AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa ssp. caerulea / MsaG005195


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CRISPR-Local

CRISPR-GE

Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 78766986 78774422 78766986 ID=MsaG005195
Chr1 mRNA 78766986 78774422 78766986 ID=MsaT005195.1;Parent=MsaG005195
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Chr1 exon 78769024 78769234 78769024 ID=MsaT005195.1.exon8;Parent=MsaT005195.1
Chr1 CDS 78769024 78769234 78769024 ID=cds.MsaT005195.1;Parent=MsaT005195.1
Chr1 exon 78769369 78769468 78769369 ID=MsaT005195.1.exon7;Parent=MsaT005195.1
Chr1 CDS 78769369 78769468 78769369 ID=cds.MsaT005195.1;Parent=MsaT005195.1
Chr1 exon 78769669 78769755 78769669 ID=MsaT005195.1.exon6;Parent=MsaT005195.1
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Chr1 exon 78770776 78771014 78770776 ID=MsaT005195.1.exon5;Parent=MsaT005195.1
Chr1 CDS 78770776 78771014 78770776 ID=cds.MsaT005195.1;Parent=MsaT005195.1
Chr1 exon 78771200 78771288 78771200 ID=MsaT005195.1.exon4;Parent=MsaT005195.1
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Chr1 exon 78771408 78771540 78771408 ID=MsaT005195.1.exon3;Parent=MsaT005195.1
Chr1 CDS 78771408 78771540 78771408 ID=cds.MsaT005195.1;Parent=MsaT005195.1
Chr1 exon 78772210 78773135 78772210 ID=MsaT005195.1.exon2;Parent=MsaT005195.1
Chr1 CDS 78772210 78773135 78772210 ID=cds.MsaT005195.1;Parent=MsaT005195.1
Chr1 exon 78773270 78774422 78773270 ID=MsaT005195.1.exon1;Parent=MsaT005195.1
Chr1 CDS 78773270 78774422 78773270 ID=cds.MsaT005195.1;Parent=MsaT005195.1
Gene Sequence

>MsaT005195.1

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Protein sequence

>MsaT005195.1

MEPGTRIGSPSGVVVKNRSSSGCLIVRKKGDALGGGVGGGGSSSRKQYDSKKVRKKVKVEVDSSDSESSGELVMPSGRRLGPETIRVCNSLSALERGGGNVGGGEISRKRERMEQIRRNGDGMVEGNGLERREKKVKLDVFDFDEYDGVGKERMRRQFDNDRVGLGGGRFMGTMHAARGSVDREIESGSSRHTVDKRKKAYYDRAIGLHPGDGGEHSRMKMNRDGTQPPLPLLKEKFKPDESIRVQGKNGVLKVMVNKKKVGGSVERYEQRKPVESKQSLRAEGTSKRSVPIHPSSHLETKSAEKQGLLVRPEKKQITTRKSLSSKEDSKGKEQDSEDNDTSMNLEVKNIKAHTPSKKITSENEQTPVHDKFPTTKSSEGKIRRAYWSIIKAYDALQKQLIEDERAAKGESSSFAPIADDVLSQLTRKTRKKMEKDLKMKKKKQRIDDIDSGKERQIKRTSGKKHHMNSIDSDSNEDKLSSFIKQQGSKSMKAKLTENAVTGGSSKSQNATTEKPFSENDPQNLHGRKSRKHGRCTLLVRNKGLNSESDDFVPYTGKRTVLSWLVDSGVVQVSQKVQYRRRKKVMLEGWITREGIHCGCCSKILTVSKFELHAGSKLPQPYQNIYLDSGVSLLQCQIDAWEKQENSGKISFHSVDVDGNDPNDDTCGICGDGGDLICCDGCPSTFHQSCLDIQMLPPGEWRCPNCTCKFCGLARATTDKEDDATVNALRTCDLCEKKYHDRCTKDMGALLANSNVSEHSFCGKSCKELFENLKKYLGTKHELDAGFTWCLVRRTNDDSEAASRGVTQRVECNSKLAVALTVMDECFLPVVDRRSGVNLIHNSLYNSGSNFSRLNYTGFYTAILERGDEIISAASIRFHGTKLAEMPFIGTRHIYRNQGMCRRLFSAIELALCSLKVEKLVIPAISELVHTWTTVFGFTHLEEPLRQEMRSLNMLVFPGIDMLQKLLAEQGKLEGNTTGEDAEQFENGDVGSIKPAVVNGLDINSPALQDPHGSEDASSNLANKINNECSDASQDISNQGLSGRTVCSKSHSEERISDFVSENCASPSNSSHGVLKKKIKISMSSPINDPSPKCQLISPNDTSTNGLPSDHSDSHEIRALGQATACSDLATVKNMVEPASEGKPHAFTDMNCDSPGLDQNPVSDSQVVDNALSFKEFDMNDAHVEVLEAGPLVNSSQANNTEENNENVDVSGSVLNHAITDMNCDSPGLDQNPVSDSRVADNDMSLKKFDMNDAHVEVVEVGPLVNSFEGNNAKENDENVDVSGSVLNHAITDVNCDSPGLDQNPVSDSQVVDNDLSLKKFDMNDSLGEVLEAGPLVNSSQANNTKENNENVDVSGSALNQDITDMNCDSPGLDQNPVSDSQVGDNALSCKEFDMNDTHVEVLESGPLANLSEANNAKENDENVDVSGSVLDHTESDMNNNSPGHDRNPVTDSQVTDNALPFKEFGMNDVCDEVVEAGPSVSSSEGNNTKENNKNVDVSGSALNHASIDMNSNSPGLDQNPAVDSQVAESASCKEFDMNDTHVEVLEAGPLVNLPEGNNAKENVENVDVSSSVLNHAGESSLQVRSDLNGELAYEGKKNSHLDTQVASNEMHFDETGVNPSGDSAETDQALNG*