AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar XinJiangDaYe / MS.gene060406


Find 164 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 411 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-GE



Chromosome Type Strat End Strand Name
chr2.1 gene 53665061 53671571 53665061 ID=MS.gene060406
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Gene Sequence

>MS.gene060406

ATGGAACAACCTCCTTCCGATCCTCCGGTCACCGCTCCCGCCGCGGGCGAAACCATAAGCAAAAAGTAACTCCCCCGAATCTCTTTCTCATCGCTAAATCGATTTCACCATCACCACCATCGTTGAATTTCTCCTTTTTTTTTTTTGTTTTAAACTTTTATTGTTAATTTGTTTACAGTGCACTGAAGCGTGAACAAAAGAAAAAGGACAGAGAAGAAGAAAAGAGGAGAAAGGACGAGGAAAAAGCCAGAAAGGTAATTCTCTTATCCATTTATCGAAACCTTCGATTCGTGCTTAAATTTATTCATTGTTTTGTTAAATTTAACTTCTGTGTGATTTTATTCTTTGCATTTTGGTTTCAATTTCTGAAAATTTATTTTATTTTATATGTAACTAAACAATTGATAATCTAACCTTTGATTTGCGGGGAAATTTATGTATTTAATTTTTTAAATTTCGGTTTATAAATTTTTTAGTAGAACTCTGATTTTTGTTATTTGAATATTGATTTCTTTCTGACAATTTTTATTTTATTTTACATATGTAATGTAAACAATTGTTAGGACCTATCCTAGAAAAGATGGTGAAAACTTGATTTAGGGAGAAGATTTGTAAATCTAGTAAGGAGAGTAGATCAGATGGGGTAGTGAATTACTAGAGGCAGAGGAAGACCAAGAAAAACTATAAGAGAAACTACTAAGAAAAAATGTAGAGATTAACGAGTTGGGTAGAGATATGATATCTGAATCTGATTGGACGTTATGGTGTCGTTTGGTCCATGTAGCCGACCCCACTTAGTGGGTTAAGTTTTTCTTTTTTGTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTAACAATAGGCTTGGTGGTTGGTTTTTGTGATGTAAACAATTGATCAATGGTTAAATTTATATATTTAGTTTCTGCATGTTTTGATATAATTTTGTGATTTTATTCTTTCCTTATTGATTTCAATTCCTGAAAATTTATGTTTTATATATAACGTCAATACTTTTTTAGGCTGCTGAAATGAGAAGTGGCAAAGAGAACAAACCTGCAGCTGCTGATGAGGAAGATATGGATCCAACGGTGTGACTCCCCTTTTTTCACCGCAATGTTTCCAACATGTTATTTCTTCTATATAATGTTTGATGAACTGTTTTTTGTTACTTGGGTTGTTTAACTGCAGCAATACTTGGAGAACAGGCTTAAGTATCTTGCAACTGAAAAGGAAGAAGGGAGAAACCCATATCCACACAAATTCTCTGCCACTATTACTATTAGACAATATATCAAGGAATATGAAGGTTTAAGTGACGGGCAACATCGTGACGATGTCTCTGTATCTTTGACTGGTAATCATGAGTTTATTTGTTGATGTTTTTGTTTTTGAATTTAGTGGTTGCTCGTGTTGATATATTTGTTGTTTCTAATATGTTTTCTGTATTTCAGGCAAAATCATGCACAAACGTTCCTCTGGTGCAAAGCTCGTCTTTTATGACCTTCATGATGATGGTTTCAAGGTTCAGGTTATGGCCGATGCGAGGTACCCATTGTTGTTTCCTTCAATTTTACATATGTAGAGATGATGCCGATATAAAATATTGTATTCTATTAAGTTATTAGACCTTCGTTGCTATGTGTTTGCTTTTTGAATAAGCCCAAAATTTAAGCTTAAAAAGGTGATTTTATGATGTGTCTTTTTTTCAAGAATTTTTTCACAATTACATGTATGTTTATGTGAAAAGTTCAAACAGTTTTTCCCCAATTTTTTTTTACATATTAAGGATTTCTTGAAACAGATACCTTATAAAATATATTTTCATTAAGCTTGAAACAAATCCCTTATAAAATATATTTTCATCAAGAATATGCAGAAACAAACAAGTTCTTATTTTAAGATGGGTCTTATTGATTGTAATGTCAAATAACAGCGTTATTTTGAGATTTGACTCCTGTTACCTTGGTGTTTGACTAACATAGAAGTATTTGTTTGGCTTTTTCCAAATTTTCAAGATGTTTTGGCATTTTAATTTTTTCTTGAATGTATTTTTTTCTTCTTATTTTAGAGAATACATTTTTTTTTTTTTAATTCTTTCATGTATAATTTAGCAGGACAGAAACAACTAATGTATCTCTTATGCAGTAAATCGGACTTAAATGAGGCTGGGTTTGACAAAGTCCATTCTAATGTGAAGCGTGGTGATATTGTTGGCATCACAGGGTTTCCAGGTTTGTGGTGCTATATACTTCCAGGACTCTTATTATTTTGTTTAACTTTGTCTTTCTTCCATATGAAGTCTGTAATTCTTTGACATAACAATAAATAAGGACAATAATATTTTTTTATTTTTTTATTTTAGAAATGTATTAACTCTTTGGAAATAGGAGCAAATTAAGTGAAGTCCTATCAGGATAGTTTGCATAGTATTAAACTATTCTATCTTCAGACTGGGAACATGCCTCGTTACCATTCATGAGACAATTGCAAACTATTTTAAGCAGACATATCACTTCAAAGTGTTACTTAGTTTCAAAATTTGGAGGGCATATTAGTTGCAGTTACATTTATTTAAATCCTACTAATTGGGCCAATATTTTTCTATTTGATGTATACTTGGATGTATTCTATTCTATAGCATTACATTCTGAATTATAATATCATTTTAAAGGTTTTCCTTGTTTAATTGCCCAGGCAAAAGCAGGAAGGGGGAGCTTAGTATTTTCCCCAAAACTTTTGTGGTGCTGTCTCATTGTCTGCATATGATGCCTAGGCAAAAATCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGATAATGCATGGGTACCAGGAAAGACCAGGAATCCCGAAGCATACACTCTGAAAGACCAGGTATTATAGCATGAATTGCAGTCTGATAGATGCTTTCACTGCTTTAAGTCTGCCATATACTATCTTAGAGGGTTATAATGAGGAAGATACTATCTTATTAAATGTTGGATTGCAATTTACCTTCCCCCTATGGTGGATAGCATTTAGATTAGGGAATGAATTGAGATATATATTTATTTGTTATCATTCACTTTTTCTTGTGTGCATTGTGTTTTTCTTTTTCAAATTTATAGTTGGTACTTGATGTCCTTATGTGCATTTATTTACCTTGGATTCTTTATAGTCAGTGCGCTACCTGGCTTTTGTTATATATTTAATTTAATTTATTTATATTTTATGCTATAGTTTTGTGAATTTAGGAAGCTGCAACTTGTCAGGTACTTAGTGAAGGATTGATTAAATTGATTTCTTTGAATCATTTATTTGCTTGCAGCTTTCTAACTGCATTACCAAAATGAAAAATTATTACATAGGCTTGCAGTGCTCATACAATCTTTTTGCAAATTAATTTCAACTCAAAATGAAACTAATATATTTAAACTCGAGGCTAAAGTGAATCATACTGTTAAGTAAGTGCGAATTGATATCAAATGACTTTAGCATGGGCCTGTATTGCAATTCTGAAGCTTGCATCTTTATTTTTATGTTCATTTTTTGTGTATTGAAAGATAAGGTGGAACTGTCTCCAGCATTATTCTGCTATGTATAATATACATGTTTTGATAAACCTTTCTCTGTGGATGCTGAACAAAAAGTTATCTTTTGCATTATCAATTGTTTTCTTTCTTTAAAAATGTACATTTCATTTTAGGTACTGATAATAATTTGATTTATTCAATAGATTATCTTCTCTTATTATTTTTTGACTCAATTATCTTTTCTTATAGGAAACTAGATACCGGTTACGCCATTTGGATTTGATGCTTAATACAGAGGTTCGAGAAATATTCAGGACTAGGTCTAAAATCATTTCTTACGTTAGGAGTTTTCTGGAGAAGCTTGATTTCTTGGAGGTTTGTTCTGTACTTTGAGTATCCTTATGTTGGATCCCTGTGATTTCTTTCCTTCCATTCATTCACCTACTTTTCCACCACTCAGGTTGAAACACCTATGATGAACATGATTGCTGGTGGAGCTGCTGCTCGTCCATTCGTAACTCATCATAATGATCTTAACATGAGATTATTCATGAGAATTGCTCCAGAACTCTATCTCAAGAAGTTGATTGTCGGTGGTCTGAACCGTGTTTATGAAATTGGGAAACAATTTAGGAATGAGGGCATAGATTTGACTCATAATCCTGAATTTACTACCTGTGAGTTCTACATGGCTTACAAGGACTACAATGACTTAATGGAGATAACAGAGAACATGTTGAGCGGTGAGCATTTACTAGGTCTTTAATTGTCACGTTATTTCTCTTTCATGTATTTTATTTTAATGTCAAGTCATTACTTTCGTGTTGAAACCATTGAATAGGTATGGTGTATGAACTTACAAAGGGCAGCTATAAAATCAAGTATCATGCAGATGGTCTTGACAAGGACCCTATTGAAATCGACTTTACTCCACCATTCAGGTGTGTTGTGTGCATCATTTGTCACTGATGGTCATTAACATTTCATCATTTTGAAATATTGATTTGGATTGTTTATTATTACAGAAGGATTGACATGATTGAAGGACTAGAGGAGATGGCAGGCCTCAGTATTCCCAAAGACTTGACGAGCGCTGAAGCTAATCAATATCTAAAGGATGCCTGCTTGAAGTACGAAATCAAATGTCCCCCTCCTGAAACAACTGCGCGTTTGTTGGATAAGGTAATATCGTTTTCATTTTCTCCTGGCTTTTGTTTGGGTATAATGTAACTTTTTTTTATTAGTTACCCTTTTATGTAAAACTTGATTATAATTTTTTTTTCCTTGTTACAATAGCACAATTTTTTTGGGCTGTTTATCAATGTCATTTTCTATGTTATTCATATTCTAGAGTTTTAGGTATATGGTTAAGATAATTAACATATTAACATATTAGACCAGGAGAAGATTTCAGCATTAGTTTTCTGTGTTATGTTTGGTAGAATGAAATAGTTATCGATGAGAGGAGGACAAAACCGTAAACAGTTGTCTTTGTAAATGGACAACTA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Protein sequence

