AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar zhongmu-4 / Msa1138420


Find 179 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 358 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-GE

Chromosome Type Strat End Strand Name
chr7_4 gene 7891638 7896666 7891638 ID=Msa1138420;Name=Msa1138420
chr7_4 mRNA 7891638 7896666 7891638 ID=Msa1138420-mRNA-1;Parent=Msa1138420;Name=Msa1138420-mRNA-1;_AED=0.43;_eAED=0.43;_QI=0|0|0|0.5|1|1|2|0|982
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chr7_4 exon 7896295 7896666 7896295 ID=Msa1138420-mRNA-1:exon:2171;Parent=Msa1138420-mRNA-1
chr7_4 CDS 7891638 7894214 7891638 ID=Msa1138420-mRNA-1:cds;Parent=Msa1138420-mRNA-1
chr7_4 CDS 7896295 7896666 7896295 ID=Msa1138420-mRNA-1:cds;Parent=Msa1138420-mRNA-1
Gene Sequence

>Msa1138420

ATGGCAAACACCAAAAATAACACTAAAATCACCCTCCTATCTCTCATTTTCCTATTGTTCCTTCTAGTTGCTAAATCATACGCATACAACCCTGATTACAATTTAGCCATCAATTGTGGCTCCTCAACAAACACTACTGCCTTAGATAAACGAATTTGGGTTGGTGATAATATTGATAACAAAAATCTCTTTTCCTTCACTGAACCAAAAACCACAAACCCATCTCTTAAAACATCACCCAATTCCCCGTCAAACATCCAAGCTCCGTACACATACGCACGTATCTCACTCTCAAATTTCACATACTCATTTTCTACCATCACTAATTCGCCTGTTTTTGTTCGCCTTTTATTTTACCCAACATCATACCAAAACTTTGAACCTTCTAATTCCCTTTCAAATGCACTTTTCTCTGTTAAAGTAAACAATAACCTAACCCTACTTGAAAACTTCAACCCTTCACTTTGGCTTCGTGACGATGAGGAAAAAATCACCAAAGAATATTGTATCCAAATCAATCCAAATGAGAACCTAAACATAACTTTCATTCCCAACAACATAAATCAATCAAATCCTTATTATGCTTTCATTAACGGAATCGAAGTTGTGTCTATGCCGCCTTTTCTCTATTACACAAACCTAAGCGACCAGAATTATCATTTTAAATCAATAGGCTTAGACATCACAGATTACCAAGTTCTGAACGACAAAGCTTTAGAGACAGTTTATAGAGTCAATGTTGGTGGCAATCAAGTTCCACAAAACCAAGATACAGGTATGTTTCGTAACTGGGACAATGATTTTCCTCGTTACTTGGAAAAAGAATATCCACAAAGTCTATCAAGTGATTATACTCATCATCCTAACTATAAAAACAACACCATTCCAAATTACACTGCACCAGAAGCTGTTTACTTAACTGCAAGAAGTTATGGAAAGTATGTGACAGAGGATTACAATGTAACATGGAATTTTGAGGTTGATTTGAACTTTACTTATATGGTAAGGTTACATTTTTGTGAGTTTGATTGGCATATCAATAATCCAGGTGATAGAGCCTTTCAGATTTTCATAGCCAACAGTTTGGCTGAGGAAAATGCTGATGTGATATTGTGGAGTGGTGCTCGTATGGTTCCTGTTCATAAGGATTATGCTGTGTTTATGTACTCTCAAGAAGGAGCCTCTCAAATTGAAAGAGTTAATCTTTCGATCAAGCTACAACAATTACCTATATTCACAAGATATCTTGATGTTACATTGAATGGAATCGAGATTTTTAAAATAAATGATAAAAATAATAATCTCTTTGGATCAAATCCAAAACCCATTATTTTAACTCCTAATGAAGAAGTTTTACCAACTCGAAAATCAAGGAAATCAACCATAGTTATCCTTGTTGTGGTTGTAGTTTCATGTCTTATGCTAGCAGCTGTTATTGGAATTCTAGTTTTTGTTCAAAGGAGAAGAAGGTTTGAATCTCATATTGATAGGGGAGAAATTTCATGCAAGACAAAGAAAGAGGATTCATCGTCTTTACCATCCCATTTGTGCCGCTATTTTACAATAGCAGAGATAAGAGCTGCTACAAACAACTTCGACAATGTTTTCATCATTGGAGTTGGAGGGTTCGGCAATGTGTACAAAGGTTATATTGATGACATACCTGTTGCGGTAAAACGTCTTAAACCAGGTTCTCAACAAGGTGTAAATGAGTTCATGAATGAGATCGAGTTACTCTCCCAGCTTCGTCATATTCACTTGGTTTCCCTCATTGGATATTGCAACGAAGGTGAGGAGATGATTCTGGTTTATGACTTCATGCAACGTGGCACTCTCCGTGAATATCTCTATGGTTCAGATAATGAACCTCTTACGTGGAAGCAGAGACTTGAGATTCTATTGGGGGCAGCCAGGGGGTTACATTATCTTCATGCAGGCGCAAAGCACAATATCATACACCGTGACGTGAAAAGTACCAACATACTCTTGGATGAAAAATGGGTGGCTAAGGTGTCTGATTTCGGGTTATCAAAAGTGGGACCAACAGGAATGTCGATGACTCATGTCAGCACCGTGGTGAAGGGCAGCCTTGGATATTTAGATCCCGAATACTACCTTCGTCAAAGGTTGACTCTAAAATCCGATGTGTATTCTTTTGGCGTGGTGCTTCTAGAGGTGTTGTGTGCAAGACCTCCTCTGGCTCGTTCCTCGGATAAGAAAAAATCGAGTTTGGTTGTTTGGTTCAAACAATGTTACAATGAAGGTGTGGTAATTGAAGAGATGGTGGACCTATTCATAAAAGATTCAATAACAGCTGAATGTTTGAAAAGTTATTGTGAGATGGCGTTGAGTTGTTTGCATGACGATGGGAATGAAAGAATGTCAATGAGTGATGTTGTTGGAGCGTTAGAGTTTGTGTTGCAGTTGGAGATGAGTGAGGAGGATAGTAGGTTCTGTAGAACCCAAGAAAAGGAAAAAAATCAGCAGAGTATAAATTTGCCGCAGTTTATGAGTGATGACGGGAGTGATGTGTGTTGCACAAGTAGTAGTGGAAACTATGAGTCACATACCAGCAAGGGTTTAATCATTGATAAAATCAAAAATACAATTTATGATGGGGATAACAAGAGGTTTATCTACCTTGGTGATGGTGCTGGAGATTATTGCCCTAGCTTGAGGTTTAAAGAGAGAGACTTTGTGATGCCAAGGAAGAACTTTCCAGTGTGGGATTTGATATGCAAAGACCCTTCACTTGTTAAGGCTGAAATTCATGCTTGGTGTGATGGAGAAGAGCTTGAACAAATTTTGATTCAACTGATCAACAAAATTATCATTGAAGAAAATGCTCAGTTCATTGCTACTGATTGCAAGCTGCAAACTCTATCAATTCCATTGCATGAAACCATGCCTAAAGCTCTCTCAGTTAGTGATATGACCCAATTCGAGTAG

