AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880047736.01

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MsG0880047736.01.T01 AT4G01330 44.599 287 155 3 37 321 150 434 3.07e-73 234
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MsG0880047736.01.T01 AT2G20850 38.816 304 177 4 32 329 461 761 1.24e-63 215
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MsG0880047736.01.T01 AT2G25220 42.361 288 157 4 37 320 139 421 2.07e-63 207
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MsG0880047736.01.T01 AT5G18910 38.699 292 167 6 33 321 176 458 3.26e-63 209
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MsG0880047736.01.T01 AT5G10290 41.522 289 164 4 37 321 278 565 3.33e-63 211
MsG0880047736.01.T01 AT1G51890 40.210 286 166 4 32 317 555 835 4.02e-63 215
MsG0880047736.01.T01 AT1G51800 41.463 287 159 5 37 321 576 855 4.03e-63 215
MsG0880047736.01.T01 AT5G59270 40.550 291 167 5 33 321 333 619 4.21e-63 212
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MsG0880047736.01.T01 AT4G32300 39.041 292 174 4 37 327 483 771 3.88e-60 206
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MsG0880047736.01.T01 AT5G63710 40.411 292 162 6 37 321 242 528 7.44e-60 202
MsG0880047736.01.T01 AT5G63710 40.411 292 162 6 37 321 242 528 7.44e-60 202
MsG0880047736.01.T01 AT2G11520 38.514 296 172 6 36 324 212 504 7.67e-60 200
MsG0880047736.01.T01 AT4G23240 38.176 296 174 5 30 320 316 607 7.97e-60 203
MsG0880047736.01.T01 AT4G04540 40.283 283 160 5 37 317 312 587 8.11e-60 202
MsG0880047736.01.T01 AT2G19230 41.608 286 161 5 37 321 560 840 1.01e-59 207
MsG0880047736.01.T01 AT1G53730 39.161 286 161 5 37 315 404 683 1.05e-59 204
MsG0880047736.01.T01 AT3G13380 40.753 292 166 6 37 323 846 1135 1.07e-59 207
MsG0880047736.01.T01 AT2G19210 38.721 297 179 2 25 321 554 847 1.12e-59 206
MsG0880047736.01.T01 AT5G16000 40.000 290 164 6 37 321 300 584 1.17e-59 202
MsG0880047736.01.T01 AT4G04570 44.813 241 126 4 14 248 145 384 1.22e-59 197
MsG0880047736.01.T01 AT4G04540 40.283 283 160 5 37 317 341 616 1.25e-59 202
MsG0880047736.01.T01 AT4G21410 40.614 293 165 7 30 316 338 627 1.29e-59 203
MsG0880047736.01.T01 AT1G34300 39.274 303 163 6 29 321 466 757 1.45e-59 205
MsG0880047736.01.T01 AT5G63710 40.411 292 162 6 37 321 278 564 1.55e-59 201
MsG0880047736.01.T01 AT5G63710 40.411 292 162 6 37 321 277 563 1.55e-59 201
MsG0880047736.01.T01 AT5G59680 41.053 285 164 3 37 321 570 850 1.80e-59 205
MsG0880047736.01.T01 AT1G15530 41.812 287 159 6 37 320 349 630 1.87e-59 202
MsG0880047736.01.T01 AT4G35030 37.847 288 175 3 37 321 92 378 2.00e-59 197
MsG0880047736.01.T01 AT4G35030 37.847 288 175 3 37 321 92 378 2.00e-59 197
