTSLGEMVSLFSLDLSQNMITGVIPKSLASLLYLQNINLSYNRLQGEIPDGRGGARVLETPLPDGGPFKNFTAESYLHNEALFGDPRLQVPLCDKQAKKMSMKKNLLLKCILPILVSIIFVVACIILVKLNKRKMVENTLERSLSTLGSPRRISYYELVQATNGFNESNLLGRGGFGSVYEGKLLNGEMVAVKVIDLNSEEKSLSFDGECNALRNLGHRNLVKTISSCSNIDFKALVMEFMSNGSVEKWLYSNNCCLNFLQRLNIMIDVAHALEYLHHGSSIPVVHCDLKPSIVLLDEDMVAHVSDFGIAKLMDEGQSKTHTETLATVGYLAPEYGAKGIVSIKGDVYNYGIMLMEIFTGRKPTDDMFVADLTLKTWISETLPNSIMDVLDSKLVQQNGGKIDDILSCMSSIFGLALNCAKIHLKKELIWKMLLRC*