AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar XinJiangDaYe / MS.gene68661


Find 403 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 586 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-GE



Chromosome Type Strat End Strand Name
chr2.3 gene 39613831 39620300 39613831 ID=MS.gene68661
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chr2.3 exon 39613831 39614048 39613831 ID=MS.gene68661.t1.exon9;Parent=MS.gene68661.t1
chr2.3 CDS 39613831 39614048 39613831 ID=cds.MS.gene68661.t1;Parent=MS.gene68661.t1
Gene Sequence

>MS.gene68661

ATGGCGTTTGATCAAAGTTCTAGCCCTAAAACTATGCTGCCACCACCGGTGAACAACGTTATCCGATCGGATGAGTCGGTGAATGTAGGTTCCGGTGCGGCGGTTCCGGTTTATTATCCTGATACTGGGTTGGTTGGAGTGGGATATGGAAATGTTGCTTCTGGTGGTGGTGGTGGTTCTACAACATGGTGTATTCGACCTCATCCACCTTTGAACCCTAATGTTGGGTTTAATTTCCCCAATCGTATTGCTGGTGGCAATGCTGTTGATCTTTCAGGTAGTTTTGTTGCAACTTCTAATGGTTATCCTTTGAATTTGGGTAATTGGGTTACTACTAGTAATGCTTTGGATAGTAATAGTAATAATAGTATTCAGTATGGTAGCAGAGTGATTGGTAATGGTACTGGTGTTGGGTTGATTGGGACTCCTCCTTCCGATCGTGTTAATCAATCCGCTAGCCAGGCGAGTGAAAACAGCGGGGATGATTCTGTTTCCGGGAGGAAATTGAAGTTTATGTGTAGTTATGGTGGGAGGATTTATCCTAGACCTAGTGATGGGATGTTGAGGTATGTTGGTGGGCAGACTAGGATAATAAGTGTTAAGAGAAATGTGAGTTTTAATGATTTGGTGCAAAAGATGGTTGATACTTTTGGCCAACCTGTTGTCATCAAATATCAGCTCCCTGGCGAGGATCTTGATGCATTGGTCTCGGTTTCTTGTGCCGATGATCTTGATAATATGATAGAGGAGTATGAAAGGTTGATTCAGAGGTCTAAAGATGGTTCATCTAAGTTAAGGGTTTTTCTGTTTTCTGCTTCCGAATTGGATCCTTCAGGTCTGCAACAGTTTGCAAATTTAAATGATGGTGGGCAGAAATATGTTGAAGCAGTGAATGGAATTTTTGAGAGGATTGATGGAAACAAACTCACAAGGAAAGGGAGTCTTACAAGTGCAGCATCTACTCAAAATTCTGATTTGAGTGGGTTCGAGGCTCCTGATAGCACAAATGCTGCTCAAGTTGATGTTAATGGCCTACCTATGTTCACCACTTTATCACCCGATGCGAATGTCATTGCATCTCATGACGCTACTGCTGCAAATATTATGGTTACTGACCCTGTTGAATCGGTATGCTCAAATGTTTCTGCAGTTTCATTGGGCATACCTGTGGCTAATTCAGCTCCAACTCAGCCTCCACCTTTGCAGAATGAGGTTGAGGTAGAGAAGTTGGTGCCTGTTACTTTATCCCAACAGCCATTTGGCTTGCAGCAGTCTGGAATGCAAATTCCACCATCTGCACCTTTGCAGGCATTCACTGATCCTCAACAACAAGTTCTGAACCATGCAGATTATGTCCCAATGCCTGCCCACATGGGATTCCCAAGCCCCCAGCCTGTAGGTAGGCCTGGGACTATCTACTCTCAGCATTATTTTCATGATAATACTGCCCGGTTTACATCTCAACAGGTAATCCCTGCATTGCATGTGACAATGACTCAGCCATCTTCTCATGCCGGTATAAGACCAAGTGTTATTCAACCACAACCAGTCATACATGGGCAACAAAACGGTTTTGAGCAATATTATGACGAAAATACTTCAGGGCTAAGGATGCACCACCAGCTTATTTCTGAGCAAAGTTGCAAAGCATATCCAGTTCAAGTCCCTTTCGGAGGTAATTATGGTTGGGTTCAAATTTCTCCTTCGGAGCATGTTTTTTATCATGATGGAATGTTACCTCAACAACCATTAATGGTCCGTCAAAGAGTAGAGGATTGTTATATGTGTCAGAAAAAACTGCCTCATGCTCATTCAGATCCAGTGGTTCAGGATCAGCATAATAGCTGTGTAGGTTCAGTTCCGGATTCAATGCCAAGTTACAACAATCTCCCGGTAGAGGACAATTTAAGAGCTCAACCAACAAACAGGGTGTCGGTGACTGCACAAGTGAAGGAAGGCAATGTTAATGTTGAACAAGCAGTTGGGACCAGACCCAGGGACATTATACCGTGTGGTGACACGAGTTGTCTTCCTCTGGAGGCTGAAGGTGAGAGAAATAGGTCTGATCATCCCAGAAACGCAGTGATTATCCCGGAAATGGTTGGAAGAACAGGTGAAAAACAGTCGTCAGGGGACGGGCTTACAGCAACAGCACCACTGTCTTATCTAGATGATTTCGCCCGCCAGCACATGGTGCCAGTTGAAACTTGGGCCAAAGAAGATGTGGTCTTGAATACGCCTGTTCATGAAATACCTTTAGTTGGTGGCACATCAGTTGAAAATTCTATTTGTAGGGTTCAAGAATCATCAACAGAATATACTAATGAGCTTGCTAATACAATTTCAAAAGCAGATGCTGTGGAGAATTGGATTGCACAGGACCTGCTCAAACCTATTGATGGAGGGATGGACAACCTCAAGATAAGCAATCCTGAAACTTTTGTAAATAATGATAATTTTGATTATAGTACTCAGCATGCTATAGAGAAGAAAGGGGTGGATTTGGATAACATTGGCAGGTCAAAATTGATTGCTGATGGAAATCAAATTAAGATGGTGGATACTCTTCCTAATCCCACTGTAGAAATTCCATATGGTAATAAATCCAGGCCAGTGGAGTACAATGAGGTTGCACACTCGCCTATGTGGGGAAGTCCTGGAACAAATCCTCAATCGAAGAATGGAAACCATCAGAAGGATGATGTAGTTTTATCTTCAATTTCACAACCTGTTGGGTTTGGACATGTGCAGGATTCTTCAAACTCACTCTTTAGCAATCAGGATCCATGGAATATACACGGTACCTACTATCCACCACCTAGACCTGACAAAGTCACATCAAAGAAAGAAACCTCTTCTTATATGGATCAGTATGGTGAGAATTCAGGTAACAGTGTTGAACAAAAGTTCGATGGTCAATTGAATGATGGTCTCTATCAGACATTCAAACAGAATTCAACATTAGAAGAAGCACGATATACCAAGGGTCCGTAAATTGTTAAAGTCTTACATATCAGTTATCCTTATCAATCATAAATAGTTTAGATCTTGTATTCCATACTCATTGTATTTTGGTTTCTTCATTGATCACCAGAAGACCAACAACTTCAAGCTGTTGCTGAAAGTTCAGCTGCATCTGTTTTGCACTCAAGCACTTCAAATCCTGACTTACATGCCCGAGATGTGTCCCTTCATGAAAACATCGAAGATGGAGATGTTCAAAATAATCTACTAGATTTACACTGTAAAGAAAAAGCTCAGGTGACTGACATCCCTTTCTATTTATATTATTTTTTTCATTCTTGCAATTGCAGGAACTGTCTCCAAAATAAAATGTTTCTTCCTCTCACATTCTTGCTCCTTCTTAGTTGTGAATTTATTATTGTTCTAAATAGAATTATTCTCTTTCCTCCTTAGGATGACAAAAGCAATCTGTCAGAGAAAGCAAATTTTGGCTTTCCAGCATCAGATGTTGGATCGTTACAGGTTGAATGTTTTCTATTGTATGTTTTTTTCTATTAAAATTGCTTTCCCTGCTAAACTAAATCCTTGCTGTGGGAATGTGGCTAGATTATTAAAAATAGTGACCTTGAAGAGCTAGTAGAATTGGGCTCTGGGACCTTTGGGACTGTGTATCATGGAAAGTGGAGAGGTACTGATGTTGCAATAAAGCGGATCAATGATAGGTGTTTTGCTGGAAAGCCTTCAGAGCAAGAGCGCTTGGTCTGTTTCTCATTAGGAATTATTATTGATTTTGATTTCCATTGTCTCATAGTTTCCTTCATTATCAGTAAACTAGCTTACATTGTTCACCGTTTATGCATTAAGCAGAGAGCTGATTTTTGGAATGAAGCAATCAAGCTTGCTGATTTGCACCACCCAAACGTGGTAGCTTTTTATGGTGTTGTTCTTGATGGCCCAGGAGGGTCTGTGGCAACAGTAACAGAGTATATGGTTAATGGTTCTCTAAGAAATGCCTGCCAGAAGAATGGAAGGTATGTGTATGTCGTGCATGCACACACTTCTACCTGTTGGCTATTTTGCATTACCCTGGTTTTATGTATCACTGTTTCATATTATAAACGTTTGCATCTTTTTTTGATCATATCAGGAATCTTGACAAGCGCAAGCGTCTTATGATTGCAATGGATGTGGCCTTTGGCATGGAGTACCTCCATGGAAAAAACATTGTGCACTTCGACTTGAAAAGTGACAACTTGCTTGTGAATCTTCGTGATCCACACCGCCCAATATGCAAGGTTTTAAATCTTTCTGATGTGATAATATTATATTTAAAATATTGTTCTGCAGCATTCATCTGTGTTAGACATTCATCACATCATTTTGTATATAAGGAGCTGAATAACTAGTGCACCAAATTAGTGAACCAACTTCAATATACTCTAAGGCTCTTAGCAATTCAATGGTGTGAAAGTTCAGAGTGTGACAACATATAACCCATGTTCTGTACTCTTTGAGAAGGTGATTGGATACTAGTGTTAGGGATATGTTGAGGTGGCTTTTCTTGGAGGACCTTCATGAGATACATTTACAATTTGCTGCTTTTGTCGGATTTAAGAAATTTGAATCAGCAGAAAGGCGAATTTAAAGACTAATATTTTATTTAGCTATACTCAAGGTCTATGTAGGCATGTTTGATATATACAAAAAAAGATAGCACTATATCACTCAAAATGGTTCTTTATTACATTAGAGTTTAGTCTGCAATTTCTCATCACAGATTTGCAGTGTTCTCCCTACAGCGCCGCGAGGAATACACAACTACTAATAAATGCATCAAGTATAAGTCAGGCTTGAAGATGCATAGCTCTCCCACAAAAAAATTGAAATTTAGTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCACAAAAAATTGAAATTTATTGTTAAATCTTGAATTTTGGAGTTTTCACTACATTCTAATTAGGTACTTATTAGCATTCACCAATGATTTTACGCTAAACCTTAATGTATGCT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Protein sequence