MsG0880047736.01.T01 AT4G35030 37.847 288 175 3 37 321 92 378 2.00e-59 197
MsG0880047736.01.T01 AT4G35030 37.847 288 175 3 37 321 92 378 2.00e-59 197
MsG0880047736.01.T01 AT3G46355 39.130 276 145 5 46 321 2 254 2.11e-59 193
MsG0880047736.01.T01 AT4G02420 36.964 303 183 6 23 321 324 622 2.13e-59 202
MsG0880047736.01.T01 AT1G11130 38.796 299 171 4 29 323 399 689 2.39e-59 202
MsG0880047736.01.T01 AT1G25390 41.156 294 157 8 37 321 279 565 2.66e-59 201
MsG0880047736.01.T01 AT1G25390 41.156 294 157 8 37 321 279 565 2.66e-59 201
MsG0880047736.01.T01 AT2G37050 39.716 282 166 4 37 316 594 873 2.72e-59 205
MsG0880047736.01.T01 AT2G37050 39.716 282 166 4 37 316 593 872 3.11e-59 205
MsG0880047736.01.T01 AT4G23130 39.519 291 163 5 37 320 328 612 3.31e-59 201
MsG0880047736.01.T01 AT4G23190 38.305 295 171 4 30 317 253 543 3.42e-59 200
MsG0880047736.01.T01 AT4G23190 38.305 295 171 4 30 317 253 543 3.42e-59 200
MsG0880047736.01.T01 AT4G23130 39.519 291 163 5 37 320 332 616 3.51e-59 201
MsG0880047736.01.T01 AT5G40380 40.067 297 166 5 31 320 297 588 3.72e-59 201
MsG0880047736.01.T01 AT4G35030 37.809 283 172 3 37 316 92 373 4.13e-59 195
MsG0880047736.01.T01 AT1G29730 49.074 216 106 3 34 247 625 838 4.41e-59 204
MsG0880047736.01.T01 AT5G06740 38.144 291 171 5 37 320 318 606 4.41e-59 201
MsG0880047736.01.T01 AT5G06740 38.144 291 171 5 37 320 330 618 4.96e-59 201
MsG0880047736.01.T01 AT5G65240 41.176 289 165 4 37 321 272 559 5.08e-59 200
MsG0880047736.01.T01 AT4G23310 39.535 301 171 6 27 320 444 740 5.89e-59 202
MsG0880047736.01.T01 AT4G04510 39.456 294 170 4 29 320 321 608 7.10e-59 201
MsG0880047736.01.T01 AT5G65240 41.176 289 165 4 37 321 272 559 7.34e-59 200
MsG0880047736.01.T01 AT2G25220 45.635 252 128 4 37 284 85 331 7.54e-59 194
MsG0880047736.01.T01 AT4G39400 41.017 295 155 7 37 321 871 1156 7.68e-59 204
MsG0880047736.01.T01 AT1G11130 38.796 299 171 4 29 323 477 767 7.93e-59 202
MsG0880047736.01.T01 AT4G04510 39.456 294 170 4 29 320 319 606 7.97e-59 200
MsG0880047736.01.T01 AT5G59260 41.414 297 165 6 33 327 339 628 8.06e-59 201
MsG0880047736.01.T01 AT4G23310 39.535 301 171 6 27 320 484 780 8.26e-59 203

Find 82 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 108 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ATCCGAGTGCTCCAACTTAA+TGG 0.185684 8:+90227315 None:intergenic
GCTAATCTTGTAAAGTTAAT+TGG 0.191288 8:-90227564 MsG0880047736.01.T01:CDS
TTGCTAGGGGTAGGTGGATT+TGG 0.203729 8:-90227854 MsG0880047736.01.T01:CDS
TCTCTCGGATCATTCAAATA+TGG 0.251048 8:+90226664 None:intergenic
CAATGGAGATCAAATGCTTT+TGG 0.271676 8:-90227532 MsG0880047736.01.T01:CDS
AGTGCAAAACTGTCAGATTT+CGG 0.335817 8:-90227180 MsG0880047736.01.T01:CDS
