AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880045218.01

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MsG0880045218.01.T01 AT3G45440 33.591 646 343 20 1 581 7 631 1.16e-89 292
MsG0880045218.01.T01 AT3G45440 33.901 646 341 21 1 581 60 684 5.00e-89 291
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MsG0880045218.01.T01 AT2G43690 29.832 238 148 6 23 248 18 248 1.04e-14 78.2
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MsG0880045218.01.T01 AT1G56120 43.478 345 183 6 265 607 685 1019 1.10e-80 275
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MsG0880045218.01.T01 AT4G02630 42.069 290 162 2 278 563 150 437 1.37e-67 228
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MsG0880045218.01.T01 AT4G11480 40.964 332 171 9 253 570 289 609 9.44e-67 230
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MsG0880045218.01.T01 AT1G70740 39.414 307 168 4 266 556 24 328 1.10e-66 224
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MsG0880045218.01.T01 AT4G23250 41.214 313 173 6 266 570 330 639 3.33e-63 222
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MsG0880045218.01.T01 AT1G68690 40.767 287 164 3 278 560 365 649 3.77e-63 221
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MsG0880045218.01.T01 AT5G24080 38.689 305 177 4 275 573 390 690 7.18e-63 221
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MsG0880045218.01.T01 AT3G09830 39.404 302 172 5 271 561 65 366 4.82e-61 209
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MsG0880045218.01.T01 AT5G02800 39.936 313 175 7 278 581 61 369 9.28e-61 207
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MsG0880045218.01.T01 AT3G09010 45.299 234 123 2 276 506 32 263 3.48e-60 203
MsG0880045218.01.T01 AT2G28970 43.206 287 154 5 277 560 433 713 3.92e-60 214
MsG0880045218.01.T01 AT3G26940 40.339 295 163 6 278 562 62 353 3.98e-60 207
MsG0880045218.01.T01 AT4G03230 39.688 320 181 6 271 586 506 817 4.03e-60 215
MsG0880045218.01.T01 AT1G70520 36.919 344 197 7 278 612 313 645 4.35e-60 212
MsG0880045218.01.T01 AT4G03230 39.688 320 181 6 271 586 514 825 4.36e-60 215
MsG0880045218.01.T01 AT1G34210 40.550 291 165 4 276 560 291 579 4.69e-60 211
MsG0880045218.01.T01 AT1G34210 40.550 291 165 4 276 560 291 579 4.69e-60 211
MsG0880045218.01.T01 AT5G18610 35.930 398 237 7 226 613 19 408 4.87e-60 209
MsG0880045218.01.T01 AT5G18610 35.930 398 237 7 226 613 19 408 4.87e-60 209
MsG0880045218.01.T01 AT5G18610 35.930 398 237 7 226 613 19 408 4.87e-60 209
MsG0880045218.01.T01 AT2G28970 43.206 287 154 5 277 560 468 748 4.88e-60 214
MsG0880045218.01.T01 AT1G52540 38.276 290 173 3 278 564 28 314 5.06e-60 204
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MsG0880045218.01.T01 AT4G03230 39.688 320 181 6 271 586 599 910 5.80e-60 216
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MsG0880045218.01.T01 AT4G03230 39.688 320 181 6 271 586 671 982 7.28e-60 216
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MsG0880045218.01.T01 AT4G03230 39.688 320 181 6 271 586 571 882 7.35e-60 215
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MsG0880045218.01.T01 AT2G28990 42.907 289 152 6 277 560 566 846 2.59e-59 213
MsG0880045218.01.T01 AT1G61500 40.476 294 170 3 278 568 479 770 2.93e-59 212
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MsG0880045218.01.T01 AT1G51830 39.871 311 176 6 254 561 354 656 3.94e-59 210
MsG0880045218.01.T01 AT1G79620 41.176 289 160 6 274 557 622 905 4.10e-59 214
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MsG0880045218.01.T01 AT1G61430 40.333 300 169 6 278 572 454 748 3.78e-58 209
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MsG0880045218.01.T01 AT1G61490 40.000 300 171 5 274 568 474 769 4.08e-58 209
MsG0880045218.01.T01 AT1G61490 40.000 300 171 5 274 568 474 769 4.08e-58 209
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MsG0880045218.01.T01 AT1G61490 40.000 300 171 5 274 568 448 743 5.06e-58 208
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MsG0880045218.01.T01 AT5G01950 40.203 296 160 7 273 560 609 895 8.17e-58 210
MsG0880045218.01.T01 AT5G01950 40.203 296 160 7 273 560 609 895 8.17e-58 210
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MsG0880045218.01.T01 AT2G05940 39.865 296 161 7 278 561 75 365 3.96e-57 199
MsG0880045218.01.T01 AT4G23300 37.134 307 182 6 277 574 340 644 4.04e-57 204
MsG0880045218.01.T01 AT2G26290 39.661 295 161 8 278 560 76 365 4.27e-57 198
MsG0880045218.01.T01 AT2G04300 41.096 292 163 6 273 561 567 852 4.61e-57 207
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MsG0880045218.01.T01 AT5G63710 39.041 292 169 5 276 561 276 564 5.12e-57 203
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MsG0880045218.01.T02 AT1G70110 46.358 302 160 2 144 444 321 621 2.80e-90 289
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MsG0880045218.01.T02 AT2G43700 45.215 303 161 3 144 444 289 588 1.33e-89 287
MsG0880045218.01.T02 AT3G59750 47.195 303 157 2 144 444 280 581 1.99e-89 286
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MsG0880045218.01.T02 AT3G45430 37.132 509 232 13 16 444 119 619 2.08e-89 287
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MsG0880045218.01.T02 AT5G01540 47.157 299 148 3 152 446 352 644 2.54e-84 274
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MsG0880045218.01.T02 AT2G43690 44.932 296 158 3 151 444 321 613 4.50e-83 270
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MsG0880045218.01.T02 AT5G60300 46.205 303 155 4 143 444 324 619 1.27e-82 270
