AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar XinJiangDaYe / MS.gene22402


Find 299 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 447 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-GE



Chromosome Type Strat End Strand Name
chr7.3 gene 11447930 11454003 11447930 ID=MS.gene22402
chr7.3 mRNA 11447930 11454003 11447930 ID=MS.gene22402.t1;Parent=MS.gene22402
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chr7.3 CDS 11451224 11451597 11451224 ID=cds.MS.gene22402.t1;Parent=MS.gene22402.t1
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chr7.3 CDS 11451906 11452620 11451906 ID=cds.MS.gene22402.t1;Parent=MS.gene22402.t1
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chr7.3 CDS 11452747 11454003 11452747 ID=cds.MS.gene22402.t1;Parent=MS.gene22402.t1
Gene Sequence

>MS.gene22402

ATGTCAAAAGAGTCTGAAGAAATAAAAACTACTGAGCAATGGAAATGGTCTGAAATGCAAGGACTTGAGCTTGTGAGTGATGATATCAATTCTTCTTCTTCTGACCCTTTTAAAGGGAACTTGCCAACTGTAACAGAAGAAGGTGTTACTGCTACTGTTTCTGATTCTCAGAATCAAGTTCAAGTTTCAAAGGAAATGGAAGAACATAAGGAAGATGGTGGAAGTAAGGAGAAGGTTAAGAGTGCTCCTGCTGTTGGGTTTGGAGAGTTATTCAGATTTGCTGATGGGTTGGATTATATTCTAATGACAATTGGAACTGTTGGAGCAATTGTTCATGGTTGTTCTTTGCCTCTTTTTCTTAGATTCTTTGCTGATCTTGTTAACTCTTTTGGTTCCAATGCTAATAATTTGGATAAGATGACACAAGAAGTTGTTAAGGTAAAATAGTAATAATAATTGATAGCACAATTCAAAGTTTTATGATTTTTTTTTTTTAATTGGATTCTTTTTGTGGAAAGTAGGTGTGAATTGTTTGAGGTAATGTTGTTTTTTGCAGTATGCATTTTACTTCCTTGTGGTGGGTGCTGCTATTTGGGCTTCTTCTTGGGCAGGTTAGTTGGTTTCCAATTGAAAAAATTGAAATCGAAGAACATGTTTCTGTTTTTTTAAAGATTTTTTGCTTTTGAATTTTTGATGTTTTAATTTTCAAATGTTTAATGGATGATTGAAAGAAGGTTGGATTTGTTGCAGAGATTTCGTGCTGGATGTGGACCGGAGAGCGACAATCAACCAAGATGAGGATCAAGTATCTGGAAGCTGCATTGAAACAAGATATTGAATTCTTTGACACCGAGGTTCGAACTTCGGATGTTGTTTTTGCAATCAACACTGATGCTGTTATGGTTCAGGATGCCATTAGTGAGAAGGTTAGATGAATGAACAAGTGTTAATGTTTTTTTCTTTCTTTTCTTTTGTGACAGTGTCATTAGATTGGAATTGGACTAGTTTTTGAGTTCTGTGTTTTGTGTGTCCTGCAGCTTGGAAATTTCATTCACTACATGGCTACTTTTGTTTCTGGTTTTGTTGTTGGATTCACTGCTGTTTGGCAATTGGCTTTGGTTACCCTTGCTGTTGTTCCTATGATAGCTGTAATTGGAGGCATTCACACAACTACTTTGGCTAAACTCTCTAGTAAGAGCCAAGAAGCTCTTTCTCAAGCTGGCAACATTGTAGAACAGGTAAAGAGTAATAGTAACACATATTGTTTCTTTTCAAATTTAATAACATTTGATTTAGTATGTTTTTGTCCATGAGGTGGTAAGAGTTTGACCTTGTAACCTCAAGGGACGAAGTTCAAATCTCATCCGTGATGATTGTAAAATGGCTATCAACACCGCTTTATAATCTCTCTCAATCTCAGTTTTTCTGCATCTGAGGTGATTTTGTTATTGATATTGCAGACGGTTGTGCAAATCCGAGTAGTGTTGGCATTCGTTGGGGAGTCGCGAGCACTTCAAGGCTACTCATCAGCCTTGAAGGTTGCTCAGAAACTTGGCTACAAAACTGGATTAGCAAAGGGAATGGGATTAGGTGCGACTTACTTTGTCGTTTTCTGCTGTTACGCGCTTCTTCTGTGGTATGGAGGCTATCTTGTACGGCATCACGAAACCAATGGAGGACTTGCCATTGCAACCATGTTTGCCGTCATGATTGGTGGAATGTGAGTACTAGGGAATTTTGTGTTTTAGCAAGCAAAATCATAGTGATTGAATTTGAGTTTCTTAATGTTTAATACGTTTTAACGATTTGATTTGATTTGCATAGAGGTTTGGGGCAATCTGCACCGAGCATGGCTGCATTTACAAAGGCTAGAGTTGCGGCTGCTAAGATTTTCCGGATAATTGATCACCAGCCTGGTATAGATAGAAACAGTGAATCTGGATTGGAATTAGAGACAGTTACTGGACTTGTTGAACTGAAAAATGTGGACTTCTCTTATCCATCAAGACCTGAAGTTCTGATCCTCAATGATTTCTCCTTGAGTGTTCCTGCCGGAAAGACCATAGCTTTAGTTGGTAGCAGCGGCTCTGGCAAGAGCACTGTTGTTTCTCTAATTGAGAGATTCTATGATCCAACTTCAGGTAAATTTTTAAAATTACAGTTTAGTTTGAACGATTGAATTTTGAGATTTGAAGTTTTATGTTAGTAGTGGTTGTTACATTACATTGTTCCGAAAATTTGGTGCAGGACAAGTAATGTTGGATGGGCATGACATTAAAACTTTGAAGCTTAAATGGTTGAGGCAACAAATAGGACTAGTGAGCCAAGAACCTGCCTTGTTTGCCACCACGATCCGAGAAAATATACTCTTGGGAAGGCCTGATGCAAACCAGGTTGAGATTGAAGAAGCTGCTAGGGTTGCTAATGCTCATTCATTCATCATCAAACTTCCTGAAGGCTTTGAAACTCAGGTTAGTCGGCTCTGGCTCAATAAAATACATCTTGTTGTTGATGAACTGATGTTTGTTAAATTAATCACATTATTGAATTTAAATTTTTAGGATGGAACCATAGAAGCATTTTTTTTAAAAAATTATTGAATAAACCATCAATTTTGTCCCTAAAGTATCACCCTCTCTCCAATTTAGTCCGCGAAGTATATAAAAATAATTACTGGCCTTTAAAGTATGTGAAATCTGTTATTTTTTCGTCTCTAATGTATATAAAAATTCGTCGTTTTAGTCCTTGACATCTTAATAGCAAGGACCGATGATGTCGCAGTTTTCATATACTCTTAGGGGTTGGGTTACTTATTATTTTTATATATTTCAGAGATTAAATTGGAGTGGTATTCTAAGGACTAAATTGATAGTTTATTATAAAAAAAGTACAAGATGCTAAATAAAAAAAAAAACTTGGATATAACAGAAAAGAGGAATATTTTATTCCACAACTGTTACTATTCTGTTATTATCAATGTATACAGAAACGTGGTGATGTCTTGACTATTAATTTGGTCAAACCTGAAGCAGGAAATGTTTTTTATGCATTGCATCTGAAAAAAGACCAAGAGGGTAACATGCTTCAGTCAACTTGTGCTTGTGATAAACAATAAGGACCACAGAAAAGTTATTCATCAATCATAAAATCTCTAATCTATAGGAATAAATAATTTCTACACAGAACTCTAAATAAACTTTGAATCAGATGTGGAATCATACAATATACGATAATTTAATTGAAAATGGTACAAAATGATAAAGAAAAAAAAAATTAATTTTTTTTTAATGGCAGGTAGGAGAAAGAGGACTACAACTTTCTGGAGGGCAAAAACAAAGAATAGCAATAGCAAGGGCAATGCTAAAAAATCCAGCAATTCTTCTCCTAGATGAGGCAACAAGTGCATTGGACTCTGAATCAGAAAAGCTAGTGCAAGAAGCACTTGACCGGTTCATGATTGGCAGGACAACTCTTGTAATTGCTCATCGCCTGTCCACAATTCGCAAAGCTGACCTTGTAGCCGTGATTCAGCAAGGAAGTGTTTTTGAAATTGGAACTCATGATGAGCTCTTCTCCAAAGGTGAAAATGGAGTCTACGCCAAGCTTATTAAGATGCAGGAGGTTGCCCATGAAAATGCTATGAATAATGCTAGGAAGAGTAGTGCAAGGTAGTAGATTTCACAAATGTTGAACATTTCTTTTAAGTAATTTCATTTTCATTGTTCATGAAAGAGTAGTGCTTGGCCAAGGATTATTCCACCCAAGTTCGAATCCTAGCGCGAAATCGGGAATAATCCTTAGTTACACTTTATTTACCTCCCGGCTGAACTCCAAATTTTCAGGACCGCTTTCCCTTAGGAACCGGAGGGTCAATACCAAAAAAAATATTACTATTTTCACCAATGTTTCAAGTTCATCTTATAACTATTGCTAGTAGATATTCCGAGCTGAACATACATGACATTTTTATATGCAGGCCTTCAAGTGCAAGAAACTCTGTTAGCTCCCCAATAATTGCTAGGAATTCTTCTTATGGCCGGTCACCGTATTCGCGTAGATTGTCTGATTTCTCTACATCAGATTTTAGTTTGTCACTTGATGCATCTCATCCAAATTACAAGCATGAAAAGCTTGCCTTCAAAGATCAAGCCGGTTCCTTCTGGAGACTAGTAAAAATGAACTCTCCTGAATGGCTCTATGCTTTACTTGGCTCAATCGGTTCAATTGTTTGTGGATCGCTTAGTGCTTTCTTTGCTTATGTTCTTAGTGCTGTCCTCAGTGTCTACTACAATCCAGACCACAAACACATGATCCGAGAAATAGATAAGTACTGCTACTTGTTGATTGGTCTTTCATCAACTGCACTTATCTTTAATACATTGCAACATTTCTTCTGGGATATTGTCGGGGAAAATCTTACGAAACGTGTGAGGGAGAAAATGCTGACGGCAGTGCTTAAGAATGAAATGGCATGGTTTGATCAGGAGGAAAATGAGAGTGCTAGAATTTCTGCAAGGCTTGCTCTTGATGCCAACAATGTCAGATCAGCCATTGGAGACCGAATTTCGGTAATTGTGCAGAATACTGCACTTATGCTTGTTGCTTGTACTGCAGGCTTTGTGTTGCAGTGGCGTCTTGCACTTGTCCTCATTGCTGTATTTCCTGTTGTTGTTGCAGCCACTGTTTTGCAGGTTTGTTTTATACCATCTTCTTTCAGGCACTCTTTGTATTCAACTCTGTTTCACTTAGGGCCTGTTTGGATTGGTTTATTTGAGCATAATTAAGTTATTTATCCAATTGTTTTGTGTTTTGTACAGAAAATGTTCATGACTGGTTTCTCTGGTGACCTAGAAGCTGCTCATGCCAAGGCCACACAACTAGCTGGGGAGGCTATAGCCAATGTAAGAACTGTTGCAGCCTTCAATTCAGAATCGAAAATTGTTCGCCTTTTCGCCTCCAACCTTGAAACTCCACTACAAAGGTGCTTTTGGAAGGGACAG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Protein sequence

