AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa ssp. caerulea / MsaG030140


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CRISPR-Local

CRISPR-GE

Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 3112892 3125503 3112892 ID=MsaG030140
Chr6 mRNA 3112892 3125503 3112892 ID=MsaT030140.1;Parent=MsaG030140
Chr6 exon 3112892 3112961 3112892 ID=MsaT030140.1.exon1;Parent=MsaT030140.1
Chr6 CDS 3112892 3112961 3112892 ID=cds.MsaT030140.1;Parent=MsaT030140.1
Chr6 exon 3116402 3117084 3116402 ID=MsaT030140.1.exon2;Parent=MsaT030140.1
Chr6 CDS 3116402 3117084 3116402 ID=cds.MsaT030140.1;Parent=MsaT030140.1
Chr6 exon 3117223 3117334 3117223 ID=MsaT030140.1.exon3;Parent=MsaT030140.1
Chr6 CDS 3117223 3117334 3117223 ID=cds.MsaT030140.1;Parent=MsaT030140.1
Chr6 exon 3117375 3117539 3117375 ID=MsaT030140.1.exon4;Parent=MsaT030140.1
Chr6 CDS 3117375 3117539 3117375 ID=cds.MsaT030140.1;Parent=MsaT030140.1
Chr6 exon 3117569 3118332 3117569 ID=MsaT030140.1.exon5;Parent=MsaT030140.1
Chr6 CDS 3117569 3118332 3117569 ID=cds.MsaT030140.1;Parent=MsaT030140.1
Chr6 exon 3118455 3119051 3118455 ID=MsaT030140.1.exon6;Parent=MsaT030140.1
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Chr6 exon 3119767 3120072 3119767 ID=MsaT030140.1.exon7;Parent=MsaT030140.1
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Chr6 exon 3120687 3121019 3120687 ID=MsaT030140.1.exon8;Parent=MsaT030140.1
Chr6 CDS 3120687 3121019 3120687 ID=cds.MsaT030140.1;Parent=MsaT030140.1
Chr6 exon 3121350 3121448 3121350 ID=MsaT030140.1.exon9;Parent=MsaT030140.1
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Chr6 exon 3121532 3121966 3121532 ID=MsaT030140.1.exon10;Parent=MsaT030140.1
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Chr6 exon 3122771 3123978 3122771 ID=MsaT030140.1.exon11;Parent=MsaT030140.1
Chr6 CDS 3122771 3123978 3122771 ID=cds.MsaT030140.1;Parent=MsaT030140.1
Chr6 exon 3124023 3124127 3124023 ID=MsaT030140.1.exon12;Parent=MsaT030140.1
Chr6 CDS 3124023 3124127 3124023 ID=cds.MsaT030140.1;Parent=MsaT030140.1