MsG0880045218.01.T02 AT5G60320 45.183 301 161 3 147 446 328 625 2.08e-82 269
MsG0880045218.01.T02 AT1G56120 43.478 345 183 6 142 484 667 1001 4.90e-82 275
MsG0880045218.01.T02 AT5G60300 45.695 302 160 3 144 444 321 619 5.15e-82 270
MsG0880045218.01.T02 AT1G56120 43.478 345 183 6 142 484 685 1019 7.76e-82 274
MsG0880045218.01.T02 AT1G56140 46.278 309 162 3 142 449 668 973 1.53e-81 273
MsG0880045218.01.T02 AT4G04960 47.635 296 138 7 152 437 332 620 2.61e-81 266
MsG0880045218.01.T02 AT5G60280 44.839 310 165 4 143 451 315 619 3.49e-80 263
MsG0880045218.01.T02 AT3G45420 44.194 310 169 3 143 451 326 632 1.74e-79 261
MsG0880045218.01.T02 AT1G56130 44.660 309 167 3 142 449 470 775 7.74e-79 263
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MsG0880045218.01.T02 AT1G07650 39.247 372 211 6 121 484 636 1000 1.28e-71 246
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MsG0880045218.01.T02 AT4G23130 40.000 310 179 5 142 447 316 622 4.85e-69 233
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MsG0880045218.01.T02 AT2G18470 40.404 297 169 4 155 446 272 565 3.04e-67 228
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MsG0880045218.01.T02 AT4G23290 40.252 318 179 6 139 447 333 648 4.67e-67 228
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MsG0880045218.01.T02 AT4G23190 36.585 369 216 8 98 451 198 563 4.73e-67 226
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MsG0880045218.01.T02 AT1G11330 43.599 289 158 3 155 440 512 798 1.14e-66 230
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MsG0880045218.01.T02 AT1G11330 43.599 289 158 3 155 440 510 796 1.28e-66 230
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MsG0880045218.01.T02 AT1G56720 41.837 294 165 3 155 444 167 458 1.30e-66 223
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MsG0880045218.01.T02 AT4G21400 39.735 302 169 6 157 448 351 649 2.32e-63 218
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MsG0880045218.01.T02 AT5G10290 41.695 295 164 4 153 441 276 568 2.71e-63 217
MsG0880045218.01.T02 AT4G27290 43.728 279 151 4 160 434 504 780 2.74e-63 221
MsG0880045218.01.T02 AT5G16000 40.138 289 166 5 153 437 298 583 3.13e-63 217
MsG0880045218.01.T02 AT1G70530 40.667 300 170 5 155 450 311 606 3.15e-63 217
MsG0880045218.01.T02 AT1G11350 42.574 303 166 4 155 451 500 800 3.59e-63 220
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MsG0880045218.01.T02 AT2G17220 39.319 323 179 6 133 439 47 368 3.14e-60 204
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MsG0880045218.01.T02 AT1G11280 38.679 318 172 8 143 444 485 795 4.02e-57 203
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MsG0880045218.01.T02 AT1G61380 38.141 312 184 5 143 447 462 771 4.51e-57 203
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MsG0880045218.01.T04 AT2G43700 34.812 586 330 12 59 613 24 588 5.54e-108 340
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MsG0880045218.01.T04 AT3G45430 36.193 641 332 20 11 613 18 619 3.13e-106 337
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MsG0880045218.01.T04 AT5G60300 36.566 629 329 17 20 613 26 619 1.79e-105 337
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MsG0880045218.01.T04 AT4G05200 37.666 377 213 8 250 622 288 646 7.80e-71 243
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MsG0880045218.01.T04 AT2G18470 40.404 297 169 4 324 615 272 565 3.09e-65 227
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MsG0880045218.01.T04 AT1G56720 41.837 294 165 3 324 613 167 458 3.31e-65 223
MsG0880045218.01.T04 AT1G56720 41.837 294 165 3 324 613 167 458 3.31e-65 223
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MsG0880045218.01.T04 AT5G65240 42.568 296 160 5 322 610 270 562 1.76e-64 225
MsG0880045218.01.T04 AT1G53420 39.222 334 187 6 277 606 574 895 1.81e-64 230
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MsG0880045218.01.T04 AT1G55200 42.321 293 163 5 318 607 361 650 3.97e-64 224
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MsG0880045218.01.T04 AT1G34300 40.604 298 166 7 314 606 465 756 6.74e-59 213
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MsG0880045218.01.T04 AT5G18610 38.728 346 194 7 324 659 71 408 7.41e-59 206
MsG0880045218.01.T04 AT5G54380 39.228 311 169 5 322 622 496 796 9.50e-59 213
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MsG0880045218.01.T04 AT2G17220 39.157 332 180 7 302 612 48 378 1.67e-58 203
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MsG0880045218.01.T03 AT1G60800 38.415 328 185 6 303 625 259 574 2.23e-67 233
MsG0880045218.01.T03 AT4G00960 40.000 320 171 8 331 636 32 344 2.37e-67 226
MsG0880045218.01.T03 AT4G23180 40.667 300 170 4 342 635 335 632 3.39e-67 233
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MsG0880045218.01.T03 AT3G24790 42.568 296 160 6 339 627 49 341 5.87e-67 225
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MsG0880045218.01.T03 AT4G04510 40.127 314 173 8 329 634 314 620 1.96e-63 223
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MsG0880045218.01.T03 AT4G13190 37.798 336 199 5 310 638 26 358 2.72e-63 215
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MsG0880045218.01.T03 AT4G32000 36.842 380 216 11 268 638 44 408 3.26e-63 216
MsG0880045218.01.T03 AT2G25220 41.806 299 163 5 343 638 139 429 3.28e-63 217
MsG0880045218.01.T03 AT2G28930 38.710 310 172 6 331 625 45 351 3.45e-63 216
MsG0880045218.01.T03 AT2G28930 38.710 310 172 6 331 625 48 354 3.81e-63 216