Protein sequence

>Msa1138420

MANTKNNTKITLLSLIFLLFLLVAKSYAYNPDYNLAINCGSSTNTTALDKRIWVGDNIDNKNLFSFTEPKTTNPSLKTSPNSPSNIQAPYTYARISLSNFTYSFSTITNSPVFVRLLFYPTSYQNFEPSNSLSNALFSVKVNNNLTLLENFNPSLWLRDDEEKITKEYCIQINPNENLNITFIPNNINQSNPYYAFINGIEVVSMPPFLYYTNLSDQNYHFKSIGLDITDYQVLNDKALETVYRVNVGGNQVPQNQDTGMFRNWDNDFPRYLEKEYPQSLSSDYTHHPNYKNNTIPNYTAPEAVYLTARSYGKYVTEDYNVTWNFEVDLNFTYMVRLHFCEFDWHINNPGDRAFQIFIANSLAEENADVILWSGARMVPVHKDYAVFMYSQEGASQIERVNLSIKLQQLPIFTRYLDVTLNGIEIFKINDKNNNLFGSNPKPIILTPNEEVLPTRKSRKSTIVILVVVVVSCLMLAAVIGILVFVQRRRRFESHIDRGEISCKTKKEDSSSLPSHLCRYFTIAEIRAATNNFDNVFIIGVGGFGNVYKGYIDDIPVAVKRLKPGSQQGVNEFMNEIELLSQLRHIHLVSLIGYCNEGEEMILVYDFMQRGTLREYLYGSDNEPLTWKQRLEILLGAARGLHYLHAGAKHNIIHRDVKSTNILLDEKWVAKVSDFGLSKVGPTGMSMTHVSTVVKGSLGYLDPEYYLRQRLTLKSDVYSFGVVLLEVLCARPPLARSSDKKKSSLVVWFKQCYNEGVVIEEMVDLFIKDSITAECLKSYCEMALSCLHDDGNERMSMSDVVGALEFVLQLEMSEEDSRFCRTQEKEKNQQSINLPQFMSDDGSDVCCTSSSGNYESHTSKGLIIDKIKNTIYDGDNKRFIYLGDGAGDYCPSLRFKERDFVMPRKNFPVWDLICKDPSLVKAEIHAWCDGEELEQILIQLINKIIIEENAQFIATDCKLQTLSIPLHETMPKALSVSDMTQFE*