Chr6 exon 3124181 3124922 3124181 ID=MsaT030140.1.exon13;Parent=MsaT030140.1
Chr6 CDS 3124181 3124922 3124181 ID=cds.MsaT030140.1;Parent=MsaT030140.1
Chr6 exon 3125207 3125503 3125207 ID=MsaT030140.1.exon14;Parent=MsaT030140.1
Chr6 CDS 3125207 3125503 3125207 ID=cds.MsaT030140.1;Parent=MsaT030140.1
Gene Sequence

>MsaT030140.1

AGTAAACAGTTGCTAGATATTAATGCTTCCCCGCCTAGTGATGTTGATGGGAAGAGTTGCATGAATCGAGTTTACATTCATTTTTGTTTTAGAAAGCACGCTATGGGTGATAAATCTTTTGCTGCCAATCAATTTGGTGCTTCAGTGACATATTCAACCTTCAATAACGGGAGTGTGGTTGGCTTCCAAAGGGCATCTGGAGCTGTGACACGTCCTGTTAGAGTGGGTTTTGAGGATATATTGAATCACACCCAATCAATGGCTAGAAGCTTTGAGGAAGTACCATCTCAGACTCAAGGTCCAAATGAGTTAATTTTGCAGGCTCTTAGAGATTTTATATCTGAAAGGCATGGTGTACTGGTGGAAGGTTGGCGAGTAGATCTTAGACCATCAATGATTGGCTCTGACATGTATGCAGTTTACTGTGCACCTGATGGAAAGATATTCGATTCTGTGTATGAAGTAGCTAATTATCTGGGGCTACCGTCTGGCTACAATTCTATGGAATCTGAAGTAAGAAATGAAACGTCTCTTTCTTCTGGTGGGCCTCACCTATCCAGAAAAAGAAAGTCTTCTAGAACTCCGGCAGCCAATGGTTTTGCAGAAAAGCAGGGAACCTTTGTCAATAGTAATTATAAGGATTGTTCTTCTGATGGTTTAAGCATGGAACATGTGAATGCTCAGGGAACCGCCCTAAAAGCCACTGAGATTAGAAGAAAAGAGAATGGTCACTCCGACCCTCATCAATTTGCTGACGAACTTCCTCTGCAGTTTAAGGACTTCTCTGTTCTTTCTTTGGGAAAAGTTGATGGGAGACCTTCATATTATGATGTTAACCTTATCTTTCCTGTGGGTTATAAATCTTTTTTGGATGGGGTGATTCTGGACCTATATTTAGGATTAAAAGGTGTTCATGTTGAATTTCCTATTCCAGATGGGTCAACCATCCTTTCAATGCACAATCATTGTCAATTTGTGAGCCAAACCAATGAAGGTCAGAGAGAGACTAATGATAGTATGGATTTAGACGAACCTTGTGCACCAACAGAAGATGACATCTTGAGTTGTGTTGTCAATTGCTCAAGTGAAGCATATGCATCAGAAGGATTAAGGCCAGTTGCTGGTTCAATTCAATATAATACTGGATACTCATTTTCTGATACTATGAATTTTTGTGATGAAATTGGTCAAATTTTGGTGGAAGAGCGGTCCCCATTCTCAGCATGGAGAGTTATTTCCCAAAAGTTGGTCAATGCTTGCAAGGATATCTGCAAGAAGAACGGAACTTTTAAATTCTATTGTAAACATGTTGAAAGTGAAATGGGCTTACATAGATGGGATTTAAGGAATAGCGAAAATGATACCCACTTCACTTCGTTGGATAAATTTTGTGGTTCACCTGGATCTGTCAGCATTCCAGACACAATTTATGCAGAGAGTGACGTGAAAGACCTGTATGAGCTCTTAGAGAAGTGGTTGGAGCAGGATAGATTTGGACTAGATGCTGAATTTGTCCAAGAAATTTTGGAACCGCTTCTTGGTGTGCAAGACTGTTTGCAGTATGAACGTCTTAGTAGTAGAAACAATAGCTCTTCATTGCCAACAGTGGAAAACGGTTACCTAGTGGTCGATCGTAAAGGTCAATCTAAATATCAGGATGAAGTAATTCAAGGTTTATATAGAAGGCCTAAGAAGGCAAGATTGACCGAGTACGTTAAGGAAAACCGATGTCCACCTCCTGGGAAACCACTGTGCTCCAGAGCTCCTACTGAACTCATTGGTGACATTTTTCAGGTTTGGGATCTTTTAGAGAGATTCAATGAAATTCTAGACCTGAAAGAACCATTGTTCTTAGAAGAGCTTGAGAAGGAACTTATCAACCCATGGTTCAATGAGTTAGATTTCCCTGAGAAATCTGACAGGGGAATGGGTGGAAGTTCACGAGGGGGTGATGGTGATTGCCGATTAATATCTGAAGCCTGTCCATCAGGTTCCACAGGAGCTTCTTCCTATGTCAGATGCTTTGGTGCGTCTTTGACTAAAGCTCACAGTTCACTACTAAGAGTGCTAATAGGTGAACTGCAATCGAAAGTGGCTGCTCTGGTGGATCCAAATTCTGAGCCTGGAGAGGCTCGGACAAGACGGGGAAGAAGGAAAGATATGGATAGTGCAGTTCCGCGGACCAAGATCAATATGCTTCCGATTAATGAATTGACTTGGCCAGAACTAGCGCGTAGATATATCTTGGCTTTCTTGTCAATGGACGGTAACCTGGAGTCTGCGGAGATTACTGCCCGGGAAAGTGGTAAAGTATTTCGTTGCTTAAGAGGTGATGGTGGTTTGCTGTGTGGTTCCCTTCCTGGTGTGGTTGGGATGGAAGCTGATGCATTGTTGCTTGCGGAGGCTACGAAGAAGATTTTTGGTTCTTTGAGCAGAGAAAAAGATGTACTCATCCTAGAAGAAGAGGAGTCTGATGCAAATGGTTCTTCTGAAGCTCAATTGGCGAATGATGGTAATATTCCTGAATGGGCACAAGTGCTGGAACCTGTCAGAAAACTACCAACAAATGTGGGAACCCGAATCAGAAGGTGTGTTCATGCAGCTCTAGAAAAGAATCCGCCCGATTGGGCAAGGAAAATACTGGAGCACTCAGTTAGCAAGGCAGTGTACAAGGGCAATGCATCTGGACCAACAAAGAAAGCAGTTGTTGCATTATTGGATGGTGTAACTGATGGAGTGCAGCAGAATCCCAACAAGGGAAGGAAAAAGAAAATTTTTATATCTATTTCTGACATTATTATGAAACAATGCCGCATTGTGTTACGTCGCGCAGCTGCTTTAGATGATTCGAAAGTTTTTTGCAATTTGCTGGGAAGAAAATTAACAAATTCTTCTGACAACGATGATGAGGGGCTTCTTGGAACTCCAGCTATGGTGGCCCGCCCTCTTGACTTCCGGACTATTGATCTAAGATTGGCTTCTGGAGCTTATGGTGGATCACATGAAGCTTTTCTCGAGGACGTACGTGAGCTGTGGAGCAATGTTCGTGTTGCTTTTGGGGATCAATCTGATTTAGTTGAACTGTTAGAAAAATTATCCCAGAATTTTGAAAGTTTATACAATGAGGAGGTTGTCACCTACGTGCAAAAGTTTACAGACTATGCTGAAGTGGGATGCATAAATGCTGAAATGAAAAAAGAAATTCAGGCTTTTATTGCTTCATCAAATGAGATTCCGAAAGCCCCTTGGGATGAGGGAGTCTGTAAAATTTGTGGCATCGATAGGGATGATGACAGTGTCTTACTGTGTGATACTTGTGACGCTGAGTATCATAAATATTGCTTGAACCCTCCTCTTGCAAGGATCCCTGAAGGAAACTGGTACTGTCCATCTTGTATTGGTGGTAAACATGCAACTCAAGATCTCACAGAACGAACACAGCTTACTGGAAAACGTAGAAGTAAAAAATTCCAGGGACAAGTTAATTGTCTTTACTTGGATGCGTTGACTCATTTATCATCTGTAATTGAAGAAAAAGAATATTGGGAGTACAGTGTGGGAGAGAGAACGCTCCTTCTCAAGTTTTTATGTGACGAGTTGCTCAATTCTTCCCTGATACGACAGCAGCTTGAGCAATGTTCTGAGTTGTCTGCTGAATTAAATCAGAAGTTGCGTGGACTTTCTGTAGAGTGGAAAAACCTGAAAATTAAGGAAGACGCTTTATCCACAAAAGCTGCCAAATTTGGTACATTGTCACAATGTACCACTGGGGAAGTTGGTCTTAAGGAAGGGTTCACATCTTTGTTCTCAAATACTAGTAAATGTCTGGTTAAGCCACATGCTACAACCACCAATCCTAGTGGTCTTGGGGTATTTGATGATAGTCTACCTTCAGAAGAGATTCCCAAAGAGAAGTGTAGGTTCAATAGTGTTGATAAAAGCATATCTGTGACACATTCAAATTCTGATAGCCAAAATATGAATTCCATAGATGGACAGCTTAAGACTGTTCCTGTGGCTGTGGAGTTTCAATGTACAGATAAATCCCCCAAGTCTTTTCCATCCTCAAATCATATGCCTCAAGAAATAAACGGTTACAGTGAAGGACAATGTGTGCCGGTTGAAGTTTCCCAAAATGCTGTTAATGAGTCGGAACCATACCACCTTGAGCTCAATGCCGTCAAGCGTAATATCTCACTACTGCAGGAATCTATAAATAGCGTAGGATCACAGCTTCTGAAGCTCCCTGTTCGTCGGGATCTTTTGGGTATTGATTCCATTGGCCGACTGTACTGGGCTTTGGCTACACCCAGAGGACGTTCACGTATAGTTGTTGATGCAAGCGCTGTTCTTCAGCATGGAAGAGGATTGTCAGTTAGCAAAGATTCTGGAGAGAAGCTTTCTGCTCTGCAGCATTGTAAATTATCTGAGAAGGATAACTATAAGATGTTAGGGCTGATGAAGGGCTGCTCTTCTTTGATGTCCCAACCACTTAATGCGTTAGCCAATAGTTCACCGTGGATTGTTTATGAAACTGATTCAGAAATCGAGGAGCTATTGGGTTGGTTAGATGATTATGACCCTAAAGAAAAAGAACTGAGAGATTCCATTATGCTGGGGCCAAAATATAGATCTCAAGAGTTTATTAATGCACACACTGAAGGTCAGGTTGAGGACCAAGGACCTGTTTGTTTGCCAAGAAATACAGCACCTAACTCTCTTGTTACAAAGGCCACTTCTTTGCTGGAAAAGAATTACGGTCCCTTCTTTGAAACAACCAATGATGAAAAGTTGTATAGGTGTGAGTGCCTAGAACCCATATGGCCTTCTAGGAAACATTGCTTGTATTGCCACAAAACCTTTTTGAGCGATGTGGAGAATAAAGATAAAAATGGATCTTCTAAAGGAAGGAAGAACTTGAAATGTGATACCTCACATGAAAAATCCAGAGCTGACACAGAAACAGCTGGAACCTCAATCAGTAGATGTTCTTCTGTAAATTCGAGATTGACTAAATTTTCAAATGAAAACCCCTCTTGCCCATTTAACTTTGAAGATACATGCTCAAAGTTTGTGACAAATGATTCCAACAAGGAACTTGTCAGAGAAATTGGTCTTATTGGTTCAGATGGTGCCCCATCCTTTGTGCCTTCCGTATCTCCTTTTGTTAGTGATTATACACGACCCTTAACCATAAAAGATGTTGGCGTTGCTGGTGGTGCGTCGAAAGCTTCACAAAGCCAGGTTTCTCAGGAAAACACTGACGGAGCTGGCATATGCCATGACCATAAATCAGGCAAATCTACGGAAAGTTTAGCTGCAAATAGAAGCAACACAGCAGGAAATTCCAACAAATCATCTTTGGGAGAAGAAAGAGATGGGAAGCTATCTATTTGTAGTCCTGCTTCAGATAAGGGAGTTGATGGTTGCTGTGTGGTTCCTTTGTCCTCCTTGAGACCATTAGTTGGAAAAGTTTCTCATATTTTGAAGCAACTAAAGATTAATCTACTTGATATGGATGCTGCACTTCCGAAAGCTGCTCTAAGACCATCAAAGGCACAGTTGGACAGAAGACAGGCCTGGCGTGCATTTGTTAAATCTGCAACGACTATATATGAGATGATCCAGGCAATAATTACACTGGAGGATATGATTAAGACGGAGTTCTTAAAGAATGACTGGTGGTACTGGTCATCATTCTCAGCTGCTGCCAAATCCTCTACTTTGCCTTCTCTTGCTCTTCGCATATACTCCCTTGATTCAGCCATTATGTATGAGAAAATGCCTAATTCAAGTTTAACTGAGAGCTCTGATCCTCCTGCCGTAGCGGAACCGAAACCAGTGATCACGGTGGATGCAGATAAATCCAAAGGAAGCCGGAAGTCAAACAGGAAAAGGAAGGAATTGGATGGTTGA