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MsG0880045218.01.T03 AT5G38990 40.268 298 169 4 341 631 511 806 3.66e-60 217
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MsG0880045218.01.T03 AT5G35370 34.734 357 200 9 300 631 461 809 2.02e-57 209
MsG0880045218.01.T03 AT5G63710 38.312 308 181 5 325 626 224 528 2.04e-57 204
MsG0880045218.01.T03 AT5G63710 38.312 308 181 5 325 626 224 528 2.04e-57 204
MsG0880045218.01.T03 AT4G00960 43.697 238 121 4 331 557 32 267 2.58e-57 196
MsG0880045218.01.T03 AT1G61390 36.119 371 218 7 270 633 439 797 2.62e-57 209
MsG0880045218.01.T03 AT1G11340 42.435 271 144 5 302 562 523 791 2.69e-57 208
MsG0880045218.01.T03 AT4G13190 41.418 268 148 4 314 575 30 294 2.94e-57 196
MsG0880045218.01.T03 AT5G01950 40.339 295 161 6 338 625 609 895 3.44e-57 209
MsG0880045218.01.T03 AT5G01950 40.339 295 161 6 338 625 609 895 3.44e-57 209
MsG0880045218.01.T03 AT5G01950 40.339 295 161 6 338 625 609 895 3.44e-57 209
MsG0880045218.01.T03 AT5G01950 40.339 295 161 6 338 625 609 895 3.44e-57 209
MsG0880045218.01.T03 AT3G21340 40.397 302 171 5 328 626 567 862 3.48e-57 209
MsG0880045218.01.T03 AT3G53590 40.678 295 158 6 339 625 605 890 3.49e-57 209
MsG0880045218.01.T03 AT2G28940 46.721 244 117 4 341 571 88 331 3.74e-57 201
MsG0880045218.01.T03 AT5G59700 39.576 283 167 3 342 622 469 749 4.06e-57 208
MsG0880045218.01.T03 AT2G14510 37.892 351 182 8 285 626 509 832 5.50e-57 208
MsG0880045218.01.T03 AT5G63710 38.312 308 181 5 325 626 259 563 6.75e-57 204
MsG0880045218.01.T03 AT1G11280 37.430 358 199 11 291 632 437 785 6.92e-57 207
MsG0880045218.01.T03 AT5G63710 38.312 308 181 5 325 626 260 564 7.22e-57 204
MsG0880045218.01.T03 AT2G14510 37.892 351 182 8 285 626 517 840 7.77e-57 207
MsG0880045218.01.T03 AT1G11280 37.430 358 199 11 291 632 447 795 8.57e-57 207
MsG0880045218.01.T03 AT3G02810 36.306 314 188 6 337 640 46 357 9.84e-57 202
MsG0880045218.01.T03 AT2G26290 39.661 295 161 8 343 625 76 365 1.09e-56 199
MsG0880045218.01.T03 AT1G61380 35.040 371 219 7 270 635 271 624 1.14e-56 204
MsG0880045218.01.T03 AT1G76360 40.541 296 164 5 341 625 149 443 1.21e-56 200
MsG0880045218.01.T03 AT4G28670 37.049 305 180 5 343 639 319 619 1.29e-56 203
MsG0880045218.01.T03 AT5G61350 39.643 280 152 3 341 605 511 788 1.33e-56 207
MsG0880045218.01.T03 AT5G48740 35.955 356 208 6 274 625 538 877 1.39e-56 207
MsG0880045218.01.T03 AT2G05940 39.865 296 161 7 343 626 75 365 1.39e-56 199
MsG0880045218.01.T03 AT4G39110 39.576 283 168 2 341 622 512 792 1.91e-56 207
MsG0880045218.01.T03 AT1G66150 39.661 295 163 7 343 626 576 866 2.21e-56 207
MsG0880045218.01.T03 AT1G61360 37.719 342 201 7 308 643 450 785 3.50e-56 205
MsG0880045218.01.T03 AT1G61380 35.040 371 219 7 270 635 418 771 3.63e-56 205
MsG0880045218.01.T03 AT1G11280 37.110 353 195 10 291 632 437 773 3.71e-56 205
MsG0880045218.01.T03 AT1G61360 40.196 306 172 6 343 643 405 704 3.94e-56 204
MsG0880045218.01.T03 AT1G61360 40.196 306 172 6 343 643 405 704 3.94e-56 204
MsG0880045218.01.T03 AT1G61360 40.196 306 172 6 343 643 405 704 3.94e-56 204
MsG0880045218.01.T03 AT1G29730 46.753 231 118 4 343 570 628 856 4.04e-56 206
MsG0880045218.01.T03 AT1G61590 37.975 316 186 6 320 626 63 377 4.10e-56 197
MsG0880045218.01.T03 AT1G11280 37.110 353 195 10 291 632 447 783 4.21e-56 205
MsG0880045218.01.T03 AT1G61440 36.170 376 197 9 295 636 426 792 4.46e-56 205
MsG0880045218.01.T03 AT1G51880 40.789 304 162 7 333 626 540 835 4.96e-56 205
MsG0880045218.01.T03 AT5G35580 39.865 296 161 7 343 626 64 354 5.17e-56 199
MsG0880045218.01.T03 AT3G19300 40.753 292 159 7 339 625 312 594 5.21e-56 202
MsG0880045218.01.T03 AT1G51880 40.789 304 162 7 333 626 558 853 5.97e-56 205
MsG0880045218.01.T03 AT5G35580 39.865 296 161 7 343 626 76 366 7.08e-56 199
MsG0880045218.01.T03 AT5G47070 41.290 310 167 6 328 625 59 365 7.46e-56 196
MsG0880045218.01.T03 AT1G51880 40.789 304 162 7 333 626 566 861 7.51e-56 205
MsG0880045218.01.T03 AT1G61550 38.796 299 176 4 343 636 477 773 9.49e-56 204
MsG0880045218.01.T03 AT2G01820 32.973 370 206 6 298 626 496 864 1.07e-55 205
MsG0880045218.01.T03 AT1G30570 33.333 363 213 7 281 622 433 787 1.44e-55 204
MsG0880045218.01.T03 AT5G01950 40.000 300 160 7 338 625 609 900 1.76e-55 204
MsG0880045218.01.T03 AT2G29000 41.237 291 162 5 338 625 550 834 1.76e-55 204
MsG0880045218.01.T03 AT1G01540 45.133 226 119 2 343 565 142 365 1.85e-55 194
MsG0880045218.01.T03 AT4G21390 40.000 320 163 8 276 570 432 747 2.75e-55 202
MsG0880045218.01.T03 AT3G04690 37.201 293 180 3 341 631 503 793 2.98e-55 203
MsG0880045218.01.T03 AT5G28680 36.860 293 181 3 341 631 507 797 3.03e-55 203
MsG0880045218.01.T03 AT5G28680 36.860 293 181 3 341 631 507 797 3.03e-55 203
MsG0880045218.01.T03 AT2G02220 34.746 354 214 5 285 626 658 1006 3.36e-55 204
MsG0880045218.01.T03 AT3G46420 40.217 276 152 6 352 622 530 797 3.49e-55 202
MsG0880045218.01.T03 AT1G51870 41.034 290 159 6 341 626 571 852 3.52e-55 203

Find 130 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 153 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TAACCACCTGCTGAATTATT+TGG 0.129726 8:+55954268 None:intergenic
AGTCTTGATTATCATCTATT+TGG 0.149558 8:-55953359 MsG0880045218.01.T04:CDS
AATGCCAAACTTGGTGATTT+TGG 0.180863 8:-55953191 MsG0880045218.01.T04:CDS
GGAATTTGATGAAAGGAAAA+TGG 0.231007 8:-55952898 MsG0880045218.01.T04:CDS
TGCTGAATTATTTGGGATTT+CGG 0.232265 8:+55954276 None:intergenic
CTGTAGAATTTGATAGTTAT+TGG 0.232725 8:-55954189 MsG0880045218.01.T04:CDS
AGAAATTTGGTTCAACTCTT+AGG 0.233956 8:-55953437 MsG0880045218.01.T04:CDS
