AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar XinJiangDaYe / MS.gene95593


Find 217 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 0 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-GE



Chromosome Type Strat End Strand Name
chr4.3 gene 50004651 50012652 50004651 ID=MS.gene95593
chr4.3 mRNA 50004651 50012652 50004651 ID=MS.gene95593.t1;Parent=MS.gene95593
chr4.3 exon 50012604 50012652 50012604 ID=MS.gene95593.t1.exon1;Parent=MS.gene95593.t1
chr4.3 CDS 50012604 50012652 50012604 ID=cds.MS.gene95593.t1;Parent=MS.gene95593.t1
chr4.3 exon 50011647 50011754 50011647 ID=MS.gene95593.t1.exon2;Parent=MS.gene95593.t1
chr4.3 CDS 50011647 50011754 50011647 ID=cds.MS.gene95593.t1;Parent=MS.gene95593.t1
chr4.3 exon 50010146 50011305 50010146 ID=MS.gene95593.t1.exon3;Parent=MS.gene95593.t1
chr4.3 CDS 50010146 50011305 50010146 ID=cds.MS.gene95593.t1;Parent=MS.gene95593.t1
chr4.3 exon 50009655 50009777 50009655 ID=MS.gene95593.t1.exon4;Parent=MS.gene95593.t1
chr4.3 CDS 50009655 50009777 50009655 ID=cds.MS.gene95593.t1;Parent=MS.gene95593.t1
chr4.3 exon 50009422 50009495 50009422 ID=MS.gene95593.t1.exon5;Parent=MS.gene95593.t1
chr4.3 CDS 50009422 50009495 50009422 ID=cds.MS.gene95593.t1;Parent=MS.gene95593.t1
chr4.3 exon 50008901 50008964 50008901 ID=MS.gene95593.t1.exon6;Parent=MS.gene95593.t1
chr4.3 CDS 50008901 50008964 50008901 ID=cds.MS.gene95593.t1;Parent=MS.gene95593.t1
chr4.3 exon 50008631 50008777 50008631 ID=MS.gene95593.t1.exon7;Parent=MS.gene95593.t1
chr4.3 CDS 50008631 50008777 50008631 ID=cds.MS.gene95593.t1;Parent=MS.gene95593.t1
chr4.3 exon 50008459 50008544 50008459 ID=MS.gene95593.t1.exon8;Parent=MS.gene95593.t1
chr4.3 CDS 50008459 50008544 50008459 ID=cds.MS.gene95593.t1;Parent=MS.gene95593.t1
chr4.3 exon 50007561 50007630 50007561 ID=MS.gene95593.t1.exon9;Parent=MS.gene95593.t1
chr4.3 CDS 50007561 50007630 50007561 ID=cds.MS.gene95593.t1;Parent=MS.gene95593.t1
chr4.3 exon 50006895 50007023 50006895 ID=MS.gene95593.t1.exon10;Parent=MS.gene95593.t1