>MS.gene060406.t1

MEQPPSDPPVTAPAAGETISKNALKREQKKKDREEEKRRKDEEKARKAAEMRSGKENKPAAADEEDMDPTQYLENRLKYLATEKEEGRNPYPHKFSATITIRQYIKEYEGLSDGQHRDDVSVSLTGKIMHKRSSGAKLVFYDLHDDGFKVQVMADASKSDLNEAGFDKVHSNVKRGDIVGITGFPGKSRKGELSIFPKTFVVLSHCLHMMPRQKSAAAATRNPEAYTLKDQETRYRLRHLDLMLNTEVREIFRTRSKIISYVRSFLEKLDFLEVETPMMNMIAGGAAARPFVTHHNDLNMRLFMRIAPELYLKKLIVGGLNRVYEIGKQFRNEGIDLTHNPEFTTCEFYMAYKDYNDLMEITENMLSGMVYELTKGSYKIKYHADGLDKDPIEIDFTPPFRRIDMIEGLEEMAGLSIPKDLTSAEANQYLKDACLKYEIKCPPPETTARLLDKLVGHFLEETCVNPTFIINHPEIMSPLAKWHRSKPGLTERFELFINKHELANAYTELNDPVVQRQRFADQLKDRQSGDDEAMALDETFCTALEYGLPPTAGWGLGGSSLPCHETSRCRVPIKSFTGLFCFKSINMFNLHDCLVLTFLGKCGQVRFLMN