CAAATTCTACAGCTACTATT+TGG 0.237332 8:+55954200 None:intergenic
GAATGGGTTTGGGAGTTATA+TGG 0.250771 8:-55952963 MsG0880045218.01.T04:CDS
TTCCCTGTTGTAACACATTC+AGG 0.255925 8:+55953095 None:intergenic
CATGGAAAATGAGGTGTTCT+TGG 0.256610 8:+55954630 None:intergenic
AGTTGATAGAGGATTAAATT+TGG 0.257892 8:-55952919 MsG0880045218.01.T04:CDS
CAAGCTAAGACATAGAAATT+TGG 0.257990 8:-55953450 MsG0880045218.01.T04:CDS
TTGATAGTTATTGGAATGAT+TGG 0.288502 8:-55954180 MsG0880045218.01.T04:CDS
AAGCTTGGAGAAGGTGGATT+TGG 0.299420 8:-55953590 MsG0880045218.01.T04:CDS
AAACCAATCCTAACATATTC+TGG 0.308216 8:+55953938 None:intergenic
GTTTGATGGTAGTTGGGTTA+TGG 0.315260 8:-55952872 MsG0880045218.01.T04:CDS
CTTGCTTCGTAGGTGTGTTA+TGG 0.316929 8:-55953778 MsG0880045218.01.T04:CDS
GAATCTGATGTTTATAGCTT+TGG 0.323293 8:-55953062 MsG0880045218.01.T04:CDS
TAGGCTTGTGGAATGGGTTT+GGG 0.337619 8:-55952973 MsG0880045218.01.T04:CDS
AACCACCTGCTGAATTATTT+GGG 0.339180 8:+55954269 None:intergenic
TTAGGCTTGTGGAATGGGTT+TGG 0.343480 8:-55952974 MsG0880045218.01.T04:CDS
AAGACCAAAATCACCAAGTT+TGG 0.353236 8:+55953187 None:intergenic
TGACGGTCTATCGTTCTTCA+TGG 0.367331 8:-55954311 MsG0880045218.01.T04:CDS
ATTAACAGCTCTCATAATAA+AGG 0.373156 8:+55954348 None:intergenic
TTAATCACTTGTCTTATAGA+AGG 0.377299 8:+55952822 None:intergenic
GAAAGTTAGGCTTGTGGAAT+GGG 0.378524 8:-55952979 MsG0880045218.01.T04:CDS
TAGCTGAAGAACATTGTTAG+AGG 0.383428 8:+55954489 None:intergenic
GCTGTTAATTTATCGCTGTT+TGG 0.391589 8:-55954334 MsG0880045218.01.T04:CDS
GAAAAGGGGTTATGCTTACT+TGG 0.393944 8:-55953337 MsG0880045218.01.T04:CDS
ATTATCATCTATTTGGAAAA+GGG 0.394408 8:-55953352 MsG0880045218.01.T04:CDS
GTTTATGAATACATGCCTAA+TGG 0.400205 8:-55953383 MsG0880045218.01.T04:CDS
ATGGAATGTTTGATGGTAGT+TGG 0.401012 8:-55952879 MsG0880045218.01.T04:CDS
AGAGAGGAACTGGTCCAAAA+AGG 0.404636 8:-55953664 MsG0880045218.01.T04:CDS
GATTATCATCTATTTGGAAA+AGG 0.406631 8:-55953353 MsG0880045218.01.T04:CDS
ATGAAGAGGCTAAGAAAGTT+AGG 0.408153 8:-55952992 MsG0880045218.01.T04:CDS
TTATTAGATATAGGTTTGAT+TGG 0.413567 8:+55954533 None:intergenic
TGGTTCTCAAACAACTGTTT+TGG 0.418621 8:-55953141 MsG0880045218.01.T04:CDS
GCAAATTTCAATGCCAAACT+TGG 0.419247 8:-55953200 MsG0880045218.01.T04:CDS
GCACCTGAATGTGTTACAAC+AGG 0.420146 8:-55953098 MsG0880045218.01.T04:CDS
TATGTACTTTGCACCTCCTA+TGG 0.422413 8:-55952745 MsG0880045218.01.T04:CDS
AGGGTCAAGACAAGGGAAAA+AGG 0.424036 8:-55953501 MsG0880045218.01.T04:CDS
TGATAGTTATTGGAATGATT+GGG 0.425001 8:-55954179 MsG0880045218.01.T04:CDS
GAAGGCCTCATAGTAAAATC+TGG 0.426690 8:+55952840 None:intergenic
TTATGCTTACTTGGAGTGTA+AGG 0.430212 8:-55953328 MsG0880045218.01.T04:CDS
TTGAAGGTTGGTTTAGGAGT+TGG 0.434211 8:-55953827 MsG0880045218.01.T04:CDS
CAATGTTAATTCGATTCAAT+CGG 0.434636 8:-55954131 MsG0880045218.01.T04:CDS
GGTTCTTTAACTTGCTTCGT+AGG 0.442364 8:-55953788 MsG0880045218.01.T04:CDS
GAACTAAGCAATTCAACAAA+TGG 0.442698 8:-55953629 MsG0880045218.01.T04:CDS
GTAAGGTACAAAATAGCATT+AGG 0.442920 8:-55953311 MsG0880045218.01.T04:CDS
TTTCTGCTGCTACAGGTCAA+TGG 0.445390 8:-55953916 MsG0880045218.01.T04:CDS
GATGAATTCGAGAGAGGAAC+TGG 0.449876 8:-55953674 MsG0880045218.01.T04:CDS
CGACCAACGCTTCTTGTGAT+GGG 0.451284 8:+55954445 None:intergenic
TGGAATGTTTGATGGTAGTT+GGG 0.454422 8:-55952878 MsG0880045218.01.T04:CDS
TTGGAAGCTAGAGAAGTTGA+AGG 0.454437 8:+55954552 None:intergenic
GTTTGGGAGTTATATGGAAA+AGG 0.454850 8:-55952957 MsG0880045218.01.T04:CDS
TTCAATTCAAGTTTGAAAAG+TGG 0.456505 8:-55953863 MsG0880045218.01.T04:CDS
GGAAAAGGTGAATTATTTGA+AGG 0.457485 8:-55952942 MsG0880045218.01.T04:CDS
GTCTAGAAAATCTCTATTGT+AGG 0.457767 8:-55952640 None:intergenic
CTTGGAGAAGGTGGATTTGG+AGG 0.458740 8:-55953587 MsG0880045218.01.T04:CDS
GTTGGTTTAAGTGTCGGTTT+CGG 0.460090 8:-55953809 MsG0880045218.01.T04:CDS
GTAGAGTTTCCATTAAAAGT+TGG 0.460518 8:+55953995 None:intergenic
TTATTTGAAGGAGTTGATAG+AGG 0.460987 8:-55952930 MsG0880045218.01.T04:CDS
AAAAGAAAAGTACTAAATAA+GGG 0.462423 8:-55953740 MsG0880045218.01.T04:CDS
TGAATAAGTGGAGGATCCTT+TGG 0.465519 8:+55952677 None:intergenic
AAGGAAAATGGAATGTTTGA+TGG 0.474881 8:-55952886 MsG0880045218.01.T04:CDS
ACTTATTCATCATTGTCAGC+AGG 0.476041 8:-55952663 MsG0880045218.01.T04:CDS
TTACCAGAATATGTTAGGAT+TGG 0.476305 8:-55953941 MsG0880045218.01.T04:CDS
AAGTACTAAATAAGGGAGAA+AGG 0.478175 8:-55953733 MsG0880045218.01.T04:CDS
AATCGGTTCAAAATGTTTCG+TGG 0.478516 8:-55954114 MsG0880045218.01.T04:CDS
CCGGTGCGGTTGCGAATGCT+TGG 0.481806 8:-55954075 MsG0880045218.01.T04:CDS
TATGATTAACATGGAAAATG+AGG 0.483313 8:+55954621 None:intergenic
AAAGGAAAGCTTGGAGAAGG+TGG 0.487463 8:-55953596 MsG0880045218.01.T04:CDS
TTGAAGGAAATTGAGTGTGC+AGG 0.487799 8:+55954568 None:intergenic
AAATACACAACATTCTAACT+TGG 0.488033 8:-55953889 MsG0880045218.01.T04:CDS
AGAAAGTTAGGCTTGTGGAA+TGG 0.493194 8:-55952980 MsG0880045218.01.T04:CDS
TTAGGAGTTGGTTTAAGTGT+CGG 0.500384 8:-55953815 MsG0880045218.01.T04:CDS
TTTGGGATTTCGGATTGAAA+CGG 0.504474 8:+55954286 None:intergenic
ATTCCAACATGATCAGAACT+TGG 0.505791 8:+55954154 None:intergenic
AATTCAGCAGGTGGTTACCT+TGG 0.506266 8:-55954262 MsG0880045218.01.T04:CDS
AATTTATCGCTGTTTGGTGA+CGG 0.508407 8:-55954328 MsG0880045218.01.T04:CDS
ATTTGGTTCAACTCTTAGGT+TGG 0.512916 8:-55953433 MsG0880045218.01.T04:CDS
AGTACTAAATAAGGGAGAAA+GGG 0.513948 8:-55953732 MsG0880045218.01.T04:CDS
TCTTTATTTACATGAAGAGT+GGG 0.518463 8:-55953273 MsG0880045218.01.T04:CDS
GCGACCAACGCTTCTTGTGA+TGG 0.520325 8:+55954444 None:intergenic
AAAAGTTGGATTATCAACAT+AGG 0.522518 8:+55954009 None:intergenic
