AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar XinJiangDaYe / MS.gene047533

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
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AATGCCTCCTTCTGTCTGTT+TGG 0.286138 2.1:+71891180 MS.gene047533:CDS
AGCTGAATTTCAAATTCTTT+TGG 0.286195 2.1:-71877577 None:intergenic
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AGGGTTTCTTGATGCAATCT+TGG 0.307508 2.1:-71869595 None:intergenic
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TTGGAACTACTTGGGCAAAT+AGG 0.316467 2.1:+71892744 MS.gene047533:CDS
TATAATGAAGAGACACGTTT+AGG 0.319446 2.1:+71869795 MS.gene047533:CDS
CTCTTCAAGCCTAGCCAGTT+TGG 0.320115 2.1:-71881631 None:intergenic
TGATCAGAGTCATTTATTCT+TGG 0.328753 2.1:-71890994 None:intergenic
CTTGAAGCAAAGATTATATA+TGG 0.331484 2.1:+71863990 MS.gene047533:CDS
TTATACTCACCAAGTTGTTT+AGG 0.332203 2.1:-71869777 None:intergenic
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AATGCGCATAACATCTGTTC+TGG 0.338130 2.1:-71886528 None:intergenic
GATCAGAGTCATTTATTCTT+GGG 0.351458 2.1:-71890993 None:intergenic
GGGTAAAACTCCTTCCTCTC+TGG 0.355312 2.1:-71891641 None:intergenic
TATTGTCTGCCTGTAAAATC+TGG 0.355553 2.1:-71887786 None:intergenic
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TGCACAATGACTTTCTTGTT+AGG 0.360968 2.1:-71869615 None:intergenic
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AATGAGGATGTCTTTATGAT+TGG 0.374518 2.1:+71883355 MS.gene047533:CDS
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TACCATCATAATGTCTTTGA+CGG 0.402975 2.1:+71859757 None:intergenic
GCACAATGACTTTCTTGTTA+GGG 0.412038 2.1:-71869614 None:intergenic
TTTCTTCATGCCAGATTCGC+GGG 0.418041 2.1:+71891591 MS.gene047533:intron
TAGTTTATGGTCATACGGTT+TGG 0.418402 2.1:-71883317 None:intergenic
CAATTTGAGACACCAATAAC+TGG 0.419193 2.1:-71877608 None:intergenic
ATCTTTGCCTCCAGATGTCT+TGG 0.419636 2.1:-71881103 None:intergenic
GAGTGGGACAATCACCTCTA+TGG 0.421554 2.1:-71886196 None:intergenic
TTTATTAATCTAAAGTTTGA+AGG 0.423631 2.1:+71869732 MS.gene047533:CDS
CAAGAAGATATTAGGACAAA+TGG 0.424307 2.1:+71877066 MS.gene047533:CDS
GACCATAAACTACTTCTTGA+AGG 0.425129 2.1:+71883328 MS.gene047533:CDS
TTTCACGCCTCGACAAGTCT+CGG 0.425229 2.1:+71892230 MS.gene047533:CDS
AAAAGAATTTGAAATTCAGC+TGG 0.427109 2.1:+71877579 MS.gene047533:CDS
TGATTGGCATCAAATTTACT+AGG 0.430597 2.1:+71883371 MS.gene047533:CDS
ATTTGCAGGTGTAAATATAA+AGG 0.431488 2.1:+71889514 MS.gene047533:intron
TTCACGCCTCGACAAGTCTC+GGG 0.431958 2.1:+71892231 MS.gene047533:CDS