CAATCCGATATCTACAGTTT+TGG 0.351103 8:-90227048 MsG0880047736.01.T01:CDS
AACTTAATGGAGCTTTGTCT+TGG 0.383635 8:+90227328 None:intergenic
GATTTCGGCCTTGCTAAACT+TGG 0.390634 8:-90227165 MsG0880047736.01.T01:CDS
GAGAGCAATACTTAGTTTCA+TGG 0.390761 8:-90226966 MsG0880047736.01.T01:CDS
TAAAAGTTACCTCGCCGTTT+GGG 0.401366 8:+90227810 None:intergenic
TTAAAAGTTACCTCGCCGTT+TGG 0.408257 8:+90227809 None:intergenic
CTCTCGGATCATTCAAATAT+GGG 0.427020 8:+90226665 None:intergenic
CTACTGCCCTACTAGTATCC+AGG 0.428989 8:+90226989 None:intergenic
CACACCAAAACTGTAGATAT+CGG 0.429544 8:+90227044 None:intergenic
CCAATGGCTGGACGTTCTGT+TGG 0.432380 8:+90226544 None:intergenic
TTCAAGTCTCGATGGATAAC+CGG 0.435130 8:+90227234 None:intergenic
TCCGAGAGAGTTTATGCATA+AGG 0.441123 8:-90226650 MsG0880047736.01.T01:CDS
GTAGAGCCCTGGATACTAGT+AGG 0.452752 8:-90226996 MsG0880047736.01.T01:CDS
TAATAATTGATATGTGTCTC+CGG 0.453921 8:-90226573 MsG0880047736.01.T01:CDS
GGTTTATGAATACATGCCTA+AGG 0.455987 8:-90227511 MsG0880047736.01.T01:CDS
CTCCATTAAGTTGGAGCACT+CGG 0.458423 8:-90227317 MsG0880047736.01.T01:CDS
AGACGACGTAGGCCTCGGTT+GGG 0.459939 8:+90226601 None:intergenic
GACGTTCTGTTGGATTCTCC+CGG 0.463510 8:+90226554 None:intergenic
ACTTAATGGAGCTTTGTCTT+GGG 0.464608 8:+90227329 None:intergenic
TTAATTGGTTATTGCACCAA+TGG 0.467292 8:-90227549 MsG0880047736.01.T01:CDS
CAAAAGCATTTGATCTCCAT+TGG 0.470359 8:+90227533 None:intergenic
GGGAAGTGTCCTTGCAAAAG+AGG 0.471215 8:+90226622 None:intergenic
ACATGTGTGTCGTCTCCAAC+AGG 0.472360 8:+90227141 None:intergenic
TTCTAGTGCGCAATAGCCTT+CGG 0.484424 8:+90227098 None:intergenic
AGTATCCAGGGCTCTACGTC+CGG 0.484531 8:+90227002 None:intergenic
AAAGCAGACGACGTAGGCCT+CGG 0.486267 8:+90226596 None:intergenic
AAAATTTCAAGGAATTGCTA+GGG 0.495721 8:-90227868 MsG0880047736.01.T01:CDS
ACTCGGATAAAGATTTCTCT+TGG 0.505381 8:-90227300 MsG0880047736.01.T01:CDS
AAGACAAAGCTCCATTAAGT+TGG 0.511077 8:-90227326 MsG0880047736.01.T01:CDS
TTGAATGTGCAGAGGGTGAA+AGG 0.521988 8:-90227994 MsG0880047736.01.T01:CDS
CAGACGACGTAGGCCTCGGT+TGG 0.524178 8:+90226600 None:intergenic
GACGACGTAGGCCTCGGTTG+GGG 0.525440 8:+90226602 None:intergenic
ACCTTATGCATAAACTCTCT+CGG 0.526988 8:+90226649 None:intergenic
AATAATTGATATGTGTCTCC+GGG 0.527685 8:-90226572 MsG0880047736.01.T01:CDS
TGACAGCCTTGACAACCATC+AGG 0.530436 8:+90227630 None:intergenic
ATTTCTCTTGGAGCAGCTCA+AGG 0.532954 8:-90227288 MsG0880047736.01.T01:CDS
CTGGATACTAGTAGGGCAGT+AGG 0.535629 8:-90226988 MsG0880047736.01.T01:CDS
CTTGCTAAACTTGGACCTGT+TGG 0.540276 8:-90227156 MsG0880047736.01.T01:CDS
TACAAGGGTCGTCTCCCAAA+CGG 0.541835 8:-90227824 MsG0880047736.01.T01:CDS
TCAACAATTTCACCAATGGC+TGG 0.543295 8:+90226532 None:intergenic