TTCTTTATTTACATGAAGAG+TGG 0.526620 8:-55953274 MsG0880045218.01.T04:CDS
TAAATTTGGAATTTGATGAA+AGG 0.528989 8:-55952905 MsG0880045218.01.T04:CDS
GAAATCCCAAATAATTCAGC+AGG 0.533501 8:-55954274 MsG0880045218.01.T04:CDS
ATCCTTTGGTTGTGTTTGTG+AGG 0.534075 8:+55952691 None:intergenic
TTGATTATAGTATGAAGCAT+AGG 0.540811 8:+55954654 None:intergenic
CCAAGCATTCGCAACCGCAC+CGG 0.544891 8:+55954075 None:intergenic
GCTGTGAAGAGGGTTTCAAA+AGG 0.548986 8:-55953521 MsG0880045218.01.T04:CDS
TTATCATCTATTTGGAAAAG+GGG 0.552988 8:-55953351 MsG0880045218.01.T04:CDS
GGCCCCATCACAAGAAGCGT+TGG 0.555961 8:-55954448 MsG0880045218.01.T04:CDS
TTGTGATGGGGCCATCAAGT+TGG 0.558562 8:+55954458 None:intergenic
TCTTTATCATAAAGCTTCAG+TGG 0.559720 8:+55954406 None:intergenic
ATCTATTGAGTCAAATGAAG+AGG 0.561832 8:-55953006 MsG0880045218.01.T04:CDS
TGCTGACAATGATGAATAAG+TGG 0.562680 8:+55952665 None:intergenic
AGACTAGTAGATCATGAACT+TGG 0.565557 8:-55953161 MsG0880045218.01.T04:CDS
CTTATTCATCATTGTCAGCA+GGG 0.566451 8:-55952662 MsG0880045218.01.T04:CDS
GGATTTGGAGGTGTTTACAA+AGG 0.567330 8:-55953575 MsG0880045218.01.T04:CDS
ATTGGAAGTAGCTGTGAAGA+GGG 0.572849 8:-55953531 MsG0880045218.01.T04:CDS
CTGTGAAGAGGGTTTCAAAA+GGG 0.574404 8:-55953520 MsG0880045218.01.T04:CDS
TAGAGGAAAATGCATCACCT+TGG 0.576657 8:+55954506 None:intergenic
TCAAGTTTGAAAAGTGGTAA+CGG 0.581492 8:-55953857 MsG0880045218.01.T04:CDS
ATAGGAGGTGCAAAGTACAT+AGG 0.586423 8:+55952747 None:intergenic
TGATAATCAAGACTTCCATT+AGG 0.586672 8:+55953368 None:intergenic
GACCAACGCTTCTTGTGATG+GGG 0.588247 8:+55954446 None:intergenic
GATCCAAGTTCTGATCATGT+TGG 0.592567 8:-55954157 MsG0880045218.01.T04:CDS
AATCTACACATTTCCATAGG+AGG 0.592781 8:+55952732 None:intergenic
GTTTCAAAAGGGTCAAGACA+AGG 0.592958 8:-55953509 MsG0880045218.01.T04:CDS
AATTGGAAGTAGCTGTGAAG+AGG 0.593314 8:-55953532 MsG0880045218.01.T04:CDS
GAAAATCTACACATTTCCAT+AGG 0.595441 8:+55952729 None:intergenic
GGCTAAGAAAGTTAGGCTTG+TGG 0.599578 8:-55952985 MsG0880045218.01.T04:CDS
GGCCTCACAAACACAACCAA+AGG 0.600918 8:-55952693 MsG0880045218.01.T04:CDS
ATCCCAAATAATTCAGCAGG+TGG 0.601389 8:-55954271 MsG0880045218.01.T04:CDS
CTATATCTAATAAAATTCCA+AGG 0.602985 8:-55954523 MsG0880045218.01.T04:CDS
TTTGAAGGAAGACTAGGCAA+AGG 0.606211 8:+55952780 None:intergenic
GGTGCAAAGTACATAGGCAC+AGG 0.608989 8:+55952753 None:intergenic
CACCTGAATGTGTTACAACA+GGG 0.630249 8:-55953097 MsG0880045218.01.T04:CDS
AGTGAAAATTATGATTAACA+TGG 0.647690 8:+55954612 None:intergenic
GACGAAGATGAATTCGAGAG+AGG 0.649543 8:-55953680 MsG0880045218.01.T04:CDS
TTTCAAAAGGGTCAAGACAA+GGG 0.652934 8:-55953508 MsG0880045218.01.T04:CDS
AGCATAGGTGAAGATAGCCA+TGG 0.653100 8:+55954669 None:intergenic
TGAAGAGTGGGAACAATGTG+TGG 0.683197 8:-55953261 MsG0880045218.01.T04:CDS
ATTCCTCACTGAATAAACCA+AGG 0.690906 8:+55954245 None:intergenic
TTACCTTGGTTTATTCAGTG+AGG 0.694593 8:-55954248 MsG0880045218.01.T04:CDS
GTTGCACTTGAAATCACATG+TGG 0.733002 8:-55953035 MsG0880045218.01.T04:CDS
TGACAATGATGAATAAGTGG+AGG 0.755153 8:+55952668 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! AAAAAGAAAAGTACTAAATA+AGG - Chr8:55953567-55953586 MsG0880045218.01.T04:CDS 15.0%
!!! AAAAGAAAAGTACTAAATAA+GGG - Chr8:55953568-55953587 MsG0880045218.01.T04:CDS 15.0%
!! ACTTGAAAAAAACAACAAAT+TGG - Chr8:55953759-55953778 MsG0880045218.01.T04:CDS 20.0%
!! AGTGAAAATTATGATTAACA+TGG + Chr8:55952699-55952718 None:intergenic 20.0%
!! ATTATCATCTATTTGGAAAA+GGG - Chr8:55953956-55953975 MsG0880045218.01.T04:CDS 20.0%
!! CTATATCTAATAAAATTCCA+AGG - Chr8:55952785-55952804 MsG0880045218.01.T04:CDS 20.0%
!! TTATTAGATATAGGTTTGAT+TGG + Chr8:55952778-55952797 None:intergenic 20.0%
!!! CTTGGAATTTTATTAGATAT+AGG + Chr8:55952787-55952806 None:intergenic 20.0%
!!! TAAATTTGGAATTTGATGAA+AGG - Chr8:55954403-55954422 MsG0880045218.01.T04:CDS 20.0%
! AAAAGTTGGATTATCAACAT+AGG + Chr8:55953302-55953321 None:intergenic 25.0%
! AAATACACAACATTCTAACT+TGG - Chr8:55953419-55953438 MsG0880045218.01.T04:CDS 25.0%
! AGTCTTGATTATCATCTATT+TGG - Chr8:55953949-55953968 MsG0880045218.01.T04:CDS 25.0%
! ATTAACAGCTCTCATAATAA+AGG + Chr8:55952963-55952982 None:intergenic 25.0%
! CAATGTTAATTCGATTCAAT+CGG - Chr8:55953177-55953196 MsG0880045218.01.T04:CDS 25.0%
! GATTATCATCTATTTGGAAA+AGG - Chr8:55953955-55953974 MsG0880045218.01.T04:CDS 25.0%
! TATGATTAACATGGAAAATG+AGG + Chr8:55952690-55952709 None:intergenic 25.0%
! TGATAGTTATTGGAATGATT+GGG - Chr8:55953129-55953148 MsG0880045218.01.T04:CDS 25.0%
! TTAATCACTTGTCTTATAGA+AGG + Chr8:55954489-55954508 None:intergenic 25.0%
! TTATCATCTATTTGGAAAAG+GGG - Chr8:55953957-55953976 MsG0880045218.01.T04:CDS 25.0%
! TTGATTATAGTATGAAGCAT+AGG + Chr8:55952657-55952676 None:intergenic 25.0%
!! AAGTTTTACCAGAATATGTT+AGG - Chr8:55953362-55953381 MsG0880045218.01.T04:CDS 25.0%
!! CTGTAGAATTTGATAGTTAT+TGG - Chr8:55953119-55953138 MsG0880045218.01.T04:CDS 25.0%
!! TCTTTATTTACATGAAGAGT+GGG - Chr8:55954035-55954054 MsG0880045218.01.T04:CDS 25.0%
!! TTCAATTCAAGTTTGAAAAG+TGG - Chr8:55953445-55953464 MsG0880045218.01.T04:CDS 25.0%
!! TTCTTTATTTACATGAAGAG+TGG - Chr8:55954034-55954053 MsG0880045218.01.T04:CDS 25.0%
!! TTGATAGTTATTGGAATGAT+TGG - Chr8:55953128-55953147 MsG0880045218.01.T04:CDS 25.0%
!!! ACAAATGGTTTTGATGAAAA+AGG - Chr8:55953694-55953713 MsG0880045218.01.T04:CDS 25.0%
!!! AGTTGATAGAGGATTAAATT+TGG - Chr8:55954389-55954408 MsG0880045218.01.T04:CDS 25.0%
!!! GTTGATAATCCAACTTTTAA+TGG - Chr8:55953304-55953323 MsG0880045218.01.T04:CDS 25.0%
AAACCAATCCTAACATATTC+TGG + Chr8:55953373-55953392 None:intergenic 30.0%