TCTGTTCTGGGCTGCGTAGA+TGG 0.432566 2.1:-71886515 None:intergenic
TATTGATCATGCAGATGTAA+TGG 0.438667 2.1:+71886343 MS.gene047533:CDS
TACATGGAAGCTGAGATTAG+AGG 0.439585 2.1:-71869508 None:intergenic
AAGAATAAATGACTCTGATC+AGG 0.441660 2.1:+71890996 MS.gene047533:CDS
ATAATGAAGAGACACGTTTA+GGG 0.444515 2.1:+71869796 MS.gene047533:CDS
TCCTTAGCTGTCATCACCTA+TGG 0.444874 2.1:+71869483 MS.gene047533:intron
CAGATTGCAAATCTGCTTGA+CGG 0.447315 2.1:+71892178 MS.gene047533:intron
CATCAGTGTTCTAATTATGA+AGG 0.447798 2.1:+71889039 MS.gene047533:CDS
GGCTTCTAACTTGTAAGATA+AGG 0.451073 2.1:-71869574 None:intergenic
AATTGCACATGGAGAGGAAC+TGG 0.452040 2.1:+71877626 MS.gene047533:CDS
GACGCTTCTTCATAATGTTA+GGG 0.453224 2.1:-71875114 None:intergenic
ATCATAATGTCTTTGACGGT+TGG 0.455046 2.1:+71859761 None:intergenic
ACTTACACCTTCGGCTTACA+AGG 0.455491 2.1:+71881928 MS.gene047533:CDS
GCTTATACAACTTACACCTT+CGG 0.456485 2.1:+71881919 MS.gene047533:CDS
CATAATGTCTTTGACGGTTG+GGG 0.456537 2.1:+71859763 None:intergenic
ATGGATGTCTCCAAGACATC+TGG 0.457629 2.1:+71881093 MS.gene047533:CDS
CTTCTGAGTCTAACTTGAAA+AGG 0.460418 2.1:+71875152 MS.gene047533:CDS
AAAGAAGTTACGCGTAAGAA+AGG 0.464209 2.1:+71860850 MS.gene047533:CDS
ACTGAGAGATTCCGAGATCA+AGG 0.465252 2.1:+71881663 MS.gene047533:CDS
TACAGGCAGACAATAATTCT+GGG 0.469425 2.1:+71887794 MS.gene047533:CDS
TGGTTCCAGGCAGCAGCTAT+CGG 0.469806 2.1:+71881402 MS.gene047533:intron
GAAAGTCATTGTGCATTATC+CGG 0.471229 2.1:+71869623 MS.gene047533:CDS
CATGTCACTAAATGTGATGC+TGG 0.472359 2.1:+71869978 MS.gene047533:CDS
AGTTCTCCCTAAAATTCAAC+AGG 0.472995 2.1:+71889549 MS.gene047533:CDS
AAACTTTAGATTAATAAAAG+TGG 0.473624 2.1:-71869727 None:intergenic
AACTGGCCAAAATATCTTGA+AGG 0.475405 2.1:+71877643 MS.gene047533:CDS
GGTAAAACTCCTTCCTCTCT+GGG 0.480136 2.1:-71891640 None:intergenic
TGAGGGAAGCTTCATTTACA+TGG 0.480889 2.1:-71869524 None:intergenic
CAGACAGAAGGAGGCATTGT+GGG 0.485479 2.1:-71891175 None:intergenic
GGTTCCAGGCAGCAGCTATC+GGG 0.489703 2.1:+71881403 MS.gene047533:intron
TTGTGTACCGTGTTGTAAAG+AGG 0.491265 2.1:+71881897 MS.gene047533:CDS
ATGCGCATAACATCTGTTCT+GGG 0.493418 2.1:-71886527 None:intergenic
CGGTACACAATATTTGCAAA+TGG 0.494963 2.1:-71881884 None:intergenic
TGTAGGAAGGCGGTAGGAGC+CGG 0.497480 2.1:+71860812 MS.gene047533:intron
CTTGCATTTGCAGTGATGAC+CGG 0.497811 2.1:-71869642 None:intergenic
TCTCCTATAAGCAATGTTGC+GGG 0.498785 2.1:+71876952 MS.gene047533:CDS
ATTTCTTCATGCCAGATTCG+CGG 0.499293 2.1:+71891590 MS.gene047533:intron
AGATTGCAAATCTGCTTGAC+GGG 0.503240 2.1:+71892179 MS.gene047533:intron