Protein sequence

>MsaT030140.1

SKQLLDINASPPSDVDGKSCMNRVYIHFCFRKHAMGDKSFAANQFGASVTYSTFNNGSVVGFQRASGAVTRPVRVGFEDILNHTQSMARSFEEVPSQTQGPNELILQALRDFISERHGVLVEGWRVDLRPSMIGSDMYAVYCAPDGKIFDSVYEVANYLGLPSGYNSMESEVRNETSLSSGGPHLSRKRKSSRTPAANGFAEKQGTFVNSNYKDCSSDGLSMEHVNAQGTALKATEIRRKENGHSDPHQFADELPLQFKDFSVLSLGKVDGRPSYYDVNLIFPVGYKSFLDGVILDLYLGLKGVHVEFPIPDGSTILSMHNHCQFVSQTNEGQRETNDSMDLDEPCAPTEDDILSCVVNCSSEAYASEGLRPVAGSIQYNTGYSFSDTMNFCDEIGQILVEERSPFSAWRVISQKLVNACKDICKKNGTFKFYCKHVESEMGLHRWDLRNSENDTHFTSLDKFCGSPGSVSIPDTIYAESDVKDLYELLEKWLEQDRFGLDAEFVQEILEPLLGVQDCLQYERLSSRNNSSSLPTVENGYLVVDRKGQSKYQDEVIQGLYRRPKKARLTEYVKENRCPPPGKPLCSRAPTELIGDIFQVWDLLERFNEILDLKEPLFLEELEKELINPWFNELDFPEKSDRGMGGSSRGGDGDCRLISEACPSGSTGASSYVRCFGASLTKAHSSLLRVLIGELQSKVAALVDPNSEPGEARTRRGRRKDMDSAVPRTKINMLPINELTWPELARRYILAFLSMDGNLESAEITARESGKVFRCLRGDGGLLCGSLPGVVGMEADALLLAEATKKIFGSLSREKDVLILEEEESDANGSSEAQLANDGNIPEWAQVLEPVRKLPTNVGTRIRRCVHAALEKNPPDWARKILEHSVSKAVYKGNASGPTKKAVVALLDGVTDGVQQNPNKGRKKKIFISISDIIMKQCRIVLRRAAALDDSKVFCNLLGRKLTNSSDNDDEGLLGTPAMVARPLDFRTIDLRLASGAYGGSHEAFLEDVRELWSNVRVAFGDQSDLVELLEKLSQNFESLYNEEVVTYVQKFTDYAEVGCINAEMKKEIQAFIASSNEIPKAPWDEGVCKICGIDRDDDSVLLCDTCDAEYHKYCLNPPLARIPEGNWYCPSCIGGKHATQDLTERTQLTGKRRSKKFQGQVNCLYLDALTHLSSVIEEKEYWEYSVGERTLLLKFLCDELLNSSLIRQQLEQCSELSAELNQKLRGLSVEWKNLKIKEDALSTKAAKFGTLSQCTTGEVGLKEGFTSLFSNTSKCLVKPHATTTNPSGLGVFDDSLPSEEIPKEKCRFNSVDKSISVTHSNSDSQNMNSIDGQLKTVPVAVEFQCTDKSPKSFPSSNHMPQEINGYSEGQCVPVEVSQNAVNESEPYHLELNAVKRNISLLQESINSVGSQLLKLPVRRDLLGIDSIGRLYWALATPRGRSRIVVDASAVLQHGRGLSVSKDSGEKLSALQHCKLSEKDNYKMLGLMKGCSSLMSQPLNALANSSPWIVYETDSEIEELLGWLDDYDPKEKELRDSIMLGPKYRSQEFINAHTEGQVEDQGPVCLPRNTAPNSLVTKATSLLEKNYGPFFETTNDEKLYRCECLEPIWPSRKHCLYCHKTFLSDVENKDKNGSSKGRKNLKCDTSHEKSRADTETAGTSISRCSSVNSRLTKFSNENPSCPFNFEDTCSKFVTNDSNKELVREIGLIGSDGAPSFVPSVSPFVSDYTRPLTIKDVGVAGGASKASQSQVSQENTDGAGICHDHKSGKSTESLAANRSNTAGNSNKSSLGEERDGKLSICSPASDKGVDGCCVVPLSSLRPLVGKVSHILKQLKINLLDMDAALPKAALRPSKAQLDRRQAWRAFVKSATTIYEMIQAIITLEDMIKTEFLKNDWWYWSSFSAAAKSSTLPSLALRIYSLDSAIMYEKMPNSSLTESSDPPAVAEPKPVITVDADKSKGSRKSNRKRKELDG*