>MS.gene68661.t1

MAFDQSSSPKTMLPPPVNNVIRSDESVNVGSGAAVPVYYPDTGLVGVGYGNVASGGGGGSTTWCIRPHPPLNPNVGFNFPNRIAGGNAVDLSGSFVATSNGYPLNLGNWVTTSNALDSNSNNSIQYGSRVIGNGTGVGLIGTPPSDRVNQSASQASENSGDDSVSGRKLKFMCSYGGRIYPRPSDGMLRYVGGQTRIISVKRNVSFNDLVQKMVDTFGQPVVIKYQLPGEDLDALVSVSCADDLDNMIEEYERLIQRSKDGSSKLRVFLFSASELDPSGLQQFANLNDGGQKYVEAVNGIFERIDGNKLTRKGSLTSAASTQNSDLSGFEAPDSTNAAQVDVNGLPMFTTLSPDANVIASHDATAANIMVTDPVESVCSNVSAVSLGIPVANSAPTQPPPLQNEVEVEKLVPVTLSQQPFGLQQSGMQIPPSAPLQAFTDPQQQVLNHADYVPMPAHMGFPSPQPVGRPGTIYSQHYFHDNTARFTSQQVIPALHVTMTQPSSHAGIRPSVIQPQPVIHGQQNGFEQYYDENTSGLRMHHQLISEQSCKAYPVQVPFGGNYGWVQISPSEHVFYHDGMLPQQPLMVRQRVEDCYMCQKKLPHAHSDPVVQDQHNSCVGSVPDSMPSYNNLPVEDNLRAQPTNRVSVTAQVKEGNVNVEQAVGTRPRDIIPCGDTSCLPLEAEGERNRSDHPRNAVIIPEMVGRTGEKQSSGDGLTATAPLSYLDDFARQHMVPVETWAKEDVVLNTPVHEIPLVGGTSVENSICRVQESSTEYTNELANTISKADAVENWIAQDLLKPIDGGMDNLKISNPETFVNNDNFDYSTQHAIEKKGVDLDNIGRSKLIADGNQIKMVDTLPNPTVEIPYGNKSRPVEYNEVAHSPMWGSPGTNPQSKNGNHQKDDVVLSSISQPVGFGHVQDSSNSLFSNQDPWNIHGTYYPPPRPDKVTSKKETSSYMDQYGENSGNSVEQKFDGQLNDGLYQTFKQNSTLEEARYTKEDQQLQAVAESSAASVLHSSTSNPDLHARDVSLHENIEDGDVQNNLLDLHCKEKAQDDKSNLSEKANFGFPASDVGSLQIIKNSDLEELVELGSGTFGTVYHGKWRGTDVAIKRINDRCFAGKPSEQERLRADFWNEAIKLADLHHPNVVAFYGVVLDGPGGSVATVTEYMVNGSLRNACQKNGRNLDKRKRLMIAMDVAFGMEYLHGKNIVHFDLKSDNLLVNLRDPHRPICKVGDLGLSKVKCQTLISGGVRGTLPWMAPELLNGSSSLVSEKVDVFSFGIVMWELLTGEEPYADLHYGAIIGGIVNNTLRPPVPESCDPEWRVLMERCWSSEPSERPSFTEIANDLRSMAAKISPKGQNQQQQSASSQNQVQK