ACATGTTTCAACCCGAGTGA+TGG 0.544620 8:-90227124 MsG0880047736.01.T01:CDS
AGAGCAATACTTAGTTTCAT+GGG 0.544865 8:-90226965 MsG0880047736.01.T01:intron
GTTTATGAATACATGCCTAA+GGG 0.547055 8:-90227510 MsG0880047736.01.T01:CDS
TTTCCATCTGCAGCTTGTTG+CGG 0.547593 8:-90227667 MsG0880047736.01.T01:intron
AGCCTTCGGTACCCATCACT+CGG 0.550028 8:+90227112 None:intergenic
CATGTTTCAACCCGAGTGAT+GGG 0.551119 8:-90227123 MsG0880047736.01.T01:CDS
TTAAATCCTGATGGTTGTCA+AGG 0.551135 8:-90227636 MsG0880047736.01.T01:CDS
GTTAAACAATTAAATCCTGA+TGG 0.551792 8:-90227645 MsG0880047736.01.T01:CDS
AAGAAATTAATATGTTTAGA+CGG 0.552556 8:-90227971 MsG0880047736.01.T01:CDS
AAGGAATTGCTAGGGGTAGG+TGG 0.557168 8:-90227860 MsG0880047736.01.T01:CDS
GATCACCGGACGTAGAGCCC+TGG 0.558189 8:-90227007 MsG0880047736.01.T01:CDS
TGGATTTGGAAATGTTTACA+AGG 0.558684 8:-90227840 MsG0880047736.01.T01:CDS
TGCATCAACAATTTCACCAA+TGG 0.569071 8:+90226528 None:intergenic
CCAACAGAACGTCCAGCCAT+TGG 0.570184 8:-90226544 MsG0880047736.01.T01:CDS
TACTGCCCTACTAGTATCCA+GGG 0.570266 8:+90226990 None:intergenic
TTGAAGATTTCAAGTCTCGA+TGG 0.573627 8:+90227226 None:intergenic
TGAGTATCTCCACTGTCAAG+TGG 0.577689 8:-90227262 MsG0880047736.01.T01:CDS
GCACTAGAATATGCTATGAC+TGG 0.582178 8:-90227084 MsG0880047736.01.T01:CDS
CCACTGTCAAGTGGATCCAC+CGG 0.600278 8:-90227253 MsG0880047736.01.T01:CDS
TAGAGCCCTGGATACTAGTA+GGG 0.600479 8:-90226995 MsG0880047736.01.T01:CDS
GGAAGTGTCCTTGCAAAAGA+GGG 0.609164 8:+90226623 None:intergenic
TTAGCTATTGAATGTGCAGA+GGG 0.623289 8:-90228001 MsG0880047736.01.T01:CDS
ACCCGAGTGATGGGTACCGA+AGG 0.623848 8:-90227114 MsG0880047736.01.T01:CDS
GCCTTCGGTACCCATCACTC+GGG 0.633840 8:+90227113 None:intergenic
CAACAGGTCCAAGTTTAGCA+AGG 0.634347 8:+90227157 None:intergenic
TTCAAGGAATTGCTAGGGGT+AGG 0.634639 8:-90227863 MsG0880047736.01.T01:CDS
GGATTTGGAAATGTTTACAA+GGG 0.638869 8:-90227839 MsG0880047736.01.T01:CDS
AAGTCTCGATGGATAACCGG+TGG 0.642562 8:+90227237 None:intergenic
CAAGGACACTTCCCCAACCG+AGG 0.643310 8:-90226613 MsG0880047736.01.T01:CDS
TTATTAAAAGCAGACGACGT+AGG 0.649262 8:+90226590 None:intergenic
AAGTTTGAGAGTGTGAGTAG+TGG 0.655844 8:-90227947 MsG0880047736.01.T01:CDS
AAATTTCAAGGAATTGCTAG+GGG 0.668281 8:-90227867 MsG0880047736.01.T01:CDS
TGAGCTTCAAGAGATCCCTT+AGG 0.681247 8:+90227495 None:intergenic
CCGGTGGATCCACTTGACAG+TGG 0.682154 8:+90227253 None:intergenic
GGGTCGTCTCCCAAACGGCG+AGG 0.687110 8:-90227819 MsG0880047736.01.T01:intron
CTTAGCTATTGAATGTGCAG+AGG 0.706594 8:-90228002 MsG0880047736.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! TAAAAATGAATTTAGTTTTA+AGG + Chr8:90227571-90227590 None:intergenic 10.0%
