AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar XinJiangDaYe / MS.gene067165


Query id Subject id identity % alignment length mismatches gap openings q. start q. end s. start s. end e-value bit score
Query id Subject id identity % alignment length mismatches gap openings q. start q. end s. start s. end e-value bit score

Find 0 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 0 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content


Chromosome Type Strat End Strand Name
37938 gene 7261 14817 7261 ID=MS.gene067165
37938 mRNA 7261 14817 7261 ID=MS.gene067165.t1;Parent=MS.gene067165
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37938 exon 9322 9407 9322 ID=MS.gene067165.t1.exon8;Parent=MS.gene067165.t1
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37938 exon 8633 8719 8633 ID=MS.gene067165.t1.exon9;Parent=MS.gene067165.t1
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37938 exon 7261 7326 7261 ID=MS.gene067165.t1.exon10;Parent=MS.gene067165.t1
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Gene Sequence

>MS.gene067165

GTATGAGGCTGTTGAGTTACGGGATGGGGACAAAGGTGTATATCTAGGAAACGGTGTTGCTAAAGCTGTTAAAAATATAAATGAGAAAATATCTGAGGCGCTGATTGGTATGGATCCAACACTGCAGTCCCAGATTGATCATGCTATGATAGACCTTGACAAAACAGAGAAAAAGGTATTTCAACATCTTTCTGCTGGGAGAACACAAGTTTATTTGATAGTTAAATCCATATTGTGTATCGTTATGTCAATGCTTCTGCTATGTCACATTTTAAGACAATTGGAAACCGAGTAGGGAAAAAAAGCAGCTTGACTCACCTAGTGAGGTAAAGCTTGGTTGTTGTTGTTTTCTCTCTTGCTCTTGTTCAGGATAGGAGTTTTAGCATTCTTTAGTATAGTGATGGGTTCAACACAGATCATCAAAATCAACATTTTGTTTCCGTTGCAGGAAAGGAAATGAAATCTATCACAGACATTTATTTATGACATGTTGCAGTTAACTTAAGACACACTTTGTTCGTAGTGGGTAGCTAATGTAAAACTTTGCCAATTTTACTATAACATTTATCAATAATAAAGTTGGGACAGTGTTTGGTTCTTACTCATAAGTAAGTAACTCAGTTAGGGGAAATATTAGTTTCAAATATATTTTCACTGTTCTATTCTCAAATAACAAGGTGCATACTTAGGTTAGTATGAGAATATTAGGCTGTTAGAAAGGTGTTGTGTTCAAAACGGATATTATAAAGGATTTGAATTTCAGTAAGGTGGGAATTCATAATATATCTTTTATATTAGCTGAGAGTAGAAGTACAGCAGTTTGATCAATTTGAATAGTCGAAATCTAAATATCAAGTGATTGCTTGTCTTTCTTCCGTTTTCATCCGGAGCTTGATGAAAGTAGTCTGAGTCAATAATTCTTAGGCCTACATATGTTATGAACAATAACTTGCATGTTTGAATAATTCGTCTTAAATTACAGCTCTATCTAATCTAATTCTACAACATTTAATAATTTTGAATCTGTTTTGTTTCTGATTTTTGTTTGCAGGGGGAACTTGGGGCAAATGCTATATTAGCTGTGTCCATTGCTGCATGTAAAGCTGGGGCTGCTGAAAAGGAAGTATGGCTTGTCATTTGATATTTTTATTTTCATTTAAAGTTTAATCTGGATATGAGCTTATTTTTTATGTCAAGCTTTCATGAATCTAAAAACAAAAAATTATCAGGTTCCACTCTACAAGCACATCGCTGACCTGTCTGGAAAAACTAACCCAGTGCTTCCTGTTCCTGCTTTTACTGTTATAAGCGGTGGAAAACATGCTGGAAATAATCTGGCAATTGAGGTATAGTTTTTATTACAAGTTTCTCAGAAATTCTCATTAGTGTTTCTGTTATCTACATCTATTATTTCCTATAGACACTTATGAGTTATGAGCAATTTTTCGATCGTGAGCAGCAAAGTTAAATGCCCATTGAATGCGGAAATATTTATTTTATATTAAACTAATTATAAAACAACTTGGGGCTTACACACTTTTGTTGTAACCAACATCTTGTCAGTTCTTTGTTGTTTAACTTTGGAAGTTGGATTGTGGAAAGGACAAAACTTATAAACAGTTCTATATATACTATTTTTACTGTTGACCTATCATAATATAACACCTGGCTTAAAAGTGTCACGCAGTTAGCACACGCGTTACTCCGTTAATTTATTTTTTCGTAATCCCTTCAACAATCACTATAGAAGCAAACTTACACTTCGTTTTCCGTTCAATGCAACTTCCACTTTCTCAAGAAAAAGCGAAACTCTAAAACTATACATCAGTTTGCCATTGTTGCAGTAAGAAGAGAAGAGTCCAAACTCAATGGTTAATGATCGTAATAAAATTGAATTATTATTTGGTCCAATTTTTTTCCAAATAACCTCATTATTATCTTTTCCACCTTCTCTTCGTACTCTTGGCCTTGAATTTGCATTTGGATTTTGTTGTAATACTTGAAGATATAGGTGAATAGTATACATACGATACACTGTATTATGAAACTGTTTGAGGAAGAAAGCAACCACACTAACTCAACAATTTCATGCTAGACATGGGCACTTGTGGTTGCAGGAGTGAGTTCATCGGTTTGGTTGTCGTTGAATGCTCTATGAAAACAGAGGTCCAATAAAAACCAAAAAGGGAGATGGATGACGGAGAAGTTACGACGTTATCACGTTTTAAGTTGTTTTAAAATAAGTAATCCATGTGCCAAGTTTTTGTAGGATAACAGTAAAAACAGCATGGATGGAACTGTGTATAAGTATTGCCCTTGTTGAAATTGATTATGTTCATAATCTGACCTTTAACCATCAATAAGTATAGTTACTATTAAATCTATGTGTTTCCTCTGCTGCTTCATAGTGATTTGATTTCTTTTAAATGTGAAAGCTTTCTTACATTATTGTTACAGGAAATCATGATTCTTCCAATTGGAGCAAGCAGATTTGATGAAGCACTGCGAATGGGCTCTGAGACCTATCATCATTTAAAGGTGATTGTCTTTTTTTTTTTTCCCACTATCCTATTTTTTCAGTTTTTGTTTTCTATGTTTAGATATCTTTTCTCATAATCTCATGCTTTGTAATGTTCCCATGCTCGAATATTATCAAGTTTAATTGTGTCATGTTGTTCAGCTCTATTACAATGATTAAGGTCCCTGAGATATGTTGTTTAAGCTGATACATTTATTTGTTGTTCATGACAAAAGGGCAGGCTGTTATTACAGAAAAATGTGGGCCACATAACTGTAATGTCGGTGAAGATGGTGGCTTTGCTCCTAATGTCTCCAGGCAAGCTTTTTATCTTAAACTCTTTGGATTTGTACAGTTTTTTAAATTCTTTACTTTTAAATGAATATATGAAATGGAAATAAATCTGTTTTAGAAGAAAGGAAAGAAAAAAATATCTCCAAAACTGGTTATACAGTATTATATAATATGATGACTGATTAGAGTCAACAATTAAGTTGGTTGGTAGCTTATTTTTTATTGTTATTTCTTTTACTCTCTGATTTGTTGGAAATATAAGATCTATGGTCTTAAGAAATATATGATAATATGCTATTGTAAGAATCCCGTTTGTATTTTGCTTCTTAATCTAACTTGCTCTGAGGCAACTATTGGACTGCTTCATATTATAATTACAGAGTACTCCTATTACAACTATTGGACTGCTTCTTAATCTCTAGGAGTATCATTATACTTGATGAATGCAGTTTTTTAGAACTAATCCCTATGCATTTGTAGGGTATTTTTTAAATTAAGGTAAAATAAAAATTAAGAGATAAATTTGTCTAAGAGAAAAATGTTCAAAATTATACGGGAGATGTGCACAGTTAATCCAGGCAGATTCTAAAAAGTCTAGATTAGAAAACTGTTTAAAAATTAAAATTACAAAAAAAGGCATGGTTAATTAGTTCAGAATATTGCATCAAAAATAAATAAATAATTGGTTCATAATAATTGATTTAAATAAATAATTGGTTCATAATAATTGGTTTTAAAGTTTAGAAGTTAAGAATGATGTGTCTTTATTGAGGTAAAGTACACCAAGACTTATTACTCTTAAGAAAGTATTCTCTAATTTATATTTTGAGTGGATTGTACGAAGTTTCTCTAATTTAATAGTTTTTATATCAAGTATTTTTATTGTTTTGTATAAATCACTTGCTTTATGCTTGGGTAATATATTACTAATTATGTCCATTCTAAAATAATTACTTCTAGAGATTTTGTGATGTTATAATCTTATTTCTTCTTTTGAGCTGACTTTTTAAAATATCACCAGCTTTAGAGAAGCCCTGGATCTTGTAAAGGAGGCCATTAGTAGAACCGGTTATGATGAGAAAATAAAGATCGCTCTTGACGTCGCTGGTACAAATTTTTGTATTGGTAAGTAATTGTACTTTTCTGTTTCTTATTTGGTTCTAGATTCTGAGAAGGTTAAAGTTATCGATTCTTGCATACCTTATCATTGCTTATTGCTCTTATAATGAGAAACTGTTAGGAGCTCACGAACCTTCTATTAGGGAGGATTTTGATCCTCTAACTTTCTCTCCATCTCTCTCTTGATTTGATTTCTCTCACTTCTTTTCCTTCCATTATAAACATCATTTTCTCTCTTTTCTTCAACATTTTTCGTCTAAAGTCACTCTACCTTTCCCTCCCAAAAGGTAGAGGGTGCTTGCCCCTACTACTGATAGGATTACTAGAGTTTATTATAGAAAAAGAGGAAACATTGCAAACTCTTAATTACTTAGGTTAGTTAGTTCTTTGTTTTGTTTGTTAGGTTACTTATTTTTTGTTGTGAAGTTGACCCTATGGCCTACGTATTATAATAGGGATAACCTCACTTTGGGGAGCTGGCAGTTCTTTTAATTGAAAGTTTGTAAACTAGAGAGTGCTCTAGTGAGAGGGGATTAGAATCCTTTGTAACTTTTTCCATTGCTATCAATAAACTATACCGGCGAACAGACCCCTTTTCTCTAATTTTGAAGGTTAGGAAAATTCCTTGGAGAAACTGTGTTACGGCAGTGTTATGAACTGGTTTGCTGCATCATTTACAAAAAAACAAAAAAAAAGTAGTTCATTTCGCTTTGCCGTCGTTGCAAAACAATATTAGTCTAGCTTAGAGTTGTAGAATTAGCTATCTTATGTGTTAATAATAGCGCTATGCATTCCGAAGTCTACCGCTAATGGTGATATGTCGTTTGTCCATATCTTTACATCTGAATCTGGTAATATTTTTGTTGCGACCTGATCATATCATTTTCGGGGGGATTGATTTTGTTATTTTTGGTTTACACAGCACACTGTTCAAAATTTAGTGAGACAGAATAAGGCTTGAAAAGGTAAGAAAATAATTGAAGGTAAAAAGTTTGTAGGTTGAAGCACAATGCGTAATGGTTATGAACTTCAATCTTTAGAGCGTGTCATTGGCTTATTTTAACATTTC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Protein sequence

>MS.gene067165.t1

VUGCUVTGWGQRCISRKRCCUSCUKYKUENIUGADWYGSNTAVPDUSCYDRPUQNREKGGTWGKCYISCVHCCMUSWGCUKGSSTLQAHRUPVWKNUPSASCSCFYCYKRWKTCWKUSGNUGNHDSSNWSKQIUUSTANGLUDLSSFKGCYYRKMWATULUCRURWWLCSUCLQLURSPGSCKGGHUUNRLUUENKDRSURRWYKFLYWUKIUSGLUISSNVGTEFUVSRGYDRIVQGTMYRIPNCINRRSIUQGRLGTYQVYLKPWNLPGSRGUSLDVUCKAHUESSDUVCLUCSSSUVTSDUGRAWRSSSLCWURLEAV