AAGGAAAATGGAATGTTTGA+TGG - Chr8:55954422-55954441 MsG0880045218.01.T04:CDS 30.0%
AAGTACTAAATAAGGGAGAA+AGG - Chr8:55953575-55953594 MsG0880045218.01.T04:CDS 30.0%
AGTACTAAATAAGGGAGAAA+GGG - Chr8:55953576-55953595 MsG0880045218.01.T04:CDS 30.0%
ATCTATTGAGTCAAATGAAG+AGG - Chr8:55954302-55954321 MsG0880045218.01.T04:CDS 30.0%
CAAATTCTACAGCTACTATT+TGG + Chr8:55953111-55953130 None:intergenic 30.0%
CAAGCTAAGACATAGAAATT+TGG - Chr8:55953858-55953877 MsG0880045218.01.T04:CDS 30.0%
CATAGGTAAGAAAAACAGAA+AGG + Chr8:55953285-55953304 None:intergenic 30.0%
CTAACAAAAAACCAACTTGA+TGG - Chr8:55952839-55952858 MsG0880045218.01.T04:CDS 30.0%
GAAAATCTACACATTTCCAT+AGG + Chr8:55954582-55954601 None:intergenic 30.0%
GAACTAAGCAATTCAACAAA+TGG - Chr8:55953679-55953698 MsG0880045218.01.T04:CDS 30.0%
GAATCTGATGTTTATAGCTT+TGG - Chr8:55954246-55954265 MsG0880045218.01.T04:CDS 30.0%
GGAAAAGGTGAATTATTTGA+AGG - Chr8:55954366-55954385 MsG0880045218.01.T04:CDS 30.0%
GGAATTTGATGAAAGGAAAA+TGG - Chr8:55954410-55954429 MsG0880045218.01.T04:CDS 30.0%
GTAAGGTACAAAATAGCATT+AGG - Chr8:55953997-55954016 MsG0880045218.01.T04:CDS 30.0%
GTAGAGTTTCCATTAAAAGT+TGG + Chr8:55953316-55953335 None:intergenic 30.0%
GTTTATGAATACATGCCTAA+TGG - Chr8:55953925-55953944 MsG0880045218.01.T04:CDS 30.0%
TCAAGTTTGAAAAGTGGTAA+CGG - Chr8:55953451-55953470 MsG0880045218.01.T04:CDS 30.0%
TCTTTATCATAAAGCTTCAG+TGG + Chr8:55952905-55952924 None:intergenic 30.0%
TGATAATCAAGACTTCCATT+AGG + Chr8:55953943-55953962 None:intergenic 30.0%
TGGAAGAGTAACATAAAAAC+CGG - Chr8:55953214-55953233 MsG0880045218.01.T04:CDS 30.0%
TTACCAGAATATGTTAGGAT+TGG - Chr8:55953367-55953386 MsG0880045218.01.T04:CDS 30.0%
TTTGATGAAAAAGGAAAGCT+TGG - Chr8:55953703-55953722 MsG0880045218.01.T04:CDS 30.0%
! AGAAATTTGGTTCAACTCTT+AGG - Chr8:55953871-55953890 MsG0880045218.01.T04:CDS 30.0%
! AGATTTTCATACACTTCAGA+TGG - Chr8:55954594-55954613 MsG0880045218.01.T04:CDS 30.0%
! TCTTTGTAAGTGAACCTTTT+TGG + Chr8:55953661-55953680 None:intergenic 30.0%
! TGCTGAATTATTTGGGATTT+CGG + Chr8:55953035-55953054 None:intergenic 30.0%
!! AAAAACTTGAAGGTTGGTTT+AGG - Chr8:55953475-55953494 MsG0880045218.01.T04:CDS 30.0%
!! TTATTTGAAGGAGTTGATAG+AGG - Chr8:55954378-55954397 MsG0880045218.01.T04:CDS 30.0%
AACCACCTGCTGAATTATTT+GGG + Chr8:55953042-55953061 None:intergenic 35.0%
AACGGAAAAAACTTGAAGGT+TGG - Chr8:55953469-55953488 MsG0880045218.01.T04:CDS 35.0%
AAGACCAAAATCACCAAGTT+TGG + Chr8:55954124-55954143 None:intergenic 35.0%
AATCTACACATTTCCATAGG+AGG + Chr8:55954579-55954598 None:intergenic 35.0%
ACTTATTCATCATTGTCAGC+AGG - Chr8:55954645-55954664 MsG0880045218.01.T03:CDS 35.0%
AGACTAGTAGATCATGAACT+TGG - Chr8:55954147-55954166 MsG0880045218.01.T04:CDS 35.0%
ATGAAGAGGCTAAGAAAGTT+AGG - Chr8:55954316-55954335 MsG0880045218.01.T04:CDS 35.0%
ATTCCAACATGATCAGAACT+TGG + Chr8:55953157-55953176 None:intergenic 35.0%
ATTCCTCACTGAATAAACCA+AGG + Chr8:55953066-55953085 None:intergenic 35.0%
CTTATTCATCATTGTCAGCA+GGG - Chr8:55954646-55954665 MsG0880045218.01.T03:CDS 35.0%
GAAATCCCAAATAATTCAGC+AGG - Chr8:55953034-55953053 MsG0880045218.01.T04:CDS 35.0%
GCAAATTTCAATGCCAAACT+TGG - Chr8:55954108-55954127 MsG0880045218.01.T04:CDS 35.0%
GCTGTTAATTTATCGCTGTT+TGG - Chr8:55952974-55952993 MsG0880045218.01.T04:CDS 35.0%
GTTTGGGAGTTATATGGAAA+AGG - Chr8:55954351-55954370 MsG0880045218.01.T04:CDS 35.0%
TAACCACCTGCTGAATTATT+TGG + Chr8:55953043-55953062 None:intergenic 35.0%
TAGCTGAAGAACATTGTTAG+AGG + Chr8:55952822-55952841 None:intergenic 35.0%
TGACAATGATGAATAAGTGG+AGG + Chr8:55954643-55954662 None:intergenic 35.0%
TGCTGACAATGATGAATAAG+TGG + Chr8:55954646-55954665 None:intergenic 35.0%
TTACCTTGGTTTATTCAGTG+AGG - Chr8:55953060-55953079 MsG0880045218.01.T04:CDS 35.0%
TTATGCTTACTTGGAGTGTA+AGG - Chr8:55953980-55953999 MsG0880045218.01.T04:CDS 35.0%
TTTCAAAAGGGTCAAGACAA+GGG - Chr8:55953800-55953819 MsG0880045218.01.T04:CDS 35.0%
! AATCGGTTCAAAATGTTTCG+TGG - Chr8:55953194-55953213 MsG0880045218.01.T04:CDS 35.0%
! AATTTATCGCTGTTTGGTGA+CGG - Chr8:55952980-55952999 MsG0880045218.01.T04:CDS 35.0%
! ATGGAATGTTTGATGGTAGT+TGG - Chr8:55954429-55954448 MsG0880045218.01.T04:CDS 35.0%
! ATTTGGTTCAACTCTTAGGT+TGG - Chr8:55953875-55953894 MsG0880045218.01.T04:CDS 35.0%
! GTCATCCAGATTTTACTATG+AGG - Chr8:55954463-55954482 MsG0880045218.01.T04:CDS 35.0%
! TGGAATGTTTGATGGTAGTT+GGG - Chr8:55954430-55954449 MsG0880045218.01.T04:CDS 35.0%
! TGGTTCTCAAACAACTGTTT+TGG - Chr8:55954167-55954186 MsG0880045218.01.T04:CDS 35.0%
! TTAGGAGTTGGTTTAAGTGT+CGG - Chr8:55953493-55953512 MsG0880045218.01.T04:CDS 35.0%
! TTTGGGATTTCGGATTGAAA+CGG + Chr8:55953025-55953044 None:intergenic 35.0%
!! AATGCCAAACTTGGTGATTT+TGG - Chr8:55954117-55954136 MsG0880045218.01.T04:CDS 35.0%
!! GTGTGTTATGGTTCACTTTT+TGG - Chr8:55953542-55953561 MsG0880045218.01.T04:CDS 35.0%
!! TGGTAACGGAAAAAACTTGA+AGG - Chr8:55953465-55953484 MsG0880045218.01.T04:CDS 35.0%
AATTGGAAGTAGCTGTGAAG+AGG - Chr8:55953776-55953795 MsG0880045218.01.T04:CDS 40.0%
AGAAAGTTAGGCTTGTGGAA+TGG - Chr8:55954328-55954347 MsG0880045218.01.T04:CDS 40.0%
ATCCCAAATAATTCAGCAGG+TGG - Chr8:55953037-55953056 MsG0880045218.01.T04:CDS 40.0%
ATCCTTTGGTTGTGTTTGTG+AGG + Chr8:55954620-55954639 None:intergenic 40.0%
ATTGGAAGTAGCTGTGAAGA+GGG - Chr8:55953777-55953796 MsG0880045218.01.T04:CDS 40.0%
CACCTGAATGTGTTACAACA+GGG - Chr8:55954211-55954230 MsG0880045218.01.T04:CDS 40.0%
CTGTGAAGAGGGTTTCAAAA+GGG - Chr8:55953788-55953807 MsG0880045218.01.T04:CDS 40.0%
GAAAAAGGAAAGCTTGGAGA+AGG - Chr8:55953709-55953728 MsG0880045218.01.T04:CDS 40.0%