!!! TTTTTTTTTTTTTCTTTCTT+AGG - Chr8:90227073-90227092 MsG0880047736.01.T01:CDS 10.0%
!! AAGAAATTAATATGTTTAGA+CGG - Chr8:90226516-90226535 MsG0880047736.01.T01:CDS 15.0%
!! TATATTATGATGAATCTAAA+AGG + Chr8:90227694-90227713 None:intergenic 15.0%
!!! AAGTTATTTTCATTTCATTT+TGG - Chr8:90226770-90226789 MsG0880047736.01.T01:intron 15.0%
!!! TTTTTGGTAAAATATACTTT+TGG - Chr8:90226740-90226759 MsG0880047736.01.T01:intron 15.0%
!!! GATTATGAATGAATTCTTTT+TGG - Chr8:90226724-90226743 MsG0880047736.01.T01:intron 20.0%
! AAAAATTTCAAGGAATTGCT+AGG - Chr8:90226618-90226637 MsG0880047736.01.T01:CDS 25.0%
! AAAATTTCAAGGAATTGCTA+GGG - Chr8:90226619-90226638 MsG0880047736.01.T01:CDS 25.0%
! GCTAATCTTGTAAAGTTAAT+TGG - Chr8:90226923-90226942 MsG0880047736.01.T01:intron 25.0%
! GTTAAACAATTAAATCCTGA+TGG - Chr8:90226842-90226861 MsG0880047736.01.T01:intron 25.0%
! TAATAATTGATATGTGTCTC+CGG - Chr8:90227914-90227933 MsG0880047736.01.T01:CDS 25.0%
!! AATGATTAGGATGCTTTATT+AGG - Chr8:90227029-90227048 MsG0880047736.01.T01:CDS 25.0%
!! TAGCAATTCCTTGAAATTTT+TGG + Chr8:90226619-90226638 None:intergenic 25.0%
!! TGTGTTTTGTCATATAAAGT+TGG + Chr8:90227100-90227119 None:intergenic 25.0%
!!! CTTTTTGGTAAACAATGATT+AGG - Chr8:90227016-90227035 MsG0880047736.01.T01:CDS 25.0%
!!! GGGTAAATATTTAGTTTGAA+TGG - Chr8:90227542-90227561 MsG0880047736.01.T01:CDS 25.0%
AAATTTCAAGGAATTGCTAG+GGG - Chr8:90226620-90226639 MsG0880047736.01.T01:CDS 30.0%
AATAATTGATATGTGTCTCC+GGG - Chr8:90227915-90227934 MsG0880047736.01.T01:CDS 30.0%
AGAGCAATACTTAGTTTCAT+GGG - Chr8:90227522-90227541 MsG0880047736.01.T01:CDS 30.0%
GGATTTGGAAATGTTTACAA+GGG - Chr8:90226648-90226667 MsG0880047736.01.T01:CDS 30.0%
GTTTATGAATACATGCCTAA+GGG - Chr8:90226977-90226996 MsG0880047736.01.T01:CDS 30.0%
TGGATTTGGAAATGTTTACA+AGG - Chr8:90226647-90226666 MsG0880047736.01.T01:CDS 30.0%
TTAATTGGTTATTGCACCAA+TGG - Chr8:90226938-90226957 MsG0880047736.01.T01:intron 30.0%
AACTGCGACCAAAAATTTCA+AGG - Chr8:90226608-90226627 MsG0880047736.01.T01:CDS 35.0%
AAGACAAAGCTCCATTAAGT+TGG - Chr8:90227161-90227180 MsG0880047736.01.T01:CDS 35.0%
ACCTTATGCATAAACTCTCT+CGG + Chr8:90227841-90227860 None:intergenic 35.0%
ACTCGGATAAAGATTTCTCT+TGG - Chr8:90227187-90227206 MsG0880047736.01.T01:CDS 35.0%
AGTGCAAAACTGTCAGATTT+CGG - Chr8:90227307-90227326 MsG0880047736.01.T01:CDS 35.0%
ATGTGTTAGCATTTGCATGT+CGG - Chr8:90227594-90227613 MsG0880047736.01.T01:CDS 35.0%
CACACCAAAACTGTAGATAT+CGG + Chr8:90227446-90227465 None:intergenic 35.0%
CTCTCGGATCATTCAAATAT+GGG + Chr8:90227825-90227844 None:intergenic 35.0%
GAGAGCAATACTTAGTTTCA+TGG - Chr8:90227521-90227540 MsG0880047736.01.T01:CDS 35.0%
GGTTTATGAATACATGCCTA+AGG - Chr8:90226976-90226995 MsG0880047736.01.T01:CDS 35.0%
