AlfalfaGEDB | MsaG046809

M. sativa ssp. caerulea / MsaG046809

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PFAM: PF16282.8

Nr:

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Swissprot:

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Trembl:

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MsaG046809	tr\|A0A1S3E296\|A0A1S3E296_CICAR	72.464	759	110	8	1	745	1	674	0.0	1070

TFs/TRs:

Gene ID	Type	Classification
MsaG046809	TF	MYB-related

Protein Kinases:

Gene ID	Type	Classification

Network:

Co-expression Network

Gene1	Gene2	correlation coefficient	p_value	FDR

PPI

Gene1	Gene2	Type

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MsaG046809	MtrunA17_Chr1g0194351	97.059	408	12	0	1	408	1	408	0.0	817
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Find 0 sgRNAs with CRISPR-Local

Find sgRNAs with CRISPR-GE

CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence	on_target_score	Position	Region

CRISPR-GE

badsite warning	sgRNA_sequence	Strand	Position	Region	GC_content

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Gene Sequence

>MsaT046809.1

ATGGATGTGAAAAATATCCTTGGAGGATTACCCAATTTTTCCTTCCCACTTCAGGAGAAGAATTCTAGCGAGGTGTATGCACTTACTGGTGGATTTGCACCTCTTATGCCAGCAGTTGATTTGTCTCTGTTGAGAAAAAAGCCCCCTTCAGACAAAAAGGTCATTTGGCGATGGCTTCCTTTCAAAAATTCTGCTCGTAAAGATGATCTTCAGCTTCACCATTGGATTCAAATTGTAAATGGTGTTCCACCAACAGGGGACTATTCTTTTGCCAAGTATAACAAGTCTGTTGACATAACAAGATACACGGACGAGGAGTATGAGAAATATTTGGCAAATCCTAAATGGACCAAGGAGGAAACAGATCAACTGTTTGACTTGTGTGAGAGGTTTAATCTCCGATTTATTGTTATAGCTGATAGGTTCCCTTCATCTCGAACTGTTGAAGAATTGAAGGATCGATATTATAGTGTATCCCGGGCTATGTTAATTGCCAGGAATCCATCTTCTACGGATGTTGCAGTGGATCCACTTGTTCAGGAACCATATAACGTTTCACAGGAGATGGAGCGGAAACGAGCTCAGTCCCTGATCCTCTCTCAAACAAAGCAACAAGAGCGAAGAGATGAAGAGGTGCTTGCCGAAGCAAAAAGAATTGCTGAATTACGCATAACGACCAAGGTTGCCCGAGAGTCTGAGTTGGATGTTGCTTCAAAGGCTTGTGCAAACGTTACAGAGAGGGCCAACCCCGGTGAAACTGTATCTCCATCAAATACAGAACTTCCACCAATAGTCGTGCCTTCCATGATATCGACAGATAATGCATCTACCATAGCCTCTCTTCGCATGCTTTATGTCTATTCAAGAACCTATGCACTTGGACAAATGGTGCAATCTGCAAGCTCATCAGCTGGACTTCGGACTATCAAACGTGTTGATCAAACTTTGCTGGAACTTGGGGTCAATTTGAAACCAAGGGTTCCAACAAAAGCTGTTTGTGCAGAGCATCTAGAACTAAGAAATGAAATACTAACCTTGCTGAATCTTCAGAAACAGCTGCAAAATAAGGAGGCTGAAGGTTCATCTTTTCGTGACGGGTCACACTGCGAAACAACGGGAACACCAAAGCGTTTGCATCGAGGCGGAGATCAGGATCTGACATTTGTTCCAGATAACACAAGTTCTGGGGGGGAAAGAATTGGTAAAAGGGATCAAAAGCGCAAGACCAATGCTAAAGCACATTATTTATTTATTTATTTTATCTTGGAAACGTTACCTGTAAATGCGTCTGGACGACATTCAGAAACTTCATCATCACCAGCCCAATCAAAAAGACAGAAAAAACTGAAGGCTTCAGATCTTTATCTAAATCATCCAACACACTATGTGGACAGAGTTAAACATGAACAGGATTTGATAAAATTGAATCAACCTCATCATGTCCCAAAAACCAATCATTTTCTACTTCGTTGTTTAACTCGATGCTCGCACAAAAGGTGTAATATGCAATACCTTCTTTCATTTGGTTCCCCTTCATCTTTTGAGGCTTATAAACTCCACACAGTACGCAAACGGGGTCTGCTTAAGCCTCACCGTGCTGTCAATCAGCAGAGCCAAACTAGCGTTACAGCTTCATGGCCTCGTGTGTCACTTTCACTCTTCGGCACAGGATTCGTGTTTGGTCCACTTCTCGATGGACTCCATTCGAGAGTCGAACTCGTTTCGTACAAGTTCGGAGCAATTGACATTGGCCCACTCCATACAAACATCTGGGTTCCTCCCTTGCTGGGGTTGTTTTACTGCTCGGTTGGTTTGCTTCAACTCTACCTTGATGAGAGGGTCTTAAACAAAGTTCAAGAGGGAAGTTTAACAAAAACAATATCCTCCCTGATATTAGTAGCGTTGTTCATAGAGTTGAGTGCTGAACTATACAAAGCCGGAATAGCAGACAACGTCGAGGCCTACATATTATTTGCAGCAGCAGAGTTCCTATGGTTTTTGTTGAATGGAACATGGCCAGGCTTCACCCTCTCATGCATTGTTGGGTTTGCTTGTCCACTAGCTGAGATACCCTTAATGAAGTTCCTTCACCTTTGGTACTATCCTCAAGCTAACATTGAAATCTTTGGCCAGGGACTCGTTACTTGGACACTCACTTGCTACTTTGTGTACACGCTCTTCTTAATTAATTTGTCACGGTGGTTCAGAACAGTTTATGTCGCTCAAACAGAGGAGTCTGATGCATAA