GAAAAGGGGTTATGCTTACT+TGG - Chr8:55953971-55953990 MsG0880045218.01.T04:CDS 40.0%
GAAAGTTAGGCTTGTGGAAT+GGG - Chr8:55954329-55954348 MsG0880045218.01.T04:CDS 40.0%
GAAGGCCTCATAGTAAAATC+TGG + Chr8:55954471-55954490 None:intergenic 40.0%
GAGTAACATAAAAACCGGTG+CGG - Chr8:55953219-55953238 MsG0880045218.01.T04:CDS 40.0%
GTTGCACTTGAAATCACATG+TGG - Chr8:55954273-55954292 MsG0880045218.01.T04:CDS 40.0%
GTTTCAAAAGGGTCAAGACA+AGG - Chr8:55953799-55953818 MsG0880045218.01.T04:CDS 40.0%
TAGAGGAAAATGCATCACCT+TGG + Chr8:55952805-55952824 None:intergenic 40.0%
TATGTACTTTGCACCTCCTA+TGG - Chr8:55954563-55954582 MsG0880045218.01.T04:CDS 40.0%
TGAATAAGTGGAGGATCCTT+TGG + Chr8:55954634-55954653 None:intergenic 40.0%
TTCCCTGTTGTAACACATTC+AGG + Chr8:55954216-55954235 None:intergenic 40.0%
TTGAAGGAAATTGAGTGTGC+AGG + Chr8:55952743-55952762 None:intergenic 40.0%
TTGGAAGCTAGAGAAGTTGA+AGG + Chr8:55952759-55952778 None:intergenic 40.0%
TTTGAAGGAAGACTAGGCAA+AGG + Chr8:55954531-55954550 None:intergenic 40.0%
! ATAGGAGGTGCAAAGTACAT+AGG + Chr8:55954564-55954583 None:intergenic 40.0%
! ATAGGCACAGGCAATTTTGA+AGG + Chr8:55954546-55954565 None:intergenic 40.0%
! CATGGAAAATGAGGTGTTCT+TGG + Chr8:55952681-55952700 None:intergenic 40.0%
! GAATGGGTTTGGGAGTTATA+TGG - Chr8:55954345-55954364 MsG0880045218.01.T04:CDS 40.0%
! GATCCAAGTTCTGATCATGT+TGG - Chr8:55953151-55953170 MsG0880045218.01.T04:CDS 40.0%
! GTTTGATGGTAGTTGGGTTA+TGG - Chr8:55954436-55954455 MsG0880045218.01.T04:CDS 40.0%
!! GGATTTGGAGGTGTTTACAA+AGG - Chr8:55953733-55953752 MsG0880045218.01.T04:CDS 40.0%
!! GGCAATTTTGAAGGAAGACT+AGG + Chr8:55954537-55954556 None:intergenic 40.0%
!! GGTTCTTTAACTTGCTTCGT+AGG - Chr8:55953520-55953539 MsG0880045218.01.T04:CDS 40.0%
!! GTTGGTTTAAGTGTCGGTTT+CGG - Chr8:55953499-55953518 MsG0880045218.01.T04:CDS 40.0%
!! TTGAAGGTTGGTTTAGGAGT+TGG - Chr8:55953481-55953500 MsG0880045218.01.T04:CDS 40.0%
!!! AACTGTTTTGGCAGGAACTA+TGG - Chr8:55954179-55954198 MsG0880045218.01.T04:CDS 40.0%
!!! ACTGTTTTGGCAGGAACTAT+GGG - Chr8:55954180-55954199 MsG0880045218.01.T04:CDS 40.0%
!!! ATTGGTTTTTCTGCTGCTAC+AGG - Chr8:55953385-55953404 MsG0880045218.01.T04:CDS 40.0%
!!! TCTCAAACAACTGTTTTGGC+AGG - Chr8:55954171-55954190 MsG0880045218.01.T04:CDS 40.0%
AAAGGAAAGCTTGGAGAAGG+TGG - Chr8:55953712-55953731 MsG0880045218.01.T04:CDS 45.0%
AATTCAGCAGGTGGTTACCT+TGG - Chr8:55953046-55953065 MsG0880045218.01.T04:CDS 45.0%
AGAGAGGAACTGGTCCAAAA+AGG - Chr8:55953644-55953663 MsG0880045218.01.T04:CDS 45.0%
AGGGTCAAGACAAGGGAAAA+AGG - Chr8:55953807-55953826 MsG0880045218.01.T04:CDS 45.0%
CTTGCTTCGTAGGTGTGTTA+TGG - Chr8:55953530-55953549 MsG0880045218.01.T04:CDS 45.0%
GACGAAGATGAATTCGAGAG+AGG - Chr8:55953628-55953647 MsG0880045218.01.T04:CDS 45.0%
GATGAATTCGAGAGAGGAAC+TGG - Chr8:55953634-55953653 MsG0880045218.01.T04:CDS 45.0%
GCACCTGAATGTGTTACAAC+AGG - Chr8:55954210-55954229 MsG0880045218.01.T04:CDS 45.0%
GCTGTGAAGAGGGTTTCAAA+AGG - Chr8:55953787-55953806 MsG0880045218.01.T04:CDS 45.0%
GGCTAAGAAAGTTAGGCTTG+TGG - Chr8:55954323-55954342 MsG0880045218.01.T04:CDS 45.0%
TGAAGAGTGGGAACAATGTG+TGG - Chr8:55954047-55954066 MsG0880045218.01.T04:CDS 45.0%
TGACGGTCTATCGTTCTTCA+TGG - Chr8:55952997-55953016 MsG0880045218.01.T04:CDS 45.0%
TTTCTGCTGCTACAGGTCAA+TGG - Chr8:55953392-55953411 MsG0880045218.01.T04:CDS 45.0%
! AAGCTTGGAGAAGGTGGATT+TGG - Chr8:55953718-55953737 MsG0880045218.01.T04:CDS 45.0%
! TAGGCTTGTGGAATGGGTTT+GGG - Chr8:55954335-55954354 MsG0880045218.01.T04:CDS 45.0%
! TTAGGCTTGTGGAATGGGTT+TGG - Chr8:55954334-55954353 MsG0880045218.01.T04:CDS 45.0%
CGACCAACGCTTCTTGTGAT+GGG + Chr8:55952866-55952885 None:intergenic 50.0%
GACCAACGCTTCTTGTGATG+GGG + Chr8:55952865-55952884 None:intergenic 50.0%
GGCCTCACAAACACAACCAA+AGG - Chr8:55954615-55954634 MsG0880045218.01.T03:CDS 50.0%
GGTGCAAAGTACATAGGCAC+AGG + Chr8:55954558-55954577 None:intergenic 50.0%
! CTTGGAGAAGGTGGATTTGG+AGG - Chr8:55953721-55953740 MsG0880045218.01.T04:CDS 50.0%
! TTGTGATGGGGCCATCAAGT+TGG + Chr8:55952853-55952872 None:intergenic 50.0%
GCGACCAACGCTTCTTGTGA+TGG + Chr8:55952867-55952886 None:intergenic 55.0%
CCAAGCATTCGCAACCGCAC+CGG + Chr8:55953236-55953255 None:intergenic 60.0%
! GGCCCCATCACAAGAAGCGT+TGG - Chr8:55952860-55952879 MsG0880045218.01.T04:CDS 60.0%
CCGGTGCGGTTGCGAATGCT+TGG - Chr8:55953233-55953252 MsG0880045218.01.T04:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 55952641 55954689 55952641 ID=MsG0880045218.01;Name=MsG0880045218.01
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Chr8 exon 55953840 55954632 55953840 ID=MsG0880045218.01.T01:exon:24113;Parent=MsG0880045218.01.T01
Chr8 CDS 55953840 55954632 55953840 ID=MsG0880045218.01.T01:cds;Parent=MsG0880045218.01.T01
Chr8 CDS 55952641 55953701 55952641 ID=MsG0880045218.01.T01:cds;Parent=MsG0880045218.01.T01
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Chr8 exon 55952641 55953734 55952641 ID=MsG0880045218.01.T02:exon:24116;Parent=MsG0880045218.01.T02
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Chr8 mRNA 55952641 55954632 55952641 ID=MsG0880045218.01.T04;Parent=MsG0880045218.01;Name=MsG0880045218.01.T04;_AED=0.02;_eAED=0.02;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|663
Chr8 exon 55952641 55954632 55952641 ID=MsG0880045218.01.T04:exon:24118;Parent=MsG0880045218.01.T04
Chr8 CDS 55952641 55954632 55952641 ID=MsG0880045218.01.T04:cds;Parent=MsG0880045218.01.T04
Gene Sequence

>MsG0880045218.01.T01

