AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa ssp. caerulea / MsaG035915


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Find sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-GE

Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 24452553 24464665 24452553 ID=MsaG035915
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Gene Sequence

>MsaT035915.1

ATGGCGCTTCCTCCACAACCCGATTCCAACAATGGAGGAATTGTCGCCAACGCCACCGAAGAAACTGACGGAACTCCCATTCGATATCTTCCTCTCGATCATCTCTACTCCGCTACATCACCTTGTAGCGGTTCATCCAATGTCATGTCAAAAAAAGTTAAAGCACGAAAACTCACCAACAACAACAACGAAGACAACGAGATTCAGTTCAGTAATGGTGAAATCGATGATTCACCGATTGAAATTGAAAAAACCATGTCGAAGATGACGTTGTTTTCTGTGGAGGATTTTCCAAAACCGCCGCTTTTGTTTGTTTACTCGCGCCGGCGACGGAAGAGAAGTTCAATTGAAGTTGATTGTGAAAGGACGGCGTTGAAGAGGAGGAGAATTGGGAGTAATGAGTTGGAGGGATTAGGGATTGATTTGAATTTGATTGGGAAAATTGATGATGGACCTGGATTGAGAAAATGTCGAAATCAAATTGGGATTTTTTCTGAGAATTGTGATTCTGTTGCTAAGAATTCAAAGTTGGTGCCTGAATCTTACACATTGAAGAGATGGGTCGCGTTGAGTTTTGATGATGCCAATCCGGAGGCTTTTGTTGGATTGAAATGCAAGGTTTACTGGCCTATGGATTTAAAATCATACACTGGCCTTGTCAAAAGTTACGACAGGGAAGCTAAGATACATCATATCGAGTATGATGATGGAGAAGAGGAAAATTTAATTCTTTCAAATGAAAATGTAAAATACCATGTTTCCCGTAACGACATGGAACGTTTAAAATTGAGTTACGCCAAAGTTCATGACAATAATGTCTCTGATTATAATGTTGAAGAGATGCTCGCATTGGCTGCAAGTATGAATGATTGTCAAGACTTTGAGCCCGGGGATATAGTATGGGCCAAGCTTACAGGTTATGCTATGTGGCCAGCAGTTGTTCTGGATGAATCACTTGCTAGCAGCTGTAAGGGTTTAAAAACTTTCGTAGGGGGGAGATCAGTTCCTGTCCAATTTTTTGGCACCCATGACTTTGCAAGAGTTCGAGTGCAACAGGTGAAATCATTTCTCAGTGGACTTCTAACAGATCTACACTCAAAGTGCAAGAAACCGAGTTTCATTGAAGGTTTAGAAGAGGCAAAAAGATATGACTGTAACAATGTAAGTGGAGAGGATGGAGGATGTTCAGATTCGGGTGAAGACTATGTAAGTGACAAAGGGACTTGGGCAGCACTTCAAAAGATCGACACCTTTCCTTATGAAGTGGGAGACTTGCAAATTCTAAGCCTTGGAAAGGTAGTTGGAGATTCTACAGCTTTTCGGGATGGAAGATCCATCTGGCCTGAAGGGTACACAGCAGTGAGGAAGTTCACTTCAGTTACTGACCCTGAAGTATCTGTCCCTTATAAGATGGAGGTTTTGAGAGATCCAGAATCCAGATTCAGACCACTATTTAGAGTGACAGTTGATGGTGGTGAGCAGTTCAATGGTTATAAACCGTCTACTTGCTGGAATCAAGTATACGAAAGGATAAAGAAATTGAAAAAGGCTGTTTCTGAAGGTTCTGTTGGATTATCTAAATCCAAAGTCTCTTCGAAGAAATCAATTTGCAAGTCAGGTTCCAGATTACCTGTTGGTTATAGGCAGGTTCATATTAATTGGTTTGATCTCGATAAGTGCAATGTGTGCCATATGGATGAGGAGTACGAGAACAATCTCTTTCTGCAGTGCGACAAATGCAGAATGATGGTCCATGCTAGATGCTATGGAGAACATGAACCTGTTAATGGAGTGCTATGGTTATGCAACTTATGTCGCTCGGGTGCTCCTCCCCCACCTTGTTGCTTATGTCCACTCATAGGTGGTGCAATGAAGCCTACAACGGATGGCCGATGGGCTCATTTGGCTTGTGCCATGTGGATACCTGAAACTTGCTTAGCTGATGTCAAGAGAATGGAGCCTATTGATGGTTTGAGGAGAATCAGTAAGGACCGTTGGAAGTTGTTATGCAGCATATGTGGTGTATCTTATGGTGCTTGCATCCAATGTTCAAACAATTCTTGTCGAGTAGCATATCATCCACTCTGTGCACGTGCAGCTGGTCTTTGTGTTGAGCTTGAGAACGAGGACAGGCTCTACCTACTTTCTGTAGATGACGATGAGGATCAGTGCATTCGCTTACTTTCTTTCTGCAAGAAACATAGGCAGCCATCTCATGATCATTCTGTTGCCGATGAACGTGTCCAGGTTATTGGTCAATGTTCAGACTATGAACCACCACCCAATCCATCTGGGTGTGCCCGAAGTGAACCATATGATTACTTTGGTAGGAGAGGCCGAAAAGAACCTGAAGCACTTGCAGCTTCATCGCTGAAACGTTTATTTGTGGAGAATCAACCTTACTTAGTTGGTGGATACTGCCAACATGGATTGTTGAACGACCCAGAGCCTTCTGGCAGAGGAGTCTGCTCAAAATTCTTTTGTAGTGAACAAAGGCTGAGAACCTCTATGGTTGATGCTGCAGACAGCATACTTACTGTTGCCGAGAAATATAAGTACATGAGGGAAACTTTTCGGAAACAGTTGGCTTTTGGGAAATCAAGAATTCATGGATTTGGTATCTTTGCAAAGCATCCATATAAAGGTGGAGACATGGTGATTGAATACACTGGTGAACTTGTTAGACCTCCTATAGCTGACCGGAGAGAGCGTTTTATATACAATTCTTTGGTGGGTGCTGGAACATATATGTTTCGGATTGATGATGAACGAGTCATTGATGCCACTAGAGCAGGAAGCATTGCTCATTTAATTAATCATTCCTGTGCGCCAAATTGCTATTCAAGAGTCATTAGTGTTAACGGCGATGAGCATATTATAATATTTGCCAAGAGGGACATTAAACAATGGGAAGAGCTCACATATGATTATAGATTTTTCTCAATAGATGAGCGGCTTTCTTGTTACTGTGGCTTCCCAAAATGTCGAGGTGTAGTAAATGATACTGAGGCAGAAGAGCGAGCTGGTACCCGATATGCACCACGAAGTGAATTAGTAGATTGGAAAGGAGAATGA