chr4.3 CDS 50006895 50007023 50006895 ID=cds.MS.gene95593.t1;Parent=MS.gene95593.t1
chr4.3 exon 50006544 50006771 50006544 ID=MS.gene95593.t1.exon11;Parent=MS.gene95593.t1
chr4.3 CDS 50006544 50006771 50006544 ID=cds.MS.gene95593.t1;Parent=MS.gene95593.t1
chr4.3 exon 50006043 50006147 50006043 ID=MS.gene95593.t1.exon12;Parent=MS.gene95593.t1
chr4.3 CDS 50006043 50006147 50006043 ID=cds.MS.gene95593.t1;Parent=MS.gene95593.t1
chr4.3 exon 50005817 50005969 50005817 ID=MS.gene95593.t1.exon13;Parent=MS.gene95593.t1
chr4.3 CDS 50005817 50005969 50005817 ID=cds.MS.gene95593.t1;Parent=MS.gene95593.t1
chr4.3 exon 50005013 50005101 50005013 ID=MS.gene95593.t1.exon14;Parent=MS.gene95593.t1
chr4.3 CDS 50005013 50005101 50005013 ID=cds.MS.gene95593.t1;Parent=MS.gene95593.t1
chr4.3 exon 50004815 50004895 50004815 ID=MS.gene95593.t1.exon15;Parent=MS.gene95593.t1
chr4.3 CDS 50004815 50004895 50004815 ID=cds.MS.gene95593.t1;Parent=MS.gene95593.t1
chr4.3 exon 50004651 50004723 50004651 ID=MS.gene95593.t1.exon16;Parent=MS.gene95593.t1
chr4.3 CDS 50004651 50004723 50004651 ID=cds.MS.gene95593.t1;Parent=MS.gene95593.t1
Gene Sequence

>MS.gene95593

ATGGAACTTCGTTCTCGTCGACAACGCGCTTCCGATGAAATCGATTCTGGTAACGAATAATCTCTCTTACCTTTACTCTTCCATTTATCATTTTTTTAATTTTTTTTATTTTATATTTTTTTTTTCATTTTTTTTTCTTCTGTTGTTTGGATGTTAAATTTGTAATAGTTTAATGTAAAGAATTATGAAACGTTTGTGTTTTTGGTTATTTTACTGTTCATCTTTTTATTCAATGTTTTGATCGAAATCTGAATTGTGATGGTAAGGGTAGATGCTTGATTGTTTTGATTTAGGGTTGTTGATGATGCAATTTACTGTGTTTGATTTTCTTTAGCACACTTCTGATCGAAGTCGTGTCCGGTGTCTGTGTCAGTATAGTATCATCCGACAACCGACACATGCAATTACATTCAATACTATCATTTTCATTAATTATTAGTGGCCGAAACATGCAATTATATTAAATTATATCAGTTTCACTGATAATTGTCGGTGTCCGACATGTTGGTGTCACCTGTGTCTGTGTAATCGGTGCTTCGTAGGTTCGATTTGGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCGTGATGTTGAGTTGAGAATTTTTATTTCAAATGTAGCATTGACACTTCTAATCGAAGCTGTGTCCGGTGTCTGTGTCAGTATGCAATTACATTAAATTATATCATTTTCAGTGATAATTGCCGGTGTTGTGTTAGTGTGTCAGGTGTCAGTGTCTTTGTAGTCGGTGCTTCATAGGTTCGATTTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAGTGTGATGTTGAGTTGAGAATTTTTATTTCTAATGCAGCGCGGTTTACTGTGTTACTGATTGCTGATTACTTTGTTATTTGTTTTCAATGTTTTATGGATGAATTAGCAGCTGATAAGGGGAAGCAGCCGATGGAGGATGTTGATGAAAAGTTTGACTTTAATACAGATGAAGATGATCATGTCGCGTCTGTGAAATCTGATTCTGATTATGAAGGTATATTTGCTGCCTTTATTCATGTGTTTGAAGTCTTGTGATGATTTATCTGTTTAAGATGTTATATTGCGAGTGTTATCTAGTTTATCACAAAGGACATGATATTGATGTTTCTGAAATGTTTGTTGTCTTAAACTTGAGGAAATGTTTGTGATGTGGGAGTTTGTTTATGATTCTAGTTAATTTGTGATTGGACTTTGAATGAGGAGTGAAATTTACTTGGATTACATTTTCTTTTCTGTTAAGATGAAAAATTGGAACCCTTTTATACTGCAAATTTAGTGATAAATTTCATTTTGGTGACATAGCTGAAAGCTTCTCTTTGAAAAACTTTAATGCAGCTGAAGACATTGGTGGACAGTTCCCCTTTGACTTGAATCAAGACCCTACTATAATCATCAGTGATTCTGATGGAGAAGATAATACTTCTGATTCATCTGACTTTAGCGGGCCTTCATCTAAACGGAGAAAGACACGGTCCAGAAAGAGAGGTAGTAAATCCAAGATAGAATCTACAGACCTGAGTGGTGTAGAGAGAGCGCTGGAGTTCGACCTGAGTGGTGTAGAGAGAGCGCTGCTGGAGTTTGATGATGAGTTATTTCCAATGGTTGCTGAAGAGGCTCCATTTGATTTACCTTTACCTAAGCTGCCAAGGAAGAAAAAAGCAAAGAAGACAAAAAAGGGAGATCCTAAACCAGTGTTGTTATGGCATGCTTGGAAACATGAACATGAGAAGTGGATCGATCAGAATTTGTTGGAAGATGTTACCCTCGATCAGAGTGAAGTGATGAATGAGACGGCCGAGGCATCGTCAGATCTGATTGTTCCGTTGCTGAGGTACCAAAGGGAATGGTTAGCATGGGCTTTGAAGCAGGAGCATTCTGTAACCAGAGGTGGAATCCTTGCTGATGAAATGGGTATGGGGAAAACTATTCAAGCAATTGCCCTTGTCCTTGCTAAACGGGAATTGCAACAAATGAGCTGTGAACCATTTGAACACTCAGATTCGCCCGGGTCTTCTAAAGTCCTTCCTGTGATCAAAGGAACTCTTGTCATCTGTCCCGTGGTTGCTGTCACTCAATGGGTTAGTGAGATTGCTCGATTTACTTTGAAAGGAAGCACGAAGGTTCTGGTTTATCATGGGCCAAAGAGATGGAAGAGTGCTGACAAGTTCTCGGAATATGATTTTGTAATAACAACATATTCTACTGTGGAATCGGAGTACAGAAAGCATGTGATGCCTCCTAAGGAAAAGTGCCAATATTGTGGAAGATTATTTCACCCGCCCAGTTTAGTTTTTCACCAGAAGTACTATTGTGGGCCTGACGCTATCAGAACAACAAAACAAGCAAAGCAAACCAAGAAAAAGAAAAGAGGTCAGAGTTCAAAGTTGGATGGAGAGTTGGAACAGGGCTTTATCAAGAAAAAGGAAGACGATCAAGAAGGCAATGACAAGTCATTTCTCCATGCTGTGAAGTGGCAAAGGATCATATTGGATGAGGTCAGTTGTGATAATGTAGCATTATGGTTAAGATCTAATCAAATTATACCACTTTGTCTTTCTGAAAAGTATTATTTTTTGAATTCAAAGAGTCATTTTGTATCTATTTGTTGTTTCTATTCTCTTTCCCTGTTTCTAAACTAACGCAAGTTTGTTTTTTTTCCCTTGTTTAACTACTGTTATAGAAAAATAAAGAAAACAATGGATTATGACTCAAGCTTAATGTCTTAACTTCGTAACTATATTTGTATATCTTGTTGTGTTTTGTATTATTACGAATATTATGTTAGGACATCATCATTTTATGTTATTTAACTTGTTGAAACTTCATTGAATTAGCTTATTTTTTTCCATTAATTTGAAAACAGGCACACTTTATAAAATCTAGGCATTCTAACACTGCAAAAGCAGTTCTTGCCTTAGAGTCTTTCTACAAATGGGCATTAAGTGGCACACCCCTTCAGAATCGTGTTGGAGAGCTATATTCTTTGGTAAATTACCAGTCTTTTTGGCAGTAATATATTCATTGTTTTTTATATGATTTGTCAAATAAAACACTTCCTAAAAGCTGCTAGGTGAAGGATAAGGAATGTTTTATATAGCTTATAGCTTATCCAACATAATTCAAATACAATGCCATGTTTATGCAGGTACGATTTCTGCAGATAGTTCCCTATTCCTATAACCTGTGCAAGGACTGTGATTGCAGGACACTTGATCATAGGTATGGTTTACATTCCGTATATTCAATGCCCTTTTTGGAATCTAATTTAGCAGGCAGTGATTTTAATCAAGGACTTAATATATATTACTAAGTGTTTGATTATTATTTTTTATACTTGTTACGAAACTGAGTTGTTAGCTTATTTTTCTCATGTTATCTCATCATATAAAAAACTACTACAATCTTGAAGGACTTGATGTATCTAATGCCGTCTGGGCGCTGCTCATGTGGAACCGAGACATATGATATGCCTTCTTTTTTGGAGGATATTCATATCTTAATCTTTATACTTAATACTGTTATAACTTTGCAAACATTTGATCCGTTTACCGAAGTGTTTACTCTGTTTGAATGCTTTAATTAGAAGTTATGTTTTTACACTATTGCATTGTTCACTTTTTTTATCATTATTGCATTGTTTACTGATTATATTCGCTATATCTGTGCTCTTGTGCAGTTCCTCTAAAGTATGTTCAAACTGCTCCCACAGTTCTGTTAGGCATTTTTGTTGGTGGAACAAGGTAAGTTCCTTGTTGGTTGGGTTCTCCATATTAGAGAGAATGAGAGAAAAGTTGTTCCTTGTAATTTTATACACAAGATGTTTTAGCTGACGTTTTTTTAATCATTTGTTTAATCTTGATTAGAATATTGCCACACCAATTCAATCATCCGGATATGGTGATGATGGGAAAAGAGCTATGATTTTGCTCAAAAACAAACTTTTAAAGAGCATAGTCTTAAGGCGAACTAAAATAGGCAGGGCTGCTGATCTTGCACTTCCGCCTAGGATCGTGAGTTCTTGTTTCCCGATGACTAAGTATGAATTTCTTCATATGAAGAGACTATAAATTTATTTCTACAACATTTCTACTTGCAGGTTTCATTGAGGAGGGATAGCCTGGATATAAAAGAGCAAGACTATTATGAATCACTATACAATGAAAGTCAGGCACAATTTAATACGTATGTCAAATTCCTTATCTTACTGCCTAAAATGTGGTAAAGTGCAGTTCTGTATTTGAAGAAATTGAAATGTGTTTGACATGAATGACATTATATTTATTTAGTGGGGTTGGATTTGTGGATCTAATCACCAAACTGTCAGTGAGGGGAATATCAGGGTAGCAAGGGGAGGGAGGAAATCATTCAGGTTTATTGTTGATTGTTGGTTAGGAGAGTATTCTCTCTGGTAGTAGCTTTCCTCTGGTTTATTTCCTTTCATTGTAGAGCCTTTGTGCTCAATTTACAGGATAACTCACATACTTCCTCTTTGAATTGACGGGGTCTATCAAACTGCTTCTAGTTTCCTTCACGCTTAATTAATTTTTATTTTTTATCTTCTTTTTTTTGTTGGTATAGGAAAATAATTATTGTTAACCCACCATTTTAACTTTACAAAAATGAAGATGGAAAATTGGAAGGAAAATAAATGATGGTAATGTTTTGTTGATTATATACACTAGCAGAAACCTGTTTGTCACAGTTATATTTTTCGGTGAAAAATAAATTACAGCAAGAAGGAAAGGAGCCTCAGTAAAAGTAATTATAGAGGTTATTTTTTATTTATATTGGACTCAAGTCAAGCGTTAAACTGGACAATATTTGTGCATCCCAAAACCTGCTATTAACATTATAGATAGTAATAGATTAGTGTCTCTTTTTCTATTTAACCATGCTCAAATTAAATAGCTGTATACAAATGTTTAACTTATGAAATGCCAACAAGACAAAGCCTTGCATGATTTTTTTTATATAAGCCCTGGTTTTATGAATTTGCTTTCTCTTTTGCAGGTATGTCGAGGAAAATACTCTGACAAATAATTATGCTCATATTTTTGACCTCCTCACACGACTACGTCAGGTGAATGATAAGGGAACATAAGAAATCAGAATTTATTTTATGGGACATAAGAAATAAGAAATAATTATGGACACTCGAAATATTGGCCATGCATCGCTATTGTATTTTGAAGTTCTTGAATTTCTAATCGTTTTATCGTGTTTCTAACTTTTTTTAGTTTTTCCTTGCTGGTGAATTCATTTAGAATCCAACATTGGTGTGGAAATTAGTTTTGGAATAAAATATACAGCCTGAACTTCAGCTTACACAAACAAAACAAAGTCATCTCAATCAGCTTTTAATTTACAAAAAATAACTTTTTTCAAATTAGAAACTGGTAGCAAGAACAATAATCATAAATCGGAAAGGCACCATAGGATAGCAATTCAATAGTTTTATTTTAAAACCGAGTGCCCGTCTGAAATATGGTCAAATGCTTTATGCTTTTTTTCAATCCTTATTTTCTAGTAAAATATATATGTTTGTACTCTTTTGCCTCTGGAAGGTGTATGTGATTTTCTGCCCTCCGTCTTACACATCTCTGGCTTAAATATACAGGCTGTGGATCATCCATATCTTGTAGTGTATTCTCCAACTGCAGCAGCACTAAAAGGTGGGAACTTGGCTGGTAATGGTGATGTTGAACAAGAATGTGGCATTTGTCATGATACTGTTGAAGATCCAGTGGTTAGTACATATTTTCTTTTTCTAATTAAACTTACTCCGTGCTTGTATATAATATAAGTTCCTCCTGCTAATTTTAATGTACTACTGATTTTTCTTCAAATTTCTTTTACTATATTGATTCAGGTTACTTCTTGTGAGCATACTTTTTGCAAGGGATGCTTGATAGATTTCTCTGCTTCCTTAGGACAAGTATCATGCCCCTCATGCTCTAAATTACTCACTGTTGATTTGACTTCCAACAAGGATGCCGTGGTTGATAAAACAACAACAATTAAGGGTTTCAGATCTTCAAGCATTTTAAACAGGATTCAGATTGAGAATTTTCAGACGAGTACTAAAATAGAGGCATTGGTATGTATAAATTTGTTGGATGATATTATAAATGATATTAAGCGTCTTTATTCCTGGCAAGTATGAATAGTTCTACTAGCTTTGAGTTGTTTTTTCCTTTTACCTGCAAGATGCAATTGATAAATGAATTAATGCATGCTAGAATACATTTTGATTATCTGCAAGTGGGGTATTGATGCAAAAGTTGAATGTTGCTGCTATGTGACTAAGTAAGGTTTGGGGGGGCGGGGCTTGTAGGATTGTGTGAGACTTGCATTTTGACAAGCATAATTTTTTTTTGTAATATGGCAACAAAATAATGCTTTTATCAGTTGGTGTAAATTCTCCGTCAAGTGCATATATTTTACGATGTAATTTATACTCTTCTTCTATCTGAATGATTTCAAATTGTCGCAGAGAGAAGAAATTAGATTTATGGTTGAAAGGGATGGTTCTGCAAAGGCGATTGTTTTTAGCCAGTTCACATCATTCTTGGATCTCATCAACTACTCCCTGCAGAAGGTAAATTTACTTGTCACTTTCTATTTTATTAATAAATGAAAATAAGGATGATGACATGGTGAGCTAATTGCAGTCAGGTGTATCTTGCGTTCAATTGGTTGGAAGTATGACATTGACTGCTCGGGATAATGCCATTAAGAAATTTACTGATGATCCAGACTGCAAAATTTTTCTCATGAGCTTGAAAGCCGGAGGCGTTGCTCTGAATTTGACTGTAGCATCTCATGTGAGTAATCTCCTTTTGCATGTTTATGTCAATATTTTGGTTTTTTACGGTGTTTAATTTTAAGTTGAGTTGTGAAAGATCTGGAAGTATGTTCTACTAGTCGCATTTGGTTGTAGAAGTTAAGCAATCCATTTTCTGAGCTCATCATATGTTCTACAATTCTATTCAGGATGGGAGTTTAATTATTGGAGTTTTTTCTATTTGTTAAATATAGGCTCTGTTTGGTAAAAAATAGCAAATAGTTGATAAGCGGAAAAACTAGCTGATGGAATTTGTAGTGTTTAAGTTATAAGCTTTAAGCTCAAAAACATGTCTTAGCAAATAGACCCATAGTTTGTCCTTTAATTGACTTTCAATTCTAAGTTATTGCTTTTCTATTTCTTTTTTACATACTTGAATTCTCCTGCTATCCTGCTTTATAATTTTATCCAATGTTTGATCCAAACAGACTACTTGTTGAATACTCATTGAATGTTTGATGGGTTTGAATATGTTACTTATTCGGTGAACTGTTTTCACCATTGAGCGAGACATGTAGGCATTAAATGGACTACTTAAAGCTTTTCTGTTTTTATTTCTGTTGTTGCCGCTATTTAAACCTTTGATGTAGATTGTGACAGTAATCAAACATTTTTTTTTAATCTTATTTTGCCATTCGTAAGTTGGGTTTCTCTCACATGGTTAACACATGCCTCCGTTCATTGCACAATCTCAGGTTTTCCTCATGGATCCTTGGTGGAACCCTGCTGTGGAGCGTCAGGCTCAAGACAGAATTCACCGGATAGGGCAGTACAAACCAATCAGGTACTGCTTTTGCACTAACACTAAATTTTTAAACAAGAGTAGGAAATGCAAAAGTTAATAGAAAAACATGTAGGTTGGTCTTTTATTATGAACTTCAAACATTATTTTCATGTACAGAATTGTGAGATTTGTCATTGAAAACACAATCGAGGAGAGGATCTTGAAACTTCAAGAGAAGAAGGAACTGGTATTTGAAGGGTAAGTTTGAAGCTATAATTAAATTGAAGGTGATCTGCGTATTTTTCCATAATAAACAATGACATTTCCTTTGTTGTCCCTCCTTTAATAGGACTGTAGGCGGTTCTTCAGAGGCTCTAGGGAAGTTGACGGTGGCCGACTTGAAATTTCTCTTTGTTACTTAA

Protein sequence

>MS.gene95593.t1

MELRSRRQRASDEIDSAADKGKQPMEDVDEKFDFNTDEDDHVASVKSDSDYEAEDIGGQFPFDLNQDPTIIISDSDGEDNTSDSSDFSGPSSKRRKTRSRKRGSKSKIESTDLSGVERALEFDLSGVERALLEFDDELFPMVAEEAPFDLPLPKLPRKKKAKKTKKGDPKPVLLWHAWKHEHEKWIDQNLLEDVTLDQSEVMNETAEASSDLIVPLLRYQREWLAWALKQEHSVTRGGILADEMGMGKTIQAIALVLAKRELQQMSCEPFEHSDSPGSSKVLPVIKGTLVICPVVAVTQWVSEIARFTLKGSTKVLVYHGPKRWKSADKFSEYDFVITTYSTVESEYRKHVMPPKEKCQYCGRLFHPPSLVFHQKYYCGPDAIRTTKQAKQTKKKKRGQSSKLDGELEQGFIKKKEDDQEGNDKSFLHAVKWQRIILDEAHFIKSRHSNTAKAVLALESFYKWALSGTPLQNRVGELYSLVRFLQIVPYSYNLCKDCDCRTLDHSSSKVCSNCSHSSVRHFCWWNKNIATPIQSSGYGDDGKRAMILLKNKLLKSIVLRRTKIGRAADLALPPRIVSLRRDSLDIKEQDYYESLYNESQAQFNTYVEENTLTNNYAHIFDLLTRLRQAVDHPYLVVYSPTAAALKGGNLAGNGDVEQECGICHDTVEDPVVTSCEHTFCKGCLIDFSASLGQVSCPSCSKLLTVDLTSNKDAVVDKTTTIKGFRSSSILNRIQIENFQTSTKIEALREEIRFMVERDGSAKAIVFSQFTSFLDLINYSLQKSGVSCVQLVGSMTLTARDNAIKKFTDDPDCKIFLMSLKAGGVALNLTVASHVFLMDPWWNPAVERQAQDRIHRIGQYKPIRIVRFVIENTIEERILKLQEKKELVFEGTVGGSSEALGKLTVADLKFLFVT