Protein sequence

>MsaT046809.1

MDVKNILGGLPNFSFPLQEKNSSEVYALTGGFAPLMPAVDLSLLRKKPPSDKKVIWRWLPFKNSARKDDLQLHHWIQIVNGVPPTGDYSFAKYNKSVDITRYTDEEYEKYLANPKWTKEETDQLFDLCERFNLRFIVIADRFPSSRTVEELKDRYYSVSRAMLIARNPSSTDVAVDPLVQEPYNVSQEMERKRAQSLILSQTKQQERRDEEVLAEAKRIAELRITTKVARESELDVASKACANVTERANPGETVSPSNTELPPIVVPSMISTDNASTIASLRMLYVYSRTYALGQMVQSASSSAGLRTIKRVDQTLLELGVNLKPRVPTKAVCAEHLELRNEILTLLNLQKQLQNKEAEGSSFRDGSHCETTGTPKRLHRGGDQDLTFVPDNTSSGGERIGKRDQKRKTNAKAHYLFIYFILETLPVNASGRHSETSSSPAQSKRQKKLKASDLYLNHPTHYVDRVKHEQDLIKLNQPHHVPKTNHFLLRCLTRCSHKRCNMQYLLSFGSPSSFEAYKLHTVRKRGLLKPHRAVNQQSQTSVTASWPRVSLSLFGTGFVFGPLLDGLHSRVELVSYKFGAIDIGPLHTNIWVPPLLGLFYCSVGLLQLYLDERVLNKVQEGSLTKTISSLILVALFIELSAELYKAGIADNVEAYILFAAAEFLWFLLNGTWPGFTLSCIVGFACPLAEIPLMKFLHLWYYPQANIEIFGQGLVTWTLTCYFVYTLFLINLSRWFRTVYVAQTEESDA*