TCTCTCGGATCATTCAAATA+TGG + Chr8:90227826-90227845 None:intergenic 35.0%
TGCATCAACAATTTCACCAA+TGG + Chr8:90227962-90227981 None:intergenic 35.0%
TTAAATCCTGATGGTTGTCA+AGG - Chr8:90226851-90226870 MsG0880047736.01.T01:intron 35.0%
TTAGCTATTGAATGTGCAGA+GGG - Chr8:90226486-90226505 MsG0880047736.01.T01:CDS 35.0%
TTATTAAAAGCAGACGACGT+AGG + Chr8:90227900-90227919 None:intergenic 35.0%
! AACTTAATGGAGCTTTGTCT+TGG + Chr8:90227162-90227181 None:intergenic 35.0%
! ACTTAATGGAGCTTTGTCTT+GGG + Chr8:90227161-90227180 None:intergenic 35.0%
! CAATCCGATATCTACAGTTT+TGG - Chr8:90227439-90227458 MsG0880047736.01.T01:intron 35.0%
! CAATGGAGATCAAATGCTTT+TGG - Chr8:90226955-90226974 MsG0880047736.01.T01:intron 35.0%
! TCTCTTGAAGCTCATCTTTT+TGG - Chr8:90227001-90227020 MsG0880047736.01.T01:CDS 35.0%
! TTGAAGATTTCAAGTCTCGA+TGG + Chr8:90227264-90227283 None:intergenic 35.0%
!! CAAAAGCATTTGATCTCCAT+TGG + Chr8:90226957-90226976 None:intergenic 35.0%
!!! CGAGGTAACTTTTAAGACTT+TGG - Chr8:90226686-90226705 MsG0880047736.01.T01:intron 35.0%
ACGCCTTCCATTAGAAATGT+CGG - Chr8:90227649-90227668 MsG0880047736.01.T01:CDS 40.0%
CTTAGCTATTGAATGTGCAG+AGG - Chr8:90226485-90226504 MsG0880047736.01.T01:CDS 40.0%
GCACTAGAATATGCTATGAC+TGG - Chr8:90227403-90227422 MsG0880047736.01.T01:intron 40.0%
TAAAAGTTACCTCGCCGTTT+GGG + Chr8:90226680-90226699 None:intergenic 40.0%
TCAACAATTTCACCAATGGC+TGG + Chr8:90227958-90227977 None:intergenic 40.0%
TCCGAGAGAGTTTATGCATA+AGG - Chr8:90227837-90227856 MsG0880047736.01.T01:CDS 40.0%
TGTACCACCGACATTTCTAA+TGG + Chr8:90227659-90227678 None:intergenic 40.0%
TTAAAAGTTACCTCGCCGTT+TGG + Chr8:90226681-90226700 None:intergenic 40.0%
TTCAAGTCTCGATGGATAAC+CGG + Chr8:90227256-90227275 None:intergenic 40.0%
! AAGTTTGAGAGTGTGAGTAG+TGG - Chr8:90226540-90226559 MsG0880047736.01.T01:CDS 40.0%
!! CGATATCTACAGTTTTGGTG+TGG - Chr8:90227444-90227463 MsG0880047736.01.T01:intron 40.0%
ACATGTTTCAACCCGAGTGA+TGG - Chr8:90227363-90227382 MsG0880047736.01.T01:intron 45.0%
ATCCGAGTGCTCCAACTTAA+TGG + Chr8:90227175-90227194 None:intergenic 45.0%
ATTTCTCTTGGAGCAGCTCA+AGG - Chr8:90227199-90227218 MsG0880047736.01.T01:CDS 45.0%
CAACAGGTCCAAGTTTAGCA+AGG + Chr8:90227333-90227352 None:intergenic 45.0%
CATGTTTCAACCCGAGTGAT+GGG - Chr8:90227364-90227383 MsG0880047736.01.T01:intron 45.0%
CCACCGACATTTCTAATGGA+AGG + Chr8:90227655-90227674 None:intergenic 45.0%
CCTTCCATTAGAAATGTCGG+TGG - Chr8:90227652-90227671 MsG0880047736.01.T01:CDS 45.0%
CTTGCTAAACTTGGACCTGT+TGG - Chr8:90227331-90227350 MsG0880047736.01.T01:CDS 45.0%
GATTTCGGCCTTGCTAAACT+TGG - Chr8:90227322-90227341 MsG0880047736.01.T01:CDS 45.0%