ATGTTAATCATAATTTTCACTTTGTTCTATGCGTTTTTCAATCCTGCACACTCAATTTCCTTCAACTTCTCTAGCTTCCAATCAAACCTATATCTAATAAAATTCCAAGGTGATGCATTTTCCTCTAACAATGTTCTTCAGCTAACAAAAAACCAACTTGATGGCCCCATCACAAGAAGCGTTGGTCGCGCTTCGTTTGATCAACCACTGAAGCTTTATGATAAAGAAACAAAAGAGCTCACTGATTTCACAACACATTTCACCTTTATTATGAGAGCTGTTAATTTATCGCTGTTTGGTGACGGTCTATCGTTCTTCATGGCTCCGTTTCAATCCGAAATCCCAAATAATTCAGCAGGTGGTTACCTTGGTTTATTCAGTGAGGAATCTGCACTCAACACTAGCAAAAACCAAATAGTAGCTGTAGAATTTGATAGTTATTGGAATGATTGGGATCCAAGTTCTGATCATGTTGGAATCAATGTTAATTCGATTCAATCGGTTCAAAATGTTTCGTGGAAGAGTAACATAAAAACCGGTGCGGTTGCGAATGCTTGGATATCATATAACTCAACTACAAAAAACCTTTCTGTTTTTCTTACCTATGTTGATAATCCAACTTTTAATGGAAACTCTACTCTTTCATATAATATTGATTTGAGTGAAGTTTTACCAGAATATGTTAGGATTGGTTTTTCTGCTGCTACAGGTCAATGGATTGAAATACACAACATTCTAACTTGGTCTTTCAATTCAAGTTTGAAAAGTGGTAACGGAAAAAACTTGAAGGTTGACGAAGATGAATTCGAGAGAGGAACTGGTCCAAAAAGGTTCACTTACAAAGAACTAAGCAATTCAACAAATGGTTTTGATGAAAAAGGAAAGCTTGGAGAAGGTGGATTTGGAGGTGTTTACAAAGGTTTACTTGAAAAAAACAACAAATTGGAAGTAGCTGTGAAGAGGGTTTCAAAAGGGTCAAGACAAGGGAAAAAGGAGTACATATCAGAAGTAAGAATTATAAGCAAGCTAAGACATAGAAATTTGGTTCAACTCTTAGGTTGGTGTCATGAAAAAAGTGAGCTTTTACTTGTTTATGAATACATGCCTAATGGAAGTCTTGATTATCATCTATTTGGAAAAGGGGTTATGCTTACTTGGAGTGTAAGGTACAAAATAGCATTAGGTATAGCATCATCTCTTCTTTATTTACATGAAGAGTGGGAACAATGTGTGGTGCATAGAGATATTAAGTCAAGCAATGTAATGCTAGATGCAAATTTCAATGCCAAACTTGGTGATTTTGGTCTTGCAAGACTAGTAGATCATGAACTTGGTTCTCAAACAACTGTTTTGGCAGGAACTATGGGATACTTAGCACCTGAATGTGTTACAACAGGGAAATCAAGTAAAGAATCTGATGTTTATAGCTTTGGTGTTGTTGCACTTGAAATCACATGTGGTAGAAGATCTATTGAGTCAAATGAAGAGGCTAAGAAAGTTAGGCTTGTGGAATGGGTTTGGGAGTTATATGGAAAAGGTGAATTATTTGAAGGAGTTGATAGAGGATTAAATTTGGAATTTGATGAAAGGAAAATGGAATGTTTGATGGTAGTTGGGTTATGGTGTTGTCATCCAGATTTTACTATGAGGCCTTCTATAAGACAAGTGATTAATGTTTTGAATTTTGAAGCTCCTTTGCCTAGTCTTCCTTCAAAATTGCCTGTGCCTATGTACTTTGCACCTCCTATGGAAATGTGTAGATTTTCATACACTTCAGATGGCCTCACAAACACAACCAAAGGATCCTCCACTTATTCATCATTGTCAGCAGGGTCTAGAAAATCTCTATTGTAG

>MsG0880045218.01.T02

ATGGCTCCGTTTCAATCCGAAATCCCAAATAATTCAGCAGGTGGTTACCTTGGTTTATTCAGTGAGGAATCTGCACTCAACACTAGCAAAAACCAAATAGTAGCTGTAGAATTTGATAGTTATTGGAATGATTGGGATCCAAGTTCTGATCATGTTGGAATCAATGTTAATTCGATTCAATCGGTTCAAAATGTTTCGTGGAAGAGTAACATAAAAACCGGTGCGGTTGCGAATGCTTGGATATCATATAACTCAACTACAAAAAACCTTTCTGTTTTTCTTACCTATGTTGATAATCCAACTTTTAATGGAAACTCTACTCTTTCATATAATATTGATTTGAGTGAAGTTTTACCAGAATATGTTAGGATTGGTTTTTCTGCTGCTACAGGGGACAATAATAGAGATTTTGATGCTTCTATAGACGAAGATGAATTCGAGAGAGGAACTGGTCCAAAAAGGTTCACTTACAAAGAACTAAGCAATTCAACAAATGGTTTTGATGAAAAAGGAAAGCTTGGAGAAGGTGGATTTGGAGGTGTTTACAAAGGTTTACTTGAAAAAAACAACAAATTGGAAGTAGCTGTGAAGAGGGTTTCAAAAGGGTCAAGACAAGGGAAAAAGGAGTACATATCAGAAGTAAGAATTATAAGCAAGCTAAGACATAGAAATTTGGTTCAACTCTTAGGTTGGTGTCATGAAAAAAGTGAGCTTTTACTTGTTTATGAATACATGCCTAATGGAAGTCTTGATTATCATCTATTTGGAAAAGGGGTTATGCTTACTTGGAGTGTAAGGTACAAAATAGCATTAGGTATAGCATCATCTCTTCTTTATTTACATGAAGAGTGGGAACAATGTGTGGTGCATAGAGATATTAAGTCAAGCAATGTAATGCTAGATGCAAATTTCAATGCCAAACTTGGTGATTTTGGTCTTGCAAGACTAGTAGATCATGAACTTGGTTCTCAAACAACTGTTTTGGCAGGAACTATGGGATACTTAGCACCTGAATGTGTTACAACAGGGAAATCAAGTAAAGAATCTGATGTTTATAGCTTTGGTGTTGTTGCACTTGAAATCACATGTGGTAGAAGATCTATTGAGTCAAATGAAGAGGCTAAGAAAGTTAGGCTTGTGGAATGGGTTTGGGAGTTATATGGAAAAGGTGAATTATTTGAAGGAGTTGATAGAGGATTAAATTTGGAATTTGATGAAAGGAAAATGGAATGTTTGATGGTAGTTGGGTTATGGTGTTGTCATCCAGATTTTACTATGAGGCCTTCTATAAGACAAGTGATTAATGTTTTGAATTTTGAAGCTCCTTTGCCTAGTCTTCCTTCAAAATTGCCTGTGCCTATGTACTTTGCACCTCCTATGGAAATGTGTAGATTTTCATACACTTCAGATGGCCTCACAAACACAACCAAAGGATCCTCCACTTATTCATCATTGTCAGCAGGGTCTAGAAAATCTCTATTGTAG

>MsG0880045218.01.T04

ATGTTAATCATAATTTTCACTTTGTTCTATGCGTTTTTCAATCCTGCACACTCAATTTCCTTCAACTTCTCTAGCTTCCAATCAAACCTATATCTAATAAAATTCCAAGGTGATGCATTTTCCTCTAACAATGTTCTTCAGCTAACAAAAAACCAACTTGATGGCCCCATCACAAGAAGCGTTGGTCGCGCTTCGTTTGATCAACCACTGAAGCTTTATGATAAAGAAACAAAAGAGCTCACTGATTTCACAACACATTTCACCTTTATTATGAGAGCTGTTAATTTATCGCTGTTTGGTGACGGTCTATCGTTCTTCATGGCTCCGTTTCAATCCGAAATCCCAAATAATTCAGCAGGTGGTTACCTTGGTTTATTCAGTGAGGAATCTGCACTCAACACTAGCAAAAACCAAATAGTAGCTGTAGAATTTGATAGTTATTGGAATGATTGGGATCCAAGTTCTGATCATGTTGGAATCAATGTTAATTCGATTCAATCGGTTCAAAATGTTTCGTGGAAGAGTAACATAAAAACCGGTGCGGTTGCGAATGCTTGGATATCATATAACTCAACTACAAAAAACCTTTCTGTTTTTCTTACCTATGTTGATAATCCAACTTTTAATGGAAACTCTACTCTTTCATATAATATTGATTTGAGTGAAGTTTTACCAGAATATGTTAGGATTGGTTTTTCTGCTGCTACAGGTCAATGGATTGAAATACACAACATTCTAACTTGGTCTTTCAATTCAAGTTTGAAAAGTGGTAACGGAAAAAACTTGAAGGTTGGTTTAGGAGTTGGTTTAAGTGTCGGTTTCGGTTCTTTAACTTGCTTCGTAGGTGTGTTATGGTTCACTTTTTGGAGAAAAAGAAAAGTACTAAATAAGGGAGAAAGGGACAATAATAGAGATTTTGATGCTTCTATAGACGAAGATGAATTCGAGAGAGGAACTGGTCCAAAAAGGTTCACTTACAAAGAACTAAGCAATTCAACAAATGGTTTTGATGAAAAAGGAAAGCTTGGAGAAGGTGGATTTGGAGGTGTTTACAAAGGTTTACTTGAAAAAAACAACAAATTGGAAGTAGCTGTGAAGAGGGTTTCAAAAGGGTCAAGACAAGGGAAAAAGGAGTACATATCAGAAGTAAGAATTATAAGCAAGCTAAGACATAGAAATTTGGTTCAACTCTTAGGTTGGTGTCATGAAAAAAGTGAGCTTTTACTTGTTTATGAATACATGCCTAATGGAAGTCTTGATTATCATCTATTTGGAAAAGGGGTTATGCTTACTTGGAGTGTAAGGTACAAAATAGCATTAGGTATAGCATCATCTCTTCTTTATTTACATGAAGAGTGGGAACAATGTGTGGTGCATAGAGATATTAAGTCAAGCAATGTAATGCTAGATGCAAATTTCAATGCCAAACTTGGTGATTTTGGTCTTGCAAGACTAGTAGATCATGAACTTGGTTCTCAAACAACTGTTTTGGCAGGAACTATGGGATACTTAGCACCTGAATGTGTTACAACAGGGAAATCAAGTAAAGAATCTGATGTTTATAGCTTTGGTGTTGTTGCACTTGAAATCACATGTGGTAGAAGATCTATTGAGTCAAATGAAGAGGCTAAGAAAGTTAGGCTTGTGGAATGGGTTTGGGAGTTATATGGAAAAGGTGAATTATTTGAAGGAGTTGATAGAGGATTAAATTTGGAATTTGATGAAAGGAAAATGGAATGTTTGATGGTAGTTGGGTTATGGTGTTGTCATCCAGATTTTACTATGAGGCCTTCTATAAGACAAGTGATTAATGTTTTGAATTTTGAAGCTCCTTTGCCTAGTCTTCCTTCAAAATTGCCTGTGCCTATGTACTTTGCACCTCCTATGGAAATGTGTAGATTTTCATACACTTCAGATGGCCTCACAAACACAACCAAAGGATCCTCCACTTATTCATCATTGTCAGCAGGGTCTAGAAAATCTCTATTGTAG

>MsG0880045218.01.T03

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Protein sequence

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