>MS.gene22402.t1

MSKESEEIKTTEQWKWSEMQGLELVSDDINSSSSDPFKGNLPTVTEEGVTATVSDSQNQVQVSKEMEEHKEDGGSKEKVKSAPAVGFGELFRFADGLDYILMTIGTVGAIVHGCSLPLFLRFFADLVNSFGSNANNLDKMTQEVVKYAFYFLVVGAAIWASSWAEISCWMWTGERQSTKMRIKYLEAALKQDIEFFDTEVRTSDVVFAINTDAVMVQDAISEKLGNFIHYMATFVSGFVVGFTAVWQLALVTLAVVPMIAVIGGIHTTTLAKLSSKSQEALSQAGNIVEQTVVQIRVVLAFVGESRALQGYSSALKVAQKLGYKTGLAKGMGLGATYFVVFCCYALLLWYGGYLVRHHETNGGLAIATMFAVMIGGIGLGQSAPSMAAFTKARVAAAKIFRIIDHQPGIDRNSESGLELETVTGLVELKNVDFSYPSRPEVLILNDFSLSVPAGKTIALVGSSGSGKSTVVSLIERFYDPTSGQVMLDGHDIKTLKLKWLRQQIGLVSQEPALFATTIRENILLGRPDANQVEIEEAARVANAHSFIIKLPEGFETQVGERGLQLSGGQKQRIAIARAMLKNPAILLLDEATSALDSESEKLVQEALDRFMIGRTTLVIAHRLSTIRKADLVAVIQQGSVFEIGTHDELFSKGENGVYAKLIKMQEVAHENAMNNARKSSARPSSARNSVSSPIIARNSSYGRSPYSRRLSDFSTSDFSLSLDASHPNYKHEKLAFKDQAGSFWRLVKMNSPEWLYALLGSIGSIVCGSLSAFFAYVLSAVLSVYYNPDHKHMIREIDKYCYLLIGLSSTALIFNTLQHFFWDIVGENLTKRVREKMLTAVLKNEMAWFDQEENESARISARLALDANNVRSAIGDRISVIVQNTALMLVACTAGFVLQWRLALVLIAVFPVVVAATVLQKMFMTGFSGDLEAAHAKATQLAGEAIANVRTVAAFNSESKIVRLFASNLETPLQRCFWKGQISGSGYGIAQFALYASYALGLWYASWLVKHGISDFSKTIRVFMVLMVSANGAAETLTLAPDFIKGGRAMRSVFDLLDRQTEIEPDDQDATPVPDRLRGEVELKHVDFSYPTRPDMPVFRDLNLRIRAGKTLALVGPSGCGKSSVIALIQRFYDPTSGRIMIDGKDIRKYNLKSLRRHISVVPQEPCLFATTIYENIAYGHDSATEAEIIEAATLANAHKFISSLPDGYKTFVGERGVQLSGGQKQRIAVARAFLRKAELMLLDEATSALDAESERSVQEALDRASTGKTTIIVAHRLSTIRNANVIAVIDDGKVAEQGSHSQLMKNHQDGIYARMIQLQRFTHNEVIGMASGSSSST