TACTGCCCTACTAGTATCCA+GGG + Chr8:90227500-90227519 None:intergenic 45.0%
TAGAGCCCTGGATACTAGTA+GGG - Chr8:90227492-90227511 MsG0880047736.01.T01:CDS 45.0%
TAGCATTTGCATGTCGGTGT+CGG - Chr8:90227600-90227619 MsG0880047736.01.T01:CDS 45.0%
TGAGCTTCAAGAGATCCCTT+AGG + Chr8:90226995-90227014 None:intergenic 45.0%
TGAGTATCTCCACTGTCAAG+TGG - Chr8:90227225-90227244 MsG0880047736.01.T01:CDS 45.0%
TTCAAGGAATTGCTAGGGGT+AGG - Chr8:90226624-90226643 MsG0880047736.01.T01:CDS 45.0%
TTCTAGTGCGCAATAGCCTT+CGG + Chr8:90227392-90227411 None:intergenic 45.0%
TTGAATGTGCAGAGGGTGAA+AGG - Chr8:90226493-90226512 MsG0880047736.01.T01:CDS 45.0%
! AAGGTTGACCCTCTTTTGCA+AGG - Chr8:90227856-90227875 MsG0880047736.01.T01:CDS 45.0%
! GTTTTGCTGGAACTGATCAC+CGG - Chr8:90227466-90227485 MsG0880047736.01.T01:intron 45.0%
!! CAGTTTTGGTGTGGTTTTGC+TGG - Chr8:90227453-90227472 MsG0880047736.01.T01:intron 45.0%
!! CTCCATTAAGTTGGAGCACT+CGG - Chr8:90227170-90227189 MsG0880047736.01.T01:CDS 45.0%
!! GGAAGTGTCCTTGCAAAAGA+GGG + Chr8:90227867-90227886 None:intergenic 45.0%
!! TTTCCATCTGCAGCTTGTTG+CGG - Chr8:90226820-90226839 MsG0880047736.01.T01:intron 45.0%
AAGGAATTGCTAGGGGTAGG+TGG - Chr8:90226627-90226646 MsG0880047736.01.T01:CDS 50.0%
AAGTCTCGATGGATAACCGG+TGG + Chr8:90227253-90227272 None:intergenic 50.0%
ACATGTGTGTCGTCTCCAAC+AGG + Chr8:90227349-90227368 None:intergenic 50.0%
CTACTGCCCTACTAGTATCC+AGG + Chr8:90227501-90227520 None:intergenic 50.0%
CTGGATACTAGTAGGGCAGT+AGG - Chr8:90227499-90227518 MsG0880047736.01.T01:CDS 50.0%
GACGTTCTGTTGGATTCTCC+CGG + Chr8:90227936-90227955 None:intergenic 50.0%
GTAGAGCCCTGGATACTAGT+AGG - Chr8:90227491-90227510 MsG0880047736.01.T01:CDS 50.0%
TAACCGCAACAAGCTGCAGA+TGG + Chr8:90226826-90226845 None:intergenic 50.0%
TACAAGGGTCGTCTCCCAAA+CGG - Chr8:90226663-90226682 MsG0880047736.01.T01:CDS 50.0%
TGACAGCCTTGACAACCATC+AGG + Chr8:90226860-90226879 None:intergenic 50.0%
! TTGCTAGGGGTAGGTGGATT+TGG - Chr8:90226633-90226652 MsG0880047736.01.T01:CDS 50.0%
!! GGGAAGTGTCCTTGCAAAAG+AGG + Chr8:90227868-90227887 None:intergenic 50.0%
AAAGCAGACGACGTAGGCCT+CGG + Chr8:90227894-90227913 None:intergenic 55.0%
AGCCTTCGGTACCCATCACT+CGG + Chr8:90227378-90227397 None:intergenic 55.0%
AGTATCCAGGGCTCTACGTC+CGG + Chr8:90227488-90227507 None:intergenic 55.0%
CCAACAGAACGTCCAGCCAT+TGG - Chr8:90227943-90227962 MsG0880047736.01.T01:CDS 55.0%
CCAATGGCTGGACGTTCTGT+TGG + Chr8:90227946-90227965 None:intergenic 55.0%
CCACTGTCAAGTGGATCCAC+CGG - Chr8:90227234-90227253 MsG0880047736.01.T01:CDS 55.0%
AGACGACGTAGGCCTCGGTT+GGG + Chr8:90227889-90227908 None:intergenic 60.0%
CAAGGACACTTCCCCAACCG+AGG - Chr8:90227874-90227893 MsG0880047736.01.T01:CDS 60.0%