TGCAGATGTAATGGCAATGC+AGG 0.503707 2.1:+71886352 MS.gene047533:CDS
GAATCCTGTAGGTTTATGTA+CGG 0.509765 2.1:+71890350 MS.gene047533:intron
TTCAAGTTAGACTCAGAAGT+AGG 0.510623 2.1:-71875148 None:intergenic
GGACTGCAATGCACGATTGG+TGG 0.511428 2.1:-71869897 None:intergenic
AGAAGTAGTTTATGGTCATA+CGG 0.519556 2.1:-71883322 None:intergenic
CAATAATGAAGTCTGAGGTA+TGG 0.527090 2.1:-71883715 None:intergenic
AAAGGACTGCAATGCACGAT+TGG 0.530382 2.1:-71869900 None:intergenic
TGCCTCCTTCTGTCTGTTTG+GGG 0.532295 2.1:+71891182 MS.gene047533:CDS
GTAAGAACTAGCAAATATCA+TGG 0.534665 2.1:-71891118 None:intergenic
GACGAGTAAAACCTTGATCT+CGG 0.537229 2.1:-71881674 None:intergenic
AGGAGAAGTTATATGAGCAT+TGG 0.542600 2.1:+71881070 MS.gene047533:intron
ACATGGAAGCTGAGATTAGA+GGG 0.542847 2.1:-71869507 None:intergenic
CCTTGAAGACACAAGCATCA+TGG 0.543067 2.1:+71881466 MS.gene047533:CDS
TAATCAAACCTTCTCCATCA+TGG 0.544738 2.1:-71876335 None:intergenic
TTCTCCTATAAGCAATGTTG+CGG 0.545117 2.1:+71876951 MS.gene047533:CDS
GCACGTCGTTTGTTCACTGA+AGG 0.551936 2.1:+71891332 MS.gene047533:CDS
CTCACAAAGTTCAACCTCAC+AGG 0.553011 2.1:+71869543 MS.gene047533:CDS
CTGTGAGGTTGAACTTTGTG+AGG 0.560311 2.1:-71869542 None:intergenic
AGAATGATTCCAAACTGGCT+AGG 0.565399 2.1:+71881622 MS.gene047533:CDS
TTATTAATCTAAAGTTTGAA+GGG 0.566537 2.1:+71869733 MS.gene047533:CDS
TCAGGTCAATGTCGAGCACA+TGG 0.566806 2.1:+71883246 MS.gene047533:intron
GAAGTTATATGAGCATTGGA+TGG 0.568331 2.1:+71881074 MS.gene047533:CDS
TTTAGGGATCTATCATCACT+TGG 0.568424 2.1:+71869812 MS.gene047533:CDS
GTGATCAAAGAAAGACTCAA+AGG 0.569613 2.1:-71869918 None:intergenic
AAAGAAAGAAGGTAGAAGGG+TGG 0.569826 2.1:+71876260 MS.gene047533:CDS
AAAGAATTTGAAATTCAGCT+GGG 0.571537 2.1:+71877580 MS.gene047533:CDS
TAGTGTAAGAGAAACCGAGA+AGG 0.574459 2.1:+71863956 MS.gene047533:CDS
ATCAGTGTTCTAATTATGAA+GGG 0.578171 2.1:+71889040 MS.gene047533:CDS
ACTTCTTGAAGGCAATAATG+AGG 0.583386 2.1:+71883339 MS.gene047533:CDS
GAAGATATTAGGACAAATGG+TGG 0.588345 2.1:+71877069 MS.gene047533:CDS
AAACTCAAACCTAAACAACT+TGG 0.589771 2.1:+71869768 MS.gene047533:CDS
AACTACTTGGGCAAATAGGA+TGG 0.590198 2.1:+71892748 MS.gene047533:CDS
TAAATCTTTGAACTTGCTGG+AGG 0.590349 2.1:+71876308 MS.gene047533:CDS
GTATTCATACCCAGAGAGGA+AGG 0.592124 2.1:+71891631 MS.gene047533:CDS
GCTGAGATTAGAGGGTCCAT+AGG 0.594411 2.1:-71869499 None:intergenic
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CRISPR-GE

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>MS.gene047533

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