Protein sequence

>MsaT035915.1

MALPPQPDSNNGGIVANATEETDGTPIRYLPLDHLYSATSPCSGSSNVMSKKVKARKLTNNNNEDNEIQFSNGEIDDSPIEIEKTMSKMTLFSVEDFPKPPLLFVYSRRRRKRSSIEVDCERTALKRRRIGSNELEGLGIDLNLIGKIDDGPGLRKCRNQIGIFSENCDSVAKNSKLVPESYTLKRWVALSFDDANPEAFVGLKCKVYWPMDLKSYTGLVKSYDREAKIHHIEYDDGEEENLILSNENVKYHVSRNDMERLKLSYAKVHDNNVSDYNVEEMLALAASMNDCQDFEPGDIVWAKLTGYAMWPAVVLDESLASSCKGLKTFVGGRSVPVQFFGTHDFARVRVQQVKSFLSGLLTDLHSKCKKPSFIEGLEEAKRYDCNNVSGEDGGCSDSGEDYVSDKGTWAALQKIDTFPYEVGDLQILSLGKVVGDSTAFRDGRSIWPEGYTAVRKFTSVTDPEVSVPYKMEVLRDPESRFRPLFRVTVDGGEQFNGYKPSTCWNQVYERIKKLKKAVSEGSVGLSKSKVSSKKSICKSGSRLPVGYRQVHINWFDLDKCNVCHMDEEYENNLFLQCDKCRMMVHARCYGEHEPVNGVLWLCNLCRSGAPPPPCCLCPLIGGAMKPTTDGRWAHLACAMWIPETCLADVKRMEPIDGLRRISKDRWKLLCSICGVSYGACIQCSNNSCRVAYHPLCARAAGLCVELENEDRLYLLSVDDDEDQCIRLLSFCKKHRQPSHDHSVADERVQVIGQCSDYEPPPNPSGCARSEPYDYFGRRGRKEPEALAASSLKRLFVENQPYLVGGYCQHGLLNDPEPSGRGVCSKFFCSEQRLRTSMVDAADSILTVAEKYKYMRETFRKQLAFGKSRIHGFGIFAKHPYKGGDMVIEYTGELVRPPIADRRERFIYNSLVGAGTYMFRIDDERVIDATRAGSIAHLINHSCAPNCYSRVISVNGDEHIIIFAKRDIKQWEELTYDYRFFSIDERLSCYCGFPKCRGVVNDTEAEERAGTRYAPRSELVDWKGE*