CCGGTGGATCCACTTGACAG+TGG + Chr8:90227237-90227256 None:intergenic 60.0%
GCCTTCGGTACCCATCACTC+GGG + Chr8:90227377-90227396 None:intergenic 60.0%
!! ACCCGAGTGATGGGTACCGA+AGG - Chr8:90227373-90227392 MsG0880047736.01.T01:intron 60.0%
CAGACGACGTAGGCCTCGGT+TGG + Chr8:90227890-90227909 None:intergenic 65.0%
GACGACGTAGGCCTCGGTTG+GGG + Chr8:90227888-90227907 None:intergenic 65.0%
GATCACCGGACGTAGAGCCC+TGG - Chr8:90227480-90227499 MsG0880047736.01.T01:intron 65.0%
GGGTCGTCTCCCAAACGGCG+AGG - Chr8:90226668-90226687 MsG0880047736.01.T01:CDS 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 90226480 90228029 90226480 ID=MsG0880047736.01;Name=MsG0880047736.01
Chr8 mRNA 90226480 90228029 90226480 ID=MsG0880047736.01.T01;Parent=MsG0880047736.01;Name=MsG0880047736.01.T01;_AED=0.12;_eAED=0.12;_QI=0|0|0|1|1|1|4|0|334
Chr8 exon 90227820 90228029 90227820 ID=MsG0880047736.01.T01:exon:16132;Parent=MsG0880047736.01.T01
Chr8 exon 90227487 90227676 90227487 ID=MsG0880047736.01.T01:exon:16131;Parent=MsG0880047736.01.T01
Chr8 exon 90226966 90227357 90226966 ID=MsG0880047736.01.T01:exon:16130;Parent=MsG0880047736.01.T01
Chr8 exon 90226480 90226692 90226480 ID=MsG0880047736.01.T01:exon:16129;Parent=MsG0880047736.01.T01
Chr8 CDS 90227820 90228029 90227820 ID=MsG0880047736.01.T01:cds;Parent=MsG0880047736.01.T01
Chr8 CDS 90227487 90227676 90227487 ID=MsG0880047736.01.T01:cds;Parent=MsG0880047736.01.T01
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Chr8 CDS 90226480 90226692 90226480 ID=MsG0880047736.01.T01:cds;Parent=MsG0880047736.01.T01
Gene Sequence

>MsG0880047736.01.T01

ATGATCTTAGCTATTGAATGTGCAGAGGGTGAAAGGAAGAAATTAATATGTTTAGACGGAAAGTTTGAGAGTGTGAGTAGTGGTCACAGCAGCACATCAACAACTAGTTTTAGTTTTGATGAGCTTGTAACTGCGACCAAAAATTTCAAGGAATTGCTAGGGGTAGGTGGATTTGGAAATGTTTACAAGGGTCGTCTCCCAAACGGCGAGCTTGTTGCGGTTAAACAATTAAATCCTGATGGTTGTCAAGGCTGTCACGAATTTATGACAGAGCTTGATATTCTAAGTGTGCTGCGTCATGCTAATCTTGTAAAGTTAATTGGTTATTGCACCAATGGAGATCAAATGCTTTTGGTTTATGAATACATGCCTAAGGGATCTCTTGAAGCTCATCTTTTTGATGTTACCCAAGACAAAGCTCCATTAAGTTGGAGCACTCGGATAAAGATTTCTCTTGGAGCAGCTCAAGGTCTTGAGTATCTCCACTGTCAAGTGGATCCACCGGTTATCCATCGAGACTTGAAATCTTCAAACATTTTACTTGAAAATGACTTCAGTGCAAAACTGTCAGATTTCGGCCTTGCTAAACTTGGACCTGTTGGAGACGACACACATGTTTCAACCCGAGTGATGGGTACCGAAGGCTATTGCGCACTAGAATATGCTATGACTGGCAAATTAACTAAACAATCCGATATCTACAGTTTTGGTGTGGTTTTGCTGGAACTGATCACCGGACGTAGAGCCCTGGATACTAGTAGGGCAGTAGGAGAGCAATACTTAGTTTCATGGTGTCTCCCATATTTGAATGATCCGAGAGAGTTTATGCATAAGGTTGACCCTCTTTTGCAAGGACACTTCCCCAACCGAGGCCTACGTCGTCTGCTTTTAATAATTGATATGTGTCTCCGGGAGAATCCAACAGAACGTCCAGCCATTGGTGAAATTGTTGATGCACTAAAATACTTATATTCTAAAGTCTACAAACATCGTGTGCGCAGCTAA
Protein sequence

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